生物反应工程基本知识.ppt

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1、学习目的：The Objective of Study 1）了解生物反应工程的学科定义、特点和发展形成史； 2）明确学习生物反应工程课程的目的与关键点； 3）掌握学习生物反应工程的主要内容与学习方法。,第一章 绪论 Chapter 1. Introduction,一、生物反应工程的定义与特点 二、生物反应工程学科的形成与发展 三、生物反应工程研究的目的 四、生物反应工程研究的内容与方法 五、举例 六、本课程参考书目及相关要求,第一章 绪论 Chapter 1. Introduction,1、生物反应工程的定义 2、生物反应工程的基础知识 3、生物反应工程的特点,一、生物反应工程的定义与特点 T

2、he Definition and Characteristics of Bioreaction Engineering,1、生物反应工程的定义Definition of Bioreaction Engineering,生物反应工程是一门以研究生物反应过程中带有共性的工程技术问题的学科。 是以生物学、化学、工程学、计算机与信息技术等多学科为基础的交叉学科。,以生物反应动力学为基础，将传递过程原理、设备工程学、过程动态学及优化原理等化学工程方法与生物反应过程的反应特性方面的知识相结合，进行生物反应过程分析与开发，以及生物反应器的设计、操作和控制等。,生物反应工程是工业生物技术的核心。,Biore

3、action Engineering From Bio-appearance to Bioprocess Design From Bioprocess Design to Systems Biology,2、生物反应工程的基础知识 Elementary Knowledge of Bioreaction Engineering,代谢工程是一门涉及利用基因工程的手段对细胞属性进行改造的工程，根据不同的生物过程和所需目标，设计方案和引用的方法也不同.,步骤：（1）合成：构建重组菌株以提高细胞特性;（2）分析：对重组菌株进行分析，特别是对照出发菌株的属性进行分析;（3）设计：设计代谢工程方案（Niel

4、sen 2001）。,“个别的学问 knowledge of individuation”，解决怎样做一件事情，技术会随着时代变迁而变化。 具体的技术可以用记述的方法来表现。,Technology,研究一般化方法的学问，具有超越时代的持续性和普遍性，内容是抽象的。 抽象的方法除表现为数学的使用外，更重要的是掌握“工程思维”（engineering sense)方法。 工程本质上是具有价值取向的主体作用于客体、主观思维物化为客观实体的一种目标导向的活动和过程。,Engineering,生物技术（工程）bioengineering/biotechnology ：,生物技术是应用自然科学及工程学的原

5、理，依靠生物催化剂（biological agents)的作用将物料进行加工以提供产品或为社会服务的技术。 1982年国际经济合作及发展组织,高技术：世界所拥有的先进技术构成的一个强大的、活跃的技术群体，叫做高技术。高技术凝聚着人类早期的发明和近期的创造，代表着当代的科技文明。 我国正在实行的高技术：生物技术、信息技术、新材料技术、新能源技术、海洋技术、空间技术。 生物技术（工程）的研究内容：基因工程；酶工程；细胞工程；发酵工程；生物反应器；生化分离工程；,生物技术的特点,多学科、多技术的结合,生物作用剂（生物催化剂）的参与,目的是建立工业生产过程或进行社会服务，这一过程称为生物反应过程（ b

6、ioprocess),多学科性:,它是一门多学科、综合性的科学技术。,生物催化剂:,建立工业生产过程:,生物技术最后的目的是建立工业生产过程或进行社会服务，称为生物反应过程（bioprocess）。,生物（生化）反应过程：,从应用的观点出发可将生物技术进行如下分类：,工业生物技术 农业生物技术 医药生物技术 环境生物技术,生物现象Bio-appearance,从自然现象说起： 最初原始性的种植方式到现代化农业; 由无序到计划性。 从我们每一个人，即个体说起： 由上帝创造人类到生命起源的。 从现代化的生物工业生产而言： 由单一需求到协调发展。,如何从生物现象中抽象出共性的内容,从宏观看 以获得生

7、物量为目的： 生物合成速率影响因素（生物体、基质、环境 因素、操作条件等） 以获得目的产物为目的： 从微观看 转录与转译速率=（基因量、.等) 调控速率=（表达速率、酶活力、等）,工程思维方法Engineering sense method,Adaptability 生物适应性(或可行性） Continuity 可持续性 Fixed quantity of process 过程的量化 Economy 经济性 Efficiency 效率 ,生物反应过程与化学反应过程本质的区别是有生物催化剂参与反应。特点： 1）反应在温和的条件下进行； 2）反应速率比化学反应过程慢很多； 3）反应的复杂性有时难于

8、预计。 共性的基本问题： 1）反应过程的定量； 2）动力学研究；,3、生物反应工程的特点 Characteristics of Bioreaction Engineering,二、生物反应工程学科的形成与发展The Evolution of Bioreaction Engineering,史前时代，人们还不知道什么是酶或微生物时，就已利用它们进行有用物质生产了。,龙山文化（距今4000-4200年）已有酒具出现。公元前200年，作豆腐、酱油和酿醋。在我国最早的诗集诗经中就提出过采用厌氧进行亚麻浸渍处理。公元10年有了天花的活疫苗。,1857年巴斯德（Pasteur）证明酒精发酵是由活酵母引起的

9、。1859年，首次证明乙醇发酵机理。,第一次第二次世界大战：深层培养技术、无菌空气制备技术的建立生物化学工程诞生。 1971年，英国学者巴特金逊（Batkinson）首次提出生化反应工程这一术语。,1975年，作为生化工程领域开创人之一的日本学者合叶修一出版了关于生化动力学方面的专著生物化学工程反应动力学； 1979年，日本学者山根恒夫编著了生物反应工程一书；2006年，清华大学邢新会翻译原著第三版。 1985年，德国学者许盖得（Schugerl）出版了生物反应工程专著； 1993年，日本学者川濑义矩出版了生物反应工程基础一书； 1994年，丹麦学者尼尔森（Nielsen）等编著了生物反应工程

10、原理一书； 在此期间，我国学者也编著出版了生物反应工程原理（1990）、生物工艺学（1992）、生化工程（1993）和生化反应动力学与反应器（1996和1998）等书籍。,20世纪90年代基因工程与生物反应工程不断融合、发展。,2000年后人类基因组计划的完成，后基因组计划的进行，特别是Metabolic Engineering and Systems Biology的形成与发展，给生物反应工程技术带来新的发展机遇。,如果生物反应现象仅是通过物理学家或化学家用机械的语言、化学的语言、物理语言来描述，一定是将生物反应分解至分子，或更小的单位，然后再以此为基础把生物现象简化为化学过程或物理过程，这

11、种将生物现象简化的方法，无疑将抛弃生物反应的本质特征。 另外，由于决定生物生命的最小单位是细胞，因此，细胞个体之间的相互影响也是利用生物过程获得目的产物的技术人员不得回避的问题，但是，以往由于多种原因，无法开展相关的研究。细胞之间的相互影响与细胞内部反应的相互作用必然涉及影响强弱和时间的长短问题，而这必要需要一些工程学方法来解决，因此，也就给生物反应工程技术带来新的机遇与挑战。,分子生物学面临的挑战 ！？,三、生物反应工程研究的目的Objective of Bioreaction engineering,1、生化反应过程（工程）： 广义概念：自然界中的生物现象千变万化（如植物的生长、微生物的无

12、处不在、酶促反应所起的关键作用等），这些变化中起主导作用的是生物催化反应，或者说是生物的生长、繁殖、形成产物、某种物质的减少或增加的过程。 狭义概念：生物反应工程是指将实验室的成果经放大而成为可供工业化生产的工艺过程，包括实现工业化生产过程的高效率运转，或者说提高生产过程效率。,生物反应过程效率:,提高生物反应过程效率，即确保反应过程效率最大化。 Rateproduct（timemassenergy） Example： Enzyme glucose gluconic acid rf（pH、temp、Si、P、DO）,（1）生物反应过程-示意图,生物催化剂（酶、细胞、动植物）,种子,生化反应器,

13、无菌空气,产物提取与精制,副产物,产物,废弃物,检测控制系统,培养基制备与灭菌,原料及其处理,（2）生物反应过程的四个组成部分,原材料的预处理及培养基的制备； 生物催化剂的制备； 生物反应器及反应条件的选择与监控； 产物的分离纯化工程；,（3）生物反应过程的特点,采用生物催化剂； 采用可再生资源为主要原料； 反应器； 产物提取、纯化较难、复杂,生物反应的实质：,利用生物催化剂从事生物技术产品的生产过程。 温和条件下（常温、常压、pH接近中性等）进行反应。 对反应过程进行定量的、动力学方面的研究是各自所要探讨的最基本的问题。,2、生物反应过程研究的目的,ObjectiveEnhance Prod

14、uctivity （1）提供适宜的动力学速率方程，以描述微生物（或酶、动植物等）反应体系； （2）确定这些方程在设计方面的用途，规划实验室的实验，决定动力学方程所需的速率常数。 （3）从生物反应器设计和操作的角度，研究生物反应速率和与之相关影响因素之间的定量与定性的关系。,四、生物反应工程研究的内容与方法 Content and Method,1、生物反应过程分类 2、生物反应工程的研究内容 3、生物反应工程的研究方法,1、生物反应过程的分类Classification of Bioreaction Process,根据生物体的不同生物反应过程分为： 酶催化反应过程 细胞反应过程（包括单一微生

15、物细胞、多种微生物细胞和混合反应、动植物细胞培养等）。 废水的生物处理过程 见P4表1-1生物反应过程的分类及其特征,酶催化反应过程 采用游离或固定化酶为催化剂时的反应过程。 细胞反应过程 采用活细胞为催化剂时的反应过程： 微生物细胞反应过程发酵工程； 固定化细胞反应过程和动、植物细胞反应过程细胞工程；,废水的生物处理过程,利用微生物本身的分解和净化能力，除去废水中污浊物质的过程。 特点： （1）由细菌等菌类、原生动物、微小后生动物等各种微生物构成的混合培养系统； （2）几乎全部采用连续操作； （3）微生物所处的环境条件波动大； （4）反应的目的是消除有害物质而不是生成代谢产物和微生物细胞本身

16、；,简介其他分类方法,按获取能量的方式分好氧发酵，厌氧发酵 按产物类型分初级代谢产物发酵，次级代谢产物发酵；食品发酵，有机酸发酵，氨基酸发酵，维生素发酵，抗生素发酵 按操作类型分自然发酵，纯种发酵，混种发酵；分批发酵，半连续发酵，连续发酵；固态发酵，液态发酵 反应产物或服务的性质 按产物所属国民经济部门,2、生物反应工程的研究内容Content of Bioreaction engineering,生物反应工程以工业规模的生物反应过程为主要研究对象，具体研究中兼顾可操作性。 生物反应动力学 生物反应器 生物反应过程的放大与缩小,生物反应动力学,生物反应动力学主要研究生物反应速率和影响反应速率的

17、各种因素。 基本内容： 1）酶反应动力学的特点、均相和多相系统酶促反应动力学及酶的失活动力学； 2）微生物反应过程的质量与能量衡算、发酵动力学和微生物的培养操作技术； 3）影响动植物细胞反应的因素、动植物细胞反应及反应动力学。,生物反应器,生物反应器是使生物技术转化为产品和生产力的关键设备。 1）生物反应体系中的流变学特性、氧的传递与微生物呼吸、体积溶氧系数及相关因素、溶氧方程及溶氧速率调节； 2）酶反应器及设计、机械搅拌式发酵罐及设计、气升式生化反应器设计、生物废水处理设备及动植物细胞培养用反应器等； 3）分批、流加和连续式操作，及动植物细胞培养技术等。,生物反应过程的放大与缩小,1）探讨各

18、种类型生物反应的内在规律； 2）从概念上注意与相关学科的区别； 3）要全面、深入地看待问题； 4）确立评价生物反应过程的标准。,Content内容,Foundation of Biology and Engineering Enzyme Kinetics Biochemical Reactions Design of Fermentaton Processes Mass Transfor Scale-Up of Bioprocesses Advance of Bioreaction Engineering,Bioreaction Kinetics, Bioreactors and Scale-

19、Up of Bioprocesses,3、生物反应工程的研究方法Method of Bioreaction engineering,1）通过生物反应过程分析和生物反应器选型与设计，阐明酶促反应过程的动力学规律。 2）以基本生物反应器为基础，通过例题，讨论进行生物反应器设计与分析的基本原理和方法。 3）生物反应工程领域中新的拓展。,Method (or要注意的事项),注重归纳各类生物反应的内在规律。 注重基本理论所包含的“工程含义”。 注重从多层次考察生物反应过程。 注重生物反应过程的评价标准。 ,五、举例 Illustrate with Examples,抗生素青霉素 罗伯茨（W. Rober

20、ts，1874)首次报道微生物的颉颃（xie hang）现象（antagonism）灰绿青霉生长旺盛的液体会使人工感染细菌困难 廷德尔（J.Tyndall,1876）青霉菌与细菌液体培养中有颉颃现象 巴斯德和朱伯特（J.F.Joubert，1877)用炭疽芽孢杆菌培养物感染动物 巴比斯和科尼尔（V.Babes & A.V.Cornil,1885)细菌之间 ,弗莱明（1928）发现青霉素并将青霉素培养物的滤液中所含抗细菌的物质称为“青霉素”,化学家钱恩（E.Chain）获得精制品，1940在美国产业化,当前水平6000080000U/ml(150m3),牛津大学弗洛里 （H.florey，193

21、8 1939）,微生物学家和生物化学家赛尔曼阿勃拉罕姆 瓦克斯曼发现链霉素“痨病”有克星,六、本课程参考书目及相关要求 Referrence and Require,教材： 贾士儒编著， 生物反应工程原理(第三版),科学出版社， 普通高等教育“十一五”国家级规划教材，,2008年7月；,参考书（国外）： 1、1975年日本，合叶修一等，生物化学工程-反应动力学； 2、生物反应工程，（日）山根恒夫著，邢新会译，化学工业出版社，2006年（1979年）原著第三版； 3、1985年德国，许盖特（Schugerl），生物反应工程； 4、1993年日本学者川濑义矩，生物反应工程基础； 5、1994（02

22、）年丹麦学者Nielsen ，生物反应工程原理,参考书（国内）： 1、发酵过程原理，叶勤编著，化学工业出版社，2005年 2、生化反应动力学与反应器，戚以政、汪叔雄编著，化学工业出版社，1999年第二版； 3、生物反应器工程，张元兴、许学书编，华东理工大学出版社； 4、生物工艺学，俞俊棠、唐孝宣主编（上、下册），华东理工大学出版社； 5、发酵工程最优化控制，钱铭镛著，江苏科学技术出版社； 6、生化工程，王岁楼、熊卫东主编，中国医药科技出版社；,考试要求,1、成绩分两部分 考试成绩：闭卷考试占70%； 平时成绩：30%。 2、平时成绩 课堂测验或习题； 出勤； 课程论文撰写与本课程相关的综述论文

23、一篇； 论文翻译阅读和翻译与本课程相关的英语论文一篇； 课程论文和论文翻译选译其一，本学期第六周周二前（4月6日）交。,Problem 本章复习题：,1、什么是生物反应工程、生化工程和生物技术？ 2、生化反应工程研究的主要内容是什么？ 3、生化反应工程的研究方法有哪些？ 4、解释生物反应工程在生物技术中的作用。 5、为什么说代谢工程是建立在生物反应工程与分子生物学的基础之上？ 6、何为系统生物学？ 7、简述生化反应工程的发展史。 8、如何理解加强“工程思维能力”的重要性。 9、为生命在当今分子生物学渗入到各生物学科领域的同时，工程思维也成为当今从事生物工程工作人员共同关注的话题？,本章小结Summarize,生物技术作为解决当今人类健康、能源、环境和可持续发展的高新技术已是人们的共识。而从生物技术理论到有价值的生物技术产品离不开工程技术。 在传统的经验性酿造过程进入到对生物反应过程进行定量解析或理论分析时代，离不开生物反应工程方面的理论作为支撑。 并且，在分子生物学飞跃发展的今天,也越来越显得重要。所以，通过生物反应过程课程的学习，使生物工程专业学生对这一领域的发展有清楚的了解，为下一步学习、掌握基本理论知识打好基础。,End Thanks!,