酶学基础知识讲稿.ppt
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1、关于酶学基础知识第一页,讲稿共五十五页哦第二章第二章 酶学基础知识酶学基础知识 n第一节 酶的分类与命名n第二节酶(蛋白类酶)的结构与功能第二页,讲稿共五十五页哦第一节第一节 酶的分类与命名酶的分类与命名n大肠杆菌细胞中,大肠杆菌细胞中,30003000种酶种酶n高等真核生物细胞中,高等真核生物细胞中,50005000种酶种酶n国际酶学委员会已知的酶见表国际酶学委员会已知的酶见表1 1:第三页,讲稿共五十五页哦表1 已知酶历年增长统计n资料来源与年份已知酶数量资料来源与年份已知酶数量nReport of the Enzyme Commission(1961)712Report of the E
2、nzyme Commission(1961)712nEnzyme Nomenclature(1964)874Enzyme Nomenclature(1964)874nEnzyme Nomenclature(1972)1770Enzyme Nomenclature(1972)1770nEnzyme Nomenclature(1978)2122Enzyme Nomenclature(1978)2122nSupplements 1-4 2252Supplements 1-4 2252nEnzyme Nomenclature(1984)2477Enzyme Nomenclature(1984)2477
3、nSupplements 1-3(Eur.J.Biochem.)(1990)2966Supplements 1-3(Eur.J.Biochem.)(1990)2966nEnzyme Nomenclature(1992)3169Enzyme Nomenclature(1992)3169nSupplements 1-4(Eur.J.Biochem.)(1997)3702Supplements 1-4(Eur.J.Biochem.)(1997)3702第四页,讲稿共五十五页哦酶的分类命名原则 n分类命名方法:分类命名方法:n对于蛋白类酶现在普遍接受的是对于蛋白类酶现在普遍接受的是国际酶学国际酶学委员
4、会委员会19611961年年制定的酶分类与命名法。制定的酶分类与命名法。n对于核酸类酶由于其研究历史不长,对于分对于核酸类酶由于其研究历史不长,对于分类和命名还没有统一的原则和规定。类和命名还没有统一的原则和规定。第五页,讲稿共五十五页哦蛋白类酶与核酸类酶n按照分子中起催化作用的按照分子中起催化作用的主要组分主要组分不同,酶不同,酶可以分为蛋白类酶(可以分为蛋白类酶(proteozyme,P酶)酶)和核酸类酶(和核酸类酶(ribozyme,R酶,核酶)两大酶,核酶)两大类。类。n两者的两者的显著区别显著区别之一是蛋白类酶只能催化其之一是蛋白类酶只能催化其他分子进行反应,而核酸类酶却可以催化酶他
5、分子进行反应,而核酸类酶却可以催化酶分子本身也可以催化其他分子进行反应。分子本身也可以催化其他分子进行反应。第六页,讲稿共五十五页哦一、蛋白类酶(P酶)的分类n(1)氧化还原酶类n(2)转移酶类n(3)水解酶类n(4)裂合酶类n(5)异构酶类n(6)连接或合成酶类1961年国际酶学委员会(Enzyme Committee,EC)根据酶所催化的反应类型和机理,把酶分成6大类:第七页,讲稿共五十五页哦(1 1)氧化还原酶类氧化还原酶类n催化氧化-还原反应。n供体:受体氧化还原酶n主要包括脱氢酶(dehydrogenase)和还原(氧化)酶(Oxidase)。n例如,乳酸(Lactate)脱氢酶催化
6、乳酸的脱氢反应。第八页,讲稿共五十五页哦(2 2)转移酶类转移酶催化转移酶催化基团转移基团转移反应,即将一个底物分反应,即将一个底物分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。供体:受体供体:受体 某基团转移酶某基团转移酶例如,例如,谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。第九页,讲稿共五十五页哦(3 3)水解酶类水解酶类n水解酶催化底物的加水分解反应。n底物名称 反应集团位置 水解酶n主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。n例如,脂肪酶(Lipase)催化的脂的水解反应。第十页,讲稿共五十五页哦(4 4)裂合酶类裂合酶类n裂合酶催化
7、从底物分子中移去一个基团或原子形成双键的反应及其逆反应。n底物 裂解基团 裂合酶n主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。n例如,延胡索酸水合酶催化的反应。第十一页,讲稿共五十五页哦(5 5)异构酶类异构酶类n催化各种同分异构体的相互转变。即底物分子内基团或原子的重排过程。n按异构化类型分为6个亚类,异构、消旋、变位、表异构、顺反异构n底物名称 亚类 酶n例如,6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。第十二页,讲稿共五十五页哦(6 6)合成酶类n合成酶,又称为连接酶,能够催化C-C、C-O、C-N 以及C-S 键的形成反应。这类反应必须与ATP分解反应相互偶联。nA+B+ATP=AB+ADP+Pi n底物:
8、底物 连接酶 n例如,谷氨酰胺合成酶催化的反应。L谷氨酸+氨+ATP=L谷氨酰胺+ADP+Pi 第十三页,讲稿共五十五页哦蛋白类酶的系统名、惯用名系统名:包括所有底物的名称和反应类型。乳酸+NAD+丙酮酸+NADH+H+乳酸:NAD+氧化还原酶惯用名:只取一个较重要的底物名称和反应类型。乳酸:NAD+氧化还原酶乳酸脱氢酶对于催化水解反应的酶一般在酶的名称上省去反应类型。第十四页,讲稿共五十五页哦乳酸脱氢酶 EC 1.1.1.27第1大类,氧化还原酶第1亚类,氧化基团CHOH第1亚亚类,H受体为NAD+该酶在亚亚类中的流水编号第十五页,讲稿共五十五页哦编号系统命名习惯命名催化的反应EC.1.1.
9、1.27乳酸:NAD+氧化还原酶乳酸脱氢酶乳酸+NAD+丙酮酸+NADHEC2.6.1.1L-天冬氨酸:a-酮戊二酸氨基转移酶天冬氨酸氨基转移酶L-天冬氨酸+-酮戊二酸草酰乙酸+L-谷氨酸EC3.1.3.9D-葡萄糖-6-磷酸磷酸水解酶葡萄糖-6-磷酸酶D-葡萄糖-6-磷酸+H2O 葡萄糖+H3PO4EC4.1.2.13D-果糖-1,6-二磷酸:D-甘油醛-3-磷酸裂合酶醛缩酶D-果糖-1,6-二磷酸 磷酸二羟丙酮+D-甘油醛-3-磷酸EC3.1.3.9D-葡萄糖-6-磷酸酮醇异构酶磷酸己糖异构酶D-葡萄糖-6-磷酸 D-果糖-6-磷酸EC6.3.1.2L-谷氨酸:氨连接酶谷氨酰胺合成酶ATP
10、+L-谷氨酸+NH3 L-谷氨酰胺+ADP+H3PO4第十六页,讲稿共五十五页哦三、其他习惯归类命名法 n单体酶和寡聚酶单体酶和寡聚酶n单纯酶和结合酶单纯酶和结合酶 n恒态酶和调节酶恒态酶和调节酶 n胞内酶、胞外酶胞内酶、胞外酶 第十七页,讲稿共五十五页哦1.单体酶和寡聚酶单体酶和寡聚酶n根据酶蛋白质根据酶蛋白质组成特点组成特点可将已知酶分为单体酶可将已知酶分为单体酶和寡聚酶。和寡聚酶。n(1)单体酶n单体酶仅由单体酶仅由单条肽链单条肽链组成,相对分子质量组成,相对分子质量1300035000,不能再解离成更小的组成,不能再解离成更小的组成单位。其中许多是催化单位。其中许多是催化水解反应水解反
11、应的酶,一般的酶,一般不不需辅助需辅助因子。因子。n在单体酶中有一些是在单体酶中有一些是蛋白水解酶蛋白水解酶,它们多以,它们多以无无活性的酶原形式合成活性的酶原形式合成,在需要时再水解除去部,在需要时再水解除去部分肽链转变为有活性的酶。分肽链转变为有活性的酶。第十八页,讲稿共五十五页哦(2 2)寡聚酶寡聚酶n已知的酶绝大多数是寡聚酶,由相同或者不已知的酶绝大多数是寡聚酶,由相同或者不同的亚基组成,它们包含同的亚基组成,它们包含两条或多条肽链两条或多条肽链,相对分子质量通常超过相对分子质量通常超过35000。例如,糖酵。例如,糖酵解有关的酶都是包含解有关的酶都是包含24个亚基的寡聚酶。个亚基的寡
12、聚酶。在寡聚酶中有许多是代谢途径中的在寡聚酶中有许多是代谢途径中的关键酶关键酶,它们的它们的活性活性可通过可通过多种方式多种方式,特别是通过,特别是通过别别构机制构机制进行进行调节调节。第十九页,讲稿共五十五页哦2.单纯酶和结合酶单纯酶和结合酶n从酶的成分组成上看,可将酶分为从酶的成分组成上看,可将酶分为单成分酶单成分酶和和双成分酶双成分酶两种。两种。或称为或称为单纯酶单纯酶和和结合酶结合酶。n单成分酶单成分酶(单纯酶单纯酶)在催化过程中)在催化过程中不需要辅酶不需要辅酶,除了蛋白质外不,除了蛋白质外不含其他成分。如:水解酶类的胃蛋白酶、胰蛋白酶、脲酶、核酸酶等。含其他成分。如:水解酶类的胃蛋
13、白酶、胰蛋白酶、脲酶、核酸酶等。n双成分酶双成分酶(结合酶结合酶):又称):又称全酶全酶,在催化反应中需要有辅助因,在催化反应中需要有辅助因子,由子,由蛋白蛋白和和非蛋白非蛋白两部分组成。其中两部分组成。其中非蛋白部分非蛋白部分称为称为辅助因子辅助因子,单纯的辅助因子不呈现酶活力,只有两者结合在一起形成单纯的辅助因子不呈现酶活力,只有两者结合在一起形成全酶才显示全酶才显示活力活力。如氧化还原酶类、转移酶类中的许多酶。如氧化还原酶类、转移酶类中的许多酶。n 全酶酶蛋白辅助因子全酶酶蛋白辅助因子第二十页,讲稿共五十五页哦3.恒态酶和调节酶恒态酶和调节酶n根据酶在根据酶在代谢代谢中所处的中所处的地位
14、地位、含量含量与与活性活性情况,情况,也可以分成恒态酶与调节酶。也可以分成恒态酶与调节酶。n恒态酶恒态酶是构成代谢途径和物质转化体系的是构成代谢途径和物质转化体系的基本基本组成成分组成成分,在细胞中恒态酶的含量相对恒定,在细胞中恒态酶的含量相对恒定,其活性仅其活性仅受反应动力学受反应动力学系统本身的组成因素调系统本身的组成因素调节。节。n调节酶调节酶是指在代谢途径和物质转化体系中起是指在代谢途径和物质转化体系中起调调节作用的关键酶节作用的关键酶,它们的,它们的含量含量与与活性活性常因机体常因机体的机能状况而不同。按照其活性调节方式又可的机能状况而不同。按照其活性调节方式又可分为三种类型分为三种
15、类型:潜态酶,别构酶和多功能酶潜态酶,别构酶和多功能酶。第二十一页,讲稿共五十五页哦(1 1)潜态酶潜态酶n潜态酶潜态酶是指那些通常以无活性的酶原状态存是指那些通常以无活性的酶原状态存在,而在机能需要时再转变为活性状态的酶。在,而在机能需要时再转变为活性状态的酶。这种激活调节一般以级联催化方式进行。包这种激活调节一般以级联催化方式进行。包括两种类型:一是括两种类型:一是不可逆的共价调节不可逆的共价调节,即所,即所谓的谓的酶原激活酶原激活。除了前述的消化性蛋白水解。除了前述的消化性蛋白水解酶外,也包括那些具有生理功能的蛋白酶,酶外,也包括那些具有生理功能的蛋白酶,例如例如凝血酶、溶血纤蛋白酶凝血
16、酶、溶血纤蛋白酶等都是通过这种等都是通过这种方式调节的;二是方式调节的;二是可逆共价调节可逆共价调节。第二十二页,讲稿共五十五页哦(2 2)别构酶别构酶n别构酶,这些酶别构酶,这些酶在结构上除了具在结构上除了具有能和底物相结有能和底物相结合、并催化底物合、并催化底物进行反应的活性进行反应的活性中心外,还具有中心外,还具有能和效应物相结能和效应物相结合的合的调节中心调节中心。第二十三页,讲稿共五十五页哦 (3)多功能酶n多功能酶多功能酶指具有一种以上催化活性的酶,指具有一种以上催化活性的酶,他们有的是由他们有的是由不同亚基不同亚基组成,还有一些组成,还有一些别构酶别构酶也是多功能酶。也是多功能酶
17、。第二十四页,讲稿共五十五页哦4.胞内酶、胞外酶胞内酶、胞外酶n生物合成的酶有两种类型生物合成的酶有两种类型:存在于胞内存在于胞内或转位通过细胞质膜到胞外。或转位通过细胞质膜到胞外。第二十五页,讲稿共五十五页哦(1 1)胞内酶胞内酶n胞内酶胞内酶是指在合成后仍留在细胞内发挥作用的是指在合成后仍留在细胞内发挥作用的酶。酶。n酶在细胞内存在部位是不同的,有些酶是酶在细胞内存在部位是不同的,有些酶是“可可溶的溶的”,并不直接与细胞中任何特定结构组分,并不直接与细胞中任何特定结构组分相连接;另一些酶则是相连接;另一些酶则是“不溶的不溶的”,他们与细他们与细胞膜或细胞器结合,较难与细胞的组分分开,胞膜或
18、细胞器结合,较难与细胞的组分分开,如线粒体上的酶。为从胞内提取某种酶,一般如线粒体上的酶。为从胞内提取某种酶,一般要通过破壁、抽提、离心等步骤。要通过破壁、抽提、离心等步骤。第二十六页,讲稿共五十五页哦(2 2)胞外酶胞外酶n胞外酶胞外酶(又可称为分泌型酶又可称为分泌型酶)是指可以是指可以穿过质穿过质膜膜的任何酶,大多数是的任何酶,大多数是水解酶水解酶,多数,多数工业工业用用酶都是胞外酶。如淀粉酶、蛋白酶、纤维素酶都是胞外酶。如淀粉酶、蛋白酶、纤维素酶、果胶酶等。胞外酶优点明显,它比胞内酶、果胶酶等。胞外酶优点明显,它比胞内酶酶容易回收容易回收、纯化纯化,不必将细胞破碎不必将细胞破碎,也,也不
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