酶作用机制和酶调节PPT课件.ppt
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1、关于酶的作用机制和酶的调节第一张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月一一.酶的活性部位酶的活性部位(active site)存在于酶分子表面的具有结合和催化底物形成产物的空间区域存在于酶分子表面的具有结合和催化底物形成产物的空间区域活性中心活性中心=结合基团结合基团+催化基团催化基团必必须须基基团团=结结合合基基团团+催催化化基基团团+活活性性中中心心外外必必须须基基团团(维维持活性中心存在的基团)持活性中心存在的基团)酶分子中促使底物发生化学变化的部位称为催化部位。酶分子中促使底物发生化学变化的部位称为催化部位。通通常常将将酶酶的的结结合合部部位位和和催催化化部部位位总总称称为为酶酶的
2、的活活性性部部位位或或活活性中心性中心(active center)。结合部位决定酶的专一性结合部位决定酶的专一性催化部位决定酶所催化反应的性质催化部位决定酶所催化反应的性质第二张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月酶的活性部位酶的活性部位 与催化作用相关的结构特点活性中心:活性中心:酶分子中直接和底物结合并起催化反酶分子中直接和底物结合并起催化反应的空间局限(部位)。应的空间局限(部位)。结合部位结合部位结合部位结合部位(Binding site)Binding site):酶分子中与底物结合的部位酶分子中与底物结合的部位酶分子中与底物结合的部位酶分子中与底物结合的部位 或区域一般称为
3、结合部位。或区域一般称为结合部位。或区域一般称为结合部位。或区域一般称为结合部位。第三张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月(一)酶的活性部位的特点(一)酶的活性部位的特点(1 1)活活性性部部位位在在酶酶分分子子的的总总体体中中只只占占相相当当小小的的部部分分,通通常常只只占整个酶分子体积的占整个酶分子体积的1%-2%。(2 2)酶酶的的活活性性部部位位是是一一个个三三维维实实体体。酶酶的的活活性性取取决决于于活活性性中中心心的构象。的构象。(3 3)酶酶的的活活性性部部位位并并不不是是和和底底物物的的形形状状正正好好互互补补,而而是是在在酶酶和和底底物物结结合合的的过过程程中中,底底
4、物物分分子子或或酶酶分分子子,有有时时是是两两者者的的构构象象同同时时发发生生了了一一定定的的变变化化后后才才互互补补的的,这这是是催催化化基基团团的的位置也正好在所催化底物键断裂和即将生成键的适当位置。位置也正好在所催化底物键断裂和即将生成键的适当位置。(4 4)酶的活性部位是位于酶分子表面的一个裂缝内。)酶的活性部位是位于酶分子表面的一个裂缝内。(5 5)底物通过次级键较弱的力结合到酶上。)底物通过次级键较弱的力结合到酶上。(6 6)酶活性部位具有柔性或可运动性。)酶活性部位具有柔性或可运动性。第四张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月底底底底 物物物物 活性中心以外的活性中心以外的
5、活性中心以外的活性中心以外的必需基团必需基团必需基团必需基团结合基团结合基团结合基团结合基团催化基团催化基团催化基团催化基团 活性中心活性中心活性中心活性中心 第五张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第六张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月催化部位催化部位(Catalytic site):):酶分子中促使底酶分子中促使底物发生化学变化的部位称物发生化学变化的部位称为催化部位。为催化部位。l通常将酶的结合部位和通常将酶的结合部位和催化部位总称为酶的活催化部位总称为酶的活性部位或活性中心。性部位或活性中心。l结合部位决定酶的专一结合部位决定酶的专一性,性,l催化部位决定酶所催化催化
6、部位决定酶所催化反应的性质。反应的性质。胰凝乳蛋白酶第七张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月牛的胰蛋白酶第八张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第九张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月(二)研究酶活性部位的方法(二)研究酶活性部位的方法第十张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第十一张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月二酶催化反应的独特性质二酶催化反应的独特性质(1 1)酶酶反反应应可可分分成成两两类类,一一类类反反应应仅仅仅仅涉涉及及到到电电子子的的转移,这类反应的速率或转换数在转移,这类反应的速率或转换数在108s-1数数量量级级;另另一一类类反反应应
7、涉涉及及到到电电子子和和质质子子两两者者或或其其他他基基团的转移,它们的速率在团的转移,它们的速率在103 s-1。(2)酶酶的的催催化化作作用用是是由由氨氨基基酸酸侧侧链链上上的的功功能能基基团团和辅酶为媒介。和辅酶为媒介。(3)酶催化反应的最适)酶催化反应的最适pH范围通常是狭小的。范围通常是狭小的。(4)与与底底物物相相比比,酶酶分分子子很很大大,而而活活性性部部位位通通常常只比底物稍大一些。只比底物稍大一些。(5)酶酶除除了了具具有有进进行行催催化化反反应应所所必必需需的的活活性性基基团团外外,还有别的特性。还有别的特性。第十二张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月三三.影响酶催
8、化效率的有关因素影响酶催化效率的有关因素多元催化多元催化多元催化多元催化(multielement catalysis)multielement catalysis)酶促反应通酶促反应通酶促反应通酶促反应通常是几个基元反应协同作用的结果,包括酸碱催化、常是几个基元反应协同作用的结果,包括酸碱催化、常是几个基元反应协同作用的结果,包括酸碱催化、常是几个基元反应协同作用的结果,包括酸碱催化、共价催化、金属离子催化等。共价催化、金属离子催化等。共价催化、金属离子催化等。共价催化、金属离子催化等。表面效应表面效应表面效应表面效应(surface surface effect)effect)酶的活性中心
9、形成疏水性口袋,防止水酶的活性中心形成疏水性口袋,防止水分子干扰酶与底物的结合。分子干扰酶与底物的结合。第十三张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月(1)临近定向效应临近定向效应l在酶促反应中,底物分子结合到酶的活性中心,一方面底物在在酶促反应中,底物分子结合到酶的活性中心,一方面底物在酶活性中心的有效浓度大大增加,另一方面,由于活性中心的酶活性中心的有效浓度大大增加,另一方面,由于活性中心的立体结构和相关基团的诱导和定向作用,使底物分子中参与反立体结构和相关基团的诱导和定向作用,使底物分子中参与反应的基团相互接近,并被严格定向定位,使酶促反应具有高效应的基团相互接近,并被严格定向定位,
10、使酶促反应具有高效率和专一性特点。率和专一性特点。l l邻近效应邻近效应邻近效应邻近效应(proximity effect)proximity effect)与定向排列与定向排列与定向排列与定向排列(orientation arrange orientation arrange)邻近指底物汇聚于酶的活性中心,使酶活性中心的邻近指底物汇聚于酶的活性中心,使酶活性中心的邻近指底物汇聚于酶的活性中心,使酶活性中心的邻近指底物汇聚于酶的活性中心,使酶活性中心的底物浓度高于其它处,定向则指底物的敏感化学键与酶的底物浓度高于其它处,定向则指底物的敏感化学键与酶的底物浓度高于其它处,定向则指底物的敏感化学键
11、与酶的底物浓度高于其它处,定向则指底物的敏感化学键与酶的催化基团正好对准,使反应加速进行。催化基团正好对准,使反应加速进行。催化基团正好对准,使反应加速进行。催化基团正好对准,使反应加速进行。l有利于提高反应速度;有利于提高反应速度;第十四张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月定向效应包括定向效应包括 1)1)反反应应物物的的反反应应基基团团之之间间(双双底底物物反反应应基基团邻近)团邻近)2)2)酶的催化基团和底物反应基团之间酶的催化基团和底物反应基团之间活性中心内定向使反应变成分子内反应活性中心内定向使反应变成分子内反应第十五张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月定向效应定向效
12、应第十六张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月(2)(2)“张力张力”和和“形变形变”l底物与酶结合诱导酶的分子构象变化,底物与酶结合诱导酶的分子构象变化,变化的酶分子又使底物分子的敏感键产变化的酶分子又使底物分子的敏感键产生生“张力张力”甚至甚至“形变形变”,从而促使酶,从而促使酶底物中间产物进入过渡态。底物中间产物进入过渡态。第十七张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月诱导契合诱导契合第十八张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月(3)(3)酸碱催化酸碱催化l酸酸-碱催化可分为狭义的酸碱催化可分为狭义的酸-碱催化和广义的酸碱催化和广义的酸-碱催化。酶参碱催化。酶参与的酸与的
13、酸-碱催化反应一般都是广义的酸碱催化方式。碱催化反应一般都是广义的酸碱催化方式。l广义酸碱催化是指通过质子酸提供部分质子广义酸碱催化是指通过质子酸提供部分质子,或是通过质子碱或是通过质子碱接受部分质子的作用,达到降低反应活化能的过程。接受部分质子的作用,达到降低反应活化能的过程。l酶活性部位上的某些基团可以作为良好的质子供体或受酶活性部位上的某些基团可以作为良好的质子供体或受体对底物进行酸碱催化。体对底物进行酸碱催化。pHis 残基的咪唑基是酶的酸碱催化作用中最活泼的一个催残基的咪唑基是酶的酸碱催化作用中最活泼的一个催化功能团。化功能团。第十九张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月酸碱催
14、化酸碱催化第二十张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月 广义酸基团广义酸基团广义酸基团广义酸基团 广义碱基团广义碱基团广义碱基团广义碱基团 (质子供体)(质子供体)(质子供体)(质子供体)(质子受体(质子受体(质子受体(质子受体)第二十一张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第二十二张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第二十三张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第二十四张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月(4)(4)共价催化共价催化l催化剂通过与底物形成反应活性很高的共价过渡催化剂通过与底物形成反应活性很高的共价过渡产物,使反应活化能降低,从而提高反应速度的
15、产物,使反应活化能降低,从而提高反应速度的过程,称为共价催化。过程,称为共价催化。l酶中参与共价催化的基团主要包括酶中参与共价催化的基团主要包括 His 的咪唑的咪唑基,基,Cys 的巯基,的巯基,Asp 的羧基,的羧基,Ser 的羟基等。的羟基等。l某些辅酶,如焦磷酸硫胺素和磷酸吡哆醛等也可以某些辅酶,如焦磷酸硫胺素和磷酸吡哆醛等也可以参与共价催化作用。参与共价催化作用。第二十五张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月共价催化共价催化第二十六张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月(5)离子催化)离子催化第二十七张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月酶的催化实例酶的催化实例溶菌
16、酶溶菌酶第二十八张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月溶菌酶的活性中心溶菌酶的活性中心*谷谷谷谷氨氨氨氨酸酸酸酸3535和和和和天天天天冬冬冬冬氨氨氨氨酸酸酸酸5252是是是是催催催催化化化化基基基基团团团团;*色色色色氨氨氨氨酸酸酸酸6262和和和和6363、天天天天冬冬冬冬氨氨氨氨酸酸酸酸101101和和和和色色色色氨氨氨氨酸酸酸酸108108是是是是结结结结合合合合基基基基团团团团;*A AFF为为为为底底底底物物物物多多多多糖糖糖糖链链链链的的的的糖糖糖糖基基基基,位位位位于于于于酶酶酶酶的的的的活活活活性性性性中中中中心心心心形形形形成的裂隙中。成的裂隙中。成的裂隙中。成的裂隙
17、中。第二十九张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月溶菌酶溶菌酶第三十张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第三十一张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月溶溶菌菌酶酶第三十二张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月溶菌酶溶菌酶溶菌酶第三十三张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月溶菌酶溶菌酶溶菌酶第三十四张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月葡萄糖残基结合于酶葡萄糖残基结合于酶D D位使葡萄糖基由椅式转为高级量维持的半椅式活化态位使葡萄糖基由椅式转为高级量维持的半椅式活化态D D位葡萄糖基环上氧原子未成键电子对向位葡萄糖基环上氧原子未成键电子对向C C1 1转移形
18、成双键转移形成双键C C1 1-O-O间电子对转移至间电子对转移至O O成成O O-,O O-接受接受Glu35Glu35羧基之羧基之H H,C C1 1-O-O断裂,释放第一个产物断裂,释放第一个产物R-OHR-OHC C1 1因电子丢失呈正电状态,因电子丢失呈正电状态,Asp52Asp52电离的电离的O O-维持维持C C1 1的正电过渡态的正电过渡态因因Glu35Glu35之之OHOH间电子对转移至间电子对转移至O O,Glu35Glu35之之O O呈负电(未成键电子对)呈负电(未成键电子对)Glu35-OGlu35-O-攻击攻击H H2 2O O之之H H形成形成-OHOH,促使水电离
19、产生促使水电离产生OHOH-葡萄糖葡萄糖C C1 1+与与OHOH-结合恢复低能量维持的稳定葡萄糖椅式构象并释放第二个产物结合恢复低能量维持的稳定葡萄糖椅式构象并释放第二个产物第三十五张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月胰核糖核酸酶胰核糖核酸酶A第三十六张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月胰核糖核酸酶胰核糖核酸酶A第三十七张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月胰核糖核酸酶胰核糖核酸酶A A第三十八张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月胰胰核核糖糖核核酸酸酶酶A第三十九张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第四十张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月羧肽酶
20、羧肽酶A第四十一张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第四十二张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月丝氨酸蛋白酶族丝氨酸蛋白酶族第四十三张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月消化作用的丝氨酸蛋白酶消化作用的丝氨酸蛋白酶胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和弹性蛋白酶是一组密切胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和弹性蛋白酶是一组密切相关的水解酶类,它们的作用是水解肽链。相关的水解酶类,它们的作用是水解肽链。在胰脏内合成的是它们没有活性的酶原,然后被分在胰脏内合成的是它们没有活性的酶原,然后被分泌到消化道,并且仅仅在使用前被活化。这泌到消化道,并且仅仅在使用前被活化。这3 3种酶各种酶各有分工,每种酶在不
21、同类型氨基酸侧链相邻的肽键有分工,每种酶在不同类型氨基酸侧链相邻的肽键处水解蛋白质链。处水解蛋白质链。胰蛋白酶在碱性氮基酸,即赖氨酸或精氨酸的羰基后胰蛋白酶在碱性氮基酸,即赖氨酸或精氨酸的羰基后侧切开肽链。胰凝乳蛋白酶在芳香氨基酸后侧切开肽侧切开肽链。胰凝乳蛋白酶在芳香氨基酸后侧切开肽链。弹性蛋白酶在它的水解位点上几乎没有选择,但链。弹性蛋白酶在它的水解位点上几乎没有选择,但是它趋向于优先切开与小的不带电荷的侧链相邻的肽是它趋向于优先切开与小的不带电荷的侧链相邻的肽键。键。第四十四张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月丝氨酸蛋白酶族丝氨酸蛋白酶族第四十五张,PPT共一百零四页,创作于20
22、22年6月丝氨酸蛋白酶族丝氨酸蛋白酶族第四十六张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月丝氨酸蛋白酶族丝氨酸蛋白酶族第四十七张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月丝氨酸蛋白酶族丝氨酸蛋白酶族第四十八张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月丝氨酸蛋白酶族丝氨酸蛋白酶族第四十九张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月丝氨酸蛋白酶族丝氨酸蛋白酶族第五十张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月丝氨酸蛋白酶族丝氨酸蛋白酶族第五十一张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月丝氨酸蛋白酶族丝氨酸蛋白酶族第五十二张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月丝氨酸蛋白酶族丝氨酸蛋白酶族第五
23、十三张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月丝氨酸蛋白酶族丝氨酸蛋白酶族第五十四张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第五十五张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第五十六张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第五十七张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第五十八张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月天冬氨酸蛋白酶族天冬氨酸蛋白酶族聚体第五十九张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月天冬氨酸蛋白酶族天冬氨酸蛋白酶族第六十张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月第六十一张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月天冬氨酸蛋白酶族天冬氨酸蛋白酶族第六十二张
24、,PPT共一百零四页,创作于2022年6月天冬氨酸蛋白酶族天冬氨酸蛋白酶族第六十三张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月酶活性的调节酶活性的调节酶活力的改变可以通过增加或减少酶分子酶活力的改变可以通过增加或减少酶分子的个数,也可以通过提高或降低每一个酶的个数,也可以通过提高或降低每一个酶分子的催化能力来实现。前者牵扯到非常分子的催化能力来实现。前者牵扯到非常复杂的过程(激素复杂的过程(激素DNARNADNARNA蛋白质),蛋白质),是慢反应。后者在现成的酶分子上进行加工,是慢反应。后者在现成的酶分子上进行加工,是快反应,是酶活性调节的内容,这种调节是快反应,是酶活性调节的内容,这种调节一
25、般有一般有5 5种方式:别构调节、酶原激活、共价种方式:别构调节、酶原激活、共价修饰、反馈调节、级联放大。修饰、反馈调节、级联放大。第六十四张,PPT共一百零四页,创作于2022年6月酶活性的调节控制酶活性的调节控制(一)别构调节(一)别构调节 (allosteric regulation)allosteric regulation)变构效应剂变构效应剂(allosteric effector)变构激活剂变构激活剂变构抑制剂变构抑制剂 变构酶变构酶(allosteric enzyme)变构部位变构部位(allosteric site)一一些些代代谢谢物物可可与与某某些些酶酶分分子子活活性性中中
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