基因表达调控原核精简版.ppt
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1、关于基因的表达调控原核精简版第一张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月第一节第一节 基因表达调控概述基因表达调控概述1.1 基因表达调控的概念1.2 基因表达调控的元件和作用方式1.3 基因表达调控的策略概述第二张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月1.1 基因表达调控的概念基因表达调控的概念基因表达(gene expression)是指基因通过转录转录和翻译翻译而产生其蛋蛋白质产物白质产物,或转录后直接产生其RNA产物产物(如tRNA,rRNA等)的过程。第三张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月真核细胞基因表达第四张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月基因表
2、达调控的必要性基因表达调控的必要性细菌基因组一般编码约4,000个基因,人的基因组中含有30,000多个基因。设想一下如果这么多的基因同时表达会出现什么样的情况?第五张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月细菌中蛋白质合成的延伸因延伸因子子是细菌中最丰富的蛋白血红蛋白只在红细胞中存在DNA修复系统的酶需要量很少有些基因(如决定细胞性质的基因)只在某一些或几个细胞中表达第六张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月发育调节基因bithorax表达模式的改变结果果蝇发育中基因的正常表达改变的结果果蝇发育中基因的正常表达改变的结果第七张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月Hutch
3、inson-Gilford syndrome第八张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月第九张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月第十张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月agWild type第十一张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月1.2 基因表达调控的元件和作用方式基因表达调控的元件和作用方式持家基因持家基因,看家基因看家基因,组成型表达组成型表达基因,常备基因,常备基因。基因。理论上在所有的细胞中都能进行正常表达,并为所有类型细胞的生命活动提供基本功能的基因,其产物在不同细胞中的浓度大体保持一致,不易受环境条件的影响。有其机密的调控机制以保持基因的表达水
4、平保持在恒定状态。第十二张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月奢侈基因(luxury gene)又叫可调节基因,是在特殊的细胞类型中为特化功能蛋白质编码的基因,其表达和调控机制都受到环境条件的影响。第十三张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月奢侈基因(luxury gene)在不同时期和不同条件下基因表达的开启或关闭以及基因活性的增加或减弱等,是受到调节控制的,这种控制被称为基因表达基因表达的调控的调控。第十四张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月基因的阻遏基因的阻遏-与诱导相反,某种信号使得基因的表达水平降低(或叫下降、下调),基因的产物减少。这个过程叫做“阻遏阻遏”
5、(repression)。基因的诱导基因的诱导指某种信号使得基因的表达水平提高(或叫上升、上调),基因的产物增多。这个过程叫做“诱诱导导(induction)。第十五张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月结构基因结构基因(structural gene)指编码蛋白质或RNA的任何基因。它们编码功能各异的蛋白质和RNA,作为酶、细胞骨架结构以及调节蛋白等。第十六张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月调节基因(regulator gene)是参与其他基因表达调控的基因,编码的产物是RNA或蛋白质。第十七张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月调节基因的产物(RNA或蛋白)通过
6、与特定的特定的DNA序列结合序列结合来调节其他基因的表达。可以使基因的表达上升上升(正调控,positive regulation)或下降(负调控,negative regulation)。第十八张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月激活蛋白激活蛋白(activator),或叫做激活子,是由调节基因编码的调节蛋白,可以开启结构基因的转录。转录因子转录因子就是属于激活蛋激活蛋白。白。第十九张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月阻遏蛋白阻遏蛋白(repressor),由调节基因编码的调节蛋白,由本身或与辅阻遏物一起阻遏结构基因的转录。第二十张,PPT共一百二十九页,创作于2022年
7、6月激活蛋白与阻遏蛋白对结构基因转录激活蛋白与阻遏蛋白对结构基因转录的调控的调控第二十一张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月调节基因转录的蛋白结合的DNA序列种类很多,如启动子启动子、终止子终止子、增强子增强子、衰减子衰减子、沉默子沉默子和各种应答元件应答元件等。第二十二张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月正调控系统在一个基因转录调控的体系中,调节基因编码的调节蛋白是激调节蛋白是激活蛋白活蛋白,这样的基因表达调节体系叫正调控系统正调控系统。第二十三张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月在正调控系统中,基因开启转录的必要条件是要有调节蛋白的存在,否则基因就无法转录。如
8、真核基因转录时,仅有RNA聚合酶是不够的,还必须有转录因子等调节蛋白存在。第二十四张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月负调控系统在基因转录的调控中,调节基因编码的调节蛋白是阻遏蛋白,本身或与辅阻遏物一起阻止结构基因的转录,这样调节系统叫负调节系统负调节系统。但当有诱导物与阻遏蛋白结合后,阻遏蛋白就会失去活性使结构基因得以转录。第二十五张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月在负调节系统中,基因一般是不转录的,因为转录被阻遏蛋白抑制。基因开启转录的必要条件是除去阻基因开启转录的必要条件是除去阻遏蛋白遏蛋白。第二十六张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月1.3 基因表达调控
9、的策略概述基因表达调控的策略概述原核生物原核生物的基因表达主要取决于环境因素的诱导及细胞对环境条件的适应。原核生物是单细胞生物,直接生活在复杂多变的环境中,食物供应毫无保障。第二十七张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月为了维持自身的生存和繁衍,必须不断地通过对自身基因的表达调节以适应环境中的营养条件和应付各种不利的理化因素。第二十八张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月真核生物真核生物的基因表达则十分复杂,其调控系统也更为完善。真核生物的代谢途径和食物来源都是比较稳定的,但它们的绝大多数都是多细胞的复杂有机体。第二十九张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月真核生物真核
10、生物在个体发育过程中出现细胞分化,形成组织和器官。真核生物中基因表达调控的明显明显特征是特征是能在特定时间和特定细胞中激活特定基因的表达,实现分化和发育,并使组织和器官保持正常功能。第三十张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月尽管许多主要的基因调控方式是原核生物和真核生物共同具有的,但它们在调控策略上有明显的不同,在调控方式上也存在区别。第三十一张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月原核生物的基因表达调控可以在DNA、转录和翻译、转录和翻译三个不同的层次上进行,但转录水平上的调控转录水平上的调控是最主要的是最主要的,尤其是转录起始的调控,这是最经济最有效的调节方式。原核生物的基
11、因表达调控的主要策略第三十二张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月操纵子是原核生物转录调控的主要形式原核生物的基因一般成簇排列构成一个操纵子,一个操纵子中的每个基因都受单一启动子的调控。第三十三张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月第三十四张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月1937年,Monod发现细菌二次生长曲线1951年开始与Jacob合作研究1961年在法国的分子生物学发表蛋白质合成过程中的调节机制,提出操纵子学说。1965年 获得诺贝尔奖第三十五张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月原核细胞的DNA没有核膜包裹,因此转录和翻译是耦联转录和翻译是耦联的
12、。这是原核生物中衰减子负调控衰减子负调控的基础。很多调节氨基酸或核苷酸合成代谢的操纵子存在衰减子结构。第三十六张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月原核生物中转录水平的调控形式除了操纵子以外,还有其他其他形式形式,例如通过DNA重排重排、sigma因子的更换因子的更换和分解代谢分解代谢的阻遏来的阻遏来调节转录的起始,通过衰减子衰减子调控转录的终止等。第三十七张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月在翻译水平上的调控包括通过重叠基因、mRNA二级结构和反义RNA对翻译起始的调控,通过稀有密码子对翻译延伸的调控,通过严紧反应和mRNA的稳定性对翻译终止的调控等。第三十八张,PPT共一
13、百二十九页,创作于2022年6月真核生物的基因表达调控的主要策略真核生物的基因表达和调控要比原核生物复杂得多,产生差异的根本原因在于真核细胞的结构真核细胞的结构特征特征。第三十九张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月真核细胞的基因表达调控有更多的调控位点第四十张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月第二节第二节 原核细胞的基因表达调控原核细胞的基因表达调控原核生物基因表达调控的几个重要特点原核生物基因表达调控的几个重要特点 多组成操纵子操纵子进行调控 以负调控负调控为主 基因表达调控主要发生在转录转录水平第四十一张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月本节主要内容2.1 操
14、纵子2.2 基因表达的时序调节 2.3 生长速度的调节 2.4 细菌的SOS反应2.5 翻译水平的调控第四十二张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月2.1 操纵子(操纵子(operon)操纵子操纵子是原核生物基因转录调控的主要形式,是原核生物细胞DNA上的一段区域,由若干功能相关的结构结构基因基因和控制这些基因表达的元件组成的一个完整的连续的功能单位。第四十三张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月操纵子操纵子的活性受到的活性受到调节基因调节基因的控制,调解的控制,调解基因的产物通过与操纵子上的基因的产物通过与操纵子上的DNA序列相序列相互作用互作用而调节结构基因的表达。而调节结
15、构基因的表达。第四十四张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月调节基因的产物是阻遏蛋白或激活蛋白调节基因的产物是阻遏蛋白或激活蛋白阻遏蛋白阻遏蛋白一般与操纵基因操纵基因结合,阻碍RNA聚合酶与启动子的结合,从而关闭结构基因的表达。激活蛋白激活蛋白一般与启动子上游启动子上游处的DNA序列结合,促进RNA聚合酶对结构基因的转录,第四十五张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月乳糖操纵子(乳糖操纵子(lactose operon)调节基因调节基因LacI,有自己的启动子和终止子。编码阻遏蛋白乳糖操纵子的组成乳糖操纵子的组成操纵基因操纵基因LacO,28bp的DNA序列,不编码任何产物,可
16、以与阻遏蛋白结合,调节结构基因的转录3个结构基个结构基因因ZYA第四十六张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月阻遏蛋白与操纵基因的结合阻遏蛋白与操纵基因的结合第四十七张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月细菌的二次生长曲线细菌的二次生长曲线当细菌在含有葡萄糖和乳糖的培养基上生长时,首先利用葡萄糖,待葡萄糖消耗完之后才开始利用乳糖。结果在葡萄糖消耗完之后细菌的生长有个暂时的停顿。乳糖操纵子的发现是从研究细菌的二次生长曲线开始的乳糖操纵子的发现是从研究细菌的二次生长曲线开始的后来发现,细菌利用葡萄糖的酶是组成型表达的,而利用乳糖的酶是诱导型的。第四十八张,PPT共一百二十九页,创作
17、于2022年6月细菌分解乳糖的酶是如何被诱导表达的呢细菌分解乳糖的酶是如何被诱导表达的呢没有乳糖时没有乳糖时第四十九张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月细菌分解乳糖的酶是如何被诱导表达的呢?细菌分解乳糖的酶是如何被诱导表达的呢?没有乳糖时没有乳糖时有乳糖时有乳糖时*Animation第五十张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月开启结构基因的表达,是一个诱导物诱导物,但是真正直接直接起诱导作用的是异乳异乳糖糖(allolactose)。诱导物(诱导物(inducer)在乳糖操纵子中,乳糖可以与阻遏蛋白结合使之失活,第五十一张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月异乳糖异乳
18、糖的来源:是细菌细胞内的细胞内的-半乳糖半乳糖苷酶苷酶催化乳糖乳糖形成的产物之一,另一种产物是半乳糖和葡萄糖。第五十二张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月问题:问题:乳糖操纵子的酶是诱导乳糖操纵子的酶是诱导酶,基因的表达要受到乳糖的诱酶,基因的表达要受到乳糖的诱导才能开始;导才能开始;那么,这一切该如何解释呢?那么,这一切该如何解释呢?可是乳糖在细胞外,操纵子在细胞可是乳糖在细胞外,操纵子在细胞内,乳糖要进入细胞内才能开始诱内,乳糖要进入细胞内才能开始诱导;导;而乳糖进入细胞内需要而乳糖进入细胞内需要-半乳糖苷透性半乳糖苷透性酶酶的作用,但是的作用,但是-半乳糖苷透性酶半乳糖苷透性酶
19、却却是乳糖操纵子的结构基因,没有乳糖是乳糖操纵子的结构基因,没有乳糖是不能表达的。是不能表达的。第五十三张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月当培养基中没有乳糖时,Lac 操纵子也是在表达的,只是水平比较低,其中的-半乳糖苷半乳糖苷每个细胞每个细胞不多于5个分子。此谓“本底表达本底表达”(为诱导水平的1/1000)。这表明,阻遏蛋白对操纵子的阻遏是不完全的,有“渗漏”。乳糖操纵子的本底表达乳糖操纵子的本底表达第五十四张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月本底表达的少数结构基因产物的分子在细胞内起着“监测”的作用,当细菌遇到诱导物乳糖时,即刻将其运输到细胞内,在2-3分钟内细胞内
20、的-半乳糖苷酶就可以达到5000分子/细胞,浓度可以达到细胞内蛋白的5-10%,以便细菌迅速利用乳糖。第五十五张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月但是lac mRNA 极不稳定,半衰期仅有约3分钟,所以这种诱导能很快逆转。只要诱导物乳糖消失,基因转录就停止。mRNA 在很短的时间内被降解,mRNA含量又回落到诱导前的基础水平。第五十六张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月基因工程中,利用乳糖操纵子来表达外源基因时,一般不是使用乳糖来诱导基因的表达,而是利用一种合成的小分子叫IPTG,不被-半半乳糖苷酶乳糖苷酶水解,其浓度保持不变,可以促使外源基因一直表达。第五十七张,PPT共
21、一百二十九页,创作于2022年6月如何解释如何解释 葡萄糖效应葡萄糖效应(降解物阻遏降解物阻遏)当细菌的培养基中含有葡萄糖和乳糖时,细菌首先利用葡萄糖,待葡萄糖消耗完毕后才开始利用乳糖。这种现象以前叫“葡萄糖效应葡萄糖效应”,现称“降解物阻遏降解物阻遏(catabolite repression)”。如何解释这种现象呢?如何解释这种现象呢?第五十八张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月如何解释如何解释“葡萄糖效应(降解物阻遏)葡萄糖效应(降解物阻遏)”?Lac的启动子比较弱,即使操纵子的阻遏蛋白被去除,Lac操纵子的结构基因也不能进行强烈的表达。结构基因的强烈表达除了要求阻遏蛋白被解除
22、外,还要求有一个促进基因转录的调节蛋白CRP。CRP结合在启动子的上游,可以使基因的转录增强50倍。第五十九张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月CRP是cAMP receptor protein的缩写,又叫做CAP(catabolite gene activator protein),代谢物基因激活蛋白代谢物基因激活蛋白。CRP的活性由cAMP调节。当CRP结合了cAMP 之后具有活性,结合在操纵子的启动子上游附近,对下游结构基因的转录有增强作用。第六十张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月CRP(CAP)的二聚体与的二聚体与DNA的相互作用的相互作用弯曲的弯曲的DNA与与R
23、NA聚合酶聚合酶作用部位作用部位cAMP结合部位第六十一张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月CRP(CAP)的二聚体与的二聚体与DNA的相互作用的相互作用第六十二张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月当细胞利用葡萄糖时,分解产物抑制酰苷酰苷酸环化酶酸环化酶的活性并活化磷酸二酯酶磷酸二酯酶,细胞内的cAMP水平下降,CRP没有活性,Lac操纵子不能启动转录,当葡萄糖水平下降,细菌利用乳糖时,cAMP水平提高,CRP有活性,引起操纵子结构基因的转录。第六十三张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月CRP(CAP)对对Lac操纵子的作用操纵子的作用第六十四张,PPT共一百二十
24、九页,创作于2022年6月结论:乳糖操纵子是一个双因子调节系统结论:乳糖操纵子是一个双因子调节系统乳糖操纵子的表达需要2个调节蛋白的共同参与,一个是正调节蛋白CRP(CAP),一个是负调节蛋白(阻遏蛋白)。当阻遏蛋白解除后当阻遏蛋白解除后,没有没有CRP,基因也几乎不转录当只有当只有CRP而阻遏蛋白没有解除时而阻遏蛋白没有解除时,基因不转录只有当阻遏解除且只有当阻遏解除且CRP存在时存在时,基因才开始转录第六十五张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月遗传和生化实验已证实乳糖操纵子的正确遗传和生化实验已证实乳糖操纵子的正确如操纵基因突变,导致阻遏蛋白无法与之结合,操纵子处于无阻遏状态,成
25、“组成型表达组成型表达”阻遏蛋白基因LacI突变,导致阻遏蛋白失活或缺乏,操纵子的结构基因转录也处于组成型表达状态组成型表达状态。第六十六张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月还有一种突变,使得阻遏蛋白结构变化,失去与诱导物乳糖的结合位点,结果使操纵子处于“不可不可诱导状态诱导状态”。第六十七张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月受一种调节蛋白控制的几个操纵子构成的调节系统叫做调节子。调节子调节子(regulon)调节子是一种大范围内的基因表达控制调节手段。第六十八张,PPT共一百二十九页,创作于2022年6月受到降解物阻遏降解物阻遏 调节的的酶类除了代谢乳糖的酶类外,还有分解
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- 基因 表达 调控 精简
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