基因表达调控 (5)精选PPT.ppt
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1、关于基因表达调控(5)第1页,讲稿共89张,创作于星期日第第 一一 节节基因的结构与功能基因的结构与功能第2页,讲稿共89张,创作于星期日1基因的分子基础n现代分子生物学研究已经证实现代分子生物学研究已经证实DNA是遗传信息的主要载体,是遗传信息的主要载体,基因的化学本质就是一段基因的化学本质就是一段DNA分子片段。分子片段。nWatson和和Crick提出的提出的DNA分子双螺旋结构模型为遗传信分子双螺旋结构模型为遗传信息传递提供了物质结构基础。根据这个模型,息传递提供了物质结构基础。根据这个模型,DNA分子分子是由是由2条互补的多核苷酸链相互缠绕而成,条互补的多核苷酸链相互缠绕而成,2条链
2、之间通过碱条链之间通过碱基配对结合在一起。基配对结合在一起。第3页,讲稿共89张,创作于星期日第4页,讲稿共89张,创作于星期日n基因作为一个遗传功能单位,它所对应的一段核苷酸序列被称为基因作为一个遗传功能单位,它所对应的一段核苷酸序列被称为顺顺反子(反子(cistron)。显然,一个顺反子编码一种完整多肽链。显然,一个顺反子编码一种完整多肽链。因此,顺反子是一个功能单位。因此,顺反子是一个功能单位。n基因和顺反子这两个术语常被等同使用,但仔细分析,两者是有区别基因和顺反子这两个术语常被等同使用,但仔细分析,两者是有区别的:在原核细胞和低等真核细胞中,基因和顺反子是等价的;而在的:在原核细胞和
3、低等真核细胞中,基因和顺反子是等价的;而在高等真核细胞中,由于基因中内含子的存在,此时顺反子等价于真高等真核细胞中,由于基因中内含子的存在,此时顺反子等价于真核基因的外显子。核基因的外显子。第5页,讲稿共89张,创作于星期日2基因的结构n结构上,基因由多个不同的区域组成。无论是原核基因还是真结构上,基因由多个不同的区域组成。无论是原核基因还是真核基因,都可划分为核基因,都可划分为编码区编码区和和非编码区非编码区两个基本组成部分。编两个基本组成部分。编码区是可以被转录的区域,由连续的密码子组成,其中包括起码区是可以被转录的区域,由连续的密码子组成,其中包括起始密码(通常是始密码(通常是AUG)和
4、终止密码()和终止密码(UAA、UAG和和UGA)。编)。编码区中包含码区中包含5端的非翻译区(端的非翻译区(5UTR)和)和3端的非翻译区(端的非翻译区(3UTR)第6页,讲稿共89张,创作于星期日第7页,讲稿共89张,创作于星期日第8页,讲稿共89张,创作于星期日n启动子(启动子(promoter):是位于基因:是位于基因5端上游紧靠转录起点的一端上游紧靠转录起点的一段非编码序列,其功能是引导段非编码序列,其功能是引导RNA聚合酶与基因相应部位的正聚合酶与基因相应部位的正确结合,启动基因的转录。一般来说,原核基因的启动子比较简单,确结合,启动基因的转录。一般来说,原核基因的启动子比较简单,
5、只有数十个碱基组成,而真核基因的启动子较大,可能涉及数千个只有数十个碱基组成,而真核基因的启动子较大,可能涉及数千个碱基。碱基。n终止子终止子(terminator):基因:基因3端下游外侧与终止密码子相邻端下游外侧与终止密码子相邻的一段非编码的核苷酸短序列,具有终止转录的功能。即一旦的一段非编码的核苷酸短序列,具有终止转录的功能。即一旦RNA聚合酶完全通过了基因的转录单位后,聚合酶就不能继续聚合酶完全通过了基因的转录单位后,聚合酶就不能继续向前移动,使转录活动终止。向前移动,使转录活动终止。第9页,讲稿共89张,创作于星期日3原核生物基因结构与调控模式操纵子操纵子(operon)机制机制编码
6、序列编码序列启动序列启动序列操纵序列操纵序列其他调节序列其他调节序列(promoter)(operator)第10页,讲稿共89张,创作于星期日n由由P序列、序列、O序列和序列和CAP结合位点共同构成结合位点共同构成lac操纵子的调控操纵子的调控区,他们相互协调,共同控制着信息区中三个酶的编码区,他们相互协调,共同控制着信息区中三个酶的编码基因的表达基因的表达第11页,讲稿共89张,创作于星期日3真核生物基因结构与调控模式1)顺式作用元件顺式作用元件(cis-actingelement)可影响自身基因表达活性的可影响自身基因表达活性的DNA序列序列BADNA编码序列编码序列转录起始点转录起始点
7、不不同同真真核核生生物物的的顺顺式式作作用用元元件件中中也也会会发发现现一一些些共共有有序序列列,如如TATA盒盒、CAAT盒盒等等,这这些些共共有序列是有序列是RNA聚合酶或特异转录因子的结合位点。聚合酶或特异转录因子的结合位点。第12页,讲稿共89张,创作于星期日2 2)真核基因的调节蛋白真核基因的调节蛋白还还有有蛋蛋白白质质因因子子可可特特异异识识别别、结结合合自自身身基基因因的的调调节节序序列列,调调节节自自身身基基因因的的表表达达,称称顺式作用顺式作用。由由某某一一基基因因表表达达产产生生的的蛋蛋白白质质因因子子,通通过过与与另另一一基基因因的的特特异异的的顺顺式式作作用用元元件件相
8、相互互作作用用,调调节其表达。节其表达。反式作用因子反式作用因子(trans-actingfactor)这种调节作用称为这种调节作用称为反式作用反式作用。第13页,讲稿共89张,创作于星期日cDNAaDNA反式调节反式调节C顺式调节顺式调节mRNAC蛋白质蛋白质CBAmRNA蛋白质蛋白质AA第14页,讲稿共89张,创作于星期日启动子n启动子是启动子是RNA聚合酶特异性识别和结合的聚合酶特异性识别和结合的DNA序列。启动子序列。启动子有方向性,位于结构基因转录起始点的上游,本身并不被转录。有方向性,位于结构基因转录起始点的上游,本身并不被转录。nTATA盒(盒(TATAbox)是主要的真核生物的
9、启动子元件,)是主要的真核生物的启动子元件,它位于转录起始点上游它位于转录起始点上游-25bp处,几乎所有已发现的真核生处,几乎所有已发现的真核生物基因的启动子都有此序列。物基因的启动子都有此序列。TATA盒与一种称为盒与一种称为TATA因子因子的转录因子结合后即成为完整的启动子,精确地决定的转录因子结合后即成为完整的启动子,精确地决定RNA合成合成的起始位点的起始位点第15页,讲稿共89张,创作于星期日上游启动子元件n上游启动子元件(上游启动子元件(upstreampromoterelements)是)是TATA盒盒上游的一些特定的上游的一些特定的DNA序列。反式作用因子可与这些元序列。反式
10、作用因子可与这些元件结合,通过调节件结合,通过调节TATA因子与因子与TATA盒的结合、盒的结合、RNA聚合酶聚合酶与启动子的结合及转录起始复合物的形成(转录起始因子与与启动子的结合及转录起始复合物的形成(转录起始因子与RNA聚合酶结合)来调控基因的转录效率。聚合酶结合)来调控基因的转录效率。包括包括CAAT盒、盒、CACA盒及盒及GC盒等。盒等。第16页,讲稿共89张,创作于星期日反应元件(response elements)n是一类能介导基因对细胞外的某种信号产生反应是一类能介导基因对细胞外的某种信号产生反应的的DNA序列。反应元件都具有较短的保守序列。序列。反应元件都具有较短的保守序列。
11、这些元件通常位于启动子附近和增强子内,如这些元件通常位于启动子附近和增强子内,如热休克反应元件(热休克反应元件(heatshockresponseelement,HSE)糖皮质激素反应元件()糖皮质激素反应元件(glucocorticoidresponseelement,GRE)。)。第17页,讲稿共89张,创作于星期日增强子增强子(enhancer)n增强子增强子是一段是一段DNA序列,其中含有多个能被反式序列,其中含有多个能被反式作用因子识别与结合的顺式作用元件。作用因子识别与结合的顺式作用元件。n反应作用因子与这些元件结合后能够调控(通常为增反应作用因子与这些元件结合后能够调控(通常为增
12、强)邻近基因的转录。增强子一般位于转录起始点上强)邻近基因的转录。增强子一般位于转录起始点上游游-100-300bp处,但在基因之外或某些内含子也有处,但在基因之外或某些内含子也有增强子序列。增强子序列。第18页,讲稿共89张,创作于星期日n转位基因,也称转位因子(转位基因,也称转位因子(transposableelements),是指),是指可以从染色体基因组上的一个位置转移到另一个位置,甚可以从染色体基因组上的一个位置转移到另一个位置,甚至在不同的染色体之间跃迁的基因成分,因此有些文献形至在不同的染色体之间跃迁的基因成分,因此有些文献形象地称之为跳跃基因(象地称之为跳跃基因(jumping
13、genes)。转位基因最早由)。转位基因最早由美国冷泉港实验室的女科学家美国冷泉港实验室的女科学家B.McClintock,于上世纪,于上世纪40年代晚期在玉米中首次发现。年代晚期在玉米中首次发现。4特殊结构与功能的基因第19页,讲稿共89张,创作于星期日n原核生物的转位因子分三种不同的类型:原核生物的转位因子分三种不同的类型:插入序列:分子量小于插入序列:分子量小于2000bp转座子:大于转座子:大于2000bp可转座的噬菌体:如,噬菌体可转座的噬菌体:如,噬菌体Mu和和D108。第20页,讲稿共89张,创作于星期日n假基因(假基因(pseudogene):因碱基顺序发生某些突变:因碱基顺序
14、发生某些突变而失去功能,不能表达或表达异常,生成无生物活而失去功能,不能表达或表达异常,生成无生物活性多肽的基因。性多肽的基因。n假基因假基因4个显著特点:个显著特点:没有内含子;没有内含子;具有与具有与mRNA的的poly(A)尾的相应结构;尾的相应结构;两侧有顺向重复两侧有顺向重复序列;序列;随机出现在非正常的位置。随机出现在非正常的位置。第21页,讲稿共89张,创作于星期日n重叠基因重叠基因(overlapping genes),或嵌套嵌套基因基因(nested genes):基因的核苷酸序列是彼此重叠。第22页,讲稿共89张,创作于星期日基因家族基因家族(gene family)n就是
15、指核苷酸序列或编码产物的结构具有一定程度同源性的一就是指核苷酸序列或编码产物的结构具有一定程度同源性的一组基因组基因。n(1)核酸序列相同)核酸序列相同即多拷贝基因。即多拷贝基因。如如rRNA基因,基因,tRNA基因等基因等。n(2)核酸序列高度同源)核酸序列高度同源如人类生长激素基因家族:人生长激素如人类生长激素基因家族:人生长激素(hGH)、人胎盘促、人胎盘促乳素乳素(hCS)和催乳素和催乳素(prolactin)。第23页,讲稿共89张,创作于星期日n(3)编码产物具有同源功能区)编码产物具有同源功能区:如如src癌基因家族,基因产物都含有癌基因家族,基因产物都含有250个氨基酸顺序的个
16、氨基酸顺序的同源蛋白激酶结构域。同源蛋白激酶结构域。n(4)编码产物具有小段保守基序)编码产物具有小段保守基序:如如DEAD盒基因家族的产物都具有解旋酶的功能,其结盒基因家族的产物都具有解旋酶的功能,其结构特征是构特征是8个氨基酸序列,内含个氨基酸序列,内含DEAD序列:序列:Asp-Glu-Ala-Asp。第24页,讲稿共89张,创作于星期日n基因超家族(基因超家族(genesuperfamily)是指一)是指一组由多基因家族及单基因组成的更大的组由多基因家族及单基因组成的更大的基因家族。基因家族。它们可能起源于相同的祖先基因,它们可能起源于相同的祖先基因,但是它们的功能并不一定相同但是它们
17、的功能并不一定相同(区别于多区别于多基因家族)。基因家族)。第25页,讲稿共89张,创作于星期日第二节第二节基因组的结构与功能基因组的结构与功能n一、病毒基因组的结构与功能特点一、病毒基因组的结构与功能特点n二、原核生物基因组的结构与功能特点二、原核生物基因组的结构与功能特点n三、真核生物基因组结构与功能的特点三、真核生物基因组结构与功能的特点n四、线粒体基因组四、线粒体基因组n五、人类基因组五、人类基因组*基因组基因组(genome)一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套基因。基因。第26页,讲稿共89张,创作于星期日一、病毒基因组的结构与功能特点一
18、、病毒基因组的结构与功能特点1不同病毒基因组大小相差较大 乙肝病毒(乙肝病毒(HBV)DNA为为3.2kb痘病毒基因组痘病毒基因组DNA长长达达300kb第27页,讲稿共89张,创作于星期日n2不同病毒的基因组可以是不同结构的核酸不同病毒的基因组可以是不同结构的核酸腺病毒基因组为线性双链腺病毒基因组为线性双链DNA第28页,讲稿共89张,创作于星期日n3病毒基因组有连续的也有不连续的流感病毒由8条单链RNA分子构成 第29页,讲稿共89张,创作于星期日n4病毒基因组的编码序列大于90%病毒基因组的大部分是用来编码蛋白质的,只有很小的一部分不编码蛋白质。第30页,讲稿共89张,创作于星期日n5单
19、倍体基因组 除逆转录病毒基因组有两个拷贝外,至今发现的病毒基因组都是单倍体,每个基因在病毒颗粒中只出现一次。第31页,讲稿共89张,创作于星期日n6基因有连续的和间断的 感染细菌的病毒(噬菌体)基因组与细菌基因组结构特征相似,基因是连续的;而感染真核细胞的病毒基因组与真核生物基因组结构特征相似,有的基因含有内含子,基因是间断的。第32页,讲稿共89张,创作于星期日n7相关基因丛集相关基因丛集如腺病毒晚期基因编码表达的如腺病毒晚期基因编码表达的12种种外壳蛋白,在晚期基因转录时是在外壳蛋白,在晚期基因转录时是在1个启个启动子作用下生成多顺反子动子作用下生成多顺反子mRNA,然后,然后加工成各种加
20、工成各种mRNA,编码病毒的各种外,编码病毒的各种外壳蛋白,它们在功能上都是相关的。壳蛋白,它们在功能上都是相关的。第33页,讲稿共89张,创作于星期日n8基因重叠基因重叠有些病毒核酸分子很小,又需要装入尽可能有些病毒核酸分子很小,又需要装入尽可能多的基因,因此在进化过程中形成了重叠基因,多的基因,因此在进化过程中形成了重叠基因,即同一段核酸序列能够编码即同一段核酸序列能够编码2种或种或2种以上蛋白质。种以上蛋白质。第34页,讲稿共89张,创作于星期日n9病毒基因组含有不规则结构基因病毒基因组含有不规则结构基因主要类型有:主要类型有:几个结构基因的编码区无间隔,而是连续几个结构基因的编码区无间
21、隔,而是连续的、不间的、不间断的。断的。mRNA没有没有5 端的帽结构端的帽结构。结构基因本身没有翻译起始序列结构基因本身没有翻译起始序列第35页,讲稿共89张,创作于星期日二、原核生物基因组的结构与功能特点二、原核生物基因组的结构与功能特点n1具有操纵子结构具有操纵子结构这是原核基因组的一个突出的结构特点。所谓操纵子由信这是原核基因组的一个突出的结构特点。所谓操纵子由信息区和调控区组成,前者包括数个编码蛋白质的序列,后者息区和调控区组成,前者包括数个编码蛋白质的序列,后者包括启动子、操纵基因,以及下游的转录终止信号。包括启动子、操纵基因,以及下游的转录终止信号。n2编码序列在基因组中约占编码
22、序列在基因组中约占50%原核生物基因的编码序列在基因组中约占原核生物基因的编码序列在基因组中约占50%,远大于真,远大于真核基因组,但又小于病毒基因组;编码顺序不重叠,其转核基因组,但又小于病毒基因组;编码顺序不重叠,其转录产物多为多顺反子结构。录产物多为多顺反子结构。第36页,讲稿共89张,创作于星期日n3多顺反子结构,无内含子多顺反子结构,无内含子原核基因是多顺反子结构,同时基因内无内含子,原核基因是多顺反子结构,同时基因内无内含子,是连续的,因此转录后不需要剪切。是连续的,因此转录后不需要剪切。n4基因组中重复序列很少基因组中重复序列很少原核基因很少重复序列,其结构基因多为单拷贝,原核基
23、因很少重复序列,其结构基因多为单拷贝,只有编码只有编码rRNA的基因往往是多拷贝的,这有利于核糖体的基因往往是多拷贝的,这有利于核糖体的快速组装。的快速组装。n5存在移动基因存在移动基因原核基因组中存在着可移动的原核基因组中存在着可移动的DNA序列,包括插入序序列,包括插入序列和转座子。列和转座子。第37页,讲稿共89张,创作于星期日三、真核生物基因组结构与功能的特点三、真核生物基因组结构与功能的特点真核基因组结构庞大真核基因组结构庞大哺乳类动哺乳类动物基因组物基因组DNA约约3109碱基对碱基对编码基因编码基因约约有有40000个个,占总长的占总长的6%rDNA等重复基因等重复基因约约占占5
24、%10%第38页,讲稿共89张,创作于星期日n1多条染色体,两份同源的基因组多条染色体,两份同源的基因组配子(精子和卵子)为单倍体,体细胞一般为双倍配子(精子和卵子)为单倍体,体细胞一般为双倍体,即含两份同源的基因组,而原核生物的基因组则是体,即含两份同源的基因组,而原核生物的基因组则是单拷贝的。单拷贝的。n2基因组庞大、复杂基因组庞大、复杂真核基因组远远大于原核生物的基因组,结构复杂,基因真核基因组远远大于原核生物的基因组,结构复杂,基因数庞大,具有许多复制起点。数庞大,具有许多复制起点。n3单顺反子结构单顺反子结构(monocistron)即一分子即一分子mRNA只能翻译成一种蛋白质。只能
25、翻译成一种蛋白质。第39页,讲稿共89张,创作于星期日n4非编码顺序占绝大部分,含有大量重复顺序非编码顺序占绝大部分,含有大量重复顺序真核生物基因组内非编码的顺序占真核生物基因组内非编码的顺序占90%以上。这是与细菌、以上。这是与细菌、病毒的重要区别,且在一定程度上也是生物进化的标尺。病毒的重要区别,且在一定程度上也是生物进化的标尺。n6具有内含子结构,普遍存在选择性剪接具有内含子结构,普遍存在选择性剪接大多数真核生物的结构基因具有内含子结构,是断裂基因。大多数真核生物的结构基因具有内含子结构,是断裂基因。n7有基因家族有基因家族功能相关的基因可串联在一起,构成各种基因家族。功能相关的基因可串
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