蛋白质相互作用技术研究几种技术PPT课件.ppt
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1、关于蛋白质相互作用技术研究的几种技术第一张,PPT共十九页,创作于2022年6月酵母双杂交谷胱苷肽-S-转移酶沉淀试验(GST-pull down)免疫共沉淀双分子荧光互补技术(BIFC)生物发光共振能量转移()技术常用蛋白质相互作用的研究技术常用蛋白质相互作用的研究技术第二张,PPT共十九页,创作于2022年6月一、细菌双杂交系统一、细菌双杂交系统 Two-hybrid system 是90年代初发展起来的新方法,可用于分离能与已知靶蛋白质(target protein)相互作用的基因。基本原理:真核生物的转录因子大多是由两个结构上分开、功能上独立的结构域组成的,如GAL4(酵母转录激活蛋白
2、Gal4的基因)。这两个结构域各具功能,互不影响。但一个完整的激活特定基因表达的激活因子必须同时含有这两个结构域,否则无法完成激活功能。第三张,PPT共十九页,创作于2022年6月 酵母激活因子 GAL4:N端:147个氨基酸组成的DNA结合域(BD),C端:113个氨基酸组成的转录激活域(AD)。GAL4分子的DNA结合域可以和上游激活序列(upstream activating sequence,UAS)结合,而转录激活域则能激活UAS下游的基因进行转录。组成部分:(1)与BD融合的蛋白表达载体,被表达的蛋白称诱饵蛋白(bait);(2)与AD融合的蛋白表达载体,被其表达的蛋白称靶蛋白(p
3、rey);(3)带由一个或多个报告基因的宿主菌株。第四张,PPT共十九页,创作于2022年6月第五张,PPT共十九页,创作于2022年6月BDACOOHADBNH2 COOH共转化+BDAADGal4Gal4PromoterReporterNH2Gal4Gal4B第六张,PPT共十九页,创作于2022年6月酵母双杂交基本过程举 例第七张,PPT共十九页,创作于2022年6月二、谷胱苷肽-S-转移酶沉淀试验(GST-pull down)原理 GST-融合蛋白GSTXY谷胱甘肽-琼脂糖球珠细胞裂解物细胞裂解物 tube4下孵育下孵育2h2h GSTXY+第八张,PPT共十九页,创作于2022年6月
4、GST pull down实验流程(1)Glutathione 琼脂糖珠预处理。(2)GST融合蛋白挂柱:取适量GST-融合蛋白与10l已经处理过的beads置于1.5ml离心管中,4,摇床孵育过夜。(3)孵育过夜的蛋白质与beads的混合液于4,500g离心5min,上清收集,观察融合蛋白是否饱和地挂在beads上,用1ml冰冷的细胞裂解缓冲液洗三次beads。(4)将菌体用溶菌酶处理,之后破碎细菌壁,最大转速4离心20min,收集上清液。(5)将细胞裂解液上清加入beads中,混匀,4,摇床3h。(6)3h后,用冰冷的细胞裂解缓冲液洗三次。(7)加15l 2SDS上样缓冲液,煮沸5min.
5、(8)SDS-PAGE,Western Blot或质谱仪分析。第九张,PPT共十九页,创作于2022年6月免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质蛋白质间的相互作用被保留了下来。当用预先固化在argarose beads上的蛋白质A的抗体免疫沉淀A蛋白,那么与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来。再通过蛋白变性分离,对B蛋白进行检测,进而证明两者间的相互作用。三、免疫共沉淀原理三、免疫共沉淀
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