水处理微生物学ppt.ppt
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1、关于水处理微生物学关于水处理微生物学PPT现在学习的是第1页,共82页第一章 绪论主要内容:主要内容:主要内容:主要内容:水处理微生物学的研究对象和任务水处理微生物学的研究对象和任务水处理微生物学的研究对象和任务水处理微生物学的研究对象和任务微生物的分类、命名微生物的分类、命名微生物的分类、命名微生物的分类、命名微生物的特点微生物的特点微生物的特点微生物的特点 原核微生物与真核微生物的区别原核微生物与真核微生物的区别原核微生物与真核微生物的区别原核微生物与真核微生物的区别现在学习的是第2页,共82页第一节第一节第一节第一节 水处理微生物学研究的对象和任务水处理微生物学研究的对象和任务水处理微生
2、物学研究的对象和任务水处理微生物学研究的对象和任务n n研究对象研究对象:n n研究水体中微生物的形态,生理特性和控制方法;研究水体中微生物的形态,生理特性和控制方法;研究水体中微生物的形态,生理特性和控制方法;研究水体中微生物的形态,生理特性和控制方法;n n研究微生物在水处理中的作用机理和规律;研究微生物在水处理中的作用机理和规律;研究微生物在水处理中的作用机理和规律;研究微生物在水处理中的作用机理和规律;n n研究水体中微生物的检测方法,判定水体污染和自净能力以研究水体中微生物的检测方法,判定水体污染和自净能力以研究水体中微生物的检测方法,判定水体污染和自净能力以研究水体中微生物的检测方
3、法,判定水体污染和自净能力以及水处理效果的好坏。及水处理效果的好坏。及水处理效果的好坏。及水处理效果的好坏。现在学习的是第3页,共82页n n研究任务研究任务:n n掌握微生物的基本概念、类型、生理特性、微生物与环境的关掌握微生物的基本概念、类型、生理特性、微生物与环境的关掌握微生物的基本概念、类型、生理特性、微生物与环境的关掌握微生物的基本概念、类型、生理特性、微生物与环境的关系、以及微生物在水处理中的作用等基本理论系、以及微生物在水处理中的作用等基本理论系、以及微生物在水处理中的作用等基本理论系、以及微生物在水处理中的作用等基本理论n n充分利用微生物控制,消除水体的有机污染物,营养盐类,
4、重金属充分利用微生物控制,消除水体的有机污染物,营养盐类,重金属充分利用微生物控制,消除水体的有机污染物,营养盐类,重金属充分利用微生物控制,消除水体的有机污染物,营养盐类,重金属的污染的污染的污染的污染n n利用微生物进行水处理使水资源再生利用微生物进行水处理使水资源再生利用微生物进行水处理使水资源再生利用微生物进行水处理使水资源再生现在学习的是第4页,共82页一、什么是微生物一、什么是微生物一、什么是微生物一、什么是微生物 一切肉眼看不见或看不清的微小生物的总称。是一一切肉眼看不见或看不清的微小生物的总称。是一一切肉眼看不见或看不清的微小生物的总称。是一一切肉眼看不见或看不清的微小生物的总
5、称。是一些个体微小、构造简单的低等生物。些个体微小、构造简单的低等生物。些个体微小、构造简单的低等生物。些个体微小、构造简单的低等生物。微生物的菌落细菌的显微图样第二节第二节 微生物概述微生物概述现在学习的是第5页,共82页微生物小小m级:光学显微镜下可见(细胞)Nm级:电子显微镜下可见(细胞器、病毒)简简单细胞简单多细胞非细胞(即“分子生物”,如病毒)原核类:原核类:细菌,放线菌、蓝细菌,支原体、立克次氏体,衣原体等低低(进化地位低)真核类:真核类:真菌,原生动物,微型后生动物,微藻类非细胞:非细胞:病毒,亚病毒(朊病毒、类病毒、拟病毒)现在学习的是第6页,共82页微生物的进化地位:微生物的
6、进化地位:通过放射性元素的计时技术,测得地球年龄约有通过放射性元素的计时技术,测得地球年龄约有通过放射性元素的计时技术,测得地球年龄约有通过放射性元素的计时技术,测得地球年龄约有45-4645-46亿年。类似细菌的生物亿年。类似细菌的生物亿年。类似细菌的生物亿年。类似细菌的生物在约在约在约在约3535亿年前就已出现,此时地球开始由化学进化转入到生物进化阶段;亿年前就已出现,此时地球开始由化学进化转入到生物进化阶段;亿年前就已出现,此时地球开始由化学进化转入到生物进化阶段;亿年前就已出现,此时地球开始由化学进化转入到生物进化阶段;蓝细菌类原核生物是在蓝细菌类原核生物是在蓝细菌类原核生物是在蓝细菌
7、类原核生物是在2121亿年前出现亿年前出现亿年前出现亿年前出现,此时地球大气开始由无氧变成有氧,之后出现此时地球大气开始由无氧变成有氧,之后出现此时地球大气开始由无氧变成有氧,之后出现此时地球大气开始由无氧变成有氧,之后出现真核微生物;真核微生物;真核微生物;真核微生物;大约大约大约大约6 6亿年前,水圈中出现了后生动物(摄食消费者),之后出现由亿年前,水圈中出现了后生动物(摄食消费者),之后出现由亿年前,水圈中出现了后生动物(摄食消费者),之后出现由亿年前,水圈中出现了后生动物(摄食消费者),之后出现由“鱼鱼鱼鱼陆生生陆生生陆生生陆生生物物物物两栖类两栖类两栖类两栖类爬行类爬行类爬行类爬行类
8、”的进化趋势,人类诞生至今不过的进化趋势,人类诞生至今不过的进化趋势,人类诞生至今不过的进化趋势,人类诞生至今不过300300万年。万年。万年。万年。如果把地球年龄比喻为一年的话,则微生物诞生的时间是在如果把地球年龄比喻为一年的话,则微生物诞生的时间是在如果把地球年龄比喻为一年的话,则微生物诞生的时间是在如果把地球年龄比喻为一年的话,则微生物诞生的时间是在3 3月月月月2020日左右,人类出现的日左右,人类出现的日左右,人类出现的日左右,人类出现的时间是时间是时间是时间是1212月月月月3131日下午日下午日下午日下午7 7时左右,所以可以毫不夸张地说,微生物是一切生物时左右,所以可以毫不夸张
9、地说,微生物是一切生物时左右,所以可以毫不夸张地说,微生物是一切生物时左右,所以可以毫不夸张地说,微生物是一切生物(包括人类)的(包括人类)的(包括人类)的(包括人类)的“老前辈老前辈老前辈老前辈”。现在学习的是第7页,共82页原核生物细胞无核膜,有原核生物细胞无核膜,有一个明显的核区(拟核),一个明显的核区(拟核),核区集中了主要遗传物质,核区集中了主要遗传物质,由一条与类组蛋白相联系的由一条与类组蛋白相联系的双链双链DNADNA构成的染色体组。构成的染色体组。真核生物细胞则是由一条真核生物细胞则是由一条或一条以上的双链或一条以上的双链DNADNA与与组蛋白等结合成的染色体,组蛋白等结合成的
10、染色体,并由核膜包围。并由核膜包围。核、核膜、染色体核、核膜、染色体原核细胞没有独立的内膜原核细胞没有独立的内膜系统,与代谢有关的酶如系统,与代谢有关的酶如呼吸酶合成酶等位于细胞呼吸酶合成酶等位于细胞膜上,因此它的能量代谢膜上,因此它的能量代谢在质膜上进行。在质膜上进行。真核细胞不仅有独立的内真核细胞不仅有独立的内膜系统,还有细胞骨架,膜系统,还有细胞骨架,呼吸酶在线粒体中,有专呼吸酶在线粒体中,有专用的细胞器来完成各项生用的细胞器来完成各项生理功能,如线粒体、叶绿理功能,如线粒体、叶绿体。体。代谢场所代谢场所u 原核微生物和真核微生物的区别原核微生物和真核微生物的区别现在学习的是第8页,共8
11、2页典型的真核典型的真核细细胞胞结结构(构(动动物物典型的真核典型的真核细细胞胞结结构(植物)构(植物)现在学习的是第9页,共82页二、微生物分类和命名二、微生物分类和命名经典分类学:按微生物经典分类学:按微生物表型特征分类表型特征分类微生物系统学:按亲微生物系统学:按亲缘关系和进化规律分缘关系和进化规律分类类表型特征:形态学、生理生化学、生态学等,推断微生物的系统发育。表型特征结合分子水平上的基因型特征(如16S rRNA),探讨微生物进化地位、系统发育关系并进行分类鉴定。微生物分类学的三个任务:分类、鉴定及命名微生物分类学的三个任务:分类、鉴定及命名分类:是根据微生物的相似性和亲缘关系,将
12、微生物归入不同的分类类群。分类:是根据微生物的相似性和亲缘关系,将微生物归入不同的分类类群。鉴定:是确定一个新的分离物属于已经确认的哪个分类类群的过程。鉴定:是确定一个新的分离物属于已经确认的哪个分类类群的过程。命名:是根据国际命名法规给每一微生物类群及种类以科学的名称。命名:是根据国际命名法规给每一微生物类群及种类以科学的名称。现在学习的是第10页,共82页(1)通用的分类单元)通用的分类单元)通用的分类单元)通用的分类单元七级单元七级单元七级单元七级单元 界(界(KingdomKingdom)门(门(PhylumPhylum)纲(纲(ClassClass)目(目(OrderOrder)科(
13、科(FamilyFamily)属(属(GenusGenus)种(种(SpeciesSpecies)n n每一分类单元后可有若干辅助单元,如亚门、亚纲、亚目、亚科等每一分类单元后可有若干辅助单元,如亚门、亚纲、亚目、亚科等每一分类单元后可有若干辅助单元,如亚门、亚纲、亚目、亚科等每一分类单元后可有若干辅助单元,如亚门、亚纲、亚目、亚科等现在学习的是第11页,共82页以以啤酒酵母啤酒酵母为例,它在分类学上的地位是:为例,它在分类学上的地位是:界界(Kindom)(Kindom):真菌界:真菌界 门门(Phyllum)(Phyllum):真菌门:真菌门 纲纲(Class)(Class):子囊菌纲:子
14、囊菌纲 目目(Order)(Order):内孢霉目:内孢霉目 科科(Family)(Family):内孢霉科:内孢霉科 属属(Genus)(Genus):酵母属:酵母属 种种(Species)(Species):啤酒酵母:啤酒酵母现在学习的是第12页,共82页n n界是最大的分类单位,往下依次递小,种是最基本的分类单元。n n在越是大的分类单位中,生物彼此的共同特征越少,亲缘关系越远;在越是小的分类单位中,共同特征越多,亲缘关系越近。现在学习的是第13页,共82页在认识发展过程的不同阶段存在对生物分类的不同观点。在认识发展过程的不同阶段存在对生物分类的不同观点。在认识发展过程的不同阶段存在对生
15、物分类的不同观点。在认识发展过程的不同阶段存在对生物分类的不同观点。两界:两界:两界:两界:动物界和植物界动物界和植物界动物界和植物界动物界和植物界三界:三界:三界:三界:菌物界菌物界菌物界菌物界、动物界和植物界动物界和植物界动物界和植物界动物界和植物界四界:四界:四界:四界:原始生物界、菌界、原始生物界、菌界、原始生物界、菌界、原始生物界、菌界、植物界、动物界(由植物界、动物界(由植物界、动物界(由植物界、动物界(由CopelandCopeland提出)提出)提出)提出)五界:五界:五界:五界:WhittakerWhittaker提出生物五界分类系统,后被提出生物五界分类系统,后被提出生物五
16、界分类系统,后被提出生物五界分类系统,后被MargulisMargulis修改为:修改为:修改为:修改为:原原原原核生物界、原生生物界、真菌界核生物界、原生生物界、真菌界核生物界、原生生物界、真菌界核生物界、原生生物界、真菌界,动物界和植物界动物界和植物界动物界和植物界动物界和植物界六界:六界:六界:六界:我国我国我国我国王大耜王大耜王大耜王大耜教授提出:教授提出:教授提出:教授提出:病毒界、病毒界、病毒界、病毒界、原核生物界、真核原生生物界、真菌界原核生物界、真核原生生物界、真菌界原核生物界、真核原生生物界、真菌界原核生物界、真核原生生物界、真菌界、动物界和植物、动物界和植物、动物界和植物、
17、动物界和植物界界界界生物的界级分类学说生物的界级分类学说现在学习的是第14页,共82页种的定义:微生物的种是一个基本分类单元,它是一大群表形特征高度相似、亲缘关系及其接近、与同属的其他物种有着明显的差异的一大群菌株的总称。新种:指权威性的分类、鉴定手册中从未记载过得一种新分离并鉴定过的微生物。现在学习的是第15页,共82页微生物的常用分类系统微生物的常用分类系统n n细菌细菌细菌细菌:伯杰氏鉴定细菌学手册(第八、第九版)、细菌:伯杰氏鉴定细菌学手册(第八、第九版)、细菌:伯杰氏鉴定细菌学手册(第八、第九版)、细菌:伯杰氏鉴定细菌学手册(第八、第九版)、细菌系统学手册(第一版)系统学手册(第一版
18、)系统学手册(第一版)系统学手册(第一版)n n放线菌放线菌放线菌放线菌:中国科学院微生物研究所编著的放线菌目:中国科学院微生物研究所编著的放线菌目:中国科学院微生物研究所编著的放线菌目:中国科学院微生物研究所编著的放线菌目分科、分属检索表分科、分属检索表分科、分属检索表分科、分属检索表n n真菌真菌真菌真菌:SmithSmith、Alexopoulos Alexopoulos、AinsworthAinsworth的分的分的分的分类系统类系统类系统类系统现在学习的是第16页,共82页n n分类依据:分类依据:形态学特征、表型特征、生理特征、生态特征、血清反应、噬菌体反应等 DNA中G+C%,D
19、NA杂交,DNA-RNA杂交,16S rRNA碱基序列分析碱基序列分析等现在学习的是第17页,共82页形态学特征培养特征、运动性等等特殊的细胞结构、细胞形态及其染色特性、是微生物分类和鉴定的重要依据之一:a)易于观察和比较,尤其是真核微生物和具有特殊 形态结构的细菌;b)许多形态学特征依赖于多基因的表达,具有相对 的稳定性;现在学习的是第18页,共82页生理生化特征与微生物的酶和调节蛋白质的本质和活性直接相关;与微生物的酶和调节蛋白质的本质和活性直接相关;代谢产物等代谢产物等营养类型;营养类型;与氧的关系;与氧的关系;对温度的适应性;对温度的适应性;对对pHpH的适应性;的适应性;对渗透压的适
20、应性;对渗透压的适应性;酶及蛋白质都是基因产物;酶及蛋白质都是基因产物;对微生物生理生化特征的比较也是对微生物基因组的间接比较;对微生物生理生化特征的比较也是对微生物基因组的间接比较;测定生理生化特征比直接分析基因组要容易得多。测定生理生化特征比直接分析基因组要容易得多。这些特征包括:这些特征包括:现在学习的是第19页,共82页 常借助特异性的血清学反应来确定未知菌种、常借助特异性的血清学反应来确定未知菌种、亚种或菌株。亚种或菌株。生态特性 包括在自然界的分布情况,与其他生物有否寄包括在自然界的分布情况,与其他生物有否寄生或共生关系生或共生关系,宿主种类及与宿主关系宿主种类及与宿主关系,有性生
21、殖有性生殖情况情况,生活史等。生活史等。血清学反应现在学习的是第20页,共82页 G GC%C%测定主要用于对表型特征难区分的细菌作出鉴定,并可检验表型特测定主要用于对表型特征难区分的细菌作出鉴定,并可检验表型特征分类的合理性,从分子水平上判断物种的亲缘关系。征分类的合理性,从分子水平上判断物种的亲缘关系。每一种生物都有一定的碱基组成,亲缘关系近的生物,它们应该具每一种生物都有一定的碱基组成,亲缘关系近的生物,它们应该具有相似的有相似的GC%GC%含量;若不同生物之间含量;若不同生物之间GC%GC%含量差别很大,表明它们亲缘含量差别很大,表明它们亲缘关系较远。关系较远。但具有相似但具有相似GC
22、%GC%含量的生物,却并不一定表明它们之间具有近的亲缘关含量的生物,却并不一定表明它们之间具有近的亲缘关系。系。DNA中G+C%使用原则:同一个种内的不同菌株同一个种内的不同菌株GC%GC%含量差别应在含量差别应在4 45%5%以下;同属不同种的以下;同属不同种的差别应低于差别应低于101015%15%;若若2 2个在形态及生理生化特性方面极其相似的菌株,如果其个在形态及生理生化特性方面极其相似的菌株,如果其GC%GC%含量的含量的差别大于差别大于5%5%,则肯定不是同一个种,大于,则肯定不是同一个种,大于15%15%则肯定不是同一个属。则肯定不是同一个属。G+C%G+C%含量的比较主要用于分
23、类鉴定中的含量的比较主要用于分类鉴定中的“否定否定”现在学习的是第21页,共82页16SrRNA16SrRNA的序列高度保守,可精确指示细菌之间的亲缘关的序列高度保守,可精确指示细菌之间的亲缘关系系16SrRNA16SrRNA的大小为的大小为1540bp1540bp左右,所含信息能反映生物界进左右,所含信息能反映生物界进化关系,易操作,适用于各级分类单元化关系,易操作,适用于各级分类单元目前常用的是建立在目前常用的是建立在PCRPCR技术基础上的技术基础上的16SrRNA16SrRNA基因的直基因的直接测序法,方便快捷。接测序法,方便快捷。16SrRNA的核酸序列分析现在学习的是第22页,共8
24、2页(2)微生物命名)微生物命名)微生物命名)微生物命名n n通常以学名命名:常采用通常以学名命名:常采用通常以学名命名:常采用通常以学名命名:常采用二名法二名法二名法二名法 即:一个属名即:一个属名即:一个属名即:一个属名+一个种名(均为拉丁字)一个种名(均为拉丁字)一个种名(均为拉丁字)一个种名(均为拉丁字)注意:属名和种名都要用注意:属名和种名都要用注意:属名和种名都要用注意:属名和种名都要用斜体表示斜体表示斜体表示斜体表示 属名在前,第一个字母大写属名在前,第一个字母大写属名在前,第一个字母大写属名在前,第一个字母大写 种名在后,第一个字母小写种名在后,第一个字母小写种名在后,第一个字
25、母小写种名在后,第一个字母小写现在学习的是第23页,共82页例子:例子:1.1.大肠埃希氏杆菌:大肠埃希氏杆菌:Escherichia coliEscherichia coli 分类学文献中,上述两部分类学文献中,上述两部分还应加写分还应加写3 3项内容,即首次项内容,即首次定名人,现定名人和现名的定定名人,现定名人和现名的定名年分名年分 如:如:Escherichia coliEscherichia coli(MigulaMigula)Castellani andCastellani and Chalmers 1919Chalmers 1919大肠杆菌现在学习的是第24页,共82页2.枯草芽
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