药学分子生物学重点hgrt.docx
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1、药学分子子生物学学 绪论基因诊断断:应用用分子生生物学技技术,检检测人体体某些基基因结构构或表达达的变化化,或检检测病原原体基因因组在人人体内的的存在,从从而达到到诊断或或监控疗疗效的目目的基因治疗疗:通过过特定的的分子生生物学技技术,关关闭或降降低异常常表达的的基因;或将正正常的外外源基因因导入体体内特定定的靶细细胞以弥弥补缺陷陷基因;或将某某种特定定基因导导入体细细胞表达达一产生生特定的的蛋白质质因子,实实现对疾疾病的治治疗作用用药物基因因组学:研究遗遗传变异异对药物物效能和和毒性的的影响,开辟药药物研发发的领域域、促进进合理用用药的发发展、加加强临床床前及临临床药理理的研究究并对药药物经
2、济济学产生生重要影影响。第一章 核酸的的分子结结构、性性质和功功能DNA双双螺旋结结构DNA分分子是由由两条互互补的多多核苷酸酸链组成成的。两两条链以以一定的的空间距距离,在在同一轴轴上相互互盘旋起起来构成成双螺旋旋结构。 DNA双双链呈反反向平行行。一条条链的走走向从55到3,另一一条链的的走向从从3到5。AT,GGC各对碱基基上下之之间的距距离为33.4,每个个螺距的的距离334 ,包括括10对对碱基。中心法法则DNA是是自身复复制的模模板DNA通通过转录录将遗传传信息传传递给中中间物质质RNAARNA通通过翻译译将遗传传信息表表达为蛋蛋白质在某些病病毒中,RRNA可可以自我我复制,并并且
3、在某某些病毒毒蛋白质质合成中中,RNNA可以以在逆转转录酶的的作用下下合成DDNA DNA的的结构与与功能一级结构构:DNNA分子子中脱氧氧核苷酸酸连接及及其排列列顺序,是是物种间间差异的的根本原原因1为RNNA和蛋蛋白质一一级结构构编码的的信息2基因选选择性表表达的调调控信息息二级结构构:是指指通过分分子间相相互作用用形成的的双链DDNA或或称为双双螺旋DDNA三级结构构:双螺螺旋DNNA进一一步扭曲曲盘绕则则形成其其三级结结构,超超螺旋是是DNAA三级结结构的主主要形式式三链DNNA: DNAA分子中中的单链链与双链链相互作作用形成成的三链链结构1基因表表达抑制制物:选选择性阻阻断靶基基因
4、,抑抑制其转转录2阻断序序列专一一性蛋白白质的结结合,影影响DNNA与蛋蛋白质结结合及DDNA复复制、转转录RNA的的结构与与功能mRNAA是蛋白白质合成成的直接接模板,将将细胞核核内DNNA的碱碱基顺序序按互补补配对原原则,抄抄录并转转送到胞胞质的核核糖体,用用以决定定蛋白质质合成的的氨基酸酸序列核内不不均一RRNA(hnRRNA):真核核生物mmRNAA的原始始转录物物是分子子量极大大的前体体,在核核内加工工过程中中形成分分子大小小不等的的中间产产物,被被称为hhnRNNA开放阅阅读框(OORF):mRNA分子上从起始密码(AUG)开始到终止密码子结束这一段连续的核苷酸序列,即mRNA分子
5、上的编码区。是一个特定蛋白质多肽链的编码序列特点原核生物物真核生物物半衰期数分钟数小时/天翻译模板板多顺反子子单顺反子子5帽子子无有,保护护mRNNA及蛋蛋白合成成正确起起始3尾巴巴无polyy A,与与mRNNA半衰衰期及核核到浆转转运有关关内含子无有SD序列列有(AGGGAGGG)无稀有碱基基无有,但极极少生成方式式边转录边边翻译前体hnnRNAA修饰后后转入胞胞质tRNAA 1、含含有稀有有碱基 2、3末端含有CCA序列 3、二级结构呈三叶草形 4、三级结构呈倒L型5、蛋白质生物合成中识别密码子,特异性搬运氨基酸的作用二级结构构三级结结构单链、 三叶草草叶形、 四臂四四环在二二级结构构基
6、础上上进一折折叠扭曲曲形成倒倒L型rRNAA与核糖体体蛋白构构成核糖糖体,是是蛋白生生物合成成的场所所mRNAA结合位位点、起起始部分分的识别别、密码码子与反反密码子子的相互互作用肽键形成成、AAA-tRRNA、肽肽基-ttRNAA的结合合核小RRNA和和胞浆小小RNAA(snnRNAA/sccRNAA)snRNNA核内、与与蛋白质质结合在在一起形形成小分分子核内内蛋白颗颗粒,参参与mRRNA的的剪切加加工scRNNA蛋白质质定位于于内质网网的信号号肽识别别 粒子子的组成成成分起始RNNA作为DDNA生生物合成成的通用用引物指导RNNARNAA编辑的的模板端粒酶RRNA和和核酶端粒:短短而数目
7、目精确的的串联重重复DNNA小片片段与蛋蛋白质够够成的特特殊结构构端粒酶(tellomeerasse):自身携携带RNNA模板板的逆转转录酶,催催化端粒粒DNAA合成端粒酶RRNA:形成端端粒重复复序列的的模板RRNA核酶(rriboozymme):具有酶酶作用特特征的一一类RNNA,无无需能量量可以自自我催化化和切割割,使RRNA被被降解而而无法进进行转录录和翻译译RNA种种类功 能mRNAA 转录自编编码蛋白白质基因因的RNNA,携携带翻译译信息。hnRNNA mRNAA剪接前前体。tRNAA 在翻译过过程中的的转接分分子。在在反转录录病毒复复制的过过程中,tRNA可以作为DNA复制的引物
8、rRNAA 是核糖体体的主要要结构组组成部分分,蛋白白质合成成过程所所必需iRNAA(起始始RNAA)在DNAA合成中中作为后后滞链合合成引物物的短RRNA片片段snRNNA(核核内小RRNA) 参与内含含子的剪剪切及其其他加工工过程scRNNA(胞胞质内小小RNAA)是信号肽肽识别颗颗粒的组组成部分分端粒酶RRNA 作为形成成端粒重重复序列列的模板板的核RRNA,是是端粒的的组成部部分gRNAA(指导导RNAA)在锥虫动动基粒中中合成的的RNAA种类,可可作为RRNA编编辑过程程的模板板反义RNNA 反义RNNA与mRNNA互补补,可与与其形成成双螺旋旋结构阻阻断蛋白白质的合合成。核酶指具有
9、化化学催化化功能的的RNAA分子(RRNA酶酶)。它它通常具具有自我我催化功功能DNAA的变性性:维持持双螺旋旋稳定性性的氢键键和疏水水键的断断裂,DDNA分分子由稳稳定的双双螺旋结结构松解解为无规规则线性性结构的的现象。断裂可以以是部分分的或全全部的,是是可逆的的或是非非可逆的的,但不不涉及DDNA一一级结构构的变化化核酸分子子杂交(hybbriddizaatioon):具有一一定互补补序列的的不同来来源的核核苷酸单单链在一一定条件件下,按按照碱基基互补配配对原则则形成异异源双链链的过程程Souttherrn bblott=印迹: 检检测目标标DNAANorttherrn bblott=印迹
10、: 定定性分析析mRNNA原位杂交交: 在在组织或或细胞水水平,使使用标记记探针与与细胞内内DNAA或RNNA杂交交Westternn检测Prroteein生物芯片片通过微微电子、微微加工技技术在平平方厘米米大小的的固相介介质表面面构建的的微型分分析系统统,以实实现对组组织细胞胞中DNNA、蛋蛋白质及及其他生生物组分分的快速速、高效效敏感地地处理分分析反义核酸酸:是一一段与靶靶基因的的某段序序列互补补的天然然存在或或人工合合成的核核苷酸序序列。通通过碱基基配对与与细胞内内核酸特特异结合合形成杂杂交分子子,从而而在复制制、转录录和翻译译水平调调节靶基基因的表表达反义DNNA:与与DNAA双链中中
11、的有义义链互补补结合的的短小DDNA分分子反义RNNA:与与mRNNA完全全互补的的小分子子RNAA或寡聚聚核苷酸酸片段 RNAii在进化化过程中中高度保保守的、由由双链RRNA诱诱发的、同同源mRRNA高高效特异异性降解解的现象象 1、长双双链RNNA被细细胞源性性的双链链RNAA特异的的Diccer成成21-23个个碱基对对的短双双链RNNA小干扰扰性RNNA(ssmalll iinteerfeerinng RRNA,siRNA)2、siiRNAA与细胞胞源性的的酶和蛋蛋白质形形成复合合体RNAA诱导的的沉默复复合体(RRISCC)识别与与siRRNA有有同源序序列的mmRNAA,并在在特
12、异的的位点将将该mRRNA切切断。 DNA病病毒多数动动物病毒毒、双链链DNAA(环型型或线型型)RNA病病毒RNAA携带全全部遗传传信息。单单链、双双链和逆逆转录病病毒第二章 染色质质、染色色体、基基因和基基因组染色质(chrromaatinn) :是指细细胞周期期间期细细胞核内内由DNNA、组组蛋白、非非组蛋白白和少量量RNAA组成的的复合结结构染色体(chrromoosomme):是指在在细胞分分裂期出出现的一一种能被被碱性染染料强烈烈染色,并并具有一一定形态态、结构构特征的的物体。1染色单单体:中中期染色色体由两两条染色色单体组组成,两两者在着着丝粒的的部位相相互结合合,每一一条染色色
13、单体是是由一条条DNAA双链经经过螺旋旋和折叠叠而形成成的。2着丝丝粒:两两条染色色单体相相连处染染色较浅浅向内凹凹陷的缢缢痕(主主缢痕)3副缢痕痕:染色色体臂上上狭窄浅浅染的缢缢缩的部部分4随体:位于染染色体末末端的球球形染色色体节段段5核仁组组织区 :是核核糖体RRNA基基因所在在的区域域,位于于副缢痕痕区 6复制子子与复制制起始点点:7端粒粒 (tteloomerre):由端粒粒DNAA与端粒粒结合蛋蛋白形成成的、染染色体端端部的特特化部分分。端粒的的功能1防止染染色体DDNA降降解、融融合和缺缺失,维维持染色色体的稳稳定性 2稳定和和保护染染色体的的完整性性,确保保遗传信信息完整整复制
14、3指导染染色体与与核膜相相连4反映细细胞分裂裂的能力力染色质和和染色体体的化学学成分及及组成化学组成成(1)DDNA:约占330%,每每条染色色体一个个双链DDNA分分子是遗遗传信息息的载体体。(2)蛋蛋白质组蛋白(hisstonne):呈碱性性,结构构稳定;与DNNA结合合形成、维维持染色色质结构构,与DDNA含含量呈一一定的比比例非组蛋白白:呈酸酸性,种种类和含含量不稳稳定;作作用还不不完全清清楚,可可能与染染色质结结构调节节有关,在在DNAA遗传信信息的表表达中有有重要作作用(3)少少量的RRNA脱氧核糖糖核酸(DNAA)1非重复复序列:一个基基因组中中只有一一个拷贝贝,是编编码蛋白白质
15、和酶酶的结构构基因2轻度重重复序列列:一个个基因组组中有22-100个拷贝贝的序列列3中度重重复序列列:重复复数十至至数万(1055)次的的重复顺顺序 ,在在基因组组中所占占比例在在不同种种属之间间差异很很大,一一般约占占10-40。大大多不编编码蛋白白质,编编码各种种rRNNA和ttRNAA及结构构基因。4高度重重复序列列:在基基因组中中重复频频率高,可可达百万万(1006)以以上 ,不不转录,多多位于着着丝粒处处,是异异染色质质组分,可可能与染染色体稳稳定有关关。有丝分裂裂细胞间间接分裂裂的一种种方式,由由多种过过程复合合而成,藉藉此二子子核接受受原种属属体细胞胞的特征征,即相相等数的的染
16、色体体,得以以有丝分分裂,集集体成长长并更新新细胞减数分裂裂染色体体复制一一次而细细胞连续续分裂两两次的分分裂方式式 ,其其二倍体体的原始始生殖细细胞染色色体复制制一次之之后,要要经过两两次细胞胞分裂,结结果子细细胞(即即生殖细细胞)所所含的染染色体数数目比亲亲代细胞胞减少一一半。染色体畸畸变是因因为先天天性染色色体数目目异常或或(和)结结构畸变变数目畸变变:整倍体 :增加加或减少少整套的的染色体体 多倍倍体 三倍倍体非整倍体体:增加加或减少少一条或或几条染染色体缺体 单体 三体 结构畸变变:缺失失、重复复、倒位位、易位位 基因 (Genne)是是核酸分分子中贮贮存遗传传信息的的遗传单单位。是
17、是DNAA长链上上一个由由特定核核苷酸组组成并具具有特定定遗传功功能的片片段,包包括编码码蛋白质质或RNNA的核核酸序列列和调控控序列。特点:11能忠实实地复制制自己,以以保持生生物的基基本特征征 2能够“突变” ,致致病或给给自然选选择带来来原始材材料1顺反子子:可以以编码一一条多肽肽链的的的一个遗遗传功能能单位。一一个顺反反子决定定一条多多肽链 2重叠基基因:是是指两个个或两个个以上的的基因共共有一段段DNAA序列,或或是指一一段DNNA序列列成为两两个或两两个以上上基因的的组成部部分。3断裂基基因:真真核生物物的基因因是不连连续的,其其编码区区(外显显子),被一些些非编码码区(内内含子)
18、所所隔断4假基因因:与有有功能的的基因在在核苷酸酸顺序的的组成上上非常相相似,却却不具有有正常功功能的基基因。5癌基因因:人类类或其他他动物细细胞(以以及致癌癌病毒)固固有的一一类基因因,又称称转化基基因。是是具有潜潜在的促促发肿瘤瘤发生活活性的基基因6抑癌基基因:是是指某种种基因当当其受阻阻抑、失失活、丢丢失、或或其表达达产物丧丧失功能能可导致致细胞恶恶性转化化基因组单单倍体细细胞中所所含有的的全部遗遗传信息息,包括括编码和和非编码码序列在在内的全全部DNNA分子子。原核生生物基因因组特征征1基因组组通常仅仅由一条条双链DDNA组组成。2基因组组中只有有一个复复制起始始点3基因是是连续的的,
19、没有有内含子子4功能相相关的基基因高度度集中构构成操纵纵子5DNAA大部分分是用于于编码蛋蛋白质6编码蛋蛋白质的的基因通通常为单单拷贝7结构基基因的重重复序列列少8基因组组中存在在可移动动的DNNA序列列真核生生物基因因组特点点1真核基基因组的的复杂性性:基因因组大、主主要的遗遗传物质质与组蛋蛋白等构构成染色色质,被被包裹在在核膜内内,核外外还有遗遗传成分分(如线线粒体DDNA等等)2真核生生物是一一个结构构基因转转录生成成一条mmRNAA,即mmRNAA是单顺顺反子,基基本上没没有操纵纵子的结结构3结构基基因所占占区域远远小于非非编码区区4结构基基因大多多为断裂裂基因,即即有外显显子(eex
20、onn)和内内含子(inttronn),转转录后需需经剪接接去除内内含子,才才能翻译译获得完完整的蛋蛋白质5基因组组中存在在大量重重复序列列 高度重复复序列:反向重重复序列列:两个个相同顺顺序的互互补拷贝贝在同一一DNAA链上反反向排列列而成,与与复制、转转录的调调控有关关。卫星DDNA:一般较较短,采采用密度度梯度离离心后,分分布于DDNA主主带的旁旁边,参参与复制制水平的的调节、表表达的调调控、参参与染色色体配对对中度重复复序列:重复次次数在1101105,散散布于基基因组中中。一部部分编码码rRNNA、ttRNAA、组蛋蛋白及免免疫球蛋蛋白,另另一些与与基因调调控有关关 AAlu家家族:
21、哺哺乳动物物中含量量最丰富富,有种种属特异异性 KKpnII家族:灵长类类所特有有,用作作天然标标记6基因家家族:来来源相同同、结构构相似、功功能相关关的基因因构成串联重复复基因簇簇:编码码RNAA的基因因串联排排列分散式基基因簇:分布在在不同部部位,编编码干扰扰素、珠珠蛋白、 生长激激素等假基因:不能产产生有功功能基因因产物的的基因病毒和和噬菌体体基因组组特征1基因组组很小,但但是不同同的病毒毒之间其其基因组组相差大大2基因组组可以由由DNAA或RNNA组成成,但只只能是其其中之一一3 RNNA病毒毒基因组组可以由由数条不不相连的的RNAA链组成成4含有启启动子和和操纵基基因5存在基基因重叠
22、叠6可以形形成多顺顺反子mmRNAA7噬菌体体基因是是连续的的,真核核细胞病病毒基因因是不连连续的 第三章 可移动动的遗传传因子(转转座子)和和染色体体外的遗遗传因子子转座子:是基因因组中一一段可移移动的DDNA序序列,可可以通过过切割、重重新整合合等一系系列过程程从基因因组的一一个位置置“跳跃”到另一一个位置置。 转座子子的共同同特点1都有一一个保守守结构,有有一个或或多个OORF,两两端有末末端反向向重复序序列2转座后后靶位点点呈现正正向重复复3编码与与转座有有关的蛋蛋白4可以在在基因组组中移动动 转座子的的分类1 DNNA-DDNA方方式转座座:通过过DNAA复制或或直接切切除两种种方式
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