生物技术.ppt
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1、植物生物技术,第十一章 转基因植物的分子检测及安全评价,Good afternoon,第一节 转基因植物的检测 第二节 转基因植物的安全性评价,本章主要内容,第11章 转基因植物的分子检测 及安全性评价,本章教学目的与要求,转基因植物检测方法 人们对转基因安全性的几类问题,第11章 转基因植物的分子检测 及安全性评价,第一节、转基因植物的检测,外源基因是否进入受体植物细胞 进入植物细胞的外源基因是否整合到植物染色体上 整合到染色体上的外源基因是否表达 能否产生理想的目的表型,一、外源基因整合状态检测,(一)、PCR 检测方法 检测报告基因或目的基因 快捷、简易、灵敏等优点,1. 引物的设计与合
2、成,2. 模板DNA的制备 PCR对模板DNA的质量要求不高,可以直接利用细胞裂解液,或用快速微量法(CTAB或SDS法)制备基因组DNA 要有阴性对照和阳性对照,8,3. 反应体系与循环参数,反应体系:DNA模板,dNTP,Taq DNA聚合酶,buffer 反应程序: 变性 ( 9495oC) 复性 延伸 ( 3755 oC) ( 7072 oC ) 72 oC延伸10min 30-35cycles DNA扩增100万倍,转基因棉花再生植株的NPT-报告基因的PCR检测 M:1Kb的分子量标准;P:质粒;C:非转基因对照; 1-27:转化再生植株,4. 扩增产物检测,5. PCR检测的特点
3、: 检测迅速 灵敏度高,可以检测到纳克级外源DNA 操作方便,对DNA质量要求不高 不足之处在于假阳性偏高、不能提供整合位点的遗传信息,(二). Southern杂交及拷贝数检测,基因的碱基序列,与含有标记的探针发生同源配对,杂交后能产生杂交印迹或杂交带的转化植株为转基因植株;未产生杂交印迹或杂交带的为非转基因植株 选择不同的内切酶和探针组合,根据杂交带的片断大小及数目,可以判断外源基因的插入位点的整合情况及插入的拷贝数,1. 植物总DNA提取 CTAB: 十六烷基三乙基溴化铵是一种去污剂,可溶解细胞膜,能与核酸形成复合物,在低盐溶液中,复合物在溶液中沉淀,在高盐溶液中是可溶的,再加入乙醇使核
4、酸沉淀。 SDS法:高浓度的SDS在较高的温度下裂解细胞,高盐低温下沉淀多糖及蛋白质,然后用乙醇沉淀DNA,2. DNA纯度及浓度的检测: 琼脂糖凝胶电泳 0.8% 植物DNA呈现分子量较大的清晰条带 如果DNA 条带呈弥散状,表明降解 如果在小分子量区存在较亮的条带,说明含RNA 如果点样孔较亮,表明样品含杂质 紫外分光光度法: OD260/ OD260 =1.8 OD260/ OD260 1.8 含较多RNA OD260/ OD260 1.8 含较多的蛋白质及其它杂质,3. 总DNA的限制性酶切 选择合适的限制性内切酶 单酶切 酶切反应体系 DNA 5-15ug 体积20-90ul 检测酶
5、切效果 琼脂糖凝胶分离,4. 凝胶电泳分离各酶切片段 凝胶厚度 0.5cm以上 样品及上样量 含分子量质量标准DNA,阳性对照,阴性对照 低电压、长时间电泳 1V/CM 电泳16小时,5. 凝胶变性及转膜 双链DNA变性成为单链,用0.5M NaOH+1.5M NaCl 硝酸纤维素膜 尼龙膜 毛细管转移法 电转移法 真空转移法,5. 预杂交及杂交 预杂交:在加入探针前用封闭剂封闭膜上的非特异性位点 封闭剂:变性的非特异DNA,鲑鱼精DNA 高分子化合物:PVP+BSA+Ficoll400 杂交膜在预杂交液中,37-42温育3-12小时 杂交:加入杂交探针,65保温摇床过夜 洗膜:2*SSC0.
6、1*SSC洗膜,6. 杂交信号的检测 同位素标记的探针通过放射性自显影检测 非同位素探针采用酶反应检测,转基因棉花再生植株的Southern分子杂交图,灵敏度高(可检测1pg的DNA样品),特异性强(可鉴别20个碱基的同源序列)是目前坚定外源基因整合最权威的方法,HR16 HR18 HR19 HR24 HR26 HR30 HR35 HR37 HR38 HR39 YZ1,二、外源基因表达的检测,基因表达包括转录和翻译两个水平 转录是指以DNA(基因)为模板合成mRNA的过程 翻译是指以mRNA为模板合成蛋白质的过程 检测外源基因的表达包括特异mRNA和特异蛋白质 检测特异mRNA的主要方法是No
7、rthern杂交和RT-PCR 特异蛋白质表达的检测方法主要有三种 生化反应检测法 免疫学检测法:Western杂交 生物学活性的检测,Northern杂交DNA和RNA分子之间的杂交 检测目的基因是否转录出mRNA的方法,(一)、Northern 杂交,(二)RT-PCR,原理:RNA的多聚酶反应(RT-PCR)是以mRNA 为模板进行逆转录反应(reverse transcription, RT)与PCR,可用于检测单个细胞或少数细胞中少于10个拷贝的RNA模板。,RNA提取: 逆转录体系:RNA、缓冲液、dNTP、逆转录酶、引物(随机引物,Oligo dT; 特异引物) RT-PCR体系
8、:特异性引物、cDNA模板、Taq DNA聚合酶、buffer,利用凝胶成像分析仪对电泳结果进行拍照和结果记录; 观察胶上是否有预扩增的主要产物带。对比目的基因产物的电泳谱带分子量和谱带的特异性,确定和描述谱带特征。,GhUBQ7,GhCIPK6,Western immunoblot analysis of chitinase (chi) gene expression in leaf extract of transgenic cotton lines.,(三)、 Western blot,(四)、生化反应检测法,主要通过酶反应来检测 标记基因的检测(卡那霉素抗性、除草剂抗性) 卡拉霉素抗性
9、检测:在转基因植株的顶端刚展开的幼嫩的叶片上涂抹1%(w/v)的卡那霉素水溶液,7天后,观察叶片涂抹部位的颜色反应来判断结果(黄色为敏感、绿色为抗性),(五)、生物鉴定法,抗性转基因时,为了测定基因是否转入或者转入的是否表达,可以给转基因植株施加生物胁迫因子, 如果产生抗性,表明转基因理想效果;转Bt 基因的棉花中, 采用抗虫筛选能够最直观地检测到抗虫基因的表达效果,本节完,一、转基因植物的类型,抗病转基因植物:抗病毒转基因烟草 抗虫转基因植物:抗虫棉 抗逆转基因植物:抗旱、抗盐碱 抗除草剂转基因植物:抗除草剂转基因玉米、大豆、棉花、油菜 改良品质转基因植物:转VtA水稻 转基因药品植物:生产
10、霍乱疫苗的胡萝卜,第二节 转基因植物安全性评价,转基因植物的贡献,增加农作物产量 降低生产成本 减少化学农药对环境的污染 改善农作物品质 提高经济效益,抗除草剂作物,转基因植物的生产(图例),抗虫棉花,抗CMV病毒转基因番茄,抗CMV病毒转基因甜椒,转查尔酮合酶矮牵牛花,二、转基因产品,安全吗?!,转基因生物给人类创造了巨大的经济和社会效益的同时,也可能给人类带来极大的潜在或现实危害。 康奈尔大学斑蝶事件 加拿大“超级杂草”事件 墨西哥玉米事件,1999年5月,康奈尔大学的一个研究组在Nature杂志上发表文章,声称转基因抗虫玉米的花粉飘到一种名叫马利筋的杂草上,用马利筋叶片饲喂美国大斑蝶,导
11、致44的幼虫死亡。斑蝶蝴蝶是北美一种珍稀濒危动物,所以在当时在全世界都引起了很大的反响。 事实上,这一实验结果在科学上没有说服力。因为试验是在实验室完成的,且没有提供使用花粉量的数据。 现在这个事件也有了科学的结论:,第一,玉米的花粉非常重,扩散不远,在玉米地以外米,每一平方厘米马利筋叶片上只找到一个玉米花粉。 第二,2000年开始在美国三个州和加拿大进行的田间试验都证明,抗虫玉米花粉对斑蝶并不构成威胁,实验室试验中用10倍于田间的花粉量来喂大斑蝶的幼虫,也没有发现对其生长发育有影响。 斑蝶减少的真正原因,一是农药的过度使用,二是墨西哥生态环境的破坏,有人认为,外源基因的导入可能会造就某种强势
12、生物,从而破坏原有生物种群的动态平衡和生物多样性。 1995年,加拿大首次商业化种植了通过基因工程改造的转基因油菜。但在种植后的几年里,其农田便出现了对多种除草剂具有耐抗性的野草化的油菜植株,即超级杂草。如今,这种杂草化油菜在加拿大的草原农田里已非常普遍。因为一些转基因油菜籽在收获时掉落,留在了泥土中,来年它们又重新萌发。如果在这片田地上种下去的不是同一个物种,那么萌发出来的油菜就变成了一种不受欢迎的野草,而且这种能够同时抵御三种除草剂的野草化的油菜不但很难铲除,而且还会通过交叉传粉等方式,污染同类物种,使种质资源遭到破坏。 应当指出的是,“超级杂草”并不是一个科学术语,只是一个形象化的比喻,
13、目前并没有证据证明已经有“超级杂草”存在。同时,基因漂流并不是从转基因作物开始,而是历来都有。如果没有基因漂流,就不会有进化,世界上也就不会有这么多钟的植物和现在的作物栽培品种。,2001年发现的一种墨西哥玉米基因污染的问题是比较重要的。还有自然2001年曾经发表文章,关于墨西哥玉米遭到转基因玉米污染的事件。墨西哥本身不种植转基因的玉米,而且有法规规定不允许种植,但是它进口美国的转基因玉米用做饲料。结果可能是有些农民拿转基因玉米去种,种完之后就污染了当地的玉米。墨西哥是玉米的原产地。如果玉米原产地的遗传多样性受到污染,本地的玉米遗传结构受到破坏,产生的污染问题是很严重的。这件事对中国也有很大的
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