原核生物转录和调控.ppt
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1、关于原核生物的关于原核生物的转录与与调控控第一张,PPT共六十页,创作于2022年6月第二张,PPT共六十页,创作于2022年6月转录转录(transcription)生物体以生物体以DNA为模板按为模板按53方向方向合成合成RNA的过程的过程转转录录RNADNA 第三张,PPT共六十页,创作于2022年6月参参 与与 转转 录录 的的 物物 质:质:原料原料:4种种NTP (ATP,UTP,GTP,CTP)模板模板:DNA 酶酶 :RNA聚合酶聚合酶其他蛋白质因子其他蛋白质因子第四张,PPT共六十页,创作于2022年6月A.原核生物的转录原核生物的转录一、转录概述一、转录概述二、转录的基本过
2、程二、转录的基本过程三、大肠杆菌三、大肠杆菌RNA聚合酶聚合酶四、转录的机制四、转录的机制第五张,PPT共六十页,创作于2022年6月一、转录概述一、转录概述第六张,PPT共六十页,创作于2022年6月起始点起始点(start point):合成第一个:合成第一个RNA碱基的位置,用碱基的位置,用“+1”表示。表示。启动子启动子(promoter):位于转录起始点前,和:位于转录起始点前,和RNA聚合酶结合的一段聚合酶结合的一段DNA序列。序列。终止子终止子(terminator):使:使RNA聚合酶终止转录的一段聚合酶终止转录的一段DNA序列。序列。转录单位转录单位(transcriptio
3、n unit):从启动子到终止子间的一段:从启动子到终止子间的一段DNA序列。序列。1.基本术语:基本术语:第七张,PPT共六十页,创作于2022年6月上游序列:基因中起始点前面的序列,用“-”表示下游序列:在起始点后面的序列,用“+”表示初级转录本:刚转录完成的RNA产物转录泡:RNA聚合酶与启动子结合后形成的DNA解旋区。转录泡可和RNA聚合酶一起沿DNA链移动,RNA合成在转录泡内进行。1.基本术语:基本术语:第八张,PPT共六十页,创作于2022年6月转录泡的结构转录泡的结构当当RNA聚聚合合酶酶沿沿DNA模模板板移移动动时时,它它打打开开泡泡前前的的DNA双双螺螺旋旋(在在解解链链点
4、点打打开开),并并在在复复链链点点使使DNA复原。复原。转转录录泡泡的的长长度度随随增增长长反反应应阶阶段段而而异异,在在12-20bp之之间间(17 bp),但但其其中中的的RNA-DNA杂杂合合双双螺螺旋旋区区域域比比这这个个长长度度要要短短(12 bp)。第九张,PPT共六十页,创作于2022年6月二、转录的基本过程二、转录的基本过程二、转录的基本过程二、转录的基本过程1.1.识别启动子识别启动子识别启动子识别启动子RNARNA聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶识识识识别别别别启启启启动动动动子子子子,并并并并在在在在启启启启动动动动子子子子处处处处结结结结合合合合形形形形成成成成一一一一个个个个
5、“转转转转录录录录泡泡泡泡”,转转转转录泡内的录泡内的录泡内的录泡内的DNADNA双链解开,为双链解开,为双链解开,为双链解开,为RNARNA合成提供模板。合成提供模板。合成提供模板。合成提供模板。转录泡转录泡有义链有义链模板链,反义链模板链,反义链第十张,PPT共六十页,创作于2022年6月2.2.转录起始转录起始转录起始转录起始a.a.转录起始无需引物。转录起始无需引物。转录起始无需引物。转录起始无需引物。b.b.流产起始:流产起始:流产起始:流产起始:转录起始后直到形成转录起始后直到形成转录起始后直到形成转录起始后直到形成9 9个核苷酸短链的过程是通过启动子阶段,个核苷酸短链的过程是通过
6、启动子阶段,个核苷酸短链的过程是通过启动子阶段,个核苷酸短链的过程是通过启动子阶段,此时此时此时此时RNARNA聚合酶一直处于启动子区域,新生聚合酶一直处于启动子区域,新生聚合酶一直处于启动子区域,新生聚合酶一直处于启动子区域,新生RNARNA链与链与链与链与DNADNA模板链的结模板链的结模板链的结模板链的结合不够牢固,很容易从合不够牢固,很容易从合不够牢固,很容易从合不够牢固,很容易从DNADNA链上掉下来并导致转录重新开始,这一过程称链上掉下来并导致转录重新开始,这一过程称链上掉下来并导致转录重新开始,这一过程称链上掉下来并导致转录重新开始,这一过程称为为为为流产起始流产起始流产起始流产
7、起始。c.c.启动子清除:启动子清除:启动子清除:启动子清除:一旦一旦一旦一旦RNARNA聚合酶成功地合成聚合酶成功地合成聚合酶成功地合成聚合酶成功地合成9 9个以上核苷酸并离开启动子区个以上核苷酸并离开启动子区个以上核苷酸并离开启动子区个以上核苷酸并离开启动子区域,转录就进入正常的延伸阶段,这一过程称为启动子清除。域,转录就进入正常的延伸阶段,这一过程称为启动子清除。域,转录就进入正常的延伸阶段,这一过程称为启动子清除。域,转录就进入正常的延伸阶段,这一过程称为启动子清除。d.d.通过启动子的时间代表一个启动子的强弱,时间越短表明该基因转录通过启动子的时间代表一个启动子的强弱,时间越短表明该
8、基因转录通过启动子的时间代表一个启动子的强弱,时间越短表明该基因转录通过启动子的时间代表一个启动子的强弱,时间越短表明该基因转录起始的频率越高。起始的频率越高。起始的频率越高。起始的频率越高。第十一张,PPT共六十页,创作于2022年6月3.链的延伸链的延伸RNA聚聚合合酶酶沿沿DNA模模板板链链移移动动并并使使新新生生RNA链链不不断断伸伸长长的的过过程程。大大肠肠杆杆菌菌RNA聚聚合合酶酶的的活活性性一一般般为为每每秒秒50-90个个核核苷苷酸酸。酶酶移移动动时时局局部部解解旋旋DNA;酶酶经经过过之之后后,DNA又又重重新新形成双螺旋。形成双螺旋。第十二张,PPT共六十页,创作于2022
9、年6月4.链的终止和释放链的终止和释放当当当当RNARNA链延伸到转录终止位点时,链延伸到转录终止位点时,链延伸到转录终止位点时,链延伸到转录终止位点时,RNARNA聚合酶不再形成新聚合酶不再形成新聚合酶不再形成新聚合酶不再形成新的磷酸二酯键,的磷酸二酯键,的磷酸二酯键,的磷酸二酯键,RNA-DNARNA-DNA杂合物分离,转录泡瓦解,杂合物分离,转录泡瓦解,杂合物分离,转录泡瓦解,杂合物分离,转录泡瓦解,DNADNA恢复恢复恢复恢复成双链状态,而成双链状态,而成双链状态,而成双链状态,而RNARNA聚合酶和聚合酶和聚合酶和聚合酶和RNARNA链都从模板上释放出来,这就是链都从模板上释放出来,
10、这就是链都从模板上释放出来,这就是链都从模板上释放出来,这就是转录的终止。转录的终止。转录的终止。转录的终止。第十三张,PPT共六十页,创作于2022年6月三、大肠杆菌三、大肠杆菌RNA聚合酶聚合酶1.RNA聚合酶的功能聚合酶的功能a.RNA合成合成b.合成起始和终止位点的识别合成起始和终止位点的识别c.确定与确定与DNA结合位点的结合与脱离的时间等结合位点的结合与脱离的时间等第十四张,PPT共六十页,创作于2022年6月核心酶核心酶 core enzyme全酶全酶 holoenzyme 全酶至少含全酶至少含5 5个亚基:个亚基:2 2、,是转录起始所必需的。是转录起始所必需的。2 2、和和
11、亚基组成核心酶,种间基本没有变化亚基组成核心酶,种间基本没有变化;因子存在广泛的种间变异因子存在广泛的种间变异,用于识别不同的启动子用于识别不同的启动子。2.RNA聚合酶的结构第十五张,PPT共六十页,创作于2022年6月2)因子的功能:因子的功能:使使使使RNARNA聚合酶特异性地与启动子结合。聚合酶特异性地与启动子结合。聚合酶特异性地与启动子结合。聚合酶特异性地与启动子结合。大肠杆菌中最常见的大肠杆菌中最常见的大肠杆菌中最常见的大肠杆菌中最常见的 因子是因子是因子是因子是 7070核核核核心心心心酶酶酶酶不不不不能能能能区区区区分分分分DNADNA的的的的启启启启动动动动子子子子和和和和其
12、其其其它它它它序序序序列列列列,它它它它与与与与DNADNA非非非非选选选选择择择择性性性性结结结结合合合合形形形形成成成成松松松松散散散散型型型型复复复复合合合合体体体体。因因因因子子子子是是是是通通通通过过过过将将将将核核核核心心心心酶酶酶酶对对对对非非非非特特特特异异异异序序序序列列列列的的的的亲亲亲亲和和和和力力力力降降降降低低低低10104 4倍倍倍倍,同同同同时时时时增增增增加加加加其其其其对对对对启启启启动动动动子子子子的的的的亲亲亲亲和和和和力力力力来来来来帮帮帮帮助助助助启启启启动动动动子子子子识识识识别的。别的。别的。别的。RNARNA链链链链延延延延伸伸伸伸至至至至8-9
13、nt8-9nt时时时时,因因因因子子子子会会会会从从从从RNARNA聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶中中中中释释释释放放放放出出出出来来来来,它它它它可可可可以以以以再再再再与与与与其其其其他他他他核心酶核心酶核心酶核心酶结合重新起始转录。结合重新起始转录。结合重新起始转录。结合重新起始转录。第十六张,PPT共六十页,创作于2022年6月3.RNA聚合酶在细胞内的分布形式聚合酶在细胞内的分布形式1)1)很少有游离的核心酶和全酶很少有游离的核心酶和全酶很少有游离的核心酶和全酶很少有游离的核心酶和全酶2)2)细细细细胞胞胞胞内内内内 因因因因子子子子数数数数量量量量只只只只有有有有核核核核心心心心酶酶酶酶
14、的的的的30%30%,因因因因此此此此在在在在任任任任何何何何时时时时刻刻刻刻只只只只有有有有1/31/3的聚合酶能以全酶的形式存在。的聚合酶能以全酶的形式存在。的聚合酶能以全酶的形式存在。的聚合酶能以全酶的形式存在。第十七张,PPT共六十页,创作于2022年6月四、转录的机制四、转录的机制1.1.启动子识别和转录起始启动子识别和转录起始启动子识别和转录起始启动子识别和转录起始1)1)在在在在RNARNA聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶开开开开始始始始链链链链延延延延长长长长前前前前,它它它它与与与与DNADNA的相互作用经历了的相互作用经历了的相互作用经历了的相互作用经历了4 4个阶段:个阶段:个阶
15、段:个阶段:a.a.RNARNA聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶与与与与处处处处于于于于碱碱碱碱基基基基配配配配对对对对状状状状态态态态的的的的启启启启动动动动子序列子序列子序列子序列结合形成结合形成结合形成结合形成闭合复合物闭合复合物闭合复合物闭合复合物。b.b.DNADNA的的的的初初初初始始始始解解解解旋旋旋旋导导导导致致致致DNADNA与与与与聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶形形形形成成成成开放复合物,这一过程称为开放复合物,这一过程称为开放复合物,这一过程称为开放复合物,这一过程称为紧密结合紧密结合紧密结合紧密结合。c.c.进行多次流产起始进行多次流产起始进行多次流产起始进行多次流产起始d.d.起起
16、起起始始始始成成成成功功功功后后后后,聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶释释释释放放放放 因因因因子子子子,形形形形成成成成聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶-DNA-DNA-新新新新生生生生RNARNA的的的的三三三三聚聚聚聚复复复复合合合合物物物物,RNARNA链开始延伸。链开始延伸。链开始延伸。链开始延伸。第十八张,PPT共六十页,创作于2022年6月RNA RNA pol pol 是如何发现正确的起点而启动基因转录的呢?是如何发现正确的起点而启动基因转录的呢?第十九张,PPT共六十页,创作于2022年6月1)1)启动子的识别取决于共有序列启动子的识别取决于共有序列启动子的识别取决于共有序列启动子的识别取决
17、于共有序列保保保保守守守守性性性性序序序序列列列列:每每每每个个个个启启启启动动动动子子子子都都都都包包包包括括括括一一一一个个个个能能能能被被被被RNARNA聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶识识识识别别别别的的的的特征特征特征特征DNADNA序列序列序列序列。共共共共有有有有序序序序列列列列:是是是是根根根根据据据据保保保保守守守守性性性性序序序序列列列列总总总总结结结结出出出出的的的的一一一一种种种种理理理理想想想想序序序序列列列列,它它它它的的的的每每每每一一一一个个个个位位位位置置置置代代代代表表表表了了了了很很很很多多多多实实实实际际际际序序序序列列列列中中中中最最最最经经经经常常常常发发发
18、发现现现现的的的的碱碱碱碱基基基基。典型的启动子有典型的启动子有典型的启动子有典型的启动子有3 3个共有序列:个共有序列:个共有序列:个共有序列:-35-35序列、序列、序列、序列、-10-10序列和起始点序列序列和起始点序列序列和起始点序列序列和起始点序列-35序列序列-10序列序列起始点起始点TTGACATATAATACTG16-18bp5-8bp+1Pribnow框框Sextama框框第二十张,PPT共六十页,创作于2022年6月细菌启动子有个保守性特征:细菌启动子有个保守性特征:细菌启动子有个保守性特征:细菌启动子有个保守性特征:1)1)转录起始点:转录起始点:转录起始点:转录起始点:
19、开始碱基开始碱基开始碱基开始碱基90%90%是嘌呤,是嘌呤,是嘌呤,是嘌呤,GG比比比比A A更常见。更常见。更常见。更常见。2)2)-10-10序序序序列列列列:起起起起始始始始点点点点上上上上游游游游一一一一个个个个6bp6bp区区区区,这这这这个个个个六六六六聚聚聚聚体体体体的的的的中中中中心心心心靠靠靠靠近近近近起起起起始始始始点点点点上上上上游游游游的的的的第第第第1010碱碱碱碱基基基基对对对对,它它它它的的的的共共共共有有有有序序序序列列列列是是是是TATAATTATAAT。-10-10序序序序列列列列是是是是RNARNA聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶的的的的牢牢牢牢固固固固结结结结合
20、合合合位位位位点点点点,是是是是聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶启启启启动动动动DNADNA解解解解旋旋旋旋的的的的序序序序列列列列。因因因因此此此此,-10-10序序序序列列列列可可可可通通通通过过过过影影影影响响响响开开开开放放放放复复复复合合合合物物物物的形成速度而控制转录。的形成速度而控制转录。的形成速度而控制转录。的形成速度而控制转录。3)3)-35-35序序序序列列列列:也也也也是是是是一一一一个个个个六六六六聚聚聚聚体体体体,其其其其中中中中心心心心位位位位于于于于-35-35碱碱碱碱基基基基对对对对处处处处,它它它它的的的的共共共共有有有有序序序序列列列列是是是是TTGACATTGAC
21、A,是,是,是,是RNARNA聚合酶的识别位点。聚合酶的识别位点。聚合酶的识别位点。聚合酶的识别位点。4)4)-35-35和和和和-10-10序序序序列列列列之之之之间间间间的的的的距距距距离离离离十十十十分分分分重重重重要要要要,在在在在90%90%的的的的启启启启动动动动子子子子中中中中变变变变动动动动在在在在1616和和和和1818个碱基之间,两序列间为个碱基之间,两序列间为个碱基之间,两序列间为个碱基之间,两序列间为17bp17bp时转录效率最高。时转录效率最高。时转录效率最高。时转录效率最高。-35序列序列-10序列序列起始点起始点TTGACATATAATACTG16-18bp5-8
22、bp+1第二十一张,PPT共六十页,创作于2022年6月启动子的突变影响它所控制的基因的转录水平而不改变转录产物启动子的突变影响它所控制的基因的转录水平而不改变转录产物启动子的突变影响它所控制的基因的转录水平而不改变转录产物启动子的突变影响它所控制的基因的转录水平而不改变转录产物:下降突变下降突变下降突变下降突变:T TATAATATAAT A AATAATATAAT上升突变上升突变上升突变上升突变:TATTATGGTT TT TATTATA ATTTT-35-35序序序序列列列列的的的的作作作作用用用用是是是是为为为为RNARNA聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶的的的的识识识识别别别别提提提提供供供
23、供信信信信号号号号,而而而而-10-10序序序序列列列列使使使使复复复复合合合合物物物物由由由由闭闭闭闭合合合合转转转转化化化化为为为为开开开开放放放放。所所所所以以以以我我我我们们们们可可可可以以以以认认认认为为为为-35-35序序序序列列列列包包包包括括括括一一一一个个个个识识识识别别别别结结结结构构构构域域域域,而而而而-10-10序序序序列列列列包包包包括括括括一一一一个个个个解解解解链结构域链结构域链结构域链结构域。起起起起始始始始点点点点周周周周围围围围的的的的碱碱碱碱基基基基序序序序列列列列对对对对起起起起始始始始作作作作用用用用也也也也有有有有影影影影响响响响,起起起起始始始始
24、转转转转录录录录区区区区间间间间(+1+30+1+30)影影影影响响响响RNARNA聚合酶沿启动子滑动的速度从而影响启动子的强度。聚合酶沿启动子滑动的速度从而影响启动子的强度。聚合酶沿启动子滑动的速度从而影响启动子的强度。聚合酶沿启动子滑动的速度从而影响启动子的强度。第二十二张,PPT共六十页,创作于2022年6月4)转录起始的效率转录起始的效率a.不不同同启启动动子子的的起起始始效效率率有有差差异异。不不同同启启动动子子与与全全酶酶的的结结合合紧紧密密程程度不同,结合的紧密程度与启动子起始转录的效率有关。度不同,结合的紧密程度与启动子起始转录的效率有关。b.转录起始受调节蛋白控制。转录起始受
25、调节蛋白控制。c.启动子上游序列可能增强启动子的活性。启动子上游序列可能增强启动子的活性。d.负负超超螺螺旋旋状状态态有有利利于于转转录录起起始始,是是因因为为负负超超螺螺旋旋结结构构需需较较少的自由能,就可使起始复合物中的双链解开。少的自由能,就可使起始复合物中的双链解开。第二十三张,PPT共六十页,创作于2022年6月5)特定类型基因的转录由不同的特定类型基因的转录由不同的 因子控制因子控制 在细胞中不止一种在细胞中不止一种在细胞中不止一种在细胞中不止一种 因子因子因子因子 RNARNA聚合酶起始一些基因的转录需要特殊的聚合酶起始一些基因的转录需要特殊的聚合酶起始一些基因的转录需要特殊的聚
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