酶的分类与命名课件.ppt
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1、关于酶的分类与命名现在学习的是第1页,共136页酶是生物催化剂酶是生物催化剂n 酶是活细胞产生的一类具有催化功能的生物酶是活细胞产生的一类具有催化功能的生物分子,所以又称为生物催化剂分子,所以又称为生物催化剂(b(biocatalysts)n 绝大多数的酶都是蛋白质。绝大多数的酶都是蛋白质。n 酶催化的生物化学反应,称为酶促反应(酶催化的生物化学反应,称为酶促反应(Enzymatic reaction)。)。n 在酶的催化下发生化学变化的物质,称为底物(在酶的催化下发生化学变化的物质,称为底物(substrate)。)。现在学习的是第2页,共136页n 1926年,James Summer由刀
2、豆制出脲酶结晶确立酶是蛋白质的观念,其具有蛋白质的一切性质。n 核酶的发现:n 19811982年,Thomas R.Cech实验发现有催化活性的天然RNARibozyme。n L19 RNA和核糖核酸酶P的RNA组分具有酶活性是两个最著名的例子。n n 抗体酶(abzyme):n 1986年,Richard Lerrur和Peter Schaltz运用单克隆抗体技术制备了具有酶活性的抗体(catalytic antibody)。现在学习的是第3页,共136页第一节 酶的分类与命名n一 酶的分类n (一)根据酶的化学组成可将酶分为:n 1 单纯蛋白酶类:只含有蛋白质成分n 2 结合蛋白酶类(全
3、酶):含有蛋白成分(酶蛋白)和非蛋白成分(辅助因子)n 现在学习的是第4页,共136页全酶 =酶蛋白+辅助因子辅助因子辅助因子与酶蛋白结合比较疏松的小分子有机物与酶蛋白结合紧密的小分子有机物。金属离子作为辅助因子。金属离子金属离子辅酶辅酶辅基辅基酶蛋白和辅助因子单独存在均无催化活性,只有二者结合为全酶才有催化活性。酶蛋白决定酶催化专一性,辅助因子通常是作为电子、原子或某些化学基团的载体决定反应的性质。现在学习的是第5页,共136页n 某某些些小小分分子子有有机机化化合合物物与与酶酶蛋蛋白白结结合合在在一一起起并并协协同同实实施施催催化化作作用用,这这类类分分子子被被称称为为辅辅酶酶(或辅基)。
4、(或辅基)。n 辅辅酶酶是是一一类类具具有有特特殊殊化化学学结结构构和和功功能能的的化化合合物物。参参与与的的酶酶促促反反应应主主要要为为氧氧化化-还还原原反反应应或或基团转移反应。基团转移反应。n 大多数辅酶的前体主要是水溶性大多数辅酶的前体主要是水溶性 B B 族维生族维生素。许多维生素的生理功能与辅酶的作用密切素。许多维生素的生理功能与辅酶的作用密切相关。相关。现在学习的是第6页,共136页辅酶在酶促反应中的作用特点辅酶在酶促反应中的作用特点n 辅酶在催化反应过程中,直接参加了反应。辅酶在催化反应过程中,直接参加了反应。n 每每一一种种辅辅酶酶都都具具有有特特殊殊的的功功能能,可可以以特
5、特定定地地 催催某一类型的反应。某一类型的反应。n 同同一一种种辅辅酶酶可可以以和和多多种种不不同同的的酶酶蛋蛋白白结结合合形形成成不不同同的的全酶。全酶。n 一一般般来来说说,全全酶酶中中的的辅辅酶酶决决定定了了酶酶所所催催化化的的类类型型(反反应应专专一一性性),而而酶酶蛋蛋白白则则决决定定了了所所催催化化的的底底物物类类型型(底底物专一性)。物专一性)。现在学习的是第7页,共136页 酶分子中的金属离子酶分子中的金属离子n 根据金属离子与酶蛋白结合程度,可分为两根据金属离子与酶蛋白结合程度,可分为两类:金属酶和金属激酶。类:金属酶和金属激酶。n 在金属酶中在金属酶中,酶蛋白与金属离子结合
6、紧密。酶蛋白与金属离子结合紧密。如如 FeFe2+2+/Fe/Fe3+3+、CuCu+/Cu/Cu3 3、ZnZn2+2+、MnMn2+2+、CoCo2 2 等。等。n 金属酶中的金属离子作为酶的辅助因子,在金属酶中的金属离子作为酶的辅助因子,在酶促反应中传递电子,原子或功能团酶促反应中传递电子,原子或功能团。现在学习的是第8页,共136页金属酶中的金属离子与配体金属酶中的金属离子与配体n金属离子金属离子 配体配体 酶或蛋白酶或蛋白nMnMn2 2 咪唑咪唑 丙酮酸脱氢酶丙酮酸脱氢酶nFeFe2+2+/Fe/Fe3+3+卟啉环,咪唑,卟啉环,咪唑,血红素,血红素,n 含硫配体含硫配体 氧化氧化
7、-还原酶,还原酶,n 过氧化氢酶过氧化氢酶nCuCu+/Cu/Cu2+2+咪唑,酰胺咪唑,酰胺 细胞色素氧化酶细胞色素氧化酶nCoCo2+2+卟啉环卟啉环 变位酶变位酶nZnZn2+2+-NH -NH3 3,咪唑,(,咪唑,(-RS-RS)2 2 碳酸酐酶,醇脱氢酶碳酸酐酶,醇脱氢酶nPbPb2 2 -SH d-SH d-氨基氨基-g-g-酮戊二酸脱水酶酮戊二酸脱水酶nNiNi2 2 -SH -SH 尿酶尿酶现在学习的是第9页,共136页金属激酶中的金属离子金属激酶中的金属离子n 激酶是一种磷酸化酶类,在激酶是一种磷酸化酶类,在ATPATP存在下催化葡萄糖,存在下催化葡萄糖,甘油等磷酸化。甘油
8、等磷酸化。n 其中的金属离子与酶的结合一般较松散。在溶液中,其中的金属离子与酶的结合一般较松散。在溶液中,酶与这类离子结合而被激活。酶与这类离子结合而被激活。n 如如NaNa+、K K+、MgMg2+2+、CaCa2+2+等。金属离子对酶有一定等。金属离子对酶有一定的选择性的选择性,某种金属只对某一种或几种酶有激活作用。某种金属只对某一种或几种酶有激活作用。现在学习的是第10页,共136页(二)根据酶蛋白结构特点可将酶(二)根据酶蛋白结构特点可将酶分为分为单体酶:单体酶:以一个独立的三级结构为完整生物以一个独立的三级结构为完整生物 功能分子的最高结构形式的酶。功能分子的最高结构形式的酶。寡聚酶
9、寡聚酶:以一个独立的四级结构为完整生物以一个独立的四级结构为完整生物 功能分子的最高结构形式的酶。功能分子的最高结构形式的酶。多酶复合体:多酶复合体:由多种酶彼此镶嵌成一个功能由多种酶彼此镶嵌成一个功能 完整的具有特定结构的复合体完整的具有特定结构的复合体,它们相互配合它们相互配合依次进行,催化连续的依次进行,催化连续的 一系列相关反应。一系列相关反应。现在学习的是第11页,共136页n (三)、酶的分类(三)、酶的分类n 根据酶所催化的反应类型,按照国际系统根据酶所催化的反应类型,按照国际系统 分类方法,将酶分为六大类:分类方法,将酶分为六大类:现在学习的是第12页,共136页n氧化氧化-还
10、原酶催化氧化还原酶催化氧化-还原反应。还原反应。n主要包括脱氢酶主要包括脱氢酶(dehydrogenase)(dehydrogenase)和氧化酶和氧化酶(Oxidase)(Oxidase)。n如,乳酸如,乳酸(Lactate)(Lactate)脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。1 氧化氧化-还原酶还原酶 OxidoreductaseAH2+B(O2)+BH2(H2O2,H2O)A现在学习的是第13页,共136页n转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分子的基团或转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。原子转移到另一个底物的分子上。例如,例
11、如,谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。2 转移酶转移酶 TransferasevAX+BA+BX现在学习的是第14页,共136页n水解酶催化底物的加水分解反应。水解酶催化底物的加水分解反应。n主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。n例如,脂肪酶例如,脂肪酶(Lipase)(Lipase)催化的脂的水解反应:催化的脂的水解反应:3 3 水解酶水解酶 hydrolasehydrolaseAOH+BHAB+H2O现在学习的是第15页,共136页n裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或原裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或原子形成双键的
12、反应及其逆反应。子形成双键的反应及其逆反应。n主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。n例如,例如,延胡索酸水合酶催化的反应。延胡索酸水合酶催化的反应。4 裂合酶裂合酶 LyaseABA+B现在学习的是第16页,共136页n异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即底物分子内基团或原子的重排过程。底物分子内基团或原子的重排过程。例如,例如,6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。5 异构酶异构酶 IsomeraseAB常见的有消旋和变旋、醛酮异构、顺反异构和变位酶类常见的有消旋和变旋、醛酮异构、顺反异构和变位酶类
13、。现在学习的是第17页,共136页n合成酶,又称为连接酶,能够催化合成酶,又称为连接酶,能够催化C-CC-C、C-OC-O、C-N C-N 以及以及C-S C-S 键的形成反应。这类反应必须与键的形成反应。这类反应必须与ATPATP分解反应相互偶分解反应相互偶联。联。nA+B+ATP+H-O-H=A A+B+ATP+H-O-H=A B+ADP+Pi B+ADP+Pi n例如,丙酮酸羧化酶催化的反应。例如,丙酮酸羧化酶催化的反应。n 丙酮酸丙酮酸 +CO+CO2 2 草酰乙酸草酰乙酸6 合成酶合成酶 Ligase or Synthetase 现在学习的是第18页,共136页n核酸酶是唯一的非蛋白
14、酶。它是一类特殊的核酸酶是唯一的非蛋白酶。它是一类特殊的RNARNA,能够催,能够催化化RNARNA分子中的磷酸酯键的水解及其逆反应。分子中的磷酸酯键的水解及其逆反应。7核酸酶(催化核酸)核酸酶(催化核酸)ribozyme 现在学习的是第19页,共136页n(一)习惯命名方法(一)习惯命名方法 n(1)根据作用底物来命名,如淀粉酶、蛋白酶等。)根据作用底物来命名,如淀粉酶、蛋白酶等。n(2)根据所催化的反应的类型命名,如脱氢酶、)根据所催化的反应的类型命名,如脱氢酶、转移酶等。转移酶等。n(3)两个原则结合起来命名,如丙酮酸脱羧酶等。)两个原则结合起来命名,如丙酮酸脱羧酶等。n(4)根据酶的来
15、源或其它特点来命名,如胃蛋白)根据酶的来源或其它特点来命名,如胃蛋白酶、胰蛋白酶等。酶、胰蛋白酶等。二 酶的命名酶的命名现在学习的是第20页,共136页(二)国际系统命名法(二)国际系统命名法n系统名称包括底物名称、构型、反应性质,系统名称包括底物名称、构型、反应性质,最后加一个酶字最后加一个酶字。例如:例如:习惯名称习惯名称:谷丙转氨酶谷丙转氨酶系统名称系统名称:丙氨酸:丙氨酸:-酮戊二酸氨基转移酶酮戊二酸氨基转移酶酶催化的反应酶催化的反应:谷氨酸谷氨酸 +丙酮酸丙酮酸 -酮戊二酸酮戊二酸 +丙氨酸丙氨酸现在学习的是第21页,共136页酶的编码乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶 EC 1.1.1.27第1
16、大类,氧化还原酶第1亚类,氧化基团CHOH第1亚亚类,H受体为NAD+该酶在亚亚类中的流水编号每个酶都有一个有四个数字组成的编码现在学习的是第22页,共136页第二节 酶催化作用的特性n 酶是生物催化剂,与无机催化剂相比,二者n 有共性;但酶的化学本质是蛋白质,又在生物体内作用,因此酶的作用又有特性。n 现在学习的是第23页,共136页一一 酶和一般催化剂的共性酶和一般催化剂的共性n1.1.用量少而催化效率高;用量少而催化效率高;n2.2.它能够改变化学反应的速度,但是不能它能够改变化学反应的速度,但是不能改变化学反应平衡。改变化学反应平衡。n3.3.只能催化热力学允许的反应,在反映前只能催化
17、热力学允许的反应,在反映前后不发生改变。后不发生改变。现在学习的是第24页,共136页二二 酶催化作用特性酶催化作用特性n1 1高效性高效性n2 2专一性专一性n3 3反应条件温和反应条件温和n4.4.酶的催化活性可调节控制酶的催化活性可调节控制现在学习的是第25页,共136页二二 酶催化作用特性酶催化作用特性n酶的催化作用可使反应速度提高酶的催化作用可使反应速度提高10106-6-10101212倍。倍。n例如:过氧化氢分解例如:过氧化氢分解n 2H2H2 2O O2 2 2H 2H2 2O +OO +O2 2n用用Fe+Fe+催化,效率为催化,效率为6*106*10-4-4 mol/mol
18、.S mol/mol.S,而用过氧化氢,而用过氧化氢酶催化,效率为酶催化,效率为6*106*106 6 mol/mol.Smol/mol.S。n用用-淀粉酶催化淀粉水解,淀粉酶催化淀粉水解,1 1克结晶酶在克结晶酶在6565 C C条件下可条件下可催化催化2 2吨淀粉水解。吨淀粉水解。1 1高效性高效性现在学习的是第26页,共136页n 酶的专一性酶的专一性 Specificity又称为特异性,是又称为特异性,是指酶在催化生化反应时对底物的选择性。根指酶在催化生化反应时对底物的选择性。根据专一性的不同又可分为:据专一性的不同又可分为:n (1)1)绝对专一性绝对专一性n (2 2)相对专一性)
19、相对专一性n (3 3)立体异构专一性)立体异构专一性 n 2 2专一性专一性现在学习的是第27页,共136页(1 1)绝对专一性绝对专一性n有些酶对底物的要求非常严格,只作用于有些酶对底物的要求非常严格,只作用于一个特定的底物。这种专一性称为绝对专一个特定的底物。这种专一性称为绝对专一性(一性(Absolute specificity)。现在学习的是第28页,共136页n有些酶的作用对象不是一种底物,而是一类有些酶的作用对象不是一种底物,而是一类化合物或一类化学键。这种专一性称为相对化合物或一类化学键。这种专一性称为相对专一性专一性(Relative Specificity)。n包括族包括族
20、(group)专一性。如专一性。如-葡萄糖苷酶,葡萄糖苷酶,催化由催化由-葡萄糖所构成的糖苷水解,但对于葡萄糖所构成的糖苷水解,但对于糖苷的另一端没有严格要求。糖苷的另一端没有严格要求。n和键和键(Bond)专一性。如酯酶催化酯的水解,专一性。如酯酶催化酯的水解,对于酯两端的基团没有严格的要求。对于酯两端的基团没有严格的要求。(2)相对专一性)相对专一性现在学习的是第29页,共136页(3 3)立体化学专一性)立体化学专一性n酶的一个重要特性是能专一性地与手性底酶的一个重要特性是能专一性地与手性底物结合并催化这类底物发生反应。物结合并催化这类底物发生反应。n例如,淀粉酶只能选择性地水解例如,淀
21、粉酶只能选择性地水解D D葡萄葡萄糖形成的糖形成的1 1,4 4糖苷键糖苷键I,I,光学专一性光学专一性 Optical SpecificityOptical SpecificityStereochemical SpecificityStereochemical Specificity现在学习的是第30页,共136页几何专一性几何专一性n有些酶只能选择性催化某种几何异构体底有些酶只能选择性催化某种几何异构体底物的反应,而对另一种构型则无催化作用。物的反应,而对另一种构型则无催化作用。n如延胡索酸水合酶只能催化延胡索酸水合如延胡索酸水合酶只能催化延胡索酸水合生成苹果酸,对马来酸则不起作用。生成苹
22、果酸,对马来酸则不起作用。geometrical specificitygeometrical specificity现在学习的是第31页,共136页n酶促反应一般在酶促反应一般在pH 5-8 pH 5-8 水溶液中进行,反水溶液中进行,反应温度范围为应温度范围为20-4020-40 C C。n高温或其它苛刻的物理或化学条件,将引起高温或其它苛刻的物理或化学条件,将引起酶的失活。酶的失活。3 3反应条件温和反应条件温和现在学习的是第32页,共136页4.4.酶的催化活性可调节控制酶的催化活性可调节控制n如抑制剂调节、共价修饰调节、反如抑制剂调节、共价修饰调节、反馈调节、酶原激活及激素控制等。馈
23、调节、酶原激活及激素控制等。某些酶催化活力与辅酶、辅基及金某些酶催化活力与辅酶、辅基及金属离子有关。属离子有关。现在学习的是第33页,共136页第三节酶结构与功能的关系第三节酶结构与功能的关系 酶的化学本质是蛋白质,同样具有一、二、三级结构,有些酶还具有四级结构。作为生物催化剂,酶的结构又有一些特点。现在学习的是第34页,共136页第三节第三节 酶结构与功能的关系酶结构与功能的关系一一 活性部位活性部位:酶分子中直接与底物结合,并催化底物发 生 反应的部位。酶活性中心包括两个部位。酶酶活活性性中中心心 结合中心:酶与底物结合的部位,结合中心:酶与底物结合的部位,决定酶的专一性决定酶的专一性催化
24、中心:催化底物发生反应的部位,催化中心:催化底物发生反应的部位,决定酶的催化效率、反映性质。决定酶的催化效率、反映性质。现在学习的是第35页,共136页现在学习的是第36页,共136页n主要包括:主要包括:n亲核性基团:丝氨酸的亲核性基团:丝氨酸的羟基,半胱氨酸的巯基羟基,半胱氨酸的巯基和组氨酸的咪唑基。和组氨酸的咪唑基。必需基团:必需基团:在酶分子中和酶的催化活性直接有关的在酶分子中和酶的催化活性直接有关的基团,活性中心内外都有。基团,活性中心内外都有。现在学习的是第37页,共136页n酸碱性基团:门酸碱性基团:门冬氨酸和谷氨酸冬氨酸和谷氨酸的羧基,赖氨酸的羧基,赖氨酸的氨基,酪氨酸的氨基,
25、酪氨酸的酚羟基,组氨的酚羟基,组氨酸的咪唑基和半酸的咪唑基和半胱氨酸的巯基等。胱氨酸的巯基等。必需基团:必需基团:现在学习的是第38页,共136页二二 变构酶变构酶亦称别构酶,由两个以上亚基组成,除了具有亦称别构酶,由两个以上亚基组成,除了具有与底物结合的活性中心外,还具有与调节剂结合与底物结合的活性中心外,还具有与调节剂结合的的调节中心调节中心。当酶与调节剂结合后,酶蛋白的构象。当酶与调节剂结合后,酶蛋白的构象发生变化,从而引起酶活性的变化。发生变化,从而引起酶活性的变化。现在学习的是第39页,共136页酶的别构(变构)效应示意图酶的别构(变构)效应示意图效应剂效应剂别别构构中中心心活性活性
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