蛋白质的合成过程课件.ppt
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1、关于蛋白质的合成过程现在学习的是第1页,共54页植物细胞中蛋白质合成的部位植物细胞中蛋白质合成的部位More than 20,000 proteins50-10030-40现在学习的是第2页,共54页一、蛋白质合成的一般特征:一、蛋白质合成的一般特征:蛋白质生物合成的方向:蛋白质生物合成的方向:N端端C端;端;mRNA的转录方向:的转录方向:53 蛋白质合成除需要蛋白质合成除需要aa,核糖体,核糖体,mRNA,tRNA外,还需要外,还需要ATP、GTP,一系列,一系列辅助因子。辅助因子。现在学习的是第3页,共54页二、蛋白质合成的过程二、蛋白质合成的过程1、氨基酸的、氨基酸的活化活化;2、蛋白
2、质合成的、蛋白质合成的起始起始;3、蛋白质合成的、蛋白质合成的延伸延伸;4、蛋白质合成的、蛋白质合成的终止终止;现在学习的是第4页,共54页(一)、氨基酸的活化:(一)、氨基酸的活化:1、E.Coli氨基酸的活化氨基酸的活化:由高度特异的氨酰由高度特异的氨酰-tRNA合成酶合成酶 (aminoacyl-tRNA synthetase)催化,反应分两步:催化,反应分两步:第一步:第一步:第一步:第一步:现在学习的是第5页,共54页总反应式总反应式 第二步:第二步:总反应式:总反应式:2、真核生物的氨基酸的活化与原核生物相同、真核生物的氨基酸的活化与原核生物相同。现在学习的是第6页,共54页生成的
3、氨酰生成的氨酰tRNA的化学结构的化学结构现在学习的是第7页,共54页生成的氨酰生成的氨酰tRNA的空间构象的空间构象现在学习的是第8页,共54页(二)、蛋白质合成的起始:(二)、蛋白质合成的起始:(1 1)、多肽链合成起始需要专一的)、多肽链合成起始需要专一的tRNA:1、大肠杆菌蛋白质合成的起始:、大肠杆菌蛋白质合成的起始:A A、起始密码子是、起始密码子是、起始密码子是、起始密码子是AUGAUG,与之相对应的,与之相对应的tRNAtRNA为起始为起始为起始为起始tRNAtRNA(记为记为记为记为tRNAtRNAfMefMet t),这),这),这),这种种种种氨酰氨酰氨酰氨酰-tRNA-
4、tRNA 通常通常通常通常被被被被缩写缩写为为为为fMet-tRNAfMet-tRNAfMet t。而与基因中密码子。而与基因中密码子。而与基因中密码子。而与基因中密码子AUGAUGAUGAUG相对应的相对应的相对应的相对应的tRNAtRNAtRNAtRNA是另是另外一种外一种tRNAtRNAtRNAtRNA,记为,记为,记为,记为tRNAmm。现在学习的是第9页,共54页(2 2)、多肽链合成起始需要甲酰甲硫氨)、多肽链合成起始需要甲酰甲硫氨酸:酸:tRNAtRNAfMet t通通过过两两步步步步反应反应反应反应获得获得被被被被修饰修饰的氨基酸。的氨基酸。A A、tRNAtRNAfMefMe
5、fMefMet t t t与与与与MetMetMetMet相连得到相连得到Met-tRNAMet-tRNAMet-tRNAMet-tRNAfMefMefMefMet t t t;B B B B、N10N10N10N10甲酰甲酰FH4FH4FH4FH4为甲基供体,为甲基供体,为甲基供体,为甲基供体,甲酰基封锁了甲酰基封锁了甲酰基封锁了甲酰基封锁了Met-Met-Met-Met-tRNAtRNAtRNAtRNAfMefMefMefMet t 上的上的上的上的MetMetMetMet上的上的上的上的NH2NH2NH2NH2,得到得到得到得到fMet-tRNAfMet-tRNAfMet-tRNAfMe
6、t-tRNAfMefMefMefMet t t t ;甲酰基的作用:甲酰基的作用:甲酰化并不是必不可少的甲酰化并不是必不可少的,因为没有甲酰化的,因为没有甲酰化的Met-Met-Met-Met-tRNAtRNAtRNAtRNAfMefMet t 也能行使起始的功能,但甲酰化后也能行使起始的功能,但甲酰化后,能提高能提高能提高能提高fMet-tRNAfMet-tRNAfMefMet t 的的的的起始起始起始起始效率效率。现在学习的是第10页,共54页起始起始起始起始tRNAtRNA由甲硫氨酰由甲硫氨酰由甲硫氨酰由甲硫氨酰-tRNA-tRNA甲酰化甲酰化 tRNAfMefMetMetMet-tRN
7、AfMefMet t甲酰基转移酶甲酰基转移酶N10甲酰甲酰FH4FH4(fMettRNAfMet t)甲酰基甲酰基AARSAARS现在学习的是第11页,共54页N甲酰甲硫氨酸甲酰甲硫氨酸现在学习的是第12页,共54页MetATP/Mg 2+tRNAm MettRNAf MetMet-tRNAmMetMet-tRNAfMetfMet-tRNAfMetN10-ormyltetrahydrofolateTransformylaseAMP/Mg2+PPiAMP/Mg2+PPiMet-tRNAMet-tRNAmmMetMet只只只只识别内识别内识别内识别内部部部部的的的的AUG AUG 密码子,它的密码
8、子,它的密码子,它的密码子,它的甲硫甲硫甲硫甲硫氨酸氨酸氨酸氨酸不不不不能能能能被被被被甲甲甲甲酰酰酰酰化化化化现在学习的是第13页,共54页(3)、起始)、起始Met的水解:的水解:几乎所几乎所有蛋白质合成的有蛋白质合成的起起始始氨基酸氨基酸都都都都相同,但相同,但并不是所并不是所并不是所并不是所有的蛋白质第一个氨基酸是甲酰甲硫氨酸有的蛋白质第一个氨基酸是甲酰甲硫氨酸有的蛋白质第一个氨基酸是甲酰甲硫氨酸有的蛋白质第一个氨基酸是甲酰甲硫氨酸;A A、对于末端是甲硫氨酸的蛋白质:是、对于末端是甲硫氨酸的蛋白质:是由由专专专专一的一的去去甲甲酰酰化化酶酶(Deformylase)(Deformyl
9、ase)催化催化去掉甲酰基团去掉甲酰基团;B B、对于末端不是、对于末端不是N N N N甲酰甲硫氨酸的蛋白质:在甲酰甲硫氨酸的蛋白质:在甲酰甲硫氨酸的蛋白质:在甲酰甲硫氨酸的蛋白质:在第一步第一步第一步第一步的基础上,的基础上,的基础上,的基础上,末末端端的的甲硫甲硫甲硫甲硫氨酸会氨酸会被被被被一一种称为种称为氨肽氨肽酶酶(Aminopeptidase)的的酶去掉酶去掉;现在学习的是第14页,共54页细菌细菌细菌细菌中中中中新新合成的蛋白质以合成的蛋白质以甲甲酰甲酰甲硫硫氨酸氨酸氨酸氨酸开始开始,但但在蛋白在蛋白质质合成合成合成合成期期间间甲甲酰基被去掉,有酰基被去掉,有时时甚至甚至甲硫甲硫
10、氨酸也氨酸也氨酸也氨酸也被除被除掉掉掉掉。现在学习的是第15页,共54页(4)、大肠杆菌对起始密码子的利用:)、大肠杆菌对起始密码子的利用:原核生物的原核生物的起始密码子为起始密码子为AUG AUG 或或GUG(GUG(偶尔也识别偶尔也识别UUG)UUG)。起始密码子被识别的程度不同,若将起始密码子被识别的程度不同,若将AUG AUG 替换为替换为GUGGUG,则起始的效率将会,则起始的效率将会降低大约一半降低大约一半降低大约一半降低大约一半,若替换为,若替换为UUGUUG,则效,则效,则效,则效率将会在这个基础上又降低大约一半。率将会在这个基础上又降低大约一半。率将会在这个基础上又降低大约一
11、半。率将会在这个基础上又降低大约一半。AUGAUGAUGAUG和和GUGGUGGUGGUG是是是是兼职密码子兼职密码子兼职密码子兼职密码子,它们既可以作为起始密码子,它们既可以作为起始密码子,作为肽链合成的作为肽链合成的起始信号起始信号,这时与之对应的氨基酸是,这时与之对应的氨基酸是甲酰甲酰MetMet。另外也可作肽链内部相应。另外也可作肽链内部相应aaaa的密码,这时的密码,这时AUGAUGAUGAUG编码编码编码编码MetMetMetMet,GUGGUG编码编码valvalvalval。现在学习的是第16页,共54页(5)、)、mRNA上上核糖体结合位点核糖体结合位点序列特点:序列特点:A
12、 A、起始序列的确定方法:、起始序列的确定方法:核糖体结合到核糖体结合到核糖体结合到核糖体结合到mRNAmRNA上上上上阻止肽链的延伸,加核酸阻止肽链的延伸,加核酸阻止肽链的延伸,加核酸阻止肽链的延伸,加核酸酶消化未被保护的酶消化未被保护的酶消化未被保护的酶消化未被保护的mRNAmRNA对获得的序列进行分析对获得的序列进行分析对获得的序列进行分析对获得的序列进行分析现在学习的是第17页,共54页B、mRNA上核糖体结合位点(上核糖体结合位点(RBS)序列)序列的特点:的特点:AUG(或或偶尔偶尔GUG 或或UUG)起起起起始始始始密码子密码子密码子密码子总总是位于是位于被被保保保保护护的的序序
13、列中。列中。在在AUG 上上上上游游10 10 个个核苷酸核苷酸核苷酸核苷酸以以内内有一有一段段序序序序列列接接近近或或同下同下面面的的的的序序列完全相同列完全相同:5 AGGAGGAGGAGG 3这这这这段多段多嘌呤嘌呤的的的的序序列列被被称为称为称为称为SD(Shine-Dalgarno)序序列。列。它与它与16S rRNA上上靠靠近近3一一段保守段保守段保守段保守序序序序列列配配配配对对对对:3 UCCUCC 5现在学习的是第18页,共54页v SD SD序列的意义:序列的意义:q 对对SD 序序列进列进行点突变行点突变,发发现现mRNA 无法无法被被翻译翻译。q 说明说明SDSD序列是
14、原核生物蛋白质翻译所必须的。序列是原核生物蛋白质翻译所必须的。现在学习的是第19页,共54页(6)、原核生物中)、原核生物中起始辅助因子起始辅助因子:IF-1 9.5kd 与与与与 30S 30S 亚亚亚亚基结合,成基结合,成基结合,成基结合,成为为起起起起始始始始复合复合物物物物的的的的一一一一部部部部分分分分,促进,促进IF-2IF-2IF-2IF-2的释放的释放的释放的释放;IF-2 95kd-117kd IF-2 95kd-117kd 与与与与GTP结合结合结合结合活化,促使活化,促使fMet-tRNAfMet t 选择性的选择性的 结合在结合在30S30S亚基上亚基上IF-3 20k
15、d 促使促使促使促使30S30S亚基亚基亚基亚基结合于结合于结合于结合于mRNA起始部起始部位位;因因 子子大大 小小作作 用用现在学习的是第20页,共54页inactive 70S ribosomeSD sequence30S initiation complex(7)、)、30S起始复合物的形成:起始复合物的形成:IFIF2 2与与与与GTPGTP结结结结合合合合现在学习的是第21页,共54页70S initiation complexGDP+Pi(8)、)、70S起始复合物的形成起始复合物的形成现在学习的是第22页,共54页 起始复合物形成过程的特点:起始复合物形成过程的特点:A、通通过
16、与过与过与过与fMet-tRNAfMet-tRNAfMefMet t专专一结合,一结合,IF-2使使使使起起起起始始tRNAtRNA而而而而不是其他不是其他的的MetMet-tRNA参参加加加加起起始始反应反应。B B、IF-2具具具具有有依赖依赖核糖体核糖体核糖体核糖体的的GTPaseGTPase活性活性:当当当当50S 50S 亚亚基基连连接上接上,形形成完成完成完成完整整的核糖体的核糖体时时,GTPGTP被被水水解。解。GTP的的的的水水解解对对核糖体结核糖体结构构的的改变改变有有所所帮帮助,使助,使70S 核糖体成核糖体成为为有有活性的结合体活性的结合体。C C、fMet-tRNAfM
17、et-tRNAfMet t是进入核糖体的是进入核糖体的P位,而不是位,而不是A位。位。现在学习的是第23页,共54页2、真核生物起始复合体的形成:、真核生物起始复合体的形成:(1)、真核生物)、真核生物mRNA的特点:的特点:每每每每个个真真核核生物生物的的的的mRNA mRNA 都是都是单单单单顺顺反子反子反子反子,但每分但每分但每分但每分子的子的子的子的mRNA mRNA 通常通常都比都比编编码蛋白质码蛋白质所所必需必需必需必需的的长长长长度度长长。真真真真核核生物细胞质生物细胞质中中mRNA 的的的的平平均均长长长长度度为为1000-2000 个个碱碱基基,在,在,在,在5 5端端有一个
18、有一个甲甲酰酰化化化化帽帽子,在子,在3端带端带有有100-200 100-200 个个碱碱基的基的poly(A)。有有有有时时时时AUG起起始始密码子密码子位于位于mRNA 5末末端端40个个碱碱基基以以内内,使,使帽帽结结构和构和AUG都位于都位于核糖体结合的核糖体结合的核糖体结合的核糖体结合的范范围围之之内内。但但但但最最远远可可达达到到1000 个个碱碱基。并且有基。并且有二级发卡结构。二级发卡结构。现在学习的是第24页,共54页(2)、真核生物起始)、真核生物起始tRNA的特点:的特点:A A、真核生物起、真核生物起始始始始tRNAtRNAtRNAtRNA为为tRNAi,延伸中负责运
19、转,延伸中负责运转MetMetMetMet为为为为tRNAm,二者携带的氨基酸均为,二者携带的氨基酸均为MetMet。B B、在、在酵母酵母酵母酵母中,中,起起始始tRNAitRNAi至至少少少少有有两两两两个个独特独特独特独特的的特点特点:它具有它具有特特特特殊殊的的三三级级结结构构;在在64 号号碱碱基的基的2 2羟基羟基被被磷磷酸酸化化,如如果果不不存存在这一在这一修修饰则饰则tRNAitRNAitRNAitRNAi可可用用用用于于延伸。延伸。现在学习的是第25页,共54页(3)、真核生物蛋白质合成的)、真核生物蛋白质合成的起始因子:起始因子:i eIF2-A 65kd 促使促使Met-
20、tRNAi与与40S亚基结合亚基结合eIF1 15kd 促使促使40S亚基与亚基与mRNA结合结合eIF3 500kd 与与eIF4e有高亲和力,促使有高亲和力,促使40S亚基与亚基与mRNA 起始位点起始位点结合结合 eIF5 150kd 水解水解GTP,释放,释放eIF2,eIF3 促使核糖体大小亚基之间的结合促使核糖体大小亚基之间的结合 eIF4e (eIF4f 的亚基的亚基)促进促进40S核糖体小亚基与核糖体小亚基与mRNA5端帽子结合端帽子结合因子因子大小大小作作 用用eIF4a 50kd 使使 mRNA发卡二级结构解开发卡二级结构解开eIF4b 80kd 协助协助 eIF4a解开发
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