分子生物学基础知识讲稿.ppt
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1、第一页,讲稿共九十五页哦(deoxyribonucleic acid,DNA)(ribonucleic acid,RNA)脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸 核糖核酸核糖核酸核苷酸核苷酸核苷核苷碱基碱基磷酸磷酸戊糖戊糖核糖核糖脱氧核糖脱氧核糖嘌呤嘌呤嘧啶嘧啶第二页,讲稿共九十五页哦(一一)碱碱 基基1 1、特性:、特性:共轭性分子结构,共轭双键,共轭性分子结构,共轭双键,260nm260nm处有最大吸收处有最大吸收NNNHN123456789嘌呤嘌呤(purine)弱碱性,低弱碱性,低PHPH值时可接受质子值时可接受质子NNH132456嘧啶嘧啶(pyrimidine)碱基间存在疏水堆积力碱基间存在疏水
2、堆积力第三页,讲稿共九十五页哦2 2、种类和结构:、种类和结构:嘌呤嘌呤NNNHN123456789NNNHNNH2腺嘌呤腺嘌呤(adenine,A)NNHNHNNH2O鸟嘌呤鸟嘌呤(guanine,G)第四页,讲稿共九十五页哦NNH132456嘧啶嘧啶胞嘧啶胞嘧啶(cytosine,C)NNHNH2O尿嘧啶尿嘧啶(uracil,U)NHNHOO胸腺嘧啶胸腺嘧啶(thymine,T)NHNHOOCH3第五页,讲稿共九十五页哦(二二)戊戊 糖糖(构成(构成DNA)OHOCH2OHOH2 2、脱氧核糖脱氧核糖(deoxyribose)(构成(构成RNA)12345OHOCH2OHOHOH1 1、核
3、糖核糖(ribose)2 2OH OH 亲水极性集团亲水极性集团 易水解易水解 易受攻击易受攻击RNARNA不稳定性不稳定性无无2 2OHOH,DNADNA相对稳定相对稳定第六页,讲稿共九十五页哦(三三)核核 苷苷戊糖戊糖C1C1嘌呤嘌呤N9N9嘧啶嘧啶N1N1糖苷键糖苷键/糖甙键糖甙键核糖核苷核糖核苷脱氧核糖核苷脱氧核糖核苷OHOCH2OHOHNNNH2O11第七页,讲稿共九十五页哦(四四)核苷酸核苷酸POOOHOHOCH2OHOHNNNH2O第八页,讲稿共九十五页哦2 2、游离核苷酸、游离核苷酸NOCH2OOHOHNNNNH2POOHOPOOHOPOOHOHNOCH2OOHOHNNNNH2
4、POOHOPOOHOHNOCH2OOHOHNNNNH2POOHOH第九页,讲稿共九十五页哦(五五)核酸的一级结构核酸的一级结构1 1、定义、定义核酸中核苷酸的排列顺序。核酸中核苷酸的排列顺序。由于核苷酸间的差异主要是由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基不同,所以也称为碱碱基序列基序列。55端端3端端CGA2 2、核苷酸链的方向性:、核苷酸链的方向性:PO4OH55端端33端端第十页,讲稿共九十五页哦3 3、一级结构的表示方法、一级结构的表示方法 结构式结构式/线条式线条式/字母式字母式A G P5 P T PG PC PT P OH 3 5 pApCpTpGpCpT-OH 3 5
5、A C T G C T 3 55端端3端端CGA磷酸基团磷酸基团3535磷酸二酯键磷酸二酯键羟基羟基第十一页,讲稿共九十五页哦 DNA一级结构的基本特点一级结构的基本特点 4种种dNTP以以3、5磷酸二酯键相连构成一个磷酸二酯键相连构成一个没有分枝的线性大分子。它们的两个末端分别没有分枝的线性大分子。它们的两个末端分别称称5末端(游离磷酸基)和末端(游离磷酸基)和3末端(游离羟末端(游离羟基)。基)。第十二页,讲稿共九十五页哦思考题:思考题:ATGGTTAGATGGTTAG的互补序列:的互补序列:A A、TACCGAATCTACCGAATC B B、CTAAGCCATCTAAGCCAT ATG
6、GTTAGATGGTTAG的反向互补序列:的反向互补序列:A A、CTAACCATCTAACCAT第十三页,讲稿共九十五页哦DNARNA碱基碱基 AGCT AGCU戊糖戊糖 脱氧核糖脱氧核糖 核糖核糖结构结构 双链双链 大多单链,局部双链大多单链,局部双链配对配对 AT AU G C G C 第十四页,讲稿共九十五页哦(一一)DNA的二级结构的二级结构 双螺旋结构双螺旋结构第十五页,讲稿共九十五页哦1 1、特征、特征反向平行的双螺旋反向平行的双螺旋反向平行反向平行配对规律配对规律a.a.疏水碱基平面处于内侧,亲水戊糖与疏水碱基平面处于内侧,亲水戊糖与磷酸骨架处于外测磷酸骨架处于外测第十六页,讲
7、稿共九十五页哦第十七页,讲稿共九十五页哦右手螺旋右手螺旋每周每周1010个碱基,每对碱基个碱基,每对碱基3636,碱基平面距离,碱基平面距离0.34nm0.34nm存在大沟、小沟存在大沟、小沟(大沟和小沟分别指双螺旋表面凹下去的较大沟大沟和小沟分别指双螺旋表面凹下去的较大沟槽和较小沟槽。槽和较小沟槽。)稳定因素稳定因素横向:氢键横向:氢键纵向:碱基疏水堆积力纵向:碱基疏水堆积力第十八页,讲稿共九十五页哦ABZ第十九页,讲稿共九十五页哦 Z-DNA是比较特殊的,它与其他是比较特殊的,它与其他DNA不同之处在于它是不同之处在于它是在减数第一次分裂前期中的偶线期产生的,约占在减数第一次分裂前期中的偶
8、线期产生的,约占DNA总总量的量的0.3%。当一段当一段Z-DNA形成时,其两端必为形成时,其两端必为B-Z相互结合型态,形相互结合型态,形成与成与B-DNA的接口。的接口。Z-DNA能够与能够与B-DNA构成相互结合型态,这种结构会使构成相互结合型态,这种结构会使一对碱基突出于双螺旋之外。一对碱基突出于双螺旋之外。第二十页,讲稿共九十五页哦ABZB-DNA第二十一页,讲稿共九十五页哦(二二)DNA)DNA的三级结构的三级结构 超螺旋结构超螺旋结构超螺旋结构超螺旋结构(superhelix(superhelix 或或supercoil)supercoil)DNADNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋
9、结构。双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构。正超螺旋正超螺旋(positive supercoil)(positive supercoil)盘绕方向与盘绕方向与DNADNA双螺旋方同相同双螺旋方同相同 负超螺旋负超螺旋(negative supercoil)(negative supercoil)盘绕方向与盘绕方向与DNADNA双螺旋方向相反双螺旋方向相反 第二十二页,讲稿共九十五页哦第二十三页,讲稿共九十五页哦多级螺旋模型多级螺旋模型压缩倍数压缩倍数 7 6 40 5 (8400)DNA 核小体核小体 螺线管螺线管 超螺线管超螺线管 染色单体染色单体 2nm 10nm 30(10)nm 400nm
10、 210m 一级包装一级包装 二级包装二级包装 三级包装三级包装 四级包装四级包装第二十四页,讲稿共九十五页哦(一一)DNA的基本功能的基本功能:以基因的形式荷载遗传信息,作为基因复制的模板,是生命遗以基因的形式荷载遗传信息,作为基因复制的模板,是生命遗传的物质基础。传的物质基础。是转录的模板,是个体生命活动的信息基础。是转录的模板,是个体生命活动的信息基础。(二二)基本概念基本概念:基因基因(gene)(gene):携带遗传信息的:携带遗传信息的一段特定的核苷酸序列一段特定的核苷酸序列,可自我复制并,可自我复制并指导转录。指导转录。基因组基因组(genomic)(genomic):一个生物体
11、所包含的全部遗传信息的总和,:一个生物体所包含的全部遗传信息的总和,即全部即全部DNADNA序列。序列。遗传密码遗传密码(genetic code)(genetic code):DNADNA碱基序列与蛋白质的氨基酸序列碱基序列与蛋白质的氨基酸序列之间存在的对应关系。之间存在的对应关系。起始密码起始密码(ATG)(ATG)AUG AUG 终止密码:终止密码:UAA UAG UAA UAG UGAUGA第二十五页,讲稿共九十五页哦(一一)RNA的结构特征的结构特征:组成:核糖组成:核糖 碱基碱基A U C GA U C G单链,局部形成双链。单链,局部形成双链。含稀有碱基较多含稀有碱基较多DHU(
12、DHU(二氢尿嘧啶二氢尿嘧啶),T T(假尿嘧啶),甲基化,(假尿嘧啶),甲基化,甲羟化,乙酰化等甲羟化,乙酰化等第二十六页,讲稿共九十五页哦1、参与基因表达的、参与基因表达的RNA信使信使RNA(mRNA):遗传信息的传递,翻译模板):遗传信息的传递,翻译模板转运转运RNA(tRNA):氨基酸载体):氨基酸载体核糖体核糖体RNA(rRNA):提供蛋白质合成的场所):提供蛋白质合成的场所2、核不均一、核不均一RNA(hnRNA):mRNA的前体的前体3、核内小、核内小RNA(snRNA):参与):参与hnRNA的剪接、转运的剪接、转运4、核仁小核仁小RNA(snoRNA):参与):参与rRNA
13、的加工修饰的加工修饰 5、胞质小、胞质小RNA(hnRNA):运输新合成的运输新合成的Pr到高尔基体加工到高尔基体加工6、小片段干扰、小片段干扰RNA(siRNA):诱发外源):诱发外源mRNA的降解的降解第二十七页,讲稿共九十五页哦含量最少含量最少种类繁多种类繁多半衰期最短半衰期最短原核生物原核生物mRNA为为多顺反子多顺反子 真核生物真核生物mRNA为为单顺反子单顺反子1、mRNA的特征:的特征:第二十八页,讲稿共九十五页哦2、真核生物、真核生物mRNA的帽子结构:的帽子结构:类型类型 m7G 5ppp 5 Np (O型型)m7G 5ppp 5 NmpNp (I型型)m7G 5ppp 5
14、NmpNmpNp(II型型)第二十九页,讲稿共九十五页哦Human wild p16 mRNACtcctccgagcactcgctcacggcgtccccttgcctggaaagataccgcggtccctccagaggatttgagggacagggtcggagggggctcttccgccagcaccggaggaagaaagaggaggggctggctggtcaccagagggtggggcggaccgcgtgcgctcggcggctgcggagagggggagagcaggcagcgggcggcggggagcagcatggagccggcggcggggagcagcatggagccttcggctga
15、ctggctggccacggccgcggcccggggtcgggtagaggaggtgcgggcgctgctggaggcgggggcgctgcccaacgcaccgaatagttacggtcggaggccgatccaggtcatgatgatgggcagcgcccgagtggcggagctgctgctgctccacggcgcggagcccaactgcgccgaccccgccactctcacccgacccgtgcacgacgctgcccgggagggcttcctggacacgctggtggtgctgcaccgggccggggcgcggctggacgtgcgcgatgcctggggccgtctgcc
16、cgtggacctggctgaggagctgggccatcgcgatgtcgcacggtacctgcgcgcggctgcggggggcaccagaggcagtaaccatgcccgcatagatgccgcggaaggtccctcagacatccccgattgaaagaaccagagaggctctgagaaacctcgggaaacttagatcatcagtcaccgaaggtcctacagggccacaactgcccccgccacaacccaccccgctttcgtagttttcatttagaaaatagagcttttaaaaatgtcctgccttttaacgtagatatatgccttccc
17、ccactaccgtaaatgtccatttatatcattttttatatattcttataaaaatgtaaaaaagaaaaacaccgcttctgccttttcactgtgttggagttttctggagtgagcactcacgccctaagcgcacattcatgtgggcatttcttgcgagcctcgcagcctccggaagctgtcgacttcatgacaagcattttgtgaactagggaagctcaggggggttactggcttctcttgagtcacactgctagcaaatggcagaaccaaagctcaaataaaaataaaataattttcattcat
18、tcactca第三十页,讲稿共九十五页哦功能功能a、稳定、稳定mRNAb、有利于、有利于mRNA由核内到胞浆的转位由核内到胞浆的转位c、有利于与核糖体蛋白的结合、与翻译起始蛋白的结合、有利于与核糖体蛋白的结合、与翻译起始蛋白的结合3、真核生物、真核生物mRNA的的3 poly(A)尾巴:)尾巴:结构:结构:200多个串联的聚合腺苷酸,多个串联的聚合腺苷酸,poly(A)长则半衰期长)长则半衰期长功能:功能:a、稳定、稳定mRNA模板模板 b、有利于从核内到胞浆的转运、有利于从核内到胞浆的转运第三十一页,讲稿共九十五页哦4、真核生物、真核生物mRNA的的5 非翻译区,非翻译区,3 非翻译区:非翻
19、译区:hnRNA(胞核)(胞核)内含子内含子(intron)mRNA(胞液)(胞液)外显子外显子(exon)DNA(胞核)(胞核)protein5 mG3 poly(A)第三十二页,讲稿共九十五页哦1、原核细胞和真核细胞的核糖体组成、原核细胞和真核细胞的核糖体组成原核细胞真核细胞(哺乳动物细胞)沉降常数近似分子量沉降常数近似分子量核蛋白体70S2.710680S4.6106小亚基30S0.910640S1.5106rRNA16S0.610618S0.7106蛋白质21种0.3106约30种0.78106大亚基50S2.010660S3.0106rRNA23S1.210628S1.71065.8
20、S4.01045S3.21045S3.2104蛋白质34种0.7106约50种1.37104第三十三页,讲稿共九十五页哦第三十四页,讲稿共九十五页哦2、rRNA的特征:的特征:分子量最大,含量最多占分子量最大,含量最多占RNA的的80 一级结构较保守,代谢稳定一级结构较保守,代谢稳定 含甲基化碱基较多,利于与蛋白质结合含甲基化碱基较多,利于与蛋白质结合 含有许多基环结构,存在大量氢键含有许多基环结构,存在大量氢键3、rRNA的二级结构的二级结构 基基/茎环结构茎环结构第三十五页,讲稿共九十五页哦2、rRNA的功能:的功能:在翻译的各阶段均与在翻译的各阶段均与tRNA、rRNA相互作用。相互作用
21、。小亚基上有帽结合蛋白的识别位点,识别小亚基上有帽结合蛋白的识别位点,识别mRNA的帽子结构的帽子结构1、一级结构:、一级结构:分子量最小分子量最小含有稀有碱基最多含有稀有碱基最多20个核苷酸是保守的,个核苷酸是保守的,10个核苷酸是恒定的个核苷酸是恒定的空间结构相似空间结构相似3端端CCAOH第三十六页,讲稿共九十五页哦2、空间结构:、空间结构:二级结构二级结构三叶草结构三叶草结构携带氨基酸携带氨基酸辨认并结合氨基酰辨认并结合氨基酰tRNA合成酶合成酶识别识别mRNA上的密码上的密码识别并结合识别并结合核蛋白体核蛋白体氨基酸臂氨基酸臂DHU臂臂反密码臂反密码臂可变臂可变臂T C臂臂第三十七页
22、,讲稿共九十五页哦 tRNA的三级结构的三级结构倒倒L形结构形结构第三十八页,讲稿共九十五页哦1、粘度、粘度 DNA RNA2、沉降系数、沉降系数 DNA RNA3、酸碱性质、酸碱性质 DNA PI 44.5,PH 4.0 11.0 稳定,稳定,提取提取pH8.0 RNA PI 22.5 提取提取pH4.5左右,混有很少左右,混有很少DNA污染污染第三十九页,讲稿共九十五页哦1、碱基的行为表现、碱基的行为表现 共轭双剑在共轭双剑在260nm有最大吸收有最大吸收第四十页,讲稿共九十五页哦2、应用、应用 测定浓度测定浓度 OD260=1.0 相当于双链相当于双链DNA 50g/ml 单链单链DNA
23、(或(或RNA)40g/ml 寡核苷酸寡核苷酸 20g/ml 判断核酸样品的纯度判断核酸样品的纯度 DNA纯品纯品:OD260/OD280=1.8 RNA纯品纯品:OD260/OD280=2.0 测定是否变性测定是否变性 DNA完全变性完全变性 增加增加 2540 RNA变性变性 增加增加 1.1左右左右第四十一页,讲稿共九十五页哦1、定义:通过加热、化学因素(尿素或者甲酰胺)等外力作用、定义:通过加热、化学因素(尿素或者甲酰胺)等外力作用DNA解螺解螺旋,由双链变成单链称为旋,由双链变成单链称为DNA变性。变性。2、变性因素:、变性因素:加热加热 强酸强碱强酸强碱 有机溶剂有机溶剂3、变性后
24、理化性质的改变、变性后理化性质的改变 增色效应增色效应碱基暴露碱基暴露 Tm值:值:DNA在加热变性过程中紫外吸收达最大值一半时的温度。在加热变性过程中紫外吸收达最大值一半时的温度。沉降系数增加沉降系数增加 粘度下降粘度下降第四十二页,讲稿共九十五页哦第四十三页,讲稿共九十五页哦4 4、复性:变性的、复性:变性的DNADNA在适当的温度、一定离子强度条件下,给以足够的在适当的温度、一定离子强度条件下,给以足够的时间重新缔合形成双螺旋的过程,称为复性。时间重新缔合形成双螺旋的过程,称为复性。5 5、影响复性的因素:、影响复性的因素:T T:Tm Tm 20202626 离子强度:降低带同种电荷单
25、链间的排斥离子强度:降低带同种电荷单链间的排斥 DNADNA浓度浓度 DNADNA复杂程度复杂程度6 6、分子杂交:不同来源的具有互补序列的两条核酸单链,在一定条、分子杂交:不同来源的具有互补序列的两条核酸单链,在一定条件下可以按碱基互补原则形成双链的过程。件下可以按碱基互补原则形成双链的过程。第四十四页,讲稿共九十五页哦第四十五页,讲稿共九十五页哦基因表达基因表达(gene expression)translationtranscriptiontranscription第四十六页,讲稿共九十五页哦核酸生物合成的一般规律核酸生物合成的一般规律1 按照碱基互补配对原则,以按照碱基互补配对原则,以
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