细胞信号转导研究方法课件.ppt
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1、关于细胞信号转导研究方法现在学习的是第1页,共71页生物样品的处理生物样品的处理v组织样品组织样品采集:新鲜、未污染,剥去脂肪和筋皮等结缔组织采集:新鲜、未污染,剥去脂肪和筋皮等结缔组织若保存,液氮速冻,若保存,液氮速冻,-80冻存冻存v蛋白质成分的保护蛋白质成分的保护通常在生物样品中加入适量的蛋白酶抑制剂:通常在生物样品中加入适量的蛋白酶抑制剂:PMSF(苯甲磺酰氟)、(苯甲磺酰氟)、EDTA、胰蛋白酶抑制剂、胃蛋白酶抑制剂和亮抑蛋白酶肽。、胰蛋白酶抑制剂、胃蛋白酶抑制剂和亮抑蛋白酶肽。现在学习的是第2页,共71页v低温保存:根据蛋白质的用途决定保存温度:低温保存:根据蛋白质的用途决定保存温
2、度:4、-20还是还是-80,特殊要液氮,特殊要液氮v冻溶:冻溶:-20或或-804(一天)(一天)室温室温均匀摇晃,勿产生气泡,减少沉淀均匀摇晃,勿产生气泡,减少沉淀v组织提取物的制备:提取可溶蛋白(尽可能选择组织提取物的制备:提取可溶蛋白(尽可能选择含目标蛋白高的组织)含目标蛋白高的组织)现在学习的是第3页,共71页v步骤及注意事项:步骤及注意事项:v1、切成小块,放入预冷匀浆器,加入预冷缓冲液(、切成小块,放入预冷匀浆器,加入预冷缓冲液(2倍体积)倍体积)v2、匀浆、匀浆1-3min,若较长时间,则间隔,若较长时间,则间隔1minv3、匀浆方法选择:有的组织在匀浆前先冷冻后有利于破碎;人
3、、匀浆方法选择:有的组织在匀浆前先冷冻后有利于破碎;人工匀浆工匀浆v4、缓冲液的选择:使用中性、缓冲液的选择:使用中性PH、离子强度适当、离子强度适当v5、抑制蛋白酶的加入:根据蛋白质的可能降解情况加入(酶抑制、抑制蛋白酶的加入:根据蛋白质的可能降解情况加入(酶抑制剂价格昂贵)剂价格昂贵)v6、低温高速或超速离心、低温高速或超速离心v7、超声的方法、超声的方法现在学习的是第4页,共71页细胞破碎与分离细胞破碎与分离v破碎方法:破碎方法:机械法:机械法:非机械法:非机械法:溶胞作用:酶溶法、化学法、物理法溶胞作用:酶溶法、化学法、物理法v酶溶法:酶溶法:用生物酶将细胞壁和细胞膜消化溶解用生物酶将
4、细胞壁和细胞膜消化溶解常用:常用:溶菌酶、溶菌酶、-1,3-1,3葡聚糖酶、蛋白酶等;葡聚糖酶、蛋白酶等;缺点:缺点:价格高,通用性差价格高,通用性差现在学习的是第5页,共71页v化学渗透法:化学渗透法:化学药品改变细胞壁或膜的通透性化学药品改变细胞壁或膜的通透性有机溶剂(苯、甲苯)、表面活性剂(有机溶剂(苯、甲苯)、表面活性剂(SDS、TritonX-100)、金属螯合剂()、金属螯合剂(EDTA)、变性剂(尿素)、变性剂(尿素)v微波加热法:微波加热法:适用于热稳定的产物适用于热稳定的产物v其他:其他:反复冻融法、渗透压法、干燥法反复冻融法、渗透压法、干燥法现在学习的是第6页,共71页信号
5、转导的研究方法信号转导的研究方法受体v突变株的筛选(遗传学方法)突变株的筛选(遗传学方法)受体提纯(亲和层析)受体提纯(亲和层析)标记配体法检测受体:标记配体法检测受体:现在学习的是第7页,共71页v受体与配体相互作用研究方法受体与配体相互作用研究方法:(1 1)饱和实验,用于测定放射性配体对受体的亲和力()饱和实验,用于测定放射性配体对受体的亲和力(K K)以及结合位点的密度()以及结合位点的密度(BmaxBmax););(2 2)抑制实验,用于测定未标记的竞争配体与受体的亲和力)抑制实验,用于测定未标记的竞争配体与受体的亲和力(KiKi););(3 3)动力学实验,用于测定放射性配体与受体
6、的结合)动力学实验,用于测定放射性配体与受体的结合速率常数(速率常数(K+1K+1)和解离速率常数()和解离速率常数(k-1k-1)。)。现在学习的是第8页,共71页v饱和实验饱和实验常用于确定受体密度(受体的数目)在实验干预(如药物治疗)时的变化。保持受常用于确定受体密度(受体的数目)在实验干预(如药物治疗)时的变化。保持受体数不变而改变放射配体浓度可得到饱和曲线。从该实验中可估计受体最大结合量体数不变而改变放射配体浓度可得到饱和曲线。从该实验中可估计受体最大结合量(Bmax)和受体对放射性配体的解离常数()和受体对放射性配体的解离常数(Ka)。)。v饱和实验的结果以结合配体数(与受体结合的
7、放射性配体的浓度)为饱和实验的结果以结合配体数(与受体结合的放射性配体的浓度)为y轴,游离配体轴,游离配体数(未与受体结合的放射性配体的浓度)为数(未与受体结合的放射性配体的浓度)为x轴作图。当放射性配体浓度增大时轴作图。当放射性配体浓度增大时结合配体数逐渐增加,当达到某一点以后,再增多放射性配体量也不引起结结合配体数逐渐增加,当达到某一点以后,再增多放射性配体量也不引起结合配体数的显著增加。合配体数的显著增加。v饱和曲线的最高趋近点所对应的饱和曲线的最高趋近点所对应的y值,亦可代表所研究组织中的受体密度。值,亦可代表所研究组织中的受体密度。Kd为占据受体为占据受体50结合位点时的配体浓度。结
8、合位点时的配体浓度。现在学习的是第9页,共71页v亲和标记法分离表面受体亲和标记法分离表面受体v亲和标记(亲和标记(affinitylabeling)是常用的分离细胞表面受体的方法)是常用的分离细胞表面受体的方法v原理:原理:将细胞与超量标记的激素(配体)混合,以饱和所有特异受将细胞与超量标记的激素(配体)混合,以饱和所有特异受体的激素结合位点。洗去多余的激素,然后加入能够与受体和配体体的激素结合位点。洗去多余的激素,然后加入能够与受体和配体结合的结合的共价交联剂共价交联剂将激素与受体进行共价交联。将激素与受体进行共价交联。现在学习的是第10页,共71页v亲和标记胰岛素受体亲和标记胰岛素受体现
9、在学习的是第11页,共71页v大多数交联剂含有两个可与蛋白质中自由氨基相互作用的基团,大多数交联剂含有两个可与蛋白质中自由氨基相互作用的基团,当表面受体与配体结合后,配体和受体上各自的自由氨基的距当表面受体与配体结合后,配体和受体上各自的自由氨基的距离靠近到足以被小分子的交联剂结合时,受体和配体就会被交离靠近到足以被小分子的交联剂结合时,受体和配体就会被交联在一起。联在一起。v与交联剂共价结合的配体和受体能够耐受去垢剂和变性剂的处理。与交联剂共价结合的配体和受体能够耐受去垢剂和变性剂的处理。v因而可用去垢剂和变性剂溶解细胞质膜,分离膜蛋白通过电泳因而可用去垢剂和变性剂溶解细胞质膜,分离膜蛋白通
10、过电泳进行分析。进行分析。现在学习的是第12页,共71页v交联剂的分子结构及与受体和配体的共价交联交联剂的分子结构及与受体和配体的共价交联与自由氨基反应的位点现在学习的是第13页,共71页v核受体作用的核受体作用的DNA元件研究方法元件研究方法ChiponChip纯化的受体制备抗体纯化的受体制备抗体CHIP特异核酸特异核酸序列与已知序列的基因芯片杂交序列与已知序列的基因芯片杂交受体结受体结合的核酸序列合的核酸序列现在学习的是第14页,共71页G蛋白v药理学激活剂及抑制剂药理学激活剂及抑制剂非水解的非水解的GTP类似物激活剂:类似物激活剂:-S-GTP、,-,-亚氨基亚氨基GTPGTP,与活化,
11、与活化G G蛋白混合,使蛋白混合,使G G蛋白持续活化状态蛋白持续活化状态细菌毒素细菌毒素-霍乱毒素激活剂:霍乱毒素激活剂:ADP核糖基共价结合核糖基共价结合亚基,不可逆修亚基,不可逆修饰,结合饰,结合GTPGTP,但不能水解,但不能水解GDP类似物抑制剂:类似物抑制剂:GDPS S,结合,结合亚基的鸟苷酸位点,广泛应用亚基的鸟苷酸位点,广泛应用现在学习的是第15页,共71页v生化实验检测生化实验检测GTP结合实验:结合实验:用用GTPGTP类似物类似物 -3232PGTPPGTP,检测,检测G G蛋白的存在,几种蛋白的存在,几种G G蛋白的特异性?蛋白的特异性?免疫印迹实验:免疫印迹实验:抗
12、体抗体GTPase活性实验:活性实验:不同反应底物:同位素标记法不同反应底物:同位素标记法(-3232PGTPPGTP);级联反应荧光法);级联反应荧光法(NADHNADH,GTPaseGTPase、丙酮酸激酶和、丙酮酸激酶和LDHLDH)v分子遗传学手段分子遗传学手段借助借助G蛋白突变株蛋白突变株(功能缺失突变株、显性负突变株、功能获得突变(功能缺失突变株、显性负突变株、功能获得突变株)株)现在学习的是第16页,共71页环核苷酸信使系统vcAMP/cGMP定性及定量测定定性及定量测定3H/125I标记标记cAMP/CGMP竞争结合分析系统竞争结合分析系统酶联免疫方法(酶联免疫方法(ELISA
13、)色谱分离色谱分离-质谱测定质谱测定细胞内实时测定:细胞内实时测定:荧光共振能量转移(荧光共振能量转移(FRET)及生物分子荧光互补)及生物分子荧光互补(BIFC)现在学习的是第17页,共71页vcAMP3H分析系统,优点是放射性半衰期优点是放射性半衰期长,可用于大量样品的分析;长,可用于大量样品的分析;vcAMP125I分析系统,用于小量样品的分析;用于小量样品的分析;vcAMPELISA测定方法,测定简便、敏感性高测定简便、敏感性高(特异受体)(特异受体)。现在学习的是第18页,共71页vcAMP信号系统常用药理学试剂信号系统常用药理学试剂vcAMP类似物:类似物:竞争性结合竞争性结合PK
14、A调节亚基上的调节亚基上的cAMP结合位点,结合位点,PKA的竞争拮抗剂,的竞争拮抗剂,PDE不能水解,不能水解,Rp-cAMP、Sp-CAMPv与与PKA的底物结合位点竞争的抑制剂:的底物结合位点竞争的抑制剂:结合结合C亚基的亚基的ATP结合位结合位点,抑制专一性低,异喹啉衍生物点,抑制专一性低,异喹啉衍生物H89、KT5720v蛋白激酶抑制剂(蛋白激酶抑制剂(PKI):):结合结合C亚基的底物结合位点,细胞内源:亚基的底物结合位点,细胞内源:、三种亚型,人工合成三种亚型,人工合成PKAPKA抑制肽(高浓度时对抑制肽(高浓度时对PKGPKG的的影响)影响)现在学习的是第19页,共71页vcG
15、MP信号系统常用药理学试剂信号系统常用药理学试剂人工合成的人工合成的cGMP类似物:类似物:8-Br-cGMP,直接激活,直接激活PKGsGC抑制剂:抑制剂:NS2028PKG抑制剂:抑制剂:KT5823现在学习的是第20页,共71页脂质代谢的常用方法v同位素示踪:通过标记32Pv磷脂分子的定性和定量:色谱、质谱的应用脂组学现在学习的是第21页,共71页vDAG的测定的测定提取含提取含DAG的样品,用的样品,用DAG激酶催化底物激酶催化底物DAG,使之发,使之发生磷酸化,外源加入生磷酸化,外源加入32-ATP,最后将反应产物进行分离后,最后将反应产物进行分离后测定放射性含量,根据标准品计算出样
16、品中测定放射性含量,根据标准品计算出样品中DAG的含量的含量(Amersham公司生产的公司生产的DAG分析系统)。分析系统)。现在学习的是第22页,共71页vIP3的测定的测定v采用采用3H-TdR标记的肌醇标记靶细胞后,用不同的刺激剂刺标记的肌醇标记靶细胞后,用不同的刺激剂刺激细胞,分离磷脂酰肌醇混合物,通过阴离子交换层析柱激细胞,分离磷脂酰肌醇混合物,通过阴离子交换层析柱分离洗脱,收集分离洗脱,收集IP3洗脱峰后进行液闪测定。洗脱峰后进行液闪测定。vD-myo-IP33H分析系统直接测定粗提物中的分析系统直接测定粗提物中的IP3含量,此含量,此方法简易、敏感(方法简易、敏感(Amersh
17、am公司)。公司)。现在学习的是第23页,共71页钙信号v细胞内游离钙离子测定方法细胞内游离钙离子测定方法v方法选择:方法选择:1 1、使用、使用CaCa2+2+特异性指示剂时,指示剂与特异性指示剂时,指示剂与CaCa2+2+专一结合性强、亲和力专一结合性强、亲和力高,可以测定低浓度高,可以测定低浓度CaCa2+2+;2 2、尽可能获得、尽可能获得CaCa2+2+浓度绝对值;浓度绝对值;3 3、测定、测定CaCa2+2+水平的变化比细胞内水平的变化比细胞内CaCa信号引起的相关生理反应要快;信号引起的相关生理反应要快;4 4、指示剂与、指示剂与CaCa2+2+结合不损害细胞内正常生理生化过程;
18、结合不损害细胞内正常生理生化过程;5 5、容易进入细胞并在胞质内扩散;、容易进入细胞并在胞质内扩散;6 6、有可能显示胞内、有可能显示胞内CaCa2+2+分布。分布。现在学习的是第24页,共71页vCa2+i的测定的测定v细胞内细胞内Ca2+的测定方法有原子吸收光谱法、离子的测定方法有原子吸收光谱法、离子微电极测定法、放射示踪法及标记示踪法等。微电极测定法、放射示踪法及标记示踪法等。现在学习的是第25页,共71页荧光法v水母发光蛋白法水母发光蛋白法v钙离子荧光探针法(目前常用),标记靶细胞钙离子荧光探针法(目前常用),标记靶细胞钙离子荧光探针钙离子荧光探针常用的常用的有有Fluo-3AM、qu
19、in-2/Am、Fura-2/Am及及Indo-1等。等。现在学习的是第26页,共71页v荧光探针的装载方法:荧光探针的装载方法:显微注射:显微注射:水母发光蛋白和水母发光蛋白和Dextran偶联的探针偶联的探针酸化导入法:酸化导入法:离子型探针(有些细胞无法导入)离子型探针(有些细胞无法导入)常温孵育法:常温孵育法:AM酯化的探针(在动物细胞应用广泛酯化的探针(在动物细胞应用广泛)低温导入法:低温导入法:植物细胞,低温抑制细胞壁的酯酶植物细胞,低温抑制细胞壁的酯酶现在学习的是第27页,共71页v荧光测定仪器荧光测定仪器 荧光分光光度计:少用荧光分光光度计:少用 流式细胞仪:流式细胞仪:激光扫
20、描共聚焦显微镜术(激光扫描共聚焦显微镜术(LSCMLSCM)数字共聚焦显微镜数字共聚焦显微镜现在学习的是第28页,共71页vFluo3若以游离配体形式存在时几乎是非荧光性的,但是当它若以游离配体形式存在时几乎是非荧光性的,但是当它与钙离子与钙离子Ca2+结合后荧光会增加结合后荧光会增加60至至80倍,最大激发波长为倍,最大激发波长为506nm,最大发射波长为,最大发射波长为526nm。是目前最常用的一种钙离子荧光探。是目前最常用的一种钙离子荧光探针。针。vFluo3-AM是是Fluo3的一种乙酰甲酯衍生物,通过培养,能够轻易进入的一种乙酰甲酯衍生物,通过培养,能够轻易进入细胞中。细胞中。Flu
21、o3-AM进入细胞后可以被细胞内的酯酶剪切形成进入细胞后可以被细胞内的酯酶剪切形成Fluo3,从而被滞留在细胞内。,从而被滞留在细胞内。v激光共聚焦荧光显微镜具有氩激光器,所以激光共聚焦荧光显微镜具有氩激光器,所以Fluo3可被广泛使用于可被广泛使用于这种显微镜上。这种荧光信号发出来的长波也便于减小对样品这种显微镜上。这种荧光信号发出来的长波也便于减小对样品细胞的光损伤。细胞的光损伤。现在学习的是第29页,共71页v钙调素的定量测定钙调素的定量测定酶法:酶法:根据根据CaM依赖的酶(依赖的酶(PDE、NAD激酶、激酶、Ca-ATP酶等)激活的程度,使用广泛酶等)激活的程度,使用广泛免疫学法:免
22、疫学法:RIA和和ELISA(抗体,特异性强、测定(抗体,特异性强、测定CaM的总量,非活性)的总量,非活性)现在学习的是第30页,共71页磷酸化的信号转导分子v酪氨酸磷酸化、苏氨酸残基磷酸化及丝氨酸残基磷酸化酪氨酸磷酸化、苏氨酸残基磷酸化及丝氨酸残基磷酸化v蛋白鉴定蛋白鉴定通常是首先分离粗提蛋白,采用针对含这些通常是首先分离粗提蛋白,采用针对含这些氨基酸残基磷酸化蛋白的单克隆抗体进行免疫沉淀氨基酸残基磷酸化蛋白的单克隆抗体进行免疫沉淀,SDS-PAGE电泳,然而采用电泳,然而采用Westernblotting鉴定鉴定其分子量,进一步利用分子生物学技术克隆信号蛋白,其分子量,进一步利用分子生物
23、学技术克隆信号蛋白,搞清其基因结构和氨基酸序列。搞清其基因结构和氨基酸序列。现在学习的是第31页,共71页免疫学法v蛋白质印迹:蛋白质印迹:抗体(如抗抗体(如抗p-Thr)、样品匀浆液加入蛋白酶)、样品匀浆液加入蛋白酶抑制剂、蛋白磷酸酶抑制剂或蛋白激酶抑制剂;目标蛋白印抑制剂、蛋白磷酸酶抑制剂或蛋白激酶抑制剂;目标蛋白印迹发生移位迹发生移位v免疫组织化学:免疫组织化学:磷酸化蛋白在亚细胞定位和动态变化磷酸化蛋白在亚细胞定位和动态变化v流式细胞术:流式细胞术:荧光抗体荧光抗体现在学习的是第32页,共71页v磷酸化蛋白组学磷酸化蛋白组学 高分辨率质谱高分辨率质谱 磷酸酶抑制剂使用:钒酸钠(酪氨酸磷
24、酸酶)、冈田酸(丝磷酸酶抑制剂使用:钒酸钠(酪氨酸磷酸酶)、冈田酸(丝/苏苏氨酸磷酸酶)、氟化钠、焦磷酸钠、甘油磷酸钠(广谱、氨酸磷酸酶)、氟化钠、焦磷酸钠、甘油磷酸钠(广谱、非特异磷酸酶)非特异磷酸酶)现在学习的是第33页,共71页激酶活性的测定激酶活性的测定v常见激酶活性的测定有常见激酶活性的测定有PTK、PKC及及PI-3K等。均有商品化的试剂盒。等。均有商品化的试剂盒。v检测原理:检测原理:根据激酶可以催化特定底物发生磷酸化,外源加入根据激酶可以催化特定底物发生磷酸化,外源加入32-ATP,通过分离反应产物后测定放射活性,从标准曲线推算出样品酶的,通过分离反应产物后测定放射活性,从标准
25、曲线推算出样品酶的活性。活性。vPKC从胞质向胞膜的转位是从胞质向胞膜的转位是PKC活化的一个重要指标,因而分离胞质和活化的一个重要指标,因而分离胞质和胞膜中的胞膜中的PKC并分别测定其活性,计算胞膜上并分别测定其活性,计算胞膜上PKC活性占总活性占总PKC活性的比活性的比例,从而判定例,从而判定PKC的活化程度。的活化程度。现在学习的是第34页,共71页蛋白质表达水平和细胞内定位研究蛋白质表达水平和细胞内定位研究v信号蛋白分子表达水平及分子量检测信号蛋白分子表达水平及分子量检测westernblotanalysisv信号蛋白分子在细胞内定位研究信号蛋白分子在细胞内定位研究immunohist
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