实验动物的遗传学分类及其质量控制.ppt
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1、实验动物的遗传学分类及其质量控制,第二章,实验动物遗传学质量标准化的意义,1、增加动物实验结果的均一性和重复性。 2、根据动物基因组与人类基因组的不同,可以在遗传限定的动物身上复制出更多的人类疾病模型。 3、标准化实验动物有利于动物基因组作图。 4、建立生物信息数据库。,(不同基因型的动物,其生物学特性也不同,对同样一个实验处理因素其反应也不同,实验结果就会有差别,应此要获得均一的和可重复的实验结果,就必须要根据我们的实验目的和要求,选择相应遗传背景的实验动物) (人类17号染色体上的全部基因可以在小鼠的11号染色体上找到) (遗传连锁图的绘制采用重组近交系和已知近交系的杂交方式来进行) (小
2、鼠基因数据库、小鼠基因组百科全书、小鼠突变体资源库等等),实验动物的分类,一般生物学意义上动物的分类原则包括界、门、纲、目、科、属、种。 就实验动物而言品种、品系才是其分类的最基本单位。同时可以根据不同的标准进行分类。 实验动物的遗传学分类:基因是否相同 微生物学分类,实验动物的分类,实验动物在生物学的分类: 界(kingdom,regnum) 动物界 门(phylum,phylum) 脊椎动物门 纲(class,classis) 哺乳纲 目order,ordo) 食肉目 科(family,familia) 犬科 属(genus,genus) 犬属 种(species,species) 家犬种
3、,常用实验动物在动物学的分类位置,目 科 属 实验动物 目 科 属 实验动物 有袋目 大袋鼠科 袋鼠属 袋鼠 啮齿目 鼠科 仓鼠属 黑线仓鼠 灵长目 猴科 猕猴属 猕猴 鼠科 棉鼠属 棉鼠 狨科 狨猴属 狨猴 豚鼠科 豚鼠属 豚鼠 猩猩科 猩猩属 猩猩 仓鼠科 沙鼠属 长爪沙鼠 兔形目 兔科 兔 属 兔 鼠科 田鼠属 田鼠 鼠兔科 鼠兔属 鼠兔 食肉目 猫科 猫 属 猫 啮齿目 鼠科 大鼠属 大鼠 犬科 犬 属 犬 鼠科 小鼠属 小鼠 偶蹄目 野猪科 猪 属 猪 鼠科 仓鼠属 金黄鼠 牛科 羊 属,犬:动物界、脊椎门、哺乳纲、食肉目、犬科、犬属、家犬种。 鼠:动物界、脊椎门、哺乳纲、啮齿目、鼠
4、科、家鼠属,小鼠是野生鼷鼠的变种,大鼠是野生褐家鼠的变种,豚鼠是秘鲁野生豚鼠的变种。,第一节 实验动物的遗传学分类,从遗传观点讲,实验动物应是遗传限定的动物。根据基因型是否相同,将实验动物可分为近交系、封闭群、杂交群。,相同基因型,不同基因型,近交系(纯合),杂交F1(杂合),封闭群(杂合),突变种,封闭群(远交种),遗传限定:有相同的遗传来源和稳定的遗传性能,具有相同的外貌特征和生物学特性。 近交系动物的基因位点都是纯合子,基本不存在暗藏的杂合基因,实验动物学规定,只有当一个种群的遗传位点纯合程度达到99%,才能称之为近交系动物。 近交系又可分为:不同的亚系、支系、重组近交系、分离近交系、同
5、源突变近交系、同源导入近交系 杂交群动物虽然基其基因位点是杂合的,但是基因型是相同的,个体间的遗传型与表现型都是一致的,符合实验动物有明确遗传背景的基本要求,在实验中能获得一致的、可重复的实验结果。 概念、特征、命名、应用、繁殖方法都将一一作详细介绍。,实验动物品种、品系,1.种:“种”(species)是生物学分类的最基本单位,在实验动物中,种是指一群形态相似、可以相互交配且后代有繁殖能力的,在生殖上与其他群体相隔离的同一种类的动物。 2.实验动物品种(stock,breed):一般指具有一些容易识别和人们所需要的性状,而且是可以稳定遗传的动物群体。通常把封闭群动物称为品种,如新西兰白兔、K
6、M小鼠等。 3.品系(strain):实验动物学上把基因高度纯合的动物称为品系动物,通常指近交系、突变系动物。如BALB/c、 C57,C3H。,KM小鼠:毛色是白色、抗病力和适应力强,繁殖力和成活率高、乳腺癌发病率为25%,是我国应用最多的实验小鼠。 新西兰白兔:繁殖力强、生长迅速、性情温和,对皮肤刺激敏感、体温变化敏感,广泛用于皮肤反应试验、热源试验、毒性试验和胰岛素鉴定。 Balb/c、C57,C3H(野生色)小鼠是近交系小鼠,虽然毛色不同,生物学特性不同,遗传来源不同,基因型也不同,它们都采用近亲交配的方式进行繁殖,基因位点都是纯合子。,作为品种、品系应具备的条件,1.相似的外貌特征:
7、例如小鼠C57BL/6品系的毛色是黑色的, KM品种的毛色是白色的,DBA/2 品系的毛色是灰色的。当然,相似的外貌特征只是品系、品种应具备的条件之一,不同品系、品种的动物也有相似的外貌, 但它们在其他的条件上是有区别的。 2.独特的生物学特性:A品系母鼠红斑狼疮细胞和抗核抗体均为阳性,体内缺乏补体C5,易发中度听觉性痉挛,对麻疹病毒高度敏感、对X线高度敏感,对致癌物质敏感,易发生肺癌,繁殖母鼠乳腺癌为发病率为80%。AKR品系小鼠白血病自发率可达90%,对百日咳组织胺易感因子敏感 。C3H品系小鼠毛色是棕灰色,乳腺癌发病率高达97%,对肝癌因素敏感、对狂犬病病毒敏感 。ICR小鼠繁殖能力强,
8、母性好,经常作为胚胎移植的代乳动物。,3.稳定的遗传性能 在不断的育种过程中性状不会分离,遗传性能稳定,能将其特性稳定的传给后代。比如杂交F1代繁殖后代时,不论采用何种繁殖交配方式,从F2代开始其遗传性状都会不断发生分离,因此F1代动物不能成为一个品系,也不具有保种价值。 4.具有共同的遗传来源和一定的遗传结构:任何品种和品系在遗传上是同源的,都可追溯到共同的祖先,并由其祖先分支经选育而成,任何品系、品种遗传结构也应该是独特的。,(例如A、AKR、KM等十几个品种、品系动物的毛色都是白色) (独特的生物学特性是一个实验动物品种、品系存在的基础) (作为一个品系不仅要有相同的外貌和相似的生物学特
9、性,更要有稳定的遗传性能,即一个品种或品系必须具有一定的育种价值) (例如KM小鼠Glo-1位点为a基因单一型。而NIH小鼠在该位点基因呈ab型的多态性分布,a、b型基因分布比例分别为66%和34%,遗传结构有很大差异。),第二节、近交系动物,(一)普通近交系 概念:至少经过20代以上的连续全同胞交配或亲子交配,品系内所有个体都可追溯到起源于第20代或以后代数的一对共同祖先的动物群。 近交系动物的近交程度用近交系数表示,近交系数应大于98.6%,动物群内所有的个体98.6%以上的遗传基因是相同的。 通常科研交流所说的近交系一般是指普通近交系。,近交系动物是指人为的选择有血缘关系的动物个体,按近
10、亲交配方式,(举例),繁殖若干代而形成的动物群体。其最终的结果是基因纯合性提高,杂合性下降。 从近交系的概念中我们可以看出,近交系的培育是人为的将血缘相近的动物进行交配,从群体多态杂合的遗传组成中选择性的保留一小部分而淘汰其他大部分的过程,经过近交培育后每个品系从物种的整个基因库中只能获得极少部分基因,这些基因的组合构成了该品系的遗传组成。 经过20代近交后,近交系的所有个体有98.6%的遗传位点是纯合的,因此品系内的所有个体间的基因型遗传型和表现型基本是相同的,其遗传差异很小。但是,不同近交系之间由于近交而固定的基因不同,所以不同近交系之间的遗传差异很大,(毛色基因、生化基因、免疫学性状比较
11、)。,近交系数:指群体中某个体通过遗传,携带2个同源等位基因(即源于同一祖先的基因)的概率。 Falconer :Fn=1-(1-F)n100% 例如: F20=1-(1-0.19)20100%=98.6%,Falconer于1960年经实验获得一个近交系数的计算公式。 小鼠全同胞兄妹近交过程的前四代中,其近交系数上升率分别为28%、17%、20%、19%,以后每代恒定为19.1%也就是0.191,这样到了第20代时,近交系数达到了98.6%,基本符合国际上规定的近交品系小鼠必须达到99%的近交系数。 F近交系数的代递增率,在同胞兄妹交配或回交情况下,F为0191 例如:全同胞兄妹连续20代交
12、配的近交系数是:,近交系动物的特征,遗传基因位点的纯合性 遗传组成的同源性 遗传组成的独特性 遗传组成的可分辨性 长期的遗传稳定性 表型的一致性 国际分布广泛和背景资料完整 对外界环境变化较为敏感 抗病力和适应环境的能力减退 生活力和生育力下降,生产饲养成本增高,纯合性:通过连续20代以上的近亲繁殖,品系内动物的所有基因位点都是纯合的,基因是一致的,遗传组成是相同的,在这些动物中没有隐藏的隐性基因。,也即是说经过20代的近亲交配后纯合子的纯合度在理论上 达到最高的98.6%,所有基因位点都是纯合子无暗藏隐性基因。这样的个体与该品系中任何一个动物交配所产生的后代也是纯合子。,同源性:一个近交品系
13、中所有个体在遗传上是同源的,可以追溯到一对共同的祖先,具有基本完全相同的遗传组成。所以,在同一品系内的动物个体间进行皮肤和肿瘤移植不会发生异体排斥。,当应用生化或免疫学方法检测个体在各条染色体上的基因标记时,可以看到同一品系内不同个体间的基因型完全一致。,独特性:经过近交培育后。每个品系从物种的整个基因库中只能获得极少部分基因,这些基因的组合构成了该品系独特的遗传组成。因此各个品系具有独自的遗传组成和生物学特征。这些遗传和表型的独特性使各个品系之间的差异相当大。,目前国际上公认的700多个近交系小鼠之间,均各有明显的区别,有其独特的反应性和敏感性。 因此可以根据实验的目的和要求,结合其遗传组成
14、的独特性,在众多的近交系中筛选出对实验处理因素敏感的品系来开展实验,以达到不同的实验目的,可分辨性:每个近交系都有各自特有的遗传概貌,可建立遗传概貌图,包括毛色基因、生化基因和免疫学性状基因等。,掌握了遗传学检测方法,就可以轻而易举的将两个外貌相似的近交系分辨开来。,长期遗传稳定性:由于近亲繁殖增加了在特定部位纯合子相互配合的可能性,所以减少了遗传变异,使基因型长期处于稳定状态,人为选择不会改变其基因型,个体遗传仅发生在几率很低的少量残留杂合基因或基因突变上。,在品系确定为近交系后,坚持近交繁殖,辅以遗传检测,及时发现和清除遗传变异的动物,近交系的遗传特征可以世代相传。,表型一致性:由于近交系
15、动物是相同基因型的动物,同一品系内的动物在相同环境因素下的表型也是一致的,任何可遗传的生物学特征如毛色、体重、血型、组织型、生化同功酶、形态学特征完全相同。,甚至行为类型也趋向于一致,可以说同一近交系不同个体之间基本不存在质的差别,所以对同样的实验处理有极高的均一性结果。 所以使用近交系动物做实验,仅仅需要很少量的动物及可以达到很一致的实验结果,具有很高的统计学价值。某些个体的微小差异可能是由于环境的改变、残留杂合性、基因突变、遗传污染造成的。,背景资料完整:近交系动物由于在培育和保种过程中都有详细记录。加之这些动物分布广泛,应用广泛,已经积累了相当数量的文献记载着各个品系的生物学特性,另外对
16、任何近交系的每一项研究又增加了该品系的研究履历。,例如:来源、近交代数、双亲编号、出生日期等资料 这些基本数据对于设计新的实验和解释实验结果提供了有价值的参考信息。,国际分布广泛:近交系动物个体具备一个品系动物的全能性,任何个体均可携带该品系全部基因库,引种非常方便,仅需2至3对动物即可将该品系传代下去,容易广泛分布。,目前许多近交系动物在国际上分布广泛,从而有可能在世界各国之间进行比较研究,这意味着不同地区、不同国家的科学家有可能去重复和验证已取得的结果和数据。,对外界环境变化较为敏感 抗病力和适应环境的能力减退 生长力、成活力和生育力下降,生产饲养成本增高,这3项在一起讲的原因是他们都是由
17、于近交衰退产生的,因为近交增加了纯合性,降低了杂合性,因此增加了有害隐性基因暴露的概率和多基因平衡的破坏,所以近交衰退现象产生。可以说近交系小鼠类似精密的天平,对外界任何微小的变化都会发生摆动。,近交衰退的原因: 1、有害的隐性基因的暴露:一般病态的突变基因绝大多数都是隐性的,处于杂合状态时这些有害基因的作用被显性的杂合等位基因所掩盖是不表现出病态,但经过近亲繁殖,纯合的基因比例渐渐增多,于是有害的隐性基因相遇成为纯合子而表现出不利的性状,对个体的生长发育、抗病力、繁殖等产生明显的不利影响。例如杂交动物所带有的不育的隐性基因往往被其显性的等位基因所掩盖,而不表达其不育的性状,但由于近交,动物的
18、纯合性逐渐增高,不育的现象也就表现出来,所以很多近交系动物交配后发生不孕的现象很普遍。,近交衰退的原因: 2、多基因平衡的破坏:个体的发育受多个基因共同作用的影响,对环境适应较好的野生动物或杂交动物,由于自然选择的作用有利于保存那些生物适应能力较强的基因组合,具有平衡的多基因系统,近交繁殖往往会破坏这个平衡,对个体发育造成不利影响。,近交类型,(1)纯交:相同基因型个体之间交配,如AAAA,下一代全部为纯合子 (2)回交:纯合子与杂合子交配AAAa,下一代中纯合子、杂合子各占一半。 (3)互交:相同杂合子之间交配,AaAa,其后代1/2为杂合子(Aa),1/4为显性纯合子(AA),1/4为隐性
19、纯合子(aa)。 (4)杂交:为亲代不相同的纯合子交配,A/Aa/a,子代的基因型为Aa、表现型为A。,近交系动物的命名,近交系小鼠的命名已由国际统一规定,由国际实验动物科学委员会(LCLAS)的小鼠标准化遗传命名委员会制定命名法,并由该组织对各国培育的新品系作鉴定和认可。 对承认的近交系动物四年公布一次信息,介绍各个品系的历史、来源、独特的生物学特性、培育人的人名、单位名的规定写法和遗传背景,基因组成、缩写符号及标准命名等,这些资料供全世界参考。,为什么要学习命名方法?,看懂: 会用:购买时 繁殖时:C57BL/Jnga(F73+26) 发表文章时,我们在查阅文献资料时要能看懂实验动物的命名
20、和缩写,这样才能在看似复杂的实验动物综合命名和表示法中,清楚的知道这些动物的来源、历史和培育经过。 名称、等级、周龄、体重、数量及雌雄比例 实验室引进某品系小鼠可能要做遗传学方面的研究,那么就需要对动物进行繁殖传代,要能正确、严谨的表示出所繁殖的动物的名称 要能够准确的描述所用动物的名称。,普通近交系动物的命名,1.一般用14个大写英文字母表示,如A、AE、BA、AKR、DBA、NZB、STAR 2.大写英文字母结合数字,如TA1、TA2、C3H、C57BL 3.惯用的非正规命名已为国际广泛认同可保留沿用,如129、615 、101 4.近交代数表示:品系名称后括号内用大写英文字母F加数字表示
21、兄妹交配的代数,(Filial,F)如C3H(F130)、A(F78);若从其他实验室引入的近交系或亚系,又经自己的实验室繁殖若干代,其近交代数的表示是在F后先标明引入时的代数,再加上自己实验室繁殖的代数,如C57BL/Jnga(F73+26)。若之前繁殖代数资料不全,则在已知代数前加?,如AKR(F?+10)。,关系相近原则:同来源的不同品系,其名称基本相似,差异部分用一个不同大写英文字母表示。如NZB、NZO、NZW、NZX、NZY等,性腺肿瘤发病率高129;肺癌发病率高615,虽然是非正规命名,但是都是可以继续沿用的。,5.品系优先权:任何品系或亚系命名均应参照国际命名委员会的规则命名,
22、如果出现两品系命名符号相同,则保留先正式公布者,并以发表在Mouse News Letter、Inbred Strains of Mice两个刊物上的品系为准。 6.书写品系符号要完整,应使用公布的全称,不能随便缩写(写论文报告时在材料方法一栏里一定要把品系命名符号写全,才能说明所指的是哪个品系或亚系)。CBA,如CBA只写CBA为不准确的写法,因为它分支成若干个特性不同的亚系,如CBA/J是有视网膜退变基因,而CBA/c则没有,另外它们的组织相容性也不同,有5个不同的基因位点。,国际上公布的品系缩写有: AKR-AK BALB/c-C C3H-C3 C57BL-B C57BL/6-B6 C5
23、7BL/10-B10 DBA/1-D1 DBA/2-D2 CBACB DBAD HRS/JHR RR3,亚系和支系的概念,亚系(substrain):育成的近交系在培育过程中由于杂合子基因的分离、基因突变以及抽样误差导致部分遗传组成改变而形成遗传差异的近交系动物群。 形成原因: 1)在兄妹交配代数达40代前形成的分支,很可能由于遗传漂变即残余杂合性而导致形成亚系。 2)同一近交系长年处于分离状态,即一个分支与其他分支分开繁殖超过100代,可能由于基因突变形成亚系。 3)已发现一个分支与其他分支存在遗传差异。产生这种差异的原因可能是残留杂合、突变或遗传污染。,由同一个近交系分支分离出来的具有各不
24、同生物学特性的品系,称为原品系的亚系或支系。先看什么是亚系,亚系指一个近交系内各个分支的动物之间,已发现或十分可能存在遗传差异的动物群体.,遗传漂变:是指一个品系动物的基因型在饲养过程中由于残留杂合基因分离等原因发生的随机改变。 基因突变:由于动物基因组中某个核苷酸残基的置换、缺失或插入,引起一个等位基因的改变。 遗传污染:通常是由于其他品系动物与本品系动物发生交配所致。由于遗传污染形成的亚系,通常与原品系之间遗传差异较大,因此对这样形成的亚系应重新命名。例如A近交系在发生遗传污染后,重新命名为AZG。,遗传污染是最常见的实验动物管理事故,,亚系的命名,在品系名称后加一道斜线(/),斜线后标明
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- 实验 动物 遗传学 分类 及其 质量 控制
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