基因工程与分子生物学常用技术精选PPT.ppt
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1、关于基因工程与分子生关于基因工程与分子生物学常用技术物学常用技术第1页,讲稿共34张,创作于星期日第一节 基因工程与基因重组(Genetic Engineering and Genetic recombination)一、基因工程的基本概念一、基因工程的基本概念 不同来源的不同来源的DNA分子可以通过磷酸二酯键连接形成分子可以通过磷酸二酯键连接形成重新组合的重新组合的DNA分子,称为分子,称为DNA重组重组。将基因进行克隆,并表达制备特定的产物,或将基因进行克隆,并表达制备特定的产物,或定向改造细胞乃至生物个体的特性所用的方法及相定向改造细胞乃至生物个体的特性所用的方法及相关的工作统称为关的工
2、作统称为基因工程基因工程。第2页,讲稿共34张,创作于星期日(一一)工具酶工具酶1.1.限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶 (1)(1)能够切割能够切割能够切割能够切割DNADNA中磷酸二酯键的酶称核酸酶,其中中磷酸二酯键的酶称核酸酶,其中中磷酸二酯键的酶称核酸酶,其中中磷酸二酯键的酶称核酸酶,其中有选择地切割有选择地切割有选择地切割有选择地切割DNADNA分子特异序列的核酸酶,称为分子特异序列的核酸酶,称为分子特异序列的核酸酶,称为分子特异序列的核酸酶,称为限制性限制性限制性限制性核酸内切酶核酸内切酶核酸内切酶核酸内切酶,简称限制性内切酶。,简称限制性内切酶。,
3、简称限制性内切酶。,简称限制性内切酶。(2)(2)命名命名命名命名Hin d 属属 系系 株株 序序Haemophilus influenzae d株株流感嗜血杆菌流感嗜血杆菌d株的第株的第三三种酶种酶(3)(3)识别特征识别特征识别特征识别特征5GAATTC33CTTAAG5 限制性内切酶识别限制性内切酶识别限制性内切酶识别限制性内切酶识别的的的的DNADNA序列具有序列具有序列具有序列具有回文回文回文回文结构结构结构结构特征。特征。特征。特征。第3页,讲稿共34张,创作于星期日 不同的限制性内切酶识别和切割的特异性不同,结果有不同的限制性内切酶识别和切割的特异性不同,结果有3种不种不同的情
4、况:同的情况:产生产生产生产生3 3 突出粘性末端突出粘性末端突出粘性末端突出粘性末端:以:以:以:以EcoEcoR R为例:为例:为例:为例:5G5GAATTC3 AATTC3 5G5G AATTC3 AATTC33CTTAA3CTTAAG5 G5 3CTTAA3CTTAA G5 G5 产生产生产生产生5 5 突出粘性末端突出粘性末端突出粘性末端突出粘性末端:以:以:以:以PstPst为例:为例:为例:为例:5CTGCA5CTGCA G3 G3 5CTGCA5CTGCA G3 G33G3G ACGTC5 ACGTC5 3 G3 G ACGTC5 ACGTC5 产生产生产生产生平末端平末端平末
5、端平末端:NruNru为例:为例:为例:为例:5TCG5TCGCGA3 CGA3 5TCG5TCG CGA3 CGA3 3AGC3AGCGCT5 GCT5 3AGC3AGC GCT5 GCT5(4)(4)切割位点切割位点切割位点切割位点第4页,讲稿共34张,创作于星期日2.DNA2.DNA聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶(1)(1)基因工程主要应用基因工程主要应用基因工程主要应用基因工程主要应用E.coli E.coli DNADNA聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶、T4 DNAT4 DNA聚合酶和聚合酶和聚合酶和聚合酶和TaqTaq DNA DNA聚合酶等。聚合酶等。聚合酶等。聚合酶等。(2)(2)主要用途
6、:主要用途:主要用途:主要用途:利用利用利用利用5 5/33/聚合活性,合成聚合活性,合成聚合活性,合成聚合活性,合成DNADNA第二条链;第二条链;第二条链;第二条链;对对对对DNADNA的的的的3 3/端进行填补或末端标记;端进行填补或末端标记;端进行填补或末端标记;端进行填补或末端标记;E.coliE.coli DNA-pol DNA-pol用于缺口平移,制作探针;用于缺口平移,制作探针;用于缺口平移,制作探针;用于缺口平移,制作探针;T4 DNAT4 DNA聚合酶可用于聚合酶可用于聚合酶可用于聚合酶可用于DNADNA序列测定;序列测定;序列测定;序列测定;TaqTaq DNA DNA聚
7、合酶用于聚合酶链式反应聚合酶用于聚合酶链式反应聚合酶用于聚合酶链式反应聚合酶用于聚合酶链式反应(PCR)(PCR)。3.DNA3.DNA连接酶连接酶连接酶连接酶 使单链切口形成磷酸二酯键,共价地连接。使单链切口形成磷酸二酯键,共价地连接。使单链切口形成磷酸二酯键,共价地连接。使单链切口形成磷酸二酯键,共价地连接。第5页,讲稿共34张,创作于星期日4.4.逆转录酶逆转录酶逆转录酶逆转录酶(1)(1)用于真核用于真核用于真核用于真核mRNAmRNA逆转录,构建逆转录,构建逆转录,构建逆转录,构建cDNAcDNA文库。文库。文库。文库。(2)(2)用于进行用于进行用于进行用于进行3 3/端填补和标记
8、,制备端填补和标记,制备端填补和标记,制备端填补和标记,制备DNADNA探针。探针。探针。探针。(3)(3)用于用于用于用于DNADNA序列测定。序列测定。序列测定。序列测定。5.5.多核苷酸激酶多核苷酸激酶多核苷酸激酶多核苷酸激酶 (1)(1)用于放射性标记用于放射性标记用于放射性标记用于放射性标记DNADNA链的链的链的链的5 5/端。端。端。端。(2)(2)用于缺少用于缺少用于缺少用于缺少5 5/-磷酸基的磷酸基的磷酸基的磷酸基的DNADNA磷酸化。磷酸化。磷酸化。磷酸化。6.6.碱性磷酸酶碱性磷酸酶碱性磷酸酶碱性磷酸酶 此酶防止载体的自身连接。此酶防止载体的自身连接。此酶防止载体的自身
9、连接。此酶防止载体的自身连接。7.7.末端脱氧核苷酸转移酶末端脱氧核苷酸转移酶末端脱氧核苷酸转移酶末端脱氧核苷酸转移酶 能催化单核苷酸转移到能催化单核苷酸转移到能催化单核苷酸转移到能催化单核苷酸转移到DNADNA的的的的3 3/-端羟基上。端羟基上。端羟基上。端羟基上。第6页,讲稿共34张,创作于星期日(二二)载体载体1.为为携携带带目目的的基基因因,实实现现其其无无性性繁繁殖殖或或表表达达有有意意义义的蛋白质所采用的一些的蛋白质所采用的一些DNA分子,称为载体。分子,称为载体。2.载体的选择标准载体的选择标准能自主复制。能自主复制。能自主复制。能自主复制。易进入宿主细胞。易进入宿主细胞。易进
10、入宿主细胞。易进入宿主细胞。具有多克隆位点。具有多克隆位点。具有多克隆位点。具有多克隆位点。易从宿主细胞中分离纯化。易从宿主细胞中分离纯化。易从宿主细胞中分离纯化。易从宿主细胞中分离纯化。有易被识别和筛选的标志。有易被识别和筛选的标志。有易被识别和筛选的标志。有易被识别和筛选的标志。质粒质粒噬菌体噬菌体粘粒粘粒粘粒粘粒病毒病毒3.常用载体常用载体第7页,讲稿共34张,创作于星期日质粒是细菌中独立于染质粒是细菌中独立于染质粒是细菌中独立于染质粒是细菌中独立于染色质以外的、能自主复制色质以外的、能自主复制色质以外的、能自主复制色质以外的、能自主复制的、并与细菌或细胞共存的、并与细菌或细胞共存的、并
11、与细菌或细胞共存的、并与细菌或细胞共存的遗传成分,的遗传成分,的遗传成分,的遗传成分,可赋予宿主可赋予宿主细胞某些遗传性状。细胞某些遗传性状。通常质粒的大小为通常质粒的大小为通常质粒的大小为通常质粒的大小为2 2300kb300kb。一般只能容纳一般只能容纳一般只能容纳一般只能容纳10kb10kb的外的外的外的外源源源源DNADNA片断。片断。片断。片断。(1)(1)质粒质粒质粒质粒(plasmid)(plasmid)第8页,讲稿共34张,创作于星期日(2)(2)噬菌体噬菌体噬菌体噬菌体(bacteriophage(bacteriophage,phage)phage)噬菌体是感染细菌的一类病毒
12、,因其寄生在细菌中并噬菌体是感染细菌的一类病毒,因其寄生在细菌中并噬菌体是感染细菌的一类病毒,因其寄生在细菌中并噬菌体是感染细菌的一类病毒,因其寄生在细菌中并能溶解细菌细胞,故称为噬菌体。能溶解细菌细胞,故称为噬菌体。能溶解细菌细胞,故称为噬菌体。能溶解细菌细胞,故称为噬菌体。噬菌体由头和尾构成,感染时尾管将基因组噬菌体由头和尾构成,感染时尾管将基因组噬菌体由头和尾构成,感染时尾管将基因组噬菌体由头和尾构成,感染时尾管将基因组DNADNA注入注入注入注入大肠杆菌,而将其蛋白质外壳留在菌外。大肠杆菌,而将其蛋白质外壳留在菌外。大肠杆菌,而将其蛋白质外壳留在菌外。大肠杆菌,而将其蛋白质外壳留在菌外
13、。具有具有具有具有溶菌性和溶原性两种不同的繁殖方式。溶菌性和溶原性两种不同的繁殖方式。溶菌性和溶原性两种不同的繁殖方式。溶菌性和溶原性两种不同的繁殖方式。第9页,讲稿共34张,创作于星期日(3)(3)粘粒粘粒粘粒粘粒(cosmid)(cosmid)粘粒本身约粘粒本身约粘粒本身约粘粒本身约4 4 6kb6kb,可克隆,可克隆,可克隆,可克隆DNADNA大片段,可用作建大片段,可用作建大片段,可用作建大片段,可用作建立真核基因组文库的载体。立真核基因组文库的载体。立真核基因组文库的载体。立真核基因组文库的载体。粘粒是将粘粒是将粘粒是将粘粒是将 噬菌体的噬菌体的噬菌体的噬菌体的coscos区与质粒组
14、合的装配型载区与质粒组合的装配型载区与质粒组合的装配型载区与质粒组合的装配型载体。体。体。体。(4)(4)病毒病毒病毒病毒 病毒载体更多病毒载体更多病毒载体更多病毒载体更多地用于真核表达系地用于真核表达系地用于真核表达系地用于真核表达系统,如腺病毒、痘统,如腺病毒、痘统,如腺病毒、痘统,如腺病毒、痘病毒、反转录病毒病毒、反转录病毒病毒、反转录病毒病毒、反转录病毒和猴空泡病毒。和猴空泡病毒。和猴空泡病毒。和猴空泡病毒。第10页,讲稿共34张,创作于星期日二、重组二、重组DNA技术的基本原理和技术的基本原理和过程过程 基因工程中最主要是基因工程中最主要是基因工程中最主要是基因工程中最主要是分子克隆
15、分子克隆分子克隆分子克隆,克隆克隆克隆克隆是指由一个是指由一个是指由一个是指由一个细胞经过无性繁殖后所形成的子代群体。进行分子克隆所细胞经过无性繁殖后所形成的子代群体。进行分子克隆所细胞经过无性繁殖后所形成的子代群体。进行分子克隆所细胞经过无性繁殖后所形成的子代群体。进行分子克隆所采用的技术即重组采用的技术即重组采用的技术即重组采用的技术即重组DNADNA技术,故又称为分子克隆技术技术,故又称为分子克隆技术技术,故又称为分子克隆技术技术,故又称为分子克隆技术或基因工程技术。或基因工程技术。或基因工程技术。或基因工程技术。制备目的基因和相关载体;制备目的基因和相关载体;制备目的基因和相关载体;制
16、备目的基因和相关载体;将目的基因和载体进行连接;将目的基因和载体进行连接;将目的基因和载体进行连接;将目的基因和载体进行连接;将重组的将重组的将重组的将重组的DNADNA导入受体细胞;导入受体细胞;导入受体细胞;导入受体细胞;DNADNA重组体的筛选和鉴定;重组体的筛选和鉴定;重组体的筛选和鉴定;重组体的筛选和鉴定;DNADNA重组体的扩增、表达。重组体的扩增、表达。重组体的扩增、表达。重组体的扩增、表达。基本步骤基本步骤基本步骤基本步骤第11页,讲稿共34张,创作于星期日(一一)目的基因的制备目的基因的制备1.1.制备基因组制备基因组制备基因组制备基因组DNADNA文库文库文库文库 (gen
17、omic library)(genomic library)将基因组将基因组将基因组将基因组DNADNA酶切成片段,再与载体分子拼接成重酶切成片段,再与载体分子拼接成重酶切成片段,再与载体分子拼接成重酶切成片段,再与载体分子拼接成重组组组组DNADNA,将其引入宿主细胞进行扩增,所得分子克隆,将其引入宿主细胞进行扩增,所得分子克隆,将其引入宿主细胞进行扩增,所得分子克隆,将其引入宿主细胞进行扩增,所得分子克隆混合体称基因组文库。混合体称基因组文库。混合体称基因组文库。混合体称基因组文库。2.2.制备制备制备制备cDNAcDNA文库文库文库文库 (cDNA library)(cDNA libra
18、ry)将将将将mRNAmRNA逆转录合成逆转录合成逆转录合成逆转录合成cDNA cDNA,再与载体连接成重组,再与载体连接成重组,再与载体连接成重组,再与载体连接成重组DNADNA,将其引入宿主细胞并进行扩增,所得分子克隆,将其引入宿主细胞并进行扩增,所得分子克隆,将其引入宿主细胞并进行扩增,所得分子克隆,将其引入宿主细胞并进行扩增,所得分子克隆的混合体称为的混合体称为的混合体称为的混合体称为cDNAcDNA文库。文库。文库。文库。第12页,讲稿共34张,创作于星期日3.3.聚合酶链式反应聚合酶链式反应聚合酶链式反应聚合酶链式反应(PCR)(PCR)如已知目的基因序列,则可采用如已知目的基因序
19、列,则可采用如已知目的基因序列,则可采用如已知目的基因序列,则可采用PCRPCR从基因组从基因组从基因组从基因组DNADNA中获得目的基因,也可以采用逆转录中获得目的基因,也可以采用逆转录中获得目的基因,也可以采用逆转录中获得目的基因,也可以采用逆转录PCR(RT-PCR(RT-PCR)PCR)直接从直接从直接从直接从mRNAmRNA获得特定基因的获得特定基因的获得特定基因的获得特定基因的cDNAcDNA。4 4化学合成化学合成化学合成化学合成 如已知肽链的氨基酸顺序,则可按对应密码如已知肽链的氨基酸顺序,则可按对应密码如已知肽链的氨基酸顺序,则可按对应密码如已知肽链的氨基酸顺序,则可按对应密
20、码子推导出子推导出子推导出子推导出DNADNA的碱基序列,然后合成该段的碱基序列,然后合成该段的碱基序列,然后合成该段的碱基序列,然后合成该段DNADNA序列。序列。序列。序列。第13页,讲稿共34张,创作于星期日(二二)目的基因与载体的连接目的基因与载体的连接1 1粘性末端连接粘性末端连接粘性末端连接粘性末端连接2 2同聚物加尾连接同聚物加尾连接同聚物加尾连接同聚物加尾连接3 3平末端连接平末端连接平末端连接平末端连接4 4人工接头连接人工接头连接人工接头连接人工接头连接 将目的基因插入载体,用将目的基因插入载体,用将目的基因插入载体,用将目的基因插入载体,用DNADNA连接酶连接双链连接酶
21、连接双链连接酶连接双链连接酶连接双链DNADNA粘性末端序列,在体外重新连接成人工重组体。方粘性末端序列,在体外重新连接成人工重组体。方粘性末端序列,在体外重新连接成人工重组体。方粘性末端序列,在体外重新连接成人工重组体。方法主要有以下四种:法主要有以下四种:法主要有以下四种:法主要有以下四种:第14页,讲稿共34张,创作于星期日(三三)将外源将外源DNA导入宿主细胞导入宿主细胞常用的方法有以下两种:常用的方法有以下两种:常用的方法有以下两种:常用的方法有以下两种:1.1.转化转化转化转化(transformation)(transformation)转化是指将质粒或其他外源转化是指将质粒或其
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