基因克隆载体 (3)精选PPT.ppt
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1、关于基因克隆载体关于基因克隆载体(3)第1页,讲稿共37张,创作于星期日第二节第二节 病毒(噬菌体)克隆载体病毒(噬菌体)克隆载体病毒病毒病毒病毒基本结构:基本结构:基本结构:基本结构:DNADNADNADNA(或(或(或(或RNARNARNARNA)+外壳蛋白外壳蛋白外壳蛋白外壳蛋白 噬菌体噬菌体噬菌体噬菌体:感染细菌的病毒感染细菌的病毒感染细菌的病毒感染细菌的病毒 分类(根据病毒与宿主的关系)分类(根据病毒与宿主的关系)分类(根据病毒与宿主的关系)分类(根据病毒与宿主的关系)温和温和温和温和性病毒:性病毒:性病毒:性病毒:溶原性增殖溶原性增殖溶原性增殖溶原性增殖构建病毒载体构建病毒载体构建
2、病毒载体构建病毒载体 烈性病毒:烈性病毒:烈性病毒:烈性病毒:溶菌性增殖溶菌性增殖溶菌性增殖溶菌性增殖改造后改造后改造后改造后 第2页,讲稿共37张,创作于星期日噬菌体的电子显微镜照片噬菌体的电子显微镜照片一、一、噬菌体克隆载体噬菌体克隆载体第3页,讲稿共37张,创作于星期日DNA+DNA+外壳蛋白外壳蛋白 1 1、DNA(48.5kb)DNA(48.5kb)噬菌体中:噬菌体中:线性线性 宿主细胞:宿主细胞:环状环状(cos(cos位点位点)(一)(一)噬菌体性质噬菌体性质第4页,讲稿共37张,创作于星期日l l在噬菌体内呈在噬菌体内呈线性双链线性双链DNA分子分子(48502bp)在两在两端
3、各有端各有12个碱基组成的个碱基组成的5单链单链互补粘性末端互补粘性末端(Cohesive end);l l进入宿主细胞后,粘性末端连接形成环状分子进入宿主细胞后,粘性末端连接形成环状分子(Cos位点位点)。(。(DNA连接酶)连接酶)第5页,讲稿共37张,创作于星期日2 2、噬菌体噬菌体基因组有基基因组有基因因6161个以上个以上J J与与N N、P P与与Q Q之间为之间为非非必需序列必需序列第6页,讲稿共37张,创作于星期日n n迄今已经定位的迄今已经定位的噬菌体基因至少有噬菌体基因至少有6161个,其个,其中有一半左右参与了噬菌体生命周期的调控(中有一半左右参与了噬菌体生命周期的调控(
4、必必需基因需基因););n n另一部分基因则被称为另一部分基因则被称为非必需基因非必需基因;当它们被;当它们被外源基因取代后,不影响噬菌体的生命周期。外源基因取代后,不影响噬菌体的生命周期。n n由外源基因取代非必需基因所形成的重组噬菌体由外源基因取代非必需基因所形成的重组噬菌体DNADNA,可以随寄主细胞一起被复制和增殖。,可以随寄主细胞一起被复制和增殖。第7页,讲稿共37张,创作于星期日3 3、限制性核酸内切酶位点限制性核酸内切酶位点:56 56种种4 4、噬菌体的生长途径噬菌体的生长途径 溶菌溶菌生长途径生长途径 溶原溶原生长途径生长途径宿主合成宿主合成int基因产物基因产物-DNA整整
5、合到染色体合到染色体DNA上上 某种胁迫条件下某种胁迫条件下合成合成six基因产物基因产物-DNA脱离细菌染色体脱离细菌染色体溶菌溶菌第8页,讲稿共37张,创作于星期日(二)构建依据(二)构建依据 1 1、噬菌体是一种温和噬菌体噬菌体是一种温和噬菌体 2 2、能承载较大的外源、能承载较大的外源DNADNA片段片段 野生型野生型DNADNA头部可包装约头部可包装约36.436.451kb51kb(自身的自身的75%75%105%)105%),且约有,且约有20kb20kb DNA DNA可缺失(生可缺失(生长非必需)长非必需)3 3、在、在DNADNA上有多种限制性内切酶位点上有多种限制性内切酶
6、位点 第9页,讲稿共37张,创作于星期日(三)构建的基本策略与技术路线(三)构建的基本策略与技术路线 策略策略:n n切去部分非必需区切去部分非必需区n n删掉多余的限制性内切酶位点删掉多余的限制性内切酶位点n n插入选择性标记基因插入选择性标记基因n n建立体外包装系统建立体外包装系统第10页,讲稿共37张,创作于星期日n n技术路线技术路线 1 1 1 1、用限制性酶切去非必需区,抹去多余识别位点、用限制性酶切去非必需区,抹去多余识别位点、用限制性酶切去非必需区,抹去多余识别位点、用限制性酶切去非必需区,抹去多余识别位点 选定一种酶,以选定一种酶,以选定一种酶,以选定一种酶,以gtWES
7、gtWES gtWES gtWES 为例,为例,为例,为例,EcoRIEcoRIEcoRIEcoRI(48.5kb48.5kb48.5kb48.5kb)DNA DNA DNA DNA E co R I E co R I E co R I E co R I 6 6 6 6个片段个片段个片段个片段 第11页,讲稿共37张,创作于星期日uuB B B B片段是片段是片段是片段是噬菌体生长非必需的;噬菌体生长非必需的;噬菌体生长非必需的;噬菌体生长非必需的;uuC C C C片段缺失可阻断溶原生长途径,但不影响溶菌途径;片段缺失可阻断溶原生长途径,但不影响溶菌途径;片段缺失可阻断溶原生长途径,但不影响
8、溶菌途径;片段缺失可阻断溶原生长途径,但不影响溶菌途径;uuE E E E片段去掉片段去掉片段去掉片段去掉min5min5min5min5序列(序列(序列(序列(2.6kb2.6kb2.6kb2.6kb)。)。)。)。两端两端两端两端EcoR IEcoR IEcoR IEcoR I别点经点突变或甲基化处别点经点突变或甲基化处别点经点突变或甲基化处别点经点突变或甲基化处理,即得理,即得理,即得理,即得gtWESgtWESgtWESgtWES:(:(:(:(48.5-5.5-2.6=40.4kb48.5-5.5-2.6=40.4kb48.5-5.5-2.6=40.4kb48.5-5.5-2.6=4
9、0.4kb)克隆能力:克隆能力:克隆能力:克隆能力:替换替换替换替换B B B B:最大:最大:最大:最大:51-(40.4-4.9)=15.5kb 51-(40.4-4.9)=15.5kb 51-(40.4-4.9)=15.5kb 51-(40.4-4.9)=15.5kb 最小:最小:最小:最小:36.4-(40.4-4.9)=0.9kb 36.4-(40.4-4.9)=0.9kb 36.4-(40.4-4.9)=0.9kb 36.4-(40.4-4.9)=0.9kb 实际应用时克隆能力略有出入(实际应用时克隆能力略有出入(实际应用时克隆能力略有出入(实际应用时克隆能力略有出入(p109,p
10、109,p109,p109,表表表表3-53-53-53-5)4.9kb21.6kb5.5kb7.5kb5.9kb3.3kb第12页,讲稿共37张,创作于星期日 2 2、在、在DNADNA的非必需区内插入选择标记基因的非必需区内插入选择标记基因(1 1 1 1)自然筛选)自然筛选)自然筛选)自然筛选(51kb51kb51kb51kb或或或或36.4kb36.4kb36.4kb36.4kb不能包装)不能包装)不能包装)不能包装)(2 2 2 2)插入选择标记基因)插入选择标记基因)插入选择标记基因)插入选择标记基因 取代取代取代取代redredredred和和和和gamgamgamgam基因基因
11、基因基因野生型野生型野生型野生型噬菌体噬菌体噬菌体噬菌体(Spi+(Spi+(Spi+(Spi+表型表型表型表型)在在在在P2P2P2P2噬菌体溶原性细胞中噬菌体溶原性细胞中噬菌体溶原性细胞中噬菌体溶原性细胞中不能不能不能不能生长生长生长生长 (redredredred、gamgamgamgam基因基因基因基因)外源外源外源外源DNADNADNADNA取代取代取代取代 获获获获Spi-Spi-Spi-Spi-表型表型表型表型 在在在在P2P2P2P2噬菌体溶原性细胞中噬菌体溶原性细胞中噬菌体溶原性细胞中噬菌体溶原性细胞中能能能能生长生长生长生长 redredredred、gamgamgamga
12、m基因基因基因基因 局限性:局限性:局限性:局限性:只能以只能以只能以只能以P2P2P2P2噬菌体溶原细胞作为受体噬菌体溶原细胞作为受体噬菌体溶原细胞作为受体噬菌体溶原细胞作为受体 最常用的筛选标记:最常用的筛选标记:最常用的筛选标记:最常用的筛选标记:Lac ZLac ZLac ZLac Z基因基因基因基因第13页,讲稿共37张,创作于星期日3 3 3 3、建立重组、建立重组、建立重组、建立重组DNADNADNADNA分子体外包装系统分子体外包装系统分子体外包装系统分子体外包装系统体外重组体外重组体外重组体外重组DNADNADNADNA分子必须经分子必须经分子必须经分子必须经体外包装体外包装
13、体外包装体外包装成噬菌体颗粒后,成噬菌体颗粒后,成噬菌体颗粒后,成噬菌体颗粒后,才能转导受体细胞。才能转导受体细胞。才能转导受体细胞。才能转导受体细胞。野生型野生型野生型野生型噬菌体感染的细胞中无多余的外壳蛋白。噬菌体感染的细胞中无多余的外壳蛋白。噬菌体感染的细胞中无多余的外壳蛋白。噬菌体感染的细胞中无多余的外壳蛋白。D D D D-(D D D D基因缺失噬菌体)基因缺失噬菌体)基因缺失噬菌体)基因缺失噬菌体)受体细胞受体细胞受体细胞受体细胞积累除积累除积累除积累除D D D D蛋白以蛋白以蛋白以蛋白以外所有蛋白质外所有蛋白质外所有蛋白质外所有蛋白质E E E E-(E E E E基因缺失噬
14、菌体)基因缺失噬菌体)基因缺失噬菌体)基因缺失噬菌体)受体细胞受体细胞受体细胞受体细胞积累除积累除积累除积累除E E E E蛋白以蛋白以蛋白以蛋白以外所有蛋白质外所有蛋白质外所有蛋白质外所有蛋白质混合混合混合混合 D D D D、E E E E互补互补互补互补 包装包装包装包装DNADNADNADNA分子分子分子分子 噬菌体噬菌体噬菌体噬菌体 如如如如:菌株菌株菌株菌株BHB2688(EBHB2688(EBHB2688(EBHB2688(E-)+BHB2690(D)+BHB2690(D)+BHB2690(D)+BHB2690(D-)第14页,讲稿共37张,创作于星期日第15页,讲稿共37张,创
15、作于星期日(四)(四)噬菌体克隆载体的应用噬菌体克隆载体的应用 1 1、建立、建立c DNAc DNA基因文库基因文库 n n转导转导(transduction)(transduction)由噬菌体和细胞病毒介导的由噬菌体和细胞病毒介导的遗传信息转移过程。遗传信息转移过程。效率高效率高。n n转染转染(transfection)(transfection)指真核细胞主动或者被动指真核细胞主动或者被动导入外源导入外源DNA DNA 片段而获得新表型的过程。片段而获得新表型的过程。2 2、克隆外源目的基因、克隆外源目的基因第16页,讲稿共37张,创作于星期日(五)重组(五)重组DNADNA分子的体
16、外包装(自分子的体外包装(自学)学)1 1、溶原菌、溶原菌BHB2688(EBHB2688(E-)和和BHB2690(DBHB2690(D-)的检验的检验2 2、制备包装物、制备包装物3 3、体外包装、体外包装第17页,讲稿共37张,创作于星期日(一)构建策略(一)构建策略(一)构建策略(一)构建策略 由由由由质粒质粒质粒质粒和和和和含含含含coscoscoscos位点位点位点位点的的的的DNADNADNADNA片段片段片段片段组装成的载体,即组装成的载体,即组装成的载体,即组装成的载体,即cosmidcosmidcosmidcosmid克隆载体克隆载体克隆载体克隆载体,又叫粘粒又叫粘粒又叫粘
17、粒又叫粘粒;或:或:或:或:cosmidcosmidcosmidcosmid克隆载体是一类带克隆载体是一类带克隆载体是一类带克隆载体是一类带有噬菌体有噬菌体有噬菌体有噬菌体DNADNADNADNA粘性末端顺序的粘性末端顺序的粘性末端顺序的粘性末端顺序的质粒质粒质粒质粒DNADNADNADNA分子。是分子。是分子。是分子。是噬菌体质噬菌体质噬菌体质噬菌体质粒粒粒粒混合物。混合物。混合物。混合物。二、二、cosmidcosmid克隆载体(柯斯质粒载体)克隆载体(柯斯质粒载体)第18页,讲稿共37张,创作于星期日(二)(二)cosmidcosmid的特征的特征 1 1 1 1、环形双链、环形双链、环
18、形双链、环形双链DNADNADNADNA分子分子分子分子,36.4kb,36.4kb,36.4kb,36.4kb,一般一般一般一般10kb10kb10kb10kb 2 2 2 2、具有质粒的性质,可转化大肠杆菌,并按质粒方式复、具有质粒的性质,可转化大肠杆菌,并按质粒方式复、具有质粒的性质,可转化大肠杆菌,并按质粒方式复、具有质粒的性质,可转化大肠杆菌,并按质粒方式复制制制制 3 3 3 3、含有一个、含有一个、含有一个、含有一个coscoscoscos位点位点位点位点 A A A A蛋白蛋白蛋白蛋白 coscoscoscos末端末端末端末端体外包装成为噬菌体,体外包装成为噬菌体,体外包装成为
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