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1、,新的集成分类、降维策略与生物信息应用,邹 权 电子科技大学,2020 年9月,集成学习,集成学习的思想 “三个臭皮匠顶一个诸葛亮” 会议制度的来源 集成学习的麻烦 三个臭皮匠真的顶一个诸葛亮么? 如何证明集成后的结果优于之前的结果?,内容提纲,降维,0.5 0.8 1.6 0.4 0.9 0.2 1.2 0.8 1.1 0.2 0.1 1.1 0.9 0.2 1.0 0.3 0.2 1.1 0.3 0.9 0.9 0.4 0.2 1.0 0.4,1 1 1 0 0,样本1 样本2 样本3 对照1 对照2,不同的基因表达情况,标识物,集成排序 :5001/MRMD2.0/Home,PageRa
2、nk,创始人:拉里佩奇(Larry Page ) Google创始人之一,Google的创始人之一Larry Page于1998年提出了PageRank,并应用在Google搜索引擎的检索结果排序上,该技术也是Google早期的核心技术之一 Larry Page是Google的创始首席执行官,2001年4月转任现职产品总裁。他目前仍与Eric Schmidt和Sergey Brin一起共同负责 Google的日常运作。他在斯坦福大学攻读计算机科学博士学位期间,遇到了Sergey Brin,他们于1998年合伙创立Google。,PageRank,PageRank一例,求矩阵A特征值1对应的特征
3、向量M,集成排序 :5001/MRMD2.0/Home,MRMD,MRMD 1.0 JAVA版本,无需任何插件,速度快,适合大规模数据,没用ensemble MRMD 2.0 :5001/MRMD2.0/Home Anaconda3(python3.6),有插件,PageRank集成,有Web Server MRMD 3.0 集合了PageRank,LeaderRank,Hits和TrustRank算法,集成分类,Ensemble learning: Make weak classifiers to strong one,Classification Result,Combine to for
4、m the Final strong classifier,h1( ) h2()h3( ) h4( ) h5( ) h6() h7(),集成学习样本不平衡,Ensemble learning for Class Imbalance Problem,2021/4/11,利用邹权副教授提出的集成学习方法,应用1:转移瘤,Wei Tang, Shixiang Wan, Zhen Yang, Andrew E. Teschendorff*,Quan Zou*. Tumor Origin Detection with Tissue-Specific miRNA and DNA methylation M
5、arkers.Bioinformatics. 2018, 34(3): 398-406. (SCI, IF2017=5.481, PMID:29028927),引用超过100次!,Basic polar and hydrophobic properties are the main characters that affect the binding of transcription factors to methylation sites,应用2:预测与甲基化DNA结合的TF,Zijie Shen, Quan Zou*. Basic polar and hydrophobic properties are the main characteristics that affect the binding of transcription factors to methylation sites.Bioinformatics. Doi: 10.1093/bioinformatics/btaa492,感谢聆听!欢迎合作!,电子科技大学 邹权,
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