药物合成设计逆合成法幻灯片.ppt
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1、药物合成设计逆合成法第1页,共95页,编辑于2022年,星期二 9.1 9.1 引引 言言 20 20世纪世纪6060年代后期,以年代后期,以E.J.CoreyE.J.Corey为代表的合成化学家推出为代表的合成化学家推出了逆合成(了逆合成(retrosynthesisretrosynthesis)的概念。他从设计方法学的角度将)的概念。他从设计方法学的角度将有机合成涉及的所谓有机合成涉及的所谓“建筑艺术建筑艺术”与逻辑推理很好地结合起来,与逻辑推理很好地结合起来,同时吸收了计算机程序设计的思维方法,形成了自成体系、有一同时吸收了计算机程序设计的思维方法,形成了自成体系、有一定规律可循的有机合
2、成方法学,是对化学的又一巨大贡献。定规律可循的有机合成方法学,是对化学的又一巨大贡献。CoreyCorey的有机合成设计原理提供了一种规范和系统化的有机合成的有机合成设计原理提供了一种规范和系统化的有机合成实践活动,具有相当大的影响力,实践活动,具有相当大的影响力,CoreyCorey也因此获得了也因此获得了19901990年的年的诺贝尔化学奖。诺贝尔化学奖。第2页,共95页,编辑于2022年,星期二E.J.CoreyE.J.Coreyl E.J.CoreyE.J.Corey和和R.B.WoodwardR.B.Woodward是二十世纪最伟大的两个有机化学家。复杂化合物的是二十世纪最伟大的两个
3、有机化学家。复杂化合物的合成绝对不是轻松的活,官能团的保护,活化,区域选择,立体选择,都是极其头合成绝对不是轻松的活,官能团的保护,活化,区域选择,立体选择,都是极其头痛的活。重复文献都能搞得人焦头烂额。痛的活。重复文献都能搞得人焦头烂额。l 全合成是有机化学整个学科的精华所在,一切的工作都是为了制造对人类有全合成是有机化学整个学科的精华所在,一切的工作都是为了制造对人类有用的,天然无法大量提供的化合物。用的,天然无法大量提供的化合物。l E.J.CoreyE.J.Corey的重要贡献是合成子分析,新合成反应,以及合成重要的天然产物。的重要贡献是合成子分析,新合成反应,以及合成重要的天然产物。
4、l19591959年年3131岁的岁的CoreyCorey在在IllionisIllionis大学得到了教授职位。他的活力和智慧使他成为和大学得到了教授职位。他的活力和智慧使他成为和R.B.WoodwardR.B.Woodward一样的全合成大师。并且二十年两人如同双星一起照耀着全合成这个领域的广一样的全合成大师。并且二十年两人如同双星一起照耀着全合成这个领域的广阔宇宙。阔宇宙。l第3页,共95页,编辑于2022年,星期二E.J.CoreyE.J.Coreyl 他对于全合成的创新是,逆合成分析和新合成方法。他对于全合成的创新是,逆合成分析和新合成方法。从那时候到他获得从那时候到他获得19901
5、990年诺贝尔奖,他合年诺贝尔奖,他合成了上百种化合物。和同时代的其他化学家一起,到成了上百种化合物。和同时代的其他化学家一起,到19901990年人们已经征服了一些结构:前列腺素,年人们已经征服了一些结构:前列腺素,多醚,生物碱,多醚,生物碱,B-B-内酰胺(重要的抗生素),大环内酯(另外一种重要抗生素),海葵毒素,卟啉内酰胺(重要的抗生素),大环内酯(另外一种重要抗生素),海葵毒素,卟啉等等。等等。l 前面提到过前面提到过E.J.CoreyE.J.Corey的一大贡献是逆合成分析。的一大贡献是逆合成分析。长叶松萜烯长叶松萜烯(longifolene)(longifolene)的全发表于的全
6、发表于19611961年,是年,是E.J.CoreyE.J.Corey的使用这一新的方法的处女作。该物质是个多环化合物,在双环的使用这一新的方法的处女作。该物质是个多环化合物,在双环2,2,12,2,1庚烷庚烷骨架上的两个非桥头碳原子又连了一个环。合成是从萘骨架骨架上的两个非桥头碳原子又连了一个环。合成是从萘骨架#开始的。保护羰基后开始的。保护羰基后wittigwittig反应,反应,OsO4OsO4氧化氧化,pinacol,pinacol片呐醇重排后就得到了扩环产物,及生成了那个双环片呐醇重排后就得到了扩环产物,及生成了那个双环2,2,12,2,1庚烷骨架外的庚烷骨架外的七员环。形成骨架的一
7、步是分子内麦克尔加成。七员环。形成骨架的一步是分子内麦克尔加成。l 据说海葵毒素的毒性大约可以排名前十。无论其结构测定还是全合成都是极大的挑战,据说海葵毒素的毒性大约可以排名前十。无论其结构测定还是全合成都是极大的挑战,因为它有因为它有6464个手性中心,一百多个碳,几十个官能团。合成并非从基本原料开始个手性中心,一百多个碳,几十个官能团。合成并非从基本原料开始,就是说就是说不是我们出题老师经常给的不是我们出题老师经常给的4 4个碳以下啊,甲苯啦,手性中心和骨架在基本原料中就已经带有个碳以下啊,甲苯啦,手性中心和骨架在基本原料中就已经带有了。思想仍然是先合成片断,然后用恰当的方法对接了。思想仍
8、然是先合成片断,然后用恰当的方法对接-这么多碳和手性中心的玩意谁敢慢这么多碳和手性中心的玩意谁敢慢慢接上来。慢接上来。很多碳碳键都是用很多碳碳键都是用wittigwittig反应然后氢化得到的。还有一些铂系元素的催化反反应然后氢化得到的。还有一些铂系元素的催化反应。应。第4页,共95页,编辑于2022年,星期二E.J.CoreyE.J.Coreyl 漂亮,简单的解决复杂化合物的能力恐怕是别人难以企及的。解决困难越是轻描淡写漂亮,简单的解决复杂化合物的能力恐怕是别人难以企及的。解决困难越是轻描淡写越是需要实力。如同当年公瑾谈笑间樯橹灰飞烟灭是何等的潇洒。而平淡的文字比起声越是需要实力。如同当年公
9、瑾谈笑间樯橹灰飞烟灭是何等的潇洒。而平淡的文字比起声嘶力竭的大喊,有时候感情更深沉,比如金老先生在嘶力竭的大喊,有时候感情更深沉,比如金老先生在倚天屠龙记倚天屠龙记结尾的一句结尾的一句“只因为只因为我那时候还不明白我那时候还不明白”藏着多少伤心的故事。藏着多少伤心的故事。l 银杏毒素银杏毒素B B,顾名思义是从银杏树上提取出来的,是一个很让人头晕的家伙。特点在于,顾名思义是从银杏树上提取出来的,是一个很让人头晕的家伙。特点在于看上去小,紧凑而非常奇特的碳骨架上高度官能团化,还有自然界很少出现的叔,看上去小,紧凑而非常奇特的碳骨架上高度官能团化,还有自然界很少出现的叔,1111个个手性中心,其中
10、两个是季碳,六个五员环。这个家伙上非手性碳没几个,才手性中心,其中两个是季碳,六个五员环。这个家伙上非手性碳没几个,才8 8个而已,其中个而已,其中4 4个个被叔丁基占了。骨架小而奇特,官能团和手性中心太多,无疑是有机合成的天敌。被叔丁基占了。骨架小而奇特,官能团和手性中心太多,无疑是有机合成的天敌。CoreyCorey在在19881988年解决了其全合成。路线从环戊酮的和保护一个醛基的乙二醛的缩合开始,经过几步得到一年解决了其全合成。路线从环戊酮的和保护一个醛基的乙二醛的缩合开始,经过几步得到一个螺环化合物(其中用了几次不常用试剂,例如原甲酸季戊三醇酯衍生物和金属有机试剂)。双环化个螺环化合
11、物(其中用了几次不常用试剂,例如原甲酸季戊三醇酯衍生物和金属有机试剂)。双环化合物用草酰氯关环,构造了一个三环化合物。然后是一个合物用草酰氯关环,构造了一个三环化合物。然后是一个2+22+2烯和酮的环加成得到第四个环,过烯和酮的环加成得到第四个环,过氧酸氧化羰基。几次官能团变换以后用特殊试剂氧酸氧化羰基。几次官能团变换以后用特殊试剂(一个环氧化物,但是骨架上有个氮,没一个环氧化物,但是骨架上有个氮,没见过这种玩意)形成第五个环,该环其实就是用氧搭了个桥。最后一个环是用过氧见过这种玩意)形成第五个环,该环其实就是用氧搭了个桥。最后一个环是用过氧酸氧化双键得到的环氧化物开环生成。酸氧化双键得到的环
12、氧化物开环生成。第5页,共95页,编辑于2022年,星期二 9.2 9.2 逆合成法原理和基本概念逆合成法原理和基本概念9.2.1.9.2.1.逆合成法原理逆合成法原理 逆向合成推理示意图:逆向合成推理示意图:目标分子目标分子(靶分子)(靶分子)中间体中间体1 1中间体中间体n n起始原料起始原料结构变换结构变换反反 应应结构变换结构变换结构变换结构变换反反 应应反反 应应第6页,共95页,编辑于2022年,星期二 2 2原料:原料:市场上易购得的合成靶分子的较简单的有机化合物。广市场上易购得的合成靶分子的较简单的有机化合物。广义的原料还可将多步合成中前一反应的产物(中间体义的原料还可将多步合
13、成中前一反应的产物(中间体n n)视为后一)视为后一步合成步合成(中间体中间体n n1 1)反应的原料。反应的原料。1 1靶分子:靶分子:即目标分子(即目标分子(TMTM),凡所需合成的目标分子均称为靶分子。),凡所需合成的目标分子均称为靶分子。靶分子或是最终产物,或是合成中的某一中间体。在逆合成分析中,可以靶分子或是最终产物,或是合成中的某一中间体。在逆合成分析中,可以将前一步结构变换的中间体视为后一步结构变换的靶分子(变换靶分子)。将前一步结构变换的中间体视为后一步结构变换的靶分子(变换靶分子)。3 3中间体:中间体:合成靶分子所需的前体化合物,亦即市场上难以购得合成靶分子所需的前体化合物
14、,亦即市场上难以购得的需自行合成的有机化合物。的需自行合成的有机化合物。9.2.2.9.2.2.逆合成法基本概念逆合成法基本概念第7页,共95页,编辑于2022年,星期二 4 4结构变换:结构变换:逆合成方向上的结构变化称为结构变换。为了区别逆合成方向上的结构变化称为结构变换。为了区别于用于用“”“”表示的正常的合成方向,常用表示的正常的合成方向,常用“”“”表示逆合成表示逆合成分析的结构变换过程。分析的结构变换过程。5.5.合成元(合成元(synthonsynthon)与合成等效剂)与合成等效剂:合成元合成元逆合成分析中目标分子转化所得的结构单元。逆合成分析中目标分子转化所得的结构单元。合成
15、等效剂合成等效剂与合成元相对应的具有等同功能的稳定化合与合成元相对应的具有等同功能的稳定化合 物。物。第8页,共95页,编辑于2022年,星期二表表9.1 9.1 合成元和合成等效剂的几个实例合成元和合成等效剂的几个实例 示例示例目标分子目标分子合成元合成元合成等效剂合成等效剂转化的依据转化的依据1 1酮与格氏试剂的反应酮与格氏试剂的反应2 2偶姻反应(酮醇缩合)偶姻反应(酮醇缩合)3 3Diels-AlderDiels-Alder反应反应 第9页,共95页,编辑于2022年,星期二 合成元的类型:合成元的类型:(1 1)a a型型合成元合成元:具有亲电性或能接受电子的合成元具有亲电性或能接受
16、电子的合成元碳正离子合成元碳正离子合成元 (2 2)d d型型合成元合成元:具有亲核性或能给出电子的合成元具有亲核性或能给出电子的合成元碳负离子合成元碳负离子合成元 (3 3)r r型型合成元合成元:自由基合成元自由基合成元 (4 4)e e型型合成元合成元:中性分子合成元中性分子合成元 合成元与合成等效剂是两个不同的概念,但二者有互相联系。在例合成元与合成等效剂是两个不同的概念,但二者有互相联系。在例3 3情况下,二者情况下,二者指的是同一种化合物。指的是同一种化合物。第10页,共95页,编辑于2022年,星期二6 6结构变换的主要类型结构变换的主要类型改变靶分子碳骨架的结构变换改变靶分子碳
17、骨架的结构变换不改变靶分子碳骨架的结构变换不改变靶分子碳骨架的结构变换 FGIFGIFGAFGAFGRFGRdisdisconconrearrrearr第11页,共95页,编辑于2022年,星期二改变靶分子碳骨架的结构变换:改变靶分子碳骨架的结构变换:(1 1)逆向切断)逆向切断切断化学键的方法切断化学键的方法,把靶分子骨架拆分为两个或两个以把靶分子骨架拆分为两个或两个以 (dis)dis)上的合成元,以此来简化目标分子的一种结构变换方法上的合成元,以此来简化目标分子的一种结构变换方法(3 3)逆向重排)逆向重排 按某一重排反应的反方向把目标分子拆开或重新按某一重排反应的反方向把目标分子拆开或
18、重新 (rearr)rearr)组装,以此来简化目标分子。组装,以此来简化目标分子。(2 2)逆向连接)逆向连接把目标分子中两个适当的碳原子连接起来,使之形成新把目标分子中两个适当的碳原子连接起来,使之形成新 (con)con)的化学键,获得便于进一步拆分的合成元。的化学键,获得便于进一步拆分的合成元。第12页,共95页,编辑于2022年,星期二不改变靶分子碳骨架的结构变换:不改变靶分子碳骨架的结构变换:(1 1)逆向官能团互换)逆向官能团互换 (FGI)FGI)(2 2)逆向官能团添加)逆向官能团添加 (FGA)FGA)(2 2)逆向官能团除去)逆向官能团除去 (FGR)FGR)第13页,共
19、95页,编辑于2022年,星期二官能团转化的主要目的是:官能团转化的主要目的是:使目标分子变换成一种更易合成的前体化合物或易得的原料;使目标分子变换成一种更易合成的前体化合物或易得的原料;为为作作逆逆向向的的切切断断、连连接接或或重重排排等等逆逆合合成成分分析析,首首先先须须经经过过官官能能团团转转化化把把目目标标分子变换成必要的形式;分子变换成必要的形式;添添加加导导向向基基如如活活化化基基、钝钝化化基基、阻阻断断基基和和保保护护基基等等,以以提提高高化化学学、区区域域或或立体选择性。立体选择性。总之,逆合成分析就是通过以上三种骨架转化和三种官能团转化而实现的。总之,逆合成分析就是通过以上三
20、种骨架转化和三种官能团转化而实现的。第14页,共95页,编辑于2022年,星期二 7 7逆合成元(逆合成元(ertronertron)在在对对目目标标分分子子进进行行逆逆合合成成转转化化时时,要要求求目目标标分分子子中中存存在在某某些些必必要要的的结结构构单单元元.只只有有这这种种结结构构单单元元存存在在时时才才能能进进行行有有效效的的逆逆合合成成转转化化,逆逆合合成成元元是是逆逆合合成成分分析中进行某一结构变换所必要的结构单元。析中进行某一结构变换所必要的结构单元。第15页,共95页,编辑于2022年,星期二 8.8.合成树合成树 为为合合成成目目标标分分子子设设计计的的多多条条相相互互关关
21、联联或或相相互互独独立立的的逆逆合合成成路路线线的的平平面面展展示示图图,犹犹如如一一株株倒长的树,该图像就称为合成树。倒长的树,该图像就称为合成树。合成树的树根即为目标分子(合成树的树根即为目标分子(TM)TM);每一条枝干的末梢即为每一条逆合成路;每一条枝干的末梢即为每一条逆合成路线的起始原料。线的起始原料。第16页,共95页,编辑于2022年,星期二 9.3 9.3 逆合成分析中的结构变换技巧逆合成分析中的结构变换技巧 9.3.1.9.3.1.优先考虑骨架的形成优先考虑骨架的形成 分分子子骨骨架架的的形形成成是是设设计计合合成成路路线线的的核核心心,因因此此在在逆逆合合成成分分析析的的结
22、结构构变变换换中中,应应尽尽可可能能优先考虑碳碳键形成(升级反应)的逆向结构变换,亦即优先考虑优先考虑碳碳键形成(升级反应)的逆向结构变换,亦即优先考虑“dis”“dis”。例例1 1:74第17页,共95页,编辑于2022年,星期二 骨骨架架的的形形成成往往往往离离不不开开官官能能团团的的协协同同作作用用,因因为为碳碳-碳碳键键形形成成的的位位置置往往往往就就在在官官能能团团所所在在的的或或受受官官能能团团影影响响的的邻邻近近部部位位上上。因因此此,要要形形成成碳碳-碳碳键键,必必须须考考虑虑在在目标分子官能团附近的适当位置上拆卸目标分子。目标分子官能团附近的适当位置上拆卸目标分子。9.3.
23、2 9.3.2 碳杂原子键先拆碳杂原子键先拆 连连接接杂杂原原子子(如如O O、N N、S S等等)的的化化学学键键往往往往是是不不稳稳定定的的,而而且且在在合合成成过过程程中中既既容容易易连连接接,也也容容易易断断裂裂,因因此此在在合合成成复复杂杂分分子子时时,将将碳碳杂杂原原子子之之间间的的键键留留在在最最后后几几步步形形成成,是是比比较较有有利利的的。这这样样做做,一一方方面面可可以以避避免免早早期期反反应应对对这这个个键键的的侵侵袭袭,另另一一方方面面又又可可以以选选择择温温和和的的反反应应条条件件来来连连接接,避避免免在在后后期期反反应应中中,伤伤害害已已引引入的官能团。故优先切断目
24、标分子中的碳杂原子键对合成路线是有利的。入的官能团。故优先切断目标分子中的碳杂原子键对合成路线是有利的。例例2 2:第18页,共95页,编辑于2022年,星期二合成:合成:例例3 3:TM3逆合成分析:逆合成分析:第19页,共95页,编辑于2022年,星期二合成:合成:例例4 4:逆合成分析:逆合成分析:第20页,共95页,编辑于2022年,星期二例例5 5:逆合成分析:逆合成分析:第21页,共95页,编辑于2022年,星期二合成:合成:汇聚型合成91第22页,共95页,编辑于2022年,星期二 9.3.3 9.3.3 优先在官能团处切断优先在官能团处切断 官官能能团团是是分分子子中中最最活活
25、跃跃的的部部位位,也也是是键键容容易易连连接接的的地地方方。在在逆逆合合成成分分析析中中,应应优优先先考虑官能团处的切断。考虑官能团处的切断。合成:合成:例例6 6:逆合成分析:逆合成分析:第23页,共95页,编辑于2022年,星期二合成:合成:例例7 7:逆合成分析:逆合成分析:第24页,共95页,编辑于2022年,星期二9.3.4 9.3.4 添加辅助官能团后再切断添加辅助官能团后再切断有有些些化化合合物物直直接接拿拿来来切切断断比比较较困困难难,此此时时如如果果在在某某一一部部位位添添加加某某种种官官能能团团,问问题就会得到解决。但在添加辅助官能团时应确认它又是易被除去的,否则不能添加。
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