原核基因表达调控精选PPT.ppt
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1、关于原核基因表达调控第1页,讲稿共90张,创作于星期日引言一个体系在需要时被打开,不需要时被关闭。这种“开-关”(on-off)活性是通过调节转录来建立的,也就是说mRNA的合成是可以被调节的。当我们说一个系统处于“off”状态时,也有本底水平的基因表达,常常是每世代每个细胞只合成1或2个mRNA分子。所谓“关”实际的意思是基因表达量特别低,很难甚至无法检测。科学家把这个从DNA到蛋白质的过程称为基因表达(geneexpression),对这个过程的调节就称为基因表达调控(generegulation或genecontrol)。要了解动、植物生长发育的规律、形态结构特征和生物学功能,就必须弄清
2、楚基因表达调控的时间和空间概念,掌握了基因表达调控的秘密,我们手中就有了一把揭示生物学奥妙的金钥匙。第2页,讲稿共90张,创作于星期日基因表达调控主要表现在以下几个方面:转录水平上的调控(transcriptionalregulation);mRNA加工成熟水平上的调控(differentialprocessingofRNAtranscript);翻译水平上的调控(differentialtranslationofmRNA).原核生物中,营养状况(nutritionalstatus)和环境因素(environmentalfactor)对基因表达起着举足轻重的影响。在真核生物尤其是高等真核生物中
3、,激素水平(hormonelevel)和发育阶段(developmentalstage)是基因表达调控的最主要手段,营养和环境因素的影响力大为下降。第3页,讲稿共90张,创作于星期日6.1.1 Discovery of Operon 1961年年,F.Jacob&J.Monod提出提出,此后不断完善。此后不断完善。获获19651965年年诺贝尔生理学和医学奖诺贝尔生理学和医学奖1940年,年,Monod发现:细菌在含葡萄糖和乳糖的培养基上生长发现:细菌在含葡萄糖和乳糖的培养基上生长时,细菌先利用葡萄糖,葡萄糖用完后,才利用乳糖;在糖源转时,细菌先利用葡萄糖,葡萄糖用完后,才利用乳糖;在糖源转变
4、期,细菌的生长会出现停顿。即产生变期,细菌的生长会出现停顿。即产生“二次生长曲线二次生长曲线”。文献:细胞中存在两种酶,即组成酶与诱导酶文献:细胞中存在两种酶,即组成酶与诱导酶1947年,报告:年,报告:“酶的适应现象及其在细胞分化中的意义酶的适应现象及其在细胞分化中的意义”Francis JacobJacques Monod6.1 乳糖操纵元乳糖操纵元第4页,讲稿共90张,创作于星期日1951年,年,Monod与与Jacob合作,发现两对基因:合作,发现两对基因:Z基因基因:与合成:与合成-半乳糖苷酶有关;半乳糖苷酶有关;I基因基因:决定细胞对诱导物的反应。:决定细胞对诱导物的反应。Szil
5、ard:I基因决定阻遏物的合成,当阻遏物存在时,基因决定阻遏物的合成,当阻遏物存在时,酶无法合成,只有有诱导物存在,才能去掉该阻遏物。酶无法合成,只有有诱导物存在,才能去掉该阻遏物。Jacob:结构基因旁有开关基因(:结构基因旁有开关基因(操纵基因操纵基因),阻),阻遏物通过与开关基因的结合,控制结构基因的表达。遏物通过与开关基因的结合,控制结构基因的表达。第5页,讲稿共90张,创作于星期日乙酰基转移酶乙酰基转移酶半乳糖苷半乳糖苷透性酶透性酶-半乳糖苷酶半乳糖苷酶操作位点操作位点乳糖操纵元结构结构调节基因调节基因第6页,讲稿共90张,创作于星期日操纵元操纵元是一种完整的具有特定功能的细菌基因表
6、达和调是一种完整的具有特定功能的细菌基因表达和调节的单位,包括节的单位,包括调节基因调节基因,操纵位点操纵位点,结构基因结构基因,组,组成一个控制单元成一个控制单元结构基因:结构基因:产生产生mRNA,合成蛋白质合成蛋白质操纵位点操纵位点 promotor,operator:启动子结合位点:启动子结合位点调节基因:产生调节蛋白调节基因:产生调节蛋白(与操纵位点结合)(与操纵位点结合)结构基因不转录结构基因不转录 诱导物存在时,可与阻遏蛋白结合诱导物存在时,可与阻遏蛋白结合 结构基因转录结构基因转录Control elementStructural genes第7页,讲稿共90张,创作于星期日6
7、.1.2酶的诱导现象-半乳糖苷酶半乳糖苷酶第8页,讲稿共90张,创作于星期日分解底物的酶只有在底物存在时才出现!无乳糖时,几个无乳糖时,几个-gal/cell 加入乳糖时,加入乳糖时,5000个个 再去掉乳糖,再去掉乳糖,-gal mRNA下降下降 乳糖能激发乳糖能激发-gal mRNA的合成的合成 乳糖的诱导作用是由酶前体转化而来,还是诱导新酶合乳糖的诱导作用是由酶前体转化而来,还是诱导新酶合成?成?培养基(培养基(35S-aa,无乳糖)无乳糖)E.coli繁殖繁殖 培养基(无培养基(无35S-aa,加入乳糖)加入乳糖)-gal(无无35S)第9页,讲稿共90张,创作于星期日6.1.3调控机
8、理1 调控区结构调控区结构 lacI,1045bp,独立,独立PiP,82bp,821O,35bp,728lacZYA第10页,讲稿共90张,创作于星期日体外结合竞争实验:阻遏物RNApol,offRNApol阻遏物,on2.阻遏状态阻遏状态第11页,讲稿共90张,创作于星期日3 诱导状态诱导状态诱导物诱导物诱导物诱导物诱导作用:在可诱导的操纵元中,加入诱导作用:在可诱导的操纵元中,加入对基因表达有调节作用的小分子后,开对基因表达有调节作用的小分子后,开启基因的转录活性启基因的转录活性第12页,讲稿共90张,创作于星期日4诱导物不是乳糖生成生成lac诱导物诱导物乳糖代谢乳糖代谢Allolcto
9、se 异构乳糖异构乳糖 别乳糖别乳糖细胞内细胞内-半乳糖苷酶来源半乳糖苷酶来源?第13页,讲稿共90张,创作于星期日gratuitousinducer安慰诱导物义务诱导物可诱导半乳糖苷酶产生,但可诱导半乳糖苷酶产生,但不是其底物不是其底物IPTG,异丙基半乳糖苷,异丙基半乳糖苷TMG,巯甲基半乳糖苷,巯甲基半乳糖苷ONPG,O-硝基半乳糖苷硝基半乳糖苷在研究诱导作用时,很少使用乳糖在研究诱导作用时,很少使用乳糖在研究诱导作用时,很少使用乳糖在研究诱导作用时,很少使用乳糖第14页,讲稿共90张,创作于星期日6.1.4阻遏蛋白的作用机制1 阻遏蛋白结构阻遏蛋白结构38KD,4 聚体聚体,一个亚基结
10、合一个一个亚基结合一个IPTG分子分子lacI 组成型转录组成型转录 Pi 弱启动子,弱启动子,510个个cell具有二重性具有二重性 阻止转录(与阻止转录(与lacO结合)结合)开始转录(与开始转录(与诱导物诱导物结合)结合)第15页,讲稿共90张,创作于星期日阻遏蛋白的结构域 头段头段,-NH2端,端,lacO结合结合区区 绞链区绞链区 核心段核心段,-COOH,诱导物结合区诱导物结合区第16页,讲稿共90张,创作于星期日4个亚基的核心片段接触形成四聚体第17页,讲稿共90张,创作于星期日第18页,讲稿共90张,创作于星期日 对称轴,对称轴,+11 对称序列,对称序列,6bp2.阻遏蛋白的
11、结合位点阻遏蛋白的结合位点lacO的结构的结构第19页,讲稿共90张,创作于星期日3阻遏蛋白对RNApol功能的影响阻遏蛋白和阻遏蛋白和RNA pol可同时与可同时与DNA结合结合 RNA pol 与启动子结合的平衡常数与启动子结合的平衡常数 1.9X107 有阻遏蛋白时有阻遏蛋白时,2.5X109结合着的结合着的RNA pol不能转录不能转录.但加入诱导物后但加入诱导物后,释放释放出阻遏蛋白出阻遏蛋白,变为开放型启动子复合物变为开放型启动子复合物.阻遏蛋白实际上使阻遏蛋白实际上使RNA pol贮存在启动子上。贮存在启动子上。这一模式是否存在于其它操纵元系统中?这一模式是否存在于其它操纵元系统
12、中?第20页,讲稿共90张,创作于星期日+glucose-glucoseTime(hr)Units of-galactosidase+lactoseGlucose added6.1.5lacoperon的正调控1代谢物阻遏效应实验,在实验,在lacGlu培养基上培养基上 E.coli只利用只利用G,只有,只有G 耗尽时,才会利用耗尽时,才会利用lac葡萄糖抑制葡萄糖抑制lac mRNA的转录:的转录:可阻止诱导物引起的阻遏物失活效应可阻止诱导物引起的阻遏物失活效应 仅去掉阻遏物并不能启动仅去掉阻遏物并不能启动lac基因表达基因表达,有其它因素有其它因素参与参与第21页,讲稿共90张,创作于星期
13、日葡萄糖对葡萄糖对lac操纵元表达的抑制操纵元表达的抑制是间接的是间接的 葡萄糖的降解是通过葡萄糖的降解是通过cAMP与与 CAP结合起作用的结合起作用的 cAMP:环化腺苷酸环化腺苷酸CAP,catabolite activator protein 由由crp编码编码CRP,catabolite receptor protein第22页,讲稿共90张,创作于星期日第23页,讲稿共90张,创作于星期日2CAP结合位点CAP为二聚体,为二聚体,45KD,被,被cAMP激活激活结合位点结合位点22bp I -70 -50 II-50 -40第24页,讲稿共90张,创作于星期日由于序列的差异,使不同
14、基因受cAMP激活的水平不同结合位点序列保守结合位点序列保守第25页,讲稿共90张,创作于星期日3CAP的结合对DNA构型的影响DNA弯曲弯曲弯曲点位于弯曲点位于CAP结合位点二重对称的中心结合位点二重对称的中心弯曲使弯曲使CAP能与启动子上的能与启动子上的RNA pol 接触接触第26页,讲稿共90张,创作于星期日(1)CAP结合位点与结合位点与转录起始点的位置转录起始点的位置CAP与与转录起始点转录起始点的的距离,相距数个整双距离,相距数个整双螺旋螺旋CAP结合位点在结合位点在启动启动子子的上下游,都能发的上下游,都能发挥作用挥作用4CAP对转录的影响第27页,讲稿共90张,创作于星期日(
15、2)基因转录对cAMPCAP系统的依赖性,与启动子本身的效率有关cAMP-CAP复合物的结合,使位点复合物的结合,使位点II附近的富含附近的富含GC区区域双螺旋结构稳定性降低,因而域双螺旋结构稳定性降低,因而-10区的熔解温度降低,区的熔解温度降低,促进开放型启动子复合物的形成促进开放型启动子复合物的形成第28页,讲稿共90张,创作于星期日(3)CAP激活转录的方式CAP直接作用于直接作用于RNA pol 亚基亚基 缺失缺失RNA pol 亚基亚基的的C末端时,失去受末端时,失去受CAP激活的能力激活的能力作用于作用于DNA,改变其,改变其结构结构第29页,讲稿共90张,创作于星期日6.1.6
16、lacoperon的其它问题1lac operon的功能是在的功能是在正负正负两个调控体系的协调作用两个调控体系的协调作用(coordinateregulation)下实现的。下实现的。阻遏蛋白封闭转录时,阻遏蛋白封闭转录时,CAPCAP不发挥作用;如没有不发挥作用;如没有CAPCAP加强转录,即使阻遏蛋白从加强转录,即使阻遏蛋白从P P上解上解聚仍无转录活性聚仍无转录活性CAP组成型合成,所以组成型合成,所以cAMPCAP复合物取决于复合物取决于cAMP含含量量腺苷酸环化酶位于细胞膜上,其活性与葡萄糖运输的酶有关,腺苷酸环化酶位于细胞膜上,其活性与葡萄糖运输的酶有关,因此因此cAMPCAP调
17、控乳糖、半乳糖、阿拉伯糖等糖类代谢有关调控乳糖、半乳糖、阿拉伯糖等糖类代谢有关的酶的酶降解物敏感型操纵元:只要有葡萄糖存在,这些操纵元就不降解物敏感型操纵元:只要有葡萄糖存在,这些操纵元就不表达表达 第30页,讲稿共90张,创作于星期日2.A基因及其生理功能基因及其生理功能 编码编码-半乳糖苷乙酰基转移酶,使半乳糖苷乙酰化。该酶不参与半乳糖苷乙酰基转移酶,使半乳糖苷乙酰化。该酶不参与乳糖代谢!乳糖代谢!生理意义:在细胞中有许多能被半乳糖苷酶降解的半乳糖苷生理意义:在细胞中有许多能被半乳糖苷酶降解的半乳糖苷类物质,其分解产物不能进一步代谢,积累,抑制细胞生类物质,其分解产物不能进一步代谢,积累,
18、抑制细胞生长。半乳糖苷乙酰化后,即无毒长。半乳糖苷乙酰化后,即无毒.所以所以lacA虽不在乳糖降解虽不在乳糖降解中起作用,但可抑制有害物质的积累中起作用,但可抑制有害物质的积累3.lac基因产物数量基因产物数量,1:0.5:0.2 不同酶的数量差异不同酶的数量差异,是由于在翻译水平上的调节是由于在翻译水平上的调节.方式有二方式有二:核糖核糖体脱离体脱离:多顺反子的差别性翻译多顺反子的差别性翻译 内切酶作用内切酶作用:在在lac mRNA分子内部,分子内部,a基因比基因比z基因更易受内基因更易受内切酶作用切酶作用第31页,讲稿共90张,创作于星期日Summary第32页,讲稿共90张,创作于星期
19、日第33页,讲稿共90张,创作于星期日Summary of lac operon regulationGlucosecAMPLactoseTranscription of lac mRNAHighLowPresentlow rate of expressionHighLowAbsentessentially noneLowHighAbsentessentially noneLowHighPresenthigh rate of expression第34页,讲稿共90张,创作于星期日6.2Trpoperon生物细胞中的氨基酸合成,生物细胞中的氨基酸合成,也受操纵元的调节。细胞需要某种也受操纵元的
20、调节。细胞需要某种氨基酸时,其基因即表达,不需要时基因关闭,达到经济的原氨基酸时,其基因即表达,不需要时基因关闭,达到经济的原则。则。第35页,讲稿共90张,创作于星期日trpR,阻遏蛋白阻遏蛋白P,-40+18 O,-21+1L,+1+162结构基因结构基因t,A下游下游36bp,不依赖不依赖p t,t下游下游250bp,依赖,依赖p 6.2.1基因组成第36页,讲稿共90张,创作于星期日sne298第37页,讲稿共90张,创作于星期日6.2.2Trpoperon的阻遏系统1 Trp R 四聚体四聚体第38页,讲稿共90张,创作于星期日阻遏蛋白trp有活性的阻遏物SNE299trp O 不转
21、录不转录第39页,讲稿共90张,创作于星期日2 阻遏蛋白的结合位点阻遏蛋白的结合位点 trpO -21 +1,反向重复序列,反向重复序列trpP -40 +18活性阻遏物与活性阻遏物与trpO 的结合与的结合与RNA pol与启动子的结合与启动子的结合发生竞争发生竞争SNE299第40页,讲稿共90张,创作于星期日3阻遏系统主管转录是否启动,主管转录是否启动,在缺乏在缺乏Trp时,时,mRNA起始合成,但不能自动延伸,起始合成,但不能自动延伸,一般在一般在trpE之前终止转录之前终止转录 粗调开关粗调开关第41页,讲稿共90张,创作于星期日6.2.3弱化作用attenuation1 弱化子,衰
22、减子,弱化子,衰减子,前导前导RNA,140bp第42页,讲稿共90张,创作于星期日弱化子,弱化子,弱化子,弱化子,衰减子,衰减子,衰减子,衰减子,第43页,讲稿共90张,创作于星期日序列分析发现,其中4个片段进行配对,形成不同的二级结构TerminatorTerminator第44页,讲稿共90张,创作于星期日S312POE4321LDNARNAATGTGA2 trp codons14322前导肽14aa第45页,讲稿共90张,创作于星期日第46页,讲稿共90张,创作于星期日3 3 转转录录弱弱化化作作用用Lack of trp Lack of trp Lack of aminoacyl t
23、RNA Lack of aminoacyl tRNA Ribosome pause at trp Ribosome pause at trp codons,occluding codons,occluding sequence 1sequence 1Form 2:3 hairpin Form 2:3 hairpin anti-terminatoranti-terminatoranti-terminatoranti-terminator Transcription into trpE Transcription into trpE and beyond and beyond 第47页,讲稿共90
24、张,创作于星期日High trp High trp Trp is inserted at the Trp is inserted at the trp codons trp codons Translate to the end of Translate to the end of leader message leader message Ribosome occlude sequence 2Ribosome occlude sequence 2Terminate transcription at Terminate transcription at(3:4 form(3:4 form te
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