2022年食品生物技术复习资料 .pdf
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1、第一章绪论?生物技术定义为“红色生物技术”、“绿色生物技术”和“灰色生物技术”三类。“红色生物技术”是指生物制药技术,“绿色生物技术”是指农业和食品生物技术,而“灰色生物技术”是指工业、环保生物技术。?食品生物技术-现代食品生物技术的作用?一 食品原料和食品微生物的改良,提高食品的营养价值及加工性能;?二 生产各种功能食品有效成份、新型食品添加剂;?三可直接应用于食品生产过程的物质转化;?四工业化生产预定食品或食品功能成分。第二章基因工程4个问题:1.什么是基因工程基因工程的概念在体外通过人工剪、接,将不同来源的 DNA 分子组成一个杂合 DNA 分子(DNA 分子重组体),然后导入宿主细胞去
2、复制扩增或表达。因为通过人工设计,得到一定的设计方案,故称为基因工程.由于整个操作在分子水平上进行,所以也称分子克隆。基因工程的基本特点是,分子水平操作,细胞水平表达。2.为什么能进行基因工程基因工程的原理和技术(涵盖3大理论和 3大技术准备)四基因工程 3大理论,3大技术准备:(一)理论上的 3大发现:1.20世纪40年代,Avery发现了生物遗传物质的化学本质是DNA。超越时代的科学成就往往不易被人们接受,Avery当时并未赢得阵阵掌声,他的论文事隔 10年以后才公开发表。2.20 世纪50年代,Watson-crick 提出了 DNA 结构的双螺旋结构模型,搞清楚了生物遗传物质的分子机制
3、。3.20世纪60年代,确定了遗传信息的传递方式:DNA RNA Pr,破译了全部遗传密码,43。1“基因剪刀”限制性内切酶的发明2载体(“交通工具车子”)将质粒作为基因工程载体使用3逆转录酶3.怎样进行基因工程 3大步骤(DNA 体外重组,重组 DNA 如何进行扩增和表达,基因名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 1 页,共 35 页 -工程后处理)4.基因工程的应用和前景(一)基因(gene)基因-从化学上来说,指的是一段 DNA 或RNA 顺序,该顺序可以产生或影响某种表型(genotype,phenotype);从遗传学上来说,基因代表一个遗传单位,一个功能单位,一个突变单
4、位。(二)基因工程(genetic engineering)基因工程 -在体外通过人工剪、接,将不同来源的DNA 分子组成一个杂合 DNA 分子(DNA 分子重组体),然后导入宿主细胞去复制扩增或表达。因为通过人工设计,得到一定的设计方案,故称为基因工程。由于整个操作在分子水平上进行,所以也称分子克隆。基因工程的基本特点是,分子水平操作,细胞水平表达。在这个过程中:1.“基因剪刀”剪取DNA 的酶就像一把“基因剪刀”2.“缝纫针”连接不同来源 DNA 分子的酶就像一根“缝纫针”,使二者连在一起 3.“交通工具”使用载体好比一辆车子 4.“乘客”有用基因(二)技术上的 3大发明:1“基因剪刀”限
5、制性内切酶的发明(1)20世纪4060年代,科学家们就为基因工程设计了美好的蓝图,但是面对庞大的 dsDNA(104,2.2*1011公里)束手无策,无从下手把它切成单个基因片断。(2)当时的酶学知识已有相当的发展,但是没有一个已发现的酶能完成这样的使命。(3)1970年,Smith和Wilcox 在流感嗜血杆菌(Haemophilus inffuenzae)分离纯化了 Hind,取得了突破,打破了基因工程的禁锢,迎来了改造生物的春天,为基因工程奠定了最为重要的技术基础。2载体(“交通工具车子”)基因工程技术诞生的第二个技术准备(1)有了切割与缝合(ligase)基因 DNA 的工具,还得有一
6、个车子-将重组DNA 送到宿主细胞中去。(2)1946年起,Lederberg 就研究细菌性因子(F因子).50-60 年代相继发现了R因子(抗药因子),CoE(大肠杆菌因子)等质粒。(3)然而,直到 1973年Cohen 才能将质粒作为基因工程载体使用(至今一直名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 2 页,共 35 页 -是基因工程最重要最广泛使用的载体)。这是基因工程的第二个技术准备。3逆转录酶 1970年Baltimove 和Temin等同时各自发现了逆转录酶,打破了遗传学(生物学)中心法则,使真核基因的制备成为可能。(为什么)(1)真核基因组庞大而复杂,不易制得基因图谱。H
7、GP2005 年完成,2.8 万个基因,13kb/基因,104,2.2*1011公里。(2)即使有了基因图谱,因为真核基因有内含子,不能在原核表达系统剪接出mRNA,没有成熟的 mRNA 就不能得到相应得产物。(3)经过逆转录 mRNAcDNA(complementory DNA)文库要比基因组文库小得多,所以筛选阳性克隆就方便得多。有了这些理论核技术的武装,基因工程的临盆降生指日可待,Berg和Cohen 两位科学的“助产士”,把基因工程接到了人间。第二节 基因工程的酶学基础常用的工具酶(tool enzymes)有:1.限制性核酸内切酶(resriction enzymes,restric
8、tion endonadease)-定义,分类,命名1.定义一类专门切割 DNA 的酶,它们能特异结合一段被称为限制酶识别顺序的特殊DNA 序列。并切割 dsDNA。2.分类 限制酶都是从原核生物中发现的(400多种E/350M)。所有的限制酶可分成3类。(1)、型,兼具限制与修饰活性,它们识别与切割顺序不在一个地方,不产生特异性的 DNA 片段,与基因工程意义不大(有说型识别核苷酸切割的位点一致,但罕见)。(2)型 基因工程说到的限制酶是型酶,具有此类酶的微生物限制修饰系统分别由限制酶核甲基化酶来完成。型酶分子量小,仅需Mg2作为催化反应的辅因子,识别与切割位点相同,产生特异的DNA 片段。
9、3.命名(1973年Smith 原则、型酶)根据分离此酶微生物的学名,一般取3个字母。第一个字母大写该微生物属名前的第一个字母第二、三个字母小写该微生物种名前的 2个字母第四个字母大写有变种或品系的第一个字母罗马字母、从一种微生物中发现了几种限制酶,按发现顺序排列2.DNA 连接酶(DNA ligase,ligase)功能、影响连接酶作用的因素、连接方法(一)功能:催化有互补顺序的两个 dsDNA 分子的粘性末端或平头末端3OH、5名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 3 页,共 35 页 -P连接作用。只能连接缺口(nick),不能连接裂口(gap)。而且被连接的 DNA 链必须
10、是双螺旋 DNA 分子的一部分。(二)来源噬菌体 T4感染E.coli 分离的一种单链多肽酶、MW.68KD。(三)催化反应:(1)需要 ATP、Mg2+作辅助因子;(2)对粘性末端催化活性大于平头末端(酶量1:100)?体外连接的几种方式:1.用连接酶连接具有互补粘性末端的DNA 片断 2.用连接酶将平末端的DNA 片断连接;3.用末端脱氧核苷酸转移酶给具平末端的DNA 片断加上poly(A)-poly(T)尾巴之后,再用连接酶连接。4.先在DNA 片断末端加上化学合成的衔接物或接头,形成粘性末端后,再用连接酶连接影响连接酶作用的因素 1.反应温度:连接缺口的温度:37度连接粘性末端的最佳温
11、度:4 15度 2.连接酶的用量:平末端 DNA 分子的连接反应中,最适 12个单位。粘性末端 DNA 片断之间的连接,酶浓度 0.1 个单位 ATP的用量 10mol-1mmol/L之间 3.提高外源片断与载体的浓度的比值(1020倍)粘性末端 DAN 片断的连接由于具粘性末端的载体易发生自连。对载体的 5末端进行处理,用细菌的或小牛肠的碱性磷酸酶移去磷酸基团,使载体不能自连。而外源片断的 5-P能与载体的 3-OH 进行共价键的连接。这样形成的杂种分子中,每一个连接位点中载体DNA 只有一条链与外源片断相连,失去5-P的链不能进行连接,形成 3-OH 和5-OH 的缺口。平末端 DNA 片
12、断的连接 1).T4DNA连接酶 2).用末端核苷酸转移酶给平末端加上同聚物尾巴之后,再用 DNA 连接酶连接。衔接物连接法平末端的另一种处理方式是利用衔接物(linker)进行处理,人工加上粘性末端。衔接物是一种人工合成的小分子DNA,约1020个核苷酸,其结构特征是含有多种限制性核酸内切酶的酶切位点的回文结构。将衔接物分子与平末端 DNA 分子连接,再用限制性核酸内切酶酶切,便可产生粘性末端。这种方法的优点是克隆位点具有限制酶的酶切位点。名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 4 页,共 35 页 -DNA 接头(adapter)连接法:它是一类人工合成的一头具有某种限制酶粘性末
13、端另一头为平末端的特殊的双链寡核苷酸短片断。粘性末端容易通过碱基配对形成如同衔接物一样的二聚体分子。对DNA 接头分子末端,进行必要的修饰。移走粘性末端 5-P,暴露出5-OH,不能产生稳定的二聚体分子。3.DNA 聚合酶(DNA polymerase,DNA pol)定义把脱氧核糖核苷酸连续的加到双链DNA 分子引物链的 3-OH 末端,催化核苷酸的聚合作用,而不发生从引物模板上解离的情况。7.碱性磷酸酶(BAP 或CIP)-该酶用于脱去 DNA(RNA)5末端的磷酸根,使 5-P成为5-OH,该过程称核酸分子的脱磷酸作用。当需要5端同位素标记或为了避免DNA 片段自身连接(或环化)时可进行
14、脱磷酸反应。以1.和2.最为常用,最为重要。工具酶现已商品化。第三节载体载体的概念:1.要把一个有用的基因(目的基因研究或应用基因)通过基因工程手段送到生物细胞(受体细胞),需要运载工具(交通工具)携带外源基因进入受体细胞,这种运载工具就叫做载体(vector)。2.凡来源于质粒或噬菌体的 DNA 分子,可以插入或克隆 DNA 片段统称为 vector。3.基因工程所用的 vector 实际上是 DNA 分子,是用来携带目的基因片段进入受体细胞的DNA 基因工程载体的 3个特点(一)能独立自主的复制载体DNA 分子中有一段不影响它们扩增的非必需区域,如MCS,插在其中的外源DNA 片段,能被动
15、的跟着载体一起复制/扩增,就像载体的正常成分一样。(二)能便利的加以检测如载体的药物抗性基因,多是抗生素抗性基因,将受体细胞放在含有该抗生素培养板上培养生长时,只有携带这些抗性基因的载体分子的受体细胞才能存活。(三)都能容易进入宿主细胞中去,也易从宿主细胞中分离纯化出来。噬菌体载体-噬菌体结构特点:1、野生型为 48.5kb,两端带有 12碱基的单链粘性末端,进入大肠杆菌后环化,既可溶菌又可溶原生长。2、基因组分为三个区域:左侧区包括使噬菌体成熟的全部基因;中间区不是病毒生活必需的,外源DNA 片段往往插入此区;右侧区包括所有的主要调控成分。名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 5
16、 页,共 35 页 -3、-噬菌体基因组中只有 60%是溶菌生长必需的,作为克隆载体时,可插入 923kb的外源 DNA 片段质粒载体(1)染色体外的双链环状 DNA 分子(2)大小为 1200kb;()能独立于染色体外进行自我复制,每个细胞中可含10200个拷贝。(4)分高拷贝数和低拷贝数质粒或窄宿主范围和广宿主范围(5)质粒包含:复制起始区、选择标记基因和限制性核酸内切酶的酶切位点常用质粒有:pBR322、pUC19 质粒的不相容性:同种的或亲缘关系相近的两种质粒不能同时稳定地保持在一个细胞内的现象3.柯氏质粒粘尾质粒(cosmid)柯氏质粒定义:含有入噬菌体粘性末端的复合质粒。由入-DN
17、A c o s区与质粒重组建造而成.在宿主细胞中可以作为正常噬菌体进行复制,但不表达噬菌体的任何功能。含有质粒的抗药性标记如Ampr 基因或 Tetr 基因及自主复制成分,所以这种粘性质粒可以在细菌中大量复制扩增。当体外重组的粘性质粒分子包装成噬菌体颗粒并感染大肠杆菌后,可按质粒的方式进行复制。带有噬菌体的粘性末端(cos 区)。这一粘性末端是体外包装系统必不可少的成分,所以它可以像噬菌体一样进行体外包装。具有一个或多个限制酶的酶切位点。其本身分子量小,如 pHC79 仅6.5kb,可容纳 40kb左右的 DNA 片段。由于非重组体粘性质粒很小,不能在体外包装,因而体外包装的主要是重组体,有利
18、于以后的筛选。第四节 基因工程技术与方法基因工程包括 3个步骤:1 DNA 重组DNA 分子内或分子间发生的遗传信息的重新共价组合过程。包括同源重组、名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 6 页,共 35 页 -特异位点重组和转座重组等类型,广泛存在于各类生物。体外通过人工 DNA 重组可获得重组体 DNA,是基因工程中的关键步骤2重组DNA 导入宿主细胞克隆扩增或表达3基因工程的后处理(down stream techniques of GE)重组DNA 技术的基本过程:1载体的选择和制备分;2制备目的基因片段切;3 DNA 片段的重组连接接;4重组DNA 导入受体细胞转;5转化
19、子的筛选筛;6重组子的筛选筛;1利用表型特征进行筛选2.物理筛选3.酶切鉴定4.核酸杂交5.PCR 鉴定6.免疫学方法7.利用 western 杂交8 利用序列测定转译筛选1.基因组文库法-定义、如何构建将含有某种生物不同基因的许多DNA片段,导入受体菌的群体中储存,各个受体菌分别含有这种生物的不同的基因基因文库如何构建?将某种生物体内的DNA 全部提取出来,选用适当的限制酶,将 DNA切成一定范围大小的DNA 片段,然后,将这些DNA 片段分别与载体连接起来,导入受体菌的群体中储存,每个受体菌都含有了一段不同的DNA 片段。也就是说,这个群体包含了这种生物的所有基因,叫做这种生物的基因组文库
20、。名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 7 页,共 35 页 -2.CDNA 文库法-定义、如何构建如果用某种生物发育的某个时期的mRNA 反转录产生的多种互补 DNA(也叫 cDNA)片段,与载体连接后储存在一个受体菌群中,那么,这个受体菌群体就叫做这种生物的cDNA 文库。cDNA:指体外用逆转录酶催化,以mRNA 为模板合成的互补 DNA。cDNA:汇集某生物成熟 mRNA为模板逆转录而成 cDNA 序列的的重组群体 噬菌体和质粒为载体构建在什么情况下我们选用 cDNA 文库法来制备目的基因?操作程序)总 RNA 的提取;注意抑制酶的活性,盐酸胍,二乙基焦碳酸)mRNA 的分
21、离:选用高度分化的组织,末端带有poly A.)cDNA 双链的合成:poly A RNA 为模板)cDNA 与载体的连接)噬菌体的包装以及转染或质粒的转化1.表型特征进行筛选a.根据载体表型特征的筛选抗药性标记插入失活法-半乳糖苷酶显色反应筛选法b.根据外源提供的遗传性状的筛选c.利用噬菌斑的形成d.利用遗传互补作用第六节克隆基因与表达系统一、基因工程的目的和主要工作(一)基因工程的目的有:1.生产基因工程的产品。2.改良生物的性状,对人来说是开展基因治疗。(二)根据克隆基因和宿主细胞的不同,基因工程的工作可以分成:1.克隆真核基因在真核系统表达,如开展基因治疗 2.克隆真核基因在原核系统表
22、达,如生产基因工程的产品。3.克隆原核基因在原核系统表达。4.克隆原核基因在真核系统表达。由于人类赖以生存的生物类群与真核关系密切,而原核生物的繁殖优势是任何真核生物都无法比拟的,所以除了开展基因治疗外,基因工程的主要工作是克隆真核基因在原核系统表达。外源基因在原核生物中正确表达的基本条件?启动子概念启动子 -DNA 链上一段能与 RNA 聚合酶结合并起始 RNA 合成的序列,它名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 8 页,共 35 页 -是基因表达不可缺少的重要调控序列。没有启动子,基因就不能转录。由于细菌RNA聚合酶不能识别真核基因的启动子,因此原核表达载体所用的启动子必须是原
23、核启动子.?TATAAT(pribnow box)为RNA 聚合酶结合位点,TTGACA 是识别位点。这两个区域是决定启动子强度的重要因素.?序列概念在 mRNA 上有核糖体的结合位点,它们是起始密码子AUG和一段位于 AUG 上游 310 bp处的由 39 bp组成的序列。这段序列富含嘌呤核苷酸,刚好与16S rRNA 3 末端的富含嘧啶的序列互补,是核糖体 RNA 的识别与结合位点。以后将此序列命名为Shine-Dalgarno序列,简称 SD序列。它与起始密码子 AUG之间的距离是影响mRNA 转录、翻译成蛋白的重要因素之一,某些蛋白质与SD序列结合也会影响mRNA 与核糖体的结合,从而
24、影响蛋白质的翻译。另外,真核基因的第二个密码子必须紧接在ATG之后,才能产生一个完整的蛋白质。?起始密码子-概念AUG(甲硫氨酸)GUG(缬氨酸),也就是翻译过程中,所合成多肽的第一氨基酸应是甲硫氨酸或缬氨酸?终止子-概念在一个基因的末端往往有一段特定顺序,它具有转录终止的功能,这段终止信号的顺序?转译后的修饰和加工-概念1.细菌RNApol 不能识别真核的promotor,故真核基因不能被该酶转录.2.从真核转录的 mRNA 缺乏SD序列,不能结合到细菌核糖体rRNA,因此不能被翻译成蛋白.3.真核基因有内含子,而原核细胞缺乏真核细胞转录后加工系统,成熟的 mRNA 不能形成,不能表达真核蛋
25、白 ;4.表达的真核蛋白在原核细胞中不稳定,易被细菌蛋白酶降解.将真核基因克隆到 1个强大的原核promotor 和SDs 的下游,使真核基因处于原核启动子的控制之下,转录物由于原核SDs 能与核糖 体rRNA结 合,可在原核表达.这是克服 1,2 困难的好办法.克服 3,4 从真核分离出mRNA 并逆转录成 cDNA,cDNA 有完整的编码顺序,但无内含子,这是解决第三个困难的方法,第四个困难解决的方法是采用伪装办法将真核基因插到原核基因某密码之后,其翻译产物 N端有原核多肽,这样表达的融合蛋白,可躲避细菌蛋白酶降解作用.第八节 基因工程在食品工业应用现状名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师
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