分子生物学之复制.ppt
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1、分子生物学课件之复制现在学习的是第1页,共62页第一节:第一节: DNA 复制的基本原则复制的基本原则现在学习的是第2页,共62页一、一、 Semiconservative Replication of Double-Strand DNA现在学习的是第3页,共62页概概 念念 在复制过程中首先两条亲本链之间的氢键断裂在复制过程中首先两条亲本链之间的氢键断裂, ,双链双链分开,然后以每条亲本链(分开,然后以每条亲本链(parental strandparental strand)为模板,为模板,按碱基互补配对原则按碱基互补配对原则( (A:TA:T,G:C)G:C),由由DNADNA聚合酶催化合
2、成新聚合酶催化合成新的互补子链(的互补子链(daughter stranddaughter strand)。)。复制结束后,每个子代复制结束后,每个子代DNADNA的一条链来自亲代的一条链来自亲代DNADNA,另一条链则是新合成的另一条链则是新合成的, ,并且,新形并且,新形成的两个成的两个DNADNA分子与原来的分子与原来的DNADNA分子的碱基序列完全相同。这分子的碱基序列完全相同。这种复制方式称为半保留复制种复制方式称为半保留复制( (semiconservation semiconservation replication)replication)。现在学习的是第4页,共62页现在学习
3、的是第5页,共62页现在学习的是第6页,共62页 DNA DNA合成的底物是脱氧核苷合成的底物是脱氧核苷5 5三磷酸(三磷酸(dNTPdNTP):):dATPdATP,dGTPdGTP,dCTPdCTP和和dTTPdTTP。复制的机制涉及到生长链的复制的机制涉及到生长链的3 3OHOH对与模板上的碱基互补的对与模板上的碱基互补的dNTPdNTP的的磷酸基团进行亲核进磷酸基团进行亲核进攻,释放出焦磷酸。聚合反应所需的能量来源于攻,释放出焦磷酸。聚合反应所需的能量来源于dNTPdNTP和焦和焦磷酸的水解。磷酸的水解。 二、二、DNADNA复制的化学复制的化学现在学习的是第7页,共62页现在学习的是
4、第8页,共62页三、复制起点与复制子三、复制起点与复制子Replicon: 作为一个单位进行复制的任何一段作为一个单位进行复制的任何一段DNADNA序列。序列。 它它含有一个复制起点,有时还含有一个复制终点。含有一个复制起点,有时还含有一个复制终点。Origin :是复制子起始复制的一段是复制子起始复制的一段DNADNA序列。序列。现在学习的是第9页,共62页 作为一个单位进行复制的任何一段作为一个单位进行复制的任何一段DNADNA序列。序列。 复制子的复制子的复制通常从一个固定的位点开始的,这种起始复制通常从一个固定的位点开始的,这种起始DNADNA复制的序列复制的序列叫做复制起点。叫做复制
5、起点。DNADNA复制时,双螺旋的两条链在复制起点处复制时,双螺旋的两条链在复制起点处分开形成两条模板链。一旦复制开始,就会在分开形成两条模板链。一旦复制开始,就会在DNADNA分子上分子上形成两个复制叉(形成两个复制叉(replication forkreplication fork)。复制叉向着未复制)。复制叉向着未复制的它们沿着的它们沿着DNADNA相向移动,因此复制是双向的。所有的原核生相向移动,因此复制是双向的。所有的原核生物的染色体,很多噬菌体和病毒的物的染色体,很多噬菌体和病毒的DNADNA分子是环状的,它们作分子是环状的,它们作为单个复制子完成复制。为单个复制子完成复制。 现在
6、学习的是第10页,共62页现在学习的是第11页,共62页真核生物染色体的线状真核生物染色体的线状DNADNA则含有多个复制子,每一个复制则含有多个复制子,每一个复制子都有自己的复制起点。一个典型的哺乳动物细胞有子都有自己的复制起点。一个典型的哺乳动物细胞有50 00050 000100 000100 000个复制子,复制子的长度为个复制子,复制子的长度为4040200 200 KbKb。正在复制的正在复制的真核生物基因组真核生物基因组DNADNA分子上,会形成许多复制泡。随着复制分子上,会形成许多复制泡。随着复制叉沿着叉沿着DNADNA分子向两个方向移动,复制泡不断变大,最终,分子向两个方向移
7、动,复制泡不断变大,最终,两个相邻复制泡的复制叉会相遇、融合,完成两个相邻复制泡的复制叉会相遇、融合,完成DNADNA的复制。的复制。 现在学习的是第12页,共62页现在学习的是第13页,共62页现在学习的是第14页,共62页四、四、DNADNA的半不连续复制的半不连续复制现在学习的是第15页,共62页 在复制叉处,在复制叉处,DNADNA的两条链都作为模板同时合成两条新链的两条链都作为模板同时合成两条新链。DNADNA分子的两条链是反向平行的,而分子的两条链是反向平行的,而DNADNA复制时无论以那条链复制时无论以那条链做模板,新合成的链是按做模板,新合成的链是按5 533方向进行的,所以只
8、有一条方向进行的,所以只有一条模板链指导合成的新生链能够沿着复制叉运动的方向连续模板链指导合成的新生链能够沿着复制叉运动的方向连续复制,此新合成的链称为前导链(复制,此新合成的链称为前导链(leading strandleading strand)。另)。另一条模板链指导合成的新生链也是沿一条模板链指导合成的新生链也是沿5 533方向进行,但与复方向进行,但与复制叉前进的方向相反,是分段合成的,这些片断于制叉前进的方向相反,是分段合成的,这些片断于19691969年首年首先在大肠杆菌中分离出来,被称为冈崎片段。先在大肠杆菌中分离出来,被称为冈崎片段。 现在学习的是第16页,共62页现在学习的是
9、第17页,共62页在细菌中冈崎片段长约在细菌中冈崎片段长约100010002000 2000 核苷酸,但在真核生核苷酸,但在真核生物中,相应片断的长度可能短得多,由物中,相应片断的长度可能短得多,由100100400400个核苷酸个核苷酸组成。合成的片段即为冈崎片段。这些冈崎片段以后由组成。合成的片段即为冈崎片段。这些冈崎片段以后由DNADNA连接酶连成完整的连接酶连成完整的DNADNA链,因此冈崎片段是链,因此冈崎片段是DNADNA复制中复制中短暂的中间产物。这条链不连续合成的链称为滞后链短暂的中间产物。这条链不连续合成的链称为滞后链(lagging strand) (lagging str
10、and) 。这种前导链的连续复制和滞后链的不。这种前导链的连续复制和滞后链的不连续复制在生物界是普遍存在的,称为连续复制在生物界是普遍存在的,称为DNADNA合成的半不连续合成的半不连续复制。复制。 现在学习的是第18页,共62页现在学习的是第19页,共62页One strand replicated as continuous segment现在学习的是第20页,共62页五、五、RNARNA引导引导 目前已知的目前已知的DNADNA聚合酶都只能延伸已经存在的聚合酶都只能延伸已经存在的DNADNA链,而不链,而不能从头启动能从头启动DNADNA链的合成,这是因为它在合成链的合成,这是因为它在合
11、成DNADNA时需要一个时需要一个自由的自由的3 3 OH OH。那么一个新的。那么一个新的DNADNA链的合成是如何开始的呢链的合成是如何开始的呢?研究发现,?研究发现,DNADNA复制时还需要另外一种酶来合成一段复制时还需要另外一种酶来合成一段RNARNA作为合成作为合成DNADNA的引物。在细菌中,引物合成依靠引物酶(的引物。在细菌中,引物合成依靠引物酶(primaseprimase),它是一种与转录酶不相关的),它是一种与转录酶不相关的RNARNA聚合酶。聚合酶。现在学习的是第21页,共62页引物酶不需要用特异引物酶不需要用特异DNADNA序列来起始序列来起始RNARNA引物的合成,被
12、激活引物的合成,被激活后,即用最新暴露的后随链模板合成后,即用最新暴露的后随链模板合成RNARNA引物。每个引物的引物。每个引物的长约长约5 5个核苷酸。一旦引物合成就由个核苷酸。一旦引物合成就由DNADNA聚合酶聚合酶IIIIII继续链的合继续链的合成。在真核细胞中,引物酶由成。在真核细胞中,引物酶由DNADNA聚合酶聚合酶的最小的亚基担任的最小的亚基担任。前导链的合成只需要在复制起点引发一次,因为一旦引物合。前导链的合成只需要在复制起点引发一次,因为一旦引物合成,前导链就可以连续复制直至结束。对后随链来说,引物的成,前导链就可以连续复制直至结束。对后随链来说,引物的合成是个重复的过程,因为
13、每开始合成一个新的冈崎片断就需合成是个重复的过程,因为每开始合成一个新的冈崎片断就需要一段引物。要一段引物。 现在学习的是第22页,共62页现在学习的是第23页,共62页第二节:细菌第二节:细菌DNADNA复制复制现在学习的是第24页,共62页一、复制的起始一、复制的起始1. 1. 大肠杆菌的复制起点(大肠杆菌的复制起点(OriCOriC) 大肠杆菌的复制起点称为大肠杆菌的复制起点称为OriCOriC。 将大肠杆菌的染色体随机将大肠杆菌的染色体随机断裂后插入到缺乏复制起点的质粒中,由于质粒上含有选择标断裂后插入到缺乏复制起点的质粒中,由于质粒上含有选择标记,凡能存活的克隆,质粒中都含有一段控制
14、记,凡能存活的克隆,质粒中都含有一段控制DNADNA复制的序列复制的序列。通过缺失分析鉴定出大肠杆菌的复制起点约有。通过缺失分析鉴定出大肠杆菌的复制起点约有240 240 bpbp组成。组成。 现在学习的是第25页,共62页该序列含有两个短的重复基序,两个基序的长度分别为该序列含有两个短的重复基序,两个基序的长度分别为9 9 bpbp和和13 13 bpbp。9 bp9 bp基序共有基序共有4 4个拷贝,分散于整个个拷贝,分散于整个OriCOriC的范的范围内,它是围内,它是DnaADnaA蛋白的结合位点。通过蛋白的结合位点。通过DnaADnaA蛋白与蛋白与OriCOriC的相互作用以及的相互
15、作用以及DnaADnaA蛋白之间的相互作用,大约蛋白之间的相互作用,大约3030个个DnaADnaA蛋白结合在复制起始区。这种结合只能发生在负超螺旋蛋白结合在复制起始区。这种结合只能发生在负超螺旋DNADNA分分子上,而负超螺旋是大肠杆菌染色体的正常存在状态。子上,而负超螺旋是大肠杆菌染色体的正常存在状态。 现在学习的是第26页,共62页现在学习的是第27页,共62页DNADNA分子在分子在DnaADnaA蛋白复合体上的缠绕,导致双螺旋在串连排蛋白复合体上的缠绕,导致双螺旋在串连排列的列的3 3个富含个富含ATAT的的13 13 bpbp基序处解开。一般认为螺旋解开是基序处解开。一般认为螺旋解
16、开是由于由于DNADNA双螺旋在双螺旋在DnaADnaA蛋白复合体上缠绕后产生的扭转张蛋白复合体上缠绕后产生的扭转张力的结果。力的结果。 现在学习的是第28页,共62页 DNA DNA双螺旋的进一步打开需要双螺旋的进一步打开需要DnaBDnaB蛋白。蛋白。DnaBDnaB蛋白是解旋蛋白是解旋酶(酶(HelicaseHelicase),其作用是解开),其作用是解开DNADNA双链。两个双链。两个DnaBDnaB蛋白在复蛋白在复制起点处分别与两条单链结合,并按制起点处分别与两条单链结合,并按5 533相向而行打开相向而行打开DNADNA双链。在复制起点处双链。在复制起点处DNADNA双链打开以后,
17、双链打开以后,DnaADnaA蛋白便会募蛋白便会募集由集由6 6个个DnaBDnaB和和6 6个个DnaCDnaC构成的复合体与起始位点处的单链构成的复合体与起始位点处的单链DNADNA结结合。合。DnaCDnaC为为DnaBDnaB蛋白装载因子,依靠蛋白装载因子,依靠DnaCDnaC蛋白的单链蛋白的单链DNADNA结合结合域以及与域以及与DnaADnaA蛋白的相互作用,蛋白的相互作用,DnaBDnaB和和DnaCDnaC蛋白复合体结合蛋白复合体结合在复制起始位点。在复制起始位点。 Helicase (DnaB) continues to separate strands现在学习的是第29页,
18、共62页现在学习的是第30页,共62页然后,然后,DnaCDnaC催化催化DnaBDnaB蛋白解环,并套在单链蛋白解环,并套在单链DNADNA上。在上。在DnaBDnaB和和DnaCDnaC蛋白复合体中,蛋白复合体中,DNADNA解旋酶保持非活性状态。解旋酶保持非活性状态。DNADNA解解旋酶的安装导致装载因子从复合体中释放出来,并激活旋酶的安装导致装载因子从复合体中释放出来,并激活DNADNA解旋酶。解旋酶。DNADNA解旋酶向前运动,在其身后留下单链解旋酶向前运动,在其身后留下单链DNADNA模板。模板。现在学习的是第31页,共62页接着单链结合蛋白(接着单链结合蛋白(single-str
19、anded binding protein, single-stranded binding protein, SSBSSB)与解旋酶解开的单链结合,其作用是防止单链降解,阻)与解旋酶解开的单链结合,其作用是防止单链降解,阻止单链退火。止单链退火。SSBSSB蛋白与单链蛋白与单链DNADNA的结合有协同效应的结合有协同效应(cooperative)(cooperative),即一个,即一个SSBSSB的结合会促进另一个的结合会促进另一个SSBSSB与单链与单链DNADNA的结合。这种协同结合使单链的结合。这种协同结合使单链DNADNA被解旋酶释放出后,被解旋酶释放出后,很快被很快被SSBSSB
20、所覆盖。一旦被所覆盖。一旦被SSBSSB覆盖,单链覆盖,单链DNADNA即处于伸直状即处于伸直状态,有利于其作为模板进行态,有利于其作为模板进行DNADNA合成或合成或RNARNA引物的合成。引物的合成。现在学习的是第32页,共62页 在大肠杆菌细胞中,在大肠杆菌细胞中,DNADNA解旋酶募集一个引物酶。引物解旋酶募集一个引物酶。引物酶负责合成一段短的酶负责合成一段短的RNARNA引物。引物。现在学习的是第33页,共62页现在学习的是第34页,共62页二、二、 Elongation 一旦复制起始,复制叉就沿着一旦复制起始,复制叉就沿着DNADNA分子前进,合成与亲本分子前进,合成与亲本链互补的
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- 关 键 词:
- 分子生物学 复制
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