蛋白质的研究方法精选PPT.ppt
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1、关于蛋白质的研究方法1第1页,讲稿共125张,创作于星期三2主要内容v蛋白质对象的选择和样品的获取蛋白质对象的选择和样品的获取v蛋白质的检测和鉴定蛋白质的检测和鉴定v蛋白质的结构分析蛋白质的结构分析v蛋白质生物功能检测蛋白质生物功能检测 第2页,讲稿共125张,创作于星期三3 蛋白质对象的选择和样品的获蛋白质对象的选择和样品的获取取第3页,讲稿共125张,创作于星期三4 一、研究对象的选择一、研究对象的选择无论何种来源的生物材料一般都含有成千上万种不同的蛋白质无论何种来源的生物材料一般都含有成千上万种不同的蛋白质分子;分子;在一种生物组织中,同时又存在着多种蛋白质组分。虽然它在一种生物组织中,
2、同时又存在着多种蛋白质组分。虽然它们都具有肽链结构,但在们都具有肽链结构,但在分子大小分子大小、极性极性以以及及电荷电荷上会有所差异。上会有所差异。第4页,讲稿共125张,创作于星期三5 选择研究蛋白的原则选择研究蛋白的原则:在组织中含量比较高在组织中含量比较高 相对比较稳定的蛋白质(如血液中的相对比较稳定的蛋白质(如血液中的HbHb;肌肉中的;肌肉中的 肌球蛋白和肌动蛋白等)肌球蛋白和肌动蛋白等)从模式生物基因组测序结果来看,每一种生物有机体从模式生物基因组测序结果来看,每一种生物有机体内都还有大量的蛋白质(内都还有大量的蛋白质(5050左右)从来没有被研究左右)从来没有被研究过。过。第5页
3、,讲稿共125张,创作于星期三6获取蛋白样品的方法获取蛋白样品的方法:u直接从生物组织中提纯蛋白直接从生物组织中提纯蛋白为主为主u根据基因组测序获得的信息根据基因组测序获得的信息 第6页,讲稿共125张,创作于星期三7应用各种分辨效果好的应用各种分辨效果好的化学化学及及物理化学物理化学方法方法第7页,讲稿共125张,创作于星期三8直接从生物组织中提纯蛋白直接从生物组织中提纯蛋白蛋白质的分离纯化包括以下过程:蛋白质的分离纯化包括以下过程:1.破碎生物组织,并用适当的缓冲液将蛋白质抽提出来;破碎生物组织,并用适当的缓冲液将蛋白质抽提出来;2.将有关的蛋白质分级沉淀下来将有关的蛋白质分级沉淀下来;(
4、盐析法或有机溶剂(盐析法或有机溶剂法)法)3.应用应用层析法层析法或或电泳法电泳法使它们各自分开使它们各自分开;4.蛋白质结晶;蛋白质结晶;5.蛋白质纯度鉴定和含量测定。蛋白质纯度鉴定和含量测定。第8页,讲稿共125张,创作于星期三9u根据基因组测序获得的信息根据基因组测序获得的信息(1 1)可以获得所要研究的特定蛋白质的)可以获得所要研究的特定蛋白质的AAAA序列。序列。先根据推出的先根据推出的AA序列合成对象蛋白序列合成对象蛋白中的一段肽,用它去获中的一段肽,用它去获 得得有关的有关的抗体抗体,然后用抗体去探测蛋白质的存在,甚至可以用抗,然后用抗体去探测蛋白质的存在,甚至可以用抗体通过亲和
5、层析纯化对象蛋白体通过亲和层析纯化对象蛋白第9页,讲稿共125张,创作于星期三10(2 2)去获得有关)去获得有关基因的基因的cDNAcDNA全序列全序列,然后通过,然后通过重组重组DNADNA技术去表达重组蛋白。技术去表达重组蛋白。有偏差,甚至完全是假象。有偏差,甚至完全是假象。即使推测得到的蛋白质编码信息是对的,在细胞即使推测得到的蛋白质编码信息是对的,在细胞内还存在转录后的内还存在转录后的RNA加工,翻译后的蛋白质的加工,翻译后的蛋白质的修饰和加工等基因序列上目前还无法反映的信息。修饰和加工等基因序列上目前还无法反映的信息。第10页,讲稿共125张,创作于星期三11制备过程中注意事项:制
6、备过程中注意事项:要求自始至终保持在要求自始至终保持在天然状态天然状态1.1.避免一切过激因素避免一切过激因素-如过酸或过碱,高温,如过酸或过碱,高温,2.2.重金属等的影响。重金属等的影响。2.2.通常都在低温条件下操作。通常都在低温条件下操作。3.3.尽可能使样品中蛋白质的浓度维持在较高尽可能使样品中蛋白质的浓度维持在较高 水平。水平。第11页,讲稿共125张,创作于星期三12二、细胞的破碎二、细胞的破碎 少数蛋白质少数蛋白质-存在于细胞外面(如血液和体液中)存在于细胞外面(如血液和体液中)大多数蛋白质大多数蛋白质-都存在于细胞的里面。都存在于细胞的里面。一一般般固固形形生生物物材材料料首
7、首先先都都必必须须加加以以破破碎碎,以以释释放放出出细细胞胞内内的蛋白质组分。的蛋白质组分。生物材料生物材料 必须新鲜必须新鲜要求:要求:1.1.材料材料 -80-80 2.2.或者制成干粉(丙酮)或者制成干粉(丙酮)3.3.低温存放低温存放 第12页,讲稿共125张,创作于星期三破碎的方法:破碎的方法:1.机械破碎法机械破碎法:利用机械力的搅切作用,使细胞研碎利用机械力的搅切作用,使细胞研碎高高 速速 搅搅 切切 器器、玻玻 璃璃 匀匀 浆浆 器器、家家 用用 搅搅 肉肉 器器、研研 钵钵、玻璃珠高速匀浆器以及静压器(高压破碎)玻璃珠高速匀浆器以及静压器(高压破碎)。2.2.渗透破碎法渗透破
8、碎法:利用低渗条件,使细胞溶胀破碎。利用低渗条件,使细胞溶胀破碎。红血球放于水中,便发生自溶红血球放于水中,便发生自溶。第13页,讲稿共125张,创作于星期三14*抽提作用抽提作用:生物材料在破碎的过程中,通常被浸在生物材料在破碎的过程中,通常被浸在适当的缓冲液中,使细胞中的蛋白质等内容适当的缓冲液中,使细胞中的蛋白质等内容物释放到这种溶液中去。物释放到这种溶液中去。第14页,讲稿共125张,创作于星期三153.3.交替冻融法交替冻融法:生物组织经冻结后,细胞内液结冰膨胀生物组织经冻结后,细胞内液结冰膨胀而使细胞胀破。而使细胞胀破。4.4.超声波法超声波法:利用超声波震荡,使细胞膜上所受张力不
9、均而解利用超声波震荡,使细胞膜上所受张力不均而解体。体。5.5.酶消化法酶消化法:利用蛋白酶、溶菌酶、蜗牛复合酶等对利用蛋白酶、溶菌酶、蜗牛复合酶等对细胞膜或细胞壁的分解作用,使它们解体细胞膜或细胞壁的分解作用,使它们解体第15页,讲稿共125张,创作于星期三16三、去污剂处理溶解膜蛋白三、去污剂处理溶解膜蛋白 膜蛋白的提取与细胞质蛋白,核蛋白提取不同之处在于它是嵌在膜中的,水溶性不好,基本方法就是用不同的离心速度去掉胞质蛋白等,最后用去污剂把蛋白从膜中释放出来。膜蛋白分离纯化的重要步骤是选择适当的增溶用表面活性剂 第16页,讲稿共125张,创作于星期三膜蛋白的处理:复杂膜蛋白的处理:复杂 细
10、胞膜的结构细胞膜的结构第17页,讲稿共125张,创作于星期三18按其所在按其所在位置位置大体可分为:大体可分为:两种类型外周蛋白两种类型外周蛋白(通过次级键和外膜脂质的通过次级键和外膜脂质的极性头螯合在一起)极性头螯合在一起)固有蛋白固有蛋白外周蛋白外周蛋白-选择适当离子强度及选择适当离子强度及PHPH的含有的含有EDTAEDTA的的 缓冲液抽提(高盐溶液)缓冲液抽提(高盐溶液)固有蛋白固有蛋白-嵌合在膜双层中,它通过嵌合在膜双层中,它通过疏水作用疏水作用与与 膜内部脂质层膜内部脂质层的疏水性尾部相结合,的疏水性尾部相结合,具有具有螺旋结构螺旋结构。第18页,讲稿共125张,创作于星期三去污剂
11、去污剂:一类具有一类具有 亲水性头部亲水性头部 疏性尾巴疏性尾巴 的双亲性(的双亲性(amphipathicamphipathic)脂类分子)脂类分子作用:作用:既可以破坏细胞的既可以破坏细胞的磷脂双层结构磷脂双层结构,又可以与具有疏水,又可以与具有疏水性表面的性表面的膜蛋白结合膜蛋白结合,从而阻止释放出来的膜蛋白通过疏,从而阻止释放出来的膜蛋白通过疏水相互作用形成大的、可沉淀的聚集体。水相互作用形成大的、可沉淀的聚集体。第19页,讲稿共125张,创作于星期三20有的有的去污剂的亲水性头部可离子化去污剂的亲水性头部可离子化(即含有一带电基(即含有一带电基团)团)如如:脱氧胆酸钠(脱氧胆酸钠(s
12、odium deoxycholatesodium deoxycholate)十二烷基硫酸钠十二烷基硫酸钠(sodium dodecylsulfatesodium dodecylsulfate,SDSSDS)有的有的去去污剂不能解离,所以分子中缺少带电基团污剂不能解离,所以分子中缺少带电基团,如:如:Triton X-100Triton X-100,辛基葡萄糖苷辛基葡萄糖苷(octylglucoside(octylglucoside)第20页,讲稿共125张,创作于星期三21临界微团浓度临界微团浓度(criticalmicelleconcentration,CMC):每一种去污剂都具有一特征性的
13、每一种去污剂都具有一特征性的CMC。CMCCMC值与其分子中值与其分子中疏水部分疏水部分与与亲水部分亲水部分的的结构结构有有 关。关。当当 去污剂去污剂 低于此值的时候,去污剂分子在水溶液中低于此值的时候,去污剂分子在水溶液中将不形成微团,达到此值的时候,微团开始形成。将不形成微团,达到此值的时候,微团开始形成。第21页,讲稿共125张,创作于星期三22离子化去污剂(离子化去污剂(SDSSDS):其其“疏水尾巴疏水尾巴”破坏蛋白质分子的疏水性部分的结破坏蛋白质分子的疏水性部分的结构,其带电的构,其带电的“头部头部”破坏蛋白质分子中的氢键和离破坏蛋白质分子中的氢键和离子键。子键。作用的结果是作用
14、的结果是:使任何蛋白(不管是膜蛋白还是水溶性蛋白)都使任何蛋白(不管是膜蛋白还是水溶性蛋白)都发生发生发生发生完全变性完全变性完全变性完全变性,并,并溶解在水溶解在水溶解在水溶解在水溶液中,同时溶液中,同时失去生物活性失去生物活性失去生物活性失去生物活性。在部分情况下,当去污剂被透析掉后,蛋白质可以复性在部分情况下,当去污剂被透析掉后,蛋白质可以复性并恢复生物活性。并恢复生物活性。第22页,讲稿共125张,创作于星期三23SDS-SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-polyacrylamide SDS-polyacrylamide gel electrophoresisge
15、l electrophoresis,SDS-PAGESDS-PAGE):):就是利用就是利用SDSSDS的这种结合在整个蛋白分子上,并使蛋的这种结合在整个蛋白分子上,并使蛋白完全变性的特性。白完全变性的特性。这样经过这样经过SDSSDS变性的蛋白质在电场中完全变性的蛋白质在电场中完全按大小按大小分离分离开。开。第23页,讲稿共125张,创作于星期三24非离子去污剂非离子去污剂:相对温和,一般相对温和,一般不会使蛋白质变性不会使蛋白质变性。只是将蛋白质分子。只是将蛋白质分子从膜上溶解下来而已。从膜上溶解下来而已。当当 去污剂去污剂 其其CMCCMC值的时候,去污剂分子与膜蛋白表值的时候,去污剂分
16、子与膜蛋白表面的疏水区域结合,使蛋白质在水溶液中溶解而不聚面的疏水区域结合,使蛋白质在水溶液中溶解而不聚集。集。当当 去污剂去污剂 其其CMCCMC值的时候,去污剂分子将与膜磷脂值的时候,去污剂分子将与膜磷脂一起形成混合微团,膜蛋白以整合在微团中的形式存一起形成混合微团,膜蛋白以整合在微团中的形式存在。在。一般选择非离子去污剂一般选择非离子去污剂来来保持膜蛋白生物活性保持膜蛋白生物活性第24页,讲稿共125张,创作于星期三 第25页,讲稿共125张,创作于星期三26 第26页,讲稿共125张,创作于星期三27 四、蛋白分子的稳定四、蛋白分子的稳定防止蛋白质分子可能被同时释放的蛋白质水解酶降解、
17、防止蛋白质分子可能被同时释放的蛋白质水解酶降解、Pr空间结构可能被温度或化学试剂等环境因素破坏而丧空间结构可能被温度或化学试剂等环境因素破坏而丧失生物学活性等。失生物学活性等。处理处理:需要在缓冲液中加入蛋白酶抑制剂;:需要在缓冲液中加入蛋白酶抑制剂;在低温下操作;在低温下操作;加入稳定剂加入稳定剂(如甘油等)如甘油等)第27页,讲稿共125张,创作于星期三28五、细胞碎片的去除五、细胞碎片的去除离心离心(centrifugation)(centrifugation)原理:悬浮在溶液中的两个或多个不同质量或密度的原理:悬浮在溶液中的两个或多个不同质量或密度的颗粒(如细胞、细胞器、大分子复合体、
18、或分子等)颗粒(如细胞、细胞器、大分子复合体、或分子等)沉降到试管的底部的速度是不一样的,质沉降到试管的底部的速度是不一样的,质量越大、或密度越高沉降的速度越快。量越大、或密度越高沉降的速度越快。沉淀:固体性的细胞碎片和细胞器沉降到离心管的沉淀:固体性的细胞碎片和细胞器沉降到离心管的底部形成;底部形成;上清:绝大多数蛋白分子或蛋白复合体保留在细胞上清:绝大多数蛋白分子或蛋白复合体保留在细胞抽提液中即上清中抽提液中即上清中 第28页,讲稿共125张,创作于星期三29六、目标蛋白质的分离、纯化六、目标蛋白质的分离、纯化-蛋白质的分级沉淀和层析分离蛋白质的分级沉淀和层析分离将不同蛋白质分开的性质主要
19、包括:将不同蛋白质分开的性质主要包括:分子量的大小分子量的大小 带电情况带电情况 水溶性水溶性 与某种物质的特异高亲和力等与某种物质的特异高亲和力等 第29页,讲稿共125张,创作于星期三30(一)蛋白质的分级沉淀(一)蛋白质的分级沉淀 常用的方法有:常用的方法有:u 盐析法盐析法u 有机溶剂法有机溶剂法第30页,讲稿共125张,创作于星期三31蛋白质的胶体性质:蛋白质颗粒表面多为亲水基团,可吸引水分子,使颗粒表面蛋白质颗粒表面多为亲水基团,可吸引水分子,使颗粒表面成有一层水膜成有一层水膜,蛋白质颗粒相互隔开,不会聚集成大颗粒而,蛋白质颗粒相互隔开,不会聚集成大颗粒而沉淀。沉淀。此外,蛋白质表
20、面可带有电荷,可起胶粒稳定的此外,蛋白质表面可带有电荷,可起胶粒稳定的作用。作用。若去除蛋白质胶体表面电荷和水化膜两个稳定因若去除蛋白质胶体表面电荷和水化膜两个稳定因素素 ,蛋白质极易从溶液中析出,蛋白质极易从溶液中析出 盐析法盐析法第31页,讲稿共125张,创作于星期三32#第32页,讲稿共125张,创作于星期三33盐析法盐析法概念概念:将:将中性盐加入蛋白质溶液,破坏水化膜和电荷中性盐加入蛋白质溶液,破坏水化膜和电荷而使蛋白质沉淀,叫盐析。各种蛋白质盐析所需的盐浓而使蛋白质沉淀,叫盐析。各种蛋白质盐析所需的盐浓度及度及PH不同,加入不同浓度的中性盐可不同,加入不同浓度的中性盐可使各种蛋白质
21、依次使各种蛋白质依次分别沉淀出来。分别沉淀出来。优点:操作简便优点:操作简便 对易变性的蛋白质有一定的保护作用,对易变性的蛋白质有一定的保护作用,适用范围十分广泛。适用范围十分广泛。缺点:分辨能力差,纯化倍数低缺点:分辨能力差,纯化倍数低第33页,讲稿共125张,创作于星期三34 1.1.基本原理基本原理在蛋白质水溶液中添加无机盐,可以产生两种在蛋白质水溶液中添加无机盐,可以产生两种影响:影响:(1)(1)盐离子盐离子与与PrPr分子分子中的中的 极性基团极性基团 离子基团离子基团 作用作用 降低降低PrPr分子的活度系数,趋使其溶解度分子的活度系数,趋使其溶解度 。(2)(2)盐离子盐离子也
22、与也与水水这种偶极分子作用,使水分子的活这种偶极分子作用,使水分子的活 度降低,导致度降低,导致PrPr水合程度的减少,从而趋使水合程度的减少,从而趋使PrPr溶溶 解度解度 。第34页,讲稿共125张,创作于星期三35 *盐溶(盐溶(salting in)salting in)-当溶液中的盐离子强度比较低的时候,当溶液中的盐离子强度比较低的时候,蛋白质的溶解度会随着盐浓度的增加而增加,这种现象叫做蛋白质的溶解度会随着盐浓度的增加而增加,这种现象叫做.*盐析(盐析(salting out)-salting out)-但当溶液中的盐离子强度比较但当溶液中的盐离子强度比较高的时候,蛋白质的溶解度会
23、随着盐浓度的增加而降低,高的时候,蛋白质的溶解度会随着盐浓度的增加而降低,这种现象叫做这种现象叫做.一定的盐浓度下,每一种蛋白都有一不同的特异溶解度。一定的盐浓度下,每一种蛋白都有一不同的特异溶解度。第35页,讲稿共125张,创作于星期三362影响盐析作用的因素影响盐析作用的因素(1 1)盐的种类)盐的种类(2 2)PHPH和温度和温度#(3 3)蛋白质浓度)蛋白质浓度%第36页,讲稿共125张,创作于星期三37(1 1)盐的种类)盐的种类对同一种对同一种PrPr而言,而言,价数愈高价数愈高的盐离子,盐析能力的盐离子,盐析能力也愈强也愈强:PO3-4SO42-C2O42-(CHOHCOO-)2
24、ACCLNO3-Br-I-CNS-K+Rb+Na+Cs+Li+NH4+负离子价数较高的中性盐负离子价数较高的中性盐(如硫酸盐、磷酸盐等)的(如硫酸盐、磷酸盐等)的KsKs值常较一价中性盐的值常较一价中性盐的KsKs值高。值高。Ks:盐析常数(价数较高时,盐析常数(价数较高时,Ks 值也较大)。代表盐析的效率,值也较大)。代表盐析的效率,是与是与Pr及盐种类有关的特性常数。及盐种类有关的特性常数。第37页,讲稿共125张,创作于星期三38硫酸铵硫酸铵(常用盐析剂)(常用盐析剂)优点:盐析能力较强优点:盐析能力较强 具有较高的溶解度具有较高的溶解度 较低的溶解度温度系数较低的溶解度温度系数 价格低
25、廉价格低廉 不产生副作用。不产生副作用。缺点:缓冲能力较差缺点:缓冲能力较差 PHPH难控制难控制第38页,讲稿共125张,创作于星期三39(2 2)PHPH和温度和温度S S。代表蛋白质在无机盐溶液中的溶解度。代表蛋白质在无机盐溶液中的溶解度 除取决于除取决于PrPr的种类,还受的种类,还受PHPH及温度影响及温度影响:PH=PI PH=PI时,时,S S。的数值极小。的数值极小 S S。随温度增加而减低。随温度增加而减低。盐析过程中,若增高温度,有助于盐析过程中,若增高温度,有助于PrPr的析出。的析出。#第39页,讲稿共125张,创作于星期三40(3 3)蛋白质浓度)蛋白质浓度 PrPr
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