细菌的分类和命名幻灯片.ppt

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1、细菌的分类和命名第1页，共39页，编辑于2022年，星期一微生物的分类微生物的分类l分类是认识客观事物的一种基本方法。分类是认识客观事物的一种基本方法。l因此，我们要认识、研究和利用各种微生物资源也必因此，我们要认识、研究和利用各种微生物资源也必须对它们进行分类。须对它们进行分类。l分类学涉及三个相互依存又有区别的组成部分：分类学涉及三个相互依存又有区别的组成部分：分类、分类、鉴定、命名鉴定、命名第2页，共39页，编辑于2022年，星期一分类分类:根据一定的原则根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关性表型特征相似性或系统发育相关性)对微对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系

2、统，并对各生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定。定。(根据现有数据建立系统的过程根据现有数据建立系统的过程)鉴定：鉴定：借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。过程。(根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程)命名：命名：是根据命名法规，给每

3、一个分类群一个专有的名称。是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称。(分类系统建立过程中的步骤之一分类系统建立过程中的步骤之一)第3页，共39页，编辑于2022年，星期一第一节第一节细菌的分类地位细菌的分类地位细菌过去归属植物界，自细菌过去归属植物界，自细菌过去归属植物界，自细菌过去归属植物界，自19741974年以来，划为原核生物。年以来，划为原核生物。年以来，划为原核生物。年以来，划为原核生物。细菌属于原核生物界，为种系分类的真细菌；细菌属于原核生物界，为种系分类的真细菌；细菌属于原核生物界，为种系分类的真细菌；细菌属于原核生物界，为种系分类的真细菌；广义的细菌广义的细菌广义的细菌广义

4、的细菌包括各类原核细胞型微生物，如细菌、放线菌、衣原体、支包括各类原核细胞型微生物，如细菌、放线菌、衣原体、支包括各类原核细胞型微生物，如细菌、放线菌、衣原体、支包括各类原核细胞型微生物，如细菌、放线菌、衣原体、支原体、立克次体和螺旋体；原体、立克次体和螺旋体；原体、立克次体和螺旋体；原体、立克次体和螺旋体；狭义的细菌狭义的细菌狭义的细菌狭义的细菌专指其中的细菌，它的种类最多、数量最大、最具代专指其中的细菌，它的种类最多、数量最大、最具代专指其中的细菌，它的种类最多、数量最大、最具代专指其中的细菌，它的种类最多、数量最大、最具代表性。表性。表性。表性。细菌的分类层次细菌的分类层次细菌的分类层次

5、细菌的分类层次与其他生物相同，也是界、门、纲、目、科、与其他生物相同，也是界、门、纲、目、科、与其他生物相同，也是界、门、纲、目、科、与其他生物相同，也是界、门、纲、目、科、属、种。在细菌中常用属和种。属、种。在细菌中常用属和种。属、种。在细菌中常用属和种。属、种。在细菌中常用属和种。第4页，共39页，编辑于2022年，星期一细菌在原核生物界的位置细菌在原核生物界的位置细菌在原核生物界的位置细菌在原核生物界的位置手册第八版把细菌、放线菌、粘细菌、螺旋体、支原体手册第八版把细菌、放线菌、粘细菌、螺旋体、支原体手册第八版把细菌、放线菌、粘细菌、螺旋体、支原体手册第八版把细菌、放线菌、粘细菌、螺旋体

6、、支原体和立克次氏体等归于原核生物界。原核生物界共设和立克次氏体等归于原核生物界。原核生物界共设和立克次氏体等归于原核生物界。原核生物界共设和立克次氏体等归于原核生物界。原核生物界共设2 2门、门、门、门、6 6纲、纲、纲、纲、1919部分。部分。部分。部分。原核生物界（原核生物界（原核生物界（原核生物界（Kingdom:ProcaryolaeKingdom:Procaryolae）1.1.光合营养原核生物门（光合营养原核生物门（光合营养原核生物门（光合营养原核生物门（PhotobacteriaPhotobacteria）纲纲纲纲.蓝绿色光合细菌纲蓝绿色光合细菌纲蓝绿色光合细菌纲蓝绿色光合细菌

7、纲(Bluc-green PhotobacteriaBluc-green Photobacteria)纲纲纲纲.红色光合细菌纲（红色光合细菌纲（红色光合细菌纲（红色光合细菌纲（Red PhotobacteriaRed Photobacteria）纲纲纲纲.绿色光合细菌纲（绿色光合细菌纲（绿色光合细菌纲（绿色光合细菌纲（Green PhotobacteriaGreen Photobacteria）第）第）第）第1 1部分部分部分部分2.2.化能营养原核生物门（化能营养原核生物门（化能营养原核生物门（化能营养原核生物门（ScolobacteriaScolobacteria）纲纲纲纲.细菌纲细菌纲细

8、菌纲细菌纲(BacteriaBacteria)第第第第2 2至第至第至第至第1717部分部分部分部分纲纲纲纲.立克次体纲（立克次体纲（立克次体纲（立克次体纲（RickettsiaRickettsia）第）第）第）第1818部分部分部分部分纲纲纲纲.柔膜体纲（柔膜体纲（柔膜体纲（柔膜体纲（MolliculcsMolliculcs）第）第）第）第1919部分部分部分部分第5页，共39页，编辑于2022年，星期一第6页，共39页，编辑于2022年，星期一第7页，共39页，编辑于2022年，星期一古细菌古细菌I.是一个独特的系统进化类别，其成员产甲烷、极端是一个独特的系统进化类别，其成员产甲烷、极端耐

9、盐、高度嗜热，其细胞壁组成与细菌不同。耐盐、高度嗜热，其细胞壁组成与细菌不同。II.这些极端微生物被认为是生物进化过程中的早期产物，这些极端微生物被认为是生物进化过程中的早期产物，因此称之为古细菌。因此称之为古细菌。III.在兽医微生物学中，不占重要地位。在兽医微生物学中，不占重要地位。第8页，共39页，编辑于2022年，星期一第9页，共39页，编辑于2022年，星期一第10页，共39页，编辑于2022年，星期一细菌的分类等级细菌的分类等级第11页，共39页，编辑于2022年，星期一属属具有共性的若干种的组合，应与其它属有明显的差异。具有共性的若干种的组合，应与其它属有明显的差异。不同的属之间

10、的不同的属之间的16SrRNA序列有较大差异，差异应大于序列有较大差异，差异应大于57。种种是微生物学分类的最基本单元，是微生物学分类的最基本单元，可以认为是一群性可以认为是一群性质相似的菌株，与其它菌株群体有明显差异质相似的菌株，与其它菌株群体有明显差异。凡是凡是16SrRNA序列同源性大于序列同源性大于97的两株细菌，即的两株细菌，即可确定为同一种。可确定为同一种。第12页，共39页，编辑于2022年，星期一亚种亚种是指同一菌种的各个细菌，虽然基本性状是指同一菌种的各个细菌，虽然基本性状基本相同，但是在某些方面仍有一定差异，差异基本相同，但是在某些方面仍有一定差异，差异较明显的称为较明显的

11、称为亚种亚种，差异不明显的称为，差异不明显的称为型型。新种新种是指权威性的分类、鉴定手册种从未记载过是指权威性的分类、鉴定手册种从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物。的一种新分离并鉴定过的微生物。第13页，共39页，编辑于2022年，星期一菌株菌株是不同来源的某一种细菌的纯培养物。是不同来源的某一种细菌的纯培养物。同一种细菌可有许多菌株，其主要性状应完全相同，次要性同一种细菌可有许多菌株，其主要性状应完全相同，次要性状可稍有差异。状可稍有差异。标准菌株标准菌株又叫模式菌株，具有某种细菌典型特征的菌又叫模式菌株，具有某种细菌典型特征的菌株。株。第14页，共39页，编辑于2022年，星期一种和亚

12、种指定模式菌株（种和亚种指定模式菌株（typestrain）；）；亚属和属指定模式种（亚属和属指定模式种（typespecies）；）；属以上至目级分类单元指定模式属（属以上至目级分类单元指定模式属（typegenus）；）；模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。取。第15页，共39页，编辑于2022年，星期一第二节第二节细菌的命名细菌的命名依据依据“国际细菌命名法规国际细菌命名法规”的规定，采用拉丁的规定，采用拉丁双名法双名法双名法双名法，每个菌名由两个部分组成，前一字为属名，用名词，第一个每个菌名由两个部分组成，前一字为属名，用名词

13、，第一个每个菌名由两个部分组成，前一字为属名，用名词，第一个每个菌名由两个部分组成，前一字为属名，用名词，第一个字母大写；后一字为种名，用形容词，小写。均为字母大写；后一字为种名，用形容词，小写。均为字母大写；后一字为种名，用形容词，小写。均为字母大写；后一字为种名，用形容词，小写。均为斜体斜体斜体斜体。中文的命名次序中文的命名次序与拉丁相反，种名在前，属名在后。与拉丁相反，种名在前，属名在后。属名属名种名种名种名种名属名属名金黄色葡萄球菌金黄色葡萄球菌金黄色葡萄球菌金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus第16页，共39页，编辑于2022年，星期一亚种亚种在学名后加上在学名后

14、加上ssp.或或subsp.（正体）。（正体）。新种新种在学名后加上在学名后加上sp.nov.（正体）。（正体）。第17页，共39页，编辑于2022年，星期一属名属名通常是一个描述生物形态的名词或发现该生物通常是一个描述生物形态的名词或发现该生物的人名，词首必须大写。的人名，词首必须大写。种名种名表示该生物的某种特征、寄居部位或所致疾病等，表示该生物的某种特征、寄居部位或所致疾病等，字母须小写。字母须小写。Staphylococcus aureusStaphylococcus aureus金黄色葡萄球菌金黄色葡萄球菌金黄色葡萄球菌金黄色葡萄球菌Escherichia coli 大肠埃希氏菌大肠

15、埃希氏菌第18页，共39页，编辑于2022年，星期一拉丁文学名应该按拉丁文字母的发音规则读念，用英拉丁文学名应该按拉丁文字母的发音规则读念，用英语读念是错误的。语读念是错误的。第19页，共39页，编辑于2022年，星期一第三节第三节细菌分类鉴定的标准细菌分类鉴定的标准v 形态特征形态特征v培养特征培养特征v生理特征生理特征v生态特征生态特征v化学组成化学组成v血清学反应血清学反应v遗传学特性遗传学特性细菌分类依据细菌分类依据第20页，共39页，编辑于2022年，星期一1.经典鉴定方法的指标经典鉴定方法的指标A.基本形态基本形态:球状球状球菌；杆状球菌；杆状杆菌；螺旋状杆菌；螺旋状螺旋菌螺旋菌第

16、21页，共39页，编辑于2022年，星期一B.细胞的形状、大小、结构和染色反应细胞的形状、大小、结构和染色反应第22页，共39页，编辑于2022年，星期一第23页，共39页，编辑于2022年，星期一C.细胞的群体形态细胞的群体形态第24页，共39页，编辑于2022年，星期一第25页，共39页，编辑于2022年，星期一第26页，共39页，编辑于2022年，星期一D.D.生化性质和生态特征生化性质和生态特征生化性质和生态特征生化性质和生态特征 第27页，共39页，编辑于2022年，星期一2.分子生物学方法分子生物学方法分类的依据：遗传特征分类的依据：遗传特征第28页，共39页，编辑于2022年，星

17、期一第29页，共39页，编辑于2022年，星期一第30页，共39页，编辑于2022年，星期一第四节第四节细菌分类的方法细菌分类的方法一、双歧检索条目分类法一、双歧检索条目分类法细菌分类采用传统的双歧检索条目分类法。细菌分类采用传统的双歧检索条目分类法。此法首选要在细菌的各种性状中，选择一项或数项被认此法首选要在细菌的各种性状中，选择一项或数项被认为是最主要的基本性质，作为分类指征，在最高一级的为是最主要的基本性质，作为分类指征，在最高一级的分类等阶上将细菌分成若干类别；然后在这些类别中选分类等阶上将细菌分成若干类别；然后在这些类别中选择数项次要性状为指征，将细菌作次一等阶分类，依此择数项次要性

18、状为指征，将细菌作次一等阶分类，依此类推，一直划分到种。类推，一直划分到种。人为影响因素多，但实际临床检验很实用。人为影响因素多，但实际临床检验很实用。第31页，共39页，编辑于2022年，星期一二、数值分类法二、数值分类法原理原理根据数值分析，借助电子计算机，将拟分根据数值分析，借助电子计算机，将拟分类的细菌按其性状相似程度归类定位。类的细菌按其性状相似程度归类定位。各种性状同等重要，应用多菌株比较。各种性状同等重要，应用多菌株比较。所选性状越多，正确性越高，至少要达到所选性状越多，正确性越高，至少要达到100个，否个，否则易误判。则易误判。优点：科学、规范优点：科学、规范缺点：需要电子计算

19、机缺点：需要电子计算机第32页，共39页，编辑于2022年，星期一1、伯吉氏细菌鉴定手册、伯吉氏细菌鉴定手册（BergeysManualofBergeysManualofDeterminativeBacteriology)DeterminativeBacteriology)，D.D.BergeyBergey（美国细菌学家），（美国细菌学家），（美国细菌学家），（美国细菌学家），19231923年第年第年第年第1 1版，版，版，版，19941994年第年第年第年第9 9版。版。版。版。2 2、伯吉氏系统细菌学手册、伯吉氏系统细菌学手册、伯吉氏系统细菌学手册、伯吉氏系统细菌学手册（BergeysM

20、anualofBergeysManualofSystematicBacteriology)SystematicBacteriology)，HoltHolt（美国细菌学家），（美国细菌学家），（美国细菌学家），（美国细菌学家），1984-19891984-1989年编写完第年编写完第年编写完第年编写完第1 1版共版共版共版共4 4卷，卷，卷，卷，20012001年开始发行第年开始发行第年开始发行第年开始发行第2 2版共版共版共版共5 5卷。卷。卷。卷。第五节第五节细菌的分类体系细菌的分类体系第33页，共39页，编辑于2022年，星期一3、Balows等编著的等编著的“原核生物原核生物”(TheP

21、rokaryyotes):第二版，第二版，1992，可弥补伯吉氏手册的不足。，可弥补伯吉氏手册的不足。4、国际系统与进化微生物学杂志（、国际系统与进化微生物学杂志（InternationalJournalofSystematicandEvolutionaryMicrobiology,IJSEM）：）：是细菌分类命名的世界公认的权威期刊，由国际微是细菌分类命名的世界公认的权威期刊，由国际微生物学会联合会（生物学会联合会（InternationalUnionofMicrobiologicalSocieties）于）于1901年创刊出版。年创刊出版。第34页，共39页，编辑于2022年，星期一第六节

22、第六节细菌的鉴定细菌的鉴定一、分类培养一、分类培养一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。第35页，共39页，编辑于2022年，星期一二、鉴定方法二、鉴定方法除按表型特征、除按表型特征、除按表型特征、除按表型特征、DNADNA同源性或同源性或同源性或同源性或rRNArRNA序列比较等方法鉴定细序列比较等方法鉴定细序列比较等方法鉴定细序列比较等方法鉴定细菌外菌外菌外菌外.其他方法，如测定细菌的脂肪酸组成，用气相液相其他方法，如测定细菌的脂肪酸组成，用气相液相质谱分析细菌的脂肪酸谱，每一种细菌的脂肪酸谱质谱分析细菌的脂肪酸谱，每一种细菌的脂肪酸谱是恒定的，可重复性好，因

23、此此法可用于细菌的鉴定是恒定的，可重复性好，因此此法可用于细菌的鉴定或分类，往往结合常规方法参照应用。或分类，往往结合常规方法参照应用。在有条件的单位可用在有条件的单位可用PCR技术检测鉴定细菌。技术检测鉴定细菌。用商品化的细菌鉴定试剂盒，取代自行选择若干检测项用商品化的细菌鉴定试剂盒，取代自行选择若干检测项目。目。第36页，共39页，编辑于2022年，星期一细菌学诊断细菌学诊断标本的采集和运送标本的采集和运送避免杂菌污染运送注意保存不同期不同标本用抗菌素以前采集病变明显部位标本必须新鲜第37页，共39页，编辑于2022年，星期一 革兰阳性细菌革兰阳性细菌革兰阳性细菌革兰阳性细菌球菌球菌球菌球

24、菌 杆菌杆菌杆菌杆菌 丝状及树枝状丝状及树枝状丝状及树枝状丝状及树枝状产生芽孢革兰产生芽孢革兰产生芽孢革兰产生芽孢革兰 阳性大杆菌阳性大杆菌阳性大杆菌阳性大杆菌无芽孢无芽孢无芽孢无芽孢抗酸染色阳性抗酸染色阳性抗酸染色阳性抗酸染色阳性抗酸染色阴性抗酸染色阴性抗酸染色阴性抗酸染色阴性革兰阴性细菌革兰阴性细菌革兰阴性细菌革兰阴性细菌球菌球菌球菌球菌/球杆菌球杆菌球杆菌球杆菌杆菌杆菌杆菌杆菌MZNMZN染色阳性染色阳性染色阳性染色阳性MZNMZN染色阴性染色阴性染色阴性染色阴性弧状杆菌弧状杆菌弧状杆菌弧状杆菌丝状菌丝状菌丝状菌丝状菌中等大小杆菌中等大小杆菌中等大小杆菌中等大小杆菌螺旋状菌螺旋状菌螺旋状菌螺旋状菌细菌的革兰染色细菌的革兰染色细菌的革兰染色细菌的革兰染色第38页，共39页，编辑于2022年，星期一病原菌的检查程序病原菌的检查程序药物敏感试验直接涂片镜检分离培养生化试验血清学试验动物试验明明确确诊诊断断初步诊断初步诊断分子生物学技术其他检测技术第39页，共39页，编辑于2022年，星期一