生物信息学网站汇总fyvu.docx

《生物信息学网站汇总fyvu.docx》由会员分享，可在线阅读，更多相关《生物信息学网站汇总fyvu.docx（13页珍藏版）》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。

1、EMBLL biiocoompuutinng ttutooriaalsPlaant gennomee daababbasee tuutorriall生物信信息学机机构NCCBIIInteernaatioonall Nuucleeotiide Seqquennce Dattabaase Colllabboraatioon.EEBI USDDASaangeer CCenttre北北京大学学生物信信息学中中心数据据库信息息发布及及其它GGenBBankk Reeleaase NottesddbESST ssummmaryy reeporrtEMMBL relleasse nnotees mman?e

2、mbblDDDBJ relleasse nnotees rrelnnotee.httmlEEukaaryooticc prromooterr daatabbasee reeleaase nottesSSwisssPrrot relleasse nnotees mman?swiisspprottPIRR reeleaase nottes maan?ppirPPRF relleasse nnotees mann?prrfPDDBSTTR rreleeasee nootess maan?ppdbsstrPProssitee reeleaase nottes mann?prrosiitePPDB re

3、lleasse nnotees mann?pddbKEEGG relleasse nnotees mman?patthwaay核苷苷酸数据据库GeenBaankddbESST ddbSTTS ddbGSSS GGenoome (NCCBI)dbSSNP HTGGSUnniGeeneEEMBLL核苷酸酸数据库库Gennomee (EEBI)向EMMBL数数据库提提交序列列DDBBJ Pllantt R genne ddataabasse 启启动子数数据库EEukaaryooticc prromooterr daatabbasee 转录录因子数数据库FFRANNSFAACoooTFDD蛋白质质数据

4、库库SWIISS-PROOT或TTrEMMBL PIRRPRFF PDDBSTTR bbfinnd?ppdbsstr-toddayPProssitee结结构数据据库PDDB NNDBDDNA-Binndinng PProtteinn Daatabbasee . /dnnabiind/inddex.htmmlNMMR NNuclleicc Accidss DaatabbaseeProoteiin PPluss Daatabbasee . /prooteiin/iindeex.hhtmllSwiiss 3Diimagge SCCOPCAATH酶、代代谢和调调控路径径数据库库KEGGG Enzzym

5、ee Noomennclaaturre DDataabasse PProtteinn Kiinasse RResoourcce (PKRR)LIIGANNDWIIT EEcoCCycUM-BBDD多种代代谢路径径数据库库基因调调控路径径数据库库(TRRANSSPATTH)基基因组数数据库日日本水稻稻基因组组数据库库(RGGP)华华大水稻稻基因组组框架图图欧洲水水稻测序序（第112染色色体）拟拟南芥基基因组数数据库UUSDAA Daatabbasee DDemeeterrs GennomeesRiiceGGenees RiiceBBlasstDBBFllyBaaseMMousse GGenoom

6、e Infformmatiics Saccchaarommycees GGenoome Dattabaaseurll=/urrl多多种基因因组数据据库文献献数据库库PubbMedd OMMIMAAgriicolla 关关键词为为基础的的数据库库检索EEntrrezEnntreez NNuclleottidee Seequeencee SeearcchEEntrrez Prooteiin SSequuencce SSearrchBattch EnttrezzSeequeencee Reetriievaal SSysttem, Inndiaa Seequeencee Reetriievaal SS

7、ysttem, Siingaaporre SSequuencce RRetrrievval Sysstemm, UUS Seqquennce Rettrieevall Syysteem, UKGettEnttry Nuccleootidde & Prroteein Seqquennce SeaarchhDattabaase Seaarchh wiith Keyy Woordss DDBGEET/LLinkkDB 序列为为基础的的数据库库检索BBLASSTFFASTTABBLITTZSSeearcch EElecctroonicc PCCRPrroteeomee annalyysiss多序列列分

8、析CClusstall muultiiplee seequeencee allignnmennt. httmlBBCMEEBI CluustaalW anaalyssis系系谱分析析PAUUPEBII CllusttalWW annalyysissGCGG paackaagePPHYLLIP MEGGA/MMETRREE Hennnigg86 GAMMBITT . /Reeseaarchh/Prrogrramss/MaacClladee Phyyloggeneeticc annalyysiss基因结结构预测测分析GGENSSCANNGeeneFFindderGGenee Feeatuure S

9、eaarchhes Graail GraailEEXPGGeneeMarrk VVeillAAAT GGENEEID GennlanngGGeneeParrserr GGlimmmerr MZZEFPrrocrrusttes 蛋白质质结构预预测分析析Exppasyy PPreddicttingg prroteein secconddaryy sttruccturre PPreddicttingg prroteein 3D Strructturees PPreddicttingg prroteein strructturees 其其它分析析工具和和软件PPutaativve DDNA Seqqu

10、enncinng EErroors CheeckMaatInnspeectoor FFasttMWebb Siignaal SScannBCCM SSearrch Lauunchher Webbcuttterr Traansllatee DNNA tto pprotteinnAABIMMsequuencce mmotiifs:PfaamPrroDoom PPRINNTS 其它多种数据据库、分分析工具具和生物物信息学学机构多多种数据据库和分分析工具具Commparratiive seqquennce anaalyssis功功能基因因组分析析Traansccripptioon pproffilii

11、ng tecchnoologgiess Prrotoocolls ffor cDNNA aarraay ttechhnollogyy Datta mmanaagemmentt annd aanallysiis oof ggenee exxpreessiion arrrayssExammplees oof ccommmercciallly avaailaablee fiilteer aarraays:GenneFiilteersTTM (Ressearrch Gennetiics) Geene Disscovveryy Arrrayys (Gennomee Syysteems) AttlassTM Arrrayss (CCLONNTECCH)