rna的生物合成讲稿.ppt
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1、目目 录录第一页,讲稿共一百零三页哦目目 录录转录转录 (transcription) 生物体以生物体以DNA为模板合成为模板合成RNA的过程的过程 。 转转录录RNADNA 第二页,讲稿共一百零三页哦目目 录录复制和转录的区别复制和转录的区别 A-U,T-A,G-CA-T,G-C配对配对mRNA,tRNA,rRNA子代双链子代双链DNA(半保留复制)半保留复制)产物产物RNA聚合酶(聚合酶(RNA-pol)DNA聚合酶聚合酶酶酶NTPdNTP原料原料模板链转录(不对称转录)模板链转录(不对称转录)两股链均复制两股链均复制模板模板转录转录复制复制A-U,T-A,G-CA-T,G-C配对配对mR
2、NA,tRNA,rRNA子代双链子代双链DNA(半保留复制)半保留复制)产物产物RNA聚合酶(聚合酶(RNA-pol)DNA聚合酶聚合酶酶酶NTPdNTP原料原料模板链转录(不对称转录)模板链转录(不对称转录)两股链均复制两股链均复制模板模板转录转录复制复制第三页,讲稿共一百零三页哦目目 录录参与转录的物质参与转录的物质原料原料: : NTP (ATP, UTP, GTP, CTP) 模板模板: : DNA酶酶: : RNA聚合酶聚合酶(RNA polymerase, RNA-pol)其他蛋白质因子其他蛋白质因子第四页,讲稿共一百零三页哦目目 录录模板和酶模板和酶Templates and E
3、nzymes第一节第一节第五页,讲稿共一百零三页哦目目 录录一、转录模板一、转录模板 l DNA分子上转录出分子上转录出RNA的区段,称为的区段,称为结构基因结构基因(structural gene)。 l DNA双链中按碱基配对规律能指引转录生成双链中按碱基配对规律能指引转录生成RNA的一的一股单链,称为股单链,称为模板链模板链(template strand),相对的另一,相对的另一股单链是股单链是编码链编码链(coding strand)。 第六页,讲稿共一百零三页哦目目 录录5GCAGTACATGTC 33 c g t g a t g t a c a g 55GCAGUACAUGUC
4、3NAla Val His Val C编码链编码链模板链模板链mRNA蛋白质蛋白质转录转录翻译翻译第七页,讲稿共一百零三页哦目目 录录5 5 3 3 3 3 5 5 模板链模板链编码链编码链编码链编码链模板链模板链结构基因结构基因转录方向转录方向转录方向转录方向第八页,讲稿共一百零三页哦目目 录录不对称转录不对称转录(asymmetric transcription) 在在DNA分子双链上某一区段,一股链用作模板分子双链上某一区段,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录指引转录,另一股链不转录 ;模板链并非永远在同一条单链上。模板链并非永远在同一条单链上。第九页,讲稿共一百零三页哦目目 录录二
5、、二、RNA聚合酶聚合酶(一)原核生物的(一)原核生物的RNA聚合酶聚合酶 36512 决定哪些基因被转录决定哪些基因被转录 150618 催化功能催化功能 155613 结合结合DNA模板模板 70263 辨认起始点辨认起始点亚亚 基基分分 子子 量量功功 能能第十页,讲稿共一百零三页哦目目 录录核心酶核心酶 (core enzyme)全酶全酶 (holoenzyme) 第十一页,讲稿共一百零三页哦目目 录录RNA聚合酶全酶在转录起始区的结合聚合酶全酶在转录起始区的结合 第十二页,讲稿共一百零三页哦目目 录录(二)真核生物的(二)真核生物的RNA聚合酶聚合酶 种类种类对鹅膏蕈碱对鹅膏蕈碱的反
6、应的反应45S-rRNAhnRNA5S-rRNAtRNAsnRNA耐受耐受极敏感极敏感中度敏感中度敏感转录产物转录产物第十三页,讲稿共一百零三页哦目目 录录三、模板上酶的辨认、结合三、模板上酶的辨认、结合原核生物一个转录区段可视为一个转录单位原核生物一个转录区段可视为一个转录单位,称为,称为操纵子操纵子(operon),包括若干个,包括若干个结构基因结构基因及其及其上游上游(upstream)的的调控序列调控序列。 5 3 3 5 结构基因结构基因调控序列调控序列RNA-polRNA聚合酶结合模板聚合酶结合模板DNA的部位,称为的部位,称为启动子启动子(promoter)。第十四页,讲稿共一百
7、零三页哦RNA聚合酶聚合酶保护法保护法目目 录录第十五页,讲稿共一百零三页哦目目 录录开始转录开始转录T T G A C AA A C T G T-35 区区(Pribnow box)T A T A A T Pu A T A T T A Py-10 区区1-30-5010-10-40-205 3 3 5 原核生物启动子保守序列原核生物启动子保守序列RNA-pol辨认位点辨认位点(recognition site) 5 5 RNA聚合酶保护区聚合酶保护区结构基因结构基因3 3 第十六页,讲稿共一百零三页哦目目 录录 TATA盒盒 CAAT盒盒 GC盒盒 增强子增强子 顺式作用元件顺式作用元件 结
8、构基因结构基因-GCGC-CAAT-TATA转录起始转录起始真核生物启动子保守序列真核生物启动子保守序列第十七页,讲稿共一百零三页哦目目 录录转录过程转录过程The Process of Transcription 第二节第二节 第十八页,讲稿共一百零三页哦目目 录录(一)转录起始(一)转录起始转录起始需解决两个问题:转录起始需解决两个问题:RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。始区域。1.DNA双链解开,使其中的一条链作为转录的模双链解开,使其中的一条链作为转录的模板。板。一、原核生物的转录过程一、原核生物的转录过程第十九页,讲稿共一百零三页哦2.
9、 DNA双链解开双链解开1. RNA聚合酶全酶聚合酶全酶( 2)与模板结合与模板结合 3. 在在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成转聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成转录起始复合物录起始复合物RNApol ( 2) - DNA - pppGpN- OH 3 转录起始复合物转录起始复合物:5 -pppG -OH + NTP 5 -pppGpN - OH 3 + ppi转录起始过程转录起始过程第二十页,讲稿共一百零三页哦目目 录录(二)转录延长(二)转录延长1. 亚基脱落,亚基脱落,RNApol聚合酶核心酶变构,与模聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着板结合松弛,沿着DNA模板前移;模
10、板前移; 2. 在在核心酶核心酶作用下,作用下,NTP不断聚合,不断聚合,RNA链不链不断延长。断延长。(NMP) n + NTP (NMP) n+1 + PPi第二十一页,讲稿共一百零三页哦转录空泡转录空泡(transcription bubble):RNA-pol (核心酶)(核心酶) DNA RNA目目 录录第二十二页,讲稿共一百零三页哦目目 录录第二十三页,讲稿共一百零三页哦目目 录录5 3 DNA原核生物转录过程中的羽毛状现象原核生物转录过程中的羽毛状现象核糖体核糖体RNARNA聚合酶聚合酶第二十四页,讲稿共一百零三页哦目目 录录依赖依赖Rho ()因子的转录终止因子的转录终止非依赖
11、非依赖Rho因子的转录终止因子的转录终止(三)转录终止(三)转录终止指指RNA聚合酶在聚合酶在DNA模板上停顿下来不再模板上停顿下来不再前进,转录产物前进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。链从转录复合物上脱落下来。 分类分类第二十五页,讲稿共一百零三页哦目目 录录A T P1. 依赖依赖 Rho因子的转录终止因子的转录终止第二十六页,讲稿共一百零三页哦目目 录录2. 非依赖非依赖 Rho因子的转录终止因子的转录终止DNADNA模板上靠近终止处,有些特殊的碱基序模板上靠近终止处,有些特殊的碱基序列,转录出列,转录出RNARNA后,后,RNARNA产物形成特殊的结构来终止产物形成特殊的结构
12、来终止转录。转录。第二十七页,讲稿共一百零三页哦目目 录录5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU. 3 5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU. 3 RNA 5 TTGCAGCCTGACAAATCAGGCTGATGGCTGGTGACTTTTTAGTCACCAGCCTTTTT. 3 DNA UUUU. UUUU.5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU. 3茎环茎环(ste
13、m-loop)/发夹发夹(hairpin)结构结构第二十八页,讲稿共一百零三页哦目目 录录茎环结构使转录终止的机理茎环结构使转录终止的机理 使使RNA聚合酶变构,转录停顿;聚合酶变构,转录停顿; 使转录复合物趋于解离,使转录复合物趋于解离,RNA产物释放。产物释放。5 pppG5 3 3 5 RNA-pol第二十九页,讲稿共一百零三页哦目目 录录二、真核生物的转录起始二、真核生物的转录起始(一)转录起始(一)转录起始真核生物的转录起始上游区段比原核生物多真核生物的转录起始上游区段比原核生物多样化,转录起始时,样化,转录起始时,RNA-polRNA-pol不直接结合模板,其不直接结合模板,其起始
14、过程比原核生物复杂。起始过程比原核生物复杂。第三十页,讲稿共一百零三页哦目目 录录转录起始点转录起始点TATA盒盒CAAT盒盒GC盒盒 增强子增强子顺式作用元件顺式作用元件(cis-acting element)1. 转录起始前的上游区段转录起始前的上游区段 AATAAA切离加尾切离加尾 转录终止点转录终止点 修饰点修饰点 外显子外显子 翻译起始点翻译起始点内内含含子子 OCT-1 OCT-1:ATTTGCAT八聚体八聚体第三十一页,讲稿共一百零三页哦目目 录录2. 转录因子转录因子 能直接、间接辨认和结合转录上游区段能直接、间接辨认和结合转录上游区段DNADNA的蛋白质,现已发现数百种,统称
15、为的蛋白质,现已发现数百种,统称为反式作用因子反式作用因子(trans-acting factors)(trans-acting factors)。 反式作用因子中,直接或间接结合反式作用因子中,直接或间接结合RNARNA聚合酶聚合酶的,则称为的,则称为转录因子转录因子(transcriptional factors, (transcriptional factors, TF)TF)。 第三十二页,讲稿共一百零三页哦目目 录录参与参与RNA-pol转录的转录的TF 蛋白激酶活性,使蛋白激酶活性,使CTD磷磷酸化酸化TFHATPase57( ) 34( )TFE解螺旋酶解螺旋酶30,74TFF促
16、进促进RNA-pol结合及作结合及作为其他因子结合的桥梁为其他因子结合的桥梁33TFB稳定稳定TFD-DNA复合物复合物12,19,35TFA辅助辅助TBP-DNA结合结合TAF*结合结合TATA盒盒TBP* 38TFD功功能能亚基组成,分子量亚基组成,分子量(kD)转录因子转录因子蛋白激酶活性,使蛋白激酶活性,使CTD磷磷酸化酸化TFHATPase57( ) 34( )TFE解螺旋酶解螺旋酶30,74TFF促进促进RNA-pol结合及作结合及作为其他因子结合的桥梁为其他因子结合的桥梁33TFB稳定稳定TFD-DNA复合物复合物12,19,35TFA辅助辅助TBP-DNA结合结合TAF*结合结
17、合TATA盒盒TBP* 38TFD功功能能亚基组成,分子量亚基组成,分子量(kD)转录因子转录因子第三十三页,讲稿共一百零三页哦目目 录录3. 转录起始前复合物转录起始前复合物(pre-initiation complex, PIC) 真核生物真核生物RNA-polRNA-pol不与不与DNADNA分子直接结合,而分子直接结合,而需依靠众多的转录因子。需依靠众多的转录因子。 第三十四页,讲稿共一百零三页哦目目 录录POL-TFFAB由由RNA-Pol 催化转录的催化转录的PIC POL-TFFHETBPTAFTFD-A-B-DNA复合物复合物TATAABTBPTAFTATAHECTD-PPIC
18、组装完成,组装完成,TFH使使CTD磷酸化磷酸化第三十五页,讲稿共一百零三页哦目目 录录4. 4. 模板理论模板理论(piecing theory) (piecing theory) 一个真核生物基因的转录需要一个真核生物基因的转录需要3 3至至5 5个转录个转录因子。转录因子之间互相结合,生成有活性,因子。转录因子之间互相结合,生成有活性,有专一性的复合物,再与有专一性的复合物,再与RNARNA聚合酶搭配而有针聚合酶搭配而有针对性地结合、转录相应的基因。对性地结合、转录相应的基因。 第三十六页,讲稿共一百零三页哦目目 录录(二)转录延长(二)转录延长真核生物转录延长过程与原核生物大致相似,真
19、核生物转录延长过程与原核生物大致相似,但因有核膜相隔,没有转录与翻译同步的现象。但因有核膜相隔,没有转录与翻译同步的现象。 RNA-polRNA-pol前移处处都遇上核小体。前移处处都遇上核小体。 转录延长过程中可以观察到核小体移位和解聚转录延长过程中可以观察到核小体移位和解聚现象。现象。 第三十七页,讲稿共一百零三页哦目目 录录RNA-PolRNA-PolRNA-Pol核小体核小体转转录录延延长长中中的的核核小小体体移移位位转录方向转录方向第三十八页,讲稿共一百零三页哦目目 录录5 -AAUAAA-5 -AAUAAA-核酸酶核酸酶-GUGUGUGRNA-polAATAAA GTGTGTG转录
20、终止的修饰点转录终止的修饰点5 5 3 3 3 3 加尾加尾AAAAAAA 3 mRNA(三)转录终止(三)转录终止 和转录后修饰密切相关。和转录后修饰密切相关。第三十九页,讲稿共一百零三页哦目目 录录真核生物的转录后修饰真核生物的转录后修饰Post-transcriptional Modification第三节第三节第四十页,讲稿共一百零三页哦目目 录录几种主要的修饰方式几种主要的修饰方式1. 剪接剪接(splicing)2. 剪切剪切(cleavage)3. 修饰修饰(modification)4. 添加添加(addition)第四十一页,讲稿共一百零三页哦目目 录录一、真核生物一、真核生
21、物mRNA的转录后加工的转录后加工(一)首、尾的修饰(一)首、尾的修饰 5 端形成端形成 帽子结构帽子结构(m7GpppGp ) 3 3 端加上端加上多聚腺苷酸尾巴多聚腺苷酸尾巴(poly A tail)(poly A tail)第四十二页,讲稿共一百零三页哦目目 录录帽子结构帽子结构第四十三页,讲稿共一百零三页哦目目 录录5 pppGp5 GpppGppppG ppi鸟苷酸鸟苷酸转移酶转移酶5 m7GpppGp甲基转移酶甲基转移酶SAM帽帽子子结结构构的的生生成成5 ppGp磷酸酶磷酸酶 Pi第四十四页,讲稿共一百零三页哦目目 录录(二)(二)mRNA的剪接的剪接1. hnRNA 和和 sn
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