原核基因表达调控 (7)精选PPT.ppt
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1、关于原核基因表达调控(7)第1页,讲稿共77张,创作于星期日第四节第四节 色氨酸操纵子色氨酸操纵子(trpoperon)内容提要:内容提要:n色氨酸操纵子的结构色氨酸操纵子的结构n色氨酸操纵子的色氨酸操纵子的阻遏系统阻遏系统n色氨酸操纵子的弱化机制色氨酸操纵子的弱化机制第2页,讲稿共77张,创作于星期日 调控基因调控基因 结构基因结构基因 催化分枝酸转变为色氨酸的酶催化分枝酸转变为色氨酸的酶trpRtrp一、色氨酸操纵子的结构一、色氨酸操纵子的结构第3页,讲稿共77张,创作于星期日ntrpR,阻遏蛋白阻遏蛋白nP,-40+18 nO,-21+1nL,+1+162n结构基因结构基因t,A下游下游
2、36bp,t,t下游下游250bp,基因组成基因组成第4页,讲稿共77张,创作于星期日磷第5页,讲稿共77张,创作于星期日n特点特点:(1)(1)trpRtrpR和和trpABCDEtrpABCDE不连锁不连锁(相距很远)(相距很远);(2)(2)操纵基因在启动子内操纵基因在启动子内;(3)(3)有衰减子有衰减子(attenuatorattenuator)/)/弱化子弱化子;(4)(4)启动子和结构基因不直接相连,二者被启动子和结构基因不直接相连,二者被 前导序列前导序列(Leader)(Leader)所所隔开隔开。第6页,讲稿共77张,创作于星期日二、二、trp trp 操纵子的阻遏系统操纵
3、子的阻遏系统低低Trp时:时:阻遏物不结合操阻遏物不结合操纵基因;纵基因;高高Trp时:时:阻遏物阻遏物+Trp 结合操纵基因结合操纵基因第7页,讲稿共77张,创作于星期日1 1、TrpR 四聚体四聚体第8页,讲稿共77张,创作于星期日阻遏蛋白阻遏蛋白trp 有活性的阻遏物有活性的阻遏物nSNE299trpO不转录不转录第9页,讲稿共77张,创作于星期日2 2、阻遏蛋白的结合位点、阻遏蛋白的结合位点 ntrpO-21+1,反向重复序列反向重复序列ntrpP-40+18n活性阻遏物与活性阻遏物与trpO的结合与的结合与RNApol与启动子与启动子的结合发生竞争。的结合发生竞争。操纵子操纵子第10
4、页,讲稿共77张,创作于星期日3 3、阻遏系统、阻遏系统n主管转录是否启动主管转录是否启动 粗调开关粗调开关第11页,讲稿共77张,创作于星期日三、三、trp操纵子的弱化机制操纵子的弱化机制衰减子衰减子(attenuator)/弱化子弱化子前导序列前导序列(leadersequence)1 1.弱化子:弱化子:DNA中可导致转录过早终止的一中可导致转录过早终止的一段核甘酸序列(段核甘酸序列(123-150bp区区)。)。第12页,讲稿共77张,创作于星期日123150RepressormRNAtrprepressor第13页,讲稿共77张,创作于星期日 研研究究引引起起终终止止的的mRNA碱碱
5、基基序序列列,发发现现该该区区mRNA通通过过自自我我配配对对可可以以形形成成茎茎-环环结结构构,有典型的终止子特点。有典型的终止子特点。第14页,讲稿共77张,创作于星期日POE4321LDNARNAATGTGA2trpcodons14322.2.前导肽前导肽第15页,讲稿共77张,创作于星期日前导肽前导肽14aa第16页,讲稿共77张,创作于星期日第17页,讲稿共77张,创作于星期日第18页,讲稿共77张,创作于星期日3.3.前导序列:在前导序列:在trpmRNA5端端trpE基因的起基因的起始密码前一个长始密码前一个长162bp的的mRNA片段片段。第19页,讲稿共77张,创作于星期日4
6、 4、弱化机制、弱化机制 研研究究发发现现,在在高高浓浓度度Trp和和低低浓浓度度Trp时时,Trp操操纵纵子子的的表表达达水水平平相相差差600倍倍,然然而而阻阻遏遏作作用用仅仅使使转转录录降降低低70倍倍。另另外外使使阻阻遏遏物物失失活活突突变变不不能能完完全全消消除除Trp对对 TrpTrp操操纵纵子子表表达达的的影影响响。说说明明Trp操操纵纵子子的的这这种种调调控控与阻遏物的控制无关。这就是弱化作用。与阻遏物的控制无关。这就是弱化作用。第20页,讲稿共77张,创作于星期日 阻阻遏遏系系统统是是一一个个粗粗调调开开关关,主主管管转转录录是是否否启启动动;TrpTrp操操纵纵子子对对应应
7、于于TrpTrp的的生生物物合合成成还还有有另另一一个个系系统统进进行行细细微微调调控控,并并决决定定已已经经启启动动的的转转录录是是否否进进行行下下去去。在在这这个个系系统统中中酶酶的的浓浓度度根根据据氨氨基基酸酸浓浓度度的的变变化化而而受受到到调调节节。这这个个细细微微调调控控是是通通过过转转录录达达到到第第一一个个结结构构基基因因之之前前的的过过早早终终止止来来实实现现的的,细细胞胞中中色色氨酸的浓度是实现过早终止的根本原因。氨酸的浓度是实现过早终止的根本原因。第21页,讲稿共77张,创作于星期日第22页,讲稿共77张,创作于星期日12暂停结构暂停结构23抗终止构型抗终止构型34终止构型
8、终止构型第23页,讲稿共77张,创作于星期日第24页,讲稿共77张,创作于星期日UUUU34UUUU334核糖体核糖体 前导肽前导肽 前导前导mRNA1.1.当色氨酸浓度高时当色氨酸浓度高时 转录衰减机制转录衰减机制 125 trp 密码子密码子 衰减子结构衰减子结构就是终止子就是终止子可使转录可使转录前导前导DNAUUUU3 RNARNA聚合酶聚合酶 终止终止第25页,讲稿共77张,创作于星期日UUUU342423UUUU核糖体核糖体 前导肽前导肽 前导前导mRNA15 trp 密码子密码子结构基因结构基因前导前导DNA RNARNA聚合酶聚合酶 2.2.当色氨酸浓度低时当色氨酸浓度低时 T
9、rp合成酶系相关合成酶系相关结构基因被转录结构基因被转录序列序列3 3、4 4不能不能形成衰减子结构形成衰减子结构 第26页,讲稿共77张,创作于星期日为什么需要阻遏体系?为什么需要阻遏体系?当大量当大量Trp存在时,阻遏系统起作用,阻遏物存在时,阻遏系统起作用,阻遏物与之结合,阻止非必需的先导与之结合,阻止非必需的先导mRNA合成,使这合成,使这个合成系统更加经济。个合成系统更加经济。trp操纵子具有双重调节体系?操纵子具有双重调节体系?阻遏作用与弱化作用的协调阻遏作用与弱化作用的协调第27页,讲稿共77张,创作于星期日为什么需要弱化系统?为什么需要弱化系统?当当trp浓度低时,阻遏物从有活
10、性变为无活性,浓度低时,阻遏物从有活性变为无活性,速度极慢,不能很快引发速度极慢,不能很快引发trp合成。因此需要一合成。因此需要一个能快速作出反应的系统,以保持培养基中适当个能快速作出反应的系统,以保持培养基中适当的的Trp水平。水平。弱化子能较快地通过抗终子的方法来增加弱化子能较快地通过抗终子的方法来增加Trp基基因表达,迅速提高内源色氨酸的浓度。因表达,迅速提高内源色氨酸的浓度。第28页,讲稿共77张,创作于星期日 细细菌菌通通过过弱弱化化作作用用弥弥补补阻阻遏遏作作用用的的不不足足,因因为为阻阻遏遏作作用用只只能能使使转转录录不不起起始始,对对于于已已经经起起始始的的转转录录,只只能能
11、通通过过弱弱化化作作用用使使之之中中途途停停下下来来。阻阻遏遏作作用用的的信信号号是是细细胞胞内内色色氨氨酸酸的的多多少少;弱弱化化作作用用的的信信号号则则是是细细胞胞内内载载有有色色氨氨酸酸的的tRNAtRNA的的多多少少。它它通通过过前前导导肽肽的的翻翻译译来来控控制制转转录录的的进进行行,在在细细菌菌细细胞胞内内这这两两种种作作用用相相辅辅相相成成,体体现现着着生生物物体内周密的调控作用。体内周密的调控作用。第29页,讲稿共77张,创作于星期日细菌演化出弱化系统的生物学意义细菌演化出弱化系统的生物学意义n 通过通过tRNA荷载与否进行调控,更为灵敏;荷载与否进行调控,更为灵敏;n氨基酸的
12、主要用途是合成蛋白质,因而以氨基酸的主要用途是合成蛋白质,因而以tRNA荷载荷载为标准进行调控更为恰当;为标准进行调控更为恰当;n两个调控系统,避免浪费提高效率:两个调控系统,避免浪费提高效率:阻遏系统阻遏系统 高水平高水平trp时,不转录时,不转录 低水平低水平trp时,转录时,转录 弱化系统弱化系统 细调细调 原核生物细致的精细调控机制原核生物细致的精细调控机制增强原核生物对环境的适应性增强原核生物对环境的适应性 经济经济第30页,讲稿共77张,创作于星期日第31页,讲稿共77张,创作于星期日Contentsv基因表达调控的基本概念基因表达调控的基本概念v原核基因调控机制原核基因调控机制v
13、乳糖操纵子乳糖操纵子v色氨酸操纵子色氨酸操纵子v其他操纵子其他操纵子v转录后水平上的调控转录后水平上的调控第32页,讲稿共77张,创作于星期日第五节第五节 其他操纵子其他操纵子一、半乳糖操纵子一、半乳糖操纵子(galactoseoperon)异构酶异构酶(galE)乳糖乳糖-磷酸尿嘧啶核苷转移酶磷酸尿嘧啶核苷转移酶(galT)半乳糖激酶半乳糖激酶(galk)第33页,讲稿共77张,创作于星期日第34页,讲稿共77张,创作于星期日gal操纵子的特点:操纵子的特点:它有两个启动子,其它有两个启动子,其mRNA可从两个可从两个不同的起始点开始转录;不同的起始点开始转录;它有两个它有两个O区,一个在区
14、,一个在P区上游,另区上游,另一个在结构基因一个在结构基因galE内部。内部。第35页,讲稿共77张,创作于星期日n因为半乳糖的利用效率比葡萄糖低,人们猜想葡因为半乳糖的利用效率比葡萄糖低,人们猜想葡萄糖存在时半乳糖操纵子不被诱导,但实际上有萄糖存在时半乳糖操纵子不被诱导,但实际上有葡萄糖存在时,葡萄糖存在时,gal操纵子仍可被诱导。操纵子仍可被诱导。n现已分离到一些突变株,其中一类突变株能在不含葡现已分离到一些突变株,其中一类突变株能在不含葡萄糖的培养基中高水平合成半乳糖代谢酶类(萄糖的培养基中高水平合成半乳糖代谢酶类(gal结构结构基因高效表达);基因高效表达);n而另一类突变株中而另一类
15、突变株中gal基因的表达完全依赖于葡萄糖,基因的表达完全依赖于葡萄糖,培养基中如无葡萄糖存在,这些细菌的培养基中如无葡萄糖存在,这些细菌的gal基因不表基因不表达,不合成半乳糖代谢酶类。达,不合成半乳糖代谢酶类。第36页,讲稿共77张,创作于星期日n分析分析gal操纵子操纵子P-O区的区的DNA序列发现序列发现,该操纵子确该操纵子确实存在两个相距仅实存在两个相距仅5bp的启动子,可以分别起始的启动子,可以分别起始mRNA的合成。每个启动子拥有各自的的合成。每个启动子拥有各自的RNA聚合聚合酶结合位点酶结合位点S1和和S2。n从从S1起始的转录只有在培养基中无葡萄糖时,才能起始的转录只有在培养基
16、中无葡萄糖时,才能顺利进行,顺利进行,RNA聚合酶与聚合酶与S1的结合需要半乳糖、的结合需要半乳糖、CAP和较高浓度的和较高浓度的cAMP。n从从S2起始的转录则完全依赖于葡萄糖,高水平的起始的转录则完全依赖于葡萄糖,高水平的cAMP-CAP能抑制由这个启动子起始的转录。当有能抑制由这个启动子起始的转录。当有cAMP-CAP时,转录从时,转录从S1开始,当无开始,当无cAMP-CAP时,时,转录从转录从S2开始。开始。第37页,讲稿共77张,创作于星期日S1S2S1起始的转录不依赖于葡萄糖起始的转录不依赖于葡萄糖S2起始的转录则完全依赖于葡萄糖起始的转录则完全依赖于葡萄糖第38页,讲稿共77张
17、,创作于星期日为什么为什么gal操纵子需要两个转录起始位点?操纵子需要两个转录起始位点?n半乳糖不仅可以作为唯一碳源供细胞生半乳糖不仅可以作为唯一碳源供细胞生长,而且与之相关的物质长,而且与之相关的物质-尿苷二磷酸尿苷二磷酸半乳糖半乳糖(UDPgal)是大肠杆菌细胞壁合是大肠杆菌细胞壁合成的前体。在没有外源半乳糖的情况下,成的前体。在没有外源半乳糖的情况下,UDP-gal是通过半乳糖差向异构酶(来是通过半乳糖差向异构酶(来源?)的作用由源?)的作用由UDP-葡萄糖合成的,该葡萄糖合成的,该酶是酶是galE基因的产物。基因的产物。第39页,讲稿共77张,创作于星期日n生长过程中的所有时间里细胞必
18、须能够合生长过程中的所有时间里细胞必须能够合成差向异构酶。现在设想只有成差向异构酶。现在设想只有S1一个启动一个启动子,那么由于这个启动子的活性依赖于子,那么由于这个启动子的活性依赖于cAMP-CRP,当培养基中有葡萄糖存在时当培养基中有葡萄糖存在时就不能合成异构酶。就不能合成异构酶。S1S2半乳糖存在、葡萄糖不存在时,半乳糖存在、葡萄糖不存在时,S1启动启动第40页,讲稿共77张,创作于星期日S1S2n 假如唯一的启动子是假如唯一的启动子是S2,那么,即使在葡萄糖存在的情况下,半乳糖那么,即使在葡萄糖存在的情况下,半乳糖也将使操纵子处于充分诱导状态,这无疑是一种浪费。无论从必要性或也将使操纵
19、子处于充分诱导状态,这无疑是一种浪费。无论从必要性或经济性考虑,都需要一个不依赖于经济性考虑,都需要一个不依赖于cAMP-CAP的启动子的启动子(S2)进行进行本底水平的组成型合成,以及一个依赖于本底水平的组成型合成,以及一个依赖于cAMP-CAP的启动子的启动子(S1)对高水平合成进行调节。即只有在对高水平合成进行调节。即只有在S2活性完全被活性完全被cAMP-CAP抑制时,调控作用才是有效的。抑制时,调控作用才是有效的。半乳糖、葡萄糖存在时半乳糖、葡萄糖存在时,S2启动,启动,浪费浪费半乳糖不存在、葡萄糖存在时半乳糖不存在、葡萄糖存在时,S2启动,启动,组成型合成组成型合成第41页,讲稿共
20、77张,创作于星期日二、阿拉伯糖操纵子二、阿拉伯糖操纵子(arabinoseoperon)naraBaraB基因、基因、araAaraA基因和基因和araD,araD,形成一个基形成一个基因簇,简写为因簇,简写为araBADaraBAD。三个基因的表达受到三个基因的表达受到araara操纵子中操纵子中araCaraC基因产基因产物物AraCAraC蛋白的调控蛋白的调控。第42页,讲稿共77张,创作于星期日第43页,讲稿共77张,创作于星期日araara操纵子的调控特点操纵子的调控特点:n第一,第一,araCaraC表达受到表达受到AraCAraC的自身调控。的自身调控。n第二,第二,AraCA
21、raC既是既是araara操纵子的正调节蛋白,又是其操纵子的正调节蛋白,又是其负调节蛋白。这种双重功能是通过负调节蛋白。这种双重功能是通过AraCAraC蛋白的两蛋白的两种异构体来实现的(种异构体来实现的(Pi Pi和和Pr)Pr)。n第三,第三,AraCAraC与与CAPCAP结合可充分诱导结合可充分诱导araara操纵子。操纵子。第44页,讲稿共77张,创作于星期日l与与araBADaraBAD相邻的是一个复合的启动子区域和一个相邻的是一个复合的启动子区域和一个调节基因调节基因araCaraC,这个这个AraCAraC蛋白同时显示正、负调节因蛋白同时显示正、负调节因子的功能。子的功能。Ar
22、aBADAraBAD和和araCaraC基因的转录是分别在两条基因的转录是分别在两条链上以相反的方向进行的。在标准的遗传学图谱上,链上以相反的方向进行的。在标准的遗传学图谱上,araBADaraBAD基因簇从启动子基因簇从启动子P PBADBAD开始向左进行转录,而开始向左进行转录,而araCaraC基因则是从基因则是从P Pc c向右转录。向右转录。第45页,讲稿共77张,创作于星期日第46页,讲稿共77张,创作于星期日高葡萄糖,低阿拉伯糖高葡萄糖,低阿拉伯糖有阿拉伯糖,无葡萄糖有阿拉伯糖,无葡萄糖无无araC蛋白时蛋白时第47页,讲稿共77张,创作于星期日第48页,讲稿共77张,创作于星期
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