蛋白质的结构与功能课件.ppt
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1、目录目录关于蛋白质的结构与功能现在学习的是第1页,共110页目录目录n什么是蛋白质什么是蛋白质?蛋蛋白白质质(protein)是是由由许许多多氨氨基基酸酸(amino acids)通通过过肽肽键键(peptide bond)相相连连形形成成的的具具有特定空间构象的高分子含氮化合物。有特定空间构象的高分子含氮化合物。现在学习的是第2页,共110页目录目录n蛋白质研究的历史蛋白质研究的历史18331833年年,从从麦麦芽芽中中分分离离淀淀粉粉酶酶;随随后后从从胃胃液液中中分分离离到到类似胃蛋白酶的物质。类似胃蛋白酶的物质。18641864年,血红蛋白被分离并结晶。年,血红蛋白被分离并结晶。1919
2、世世纪纪末末,证证明明蛋蛋白白质质由由氨氨基基酸酸组组成成,并并合合成成了了多多种种短肽。短肽。2020世世纪纪初初,发发现现蛋蛋白白质质的的二二级级结结构构;完完成成胰胰岛岛素素一一级级结构测定。结构测定。现在学习的是第3页,共110页目录目录2020世世纪纪中中叶叶,各各种种蛋蛋白白质质分分析析技技术术相相继继建建立立,促促进进了蛋白质研究迅速发展;了蛋白质研究迅速发展;19621962年,确定了血红蛋白的四级结构。年,确定了血红蛋白的四级结构。2020世纪世纪9090年代,功能基因组与蛋白质组研究的展开。年代,功能基因组与蛋白质组研究的展开。现在学习的是第4页,共110页目录目录n蛋白质
3、的生物学重要性蛋白质的生物学重要性分分布布广广:所所有有器器官官、组组织织都都含含有有蛋蛋白白质质;细细胞的各个部分都含有蛋白质。胞的各个部分都含有蛋白质。含含量量高高:蛋蛋白白质质是是细细胞胞内内最最丰丰富富的的有有机机分分子子,占占人人体体干干重重的的4545,某某些些组组织织含含量量更更高高,例例如脾、肺及横纹肌等高达如脾、肺及横纹肌等高达8080。1.蛋白质是生物体重要组成成分蛋白质是生物体重要组成成分现在学习的是第5页,共110页目录目录作为生物催化剂(酶)作为生物催化剂(酶)代谢调节作用代谢调节作用免疫保护作用免疫保护作用物质的转运和存储物质的转运和存储运动与支持作用运动与支持作用
4、参与细胞间信息传递参与细胞间信息传递2.蛋白质具有重要的生物学功能蛋白质具有重要的生物学功能3.氧化供能氧化供能现在学习的是第6页,共110页目录目录蛋白质的分子组成蛋白质的分子组成The Molecular Component of Protein第一节第一节现在学习的是第7页,共110页目录目录n组成蛋白质的元素组成蛋白质的元素主要有主要有C C、H H、O O、N N和和 S S。有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、铜、有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有碘锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有碘 。现在学习的是第8页,共110页目录目录 各种蛋白质的含氮量很接
5、近,平均为各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16。由由于于体体内内的的含含氮氮物物质质以以蛋蛋白白质质为为主主,因因此此,只只要要测测定定生生物物样样品品中中的的含含氮氮量量,就就可可以以根根据据以以下公式推算出蛋白质的大致含量:下公式推算出蛋白质的大致含量:100克样品中蛋白质的含量克样品中蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数每克样品含氮克数 6.251001/16%n蛋白质元素组成的特点蛋白质元素组成的特点现在学习的是第9页,共110页目录目录一、组成人体蛋白质的一、组成人体蛋白质的20种氨基酸均种氨基酸均属于属于L-氨基酸氨基酸(甘氨酸除外)存存在在自自然然界界中中的的氨氨基基酸酸有有3
6、00300余余种种,但但组组成成人人体体蛋蛋白白质质的的基基本本氨氨基基酸酸有有2020种种,且且均均属属 L-L-氨基酸氨基酸(甘氨酸除外)。(甘氨酸除外)。现在学习的是第10页,共110页目录目录H甘氨酸甘氨酸CH3丙氨酸丙氨酸L-L-氨基酸的通式氨基酸的通式RC+NH3COO-H现在学习的是第11页,共110页目录目录非极性脂肪族氨基酸非极性脂肪族氨基酸极性中性氨基酸极性中性氨基酸芳香族氨基酸芳香族氨基酸酸性氨基酸酸性氨基酸碱性氨基酸碱性氨基酸二、氨基酸二、氨基酸可根据侧链结构和理化性质可根据侧链结构和理化性质进行分类进行分类现在学习的是第12页,共110页目录目录(一一)侧链含烃链的氨
7、基酸属于非极性脂肪族氨侧链含烃链的氨基酸属于非极性脂肪族氨基酸基酸现在学习的是第13页,共110页目录目录(二二)侧链有极性但不带电荷的氨基酸是极性中侧链有极性但不带电荷的氨基酸是极性中性氨基酸性氨基酸现在学习的是第14页,共110页目录目录(三三)侧链含芳香基团的氨基酸是芳香族氨基酸侧链含芳香基团的氨基酸是芳香族氨基酸现在学习的是第15页,共110页目录目录天冬氨酸天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97谷氨酸谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22赖氨酸赖氨酸 lysine Lys K 9.74精氨酸精氨酸 arginine Arg R 10.76组氨酸组
8、氨酸 histidine His H 7.59(四四)侧链含负性解离基团的氨基酸是酸性氨基酸侧链含负性解离基团的氨基酸是酸性氨基酸(五五)侧链含正性解离基团的氨基酸属于碱性氨基酸侧链含正性解离基团的氨基酸属于碱性氨基酸目目 录录现在学习的是第16页,共110页目录目录小结:小结:A.几种特殊氨基酸几种特殊氨基酸 脯氨酸脯氨酸(亚氨基酸)(亚氨基酸)CH2CHCOO-NH2+CH2CH2CH2CHCOO-NH2+CH2CH2注意点:注意点:为亚氨基酸,此氨基仍能为亚氨基酸,此氨基仍能与另一羧基形成肽键与另一羧基形成肽键 亚氨基的亚氨基的N在环中,移在环中,移动的自由度受限制,当脯氨动的自由度受限
9、制,当脯氨酸处于多肽链中时,往往形酸处于多肽链中时,往往形成转角成转角 可被修饰为羟脯氨酸可被修饰为羟脯氨酸现在学习的是第17页,共110页目录目录-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3半胱氨酸半胱氨酸 +胱氨酸胱氨酸二硫键二硫键-HHHS-CH2-CH-COO-HS-CH2-CH-COO-+NH3现在学习的是第18页,共110页目录目录 B.哺乳动物体内还有许多氨基酸,如鸟氨酸、哺乳动物体内还有许多氨基酸,如鸟氨酸、瓜氨酸、同型丝氨酸、同型半胱氨酸等,它们出现于瓜氨酸、同型丝氨酸、同型半胱氨酸等,它们出现
10、于代谢过程中,并不参与构成蛋白质。代谢过程中,并不参与构成蛋白质。C.其它分类等其它分类等:酸碱酸碱:冬天谷酸,赖组精碱冬天谷酸,赖组精碱 芳香族芳香族:色、酪、苯丙色、酪、苯丙含硫含硫:半胱、蛋半胱、蛋 支链:亮、异亮、缬支链:亮、异亮、缬酰胺:天冬酰胺、谷氨酰胺酰胺:天冬酰胺、谷氨酰胺 R含羟基:苏、丝、酪含羟基:苏、丝、酪缩写相近:色缩写相近:色Trp、酪、酪Tyr、苏、苏Thr营养必需氨基酸:色赖苯丙蛋,苏亮异亮缬营养必需氨基酸:色赖苯丙蛋,苏亮异亮缬生酮:亮、赖;生糖:芳香族生酮:亮、赖;生糖:芳香族+苏、亮;生酮兼生糖:余苏、亮;生酮兼生糖:余 D.蛋白质中的氨基酸残基可被修饰,如
11、:甲基蛋白质中的氨基酸残基可被修饰,如:甲基化、乙酰化、甲酰化、异戊二烯化、磷酸化等化、乙酰化、甲酰化、异戊二烯化、磷酸化等现在学习的是第19页,共110页目录目录三、三、20种氨基酸具有共同或特异的理化性质种氨基酸具有共同或特异的理化性质n两性解离及等电点两性解离及等电点氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处溶液的酸碱度。溶液的酸碱度。等电点等电点(isoelectric point,pI)在在某某一一pH的的溶溶液液中中,氨氨基基酸酸解解离离成成阳阳离离子子和和阴阴离离子子的的趋趋势势及及程程度度相相等等,成成为为兼兼性性离离子子,呈呈电电中中性性
12、。此此时时溶液的溶液的pH值值称为该氨基酸的称为该氨基酸的等电点等电点。(一)氨基酸具有两性解离的性质(一)氨基酸具有两性解离的性质现在学习的是第20页,共110页目录目录pH=pI+OH-pHpI+H+OH-+H+pHpI氨基酸的兼性离子氨基酸的兼性离子 阳离子阳离子阴离子阴离子现在学习的是第21页,共110页目录目录(二)含共轭双键的氨基酸具有紫外吸收性质(二)含共轭双键的氨基酸具有紫外吸收性质色氨酸、酪氨酸的最色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在大吸收峰在 280 nm 附近。附近。大大多多数数蛋蛋白白质质含含有有这这两两种种氨氨基基酸酸残残基基,所所以以 测测 定定 蛋蛋 白白 质质 溶溶 液
13、液280nm的的光光吸吸收收值值是是分分析析溶溶液液中中蛋蛋白白质质含含量量的的快快速速简便的方法。简便的方法。芳香族氨基酸的紫外吸收芳香族氨基酸的紫外吸收现在学习的是第22页,共110页目录目录(三)多数氨基酸与茚三酮反应生成蓝紫色化合物(三)多数氨基酸与茚三酮反应生成蓝紫色化合物多多数数氨氨基基酸酸与与茚茚三三酮酮水水合合物物共共热热,可可生生成成蓝蓝紫紫色色化化合合物物,其其最最大大吸吸收收峰峰在在570nm处处。由由于于此此吸吸收收峰峰值值与与氨氨基基酸酸的的含含量量存存在在正正比比关关系系,因因此此可可作作为为氨基酸定量分析方法。氨基酸定量分析方法。脯脯氨氨酸酸和和羟羟脯脯氨氨酸酸与
14、与其其生生成成亮亮黄黄色色化化合合物物,最大最大吸收峰在吸收峰在440nm处处。现在学习的是第23页,共110页目录目录四、蛋白质是由许多氨基酸残基组成的四、蛋白质是由许多氨基酸残基组成的多肽链多肽链肽肽键键(peptide bond)是是蛋蛋白白质质分分子子中中的的氨氨基基酸酸通通过过脱脱水水缩缩合合而而形形成成的的共共价价键键。是是一一种种酰酰胺胺键键,具具有有部部分双键性质。分双键性质。(一)(一)氨基酸通过肽键连接而形成肽氨基酸通过肽键连接而形成肽(peptide)现在学习的是第24页,共110页目录目录+-HOH甘氨酰甘氨酸甘氨酰甘氨酸肽键现在学习的是第25页,共110页目录目录肽是
15、由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。两两分分子子氨氨基基酸酸缩缩合合形形成成二二肽肽,三三分分子子氨氨基基酸酸缩缩合合则形成三肽则形成三肽肽肽链链中中的的氨氨基基酸酸分分子子因因为为脱脱水水缩缩合合而而基基团团不不全全,被称为氨基酸残基被称为氨基酸残基(residue)。由由十十个个以以内内氨氨基基酸酸相相连连而而成成的的肽肽称称为为寡寡肽肽(oligopeptide),由由更更多多的的氨氨基基酸酸相相连连形形成成的的肽肽称称多多肽肽(polypeptide)。现在学习的是第26页,共110页目录目录N 末端:多肽链中有末端:多肽链中有游离游离-氨基氨基
16、的一端的一端C 末端:多肽链中有末端:多肽链中有游离游离-羧基羧基的一端的一端n多肽链有两端:多肽链有两端:多多肽肽链链(polypeptide chain)是是指指许许多多氨氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。基酸之间以肽键连接而成的一种结构。现在学习的是第27页,共110页N末端末端C末端末端牛核糖核酸酶牛核糖核酸酶现在学习的是第28页,共110页目录目录(二)(二)体内存在多种重要的生物活性肽体内存在多种重要的生物活性肽 1.谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione,GSH)现在学习的是第29页,共110页目录目录GSH过氧过氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还
17、原酶还原酶NADPH+H+NADP+nGSH与与GSSG间的转换间的转换 GSH具还原性及噬核特性具还原性及噬核特性现在学习的是第30页,共110页目录目录 体内许多激素属寡肽或多肽体内许多激素属寡肽或多肽 神经肽神经肽(neuropeptide)2.多肽类激素及神经肽多肽类激素及神经肽现在学习的是第31页,共110页目录目录蛋白质的分子结构蛋白质的分子结构The Molecular Structure of Protein 第二节第二节现在学习的是第32页,共110页目录目录n蛋白质的分子结构包括蛋白质的分子结构包括:高级高级结构结构一级结构一级结构(primary structure)二级
18、结构二级结构(secondary structure)三级结构三级结构(tertiary structure)四级结构四级结构(quaternary structure)现在学习的是第33页,共110页目录目录n定义定义:蛋白质的一级结构指在蛋白质分子从蛋白质的一级结构指在蛋白质分子从N-端至端至C-端端的的氨基酸排列顺序氨基酸排列顺序。一、一、氨基酸的排列顺序决定蛋白质氨基酸的排列顺序决定蛋白质的一级结构的一级结构n主要的化学键主要的化学键:肽键肽键,有些蛋白质还包括二硫键。,有些蛋白质还包括二硫键。现在学习的是第34页,共110页目录目录一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学一级结构是蛋白质
19、空间构象和特异生物学功能的基础功能的基础,但不是决定蛋白质空间构象的但不是决定蛋白质空间构象的唯一因素唯一因素。现在学习的是第35页,共110页目录目录二、二、多肽链的局部主链构象为蛋白质多肽链的局部主链构象为蛋白质二级结构二级结构蛋蛋白白质质分分子子中中某某一一段段肽肽链链的的局局部部空空间间结结构构,即即该该段段肽肽链链主主链链骨骨架架原原子子的的相相对对空空间间位位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。n定义定义:n主要的化学键主要的化学键:氢键氢键氢键形成的两个条件:氢的供体、氢的受氢键形成的两个条件:氢的供体、氢的受体体(X-Hy)现在学习的是第36页,共
20、110页目录目录(一)参与肽键形成的(一)参与肽键形成的6个原子在同一平面上个原子在同一平面上由由于于肽肽键键具具有有部部分分双双键键的的性性质质,不不能能自自由由旋旋转转,参参与与肽肽键键的的6个个原原子子C 1、C、O、N、H、C 2位位于于同同一一平平面面,C 1和和C 2在在平平面面上上所所处处的的位位置置为为反反式式(trans)构构型型,此此同同一一平平面面上上的的6个个原原子子构构成成了了所所谓谓的的肽单元肽单元(peptide unit)。C-N 0.149nm肽键中肽键中C-N 0.132nmC=N 0.127nm现在学习的是第37页,共110页目录目录蛋白质的空间构象:蛋白
21、质的空间构象:天然蛋白质在其一级结构的天然蛋白质在其一级结构的基础上通过折叠、盘旋,形成各自独特的空间结构。基础上通过折叠、盘旋,形成各自独特的空间结构。这种空间结构称为这种空间结构称为。蛋白质的主链骨架是由一系列刚性的肽平面所组蛋白质的主链骨架是由一系列刚性的肽平面所组成。肽键两端的成。肽键两端的-碳原子所形成的单键可自由碳原子所形成的单键可自由旋转,此旋转决定了两个肽平面的相对关系,旋转,此旋转决定了两个肽平面的相对关系,从而使多肽链折叠、盘曲成高级结构。从而使多肽链折叠、盘曲成高级结构。现在学习的是第38页,共110页目录目录 肽单元肽单元 (peptide unit)现在学习的是第39
22、页,共110页目录目录 -螺旋螺旋 (-helix)-折叠折叠 (-pleated sheet)-转角转角 (-turn)无规卷曲无规卷曲 (random coil)(二)(二)-螺旋结构是常见的蛋白质二级结构螺旋结构是常见的蛋白质二级结构n蛋白质二级结构蛋白质二级结构现在学习的是第40页,共110页目录目录n-螺旋螺旋现在学习的是第41页,共110页目录目录小结多个肽键平面通过多个肽键平面通过碳原子旋转,相互之间碳原子旋转,相互之间以顺时针方向紧密盘曲成稳固的右手螺旋。以顺时针方向紧密盘曲成稳固的右手螺旋。-47-47 -57-57主链呈螺旋上升,每主链呈螺旋上升,每3.6个氨基酸残基上升一
23、个氨基酸残基上升一圈,相当于圈,相当于0.54nm。氨基酸侧链伸向螺旋外侧。氨基酸侧链伸向螺旋外侧。螺旋每个肽键的螺旋每个肽键的N-H 和第四个肽键的和第四个肽键的CO形形成氢健,这是稳定成氢健,这是稳定螺旋的主要键。螺旋的主要键。现在学习的是第42页,共110页目录目录(三)(三)-折叠折叠使多肽链形成片层结构使多肽链形成片层结构现在学习的是第43页,共110页目录目录是肽链相当伸展的结构,每个肽单元以是肽链相当伸展的结构,每个肽单元以C 为转折点折叠为转折点折叠成锯齿状,相邻肽键平面间呈成锯齿状,相邻肽键平面间呈110角。氨基酸残基的角。氨基酸残基的R侧侧链伸出在锯齿的上方或下方。链伸出在
24、锯齿的上方或下方。依靠两条肽链或一条肽链内的两段肽链间的依靠两条肽链或一条肽链内的两段肽链间的CO与与H形形成氢键,使构象稳定。成氢键,使构象稳定。两段肽链可以是平行的,也可以是反平行的。即前者两段肽链可以是平行的,也可以是反平行的。即前者两条链从两条链从“N端端”到到“C端端”是同方向的,后者是反方向的。是同方向的,后者是反方向的。片层结构的形式十分多样,正、反平行能相互交替。片层结构的形式十分多样,正、反平行能相互交替。平行的平行的片层结构中,两个残基的间距为片层结构中,两个残基的间距为0.65nm;反平;反平行的行的片层结构,则间距为片层结构,则间距为0.7nm.小结小结现在学习的是第4
25、4页,共110页目录目录(四)(四)-转角和无规卷曲在蛋白质分子中普转角和无规卷曲在蛋白质分子中普遍存在遍存在-转角转角无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。链结构。现在学习的是第45页,共110页目录目录(五)模体(五)模体是具有特殊功能的超二级结构是具有特殊功能的超二级结构在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个构的肽段,在空间上相互接近,形成一个有规则的二级有规则的二级结构组合,被称为结构组合,被称为超二级结构超二级结构。二级结构组合形式有二级结构
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