分子遗传学常见试题课件.ppt
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1、关于分子遗传学常见试题现在学习的是第1页,共80页一、名词解释一、名词解释1AP位点位点各种细胞中都有一种核酸内切酶,它附着在自发丢失了单个嘌呤或各种细胞中都有一种核酸内切酶,它附着在自发丢失了单个嘌呤或嘧啶的位点上,这个无嘌呤(嘧啶的位点上,这个无嘌呤(apurinic)和无嘧啶()和无嘧啶(apyrimidinic)位)位点就叫做点就叫做AP位点位点2互补作用互补作用是指若两个突变位点分别位于两个基因,它们可相互补充,表现野生型,是指若两个突变位点分别位于两个基因,它们可相互补充,表现野生型,若两个突变位点在一个基因内,不能互补。若两个突变位点在一个基因内,不能互补。3Contig构建目的
2、基因区域跨叠克隆群(构建目的基因区域跨叠克隆群(contig)。以阳性克隆的末端作为探针基)。以阳性克隆的末端作为探针基因组文库,并进行染色体步行,直到获得具有目标基因两侧分子标记因组文库,并进行染色体步行,直到获得具有目标基因两侧分子标记的大片段跨叠群。的大片段跨叠群。4Cot1/2(半变(半变Cot值):反应完成一半时所需的值):反应完成一半时所需的Cot值,它直接与复性值,它直接与复性DNA成正成正比。比。5C值悖理值悖理生物基因组的大小同生物在进化上所处的地位及复杂性之间无严格生物基因组的大小同生物在进化上所处的地位及复杂性之间无严格的对应关系,这种现象称为的对应关系,这种现象称为C值
3、悖理。值悖理。2现在学习的是第2页,共80页一、名词解释一、名词解释6D-loop线粒体线粒体DNA上的一个区域,其上一小段上的一个区域,其上一小段RNA与与DNA的一条链配对,的一条链配对,使使DNA原始配对链在此区域闲置。也用来描述在原始配对链在此区域闲置。也用来描述在RecA蛋白质催化的反应蛋白质催化的反应中单链中单链“入侵者入侵者”的进入,使双链的进入,使双链DNA中的一条被闲置。中的一条被闲置。7DNA指纹图指纹图FingerprintofDNA(DNA指纹图谱):指不同基因组间的不同多形态限制性指纹图谱):指不同基因组间的不同多形态限制性片段模式。片段模式。通过用限制性内切酶消化和
4、与特异的核酸探针杂交取得不同大小的通过用限制性内切酶消化和与特异的核酸探针杂交取得不同大小的DNA片片段的多点区带图谱,并经与另一个体的段的多点区带图谱,并经与另一个体的DNA图谱比较以评价其相似性图谱比较以评价其相似性的技术。对多点带图谱中个体的特异性进行评价的方法被称为的技术。对多点带图谱中个体的特异性进行评价的方法被称为“DNA指指纹图谱法纹图谱法”。该法是根据没有两个无亲缘关系的个体在同一位置上共有同相。该法是根据没有两个无亲缘关系的个体在同一位置上共有同相同的区带图谱的机率极低,所以同的区带图谱的机率极低,所以DNA指纹图被认为对某一个体是独特的。这指纹图被认为对某一个体是独特的。这
5、种技术已广泛地应用与法医和亲子鉴定。种技术已广泛地应用与法医和亲子鉴定。3现在学习的是第3页,共80页一、名词解释一、名词解释8FootprintingDNA足迹法:是确定足迹法:是确定DNA分子中与蛋白质结合的核苷酸序列的一种方分子中与蛋白质结合的核苷酸序列的一种方法。法。DNA与蛋白质结合的部位不能被内切酶作用,故而与蛋白质结合的部位不能被内切酶作用,故而DNA分子经酶切作分子经酶切作用后遗留下该片断(亦称用后遗留下该片断(亦称“足迹足迹”),进而可以确定它的序列。),进而可以确定它的序列。9exonshuffling外显子改组:来源于不同基因的两个或多个外显子异位性地被组合在外显子改组:
6、来源于不同基因的两个或多个外显子异位性地被组合在一起,或是一个相同的外显子通过复制创造了一个新的外显子内含一起,或是一个相同的外显子通过复制创造了一个新的外显子内含子结构。子结构。目前已知有两种机制可以导致外显子的异位重组(目前已知有两种机制可以导致外显子的异位重组(ectopicrecombination):):非常规重组(非常规重组(illegitimaterecombination)和逆转录转座的外显子插入。)和逆转录转座的外显子插入。有基因组的数据表明,外显子洗牌,也就是通常说的结构域洗牌,有基因组的数据表明,外显子洗牌,也就是通常说的结构域洗牌,经常重组编码各种蛋白质结构域的序列从而
7、创造新的嵌合蛋白质经常重组编码各种蛋白质结构域的序列从而创造新的嵌合蛋白质(chimericprotein)。)。)4现在学习的是第4页,共80页一、名词解释一、名词解释10Fish荧光原位杂交技术,是一种利用非放射性的荧光信号对原位杂交样本进行荧光原位杂交技术,是一种利用非放射性的荧光信号对原位杂交样本进行检测的技术。它将荧光信号的高灵敏度、安全性,荧光信号的直观性和原检测的技术。它将荧光信号的高灵敏度、安全性,荧光信号的直观性和原位杂交的高准确性结合起来,通过荧光标记的位杂交的高准确性结合起来,通过荧光标记的DNA探针与待测样本的探针与待测样本的DNA进行原位杂交,在荧光显微镜下对荧光信号
8、进行辨别和计数,从而对染进行原位杂交,在荧光显微镜下对荧光信号进行辨别和计数,从而对染色体或基因异常的细胞、组织样本进行检测和诊断,为各种基因相关疾病的色体或基因异常的细胞、组织样本进行检测和诊断,为各种基因相关疾病的分型、预前和预后提供准确的依据。分型、预前和预后提供准确的依据。11Genecluster:(基因簇):(基因簇)一组相同或者相似的基因。一组相同或者相似的基因。12Geneknockout基因敲除,是指对一个结构已知但功能未知的基因,从分子水平上设计实基因敲除,是指对一个结构已知但功能未知的基因,从分子水平上设计实验,将该基因去除,或用其它顺序相近基因取代,然后从整体观察实验动
9、验,将该基因去除,或用其它顺序相近基因取代,然后从整体观察实验动物,推测相应基因的功能。这与早期生理学研究中常用的切除部分物,推测相应基因的功能。这与早期生理学研究中常用的切除部分-观察整观察整体体-推测功能的三部曲思想相似。推测功能的三部曲思想相似。基因敲除除可中止某一基因的表达外,还包括引入新基因及引入定点突变。基因敲除除可中止某一基因的表达外,还包括引入新基因及引入定点突变。既可以是用突变基因或其它基因敲除相应的正常基因,也可以用正常基因既可以是用突变基因或其它基因敲除相应的正常基因,也可以用正常基因敲除相应的突变基因。敲除相应的突变基因。5现在学习的是第5页,共80页一、名词解释一、名
10、词解释13Genomeimprinting:基因组印迹,是指在配子或合子发生期间,来自亲本的等位基因或染色体在基因组印迹,是指在配子或合子发生期间,来自亲本的等位基因或染色体在发育过程中产生专一性的加工修饰,导致后代体细胞中两个亲本来源的等位发育过程中产生专一性的加工修饰,导致后代体细胞中两个亲本来源的等位基因有不同的表达活性,为一种后生论修饰。目前在人类和小鼠中鉴定的印基因有不同的表达活性,为一种后生论修饰。目前在人类和小鼠中鉴定的印迹基因已超过迹基因已超过25个,它们具有一些共同的特点,如印迹基因分布的群集性、个,它们具有一些共同的特点,如印迹基因分布的群集性、复制的不同步性、表达的时空特
11、异性、遗传的保守性及编码复制的不同步性、表达的时空特异性、遗传的保守性及编码RNAs等。基等。基因组印迹的分子机理与印迹基因的甲基化尤其是因组印迹的分子机理与印迹基因的甲基化尤其是CpG岛甲基化密切相岛甲基化密切相关,特异性甲基化区域在印迹基因的表达中具有重要作用。基因组印关,特异性甲基化区域在印迹基因的表达中具有重要作用。基因组印迹基因与胎儿和胎盘的生长发育及细胞增殖有关,正常印迹的改变可迹基因与胎儿和胎盘的生长发育及细胞增殖有关,正常印迹的改变可引起包括肿瘤在内的多种遗传性疾病。引起包括肿瘤在内的多种遗传性疾病。14GT-AG规律规律指在核基因内含子开始和结束出现的两个固定的脱氧核苷酸。指
12、在核基因内含子开始和结束出现的两个固定的脱氧核苷酸。6现在学习的是第6页,共80页一、名词解释一、名词解释15miRNA和和hnRNAmicroRNA(miRNA)是一类长度很短的非编码单链小分子是一类长度很短的非编码单链小分子RNA,约,约20-25nt(少数小于(少数小于20nt的),由一段具有发夹环结构的长度为的),由一段具有发夹环结构的长度为70-80nt的单链的单链RNA前体(前体(pre-miRNA)剪切)剪切后生成。后生成。miRNA在各个物种间具有高度的进化保守性,并且在茎部的保守性更强,但在各个物种间具有高度的进化保守性,并且在茎部的保守性更强,但在环部可以容许更多的突变位点
13、存在。已经找到了数百种在环部可以容许更多的突变位点存在。已经找到了数百种miRNA。大多数植物。大多数植物miRNA还呈现出组织特异性表达和发育阶段特异性表达的特点,这种特异性对还呈现出组织特异性表达和发育阶段特异性表达的特点,这种特异性对miRNA调控功调控功能的作用有重要意义。能的作用有重要意义。microRNA的特点的特点(1)miRNA基因以单拷贝、多拷贝或基因簇(基因以单拷贝、多拷贝或基因簇(cluster)的形式广泛存在于真核生物)的形式广泛存在于真核生物基因组中;基因组中;(2)大部分位于基因间隔区()大部分位于基因间隔区(intergenicregion,IGR),也有相当一部
14、分位于编码蛋),也有相当一部分位于编码蛋白基因的内含子中;白基因的内含子中;(3)miRNA本身不编码任何蛋白质本身不编码任何蛋白质,不具有开放阅读框架(不具有开放阅读框架(openreadframe,ORF),具),具有序列保守性、表达时序性和组织特异性,由含有发夹结构的前体剪切加工而来。有序列保守性、表达时序性和组织特异性,由含有发夹结构的前体剪切加工而来。(4)成熟的)成熟的miRNA5端带有磷酸基团且多为尿嘧啶核苷酸,端带有磷酸基团且多为尿嘧啶核苷酸,3端带有羟基,因而端带有羟基,因而miRNA能与大多数寡核苷酸和功能能与大多数寡核苷酸和功能RNA的降解片段区分开来。的降解片段区分开来
15、。7现在学习的是第7页,共80页一、名词解释一、名词解释hnRNA(heterogeneous nuclear RNA系heterogeneous nuclear之缩写)。核内不均一RNA 为存在于真核生物细胞核中的不稳定、大小不均的一组高分子RNA(分子量约为1052107,沉降系数约为30100S)之总称。占细胞全部RNA之百分之几,在核内主要存在于核仁的外侧。认为hnRNA多属信使RNA(messenger ribonucleic acid,mRNA)之先驱体,包括各种基因的转录产物及其成为mRNA前的各中间阶段的分子,在5末端多附有间隙结构,而3的末端附有多聚腺苷酸聚合酶分子。这些hn
16、RNA在受到加工之后,移至细胞质,作为mRNA而发挥其功能。大部分的hnRNA在核内与各种特异的蛋白质形成复合体而存在着 8现在学习的是第8页,共80页一、名词解释一、名词解释16Oncogenes,Proto-oncogenes癌基因癌基因原癌基因原癌基因:一种能够导致癌症的基因。许多致癌基因都直接或间接地控制细胞的成长速度:一种能够导致癌症的基因。许多致癌基因都直接或间接地控制细胞的成长速度癌基因癌基因作为细胞增殖和肿瘤形成的加速器起作用作为细胞增殖和肿瘤形成的加速器起作用.编码的蛋白能够促进细胞生长的失控和细胞向恶性状编码的蛋白能够促进细胞生长的失控和细胞向恶性状态转化态转化.没有激活之
17、前,称之为原癌基因(没有激活之前,称之为原癌基因(proto-oncogenes),它们只具有破坏细胞自身活动和将细胞),它们只具有破坏细胞自身活动和将细胞转变为恶性状态的潜能转变为恶性状态的潜能.肿瘤抑制基因(肿瘤抑制基因(Tumorsuppressorgenes,TSG)作为细胞生长的刹车起作作为细胞生长的刹车起作用;用;编码蛋白可抑制细胞的生长,阻止细胞转变为恶性细胞编码蛋白可抑制细胞的生长,阻止细胞转变为恶性细胞癌基因可以分成两大类:一类是病毒癌基因,指反转录病毒的基因组里带有可使受病毒感癌基因可以分成两大类:一类是病毒癌基因,指反转录病毒的基因组里带有可使受病毒感染的宿主细胞发生癌变
18、的基因,简写成染的宿主细胞发生癌变的基因,简写成V-onc;另一类是细胞癌基因,简写成;另一类是细胞癌基因,简写成c-onc,又称原,又称原癌基因(癌基因(proto-oncogene),这是指正常细胞基因组中,一旦发生突变或被异常激活后可使),这是指正常细胞基因组中,一旦发生突变或被异常激活后可使细胞发生恶性转化的基因。换言之,在每一个正常细胞基因组里都带有原癌基因,但它不细胞发生恶性转化的基因。换言之,在每一个正常细胞基因组里都带有原癌基因,但它不出现致癌活性,只是在发生突变或被异常激活后才变成具有致癌能力的癌基因。癌基因有出现致癌活性,只是在发生突变或被异常激活后才变成具有致癌能力的癌基
19、因。癌基因有时又被称为转化基因(时又被称为转化基因(transforminggene),因为已活化的癌基因或是从肿瘤细胞里分离出来的),因为已活化的癌基因或是从肿瘤细胞里分离出来的癌基因,可将已建株的癌基因,可将已建株的NIH3T3小鼠成纤维细胞或其他体外培养的哺乳类细胞,转化成为具有癌变特征的小鼠成纤维细胞或其他体外培养的哺乳类细胞,转化成为具有癌变特征的肿瘤细胞。癌基因的形成是反映一种功能的获得(肿瘤细胞。癌基因的形成是反映一种功能的获得(gainoffunction),即细胞的原癌基因被不适当地激活),即细胞的原癌基因被不适当地激活后,会造成蛋白质产物的结构改变,原癌基因出现组成型激活,
20、以及过量表达或不能在适当的时刻关后,会造成蛋白质产物的结构改变,原癌基因出现组成型激活,以及过量表达或不能在适当的时刻关闭基因的表达等。目前已识别的原癌基因有闭基因的表达等。目前已识别的原癌基因有100多个。多个。9现在学习的是第9页,共80页一、名词解释一、名词解释17Orphangene孤独基因:成串重复序列衍生的单个分立基因,或是在成簇的基因家孤独基因:成串重复序列衍生的单个分立基因,或是在成簇的基因家族中通过染色体重排而分散到其他位置上的成员,被称为孤独基因族中通过染色体重排而分散到其他位置上的成员,被称为孤独基因Palindrome回文序列:双链回文序列:双链DNA中的一段倒置重复序
21、列,当该序列的双链被打开后,可中的一段倒置重复序列,当该序列的双链被打开后,可形成局部形成局部“十十”字形结构。这段序列被称为回文序列。字形结构。这段序列被称为回文序列。Phagedisplay:噬菌体表面展示技术:是一种对多肽功能非常有效的筛选技:噬菌体表面展示技术:是一种对多肽功能非常有效的筛选技术,即将外源蛋白分子或多肽的基因克隆到丝状噬菌体基因组中,与噬菌体术,即将外源蛋白分子或多肽的基因克隆到丝状噬菌体基因组中,与噬菌体外膜蛋白融合表达,展示在噬菌体颗粒的表面,因此,通过表型筛选就可以外膜蛋白融合表达,展示在噬菌体颗粒的表面,因此,通过表型筛选就可以获得它的编码基因。应用噬菌体表面展
22、示技术可以从多肽库中进行快速筛选,获得它的编码基因。应用噬菌体表面展示技术可以从多肽库中进行快速筛选,从而成为药物开发的强有力工具。从而成为药物开发的强有力工具。10现在学习的是第10页,共80页一、名词解释一、名词解释18RibozymeandDNAzyme脱氧核酶脱氧核酶(脱氧核酶脱氧核酶(deoxyribozyme)是利用体外分子进化技术合成的一)是利用体外分子进化技术合成的一种具有催化功能的单链种具有催化功能的单链DNA片段,具有高效的催化活性和结构识别能力。片段,具有高效的催化活性和结构识别能力。核酶核酶Ribozyme:是一种可以催化:是一种可以催化RNA切割和切割和RNA剪接反应
23、的由剪接反应的由RNA组成组成的酶,可以作为基因表达和病毒复制的抑制剂。的酶,可以作为基因表达和病毒复制的抑制剂。19RNA饱和杂交实验饱和杂交实验在在DNA和和RNA杂交时,以少量的单链杂交时,以少量的单链DNA,与大量的,与大量的RNA进行杂交,进行杂交,可以使二者充分结合,该过程即叫做可以使二者充分结合,该过程即叫做。目的是找到杂交区段,进而确。目的是找到杂交区段,进而确定定DNA转录的位置。转录的位置。20RNA编辑编辑RNAediting:某些:某些mRNA的核苷酸序列,在生成转录产物后还需插的核苷酸序列,在生成转录产物后还需插入、删除或取代一些核苷酸残基,方能生成具有正确翻译功能的
24、模入、删除或取代一些核苷酸残基,方能生成具有正确翻译功能的模板,遗传信息在板,遗传信息在mRNA水平上的改变过程,称为水平上的改变过程,称为RNA编辑。编辑。11现在学习的是第11页,共80页一、名词解释一、名词解释21RNA干扰干扰RNAinterference,RNAi:是指在进化过程中高度保守的、由双链:是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-strandedRNA,dsRNA)诱发的、同源)诱发的、同源mRNA高效特异高效特异性降解的现象。性降解的现象。RNA干扰是基因转录后沉默的一种方式,是生物界古老而干扰是基因转录后沉默的一种方式,是生物界古老而且进化的高度保守的现
25、象之一。且进化的高度保守的现象之一。22SAGE基因表达序列分析(基因表达序列分析(SAGE):是通过快速和详细分析成千上万个):是通过快速和详细分析成千上万个EST(expresssequencedtags)来寻找出表达丰富度不同的)来寻找出表达丰富度不同的SAGE标签序列。标签序列。在此方法中,通过限制性酶切可以产生非常短的在此方法中,通过限制性酶切可以产生非常短的cDNA(10-14bp)标签,)标签,并通过并通过PCR扩增和连接,随后对连接体进行测序。扩增和连接,随后对连接体进行测序。SAGE大大简化和加大大简化和加快了快了3端表达序列标签的收集和测序。同端表达序列标签的收集和测序。同
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