损伤修复突变和转座.ppt
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1、关于损伤修复突变和转座现在学习的是第1页,共77页第三节第三节突变类型突变类型第四节第四节回复突变回复突变(抑制突变抑制突变)第五节第五节突变剂和突变生成突变剂和突变生成 概述:损伤因素及其类型概述:损伤因素及其类型 第一节第一节 复制过程中的错配修复复制过程中的错配修复 第二节第二节 损伤修复损伤修复 现在学习的是第2页,共77页 引起损伤的因素引起损伤的因素:自发性损伤自发性损伤(复制复制中的损伤、碱基的自发性化学改变、中的损伤、碱基的自发性化学改变、自发脱碱基、自发脱碱基、细胞的代谢产物对细胞的代谢产物对DNA的损伤的损伤)物理因素引起的损伤物理因素引起的损伤(电离辐射、紫外线电离辐射、
2、紫外线)化学因素引起的损伤化学因素引起的损伤(烷化剂、碱基类似物)(烷化剂、碱基类似物)引起损伤的类型:引起损伤的类型:碱基脱落、碱基(或核苷)改变、错误碱基(碱基的取碱基脱落、碱基(或核苷)改变、错误碱基(碱基的取 代)、碱基的插入或缺失、链的断裂、链交联(链内、链代)、碱基的插入或缺失、链的断裂、链交联(链内、链 间)、间)、嘧啶二聚体嘧啶二聚体等等等等 现在学习的是第3页,共77页 广义的修复系统:广义的修复系统:DNA聚合酶的校对功能聚合酶的校对功能(复制的范畴复制的范畴)尿嘧啶尿嘧啶-N-糖苷酶修复系统糖苷酶修复系统 (复制时(复制时U的渗入、的渗入、C脱氨氧化成脱氨氧化成U)错配修
3、复系统错配修复系统 损伤修复系统损伤修复系统(光复活、重组修复、光复活、重组修复、SOS修复等修复等)限制修饰系统限制修饰系统-对付外源对付外源DNADNA的入侵的入侵现在学习的是第4页,共77页第一节第一节复制过程中的错配的复制过程中的错配的修复修复现在学习的是第5页,共77页DNAmismatch+-A-C-DNApol(=10-8)经第二次校正经第二次校正=10-11错配修复系错配修复系统统(MRSMismatchRepairSystem)1、错配修复碱基来源:、错配修复碱基来源:校正活性所漏校的碱基校正活性所漏校的碱基使复制的保真性提高使复制的保真性提高102103倍倍现在学习的是第6
4、页,共77页2、错配修复系统(、错配修复系统(Mismatchrepairsystem)DNApolymeraseHelicaseSSB外切核酸酶外切核酸酶(和和)连接酶连接酶MCE(mismatchcorrectenzyme)3subunitsmutH,L,SdamgeneDNA腺嘌呤甲基化酶腺嘌呤甲基化酶(m6A甲基化酶甲基化酶)扫描新生链中错配碱基扫描新生链中错配碱基识别新生链中非识别新生链中非m6A的的GATC序列序列酶切含错配碱基的新生酶切含错配碱基的新生DNA区段区段(1 1)组成)组成现在学习的是第7页,共77页 DNADNA合成过程中的甲基化变化合成过程中的甲基化变化DNA中的
5、中的GATC(palindromicseq.)为为m6A甲基化敏感位点甲基化敏感位点平均每平均每2kb左右有一左右有一GATCseq.错配修复系统受甲基化的引导错配修复系统受甲基化的引导现在学习的是第8页,共77页 甲基化程度的差异甲基化程度的差异a、MutH/MutS扫描识别错配扫描识别错配 碱基和邻近的碱基和邻近的GATC序列序列 切点甲基化切点甲基化GATC中中G的的5侧侧DNAhelicaseII,SSB,exonucleaseI去除包括错去除包括错 配碱基的片段配碱基的片段 DNApolymeraseIII和和DNAligase填充缺口填充缺口昂贵的代价用于保证昂贵的代价用于保证DN
6、ADNA的准确性的准确性(2 2)修复过程修复过程 现在学习的是第9页,共77页外切核酸酶外切核酸酶切割切点的切割切点的55端(错配碱基在切点的端(错配碱基在切点的55端)端)-3-3端(端(-3-3端)端)现在学习的是第10页,共77页3、尿嘧啶尿嘧啶-N-糖苷酶系统糖苷酶系统(ung system)修复尿嘧啶的来源:修复尿嘧啶的来源:dUTP的渗入的渗入胞嘧啶的自发脱氨氧化胞嘧啶的自发脱氨氧化现在学习的是第11页,共77页-TAGC-ATCG-TAGC-ACG-U-TAGC-ung-aseGCUAU-TAGC-ACG-AP内切酶内切酶(Apurinase)-TAGC-ATCG-DNApol
7、Ligase现在学习的是第12页,共77页 第二节第二节 DNA损伤的修复损伤的修复现在学习的是第13页,共77页一、嘧啶二聚体的产生一、嘧啶二聚体的产生 类型:类型:TT二聚体二聚体()、)、CC二聚体(二聚体()、)、CT二聚体(二聚体()TTCCCT相邻的胸腺嘧啶相邻的胸腺嘧啶胸腺嘧啶二聚体胸腺嘧啶二聚体CCCCCCCC现在学习的是第14页,共77页现在学习的是第15页,共77页PR1、光复活(、光复活(photoreactivation)-TT-AA-TT-AA-TT-AA-TT-AA-复制前进行、不容易出错复制前进行、不容易出错400nm蓝光、蓝光、PR酶酶(photo-reacti
8、vationenzyme)光敏裂合酶(光敏裂合酶(photolyase)可见光激活可见光激活 二、二聚体修复的机制二、二聚体修复的机制现在学习的是第16页,共77页2.切除修复切除修复ExisionRepair 复制前进行复制前进行不易出错不易出错UvrA,B,Cgene内切核酸酶内切核酸酶(Endonucleases)外切核酸酶外切核酸酶(Exonuclease)DNApolLigase 碱基切除修复碱基切除修复核核苷苷酸酸切切除除修修复复碱基切除修复碱基切除修复核苷酸切除修复核苷酸切除修复现在学习的是第17页,共77页ABA BCA B CA BCAB螺旋酶螺旋酶Pol 螺旋酶螺旋酶连接酶
9、连接酶切切补补切切封封现在学习的是第18页,共77页3.重组修复(重组修复(RecombinativeRepair)后复制修复、后复制修复、E.coli的挽回系统的挽回系统E.coli存活存活%U.V计量计量w.t.UvrA+RecA+uvra-reca-该该系系统统存存在在的的实实验验证证据据现在学习的是第19页,共77页 Rec-A.gene 以某种方式参与以某种方式参与DNA损伤修复损伤修复 Rec修复系统比切除修复系统更有效修复系统比切除修复系统更有效 目前知道目前知道 Uvr系统负责切除二聚体系统负责切除二聚体 Rec系统负责消除没有被切除的二聚体系统负责消除没有被切除的二聚体 可能
10、造成的后果可能造成的后果现在学习的是第20页,共77页TTTTAAAATTTTTTTTAAAATTTT变性变性E.coli(Rec-A,uvr-a-)D.S.DNAS.S.DNAU.V.复制复制提取提取变性变性复制过程越过二聚体而在相应新链上留下缺口复制过程越过二聚体而在相应新链上留下缺口二聚体后起始二聚体后起始 修复时期的证明修复时期的证明现在学习的是第21页,共77页与与Rec-A蛋白引起的重组蛋白引起的重组(strandtransfer)有关有关TTdimer未被修复,仅表现在后代群体中未被修复,仅表现在后代群体中TTdimer浓度的稀释浓度的稀释链的非准确转移,导致突变机率的增加链的非
11、准确转移,导致突变机率的增加修复相关机制修复相关机制:现在学习的是第22页,共77页 重组修复重组修复(链转移修复链转移修复)复制后修复复制后修复容易出错容易出错RecA,DNApolymeraeligase二聚体后起始二聚体后起始 RecA 聚合酶、连接酶聚合酶、连接酶重组修复后的损伤位点可重组修复后的损伤位点可由其它机制进一步修复由其它机制进一步修复现在学习的是第23页,共77页课内容回顾:1 1、复制过程中的错配修复、复制过程中的错配修复 错配修复系统错配修复系统 尿嘧啶尿嘧啶N N糖苷酶修复系统糖苷酶修复系统 2 2、DNADNA的损伤的修复的损伤的修复 嘧啶二聚体嘧啶二聚体 光复活修
12、复光复活修复 切除修复切除修复 重组修复重组修复现在学习的是第24页,共77页第三节第三节突变类型突变类型 现在学习的是第25页,共77页染色体突染色体突变变(Chromosomemutation)chromosomenumber chromosomestructure 核苷酸突核苷酸突变变(dNtpointmutation)突变突变(mutation):可以通过复制而遗传的:可以通过复制而遗传的DNA结构结构 的任何永久性改变的任何永久性改变遗传状态遗传状态现在学习的是第26页,共77页 突变体突变体(mutant):携带突变的生物个体或群体或株系:携带突变的生物个体或群体或株系 突变基因突
13、变基因(mutantgene):存在突变位点的基因存在突变位点的基因野生型基因(野生型基因(wild type gene):):表示方法表示方法 表现型表现型 Arg+Arg-基因型基因型 arg+arg-野生型野生型 正性状正性状 现在学习的是第27页,共77页1、从、从突变作用来源上定义突变作用来源上定义自发突变自然界的突变剂或偶然复制错误自发突变自然界的突变剂或偶然复制错误诱变诱变人为使用突变剂人为使用突变剂 碱基异构式引起碱基异构式引起DNA复制过程的错误复制过程的错误-自发突变自发突变碱基异构式碱基异构式 A(amino氨基氨基)A(imino亚氨基亚氨基)C(a)C(i)G(ket
14、o酮式酮式)G(enol烯醇式烯醇式)G(k)G(e,i)T(keto)T(enol-2)orT(enol-4)现在学习的是第28页,共77页碱基异构式引起碱基异构式引起DNA复制的错配复制的错配 G(k)C(a)正确配对正确配对A(a)T(k)错误配对错误配对G(k)T(e)A(a)C(i)A(i,anti)A(a,syn)A(i,anti)G(k,syn)G(e,i,anti)G(k,syn)G(e,i,anti)A(a,syn)A(i)C(a)G(e)T(k)现在学习的是第29页,共77页A(a)T(k)A(a,anti)T(k,anti)C(i)C(a,anti)A(a)A(i,ant
15、i)碱基异构式引起碱基异构式引起DNA的错配突变的错配突变 C(i)C(a)G(k,syn)G(k,syn)G(k,anti)G(k)现在学习的是第30页,共77页2、从序列改变多少上定义、从序列改变多少上定义 单点突变单点突变(point mutation)(点突变点突变)多点突变多点突变(multiple mutation)点突变点突变碱基替代碱基替代、碱基插入、碱基缺失、碱基插入、碱基缺失碱基替代(碱基替代(conversion)转换转换(transition)PyPy PuPu 颠换颠换(transvertion)PyPu 现在学习的是第31页,共77页核苷酸缺失或插入核苷酸缺失或插入
16、(dNtdeletionorinsertion)=3xdNt nxAminoacid=3xdNt 移框(移框(Framshift)移框突变(移框突变(frameshift mutation):一个或两个碱基的插入一个或两个碱基的插入 或缺失,或扁平碱性染料分子或缺失,或扁平碱性染料分子3、从对阅读框的影响上定义、从对阅读框的影响上定义移码突变移码突变现在学习的是第32页,共77页Examples of deletion mutations 现在学习的是第33页,共77页4、从对遗传信息的改变上定义、从对遗传信息的改变上定义(点突变)(点突变)同义突变:没有改变产物氨基酸序列的密码子同义突变:没
17、有改变产物氨基酸序列的密码子 错义突变:碱基序列的改变引起了氨基酸序列的改变错义突变:碱基序列的改变引起了氨基酸序列的改变 (中性突变、渗漏突变)(中性突变、渗漏突变)无义突变:碱基的改变使代表某种氨基酸的密码子变无义突变:碱基的改变使代表某种氨基酸的密码子变 为蛋白合成的终止密码子为蛋白合成的终止密码子碱基替代对遗传信息的改变碱基替代对遗传信息的改变-同义突变同义突变 GAAGAG Glu现在学习的是第34页,共77页-错义突变错义突变 GAAAAA Lys-无义突变无义突变 GAATAA(stop)无义突变类型无义突变类型UAA(Oc)赭石型(赭石型(Ocher)UAG(Am)琥珀型(琥珀
18、型(amber)UGA(Opal)乳石型(乳石型(Opal)现在学习的是第35页,共77页5、从、从突变的表达类型突变的表达类型上定义上定义-非条件型突变非条件型突变:-条件型突变条件型突变:突变的表现突变的表现=突变基因型突变基因型+诱导条件诱导条件(光,温敏感不育)(光,温敏感不育)6、从突、从突变变效效应应上定上定义义正向突正向突变变回复突回复突变变:使突使突变变体所失去的野生型性状得到恢复的第二次突体所失去的野生型性状得到恢复的第二次突变变真正的原位回复突真正的原位回复突变变很少很少大部分大部分为为第二点的回复突第二点的回复突变变抑制突抑制突变变现在学习的是第36页,共77页7、突变位
19、点存在于负责基因调控的序列中突变位点存在于负责基因调控的序列中*在启在启动动子区域子区域时时:启启动动子上升突子上升突变变:增增强强启启动动子子对转录对转录的的发动发动作用的突作用的突变变启启动动子下降突子下降突变变:*在操作子上或在操作子上或调节调节基因上基因上组组成型突成型突变变:产产生生组组成型表达方式的操作子突成型表达方式的操作子突变变或或调调节节基因的突基因的突变变突突变变的操作子不能被阻遏蛋白所的操作子不能被阻遏蛋白所识别识别调节调节基因突基因突变变不能不能产产生有活性的阻遏蛋白生有活性的阻遏蛋白两者之一都使两者之一都使结结构基因失去了构基因失去了负负向控制向控制现在学习的是第37
20、页,共77页第四节第四节回复突变回复突变(抑制突变抑制突变)现在学习的是第38页,共77页1、抑制突变发生的部位、抑制突变发生的部位基因内抑制突变:抑制突变发生在正向突变的基因中基因内抑制突变:抑制突变发生在正向突变的基因中基因间抑制突变:抑制突变发生在正向突变基因外的其它基因间抑制突变:抑制突变发生在正向突变基因外的其它基因中基因中wildtypemutant(表现型表现型)正向突变正向突变(lowF.)回复突变回复突变(verylowF.正向的正向的110)现在学习的是第39页,共77页间接抑制突变间接抑制突变:不恢复正向突变基因蛋白质产物的功能不恢复正向突变基因蛋白质产物的功能,而而是通
21、过改变其它蛋白质的性质或表达水平是通过改变其它蛋白质的性质或表达水平而补偿原来突变造成的缺陷而补偿原来突变造成的缺陷,从而恢复野生型从而恢复野生型2、野生表型恢复作用的性、野生表型恢复作用的性质质直接抑制突变直接抑制突变:通过恢复或部分恢复原来突变基因产物蛋通过恢复或部分恢复原来突变基因产物蛋白质的功能而恢复野生表型白质的功能而恢复野生表型现在学习的是第40页,共77页3、回复突变的分子机制回复突变的分子机制a)AGC(Ser)ACC(Thr)AGC(Ser)b)AGC(Ser)AGG(Arg)AGT(Ser)c)AGC(Ser)AGG(Arg)GGG(Gly)ifSer Gly现在学习的是第
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