第六章基因的转移与重组体的筛选和鉴定.ppt
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1、第六章基因的转移与重第六章基因的转移与重第六章基因的转移与重第六章基因的转移与重组体的筛选和鉴定组体的筛选和鉴定组体的筛选和鉴定组体的筛选和鉴定现在学习的是第1页,共24页一、粘性末端的连接一、粘性末端的连接DNA连连接接酶酶把把相相互互靠靠近近的的5端端磷磷酸酸与与3-OH连到一起连到一起单酶切、双酶切单酶切、双酶切第一节第一节 DNA的体外重组的体外重组DNA的的体体外外重重组组:将将目目的的基基因因与与载载体体连连接接,这这种种重重新新组组合合的的DNA称为重组称为重组DNA。现在学习的是第2页,共24页(一)(一)直接连接直接连接T4 DNA连接酶虽然能连接平末端,但效率很低,只有粘性
2、连接酶虽然能连接平末端,但效率很低,只有粘性末端的末端的110%。5 5 5 5 3 3 3 3-OH-OH-P-PP-P-HO-HO-5 3-OH-PP-HO-5 3 二、平末端(二、平末端(blunt end)的连接)的连接现在学习的是第3页,共24页(1)同聚加尾法)同聚加尾法 (二)(二)人工加尾形成人工加尾形成“粘性末端粘性末端”DNA末端转移酶末端转移酶能在没有模板的情况下给能在没有模板的情况下给DNA的的3-OH端端加上脱氧核苷酸。加上脱氧核苷酸。原理:原理:分别给载体和插入片断加上分别给载体和插入片断加上互补的互补的核苷酸。核苷酸。加尾碱基互补加尾碱基互补现在学习的是第4页,共
3、24页缺点:缺点:优点:优点:能把任何片能把任何片段连接起来段连接起来操作繁琐;操作繁琐;外源片段难以回收外源片段难以回收;同聚物尾巴影响外源基同聚物尾巴影响外源基因表达。因表达。非酶切位点现在学习的是第5页,共24页(2)衔接物()衔接物(linker)连接)连接Linker:用化学合成法合成的一段用化学合成法合成的一段10-12bp的,具有一个或数个限制的,具有一个或数个限制性内切酶识别位点的性内切酶识别位点的平末端双链寡核苷酸平末端双链寡核苷酸GGAATTCC CCTTAAGGEcoR I linker:(二)(二)人工加尾形成人工加尾形成“粘性末端粘性末端”现在学习的是第6页,共24页
4、(1)多核苷酸激酶处理)多核苷酸激酶处理(2)T4连接酶连接连接酶连接(3)限制性内切酶消化)限制性内切酶消化(4)目的片段与载体连接)目的片段与载体连接现在学习的是第7页,共24页(二)(二)人工加尾形成人工加尾形成“粘性末端粘性末端”(3)DNA接头接头(adapter)连接法)连接法 adapter一头平末端、另一头粘性末端(某种酶切位点序列)一头平末端、另一头粘性末端(某种酶切位点序列)Blunt-ended DNA5p-GATCCCGG-OH3 3HO-GGCC-p5 BamHI adapterP-P5p-GATCCCGG-GGCC-CCGG-GGCCCTAG-P5 现在学习的是第8
5、页,共24页接头与接头以粘末端连接,影响与接头与接头以粘末端连接,影响与DNA片段的连接片段的连接 优点:优点:连上后就能用。连上后就能用。缺点:缺点:先先用用小小牛牛肠肠碱碱性性磷磷酸酸酶酶(CIP)处处理理接接头头,水水解解掉掉其其5端端的磷酸,防止自我连接。的磷酸,防止自我连接。防止自我连接防止自我连接5p-GATCCCGG-GGCC-CCGG GGCCCTAG-p5 现在学习的是第9页,共24页Blunt-ended DNA5p-GATCCCGG-3 GGCC-p5 BamHI adapterP-P 5HO-GATCCCGG-GGCC CCGG-GGCCCTAG-OH5 5HO-GAT
6、CCCGG3 GGCC-OH5 nick缺口缺口nick缺口缺口HO-OHCIP处理处理T4 ligase虽然有缺口,但仍然能与虽然有缺口,但仍然能与DNA片断连接片断连接T4多核苷酸激酶处理使多核苷酸激酶处理使5磷酸化磷酸化现在学习的是第10页,共24页三、三、PCR产物的连接产物的连接1.1.在引物的在引物的55端设计酶切位点端设计酶切位点符合载体的多克隆位点;符合载体的多克隆位点;(1 1)设计原则)设计原则(2 2)带酶切位点的引物的结构)带酶切位点的引物的结构33端端151520bp20bp与模板互补;与模板互补;55端内切酶识别序列端内切酶识别序列保护碱基保护碱基避免与所扩增的避免
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- 第六 基因 转移 重组 筛选 鉴定
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