核酸的生物合成 (8)精选PPT.ppt
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1、关于核酸的生物合成(8)第1页,讲稿共72张,创作于星期二遗传信息传递的遗传信息传递的 中心法则中心法则蛋白质蛋白质翻译翻译转录转录逆转录逆转录复制复制复制复制DNARNA生生物物的的遗遗传传信信息息以以密密码码的的形形式式储储存存在在DNA分分子子上上,表表现现为为特特定定的的核核苷苷酸酸排排列列顺顺序序。在在细细胞胞分分裂裂的的过过程程中中,通通过过DNA复复制制把把亲亲代代细细胞胞所所含含的的遗遗传传信信息息忠忠实实地地传传递递给给两两个个子子代代细细胞胞。在在子子代代细细胞胞的的生生长长发发育育过过程程中中,这这些些遗遗传传信信息息通通过过转转录录传传递递给给RNA,再再由由RNA通通
2、过过翻翻译译转转变变成成相相应应的的蛋蛋白白质质多多肽肽链链上上的的氨氨基基酸酸排排列列顺顺序序,由由蛋蛋白白质质执执行行各各种种各各样样的的生生物物学学功功能能,使使后后代代表表现现出出与与亲亲代代相相似似的的遗遗传传特特征征。后后来来人人们们又又发发现现,在在宿宿主主细细胞胞中中一一些些RNA病病毒毒能能以以自自己己的的RNA为为模模板板复复制制出出新新的的病病毒毒RNA,还还有有一一些些RNA病病毒毒能能以以其其RNA为为模模板板合合成成DNA,称称为为逆逆转转录录这这是中心法则的补充。是中心法则的补充。中中心心法法则则总总结结了了生生物物体体内内遗遗传传信信息息的的流流动动规规律律,揭
3、揭示示遗遗传传的的分分子子基基础础,不不仅仅使使人人们们对对细细胞胞的的生生长长、发发育育、遗遗传传、变变异异等等生生命命现现象象有有了了更更深深刻刻的的认认识识,而而且且以以这这方方面面的的理理论论和和技技术术为基础发展了基因工程,给人类的生产和生活带来了深刻的革命。为基础发展了基因工程,给人类的生产和生活带来了深刻的革命。第2页,讲稿共72张,创作于星期二(一)(一)DNA的半保留复制的概念的半保留复制的概念 DNA在复制时,两条链解开分别作为模板,在复制时,两条链解开分别作为模板,在在DNA聚合酶的催化下按碱基互补的原则合聚合酶的催化下按碱基互补的原则合成两条与模板链互补的新链,以组成新
4、的成两条与模板链互补的新链,以组成新的DNA分子。分子。这样新形成的两个这样新形成的两个DNA分子与亲代分子与亲代DNA分子的碱基顺序完全一样。由于子代分子的碱基顺序完全一样。由于子代DNA分子中一条链来自亲代,另一条链是新分子中一条链来自亲代,另一条链是新合成的,这种复制方式称为合成的,这种复制方式称为半保留复制半保留复制。第一节第一节 DNA的生物合成的生物合成一、一、DNA的复制的复制第3页,讲稿共72张,创作于星期二T2 Genomic DNAsingle linear DNA(about 182,000 bp)第4页,讲稿共72张,创作于星期二Old strandNew strand
5、The hypothesis of semiconservativereplication proposed by Watson and Crick in 1953.第5页,讲稿共72张,创作于星期二DNA的半保留复制实验依据的半保留复制实验依据 1958年年Meselson&stahl利用氮的同位素利用氮的同位素15N标记大标记大肠杆菌肠杆菌DNA,首先证明了,首先证明了DNA的半保留复制。他们让大肠的半保留复制。他们让大肠杆菌在以杆菌在以15NH4Cl为唯一氮源的培养基中生长,经过连续培为唯一氮源的培养基中生长,经过连续培养养12代,从而使所有代,从而使所有DNA分子标记上分子标记上15N
6、。15NDNA的的密度比普通密度比普通14NDNA的密度大,在氯化铯密度梯度离心的密度大,在氯化铯密度梯度离心时,这两种时,这两种DNA形成位置不同的区带。如果将形成位置不同的区带。如果将15N标记标记的大肠杆菌转移到普通培养基中培养,经过一代之后,的大肠杆菌转移到普通培养基中培养,经过一代之后,所有所有DNA的密度都介于的密度都介于15NDNA和和14NDNA之间,即之间,即形成了一半含形成了一半含15N,一半含,一半含14N的杂合分子。两代后,的杂合分子。两代后,14N分分子和子和14N 15N杂合分子等量出现。若再继续培养,可以杂合分子等量出现。若再继续培养,可以看到看到14NDNA分子
7、增多。分子增多。第6页,讲稿共72张,创作于星期二放射性标记和密放射性标记和密度梯度离心清楚度梯度离心清楚地将半保留复制地将半保留复制和保留复制区别和保留复制区别开来。开来。第7页,讲稿共72张,创作于星期二复制中的大肠杆菌染色体放射自显影图复制中的大肠杆菌染色体放射自显影图(1963年年Cairns实验:阐明了大肠杆菌染色体实验:阐明了大肠杆菌染色体DNA是是一环状分子,并以半保留方式进行复制)一环状分子,并以半保留方式进行复制)ABC环状环状DNA的复制的复制 ABC第8页,讲稿共72张,创作于星期二 用用3H-胸苷标记大肠杆菌胸苷标记大肠杆菌DNA,经过近两代,经过近两代的时间,的时间,
8、3H-胸苷掺入大肠杆菌胸苷掺入大肠杆菌DNA。用溶菌。用溶菌酶把细胞壁消化掉,使完整的大肠杆菌染色体酶把细胞壁消化掉,使完整的大肠杆菌染色体DNA释放出来,放射自显影,得到上图。非复释放出来,放射自显影,得到上图。非复制部分(制部分(C)银粒子密度较低,由一股放射性链)银粒子密度较低,由一股放射性链和一股非放射性链构成。已复制部分占整个染色和一股非放射性链构成。已复制部分占整个染色体的三分之二,其中一条双链(体的三分之二,其中一条双链(B)仅有一股)仅有一股链是标记的,另外一股双链(链是标记的,另外一股双链(A)的两股链)的两股链都是标记的,银粒子密度为前二者的两倍。染都是标记的,银粒子密度为
9、前二者的两倍。染色体全长约为色体全长约为1100微米。微米。第9页,讲稿共72张,创作于星期二基因组能进行独立复制的单位称基因组能进行独立复制的单位称复制子复制子,每个复制每个复制子都含有一个复制起点子都含有一个复制起点 。原核生物的染色体和质粒、真核生物的细胞器原核生物的染色体和质粒、真核生物的细胞器DNA都是都是环状双链分子环状双链分子,它们都是,它们都是单单复制子,都在一个复制子,都在一个固定的起点开始复制,复制方向大多数是固定的起点开始复制,复制方向大多数是双向双向的,的,少数是单向复制。多数是对称复制,少数是不对称少数是单向复制。多数是对称复制,少数是不对称复制(一条链复制后才进行另
10、一条链的复制)。环复制(一条链复制后才进行另一条链的复制)。环状状DNA的复制眼象的复制眼象,称,称形复制形复制。(二)(二)DNA复制的起点和方式复制的起点和方式第10页,讲稿共72张,创作于星期二Visualization of bidirectional DNA replication第11页,讲稿共72张,创作于星期二 真核生物的染色体真核生物的染色体DNA是是线形双链分子线形双链分子,含有许多复制起点,因此是含有许多复制起点,因此是多复制子多复制子,每个复制,每个复制子约有子约有100-200Kb。人体细胞平均每个染色体含。人体细胞平均每个染色体含有有1000个复制子。个复制子。病毒
11、病毒DNA多种多样,环状或线形,双链多种多样,环状或线形,双链或单链,但都是或单链,但都是单复制子单复制子。复制方向复制方向:定点起始,复制方向大多数是双向的(等速定点起始,复制方向大多数是双向的(等速进行或异速进行),形成两个复制叉,少数是进行或异速进行),形成两个复制叉,少数是单向复制,形成一个复制叉。单向复制,形成一个复制叉。第12页,讲稿共72张,创作于星期二DNA的双向和单向复制的双向和单向复制环状环状 DNA复制时复制时所形成的所形成的结构结构起始点起始点复制叉的推进复制叉的推进复制叉复制叉起始点起始点起始点起始点起始点起始点复制叉复制叉复制叉复制叉未复制未复制DNA单向复制单向复
12、制双向复制双向复制放射自显影实验,在放射自显影实验,在复制复制开始时,先用低放射性的开始时,先用低放射性的3H脱氧胸苷标记大肠杆菌,脱氧胸苷标记大肠杆菌,经数分钟后再转移到高放射经数分钟后再转移到高放射性性3H脱氧胸苷培养基中。脱氧胸苷培养基中。第13页,讲稿共72张,创作于星期二(三)原核生物(三)原核生物(三)原核生物(三)原核生物DNADNA聚合反应有关的酶类聚合反应有关的酶类聚合反应有关的酶类聚合反应有关的酶类1.DNA聚合酶(聚合酶(DNA polymetases)2.引物酶和引发体引物酶和引发体(primosome):):启动启动RNA引物链的合成。引物链的合成。3.DNA连接酶(
13、连接酶(DNA ligase)4.DNA解链酶解链酶(DNA helicase)解旋酶解旋酶DNA聚聚合酶合酶III解链酶解链酶RNA引物引物引物酶和引物酶和引发体引发体DNA聚聚合酶合酶ISSB335355RNA引物引物第14页,讲稿共72张,创作于星期二5.单链结合蛋白单链结合蛋白(single-strand binding protein,SSB):结合在解开的结合在解开的DNA单链上,防止重新形单链上,防止重新形成双螺旋。成双螺旋。6.拓扑异构酶拓扑异构酶(topoisomerase):兼具内切酶和连接酶兼具内切酶和连接酶活力,能迅速将活力,能迅速将DNA超螺旋或双螺旋紧张状态超螺旋或
14、双螺旋紧张状态变成松驰状态,便于解链。变成松驰状态,便于解链。拓扑异构酶拓扑异构酶I使使DNA的一条链发生断裂和再连接,的一条链发生断裂和再连接,反应无须供给能量,主要集中在活性转录区,反应无须供给能量,主要集中在活性转录区,与转录有关。与转录有关。拓扑异构酶拓扑异构酶使使DNA的两条链同时断裂和再连的两条链同时断裂和再连接,当它引入超螺旋时需要由接,当它引入超螺旋时需要由ATP供给能量。供给能量。分布在染色质骨架蛋白和核基质部,与复制有关。分布在染色质骨架蛋白和核基质部,与复制有关。第15页,讲稿共72张,创作于星期二1.DNA聚合酶聚合酶 1956年年Kornberg 等首先从大肠杆菌提取
15、液中发等首先从大肠杆菌提取液中发现现DNA聚合酶。在有适量聚合酶。在有适量DNA和和Mg2+存在时,该酶能存在时,该酶能催化四种脱氧核糖核苷三磷酸合成催化四种脱氧核糖核苷三磷酸合成DNA。dATP、dGTP、dCTP和和dTTP四种脱氧核糖核苷三磷酸缺一四种脱氧核糖核苷三磷酸缺一不可;它们不能被相应的二磷酸或一磷酸化合物取代,不可;它们不能被相应的二磷酸或一磷酸化合物取代,也不能被核糖核苷酸取代。也不能被核糖核苷酸取代。DNA的聚合反应表示如下:的聚合反应表示如下:n1dATPn2dGTPn3dCTPn4dTTP+DNADNA聚合酶聚合酶Mg2+dAMPdGMPdCMPdTMPDNA+(n1+
16、n2+n3+n4)PPin第16页,讲稿共72张,创作于星期二Arthur Kornberg won the 1959 Nobel Prizein Medicine for his discovery of the mechanism in the biological synthesis of deoxyribonucleic acid(before Watson and Crick won theirs!)1918,3,3-2007,10,26 1918,3,3-2007,10,26 第17页,讲稿共72张,创作于星期二大肠杆菌大肠杆菌DNA聚合酶聚合酶全酶全酶的结构和功能的结构和功能 延
17、长因子延长因子DNA聚合酶聚合酶 两个两个 亚基夹住亚基夹住DNADNA聚合酶聚合酶异异二聚体二聚体核心酶核心酶校对校对引物的结引物的结合和识别合和识别促使核心促使核心酶二聚化酶二聚化第18页,讲稿共72张,创作于星期二DNA polymerase III第19页,讲稿共72张,创作于星期二*大肠杆菌大肠杆菌DNA聚合酶比较聚合酶比较第20页,讲稿共72张,创作于星期二DNA聚合酶催化的链延长反应聚合酶催化的链延长反应5RNA引物引物子链子链33553355335模板链模板链第21页,讲稿共72张,创作于星期二DNA聚合酶催化的链延长反应聚合酶催化的链延长反应 在在DNA聚合酶催化的链延长反应
18、中,链的游离聚合酶催化的链延长反应中,链的游离3羟基羟基对进入的脱氧核糖核苷三磷酸磷原子发生亲核攻击,形成对进入的脱氧核糖核苷三磷酸磷原子发生亲核攻击,形成3,5 磷酸二酯碱并脱下焦磷酸。磷酸二酯碱并脱下焦磷酸。(dNTP)第22页,讲稿共72张,创作于星期二 DNA聚合酶的反应特点(聚合酶的反应特点(P413):):1)以四种脱氧核糖核苷三磷酸作底物;)以四种脱氧核糖核苷三磷酸作底物;2)反应需要接受模板的指导;)反应需要接受模板的指导;3)反应需要有引物)反应需要有引物3羟基存在;羟基存在;4)DNA链的生长方向为链的生长方向为5 3;5)产物)产物DNA的性质与模板相同。的性质与模板相同
19、。第23页,讲稿共72张,创作于星期二 DNA聚合反应必备的条件聚合反应必备的条件(1)DNA聚合酶聚合酶(2)DNA模板(反转录时用模板(反转录时用RNA模板)模板)(3)引物()引物(DNA、RNA或蛋白质)或蛋白质)(4)4种种dNTP(5)Mg2+第24页,讲稿共72张,创作于星期二DNA聚合酶的聚合酶的3 5外切酶水解位点外切酶水解位点3355错配碱基错配碱基3-5核酸外切核酸外切酶水解位点酶水解位点第25页,讲稿共72张,创作于星期二DNA聚合酶聚合酶5 3外切酶活力外切酶活力5-3核酸外切酶核酸外切酶水解位点水解位点单链缺口单链缺口5第26页,讲稿共72张,创作于星期二DNA聚合
20、酶聚合酶水解引物并填补水解引物并填补缺口缺口第27页,讲稿共72张,创作于星期二2.DNA连接酶2.DNA连接酶连接酶DNA ligase first transfers an AMP moiety to the 5phosphate group(from NAD+or ATP)before making a phosphodiester bond.第28页,讲稿共72张,创作于星期二第29页,讲稿共72张,创作于星期二DNA复制酶系总览复制酶系总览第30页,讲稿共72张,创作于星期二(四)原核细胞(四)原核细胞DNA的半不连续复制过程的半不连续复制过程前导链前导链(leading stran
21、d):当复制叉沿:当复制叉沿DNA向前移动时,向前移动时,由于两条模板链是反向平行的,而由于两条模板链是反向平行的,而DNA聚合酶只能以聚合酶只能以53的方向合成新链,同时新链必须与模板链反向平行,的方向合成新链,同时新链必须与模板链反向平行,碱基配对。这样,以走向碱基配对。这样,以走向35的亲代链为模板,子代链的亲代链为模板,子代链就能连续合成,称为就能连续合成,称为前导链前导链;滞后链滞后链(lagging strand):以走向:以走向53的亲代链为模板的亲代链为模板,在其上在其上DNA也是以也是以53方向合成,因此和复制叉移动方向合成,因此和复制叉移动的方向正好相反,所以随着复制叉的移
22、动,形成许多不连的方向正好相反,所以随着复制叉的移动,形成许多不连续的片段,最后连成一条完整的续的片段,最后连成一条完整的DNA链,该链称为滞后链,该链称为滞后链链。第31页,讲稿共72张,创作于星期二复制叉的移复制叉的移动方向动方向解旋酶解旋酶DNA聚合酶聚合酶III解链酶解链酶RNA引物引物引发体引发体DNA聚聚合酶合酶ISSB335前导链前导链随后链随后链35复制的起始复制的起始DNA链的延长链的延长DNA链终止链终止5RNA引物引物33半不连续复制过程半不连续复制过程第32页,讲稿共72张,创作于星期二 复制体:复制体:在在DNA合成的生长点(既复制叉上)合成的生长点(既复制叉上)分布
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