群体遗传与进化PPT精选PPT.ppt
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1、关于群体遗传与进化PPT第1页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/162 本章节重点本章节重点一、群体遗传学一、群体遗传学一、群体遗传学一、群体遗传学vv基因频率和基因型频率及计算基因频率和基因型频率及计算基因频率和基因型频率及计算基因频率和基因型频率及计算vv遗传平衡定律遗传平衡定律遗传平衡定律遗传平衡定律vv影响群体遗传平衡的因素影响群体遗传平衡的因素影响群体遗传平衡的因素影响群体遗传平衡的因素 突变、选择、迁移、遗传漂变突变、选择、迁移、遗传漂变突变、选择、迁移、遗传漂变突变、选择、迁移、遗传漂变二、物种形成与进化二、物种形成与进化二、物种形成与进化二、物种形成与进化第2页,讲稿共
2、85张,创作于星期三遗传学遗传学 研究生物遗传、变异的规律和机理;研究生物遗传、变异的规律和机理;进化论进化论 研究生物物种的起源和演变过程。研究生物物种的起源和演变过程。每个物种具有相当稳定的遗传特性,而每个物种具有相当稳定的遗传特性,而新种形成新种形成和发展和发展则有赖于则有赖于可遗传的变异可遗传的变异。群体遗传学是研究进化论的必要基础。群体遗传学是研究进化论的必要基础。群体遗传学的研究:群体遗传学的研究:.为生物进化的研究提供更多的证据;为生物进化的研究提供更多的证据;.解释生物进化根本原因和历史过程。解释生物进化根本原因和历史过程。第3页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/164
3、白化病第4页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/165孟孟德德尔尔式式群群体体(Mendelian population):享享享享有有有有一一一一个个个个共共共共同同同同基基基基因因因因库库库库,个个个个体体体体间间间间能能能能能能能能相相相相互互互互交交交交配配配配并并并并能能能能繁繁繁繁育育育育后后后后代代代代的的的的群体。群体。群体。群体。第一节第一节 群体的遗传组成群体的遗传组成基基基基因因因因库库库库(gene(gene pool)pool):一一一一个个个个群群群群体体体体所所所所包包包包含含含含的的的的所所所所有有有有基基基基因因因因的的的的总总总总和和和和,即一个群体含
4、有的总的遗传信息。即一个群体含有的总的遗传信息。即一个群体含有的总的遗传信息。即一个群体含有的总的遗传信息。群群体体遗遗传传学学(population population geneticsgenetics):遗遗遗遗传传传传学学学学的的的的一一一一个个个个分分分分支支支支学学学学科科科科,它它它它以以以以孟孟孟孟德德德德尔尔尔尔遗遗遗遗传传传传理理理理论论论论为为为为基基基基础础础础,应应应应用用用用数数数数学学学学和和和和统统统统计计计计学学学学的的的的方方方方法法法法研研研研究究究究群群群群体体体体的的的的遗遗遗遗传传传传结结结结构构构构及及及及其其其其在在在在逐逐逐逐代中的变化规律科学
5、。代中的变化规律科学。代中的变化规律科学。代中的变化规律科学。第5页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/166基基基基因因因因频频频频率率率率(gene frequency):指指指指在在在在一一一一个个个个群群群群体体体体中中中中,某某某某一一一一等位基因占该位点上等位基因总数的比例。等位基因占该位点上等位基因总数的比例。等位基因占该位点上等位基因总数的比例。等位基因占该位点上等位基因总数的比例。基因频率基因频率基因频率基因频率=基因基因 A A 的频率为的频率为 p p 基因基因 a a 的频率为的频率为 q qp p q q 1 1 第6页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/
6、167 基因型频率基因型频率基因型频率基因型频率(genotype frequency):指在一个群体内某指在一个群体内某指在一个群体内某指在一个群体内某一基因型个体在群体中所占的比例。一基因型个体在群体中所占的比例。一基因型个体在群体中所占的比例。一基因型个体在群体中所占的比例。基因型频率基因型频率=基因型基因型 AAAA 的频率为的频率为 P P基因型基因型 AaAa 的频率为的频率为 H H 基因型基因型 aaaa 的频率为的频率为 Q QP P H H Q Q 1 1 第7页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/168群体遗传结构群体遗传结构(population genetic
7、structure):指群体指群体中各种等位基因的频率以及由不同的交配体制所产生中各种等位基因的频率以及由不同的交配体制所产生的各种基因型在数量上的分布特征。的各种基因型在数量上的分布特征。例如:例如:在在一一个个群群体体中中,AA个个体体60人人,Aa个个体体120个个,aa个个体体20个个,请请计计算算AA、Aa、aa的的基基因因型型频频率率,以以及及A、a的的基因频率?基因频率?P=60/(60+120+20)=0.3 H=120/(60+120+20)=0.6 Q=20/(60+120+20)=0.1 p=(60*2+120)/(60+120+20)*2=P+1/2H=0.6 q=(2
8、0*2+120)/(60+120+20)*2=Q+1/2H=0.4第8页,讲稿共85张,创作于星期三基因基因频率与基因型率与基因型频率的关系率的关系 p=P+1/2H q=Q+1/2H 并且:并且:p+q=1 P+H+Q=1适用于任何群体适用于任何群体第9页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1610第二节第二节 遗传平衡定律遗传平衡定律遗传平衡定律遗传平衡定律遗传平衡定律遗传平衡定律 (law of genetic equilibrium)G.H.HardyW.Weinberg第10页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1611Hardy-Weinberg 定律定律遗传平衡定律遗
9、传平衡定律遗传平衡定律遗传平衡定律(law of genetic equilibrium)一定条件下:一定条件下:1.1.群体很大群体很大2.2.随机交配随机交配3.3.没有突变没有突变4.4.没有选择没有选择5.5.没有大规模迁移没有大规模迁移 群体中的基因频率和基因型频率在世代传递中保持不变。群体中的基因频率和基因型频率在世代传递中保持不变。如如果一个群体达到了这种状态,就是一个遗传平衡的群体。果一个群体达到了这种状态,就是一个遗传平衡的群体。第11页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/16121.一对等位基因的遗传平衡一对等位基因的遗传平衡据数学原理:据数学原理:(p p p p
10、q q q q)2 2=(p p p p q q q q)()(p p p p q q q q)假设有一对等位基因假设有一对等位基因假设有一对等位基因假设有一对等位基因 A A 和和和和 a ap p p p q q q q 1 1 基因基因 A 的频率为的频率为 p p 基因基因 a 的频率为的频率为 q qP P P P H H H H Q Q Q Q 1 1 基因型基因型 AA 的频率为的频率为 P P基因型基因型 Aa 的频率为的频率为 HH 基因型基因型 aa 的频率为的频率为 Q Q p p p p2 2 2 2 2 2 2 2pqpqpqpq q q q q2 2 2 2 1 1
11、 即即 AA:Aa:aa=p p2 2 :2 2pqpq :q q2 2 -为遗传平衡群体为遗传平衡群体第12页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1613假定亲代假定亲代A基因频率基因频率p=0.6,a基因频率基因频率q=0.4,则,则p+q=0.6+0.4=1,在随机交配(婚配)中,其子代,在随机交配(婚配)中,其子代(AA)个体是)个体是p2,(,(Aa)个体的频率是)个体的频率是2pq,(aa)个体频率是)个体频率是q2。母母父父p(A)0.6q(a)0.4p(A)0.6p2(AA)0.36pq(Aa)0.24q(a)0.4pq(Aa)0.24q2(aa)0.16一对等位基因交配
12、的结果一对等位基因交配的结果子代子代A基因频率是:基因频率是:p2+(2pq)=p2+pq=0.36+.24=0.6子代子代a基因频率是:基因频率是:q2+(2pq)=q2+pq=0.16+0.24=0.4第13页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1614Hardy-Weinberg 定律的定律的应用应用判断一个群体是否为平衡群体判断一个群体是否为平衡群体 一个群体一个群体 100人,人,AA 60人,人,Aa 20人,人,aa 20人。这人。这是一个遗传平衡群体吗?是一个遗传平衡群体吗?假定假定Ap,aq,pq=l (pq)21二项式展开,二项式展开,p22pqq2=l p2AA,q
13、2aa,2pqAa 第14页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1615基基 因因 型型 数数 量量 频频 率率 AA 60 0.60 Aa 20 0.20 aa 20 0.20 总计总计 100 1.0 先计算基因型频率:先计算基因型频率:AA 0.6 Aa 0.2 aa 0.2第15页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1616再计算基因频率再计算基因频率:Ap=0.600.20/2=0.70 a q=0.20+0.20/2=0.30 如果是遗传平衡的群体,如果是遗传平衡的群体,它应当符合:它应当符合:p2+2pq+q2=1,p2=0.49 2pq=0.42 q2=0.09 即
14、即 0.49+0.42+0.09=1上述群体基因型频率上述群体基因型频率 p2:0.6、2pq:0.2、q2:0.2 故群体是一个遗传不平衡的群体故群体是一个遗传不平衡的群体第16页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1617基因频率的计算基因频率的计算隐性表型频率隐性表型频率(发病率发病率)隐性致病基因型频率隐性致病基因型频率 a 基因频率基因频率q q2 隐性表型频率隐性表型频率 发病率发病率 A 基因频率基因频率p 1 q Aa=2pq=2q(1 q)=2q 2q2 2q常染色体隐性遗传病常染色体隐性遗传病(AR)第17页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1618 AR:A
15、R:一个群体中白化病的发病率为一个群体中白化病的发病率为1/400001/40000,求致病基因频率;携带者频率?求致病基因频率;携带者频率?按遗传平衡定律计算:按遗传平衡定律计算:aa=qaa=q2 2=1/40000=1/40000a=q=1/40000=1/200 A=p=1-q=1-0.005=0.995 1a=q=1/40000=1/200 A=p=1-q=1-0.005=0.995 1Aa=2pq=211/2001/100Aa=2pq=211/2001/100 在这个群体中:致病基因在这个群体中:致病基因a a的频率为的频率为1/2001/200,携带者的频率约为携带者的频率约为1
16、/1001/100。第18页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/16192.2.复等位基因的遗传平衡复等位基因的遗传平衡假设某群体含有假设某群体含有A、a、a这这3个复等位基因,其频率分别个复等位基因,其频率分别为为p,q,r且且 p+q+r=1。平衡时:平衡时:(A a a)2=AA Aa aa Aa aa aa p q r p2 2pq q2 2pr 2qr r2 即:即:(p+q+r)2=p2+2pq+q2+2pr+2qr+r2 第19页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1620设:某一人群的设:某一人群的ABO血型三种基因频率分别为血型三种基因频率分别为:IA=p IB=
17、q i=r在自由婚配的情况下,后代基因型频率、血在自由婚配的情况下,后代基因型频率、血型频率为:型频率为:第20页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1621 p(IA)q(IB)r(i)p(IA)q(IB)r(i)p2(IA IA)p q(IA IB)p r(IAi)A A B Ap q(IA IB)q 2(IB IB)q r(IBi)A B B Bp r(IAi)q r(IBi)r2(ii)A B O第21页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1622设设A、B、A B、O为各种血型频率,则为各种血型频率,则A+O=p2+2pr+r2=(p+r)2B=q2+2qrA B=2pq
18、O=r2r=Op+r=A+O =1-qA=p2+2pr q=1-A+O p=1-B+O 第22页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1623 假设一个人群中,假设一个人群中,A型型45人,人,B型型13人,人,O型型36人,人,AB型型6人,人,计算复等位基因计算复等位基因IA、IB、i的频率?的频率?即即p、q、r的值。的值。因为因为O型为型为ii,表型,表型=基因型,基因型,i基因的频率基因的频率r=0.6,A型型+O型(表型频率)型(表型频率)=p2+2pr+r2=(p+r)2=0.45+0.36=0.81 所以所以p+r=0.9 而而 r=0.6 故故p=0.9-0.6=0.3
19、又因又因p+q+r=1 所以所以q=1-p-r=0.1,基因型的频率:基因型的频率:IAIA=p2=0.09;IAi=2pr=20.30.6=0.36其他依其他依 此类推。此类推。第23页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/16243.3.伴性基因的遗传平衡伴性基因的遗传平衡在在XYXY性别决定方式中,雌、雄个体的性染色性别决定方式中,雌、雄个体的性染色体组成分别是体组成分别是XXXX、XYXY,两种性别的基因型频率也,两种性别的基因型频率也不同。不同。设基因设基因A A、a a的频率分别为的频率分别为p p、q q,随机交配结,随机交配结果如下:果如下:第24页,讲稿共85张,创作于星
20、期三2022/9/1625XA(p)Xa(q)YXA(p)XAXA XAXa XAY p2 pq pXa(q)XAXa XaXa XaY pq q2 q:XAXA p2 XAXa pq XaXa q2:XAY p XaY q第25页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1626:p2+2pq+q2=1:p+q=1伴性基因的平衡公式为第26页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1627例:人类中,男性红绿色盲的患病率为,问:例:人类中,男性红绿色盲的患病率为,问:()女性患病率及携带者频率是多少?()女性患病率及携带者频率是多少?()有多少婚配的家庭,他们的孩子全正常?)有多少婚配的家
21、庭,他们的孩子全正常?()有多少婚配的家庭,他们的子、女各有一)有多少婚配的家庭,他们的子、女各有一半是色盲?半是色盲?()男性的患病率即为基因频率:()男性的患病率即为基因频率:q=8%,p=1-q=92%女性患病率为:女性患病率为:q2(8%)2.64%携带者频率为:携带者频率为:2pq 8%92%14.72%第27页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1628()孩子全正常的婚配方式有XAXA XAY和 XAXA XaY p2(92%)284.64%()子、女各有一半是色盲的婚配方式为()子、女各有一半是色盲的婚配方式为XAXa XaY14.72%8%1.12%第28页,讲稿共85
22、张,创作于星期三2022/9/1629 伴X隐性遗传病:男性发病率:女性性发病率q:q21:q 1 伴X显性遗传病:男性发病率:女性发病率p:(p2+2pq)1:(1+q)1第29页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1630第三节第三节 影响遗传平衡的因素影响遗传平衡的因素突变突变选择选择迁移迁移漂变漂变第30页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/16311、突变、突变突变率突变率(mutation rate):每个基因都有一定的突变率,每个基因都有一定的突变率,用每一世代中每一百万个基因中基因发生突变的次数用每一世代中每一百万个基因中基因发生突变的次数来表示。来表示。突变对改变
23、群体的遗传组成有两个作用,一是突变影突变对改变群体的遗传组成有两个作用,一是突变影响群体的基因频率,二是突变为自然选择提供了原始响群体的基因频率,二是突变为自然选择提供了原始材料。材料。第31页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1632正反突变压正反突变压正反突变压:正反突变压:在没有其他因素影响时:设某一世代中,一对在没有其他因素影响时:设某一世代中,一对等位基因等位基因A,a的频率分别为的频率分别为 P(A)=p,P(a)=q;正反突变率分别为正反突变率分别为u,v,则:,则:uA=av在某一世代中:在某一世代中:Aa的频率为的频率为pu(正突变压正突变压);aA的频率为的频率为q
24、v(反突变压反突变压)。第32页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1633突变压对基因频率的作用突变压对基因频率的作用经过一个世代,基因经过一个世代,基因频率的改变为:频率的改变为:p=pu-qv;即子代群体:即子代群体:P(A)=p-p;P(a)=q+p.当群体达到平衡时,当群体达到平衡时,基因频率保持不变,基因频率保持不变,即:即:p=pu-qv=0(正反正反突变压相等突变压相等)。因此在平衡状态下因此在平衡状态下:第33页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/1634突变压对基因频率的作用突变压对基因频率的作用结论:结论:在没有其他因素干扰时,平衡群体的基因频率在没有其他因素
25、干扰时,平衡群体的基因频率由正反突变频率大小决定。由正反突变频率大小决定。给定一对等位基因的正反突变频率,就可以计给定一对等位基因的正反突变频率,就可以计算平衡状态的基因频率。算平衡状态的基因频率。例:例:u=110-6,v=510-7 p=33%,q=67%;u=v=110-6 p=q=50%由于大多数基因突变频率很低由于大多数基因突变频率很低(10-410-7),因此突变压,因此突变压对基因频率的改变要经过很多世代。时间的长短则与世代对基因频率的改变要经过很多世代。时间的长短则与世代周期长短密切相关。周期长短密切相关。第34页,讲稿共85张,创作于星期三2022/9/16352、选择、选择
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