真核生物的基因组精选PPT.ppt
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1、关于真核生物的基因关于真核生物的基因组第1页,讲稿共67张,创作于星期二掌握断裂基因、端粒的概念、重复序列分类。掌握真核生物染色体的一般特征,线粒体的遗传特性。熟悉基因的转移,假基因,DNA的甲基化了解基因家族,DNA指纹及转座元件学习的目标与要求第2页,讲稿共67张,创作于星期二基因的概念基因的概念基因的概念随着分子遗传学、分子生物学、生物化学领域的进基因的概念随着分子遗传学、分子生物学、生物化学领域的进展而不断完善。展而不断完善。从遗传学角度看:从遗传学角度看:基因是生物的遗传物质,是遗传的基本单基因是生物的遗传物质,是遗传的基本单位位-突变单位、重组单位和功能单位。突变单位、重组单位和功
2、能单位。从分子生物学角度看:从分子生物学角度看:基因是负载着特定遗传信息的基因是负载着特定遗传信息的DNA分子片段,在一定条件下分子片段,在一定条件下能够表达这种遗传信息,执行特定的生理功能。能够表达这种遗传信息,执行特定的生理功能。复习第3页,讲稿共67张,创作于星期二基因组(基因组(genomegenome)是指生物体中一套完整的遗传是指生物体中一套完整的遗传物质的总和。物质的总和。基因组的结构是指具有一定生物学功能的片段在基因组的结构是指具有一定生物学功能的片段在核酸分子上的分布与排列情况。核酸分子上的分布与排列情况。基因组的功能是贮存和表达遗传信息。基因组的功能是贮存和表达遗传信息。第
3、4页,讲稿共67张,创作于星期二1.真核生物基因组都是由大分子双链线状真核生物基因组都是由大分子双链线状DNA构成。染色体通常成对出现(双倍体)。构成。染色体通常成对出现(双倍体)。2.基因组非常庞大,结构非常复杂,有多个复基因组非常庞大,结构非常复杂,有多个复制起始位点。制起始位点。一、真核生物基因组的特点(一般特征)一、真核生物基因组的特点(一般特征)第5页,讲稿共67张,创作于星期二3.基因组中存在大量的重复序列以及非编码序基因组中存在大量的重复序列以及非编码序列。真核生物基因组内非编码序列占列。真核生物基因组内非编码序列占90%90%以上,以上,是与细菌、病毒的重要区别,在一定程度上是
4、与细菌、病毒的重要区别,在一定程度上也是生物进化的标尺。也是生物进化的标尺。4.4.功能基因大多不连续,存在有内含子和外显功能基因大多不连续,存在有内含子和外显子;子;5.5.真核生物基因组中也存在一些可移动的真核生物基因组中也存在一些可移动的DNADNA序序列(转座元件)。列(转座元件)。第6页,讲稿共67张,创作于星期二真核生物基因组中通常存在大量的重复序列,真核生物基因组中通常存在大量的重复序列,可占整个基因组可占整个基因组DNADNA的的90%90%以以上。上。采用复性动力学方法来研究真核生物基因组采用复性动力学方法来研究真核生物基因组时,可按其复性速度的快慢或出现频率的高时,可按其复
5、性速度的快慢或出现频率的高低,将这些重复序列分为低,将这些重复序列分为高度重复序列高度重复序列,中中度重复序列度重复序列和和单拷贝序列单拷贝序列三大类。三大类。二、二、真核生物基因组中重复序列的结构与功能真核生物基因组中重复序列的结构与功能第7页,讲稿共67张,创作于星期二(一)高度重复序列:(一)高度重复序列:高度重复序列在基因组中重复频率高,可高度重复序列在基因组中重复频率高,可达达10106 6次,因此复性速度很快。高度重复序次,因此复性速度很快。高度重复序列在基因组中所占比例随种属而异,一般列在基因组中所占比例随种属而异,一般在在101060%60%范围内。范围内。人的高度重复序列约占
6、整个基因组的人的高度重复序列约占整个基因组的20%20%左右。左右。第8页,讲稿共67张,创作于星期二1.反向重复序列(反向重复序列(inverted repeatsinverted repeats):是是由两个相同顺序的互补拷贝在同一由两个相同顺序的互补拷贝在同一DNADNA 双链上反向排列而成双链上反向排列而成。高度重复序列按其结构特点可分为三种:高度重复序列按其结构特点可分为三种:第9页,讲稿共67张,创作于星期二反向重复序列的两种形式反向重复序列的两种形式发卡结构发卡结构第10页,讲稿共67张,创作于星期二回回 文文 结结 构构画上荷花和尚画画上荷花和尚画书临汉字翰林书书临汉字翰林书第
7、11页,讲稿共67张,创作于星期二2.2.卫星卫星DNADNA(satellite DNAsatellite DNA):卫卫星星DNADNA的的重重复复单单位位一一般般由由2 270 70 bpbp组组成成,成串排列。成串排列。卫卫星星DNADNA占占基基因因组组的的比比例例随随种种属属而而异异,在在0.50.531%31%范围内。范围内。第12页,讲稿共67张,创作于星期二卫卫星星DNADNA的的碱碱基基组组成成不不同同于于其其它它部部分分,故故可可用用等等密密度度梯梯度度离离心心法法从从基基因组中分离出来。因组中分离出来。第13页,讲稿共67张,创作于星期二人人类类基基因因组组中中可可分分
8、离离出出三三类类卫卫星星DNA DNA,共共占占人类基因组的人类基因组的5 6%5 6%:大卫星大卫星DNADNA(macrosatellite DNAmacrosatellite DNA):):n其其重重复复单单位位为为5171 5171 bpbp,主主要要分分布布于于染染色色体体的的着丝粒区。着丝粒区。小卫星小卫星DNADNA(minisatellite DNAminisatellite DNA):):n其重复单位为其重复单位为1570 bp1570 bp,存在于常染色体。,存在于常染色体。第14页,讲稿共67张,创作于星期二微卫星微卫星DNA/DNA/短串联重复序列(短串联重复序列(mi
9、crosatellite microsatellite DNA/short tandem repeat,STRDNA/short tandem repeat,STR):):n其重复单位为其重复单位为25 bp25 bp,存在于常染色体,常见于,存在于常染色体,常见于内含子中。内含子中。n人类基因组人类基因组DNADNA中平均每中平均每6 610kb10kb就有一个就有一个STRSTR位点位点 。不同个体之间在一个同源。不同个体之间在一个同源STRSTR位点的重复次数不同。位点的重复次数不同。由于重复单位及重复次数不同,使其在不同种族,不同由于重复单位及重复次数不同,使其在不同种族,不同人群之间
10、的分布具有很大差异性,构成了人群之间的分布具有很大差异性,构成了STRSTR遗传多态遗传多态性。性。第15页,讲稿共67张,创作于星期二DNA指纹指纹同一种属中不同个体的高度重复顺序的重复同一种属中不同个体的高度重复顺序的重复次数不一样,这可以作为每一个体的特征,次数不一样,这可以作为每一个体的特征,即即DNADNA指纹指纹 。STRSTR分析法已经成为分析法已经成为法医法医学领域个体识别和亲学领域个体识别和亲权鉴定的重要分析方法,可应用于权鉴定的重要分析方法,可应用于司法司法案件案件调查,也就是调查,也就是遗传指纹分析遗传指纹分析。第16页,讲稿共67张,创作于星期二Alec J.Jeffr
11、eysAlec J.Jeffreys和历史上第一张和历史上第一张DNADNA指纹图谱指纹图谱15-year old 15-year old Lynda MannLynda Mann15-year old 15-year old Dawn AshworthDawn Ashworth第17页,讲稿共67张,创作于星期二18021802年的一副杰斐逊和莎莉的讽刺画像年的一副杰斐逊和莎莉的讽刺画像第18页,讲稿共67张,创作于星期二第19页,讲稿共67张,创作于星期二(二)中度重复序列:(二)中度重复序列:中中度度重重复复序序列列是是指指在在基基因因组组中中重重复复数数十十次次至至数数万万次次的的部部
12、分分,其其复复性性速速度度快快于于单单拷拷贝贝序列,但慢于高度重复序列。序列,但慢于高度重复序列。第20页,讲稿共67张,创作于星期二中中度度重重复复序序列列中中有有一一部部分分是是编编码码rRNArRNA、tRNAtRNA、AluAlu家家族族、组组蛋蛋白白及及免免疫疫球球蛋蛋白白的的结结构构基基因因,另另一部分可能与基因调控有关。一部分可能与基因调控有关。第21页,讲稿共67张,创作于星期二真核基因组中,中度重复序列主要包括真核基因组中,中度重复序列主要包括短散在短散在核元件核元件(short interspersed nuclear short interspersed nuclear
13、elementselements,SINESINEs s)和)和长散在核元件长散在核元件(long long interspersed nuclear elementsinterspersed nuclear elements,LINELINEs s)。第22页,讲稿共67张,创作于星期二典典型型的的短短散散在在核核元元件件(SINEsSINEs)是是灵灵长长类类所所特特有有的的AluAlu重重复复序序列列家家族族,因因在在其其序序列列中中存存在在限限制制酶酶AluAlu的切点而得名。的切点而得名。限制性内切酶限制性内切酶AluAlu的切点为(的切点为(AG CT),AG CT),将其切成将其
14、切成 130bp130bp和和170bp170bp的两段。的两段。第23页,讲稿共67张,创作于星期二AluAlu家家族族的的功功能能是是多多方方面面的的,可可能能参参与与hnRNAhnRNA的的加加工工与与成成熟熟,也也与与遗遗传传重重组组及及染染色色体体不不稳稳定定性性有有关关。最最近近研研究究表表明明,AluAlu顺顺序序可可能能具具有转录调节作用。有转录调节作用。遗遗传传信信息息从从DNADNA分分子子转转录录到到RNARNA分分子子中中的的过过程程称称为为转转录录(transcription)(transcription)。在在真真核核生生物物中中,最最初初转转录录生生成成的的RNA
15、RNA称称为为不不均均一一核核RNA(heterogeneous RNA(heterogeneous nuclear nuclear RNA,hnRNA)RNA,hnRNA)。核核内内不不均均一一RNA RNA 为为存存在在于于真真核核生生物物细细胞胞核核中中的的不不稳稳定定、大大小小不不均均的的一一组组高高分分子子RNARNA(分分子子量量约约为为10510521072107,沉沉降降系系数数约约为为30100S30100S)之之总总称称。占占细细胞胞全全部部RNARNA之之百百分分之之几几,在在核核内内主主要要存存在在于于核核仁仁的的外外侧侧。认认为为hnRNAhnRNA多多属属信信使使R
16、NARNA(messenger messenger ribonucleic ribonucleic acidacid,mRNAmRNA)之之前前体体,包包括括各各种种基基因因的的转转录录产产物物及及其其成成为为mRNAmRNA前前的的各各中中间间阶阶段段的的分分子子,在在55末末端端多多附附有有间间隙隙结结构构,而而33的的末末端端附附有有多多聚聚腺腺苷苷酸酸聚聚合合酶酶分分子子。这这些些hn-RNAhn-RNA在在受受到到加加工工之之后后,移移至至细细胞胞质质,作作为为mRNAmRNA而而发发挥挥其其功功能能。大大部分的部分的hnRNAhnRNA在核内与各种特异的蛋白质形成复合体而存在着在核
17、内与各种特异的蛋白质形成复合体而存在着第24页,讲稿共67张,创作于星期二典型的典型的长散在核元件长散在核元件(LINEsLINEs)是是KpnKpn重复序重复序列列家族,因在其序列中存在限制酶家族,因在其序列中存在限制酶KpnKpn的切点的切点而得名。而得名。KpnKpn家族的重复单位一般为家族的重复单位一般为6 7 kb6 7 kb或更长,或更长,其两侧也各有一段正向重复序列,功能上与其两侧也各有一段正向重复序列,功能上与AluAlu家族相似。家族相似。第25页,讲稿共67张,创作于星期二(三)单拷贝序列(单拷贝基因):(三)单拷贝序列(单拷贝基因):单拷贝序列在基因组中只出现一次或少数单
18、拷贝序列在基因组中只出现一次或少数几次,因此复性速度很慢。几次,因此复性速度很慢。单拷贝序列属于结构基因,它储存了巨大单拷贝序列属于结构基因,它储存了巨大的遗传信息,编码各种功能不同的蛋白质。的遗传信息,编码各种功能不同的蛋白质。第26页,讲稿共67张,创作于星期二1、断裂基因(、断裂基因(split gene)。)。真核生物的结构基因的真核生物的结构基因的DNA序列由编码序列和非序列由编码序列和非编码序列两部分组成,编码序列是不连续的,被编码序列两部分组成,编码序列是不连续的,被非编码序列分割开来,称为断裂基因非编码序列分割开来,称为断裂基因(splitgene)。其包括外显子和内含子。)。
19、其包括外显子和内含子。第27页,讲稿共67张,创作于星期二(1 1)、外显子和内含子)、外显子和内含子在结构基因中,编码序列称为在结构基因中,编码序列称为外显子外显子(exon),表达多肽链部,表达多肽链部分。非编码序列称为分。非编码序列称为内含子内含子(Intron),又称插入序列。,又称插入序列。珠蛋白珠蛋白基因(基因(1700bp)=3个外显子个外显子+2个内含子。个内含子。DMD基因(基因(2300kb)=79个外显子个外显子+78个内含子。(迄今认个内含子。(迄今认识的最大的基因)识的最大的基因)第28页,讲稿共67张,创作于星期二真核生物内含子和外显子真核生物内含子和外显子不是完全
20、固定不变的,有时不是完全固定不变的,有时同一同一DNA链上的某一段链上的某一段DNA序列,当它作为编码某序列,当它作为编码某一多肽链的基因时是外显子,而作为编码另一多肽一多肽链的基因时是外显子,而作为编码另一多肽链时,则是内含子。这样,同一基因却可以转录两链时,则是内含子。这样,同一基因却可以转录两种或两种以上的种或两种以上的mRNA。真核生物某些结构真核生物某些结构Gene没有内含子,如组蛋白没有内含子,如组蛋白Gene,干扰素,干扰素Gene等。它们多以基因簇形式存在,等。它们多以基因簇形式存在,大多数的酵母结构大多数的酵母结构Gene也没有内含子。也没有内含子。第29页,讲稿共67张,创
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