转录以及转录后加工PPT课件.ppt
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1、关于转录及转录后加工第一张,PPT共九十四页,创作于2022年6月转录转录 (transcription)生物体以生物体以DNA为模板合成为模板合成RNA的过程的过程。转录转录RNADNA 第一节第一节 转录的基本原理转录的基本原理一、基本概念一、基本概念 第二张,PPT共九十四页,创作于2022年6月u 参与转录的物质参与转录的物质原料原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板模板:DNA酶酶:RNA聚合酶聚合酶(RNA polymerase,RNA-pol)其他蛋白质因子其他蛋白质因子第三张,PPT共九十四页,创作于2022年6月u 转录与复制的相似之处:转录与复制的相似之处:都是
2、酶促的核苷酸聚合过程;都是酶促的核苷酸聚合过程;都以都以DNA为模板;为模板;都需依赖都需依赖DNA的聚合酶;的聚合酶;聚合过程都是核苷酸之间生成磷酸二酯键;聚合过程都是核苷酸之间生成磷酸二酯键;都从都从5至至3 方向延伸成新链多聚核苷酸;方向延伸成新链多聚核苷酸;都遵从碱基配对规律都遵从碱基配对规律 但转录忠实性要低于但转录忠实性要低于DNA复制复制。转录与复制都受到严格的调控转录与复制都受到严格的调控 二、转录与复制的异同二、转录与复制的异同 第四张,PPT共九十四页,创作于2022年6月u 转录和转录和复制的区别复制的区别 引物引物 有有 无无高度进行性高度进行性 中途不停止中途不停止
3、可一段一段复制可一段一段复制第五张,PPT共九十四页,创作于2022年6月一、原核生物的一、原核生物的RNA聚合酶聚合酶 大肠杆菌大肠杆菌(E.coli)的的RNA聚合酶是由聚合酶是由5种亚基种亚基、和和(sigma)组成,分子量为组成,分子量为480kD。2 称为称为核心酶核心酶(core enzyme);在试管内能催化在试管内能催化NTP聚合生成聚合生成RNA。亚基加上核心酶称为亚基加上核心酶称为全酶(全酶(holoenzyme)。第二节第二节 DNADNA指导下的指导下的RNARNA聚合酶聚合酶 第六张,PPT共九十四页,创作于2022年6月大肠杆菌大肠杆菌RNA聚合酶组分聚合酶组分RN
4、ARNA聚合酶聚合酶第七张,PPT共九十四页,创作于2022年6月核心酶核心酶(core enzyme)全酶全酶(holoenzyme)RNARNA聚合酶聚合酶第八张,PPT共九十四页,创作于2022年6月RNA聚合酶全酶在转录起始区的结合聚合酶全酶在转录起始区的结合 RNARNA聚合酶聚合酶第九张,PPT共九十四页,创作于2022年6月 真核生物的真核生物的RNA聚合酶聚合酶种类种类 定定 位位 核核 仁仁 核核 质质 核核 质质转录产物转录产物 45s-rRNA hnRNA 5s-rRNA,tRNA,U1-13snRNA U6snRNA,(U6除外)除外)非非UsnRNA 对鹅膏蕈碱反应对
5、鹅膏蕈碱反应 耐受耐受 极敏感极敏感 中度敏感中度敏感二、真核生物的二、真核生物的RNA聚合酶聚合酶 RNARNA聚合酶聚合酶第十张,PPT共九十四页,创作于2022年6月u 转录模板转录模板 DNA分分 子子 上上 转转 录录 出出 RNA的的区区段段,称称为为结结构构基基因因(structural gene)。DNA双双链链按按碱碱基基配配对对规规律律能能指指引引转转录录生生成成RNA的的一一股股单单链链,称称为为模模板板链链(template strand),也也称称作作反反意意义链义链或或Watson链链。相相对对的的另另一一股股单单链链是是编编码码链链(coding strand),
6、也也称称为为有有意义链意义链或或Crick链链。第十一张,PPT共九十四页,创作于2022年6月5G C A G T A C A T G T C33 c g t c a t g t a c a g55G C A G U A C A U G U C3N Ala Val His Val C DNA转录转录mRNA翻译翻译肽肽DNA模板、转录产物模板、转录产物mRNA 和氨基酸序列之间的关系和氨基酸序列之间的关系编码链编码链模板链模板链第十二张,PPT共九十四页,创作于2022年6月5 5 3 3 3 3 5 5 模板链编码链编码链模板链结构基因结构基因转录方向转录方向转录方向转录方向第十三张,PP
7、T共九十四页,创作于2022年6月不对称转录不对称转录(asymmetric transcription)在在DNA分子双链上某一区段,一股链用作分子双链上某一区段,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录模板指引转录,另一股链不转录;模板链并非永远在同一条单链上。模板链并非永远在同一条单链上。第十四张,PPT共九十四页,创作于2022年6月 第三节第三节 与转录起始和终止有关的与转录起始和终止有关的DNA结构结构一、原核生物的启动子和终止子一、原核生物的启动子和终止子(一)启动子结构(一)启动子结构 原原核核生生物物一一个个转转录录区区段段可可视视为为一一个个转转录录单单位位,称称为为操操纵纵
8、子子(operon),包包括括若若干干个个结结构构基基因因及其上游及其上游(upstream)的的调控序列调控序列。第十五张,PPT共九十四页,创作于2022年6月5 3 3 5 结构基因结构基因调控序列调控序列RNA-polRNA聚合酶结合模板聚合酶结合模板DNA的部位,称为的部位,称为启动子启动子(promoter)。第十六张,PPT共九十四页,创作于2022年6月RNA聚合酶聚合酶保护法保护法第十七张,PPT共九十四页,创作于2022年6月开始转录开始转录T T G A C AA A C T G T-35 区区(Pribnow box)T A T A A T Pu A T A T T A
9、 Py-10 区区1-30-5010-10-40-205 3 3 5 原核生物启动子保守序列原核生物启动子保守序列RNA-pol辨认位点辨认位点(recognition site)5 5 RNA聚合酶保护区聚合酶保护区结构基因结构基因3 3 第十八张,PPT共九十四页,创作于2022年6月 -35区区 -10区区 +1trp T T G A C AN17T T A A C T N7 AtRNAtrp T T T A C AN16 T A T G A T N7 ALac T T T A C AN17T A T G T T N6 ArecA T T G A T AN16T A T A A T N7
10、 Aara C T G A C GN18T A C T G T N6 A最大一致性最大一致性 T T G A C A T A T A A T 38 36 29 40 25 30 37 37 28 41 29 44X/45被被RNA聚合酶保护的聚合酶保护的DNA区段碱基序列分析区段碱基序列分析第十九张,PPT共九十四页,创作于2022年6月1、Pribnow 框:框:10区,保守序列为区,保守序列为 TATAAT。Pribnow 框框是是RNA聚合酶的牢固结合位点,聚合酶的牢固结合位点,简称结合位点。简称结合位点。u 细菌中常见两种启动子突变:细菌中常见两种启动子突变:启动子上升突变,提高转录活
11、性;启动子上升突变,提高转录活性;启动子下降突变,降低转录水平。启动子下降突变,降低转录水平。的存在保证原核生物的存在保证原核生物RNA聚合酶只能与启聚合酶只能与启 动子区而不是其它区域形成稳定的二元复合物。动子区而不是其它区域形成稳定的二元复合物。第二十张,PPT共九十四页,创作于2022年6月2、Sextama 框:框:35区,保守序列为区,保守序列为TTGACA。Sextama 框框是是RNA聚合酶中聚合酶中 的识别位点,的识别位点,也是也是RNA聚合酶的初始结合位点。聚合酶的初始结合位点。l Pribnow 框与框与Sextama 框之间的碱基序列框之间的碱基序列 并不重要,但并不重要
12、,但两个序列之间的距离十分重要;两个序列之间的距离十分重要;l 天然启动子这段距离多为天然启动子这段距离多为1520bp,距离的,距离的 大小可能是决定启动子强度的因素之一。大小可能是决定启动子强度的因素之一。l 实验表明:两个序列之间的距离为实验表明:两个序列之间的距离为17bp时,时,转录效率最高。转录效率最高。第二十一张,PPT共九十四页,创作于2022年6月3、CAP位点位点:(乳糖:(乳糖操纵子的启动子序列)操纵子的启动子序列)v CAP即即分解代谢物基因激活蛋白分解代谢物基因激活蛋白 (catabolite gene activation Protein)也称环腺苷酸受体蛋白(也称
13、环腺苷酸受体蛋白(CRP)。)。u CAP分子内有两个结构域:分子内有两个结构域:羧基末端结构域是羧基末端结构域是DNA结合区;结合区;氨基末端结构域是氨基末端结构域是cAMP结合位点。结合位点。u CAP与与cAMP的结合能提高的结合能提高CAP对双链对双链DNA 的亲和力;的亲和力;u CAP与启动子(与启动子(CAP位点)的结合是激活乳位点)的结合是激活乳 糖操纵子转录的必要条件。糖操纵子转录的必要条件。第二十二张,PPT共九十四页,创作于2022年6月l 乳糖启动子中有两个乳糖启动子中有两个CAP结合位点:结合位点:一个在一个在 70 50位点,称位点位点,称位点;一个在一个在 50
14、40位点,称位点位点,称位点。l 位点位点包含一个反向重复序列,是强结合位点;包含一个反向重复序列,是强结合位点;位点位点是弱结合位点。是弱结合位点。AATGTGAGTT AGCTCACTCATTACACTCAA TCGAGTGAGT位点位点的反向重复序列的反向重复序列第二十三张,PPT共九十四页,创作于2022年6月(二)终止子结构(二)终止子结构 提供转录终止信号的序列称为终止子提供转录终止信号的序列称为终止子(terminator)。)。终止信号存在于终止信号存在于RNA聚合酶已经转录过的序列之中。聚合酶已经转录过的序列之中。u 原核生物终止子分为两类:原核生物终止子分为两类:一类是不依
15、赖于一类是不依赖于因子的转录终止;因子的转录终止;一类是一类是依赖依赖因子的转录终止;因子的转录终止;u 两类终止子有共同的序列特征:两类终止子有共同的序列特征:在转录终止点之前有一段间断的回文结构。在转录终止点之前有一段间断的回文结构。u 两类终止子碱基组成的不同点:两类终止子碱基组成的不同点:不依赖不依赖因子因子 回文结构富含回文结构富含G-C 下游富含下游富含A-T 依赖依赖因子因子 G-C含量较少含量较少 下游无特征下游无特征第二十四张,PPT共九十四页,创作于2022年6月转录方向转录方向335TCGGGCGAGCCCGCCGCCCGAGCGGGCTAAAAAATTT TTT3355
16、DNA模板链模板链编码链编码链AAAAAAUUUUUU5CGCCCGAGCGGGCU5TTTTTTDNA模板链模板链编码链编码链转录产物转录产物3u 不依赖不依赖因子因子 的终止子的终止子 第二十五张,PPT共九十四页,创作于2022年6月转录方向转录方向335TAAGTAGATTCATCCTACTTAGATGAATAGCTACTCGATG3355DNA模板链模板链编码链编码链AGCTACUCGAUG5CUACUUAGAUGAAU5TCGATGDNA模板链模板链编码链编码链转录产物转录产物3u 依赖依赖因子因子 的终止子的终止子 第二十六张,PPT共九十四页,创作于2022年6月二、真核生物的
17、启动子二、真核生物的启动子 u 类启动子分两部分:类启动子分两部分:40 5 称为近启动子,决定转录起始的位点;称为近启动子,决定转录起始的位点;16540 称为远启动子,影响转录的频率。称为远启动子,影响转录的频率。真核生物的三种真核生物的三种RNA聚合酶,每一种都有自己聚合酶,每一种都有自己的启动子类型。的启动子类型。(一)(一)RNA聚合酶聚合酶的启动子的启动子 即即 rRNA 基因的启动子,称基因的启动子,称类启动子。类启动子。第二十七张,PPT共九十四页,创作于2022年6月(二)(二)RNA聚合酶聚合酶的启动子的启动子 1、帽子位点(、帽子位点(cap site):):即转录起始位
18、点,其碱基大多为即转录起始位点,其碱基大多为 A。2、TATA 框:框:又称又称Hogness 框,由含有框,由含有TATA 的的67个核苷酸组成,个核苷酸组成,保守序列为保守序列为 TATA(A/T)A(A/T)。但但TATA框的两侧富含框的两侧富含G-C碱基对。碱基对。l TATA 框位于框位于25 附近,精确决定转录起始位点。附近,精确决定转录起始位点。其序列的完整与准确对维持启动子的功能是必需的。其序列的完整与准确对维持启动子的功能是必需的。即即 mRNA基因的启动子,称基因的启动子,称类启动子类启动子 第二十八张,PPT共九十四页,创作于2022年6月3、CAAT 框:框:位于位于
19、75 附近,保守序列为附近,保守序列为 GGNCAATCT。头两个头两个 G 非常重要,一但突变,转录效率大大非常重要,一但突变,转录效率大大下降。下降。l CAAT 框控制着转录起始的频率。框控制着转录起始的频率。4、GC 框:框:位于位于110附近,以附近,以5 CCGCC 3序列为特征。序列为特征。第二十九张,PPT共九十四页,创作于2022年6月5、增强子(、增强子(enhancer):):l 能结合反式作用因子,决定基因的时间和空间能结合反式作用因子,决定基因的时间和空间特异性表达,增强启动子转录活性的特异性表达,增强启动子转录活性的DNA序列。序列。l 增强子作用特点增强子作用特点
20、:增强效应十分明显:使转录频率增加百倍或千倍。增强效应十分明显:使转录频率增加百倍或千倍。增强效应增强效应与其所处的位置和取向无关:与其所处的位置和取向无关:增强子以增强子以5353或或 3535排列对启动子都有作用。排列对启动子都有作用。大多为重复序列:长约大多为重复序列:长约50bp50bp,适合与反式因子结合,内,适合与反式因子结合,内部常有一个核心序列,为增强效应所必需。部常有一个核心序列,为增强效应所必需。增强效应具有严密的组织和细胞特异性。增强效应具有严密的组织和细胞特异性。没有基因专一性。没有基因专一性。许多增强子受外部信号的调控。许多增强子受外部信号的调控。第三十张,PPT共九
21、十四页,创作于2022年6月GCGC-CAAT-TATA-ATGAATAAA切离加尾切离加尾真正终止点真正终止点修饰点修饰点外显子外显子内含子内含子翻译起始翻译起始转录起始转录起始TATA盒盒CAAT盒盒GC盒盒增强子增强子真核生物真核生物RNApol的启动子的启动子 第三十一张,PPT共九十四页,创作于2022年6月(三)(三)RNA聚合酶聚合酶 的启动子的启动子 即即 tRNA基因的启动子,称基因的启动子,称类启动子。类启动子。l 类启动子位于转录起始点下游,称类启动子位于转录起始点下游,称 下游启动子或内部启动子。下游启动子或内部启动子。l 类启动子包括:类启动子包括:A盒、盒、B盒盒
22、A盒靠近盒靠近5方向;方向;B盒盒 靠近靠近3 方向方向。l 类启动子需要的转录因子包括:类启动子需要的转录因子包括:TF C、TF B、TF A,前两者是共同,前两者是共同的,后者为的,后者为5S rRNA基因转录所需。基因转录所需。第三十二张,PPT共九十四页,创作于2022年6月第三十三张,PPT共九十四页,创作于2022年6月三、原核生物和真核生物三、原核生物和真核生物 转录起始位点的结构差异转录起始位点的结构差异 原核生物原核生物 真核生物真核生物帽子结构帽子结构 没有没有 有有 起始核苷酸起始核苷酸 嘌呤或嘧啶嘌呤或嘧啶 嘌呤(嘌呤(A为主)为主)启动区范围启动区范围 较小较小(1
23、70)较大较大(1110)上游序列上游序列 TTGACA CAAT、GC、增强子、增强子第三十四张,PPT共九十四页,创作于2022年6月图图5-4 P155页页原核生物与真核生物启动子比较原核生物与真核生物启动子比较第三十五张,PPT共九十四页,创作于2022年6月原核生物和真核生物转录及抑制剂原核生物和真核生物转录及抑制剂 第第 四四 节节 l 原核生物转录的起始原核生物转录的起始l 原核生物转录的延长原核生物转录的延长l 原核生物转录的终止与新合成原核生物转录的终止与新合成RNA链的释放链的释放 l 真核生物的转录真核生物的转录l RNA生物合成抑制剂生物合成抑制剂 第三十六张,PPT共
24、九十四页,创作于2022年6月转录起始需解决两个问题:转录起始需解决两个问题:1.RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。的起始区域。2.DNA双链解开,使其中的一条链作为转录双链解开,使其中的一条链作为转录的模板。的模板。一、原核生物转录的起始一、原核生物转录的起始第三十七张,PPT共九十四页,创作于2022年6月4.4.1010区区DNADNA双链解开双链解开121217bp,形成开放的二,形成开放的二 元元启动子复合物(模板酶)。启动子复合物(模板酶)。2.RNA2.RNA聚合酶全酶聚合酶全酶(2 2)与模板与模板3535序列结合,序列结合,形成闭合
25、的二元闭合启动子复合物。形成闭合的二元闭合启动子复合物。u 转录起始过程转录起始过程1.因子辨认转录起始点(因子辨认转录起始点(-35区的区的TTGACA序列)序列)3.RNA聚合酶向聚合酶向10区转移,并与之牢固结合。区转移,并与之牢固结合。第三十八张,PPT共九十四页,创作于2022年6月RNApol(2)-DNA-pppGpN-OH 3 转录起始复合物转录起始复合物:5-pppG-OH +NTP 5-pppGpN-OH 3 +ppi5.5.在在RNARNA聚合酶聚合酶亚基催化下形成第一个磷酸二酯亚基催化下形成第一个磷酸二酯键,形成三元复合物(模板酶键,形成三元复合物(模板酶RNARNA)
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