蛋白质结构与功能课件.ppt
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1、关于蛋白质结构与功能现在学习的是第1页,共31页 疏水疏水 相互作用相互作用静电相互作用静电相互作用金属离子配金属离子配位作用位作用折叠折叠结构结构链间链间氫健氫健螺旋螺旋结构结构链内链内氫健氫健二硫健二硫健侧链侧链之间之间氫健氫健稳定蛋白质三级结构的主要作用力稳定蛋白质三级结构的主要作用力现在学习的是第2页,共31页4.9 变性剂可引起蛋白质去折叠变性剂可引起蛋白质去折叠 环境的变化或是化学处理都会引起蛋白质天然构象的破坏,并伴环境的变化或是化学处理都会引起蛋白质天然构象的破坏,并伴随着生物活性的丧失,这一过程称之蛋白质变性随着生物活性的丧失,这一过程称之蛋白质变性。变性剂变性剂天然蛋白天然
2、蛋白天然蛋白天然蛋白天然蛋白天然蛋白去污剂去污剂尿素尿素变性蛋白变性蛋白变性蛋白变性蛋白尿素尿素盐酸胍盐酸胍现在学习的是第3页,共31页核糖核酸酶核糖核酸酶A变性,酶的三级结构和变性,酶的三级结构和活性完全丧失,生成含有活性完全丧失,生成含有8个巯基个巯基的多肽链。的多肽链。加脲和巯加脲和巯基乙醇基乙醇去除脲和巯基乙醇,去除脲和巯基乙醇,又恢复到天然状态又恢复到天然状态核糖核酸酶核糖核酸酶A变性和复性变性和复性现在学习的是第4页,共31页Anfinsen等人用含有等人用含有2-巯基乙醇的巯基乙醇的8M脲的变性剂使核糖核酸酶脲的变性剂使核糖核酸酶A(Rnase A)变性,导致酶的三级结构和催化活
3、性完全丧失,生成)变性,导致酶的三级结构和催化活性完全丧失,生成含有含有8个巯基的多肽链。个巯基的多肽链。如果使变性的酶氧化和再折叠,如果使变性的酶氧化和再折叠,8对巯基可以随机配对的话,那么就有可对巯基可以随机配对的话,那么就有可能生成能生成105种二硫键不同的结构,但具有生物活性的只有一种。事实上种二硫键不同的结构,但具有生物活性的只有一种。事实上当除去还原剂后,在当除去还原剂后,在8M脲的环境下氧化,形成的蛋白质中有脲的环境下氧化,形成的蛋白质中有99都含有都含有不正确的二硫键,而且活性大约是原来酶活性的不正确的二硫键,而且活性大约是原来酶活性的1。如果将还原剂和脲同时都除去,并且稀释还
4、原的蛋白和将它于生理如果将还原剂和脲同时都除去,并且稀释还原的蛋白和将它于生理pH条件条件下暴露在空气中,下暴露在空气中,Rnase A会自发地获得它的天然构象,一套正确的二硫会自发地获得它的天然构象,一套正确的二硫键和充分的酶活性。实验表明正确的二硫键只有当蛋白质折叠成它的天键和充分的酶活性。实验表明正确的二硫键只有当蛋白质折叠成它的天然构象后才能形成。如果向含有拼凑的不正确二硫键的失活形式的蛋白然构象后才能形成。如果向含有拼凑的不正确二硫键的失活形式的蛋白质溶液中加入少量的还原剂,然后缓慢加热,也可以复性。质溶液中加入少量的还原剂,然后缓慢加热,也可以复性。现在学习的是第5页,共31页 一
5、种名叫一种名叫Prion(朊蛋白朊蛋白)的小蛋白质(的小蛋白质(28KD)已经被证实是)已经被证实是疯牛病以及其它相关疾病,如羊的搔痒症以及人类的海绵状脑病的致疯牛病以及其它相关疾病,如羊的搔痒症以及人类的海绵状脑病的致病介质。病介质。PrionsPrions是在神经组织的细胞膜上发现的一种糖蛋白。当是在神经组织的细胞膜上发现的一种糖蛋白。当prionprion蛋蛋白的正常构形(图白的正常构形(图a a)变性折叠成非正常的构形(图)变性折叠成非正常的构形(图b b)时,疾病)时,疾病就发生了。就发生了。羊搔痒症大家都知道,但还从未发现跨物种的传播。但疯牛病羊搔痒症大家都知道,但还从未发现跨物种
6、的传播。但疯牛病就是爆发了,而起因可能是饲料里的羊肉粉末。如果吃了疯牛病发就是爆发了,而起因可能是饲料里的羊肉粉末。如果吃了疯牛病发作的牲畜的肉,则可能引发人类的海绵状脑病。正常的作的牲畜的肉,则可能引发人类的海绵状脑病。正常的PrionPrion蛋白蛋白含有大量的含有大量的螺旋,而病变的蛋白却含有更多的螺旋,而病变的蛋白却含有更多的折叠。这些折叠。这些折叠折叠在蛋白质间相互作用,形成不溶的凝块。摄入的异常在蛋白质间相互作用,形成不溶的凝块。摄入的异常prionprion蛋白利用蛋白利用免疫系统的巨噬细胞在体内运输并最终到达神经组织,然后一直传到脑免疫系统的巨噬细胞在体内运输并最终到达神经组织
7、,然后一直传到脑部。部。疯牛病是由于蛋白变性引起的疯牛病是由于蛋白变性引起的现在学习的是第6页,共31页正常的正常的PrionPrion蛋白含蛋白含有大量的有大量的螺旋螺旋病变的病变的PrionPrion蛋白含蛋白含有更多的有更多的折叠折叠现在学习的是第7页,共31页 4.10 球蛋白还存在着其它一些结构球蛋白还存在着其它一些结构 A.非重复的环结构非重复的环结构转角转角现在学习的是第8页,共31页B.超二级结构超二级结构 超二级结构也称之基元,是二级结构的组合结构。这类结构超二级结构也称之基元,是二级结构的组合结构。这类结构存在于大量的各种不同的蛋白质结构中。超二级结构可能具有一存在于大量的
8、各种不同的蛋白质结构中。超二级结构可能具有一种特定的功能或是作为大的功能单位结构域的一部分种特定的功能或是作为大的功能单位结构域的一部分。螺旋螺旋-环环-螺旋螺旋发卡发卡希腊钥匙希腊钥匙基元基元现在学习的是第9页,共31页结构域结构域 在在三三级级结结构构内内独独立立折折叠叠的的单单位位称称之之结结构构域域。一一个个典典型型的的结结构构域域都都具具有有一一种种特特殊殊的的功功能能,例例如可以结合小分子等。如可以结合小分子等。结结构构域域一一般般由由几几个个超超二二级级结结构构单单位位组组成成的的。结结构构域域的的大大小小变变化化很很大大,范范围围从从25到到300个个氨氨基基酸残基,平均约为酸
9、残基,平均约为100个残基。个残基。右右图图a为为 迂迂回回含含有有通通过过发发夹夹环环连连接接的的反反平平行行 链链。图图b是是一一种种/式式的的折折叠叠桶桶,它它是是由由重重复复的的单单位位组组成成的的,折折叠叠桶桶的的核核心心通通常常都都是疏水结合部位或反应部位。是疏水结合部位或反应部位。迂回迂回/折叠桶折叠桶现在学习的是第10页,共31页4.11.1 血红蛋白是个四聚体蛋白血红蛋白是个四聚体蛋白 Max Perutz经过二十多年的努力通过经过二十多年的努力通过X-射线晶体图确定了马血红蛋射线晶体图确定了马血红蛋白的结构。成年人的血红蛋白是一个由两个白的结构。成年人的血红蛋白是一个由两个
10、 亚基和两个亚基和两个 亚基两亚基两种类型亚基组成的四聚体。种类型亚基组成的四聚体。和和 都很类似于肌红蛋白,只是肽链稍微短一点。都很类似于肌红蛋白,只是肽链稍微短一点。和和 隔着一隔着一个空腔彼此相向(下图)。个空腔彼此相向(下图)。每个每个 亚基是由亚基是由141个氨基酸残基组成,而每个个氨基酸残基组成,而每个 亚基有亚基有146个氨基酸个氨基酸残基。无论是残基。无论是 还是还是 亚基,它们的三级结构几乎与肌红蛋白相同。亚基,它们的三级结构几乎与肌红蛋白相同。血红蛋白是血红蛋白是的二聚体,因为的二聚体,因为 和和 相互作用比相互作用比 与与,和和 之间的之间的相互作用强得多。相互作用强得多
11、。4.11 具有四级结构的蛋白质是球状亚基的组装体具有四级结构的蛋白质是球状亚基的组装体 现在学习的是第11页,共31页现在学习的是第12页,共31页氧与血红蛋白结合的同促效应氧与血红蛋白结合的同促效应氧与血红蛋白结合的同促效应氧与血红蛋白结合的同促效应 血血血血红红红红蛋蛋蛋蛋白白白白存存存存在在在在两两两两种种种种构构构构象象象象:T T态态态态(紧紧紧紧张张张张态态态态)和和和和R R态态态态(松松松松弛弛弛弛态态态态),T T态态态态和和和和R R态态态态常常常常用用用用来来来来由由由由于于于于配配配配体体体体结结结结合合合合引引引引起起起起的的的的两两两两种种种种可可可可互互互互换换
12、换换状状状状态态态态。在在在在本本本本节节节节在在在在配配配配体体体体指指指指的的的的是是是是氧氧氧氧,T T态态态态指指指指的的的的是是是是对对对对氧氧氧氧亲亲亲亲和和和和力力力力低低低低的的的的状状状状态态态态,而而而而R R态态态态指指指指的的的的是是是是对对对对氧氧氧氧亲亲亲亲和和和和力力力力高高高高的的的的状态。状态。状态。状态。当当当当一一一一个个个个与与与与血血血血红红红红蛋蛋蛋蛋白白白白中中中中的的的的一一一一个个个个O2分分分分子子子子亚亚亚亚基基基基结结结结合合合合会会会会增增增增加加加加其其其其他他他他未未未未结结结结合合合合O2的的的的亚亚亚亚基基基基对对对对O2的的的
13、的亲亲亲亲和和和和力力力力。这这这这种种种种效效效效应应应应称称称称为为为为正正正正协协协协同同同同性性性性同同同同促促促促效效效效应应应应,称称称称为为为为正同促效应物。正同促效应物。正同促效应物。正同促效应物。氧与血红蛋白结合的模式如右图所示。氧与血红蛋白结合的模式如右图所示。氧与血红蛋白结合的模式如右图所示。氧与血红蛋白结合的模式如右图所示。现在学习的是第13页,共31页4.11.2 血红蛋白和肌红蛋白的氧合曲线不同血红蛋白和肌红蛋白的氧合曲线不同 血红蛋白血红蛋白血红蛋白血红蛋白肺肺组织组织肌红肌红蛋白蛋白 血红蛋白氧血红蛋白氧合曲线为合曲线为 S 形形 肌红蛋白肌红蛋白氧合曲线为氧合
14、曲线为双曲线形双曲线形现在学习的是第14页,共31页v 血红蛋白和肌红蛋白都能结合氧,氧都是结合在血红蛋白和肌红蛋白都能结合氧,氧都是结合在分子中的血红素辅基上。分子中的血红素辅基上。v 然而血红蛋白是个四聚体分子,可以转运氧,其然而血红蛋白是个四聚体分子,可以转运氧,其氧合曲线是氧合曲线是 S 形形的;肌红蛋白是个单体,只贮存氧,的;肌红蛋白是个单体,只贮存氧,并且可以使氧在肌肉内很容易地扩散,其氧合曲线并且可以使氧在肌肉内很容易地扩散,其氧合曲线是是双曲线形双曲线形的。的。v 肌红蛋白和血红蛋白的生理功能依赖于与辅肌红蛋白和血红蛋白的生理功能依赖于与辅基可逆地结合氧,结合氧的情况可以通过氧
15、结基可逆地结合氧,结合氧的情况可以通过氧结合曲线看出。合曲线看出。现在学习的是第15页,共31页2,3 BPG是血红蛋白的别构效应剂,一分子血红蛋白只有一分子是血红蛋白的别构效应剂,一分子血红蛋白只有一分子2,3 BPG,位于由四个亚基缔合形成的中央孔穴内。,位于由四个亚基缔合形成的中央孔穴内。2,3 BPG将两个链交联在将两个链交联在一起,有助于去氧血红蛋白的构象,促进氧的释放。一起,有助于去氧血红蛋白的构象,促进氧的释放。2,3 BPG的作用的作用现在学习的是第16页,共31页q 2,3-二磷酸二磷酸-D-甘油酸(甘油酸(2,3BPG)是红细胞内)是红细胞内血红蛋白的别构效应剂。血红蛋白的
16、别构效应剂。q 2,3BPG 的存在,可使氧与全血中成熟的血的存在,可使氧与全血中成熟的血红蛋白结合的红蛋白结合的P50大约提高到大约提高到26torr。q 换言之,红细胞中的换言之,红细胞中的2,3BPG实质上是降低实质上是降低了脱氧血红蛋白对氧的亲和性。了脱氧血红蛋白对氧的亲和性。q在红细胞中,在红细胞中,2,3BPG与血红蛋白的浓度几乎与血红蛋白的浓度几乎是等摩尔的。是等摩尔的。现在学习的是第17页,共31页 2,3-二磷酸二磷酸-D-甘油酸甘油酸(2,3 BPG)对血红蛋白)对血红蛋白氧合曲线的影响氧合曲线的影响 肺中肺中pO2(海平面)(海平面)肺中肺中pO2(高高原原4500米米)
17、组织中组织中 pO2氧氧饱饱和和度度 当人从海平面上到当人从海平面上到4500米高原后两天内,米高原后两天内,2,3 BPG的浓度有原来的的浓度有原来的5mM增加到增加到8mM,结果,结果对组织的供氧量又恢复对组织的供氧量又恢复到接近正常水平(到接近正常水平(0.38)。)。如果如果BPG仍维持仍维持5mM水平,对组织的供氧量水平,对组织的供氧量将减少四分之一,为将减少四分之一,为0。30。现在学习的是第18页,共31页 波耳效应波耳效应(Bohr effect)pH对氧饱和曲线对氧饱和曲线的影响的影响现在学习的是第19页,共31页 氧氧结结合合血血红红蛋蛋白白的的另另外外调调节节作作用用涉涉
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