蛋白质的生物合成翻译 (5)精选PPT.ppt
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1、关于蛋白质的生物合成翻译(5)第1页,讲稿共78张,创作于星期三前前 言言第2页,讲稿共78张,创作于星期三第一节第一节 参与翻译过程的物质与功能参与翻译过程的物质与功能一、一、mRNA的结构与功能的结构与功能(一)(一)mRNA的结构特点的结构特点参与翻译过程的物质共包括:参与翻译过程的物质共包括:mRNA、tRNA、ribosome、氨基、氨基酸(酸(AA)、氨酰基)、氨酰基-tRNA合成酶合成酶以及各种以及各种翻译因子翻译因子等等。mRNAFigure.AribosomeassemblesfromitssubunitsonmRNA,translatesthenucleotidetripl
2、etsintoprotein,andthendissociatesfromthemRNA.第3页,讲稿共78张,创作于星期三(二)遗传密码(二)遗传密码第4页,讲稿共78张,创作于星期三(三)(三)密码子的特性密码子的特性三联体,连续性,不重叠,通用性,兼并性,兼职等。但三联体,连续性,不重叠,通用性,兼并性,兼职等。但存在例外。存在例外。1.密码子的兼并性(密码子的兼并性(degeneracy):多种密码子负责编码一种):多种密码子负责编码一种氨基酸。氨基酸。2.密码子的例外密码子的例外:1)在支原体:在支原体:UGATrp(色色);2)在纤毛虫:)在纤毛虫:UAA和和UAGGlu(谷);(
3、谷);3)在人的线粒体:)在人的线粒体:UGA(终止密码子)(终止密码子)Trp(色色);AGA,AGG(精)(精)终止密码子。另加终止密码子。另加UAA、UAG,线粒体共有,线粒体共有4个终止密码子;个终止密码子;内部蛋氨酸的密码子有内部蛋氨酸的密码子有2个:个:AUG和和AUA,起始密码子,起始密码子有有4个:个:AUN;4)在酵母线粒体:除上述)在酵母线粒体:除上述3点外,还有点外,还有CUA亮亮Thr(苏苏)。第5页,讲稿共78张,创作于星期三(四)遗传密码的破译(四)遗传密码的破译理论推算阶段:理论推算阶段:1954年科普作家年科普作家G.Gamow首先对遗传密码进首先对遗传密码进行
4、了理论推测:行了理论推测:41=4;42=16;43=64;44=256。AA=20。(。(4=A、T、C、G);所以,密码子是三联体。后来的实验证实是对的。);所以,密码子是三联体。后来的实验证实是对的。实验证实阶段:实验证实阶段:实验一:实验一:1961年,年,Nirenberg的无细胞翻译系统研究。的无细胞翻译系统研究。无无细细胞胞翻翻译译系系统统的的建建立立方方法法:破破碎碎大大肠肠杆杆菌菌(E.Coli),用用DNA酶酶(DNase)处处理理,使使模模板板DNA降降解解,不不能能再再行行转转录录生生成成新新的的mRNA,原原有有的的mRNA因因其其寿寿命命较较短短而而消消失失。在在该
5、该体体系系中中存存在在除除模模板板和和各各种种氨氨基酸以外的蛋白质合成所需全部成分。这就是无细胞翻译系统。基酸以外的蛋白质合成所需全部成分。这就是无细胞翻译系统。在在该该系系统统中中分分别别加加入入人人工工合合成成的的polyU、polyA、polyC或或polyG,结结果果发发现现,系系统统中中分分别别产产生生了了poly(Phe)、poly(Lys)、poly(Pro)或或poly(Gly)。这这说说明明Phe、Lys、Pro和和Gly的的密密码码子子分分别别为为UUU、AAA、CCC和和GGG。第6页,讲稿共78张,创作于星期三 在上述实验的基础上,将两种碱基按不同比例混合,如:在上述实
6、验的基础上,将两种碱基按不同比例混合,如:U:G=5:1U:G=5:1,合成模板合成模板mRNAmRNA,其三联体的种类共,其三联体的种类共8 8种:种:UUUUUU、UUGUUG、UGUUGU、GUUGUU、GGGGGG、GGUGGU、GUGGUG、UGGUGG 根据概率推算,上述根据概率推算,上述8 8种三联体在模板中出现的机率为种三联体在模板中出现的机率为125125:25:25:25:25:25:25:1 1:5:5:5:5:5:5。利用这种利用这种mRNAmRNA模板在无细胞翻译系统中合成多肽,经氨基酸种模板在无细胞翻译系统中合成多肽,经氨基酸种类和含量测定发现,类和含量测定发现,P
7、he:Cys=5:1Phe:Cys=5:1;Phe:Phe:Val Val=5:1=5:1;Phe:Gly=25:1Phe:Gly=25:1。由于苯丙氨酸的密码子为由于苯丙氨酸的密码子为UUUUUU,故可以推知,半胱氨酸和,故可以推知,半胱氨酸和缬缬氨酸的氨酸的密码子由密码子由2 2个个U U和和1 1个个G G组成,而苷氨酸的密码子由组成,而苷氨酸的密码子由1 1个个U U和和2 2个个G G组成。组成。应用类似的方法,测定了其他氨基酸的密码子碱基组成。应用类似的方法,测定了其他氨基酸的密码子碱基组成。第7页,讲稿共78张,创作于星期三实验二:实验二:三联体结合实验三联体结合实验-Niren
8、berg(1964年)。破译了全部密码年)。破译了全部密码子,但没有解决密码子的阅读方向问题。子,但没有解决密码子的阅读方向问题。为为了了解解决决上上述述无无细细胞胞翻翻译译系系统统测测定定密密码码子子的的不不足足,Nirenberg等等人人又又设计进行了三联体结合实验。该实验是在以下设计进行了三联体结合实验。该实验是在以下2个事实的基础上进行的:个事实的基础上进行的:1)tRNA、氨基酸和三联体的结合是特异的;、氨基酸和三联体的结合是特异的;2)由)由tRNA、氨基酸和三联体三者构成的复合体大分子不能通过、氨基酸和三联体三者构成的复合体大分子不能通过硝酸纤维素滤膜,而由硝酸纤维素滤膜,而由t
9、RNA和氨基酸二者组成的复合体可以通过此膜。和氨基酸二者组成的复合体可以通过此膜。在无细胞翻译系统中加入已知序列的三联体如在无细胞翻译系统中加入已知序列的三联体如ACA和一种用和一种用14C标记标记的氨基酸如丝氨酸(的氨基酸如丝氨酸(Ser),),ACA进入核糖体后,如果携带标记进入核糖体后,如果携带标记Ser的的tRNA能够与其结合,则不能透过硝酸纤维素滤膜,证明能够与其结合,则不能透过硝酸纤维素滤膜,证明ACA就是就是Ser的密码子。反之,的密码子。反之,ACA不是不是Ser的密码子,再更换其他的三联体,的密码子,再更换其他的三联体,直至找到直至找到Ser的密码子。的密码子。通过本实验,通
10、过本实验,Nirenberg等人成功地破译了等人成功地破译了20种氨基酸的全部遗传种氨基酸的全部遗传密码。密码。第8页,讲稿共78张,创作于星期三实验三:实验三:重复共聚物体外翻译实验重复共聚物体外翻译实验-Khorana(1965年)年)密码子全部被破译。密码子全部被破译。表表.重复多聚核苷酸的不同设计方式及无细胞翻译实验结果重复多聚核苷酸的不同设计方式及无细胞翻译实验结果重复序列重复序列可组成的三联体密码可组成的三联体密码合成多肽的氨基酸组成合成多肽的氨基酸组成(UC)nUCUCUCSer-Leu(UUC)nUUCUCUCUUPhe-Ser-Leu(UUAC)nUUACUUACUUACLe
11、u-Leu-Thr-Tyr至至此此,密密码码子子全全部部被被破破译译成成功功。正正是是由由于于Nirenberg和和Khorana二二人人的的创造性成果,他们于创造性成果,他们于1968年共同获得了诺贝尔化学奖。年共同获得了诺贝尔化学奖。第9页,讲稿共78张,创作于星期三二、二、tRNA的结构与功能的结构与功能(一)(一)tRNA的二级结构的二级结构The acceptor arm consists of a base-paired stemthatendsinanunpairedsequencewhosefree2-or3-OHgroupcanbelinkedtoanaminoacid.Th
12、eTC arm is named for the presence ofthistripletsequence.(standsforpseudouridine,amodifiedbase.)Theanticodon arm always contains theanticodontripletinthecenteroftheloop.TheD armisnamedforitscontentofthebasedihydrouridine(anotherofthemodifiedbasesintRNA).Theextra armliesbetweentheTCandanticodonarmsand
13、variesfrom321bases.第10页,讲稿共78张,创作于星期三(二)(二)tRNA的三级结构的三级结构所有的所有的tRNA的三级结构经的三级结构经X-ray衍射发现,都呈衍射发现,都呈L形,见下图。形,见下图。AmolecularmodelofthestructureofyeasttRNAPheisshowninFigure5.5.第11页,讲稿共78张,创作于星期三(三)(三)tRNA的功能的功能AA+ATPAA-AMP+PPi(氨基酸活化氨基酸活化)AA-AMP+tRNA氨酰基氨酰基-tRNA+AMP同同功功tRNA(isoaccepting tRNA):识识别别并并携携带带同
14、同一一种种氨氨基基酸酸的的不不同同tRNA。tRNA正正确确识识别别和和荷荷载载氨氨基基酸酸的的原原因因:首首先先与与氨氨酰酰基基-tRNA合合成成酶的结构有关;其次与反密码子有关;副密码子的作用非常重要。酶的结构有关;其次与反密码子有关;副密码子的作用非常重要。副密码子(副密码子(paracodon):):(四)(四)tRNA的丰富度与密码子的使用频率的丰富度与密码子的使用频率密码子优化密码子优化第12页,讲稿共78张,创作于星期三(五)摇摆假说(五)摇摆假说(wobblehypothesis):):第13页,讲稿共78张,创作于星期三第14页,讲稿共78张,创作于星期三三、三、核糖体的结构
15、与功能核糖体的结构与功能(一)核糖体的组成与结构(一)核糖体的组成与结构RNA的特异序列和功能的特异序列和功能含含CGAAC与与GTCG互补互补CCUCCU与与SD序列互补序列互补有有GAUC和和TCG互补互补和和Capm7G结合结合第15页,讲稿共78张,创作于星期三ElectronmicrographsofsubunitsandcompletebacterialribosomesareshowninFigure6.2.Togetherwithmodelsinthecorrespondingorientation.Thecomplete70Sribosomehasanasymmetricco
16、nstruction.Thepartitionbetweentheheadandbodyofthesmallsubunitisalignedwiththenotchofthelargesubunit,sothattheplatformofthesmallsubunitfitsintothelargesubunit.Thereisacavitybetweenthesubunitswhichcontainssomeoftheimportantsites.第16页,讲稿共78张,创作于星期三第17页,讲稿共78张,创作于星期三(二)核糖体的活性位点(二)核糖体的活性位点第18页,讲稿共78张,创作于
17、星期三1)mRNA结合位点:结合位点:位于位于30S亚基,亚基,由由S1/S18/S21蛋白及蛋白及16SrRNA组成。组成。2)P位点:位点:大部分位于大部分位于50S,小部分,小部分位于位于30S,能与起始,能与起始tRNA结合,结合,涉及涉及16SrRNA3-端区域;涉及端区域;涉及L2、L14、L18、L24、L27、L33。3)A位点:位点:主要位于主要位于50S亚基,亚基,涉及涉及16SrRNA及及L1、L5、L7、L12、L20、L30、L33。4)肽酰基转移酶活性位点:)肽酰基转移酶活性位点:位于位于P和和A位点的连接处位点的连接处,靠近靠近tRNA的接受臂。的接受臂。涉及涉及
18、23SrRNA、L2、L3、L4、L15、L16。5)5SrRNA位点:位点:在在50S上,靠近肽酰基转移酶活性位点,涉及上,靠近肽酰基转移酶活性位点,涉及L5、L8、L25。与。与23SrRNA结合。结合。6)EF-Tu位点:位点:位于位于50S亚基,靠近亚基,靠近30S,涉及,涉及L5、L1、L20。7)EF-G结合位点:结合位点:在在50S亚基,靠近亚基,靠近30S界面处,界面处,L7/L12附近。附近。8)E位点:位点:在在50S亚基的头部。亚基的头部。P位点的脱酰基位点的脱酰基tRNA由此脱离核糖体。由此脱离核糖体。第19页,讲稿共78张,创作于星期三第二节第二节 肽链合成的起始、延
19、伸和终止肽链合成的起始、延伸和终止回回顾:顾:mRNA、tRNA、Ribosome等的结构与功能。等的结构与功能。mRNA:蛋白质合成的模板;蛋白质合成的模板;tRNA:氨基酸的携带者;氨基酸的携带者;Ribosome:蛋白质合成的场所。蛋白质合成的场所。蛋蛋白白质质合合成成的的原原料料是是细细胞胞中中的的20种种氨氨基基酸酸,反反应应所所需需的的能能量量由由ATP与与GTP提供。提供。蛋蛋白白质质的的生生物物合合成成过过程程主主要要包包括括:合合成成的的起起始始;肽肽链链的的延延伸伸;合合成成的终止与多肽链释放。的终止与多肽链释放。第20页,讲稿共78张,创作于星期三一、氨基酸的激活与氨酰基
20、一、氨基酸的激活与氨酰基-tRNA的合成的合成1.氨基酸的激活与氨酰基氨基酸的激活与氨酰基-tRNA的合成过程的合成过程氨基酸不能直接与模板相结合,必须首先与相应的氨基酸不能直接与模板相结合,必须首先与相应的tRNA结合,结合,形成氨酰基形成氨酰基tRNA。这一过程就是氨基酸的激活。这一过程就是氨基酸的激活。将氨基酸接合于将氨基酸接合于tRNA以形成氨酰基以形成氨酰基tRNA的激活反应是在的激活反应是在氨酰氨酰基基tRNA合成酶合成酶的催化作用下进行的,需要的催化作用下进行的,需要ATP提供能量提供能量。这个反。这个反应是不可逆转的应是不可逆转的。AA+ATPAA-AMP+PPi(氨基酸活化氨
21、基酸活化)AA-AMP+tRNA氨酰基氨酰基-tRNA+AMP氨氨酰酰基基-tRNA是是蛋蛋白白质质合合成成过过程程中中的的一一个个关关键键性性物物质质,它它们们的的合合成成不不仅仅仅仅是是一一个个携携带带氨氨基基酸酸的的过过程程。因因为为:(1)它它为为肽肽键键的的形形成成提提供供能能量量;(2)tRNA上上的的反反密密码码子子与与mRNA上上的的密密码码子子识识别别,执执行行遗遗传传信信息息的的解解读读过程。过程。第21页,讲稿共78张,创作于星期三2.氨酰基氨酰基-tRNA合成过程中的校正(合成过程中的校正(proofreading)机制)机制如何保证翻译的正确性?如何保证翻译的正确性?
22、(1)氨氨酰酰基基-tRNA合合成成酶酶能能够够正正确确识识别别其其底底物物氨氨基基酸酸的的侧侧链链。有些是高度专一的,有些则专一性不高。有些是高度专一的,有些则专一性不高。(2)对专一性不高的氨酰基)对专一性不高的氨酰基tRNA合成酶的校正。合成酶的校正。(3)氨酰基)氨酰基-tRNA合成酶也必须识别正确的合成酶也必须识别正确的tRNA。另另外外,还还与与tRNA的的反反密密码码子子有有关关;副副密密码码子子的的作作用用也也非非常常重重要。要。第22页,讲稿共78张,创作于星期三二、原核生物蛋白质翻译过程二、原核生物蛋白质翻译过程(一)翻译的起始(一)翻译的起始1.30S起始复合物的形成起始
23、复合物的形成30S起始复合物包括起始复合物包括fMet-tRNA、mRNA与与30S小亚基结合。小亚基结合。这一过程是在起始因子和这一过程是在起始因子和GTP参与下完成的。参与下完成的。原核起始因子有原核起始因子有3种:种:IF1,IF2和和IF3。IF1:IF1是一个小的碱性蛋白,它能增加是一个小的碱性蛋白,它能增加IF2和和IF3的活性。的活性。IF1与与16SrRNA的结合位点在的结合位点在A位点位点。另外,。另外,IF1具有活化具有活化GTP酶的作用。酶的作用。IF2:具有很强的具有很强的GTP酶活性,在肽链合成起始时催化酶活性,在肽链合成起始时催化GTP水解。功能是生成水解。功能是生
24、成IF2GTPfMet-tRNA三元复合物,在三元复合物,在IF3存在存在下,使起始下,使起始tRNA与核糖体小亚基结合。与核糖体小亚基结合。IF3:IF3与与16SrRNA相互作用位点在相互作用位点在P位点附近。位点附近。IF3能能通过促使通过促使mRNA的的S-D序列与序列与16SrRNA的的3-端碱基配对,让核端碱基配对,让核糖体识别糖体识别mRNA上的特异启动信号,又能刺激上的特异启动信号,又能刺激fMet-tRNAf与核与核糖体结合在糖体结合在AUG上。上。第23页,讲稿共78张,创作于星期三mRNA和和fMet-tRNA结合于结合于IF30SGTP聚合体上。在结聚合体上。在结合时,
25、合时,fMet-tRNA与与IF2-GTP复合物紧密接触。复合物紧密接触。在核糖体小亚基上的在核糖体小亚基上的16SrRNA3-端有一段顺序:端有一段顺序:5-PyACCUCCUA-3。其中其中Py可以是任何嘧啶核苷酸。它可与可以是任何嘧啶核苷酸。它可与mRNA中的中的AUG上游约上游约10个碱基处有一段富含嘌呤的序列个碱基处有一段富含嘌呤的序列AGGA或或GAGG(Shine-Dalgarno顺序)互补。正是由这样的顺序)互补。正是由这样的配对将配对将AUG(或(或GUG,UUG)密码子带到核糖体的起始位置)密码子带到核糖体的起始位置上上。fMet-tRNA与小亚基上的与小亚基上的A位点结合
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