第一章基因的结构与功能课件.ppt
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1、第一章基因的结构与功能第1页,此课件共76页哦 Chapter 1 基因的结构与功能第2页,此课件共76页哦基因的活动是分子水平的核心内容核酸与蛋白质的结构与功能基因组的结构与功能基因的复制与表达基因表达的调控及其生物学效应生物大分子间的相互作用细胞间通讯和细胞内信号转导总之,人体的生长 发育 衰老 死亡等生命现象,人体各种疾病的发生,都与一种基因或几种基因的结构与功能有关。第3页,此课件共76页哦第一节 基因的概念一 基因的生物学概念与历史回顾分子生物学最初的发展是从遗传学开始,时间应该是1860年代,也就是鸦片战争后期。基因理论的奠基人是孟德尔(Gregor Mendel)。第4页,此课件
2、共76页哦孟德尔的实验孟德尔用碗豆研究性状与遗传因子之间的关连,获得的结论是生物的性状是由看不到的遗传因子所决定的。这种遗传因子是独立的,存在多重形式。现在我们知道孟德尔描述的遗传因子就是等位基因(allele)。第5页,此课件共76页哦孟德尔遗传模式孟德尔分离律:来自父本或母本的等位基因在它们遗传的个体中保持着分离性和完整性,能够各自分离地完整地由亲代传递到子代。第6页,此课件共76页哦孟德尔的贡献每个等位基因都是成对存在的。一个生物的性状(特性和类型)由其遗传单位所控制。某些基因对另一些基因是显性(dominant),另一些是隐性的(recessive),如种子的饱满与皱缩,植株的高与矮等
3、。对等位基因的认识表明,在等位基因缺陷(例如遗传病)的治疗中,只需要纠正一个基因就可以让机体功能恢复正常。第7页,此课件共76页哦继续孟德尔的研究当两个隐性基因都传递到子代时,其代表的性状才显露出来,这种状态称为纯合性(homozygous),反之就是杂合性(heterozygous)。也可以说,带有完全相同的等位基因的个体是纯合性,反之为杂合性。在细胞分裂的过程中,一对等位基因是独立地传递的,子细胞对等位基因的选择是随机的独立的。第8页,此课件共76页哦另一个重要的遗传规律 基因连锁 在不发生交换事件的前提下,某个染色体上的基因是全部连锁的,其中一个基因在减数分裂中进入到那个配子细胞,那么这
4、个染色体上的全部基因也就一起到了那里。第9页,此课件共76页哦摩尔根的发现Thomas Hunt Morgan果蝇实验研究发现果蝇(fluitfly)眼睛的颜色与X染色体有关,而不是与Y染色体有关。因此,孟德尔所说的遗传因子似应当就在染色体上。第10页,此课件共76页哦分离细胞核内物质幸运地找到最合适的研究材料鲑鱼精子(salmon sperm)。从鲑鱼精子分离到的物质中很少蛋白质。大部分是酸性的物质。后来证明它就是核酸。核内大部分物质都是核酸这一结果说明只有核酸才像是遗传信息的载体。第11页,此课件共76页哦基因化学本质的证明证明基因化学本质的第一个成功实验肺炎双球菌感染小白鼠实验:只有核物
5、质具有转化能力,此物质对蛋白酶不敏感,且有抗性。第二个成功实验-噬菌体感染细菌。核酸进入细菌细胞,并制造出成千上万的子代。第12页,此课件共76页哦二 基因的分子生物学定义 核酸是遗传信息的载体,基因是核酸分子上一段具有编码功能和调控功能的序列。遗传信息按功能可以分为两类:1.为RNA和蛋白质一级结构编码的信息 2.作为转录的调控信息第13页,此课件共76页哦基因的功能(1)基因携带遗传信息,以DNA或RNA的形式存在。基因在适当的时候,在调控信号(主要是蛋白质)的作用下,按照一定的规律转录/并表达出多肽链,行使其功能。因此可以把基因分为结构部分和调控部分两个功能不同的序列。第14页,此课件共
6、76页哦基因的功能(2)近年来,发现细胞内存在为数众多的小分子RNA,有特殊功能,它们也是转录产物,但不翻译成蛋白质。有人主张,编码这些RNA的DNA序列也应该叫做基因。按此理解,基因就是染色体上具有转录功能的DNA序列。(至于转录物RNA是进一步翻译或是就以RNA的形式行使功能,是RNA的问题)第15页,此课件共76页哦基因的结构特点由上可知,一个基因不仅包含编码蛋白质肽链或RNA的核苷酸序列(结构基因),还包括保证转录所必需的调控序列,以及编码区上游5端的非编码序列和3端的非编码序列 第16页,此课件共76页哦结构基因的结构特点由于DNA是双链,因此基因的编码信息只能在其中一条链上,这条链
7、称为有意义链,与其互补的链为反意义链。第17页,此课件共76页哦反意义链是 基因表达的模板链 在基因表达中,合成的中间物(即转录得到的RNA)并不是以有意义链(又称为编码链)为模板,而是以反意义链为模板。反意义链是基因表达的模板链。编码链和RNA(mRNA)都与模板链互补,遗传信息才得以从DNA向RNA传递。第18页,此课件共76页哦有义链有义链(sense strand)和和反义链反义链(antisense strand)的概念和定义问题的概念和定义问题生物化学(人民卫生出版社,第6版与医学分子生物学(人民卫生出版社,第2版)在这个问题上出现了矛盾。生命的化学主编祁国荣认为:这是一个容易混淆
8、的问题,显然有的介绍是不对的。我现在简单图示如下,供大家参考。第19页,此课件共76页哦 反义(反义(DNA)链)链 DNA TACACT ATGTGA 有义(有义(DNA)链)链 转录转录/转录后加工转录后加工 mRNA AUGUGA 有义(有义(RNA)链)链 翻译翻译/翻译后加工翻译后加工 蛋白质 第20页,此课件共76页哦上图的说明1带有可读框的mRNA白色链色链是有义链,显 然,它也叫编码链;2基因(DNA)中白色链色链,与mRNA序列相 同的哪条链(只是U/T之别),就叫有义链 或 编码链;3基因(DNA)中红色链色链,与有义链或编 码链互补的那条链,即反义链或模板链;4在描述双链
9、病毒中,有义链常被称作正链 (能编码),而反义链就叫负链。第21页,此课件共76页哦结构基因中的遗传信息 分为两类 1 编码RNA(tRNA,rRNA等)2 蛋白质编码信息第22页,此课件共76页哦基因结构变异 及与疾病的关系变异的原因:错配和诱发突变,后者是最主要的因素类型:点突变(转换与颠换)缺失 插入 倒位(反向插入)第23页,此课件共76页哦基因变异与 蛋白质活性改变(1)遗传密码改变:错义突变(氨基酸改变)无义突变(转变为终止密码子)同义突变(氨基酸不发生改变)移码突变(阅读框架改变)第24页,此课件共76页哦基因变异与 蛋白质活性改变(2)蛋白质肽片段缺失mRNA剪接错误其他错误(
10、识别信号错误或顺式元件错误引起的表达的质和量的错误)第25页,此课件共76页哦基因的转录调控序列原核生物基因的转录调控序列 启动子 终止子 操纵元件 正调控蛋白 结合位点真核生物基因的转录调控序列(顺式元件)启动子 上游启动子元件 增强子 反应 元件第26页,此课件共76页哦原核生物基因的特点原核生物即无细胞核结构的生物,其染色体为环状双链DNA,裸露于细胞内,形成致密区,只有一个复制起始点;结构基因串联,以操纵子形式(一个调控区控制几个基因)出现;基因连续,有重叠现象,无内含子,转录后的mRNA不剪切,以多顺反子的形式直接翻译蛋白质。第27页,此课件共76页哦原核生物基因组其他特点 编码区比
11、例(约50%)大于真核生物,小于病毒 少有重复序列,结构基因多是单拷贝 具有编码同工酶的基因 细胞内存在可移动的DNA序列 多种识别区序列特殊第28页,此课件共76页哦真核生物结构基因的结构特点 结构基因大都为断裂基因(编码序列被不编码序列隔开)转录产物为单顺反子 基因所占区域远小于非编码区域(如人的蛋白质编码序列只有基因组的2%左右)第29页,此课件共76页哦真核基因与原核基因 结构差异真核基因有内含子,原核基因无(据此,国内学者将真核基因(英文spliting)译为“断裂基因”真核基因转录初始物需要剪接加工,原核基因不需要真核基因转录产物(加工后)为单顺反子,原核为多顺反子第30页,此课件
12、共76页哦与转录有关的调控序列真核基因中的调控序列一般称为顺式作用元件(cis-acting element),包括:启动子和上游启动子元件增强子反应元件(response element)Poly(A)加尾信号第31页,此课件共76页哦启动子(promoter)概念:启动子是促进DNA转录的DNA序列,是DNA分子上可与RNA pol 特异性识别结合并使之转录的部位,但启动子本身不被转录。功能特点:启动子位于结构基因上游启动子位于结构基因上游,启动子有启动子有方向性方向性,决定转录方向及那一条DNADNA链作模板转录链作模板转录(以信息链的互补链作模板转录,转录的mRNA与信息链一致)。真核
13、生物的启动子元件是TATA boxTATA box TATA盒与TATA因子的转录因子结合后即成为完整的启动子。第32页,此课件共76页哦上游启动子元件(upstream promoter elements ups)UPS是TATA盒上游的一些特定的DNA序列。反式作用因子可与这些元件结合,通过调节TATA因子与TATA box的结合、RNA pol与启动子结合及转录起始复合物形式来调控基因转录效率。第33页,此课件共76页哦反应元件(response elements)一些信息分子的受体被细胞外信息分子激活后,能与特异的DNA序列结合,调控基因的表达。这种DNA序列实际上也是顺式元件,由于能
14、介导基因对细胞外的某种信号产生反应,被称为反应元件。反应元件都具有较短的保守序列。这些元件通常位于启动子附近和增强子内,有不少是回文序列。第34页,此课件共76页哦增强子(增强子(enhancer)和沉默子()和沉默子(silencer)增强子是一段增强子是一段DNA序列,其中含有多个能被反式作序列,其中含有多个能被反式作用因子识别与结合的顺式作用元件。反式作用因子用因子识别与结合的顺式作用元件。反式作用因子与这些元件结合后与这些元件结合后,通常为增强邻近基因的转录。增强通常为增强邻近基因的转录。增强子一般位于转录起始点上游子一般位于转录起始点上游-100-300bp处,但在处,但在基因之外或
15、某些内含子中也有增强子序列。基因之外或某些内含子中也有增强子序列。增强子作用特点:增强子作用特点:可在可在5端或端或3端发挥作用;端发挥作用;不受序列方向制约;不受序列方向制约;通过增强启动子发挥作用。沉默通过增强启动子发挥作用。沉默子子 负调控序列、负增强子;负调控序列、负增强子;第35页,此课件共76页哦加尾信号 在结构基因的最后一个外显子中有一个保守的AATAAA序列,此位点下游有一段GT丰富区或T丰富区,这两部分序列共同构成poly(A)加尾信号。mRNA转录到此部位后,产生AAUAAA和随后的GU(或U)丰富区。与RNApol结合的终止因子可以识别这种结构并与之结合,然后在AAuAA
16、A下游10-30个碱基的部位切断RNA,并加上poly(A)尾.第36页,此课件共76页哦第二节 遗传物质的结构和特点一 DNA的双螺旋结构及意义(略)二 DNA的理化性质与应用第37页,此课件共76页哦1 一般理化性质晶形晶形 DNADNA为白色纤维状固体为白色纤维状固体 RNARNA为白色粉末状固体为白色粉末状固体两性解离两性解离 呈酸性呈酸性 在中性溶液中带负电荷在中性溶液中带负电荷溶解性溶解性 均溶于水均溶于水 不溶于一般有机溶剂不溶于一般有机溶剂,在在70%70%乙醇中形成沉淀乙醇中形成沉淀 0.14MNacl 1-2MNacl0.14MNacl 1-2MNacl DNA-DNA-蛋
17、白蛋白 溶解度低溶解度低 溶解度高溶解度高 RNA-RNA-蛋白蛋白 溶解度高溶解度高 溶解度低溶解度低第38页,此课件共76页哦粘度粘度 DNADNA粘度大粘度大 RNARNA粘度小粘度小旋光性旋光性 均很强均很强密度密度 RNARNA双链双链DNADNA;环状环状DNA DNA 开环、线状开环、线状DNADNA 单链单链DNA DNA 双链双链DNA DNA 沉降速度:沉降速度:RNA RNA 环状环状DNA DNA 开环、线状开环、线状DNADNA第39页,此课件共76页哦核酸的紫外吸收核酸的紫外吸收 碱基、核苷、核苷酸和核酸在碱基、核苷、核苷酸和核酸在240290nm的的 紫外波段有强
18、烈的光吸收,紫外波段有强烈的光吸收,max=260nm 1OD 1OD260260dsDNA=50g/mldsDNA=50g/ml 1OD 1OD260260ssDNA=33g/mlssDNA=33g/ml 1OD 1OD260260 RNA=40g/ml RNA=40g/ml 纯纯DNA DNA OD OD260260/OD/OD280280=1.8=1.8 纯纯RNA RNA OD OD260260/OD/OD280280=2.0=2.0取取5l双双链链DNA样样品品,加加水水稀稀释释至至1ml,以以1ml纯纯水水作作为为参参照照测测定定波波长长在在260nm处处的的吸吸光光度度值值(26
19、0),假假如如测测得得稀稀释释样样品品的的260值为值为0.500,那么原液中,那么原液中DNA的浓度是?的浓度是?g/ml第40页,此课件共76页哦核酸的颜色反应核酸的颜色反应1.钼蓝反应(核酸中磷酸的反应)Pi +(NH4)3MoO4+Vc 钼蓝(蓝色)2.苔黑酚反应(RNA中核糖的反应)RNA+浓HCl+苔黑酚 蓝绿色3.二苯胺反应(DNA中脱氧核糖的反应)DNA+二苯胺+浓H2SO4 蓝色物第41页,此课件共76页哦2 DNA的变性 复性与分子杂交定义:在理化因素作用下,定义:在理化因素作用下,DNA双螺旋的两条互补链双螺旋的两条互补链 松散松散而分开成为单链,从而导致而分开成为单链,
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