微生物第5章分类与鉴定.ppt

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1、关于微生物第5章分类与鉴定现在学习的是第1页，共25页一、生物的系统发育和进化o1、对生物分类的两种原则：o传统：根据表形特征的相似程度分类。重在应用，不以反应生物之间的进化关系为目的o现代：通过比较不同物种间基因序列的相关性来类，目的是探寻各物种间的进化关系，建立反映生 物发育相关性的分类系统。现在学习的是第2页，共25页2、传统的分类体系o17531753年：瑞典人林奈（Carrolus LinneausCarrolus Linneaus）两界分类系统：生物 动物 植物o19691969年：惠特克 （R.H.WhittakerR.H.Whittaker）：原核生物界：细菌、蓝细菌 原生生物

2、界：原生动物、单细胞藻类五界系统 真菌界：真菌、酵母菌 植物界 动物界现在学习的是第3页，共25页3、反映生物系统发育相关性的进化计时器o 生物A A、B间的 生物B 进化关系o理想的生物进化计时器应具备的条件：见书o原核生物核糖体（70S）：大亚基（50S）：蛋白质+23SrRNA+5SrRNA 小亚基（30S）：蛋白质+16SrRNAo真核生物核糖体（80S）：大亚基（60S）：蛋白质+28SrRNA+55.8 SrRNA 小亚基（40S）：蛋白质+18SrRNA 比较两者核苷酸 or 氨基酸序列差异（进化计时器）现在学习的是第4页，共25页 o 20世纪70年代，沃斯（Carl Woes

3、e）根据生物核糖体中 18SrRNA 和 16SrRNA 的碱基序列将生物划分为3个 “域（domain)“或称“原界”：o 古细菌原界（Archaea）：甲烷菌，嗜盐菌，嗜热菌等o 真细菌原界（Bacteria）：除古细菌外的其它原核生物o 真核生物原界(Eukarya)：原生生物、真菌、动物、植物4、三域分类学说现在学习的是第5页，共25页生物的三原界系统发育树现在学习的是第6页，共25页二、微生物的分类单元和命名：1、种以上的微生物分类单元：界（KingdomKingdom）、门（PhylumPhylum）、纲（ClassClass）、目（OrderOrder）、科（FamilyFami

4、ly）、属（GenusGenus）、种（SpeciesSpecies）2、对于微生物来说，种的概念：表型特征和包括16SrRNA在内的基因序列特征高度相似的菌株群，而且这个菌株群和其它类群有明显差异。3、种以下的分类概念：o 菌株（strain）、模式菌株（typestrain）o 亚种（subspecies）o 型（form）：生物型、血清型、噬菌体型 现在学习的是第7页，共25页 4菌种学名 （1）按国际细菌命名法规命名的，国际公认，通用的正式菌种名字。采用林奈的双名法：学名：属名+种名加词 （字母均为斜体）属名：拉丁文或希腊文，名词，单数，第一个字 母大写，描述微生物的一般的、主要的特性

5、。种名加词：拉丁文或希腊文，形容词，字母小写，描述该菌种具体、次要特征。例：o金黄色葡萄球菌：StaphylococcusStaphylococcus aurousaurouso结核分枝杆菌：MycobacteriumMycobacterium tuberculosistuberculosis现在学习的是第8页，共25页 o 如果泛指某一属的微生物，或某菌种，知其属但种名未定，可用“sp”“spp”sp”“spp”作加词：o BacillusBacillus spsp:一个尚未定名的芽孢杆菌o BacillusBacillus sppspp:泛指芽孢杆菌属的菌种（2）种以下分类：o亚种（sub

6、species,subspsubspecies,subsp）指某一明显而稳定的特征与模式种不同的种，例：蜡状芽孢杆菌的蕈状亚种：BacillusBacillus cereus cereus subsp.subsp.MycoidesMycoideso变种（Variety,VarVariety,Var）:现不正式使用，枯草芽孢杆菌黑色变种：BacillusBacillus subtilissubtilis var.var.nigerniger现在学习的是第9页，共25页 o 菌株（strainstrain）:由一个独立的单细胞繁殖形成的微生物纯种群体，使用较广泛。某菌种的菌株名称加在菌种学名之后，

7、可任意取名，例：华癸中生根瘤菌 7653R7653R菌株：Mesorhizobium huakuii Mesorhizobium huakuii 7653R7653R费氏中华根瘤菌 USDA205USDA205株：Sinorhizobium frediiSinorhizobium fredii USDA205 USDA205o同一菌种学名在一篇文章中首次出现时应写全称，第二次出现，属名可只写第一个字母,字母右下加圆点，以示缩写：o Escherichia coli E.coli Escherichia coli E.coli 现在学习的是第10页，共25页三、原核生物的鉴定和分类方法 o传统分

8、类依据：表型特征o现代分类依据：以遗传型特征为依据的分子分类（一）传统分类方法o高等动物：外部形态、内部解剖结构o种子植物：生殖器官特征：花、果实o微 生 物：微生物形体小，类型多，变异大，微生物分 类、鉴定的依据远较其他生物复杂：现在学习的是第11页，共25页o个体形态：细胞形状、大小、特殊结构（如芽孢、鞭毛、荚膜）、革兰氏染色反 应 等o群体形态：在固体琼脂上的菌落形态、斜面菌苔特征、液体培养特征o生理生化反应：产能方式、与氧气关系、碳源氮源利用、糖发酵、乙酰甲基甲醇试验（V.P）、）、吲哚试验、明胶液化、淀粉水解、产氨试验 等o血清学试验o噬菌体分型现在学习的是第12页，共25页Diff

9、erent Shapes1、细菌的个体与群体形态 （1）细菌的个体形态现在学习的是第13页，共25页 o （2）细菌的排列方式：母细胞 子细胞 立即分开 分散个体 不立即分开 形成各种排列方式 o不同排列方式多见于球菌，是球菌的分类依据之一：单球菌、双球菌、链球菌、四联球菌、八叠球菌、葡萄球菌o杆菌多为单生（E.coliE.coli）或排成链状(B.tB.t)，对分类意义不大 现在学习的是第14页，共25页现在学习的是第15页，共25页现在学习的是第16页，共25页（3）细菌的群体形态o细菌在自然环境或培养基上大量繁殖后，形成肉眼可见的群体。o在固体培养基上由单个细胞生长繁殖形成的群体称为菌落

10、（colonycolony）；o 现在学习的是第17页，共25页 o细菌在固体琼脂平板上形成的菌落特征可作为分类鉴定的依据，如：菌落大小、形状颜色、光泽、隆起状况等。o 细菌在斜面、半固体、液体等培养条件下也有不同生长特征，可作为分类鉴定的依据。现在学习的是第18页，共25页现在学习的是第19页，共25页2、常用分类方法o二分法o数值分类法（Numerical taxonomyNumerical taxonomy）见书3、分子分类法：oG+CG+C 百分比的测定o核酸杂交o16 SrRNA 16 SrRNA 碱基测序4、细菌鉴定的自动分析技术oAPI系统oBiolog系统现在学习的是第20页，

11、共25页oAPIAPI细菌鉴定系统现在学习的是第21页，共25页o适用于肠道厌氧细菌的Enterotube鉴定系统现在学习的是第22页，共25页 四、原核生物的分类系统 美国微生物学会组织编写的鉴定细菌的两部工具书1伯杰氏鉴定细菌学手册 （Bergeys Manual of Determinative Bacteriology）该书根据细菌形态和生理特征进行分类，其分类体系被世界各国普遍接受o 1923年第 1 版o 1994年第 9 版：以细菌形态和生理类型为依据，结 合系统发育知识，将细菌分为 35 个群，4个大类：1.具 Cell wall的 G-真细菌 2.具 Cell wall的 G+真细菌 3.无 Cell wall真细菌 4.古细菌现在学习的是第23页，共25页2伯杰氏系统细菌学手册 （Bergeys Manual of Systematic Bacteriology）o该书在该书在伯杰氏鉴定细菌学手册基础上，建立了以核酸杂交、16SrRNA序列相似性为主要依据的分类体系。o 第1版：四卷，1984-1989年出版o 第2版：五卷，2001 现在陆续出版。第2版 古菌域：泉古菌门、广古菌门 细菌域：24个门现在学习的是第24页，共25页感谢大家观看感谢大家观看现在学习的是第25页，共25页