酶的分子结构与功能课件.ppt
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1、关于酶的分子结构与功能第1页,此课件共134页哦生物催化剂生物催化剂(biocatalyst)n酶酶(enzyme)是一类由活细胞产生的,对其是一类由活细胞产生的,对其特异底物具有高效催化作用的生物大分特异底物具有高效催化作用的生物大分子。子。n 核酶核酶(ribozyme):具有高效、特异催化作:具有高效、特异催化作用的核酸,主要参与用的核酸,主要参与RNA的剪接。的剪接。第2页,此课件共134页哦l l底物底物(substrate,S):酶作用的物质。:酶作用的物质。l l产物产物(product,P):反应生成的物质。:反应生成的物质。l l酶促反应酶促反应:酶催化的反应。:酶催化的反应
2、。l l酶活性酶活性:酶催化化学反应的能力。:酶催化化学反应的能力。第3页,此课件共134页哦n n酶学研究简史酶学研究简史公元前两千多年,我国已有酿酒记载。公元前两千多年,我国已有酿酒记载。公元前两千多年,我国已有酿酒记载。公元前两千多年,我国已有酿酒记载。一一一一百百百百余余余余年年年年前前前前,PasteurPasteur认认认认为为为为发发发发酵酵酵酵是是是是酵酵酵酵母母母母细细细细胞胞胞胞生生生生命命命命活活活活动动动动的的的的结果。结果。结果。结果。18781878年,年,年,年,KhneKhne首次提出首次提出首次提出首次提出EnzymeEnzyme一词。一词。一词。一词。189
3、71897年年年年,Eduard Eduard BuchnerBuchner用用用用不不不不含含含含细细细细胞胞胞胞的的的的酵酵酵酵母母母母提提提提取取取取液液液液,实实实实现了发酵。现了发酵。现了发酵。现了发酵。19261926年年年年,SumnerSumner首首首首 次次次次 从从从从 刀刀刀刀 豆豆豆豆 中中中中 提提提提 纯纯纯纯 出出出出 脲脲脲脲 酶酶酶酶 结结结结 晶晶晶晶 (deoxyribozyme)(deoxyribozyme)。第4页,此课件共134页哦19821982年年年年,CechCech首首首首次次次次发发发发现现现现RNARNA也也也也具具具具有有有有酶酶酶酶
4、的的的的催催催催化化化化活活活活性性性性,提提提提出出出出核酶核酶核酶核酶(ribozyme)(ribozyme)的概念。的概念。的概念。的概念。19951995年年年年,Jack Jack W.SzostakW.Szostak研研研研究究究究室室室室首首首首先先先先报报报报道道道道了了了了具具具具有有有有DNADNA连接酶活性连接酶活性连接酶活性连接酶活性DNADNA片段,称为片段,称为片段,称为片段,称为脱氧核酶脱氧核酶脱氧核酶脱氧核酶(deoxyribozyme)(deoxyribozyme)。第5页,此课件共134页哦第一节第一节酶的分子结构与功能酶的分子结构与功能The Molecu
5、lar Structure and Function of Enzyme第6页,此课件共134页哦n n酶的不同形式酶的不同形式:单体酶单体酶单体酶单体酶(monomeric enzyme)(monomeric enzyme):仅具有三级结构的酶。仅具有三级结构的酶。仅具有三级结构的酶。仅具有三级结构的酶。寡寡寡寡聚聚聚聚酶酶酶酶(oligomeric(oligomeric enzyme)enzyme):由由由由多多多多个个个个相相相相同同同同或或或或不不不不同同同同亚亚亚亚基基基基以以以以非非非非共价键连接组成的酶。共价键连接组成的酶。共价键连接组成的酶。共价键连接组成的酶。多多多多酶酶酶酶
6、体体体体系系系系(multienzyme(multienzyme system)system):由由由由几几几几种种种种不不不不同同同同功功功功能能能能的的的的酶酶酶酶彼彼彼彼此此此此聚合形成的多酶复合物。聚合形成的多酶复合物。聚合形成的多酶复合物。聚合形成的多酶复合物。多多多多 功功功功 能能能能 酶酶酶酶(multifunctional(multifunctional enzyme)enzyme)或或或或 串串串串 联联联联 酶酶酶酶(tandem(tandem enzyme)enzyme):一一一一些些些些多多多多酶酶酶酶体体体体系系系系在在在在进进进进化化化化过过过过程程程程中中中中由
7、由由由于于于于基基基基因因因因的的的的融融融融合合合合,多多多多种种种种不不不不同同同同催催催催化化化化功功功功能能能能存存存存在在在在于于于于一一一一条条条条多多多多肽肽肽肽链链链链中中中中,这这这这类类类类酶酶酶酶称称称称为为为为多多多多功能酶。功能酶。功能酶。功能酶。第7页,此课件共134页哦一、酶的分子组成中常含有辅助因子一、酶的分子组成中常含有辅助因子蛋白质部分:酶蛋白蛋白质部分:酶蛋白 (apoenzyme)辅助因子辅助因子(cofactor)金属离子金属离子小分子有机化合物小分子有机化合物全酶全酶(holoenzyme)n n结合酶结合酶结合酶结合酶 (conjugated en
8、zyme)(conjugated enzyme)n单纯酶单纯酶(simple enzyme):淀粉酶、脂酶淀粉酶、脂酶淀粉酶、脂酶淀粉酶、脂酶第8页,此课件共134页哦n n全酶分子中各部分在催化反应中的作用全酶分子中各部分在催化反应中的作用全酶分子中各部分在催化反应中的作用全酶分子中各部分在催化反应中的作用:酶蛋白酶蛋白酶蛋白酶蛋白决定反应的决定反应的决定反应的决定反应的特异性特异性特异性特异性辅助因子辅助因子辅助因子辅助因子决定反应的决定反应的决定反应的决定反应的种类与性质种类与性质种类与性质种类与性质第9页,此课件共134页哦金属酶金属酶(metalloenzyme)金属离子与酶结合紧密
9、,提取过程中不易丢失。金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易丢失。金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易丢失。金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易丢失。金属激活酶金属激活酶(metal-activated enzyme)金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不甚紧密。甚紧密。甚紧密。甚紧密。n n金属离子是最多见的辅助因子金属离子是最多见的辅助因子金属离子是最多见的辅助因子金属离子是最多见的辅助因子第10页,此课件共134页哦金属金属离子的作用:离子的作用:参与催化反应,传递电子
10、;参与催化反应,传递电子;参与催化反应,传递电子;参与催化反应,传递电子;在酶与底物间起桥梁作用;在酶与底物间起桥梁作用;在酶与底物间起桥梁作用;在酶与底物间起桥梁作用;稳定酶的构象;稳定酶的构象;稳定酶的构象;稳定酶的构象;中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。第11页,此课件共134页哦n n小分子有机化合物是一些化学稳定的小分子物质,称小分子有机化合物是一些化学稳定的小分子物质,称小分子有机化合物是一些化学稳定的小分子物质,称小分子有机化合物是一些化学稳定的小分子物质,称为为为为辅酶
11、辅酶辅酶辅酶 (coenzyme)(coenzyme)。其主要作用是参与酶的催化过程,在反应中传其主要作用是参与酶的催化过程,在反应中传其主要作用是参与酶的催化过程,在反应中传其主要作用是参与酶的催化过程,在反应中传递电子、质子或一些基团。递电子、质子或一些基团。递电子、质子或一些基团。递电子、质子或一些基团。辅酶的种类不多,且分子结构中常含有维生素或维辅酶的种类不多,且分子结构中常含有维生素或维辅酶的种类不多,且分子结构中常含有维生素或维辅酶的种类不多,且分子结构中常含有维生素或维生素类物质。生素类物质。生素类物质。生素类物质。第12页,此课件共134页哦转移的基团转移的基团小分子有机化合物
12、(辅酶或辅基)小分子有机化合物(辅酶或辅基)名称名称所含的维生素所含的维生素氢原子(质子)氢原子(质子)NADNAD(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸,辅酶苷酸,辅酶I I尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PPPP)之一)之一NADPNADP(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸,辅酶苷酸磷酸,辅酶II II尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PPPP)之一)之一FMNFMN(黄素单核苷酸)(黄素单核苷酸)维生素维生素B B2 2(核黄素)(核黄素)FADFAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)(黄素腺嘌呤二核苷酸)维生素维生素B B2 2(核黄素)(核黄素)醛基醛基TPPTPP(焦磷酸硫胺
13、素)(焦磷酸硫胺素)维生素维生素B B1 1(硫胺素)(硫胺素)酰基酰基辅酶辅酶A A(CoACoA)泛酸泛酸硫辛酸硫辛酸硫辛酸硫辛酸烷基烷基钴胺素辅酶类钴胺素辅酶类维生素维生素B B1212二氧化碳二氧化碳生物素生物素生物素生物素氨基氨基磷酸吡哆醛磷酸吡哆醛吡哆醛(维生素吡哆醛(维生素B6B6之一)之一)甲基、甲烯基、甲炔基、甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基等一碳单位甲酰基等一碳单位四氢叶酸四氢叶酸叶酸叶酸某些辅酶(辅基)在催化中的作用某些辅酶(辅基)在催化中的作用第13页,此课件共134页哦n n辅酶中与酶蛋白共价结合的辅酶又称为辅酶中与酶蛋白共价结合的辅酶又称为辅酶中与酶蛋白共价结合的辅酶又
14、称为辅酶中与酶蛋白共价结合的辅酶又称为辅基辅基辅基辅基(prosthetic group)(prosthetic group)(prosthetic group)(prosthetic group)。n n辅基和酶蛋白结合紧密,不能通过透析或超滤等辅基和酶蛋白结合紧密,不能通过透析或超滤等辅基和酶蛋白结合紧密,不能通过透析或超滤等辅基和酶蛋白结合紧密,不能通过透析或超滤等方法将其除去,在反应中不能离开酶蛋白,如方法将其除去,在反应中不能离开酶蛋白,如方法将其除去,在反应中不能离开酶蛋白,如方法将其除去,在反应中不能离开酶蛋白,如FADFADFADFAD、FMNFMNFMNFMN、生物素等。、生
15、物素等。、生物素等。、生物素等。第14页,此课件共134页哦 NAD+和和NADP+l l维生素维生素维生素维生素PPPP抗癞皮病维生素的抗癞皮病维生素的抗癞皮病维生素的抗癞皮病维生素的体内活性形式:体内活性形式:体内活性形式:体内活性形式:尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD(NAD+)尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP(NADP+)l l脱氢酶的辅酶(传递电子和质子)脱氢酶的辅酶(传递电子和质子)脱氢酶的辅酶(传递电子和质子)脱氢酶的辅酶(传递电子和质
16、子)亦称:亦称:亦称:亦称:辅酶辅酶辅酶辅酶和和和和辅酶辅酶辅酶辅酶第15页,此课件共134页哦NADP+:R为为尼克酰胺NAD+:R为为 H第16页,此课件共134页哦第17页,此课件共134页哦 FMN 和和FAD维生素维生素B2核黄素核黄素核黄素核黄素(riboflavin)(riboflavin)体内活性形式为体内活性形式为体内活性形式为体内活性形式为黄素单核苷酸黄素单核苷酸(FMN)和和黄素腺嘌呤黄素腺嘌呤二核苷酸二核苷酸(FAD)。FMNFMN及及及及FADFAD是体内是体内是体内是体内氧化还原酶氧化还原酶(如脂酰如脂酰如脂酰如脂酰CoACoA脱氢酶、脱氢酶、脱氢酶、脱氢酶、琥珀酸
17、脱氢酶、黄嘌呤氧化酶等)的辅基,主要琥珀酸脱氢酶、黄嘌呤氧化酶等)的辅基,主要琥珀酸脱氢酶、黄嘌呤氧化酶等)的辅基,主要琥珀酸脱氢酶、黄嘌呤氧化酶等)的辅基,主要起起起起氢传递体氢传递体的作用的作用的作用的作用 。第18页,此课件共134页哦VB2FMNAMPFAD第19页,此课件共134页哦焦磷酸硫胺素焦磷酸硫胺素(thiamine pyrophosphate,TPP)维生素维生素B1 硫胺素(抗神经炎因子、抗脚气病硫胺素(抗神经炎因子、抗脚气病硫胺素(抗神经炎因子、抗脚气病硫胺素(抗神经炎因子、抗脚气病V V)功能:功能:以辅酶方式参加糖的分解代谢。以辅酶方式参加糖的分解代谢。以辅酶方式参
18、加糖的分解代谢。以辅酶方式参加糖的分解代谢。TPPTPP是是是是维生素维生素维生素维生素B B1 1的的的的活性形式,是活性形式,是活性形式,是活性形式,是-酮酸氧化脱羧酶、转酮酶的辅酶。酮酸氧化脱羧酶、转酮酶的辅酶。酮酸氧化脱羧酶、转酮酶的辅酶。酮酸氧化脱羧酶、转酮酶的辅酶。第20页,此课件共134页哦 泛酸泛酸泛酸泛酸(pantothenic acid)(pantothenic acid)遍多酸的体内活性形式遍多酸的体内活性形式遍多酸的体内活性形式遍多酸的体内活性形式.酰基转移酶的辅酶,参与酰基转移酶的辅酶,参与酰基转移酶的辅酶,参与酰基转移酶的辅酶,参与酰基酰基酰基酰基的转移作用。的转移
19、作用。的转移作用。的转移作用。辅酶辅酶A(CoASH)酰基结合位点第21页,此课件共134页哦VB6转氨和脱羧过程中的辅酶转氨和脱羧过程中的辅酶转氨和脱羧过程中的辅酶转氨和脱羧过程中的辅酶转氨:通过醛、胺转化转氨:通过醛、胺转化转氨:通过醛、胺转化转氨:通过醛、胺转化第22页,此课件共134页哦生物素生物素(VB7)体内多种体内多种体内多种体内多种羧化酶羧化酶(如(如(如(如丙丙丙丙酮酸羧化酶、乙酰酮酸羧化酶、乙酰酮酸羧化酶、乙酰酮酸羧化酶、乙酰CoACoA羧化羧化羧化羧化酶)酶)酶)酶)的辅基,与专一性的的辅基,与专一性的的辅基,与专一性的的辅基,与专一性的羧化酶蛋白的羧化酶蛋白的羧化酶蛋白
20、的羧化酶蛋白的赖氨酸残基赖氨酸残基赖氨酸残基赖氨酸残基相相相相结合结合结合结合,参与,参与,参与,参与CO2固定固定过程。过程。过程。过程。第23页,此课件共134页哦叶酸叶酸叶酸叶酸(folic acid)(folic acid)又称蝶酰谷氨酸,体内活性形式为四又称蝶酰谷氨酸,体内活性形式为四又称蝶酰谷氨酸,体内活性形式为四又称蝶酰谷氨酸,体内活性形式为四氢叶酸氢叶酸氢叶酸氢叶酸(FH(FH4 4)。一碳单位转移酶一碳单位转移酶的辅酶,参与一碳单位(甲基、甲的辅酶,参与一碳单位(甲基、甲的辅酶,参与一碳单位(甲基、甲的辅酶,参与一碳单位(甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基等)的转移。烯基、甲炔基、
21、甲酰基等)的转移。烯基、甲炔基、甲酰基等)的转移。烯基、甲炔基、甲酰基等)的转移。N5、N10 是一碳是一碳是一碳是一碳单位的结合位点。单位的结合位点。单位的结合位点。单位的结合位点。四氢叶酸(四氢叶酸(FH4)第24页,此课件共134页哦l l缺乏症:缺乏症:缺乏症:缺乏症:叶酸缺乏时,红细胞的发育受到影响,叶酸缺乏时,红细胞的发育受到影响,叶酸缺乏时,红细胞的发育受到影响,叶酸缺乏时,红细胞的发育受到影响,造成巨红细胞性贫血症。造成巨红细胞性贫血症。造成巨红细胞性贫血症。造成巨红细胞性贫血症。叶酸叶酸二氢叶酸还原酶二氢叶酸还原酶NADPH+H+NADP+二氢叶酸二氢叶酸二氢叶酸还原酶二氢叶
22、酸还原酶NADPH+H+NADP+四氢叶酸四氢叶酸5,6,7,8-四氢叶酸四氢叶酸(FH4)CH27第25页,此课件共134页哦二、酶的活性中心是酶分子中执行其催二、酶的活性中心是酶分子中执行其催化功能的部位化功能的部位酶的结构酶的结构酶的结构酶的结构必需基团必需基团其它部分其它部分其它部分其它部分活性中心活性中心活性中心以外的必需基团活性中心以外的必需基团活性中心以外的必需基团活性中心以外的必需基团结合基团结合基团催化基团催化基团第26页,此课件共134页哦酶分子中氨基酸残基酶分子中氨基酸残基酶分子中氨基酸残基酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中,一些侧链的化学基团中,一些侧链的化学基团中,一
23、些侧链的化学基团中,一些与酶活性密切相关的化学与酶活性密切相关的化学与酶活性密切相关的化学与酶活性密切相关的化学基团。基团。基团。基团。n必需基团必需基团(essential group)第27页,此课件共134页哦指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物。这一区域称为并将底物转化为产物。这一区域称为并将底物转化为产
24、物。这一区域称为并将底物转化为产物。这一区域称为酶的活性中酶的活性中心。心。n酶的活性中心酶的活性中心(active center)第28页,此课件共134页哦活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团结合基团结合基团(binding group)与底物相结合与底物相结合催化基团催化基团(catalytic group)催化底物转变成产物催化底物转变成产物位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象和(或)作为调节剂的结合部位所必需。间
25、构象和(或)作为调节剂的结合部位所必需。间构象和(或)作为调节剂的结合部位所必需。间构象和(或)作为调节剂的结合部位所必需。l活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团第29页,此课件共134页哦底物活性中心以外的必需基团结合基团催化基团活性中心第30页,此课件共134页哦n溶菌酶的活性中心溶菌酶的活性中心溶溶溶溶菌菌菌菌酶酶酶酶的的的的活活活活性性性性中中中中心心心心是是是是一一一一裂裂裂裂隙隙隙隙,可可可可以以以以容容容容纳纳纳纳肽肽肽肽多多多多糖糖糖糖的的的的6 6个个个个单单单单糖糖糖糖基基基基(A A,B B,C C,D D,E E,F F),并
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