2022年分子生物学复习纲要 2.pdf

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1、绪论一、名词1、分子生物学Molecular Biology 2、中心法则Central Dogma 二、问答1、简述孟德尔、摩尔根、Avery、沃森和克里克、雅各布和莫诺，尼伦伯格和科拉纳等人对分子生物学发展的贡献2、早期验证遗传物质是DNA 的实验有哪些，具体过程是？3、分子生物研究的内容包括哪些？DNA 的复制、转录与翻译DNA 重组技术基因表达调控研究生物大分子的结构功能研究结构分子生物学基因（组）、功能基因（组）与生物信息学研究第1章、染色体与 DNA 第一节、染色体与DNA 名词1、DNA 双螺旋：两条多核苷酸链反向平行盘绕所生成的双链结构.2、DNA 三级结构:DNA 双螺旋进一

2、步扭曲盘绕形成的特定空间结构。3、核小体：是由核心颗粒（H2A、H2B、H3、H4 各两个分子生成的八聚体）和连接区DNA（大约 200bpDNA）组成4、卫星 DNA：又称随体DNA。因为真核细胞DNA 的一部分是不被转录的异染色质成分，其碱基组成与主体DNA 不同，因而可用密度梯度离心。卫星DNA 通常是高度串联重复的 DNA 5、端粒（Telomere）：是位于真核细胞线性染色体末端的特殊结构,由一段重复串联的DNA序列与端粒结合蛋白构成.6、端粒 T 环结构：端粒形成T 环结构使染色体末端封闭起来，免遭破坏.7、单顺反子：真核基因转录产物为单顺反子，即一条mRNA 模板只含有一个翻译起

3、始点和一个终止点，因而一个基因编码一条多肽链或RNA 链。8、断裂基因（splitting gene）：真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因9、间隔基因(Interrupted gene)：由于这组基因发生突变时会导致果蝇体节模式发生间隔缺失现象，所以将它们称为间隔基因10、外显子(Exon)是真核生物基因的一部分，它在剪接(Splicing)后仍会被保存下来，并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质11、内含子(Intron)在转录后的加工中，从最初的转录产物除去的内部的核苷酸序

4、列12、单核苷酸多态性Single Nucleotide Polymorphism，SNP：主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA 序列多态性。13、微卫星 DNA Microsatelite DNA：重复单位序列最短，只有 26bp，串联成簇，长度 50名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 1 页，共 19 页 -100bp，又称为短串联重复序列14、简单序列重复simple sequence repeat，SSR：基因组中以少数几个核苷酸(多数为 2 4 个)为单位多次串联重复组成的长达几十个核苷酸的序列15、3,5磷酸二酯键：是四种脱氧核苷酸相连形成多聚脱氧核

5、苷酸链之间的连接方式，即由前一核苷酸的3-OH 与下一位核苷酸的5位磷酸间形成磷酸二酯键，构成一个线性大分子。16、染色体:是细胞内具有遗传性质的遗传物质深度压缩形成的聚合体，易被碱性染料染成深色17、组蛋白:真核生物体细胞染色质中的碱性蛋白质，组蛋白与带负电荷的双螺旋DNA 结合构成染色体的组要部分。18、C值(C-value):一种生物单倍体基因组DNA 的总量称为C值(C-value)，它是恒定的，是每一物种的重要特征.19、C值反常现象:C 值一般随生物进化而增加,但也存在某些低等生物的C值比高等生物大,即 C值反常现象20、MicroRNA:是一类由内源基因编码的长度约为20-22

6、个核苷酸的非编码单链RNA分子，由 MicroRNA 前体产生21、siRNA:一般是人工体外合成的，通过转染/化进入体内，是RNA干涉的中间产物22、RNA干涉:是指在进化过程中高度保守的、由双链 RNA（double-stranded RNA，dsRNA）诱发的、同源mRNA 高效特异性降解的现象。问答1、DNA 的一级结构及其意义指 DNA 分子中脱氧核苷酸的排列顺序，由于核苷酸之间的差异仅仅是碱基的不同，故可称为碱基顺序(bp)。意义：生物遗传信息以核苷酸不同的排列顺序编码在DNA 分子上，核苷酸排列顺序变了，它的生物学含义也就不同了。因此测定DNA 的碱基排列顺序是分子生物学的基本课

7、题之一。2、DNA 双螺旋结构提出的主要依据及其主要内容（特征）？DNA 双螺旋结构的主要依据：1)Chargaff 规则：A=T、C=G；嘌呤=嘧啶，即A+G=T+C。不同生物组织DNA 在总的碱基组成上有很大差异，表现在A+T/G+C比值（不对称比率）的不同，亲缘相近的生物，其 DNA 碱基组成相近，既不对称比率相近2）DNAX射线衍射图。表明了 DNA 结构的螺旋周期性，碱基的空间取向，分子间距离3)DNA碱基物化数据的测定特征：(1)主链：由二条相互平行而走向相反的脱氧核苷酸链围绕一共同中轴向右盘旋形成双螺旋构型；糖与磷酸在外侧。(2)碱基对：碱基位于螺旋的内侧，两条单链间以碱基对之间

8、形成氢键连接，A 与 T 间形成两个氢键，G 与 C间形成三个氢键。碱基平面与螺旋中轴垂直(3)大沟和小沟：大沟和小沟分别指双螺旋表面凹下去的较大沟槽和较小沟槽。(4)结构参数：螺旋直径 2nm；螺旋周期包含10 对碱基，螺距 3.4nm；相邻碱基对平面的间距0.34nm。3、什么是 DNA 二级结构多态性？有什么意义？指的是DNA 构象的可变性，处于一种动态平衡。DNA 的二级结构有：1.B-DNA:在相对湿度为 92%的 DNA 钠盐，是最常见的DNA 构像。2.A-DNA:在相对湿度为75%以下的 DNA纤维，对基因表达有重要意义。3.Z-DNA:左手螺旋，调控基因的转录。4.ts-DN

9、A:三股螺旋意义：拓宽了人们的视野，发现生物体中最为稳定的遗传物质也可以采用不同的姿态来实现其丰富多采的生物学功能。4、DNA 三级结构的内容和意义？DNA 三级结构：DNA 双螺旋进一步扭曲盘绕形成的特定空间结构即超螺旋结构。包括线状DNA 形成的纽结、环状DNA 形成麻花状结构等名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 2 页，共 19 页 -超螺旋的意义：超螺旋形式是DNA 分子复制和转录的需要超螺旋可使DNA 分子形成高度致密的状态从而得以容纳于有限的空间5、真核生物染色体的化学组成？这些成分是如何包装成染色体的？主要化学成分:DNA 和蛋白质，蛋白质又分为组蛋白和非组蛋白，组

10、蛋白包括H1、H2A、H2B、H3 及 H4。组装过程：1，首先组蛋白组成盘装八聚体，DNA 缠绕其上，成为核小体颗粒，两个颗粒之间经过DNA连接，形成外径10nm 的纤维状串珠，称为核小体串珠纤维；2，核小体串珠纤维在酶的作用下形成每圈6 个核小体，外径30nm 的螺旋结构；3，螺旋结构再次螺旋化，形成超螺旋结构；4，超螺线管，形成绊环，即线性的螺线管形成的放射状环。绊环再非组蛋白上缠绕即形成了显微镜下可见的染色体结构。6、原核生物染色体的基本特点？1、结构简炼。基因组很小，一般只有一条染色体且大都带有单拷贝基因；绝大部分是用来编码蛋白质的，少部分调控序列；几乎每个基因序列都与它所编码的蛋白

11、质序列呈线性对应状态。2、多顺反子转录或编码功能相关的RNA 或蛋白质的基因，往往丛集在基因组的一个或几个特定部位，形成转录单元并转录产生含多个mRNA的分子，称为多顺反子mRNA。3、重叠基因一些细菌和动物病毒存在重叠基因，同一段DNA 能携带两种不同蛋白质的信息7、真核生物染色体的基本特点？1.基因组庞大，蛋白质结合形成染色体，储存于细胞核内。2.转录产物为单顺反子mRNA。3.大部分基因属于断裂基因，有内含子和外显子存在，基因是不连续的。4.存在大量的顺式作用元件，如启动子、增强子、沉默子。5.大部分为非编码序列，占整个基因组序列的90%以上。6.含有大量的重复序列。7.存在大量的DNA

12、 多态性，如SNP和短串联重复序列多态性。8.含有端粒结构。8、端粒的功能第一，保护染色体不被核酸酶降解；第二，防止染色体相互融合；第三，为端粒酶提供底物，解决DNA 复制的末端隐缩，保证染色体的完全复制。9、真核基因组非编码序列包括哪些与基因表达有关的各种调控序列内含子（intron）高度重复序列部分中度重复序列非编码 RNA（non-coding RNA）第二节、DNA 的复制名词1、半保留复制(semiconservation replication)：在 DNA 复制时，亲代DNA 的双螺旋先行解旋分开，然后以每条链为模板，按碱基互补配对原则，在这两条链上各形成一条互补链，每个子代DN

13、A 的一条链来自亲代DNA，另一条链则是新合成的名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 3 页，共 19 页 -2、复制叉（replication fork）：DNA分子中正在进行复制的部位为复制叉,它由两股亲代链及在其上新合成的子链构成3、复制眼（replication eye）：DNA 的正在复制的部分在电镜下观察起来犹如一只眼睛，称为复制眼。4、半不连续复制(Semi-discontinuous replication)：这种前导链的连续合成和滞后链的不连续合成称为DNA 合成的半不连续复制5、前导链(leading strand)：以复制叉移动的方向为基准，一条模板链是3 5

14、，以此为模板而进行的新生DNA链的合成沿5-3方向连续进行，这条链称为前导链6、滞后链(lagging strand)：在 DNA 复制中与复制叉前进的方向相反，而且是分段、不连续合成的这条链称为滞后链.7、冈崎片段(Okazaki fragment)：滞后链合成的片段即为冈崎片段8、复制起点Origin of replication:DNA 复制在生物细胞中要从DNA 分子上特定位置开始，这个特定位置称为复制起点9、复制子(replicon):DNA 复制从起点开始双向进行直到终点为止，每一个这样的DNA 单位称为复制子10、酵母自主复制序列autonomous replication se

15、quence，ARS:是酵母复制的起点，包括数个复制起始位必需的保守区。不同的ARS都含有 A-T的 11 bp 保守区11、DNA 拓扑异构酶(DNA Topisomerase):能在 DNA 分子中改变两条链的环绕次数的酶，它的作用机制首先打断DNA，让 DNA 绕过断裂点后再封闭形成双螺旋或超螺旋DNA.12、解螺旋酶(Helicase):用 ATP水解获得的能量来打断氢键，解开双链DNA 并在 DNA 上沿一定方向移动的一类酶13、单链 DNA 结合蛋白(Single stranded DNA binding protein,SSB):与单链 DNA结合的蛋白，维持 DNA 单链状态1

16、4、引发酶(Primase):催化引物 RNA 分子的合成，为DNA 复制提供RNA 引物的酶类15、引发体（primosome）:引发酶与其它蛋白质所形成的复合体称为引发体16、DNA 连接酶(DNA ligase):催化 DNA 链的 5-PO4与另一 DNA 链的 3-OH 生成磷酸二酯键，使具有相同粘末端或平端的DNA 末端连接起来17、切口(nick):DNA 连接酶只能修复磷酸二酯键的断裂，称切口18、缺口(gap):DNA 分子中核苷酸缺失，称缺口19、DNA 链的延伸:20、复制体(replisome):由解旋酶、引发酶和 DNA pol 全酶组成的复合体，DNA 合成时，沿着

17、复制叉的方向移动21、回环复制模型Trombone model:DNA pol 两个催化核心分别和DNA 的两条模板链结合，全酶延着前导链模板随着复制叉的移动而移动，而后滞链模板从复制体上“拉出”一段，形成一个环形成回环进行复制22、“”型复制:DNA 从复制起点开始，双向同时进行，中间产物呈样形状，故又称型复制23、滚环(Rolling circle)复制:是小分子量的环状DNA 分子所采取一种特殊单向复制形式。24、D 环(D-loop)复制:单向复制的特殊方式，线粒体和叶绿体DNA 的复制采取这种方式问答1、复制起点的一般特征1)多个独特的短的重复序列组成；2)复制起点附近富含A-T；3

18、)短的重复序列被多亚基的复制起点结合蛋白识别。名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 4 页，共 19 页 -2、DNA 复制所需的酶和其它蛋白质包括哪些？它们的主要功能是什么？1.DNA 聚合酶：在 RNA/DNA 的 3-OH 末端，以 dNTP为底物，按模板DNA 上的指令由DNA pol 逐个将核苷酸加上去，催化新链不断延长。此外，还具有核酸外切酶活性。2.DNA 拓扑异构酶:通过切断、旋转和再连接作用，理顺DNA 链-三级结构的调整3.解螺旋酶:解开 DNA 双螺旋4.单链 DNA结合蛋白：维持DNA 单链状态5.引发酶：催化引物RNA分子的合成，为DNA 复制提供RNA引

19、物6.DNA 连接酶：使具有相同粘末端或平端的DNA 末端连接起来3、试述 DNA复制的基本过程DNA 复制分为起始、延长、终止三个过程。1.DNA 复制的起始：1）DNA 复制起点双链解开。DnaA 蛋白识别、结合于 ori C 的重复序列然后在HU 的帮助下 DnaA 蛋白与 DNA 形成复合物，促使解链最后在DnaC 的协助下，DnaB 结合于初步打开的双链，并用其解螺旋酶活性使双链解开一定长度。2）引发前体(preprimosome)的形成。DnaB 与 oriC 组成引发前体3）引发体(primosome)与 RNA 引物的形成。引发前体进一步与引发酶DnaG 组装成引发体，引发体在

20、单链 DNA 上移动(与其他因子有关），在DnaB 的作用下识别DNA 复制起点位置。2.DNA链的延伸：1)前导链的延伸.前导链沿着5 3方向可以连续延长，方向与复制叉方向一致 2)滞后链的的延伸.岗崎片段延伸，引发体在合适的位点合成下一岗崎片段的RNA引物。钳装配器处于准备状态。岗崎片段延伸到前一个岗崎片段附近时，亚基脱离DNA polIII，引发体适时解体。RNA 引物与 DNA 形成的双链被钳装配器识别，被 2 个亚基夹住。4亚基带着DNA/RNA 转移到 DNA polIII 上。5重复以上步骤。3)DNA 复制的终止.4、复制起始过程中各种蛋白质的作用蛋白功能DnaA 协同结合于9

21、bp 和 13bp 重复顺序RNA聚合酶短的 RNA分子，以帮助解离两条DNA 链DnaB 结合于 DnaG，提供解旋酶活性DnaC 和 DnaB形成复合体HU 组蛋白样蛋白，激发复合体形成DnaG 引发酶，合成RNA引物SSB 稳定单链Topo旋转酶，解除正超螺旋5、一个 聚合酶全酶/复制体 是怎样负责两条链的合成呢？即回环复制模型是如何解释后随链的合成。岗崎片段延伸，引发体在合适的位点合成下一岗崎片段的RNA 引物。钳装配器处于准备状态。岗崎片段延伸到前一个岗崎片段附近时，亚基脱离DNA polIII，引发体适时解体。RNA引物与 DNA 形成的双链被钳装配器识别，被 2 个亚基夹住。4亚

22、基带着DNA/RNA转移到 DNA polIII 上。5重复以上步骤。6、原核与真核生物中的DNA 聚合酶有哪些?功能如何？原核生物DNA 聚合酶分类DNA 聚合酶 I DNA 聚合酶 II DNA 聚合酶 III 生物学功能切除引物DNA 损伤修复延长子链延长冈崎片段名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 5 页，共 19 页 -校读作用校读作用DNA 损伤修复真核生物五种DNA 聚合酶DNA 聚合酶（）（）（）功能DNA 引物合成后 随 链 的 合成前 导 链 的 合成，复制修复损伤修复线粒体DNA复制7、端粒的复制模型（1）首先是端粒酶与端粒DNA 结合，端粒酶中的RNA与凸出

23、的3模板配对；（2）以 RNA为模板，在DNA3端上从头合成DNA；（3）延伸六个nt；（4）合成一个重复单位后，端粒酶向DNA 模板新合成的3移动，RNA 再和模板配对，就这样循环往复，周而复始。最后延伸的3端再回折，以 GG 配对的方式形成发夹结构，产生端粒。第三节、突变与修复名词1、突变(mutation)：可以通过复制而遗传的DNA 结构的任何永久性改变2、碱基置换(base substitution)：一个碱基被另一个碱基替换3、转换（transition）：嘌呤替代嘌呤、嘧啶替代嘧啶4、颠换（transvertion）：嘌呤变嘧啶或嘧啶变嘌呤5、碱基插入(base insertio

24、n)：6、碱基缺失(base deletion)：7、同义突变(cosense mutation)：指没有改变产物氨基酸序列的密码子变化，与密码子的简并性相关8、错义突变(missense mutation)：指碱基序列的改变引起了产物氨基酸序列的改变。9、无义突变(Nonsense mutation)：指碱基的变化导致了某种氨基酸的密码子变为蛋白质合成的终止密码子。10、移码突变（Frameshift mutation）：在正常的 DNA 分子中，碱基缺失或增加非3 的倍数，造成这位置之后的一系列编码发生移位错误的改变，这种现象称移码突变。11、正向突变forward mutation：改变

25、野生型性状的突变12、回复突变reverse mutation：突变体所失去的野生型性状可以通过第二次突变得到恢复。13、抑制突变Suppressor mutations：真正的原位回复突变很少，而大多数是第二点突变，原来的突变位点依然存在，而它的表现型效应被基因组第二位点突变所抑制，因而又称为抑制突变。14、基因内抑制突变Intragenic suppressor：在同一基因内发生第二次突变，而抑制或校正第一次突变所产生的结果15、基因间抑制突变Intergenic suppressors：由于在另一基因(抑制基因，suppression gene)发生突变而产生抑制的现象16、错配修复：一

26、种纠正复制后子链中错配碱基的修复方式17、直接修复：是通过一种可连续扫描DNA，识别出损伤部位的蛋白质将损伤部位直接修复的方法。该修复方法不用切断DNA 或切除碱基名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 6 页，共 19 页 -18、切除修复：也称核苷酸外切修复，这是一种取代紫外线等辐射物质所造成的损伤部位的暗修复系统。包括碱基切除修复和核苷酸切除修复19、重组修复：即双链 DNA 中的一条链发生损伤，在DNA 进行复制时，由于该损伤部位不能成为模板，不能合成互补的DNA 链，所以产生缺口，而从原来DNA 的对应部位切出相应的部分将缺口填满，从而产生完整无损的子代DNA 的这种修复现

27、象20、SOS修复：指 DNA 受到严重损伤、细胞处于危急状态时所诱导的一种DNA 修复方式，修复结果只是能维持基因组的完整性，提高细胞的生成率，但留下的错误较多，故又称为错误倾向修复（error-prone repair），使细胞有较高的突变率问答1、引起 DNA 突变的原因或来源有哪些，突变结果如何？1.自发突：1）DNA 复制中的错误2）DNA 的自发性化学变化。碱基的异构互变、碱基的脱氨基作用、脱嘌呤与脱嘧啶、碱基修饰与链断裂、转座成分的致突变作用2.诱发突变：1）物理因素引起的DNA 突变。紫外线的致突变作用、电离辐射引起的DNA 损伤、2）化学因素引起的DNA 突变。碱基类似物突变

28、剂、直接作用于DNA 模板的突变剂、嵌合剂的致突变作用移码突变剂结果：1.无影响。改变基因型(genotype)而不改变表现型(phenotype)。产生遗传多态性（DNA多态性，蛋白质多态性）。2.丧失某些功能。生物体结构和功能的异常引起疾病：肿瘤、生殖细胞基因突变传递至后代，导致遗传性疾病的发生。3.致死性 4.进化：生物体获得新的性状，适应环境的能力增强。发生了有利于物种生存的结果，使生物进化。2、阐述 DNA 的几种修复方式。重组修复：受损伤的DNA 链复制时，产生的子代DNA 在损伤的对应部位出现缺口。完整的另一条母链DNA 与有缺口的子链DNA 进行重组交换，将母链 DNA 上相应

29、的片段填补子链缺口处，而母链 DNA 出现缺口。以另一条子链DNA 为模板，经 DNA 聚合酶催化合成一新 DNA 片段填补母链DNA 的缺口，最后由 DNA 连接酶连接，完成修补。重组修复不能完全去除损伤，损伤的 DNA 段落仍然保留在亲代DNA链上，只是重组修复后合成的DNA分子是不带有损伤的，但经多次复制后，损伤就被“冲淡”了，在子代细胞中只有一个细胞是带有损伤 DNA 的直接修复：通过种可连续扫描DNA，识别出损伤部位的蛋白质将损伤部位直接修复，该修复方法不用切断DNA 或切除碱基切除修复：在几种酶的协同作用下，先在损伤的任一端打开磷酸二酯键，然后外切掉一段寡核苷酸；留下的缺口由DNA

30、 聚合酶催化合成来填补，最后再由连接酶将其连接起来SOS修复：是细胞 DNA 受到严重损伤、细胞处于危急状态时所诱导的一种DNA 修复方式，当 DNA 两条链的损伤邻近时，损伤不能被切除修复或重组修复，这时在核苷酸内切酶、外切酶的作用下造成损伤处DNA 链空缺，再由损伤诱导产生的一套特殊DNA 聚合酶-SOS 修复酶类，催化空缺部位 DNA 的合成，这时补上去的的核苷酸是随机的，使细胞有较高的突变率。错配修复：在 DNA 复制时母链会被甲基化，一旦DNA链上碱基出现错配，修复系统就会根据“保存母链，修复子链”的原则，找出错误碱基所在的DNA 链，并在对应于母链甲基化腺苷酸上游鸟苷酸的5位置切开

31、子链，然后启动修复途径，合成新的子链。第四节、DNA 重组名词、1、重组（recombination）：2 个 DNA 分子间或一个DNA 分子的不同部位间，通过断名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 7 页，共 19 页 -裂和重接，交换DNA 片段从而改变基因的组合和序列2、Holliday model：通过要发生重组的2 个 DNA 分子的 2 条单链在同一部位断裂，断裂的游离末端彼此交换形成异源双链，然后 2 条杂合单链彼此连接形成Holliday 连接体。Holliday连接体一旦形成就能进行重排，从而改变链的彼此关系，形成不同的构象，构象决定了在Holliday 连接体

32、拆分时是否发生重组3、转座子(transposon,Tn)：存在于染色体DNA 上可自主复制和移位的基本单位问答1、转座重组及其效应转座重组：转座子从染色体的一个区段转移到另一个区段，即发生转座重组，它既不依靠转座单元和插入区段序列的同源性，也不需要重组酶。效应：转座作用除了单纯地移动基因，还打乱了DNA 序列而造成缺失、倒位和重排，从基本上改变了染色体的结构。几十年的研究结果表明转座子存在于所有生物体内，人类基因组中约35%以上的序列为转座子序列，其中大部分与疾病有关2、转座子的结构特征、类型及其转座机理转座子的结构特征：1.端有 15-25bp 的倒转重复序列，或者叫反向重复序列。而插入位

33、点两侧具有 5-9bp 的正向重复序列。2.具有编码转座酶的基因，这种酶催化转座子插入新的位置转座子类型：原核：(1)简单转座子/插入序列(2)复合转座子3）类转座因子4）TnA转座子家族。真核：以 DNA-DNA方式转座 转座子和反转录转座子机理：转座酶与靶位点上插入位点的序列结合，像限制性内切酶那样在靶DNA 链上形成交叉切割，同时也在转座子的每条链的一端切割。转座子的两条链的自由末端分别和靶DNA的两个插入位点的末端连接在一起成桥，新老两个靶DNA 分子就相互连接在一起。随着转座子和生长的具体条件不同有两种不同的选择：1简单转座：在转座子另一末端进行第二次切割，使转座子完全转移到新的DN

34、A 中。由DNA 聚合酶的作用插进几个核苷酸以完成靶位点复制，并在老的宿主靶DNA 上留下一个致死性缺口，或被修复。可见简单转座作用是将转座子转移到新的位点上。2复制性转座：转座子DNA 没有第二次被切开，而靠DNA 聚合酶从第一个切口的末端开始复制，这样产生的结构称为共合体。共合体结构的存在是这种转座过程的有力证据。离解酶催化两个转座子拷贝之间的位点专一性重组，结果每个分子都带有一个转座子拷贝。第2章、生物信息传递-转录名词、1、转录的不对称性:在 RNA 的合成中，DNA 的二条链中仅有一条链可作为转录的模板，称为转录的不对称性2、编码链(coding strand)或有义链(sense

35、strand):与 mRNA序列相同的那条DNA 链3、模板链(template strand)或反义链(antisense strand):根据碱基互补原则指导mRNA 合成的 DNA 链4、转录单元（transcription unit）:RNA的转录从 DNA模板的特定位点开始，并在一定的位点终止。此转录区域为一个转录单位。一段可以转录成RNA链的 DNA 5、因子:RNA 聚合酶全酶的一个亚基，参与启动子的识别，使RNA 聚合酶能在正确的名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 8 页，共 19 页 -位置上开始转录6、顺式作用元件（cis-acting element）:存在

36、于基因旁侧序列中能影响基因表达的DNA 序列，本身不编码任何蛋白质，仅仅提供一个作用位点，要与反式作用因子相互作用而起作用7、启动子(promoter，P)：是指能被RNA聚合酶（包括基本转录因子）识别、结合并启动基因转录的一段DNA 序列8、上游启动子元件（upstream promoter element，UPE）：在某些基因的核心启动子上游，被 RNA聚合酶本身识别，能显著增强转录效率9、转录因子（transcription factor，TF)：10、内源性终止子：富含GC碱基的 反向重复序列和 4-8 个 A 组成的序列11、依赖 的终止子（rho-dependent termina

37、tor）：依赖 的解螺旋酶和ATP酶活性，使转录复合物解体，释放RNA，终止转录过程。12、RNA 剪接(splicing)：把内含子切除，把外显子连接起来，产生成熟的RNA 分子,这个过程就叫 RNA的剪接13、RNA的编辑（editing）：RNA转录后碱基的插入、删除或转变14、RNA 的再编码（recoding）：把 RNA 编码和读码方式的改变称为RNA 的再编码。包括+1、-1 移位、核糖体跳跃、终止子通读问答1、原核生物 RNA聚合酶的组成及其作用。2、真核生物 RNA聚合酶的种类及其作用。RNA聚合酶 I:合成除 5srRNA的所有 rRNA RNA聚合酶:生成 mRNA的前体

38、 hnRNA、部分 snRNA和 miRNA 的前体RNA聚合酶 III:生成 tRNA、5srRNA、snRNA 对 鹅膏蕈碱的敏感性：RNA聚合酶 I 不敏感RNA聚合酶敏感RNA聚合酶 III 存在物种特异性3、图示原核生物启动子的一般结构，并描述各部分的特点和功能。名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 9 页，共 19 页 -（1）-35 序列：又称Sextama 框，一致序列TTGACA。RNA聚合酶 初始结合位点。亚基识别该位点，又称为RNA 聚合酶的 识别位点。（2）-10 序列：又称 Pribnow 框，一致序列TATAAT。RNA聚合酶的 牢固结合位点，对解链 十

39、分重要。RNA聚合酶结合于-35 序列，然后才结合于-10 序列。（3）转录起始位点：影响转录的起始效率4、图示真核 RNA聚合酶的启动子结构，描述各部分的特点和功能。TATA框：一致序列为TATAA/TAA/T，一般位于-25bp 附近。使转录 精确起始CAAT盒：一致序列为GGC/TCAATCT，一般位于-75 附近。GC盒：一致序列为GGGCGGG，一般位于-80 到-110 附近。几个串联存在。CAAT盒和 GC盒分别于特异性转录因子SP1和 CTF结合，主要控制转录起始频率，不参与起始位点的确定5、试述真核生物TFIID的组成、功能及作用机制。TF D 包括两类成分：a)TBP（TA

40、TA box binding protein）。是唯一能识别TATA盒并与其结合的转录因子，是三种 RNA 聚合酶转录时都需要的；b)TAF（TBP-associated factors）TF-D 中其它蛋白因子称为TBP相关因子。功能：1、帮助 TBP与 TATA盒的结合。2、TATA盒缺失时，使TFD 与其他启动子元件的结合。3、与各种特异转录因子（如激活因子）结合。6、原核生物转录起始的过程?模板识别template recognitionRNA。聚合酶与DNA接触，搜索并识别特异结合位点。?封闭起始复合物closed complex。RNA聚合酶与启动子识别并结合，DNA 仍是双链。?

41、开放起始复合物open complex。DNA 解链，封闭起始复合物转变为开放起始复合物。?三元复合体ternary complex。最初的一个或几个核苷酸被合成，开放起始复合物转变成包括 RNA 聚合酶、DNA 和新生 RNA 的三元复合体。7、真核生物mRNA转录后加工包括哪些内容？加帽、加尾、切割和剪接反应(splicing)8、比较核基因mRNA 与 I、II 类内含子的剪接特点。名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 10 页，共 19 页 -I 类内含子 的剪接：5 拼接点和 3 拼接点的序列绝大部分为U 和 G，前体 rRNA 的拼接过程需要加入一种鸟嘌呤核苷酸（GTP

42、、GDP、GMP 和鸟苷），发生两次转酯反应。II 类内含子的切除体系中，由内含子本身靠近 3 拼接点的保守腺苷酸2-OH 作为亲核基团攻击 5，拼接点不需要剪接体、snRNA，但要形成套索中间体9、原核生物和真核生物的mRNA在结构上主要区别1）原核生物的mRNA是多顺反子，真核生物的mRNA是单顺反子2）原核 mRNA 5端无帽子结构，真核mRNA 5端有一段帽子结构3）原核 mRNA3端无 polyA，真核 mRNA3端有 polyA 结构。10.真核生物mRNA帽子和 polyA 结构，主要功能是什么？鸟嘌呤第 7 位氮被甲基化，分为：零类帽子、1 类帽子、2 类帽子。功能：封闭 mR

43、NA的 5 端，使其没有游离的5-磷酸，从而阻止核酸外切酶的降解，使mRNA 更稳定；作为 mRNA 与核糖体结合的信号（通过帽子结合蛋白），无帽子结构的RNA不能与核糖体的 40S 亚基结合；与 mRNA的运输有关。有利于成熟mRNA从细胞核输送到细胞质polyA 结构：大多数真核生物mRNA3端的 40-200 个腺苷酸残基。功能：polyA 是 mRNA 由细胞核进入细胞质所必需的形式.polyA 可抵抗外切核酸酶从3 端降解 mRNA，增加 mRNA的稳定性。polyA 能增强翻译能力。通过polyA 结合蛋白与翻译起始因子结合11、什么是核酶？其发现有何重要意义？核酶：是指一类具有催

44、化功能的RNA 分子，通过催化靶位点RNA 链中磷酸二酯键的断裂而特异性剪切底物RNA的分子。根据其催化功能可以分为剪切型核酶（只剪不接）和剪接型核酶（内切酶、连接酶活性）两种。意义：核酶的发现使我们对RNA的功能又有了新的认识，是对中心法则的又一个重要修正，说明 RNA既是遗传物质又是酶。同时也为生命起源的研究提供了新的思路生命进化的早期可能存在着一个RNA 的世界生物信息传递-翻译名词1、密码子codon：mRNA上决定一个特定氨基酸的三个连续核苷酸2、密码子简并性(degeneracy)一种氨基酸有几个密码子，或者几个密码子代表一种氨基酸的现象称为密码子的简并性：3、密码子摆动性(Wob

45、ble):密码的第一、第二碱基是必需严格按标准配对(A-U、G-C)而第三碱基配对可以有一定程度的摆动灵活性4、第二密码系统:tRNA 分子中可以被氨基酰tRNA 合成酶识别，并决定 tRNA 的特异性的序列或位点。5、核糖体:由多种核糖体RNA(rRNA)和几十种蛋白质所组成的亚细胞颗粒。是蛋白质合成的工厂6、多核糖体:几个到几十个核糖体在一条mRNA上结合起来的现象7、SD序列:在 mRNA分子中起始密码子的上游8-13 个核苷酸处有一段富含嘌呤核苷酸的顺序。16SrRNA结合位点。8、分子伴侣molecular chaperone:一类序列上没有相关性但有共同功能的保守性蛋白质，它们在细

46、胞内能帮助其它多肽进行正确的折叠、组装、运转和降解。9、信号识别颗粒:是一个小分子RNA-蛋白质复合物，在翻译过程中能够识别信号序列，指导核糖体到转运通道10、信号肽:起始密码子后mRNA 编码的一段疏水的氨基酸序列，能够形成包括两个-螺名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 11 页，共 19 页 -旋的发夹结构，在SRP的帮助下插入到粗面内质网的膜中。11、核定位序列Nuclear Localization Sequence,NLS:12、泛素（Ubiquitin）:是一种存在于大多数真核细胞中的小蛋白。它的主要功能是标记需要分解掉的蛋白质，使其被水解问答1、遗传密码是如何破译的

47、？1、五十年代的数学推理阶段：根据在DNA 中存在四种核苷酸、在蛋白质中存在二十种氨基酸的对应关系，做出数学推理：43=64 这种关系是最理想的2、六十年代的实验阶段：1）插入或删除实验：用核苷酸的插入或删除实验证明模板上每三个核苷酸组成一个密码子。2)、同聚物/共聚物序列指导蛋白合成：同聚物实验：通过人工合成更多的mRNA，通过分析其多肽产物来研究密码子。共聚物序列实验：表明密码子有奇数个核苷酸组成。核糖体结合技术验证并破解了所有的密码子2、遗传密码有哪些特性1、密码子的连续性2、密码子有简并性(degeneracy)3、密码子的偏好性4、密码子的摆动性5、密码子的通用性与特殊性：不论是病毒

48、、原核生物还是真核生物可共用同一套密码。但也有一些例外，主要发生在线粒体和一些低等生物的核基因组6、共有 64 个密码子7、密码子具有方向性：mRNA从 5 端到 3 端的核苷酸排列顺序决定了多肽链中从N 端到 C 端的氨基酸排列顺序3、tRNA 在组成和结构上有哪些特点？tRNA 的种类和功能a)一级结构：tRNA 稀有碱基丰富。不同的tRNA 序列差异较大，但在绝大多数tRNA上具有固定核苷酸，这些核苷酸的种类和位置不变。b)tRNA 的二级结构三叶草结构:具有（1）受体臂：又称为氨基酸接受茎，3 端含 CCA-OH序列。(2)二氢尿嘧啶环(D 环)(3)TC环(4)额外环或可变环(5)反

49、密码子环c)tRNA 的三级结构倒 L 形 tRNA 的种类1、起始 tRNA 和延伸tRNA：起始 tRNA 特异性识别起始密码子AUG，延伸 tRNA 则将Met 和其它氨基酸引入mRNA分子内部，并且Met 不能被甲酰化。2、同工 tRNA（携带相同氨基酸的不同tRNA）：携带相同氨基酸3、校正 tRNA：针对基因或密码子突变可经过其反密码子上也发生某种突变，以“代偿”或校正原有突变所产生的不良后果4、氨酰 tRNA 合成酶的功能催化形成氨酰tRNA，决定反应的专一性特异性的识别不同的氨基酸5、比较原核与真核的核糖体组成。原核 细胞的核糖体较小，沉降系数为70S，由 50S和 30S 两

50、个亚基组成。50S 大亚基含有 36 种蛋白质和23SrRNA、5SrRNA。30S小亚基含有21 种蛋白质和一个16S的 rRNA 分子。真核 细胞的核糖体体积较大，沉降系数是80S，由 60S和 40S两个亚基组成。在大亚基中，有大约49 种蛋白质，另外有三种rRNA28S rRNA、5S rRNA和 5.8S rRNA。小亚基含有大约 33 种蛋白质，一种18S的 rRNA。6、核糖体有哪些活性中心（或功能位点）？名师资料总结-精品资料欢迎下载-名师精心整理-第 12 页，共 19 页 -7、真核生物与原核生物在翻译的起始过程中有哪些区别？1)真核细胞起始因子较原核生物多2)真核生物核糖