蛋白质的共价结构 (4)讲稿.ppt
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1、目目 录录关于蛋白质的共价结构(4)第一页,讲稿共五十八页哦目目 录录 第第 二二 章章 蛋白质的共价结构蛋白质的共价结构第一节、蛋白质通论第一节、蛋白质通论 (P157)(P157)第二节、肽第二节、肽第三节、蛋白质一级结构的测定第三节、蛋白质一级结构的测定第四节、蛋白质的氨基酸序列与生物功能第四节、蛋白质的氨基酸序列与生物功能第五节、肽和蛋白质的人工合成第五节、肽和蛋白质的人工合成(不要求不要求)第二页,讲稿共五十八页哦目目 录录第一节、蛋白质通论第一节、蛋白质通论一一 、蛋白质的化学组成和分类、蛋白质的化学组成和分类二、蛋白质分子的形状和大小二、蛋白质分子的形状和大小三、蛋白质构象和蛋白
2、质结构的组织层次三、蛋白质构象和蛋白质结构的组织层次四、蛋白质功能的多样性四、蛋白质功能的多样性第三页,讲稿共五十八页哦目目 录录一、蛋白质的化学组成和分类1、化学组成:蛋白质是一类含氮有机化合物,除含有碳、氢、氧外,蛋白质是一类含氮有机化合物,除含有碳、氢、氧外,还有氮和少量的硫。某些蛋白质还含有其他一些元素,还有氮和少量的硫。某些蛋白质还含有其他一些元素,主要是磷、铁、碘、钼、锌和铜等。这些元素在蛋白质主要是磷、铁、碘、钼、锌和铜等。这些元素在蛋白质中的组成百分比约为:中的组成百分比约为:碳碳 5050-55%-55%氢氢 6.5-7.36.5-7.3 氧氧 19-2419-24 氮氮 1
3、6%16%硫硫 0-30-3 其他其他 微微 量量第四页,讲稿共五十八页哦目目 录录蛋白质的含氮量蛋白质的含氮量v大大多多数数蛋蛋白白质质的的含含氮氮量量接接近近于于16%16%,这这是是蛋蛋白白质质元元素素组组成成的的一一个个特特点点,也也是是凯凯氏氏(KjedahlKjedahl)定定氮氮法法测测定定蛋蛋白白质质含含量量的的计计算算基基础础。所以,可以根据生物样品中的含氮量来计算蛋白质的大概含量:v蛋白质含量蛋白质含量=蛋白氮蛋白氮 6.256.25v6.256.25为为蛋蛋白白质质系系数数,即即1 1克克氮氮所所代代表表的的蛋蛋白质量(克数)白质量(克数)1/16%第五页,讲稿共五十八页
4、哦目目 录录2、分类(P157,了解):*根据蛋白质组成成分根据蛋白质组成成分 单纯蛋白质单纯蛋白质:只含氨基酸只含氨基酸如清蛋白、谷蛋白、组蛋白、精蛋白如清蛋白、谷蛋白、组蛋白、精蛋白等等 结合蛋白质结合蛋白质 =蛋白质部分蛋白质部分 +非蛋白质部分非蛋白质部分*根据蛋白质结构分根据蛋白质结构分 单体蛋白单体蛋白:仅有一条多肽链构成的蛋白质。:仅有一条多肽链构成的蛋白质。寡聚寡聚(多聚多聚)蛋白蛋白:由:由2 2条或多条多肽链构成的蛋白质条或多条多肽链构成的蛋白质*根据蛋白质生物学功能分根据蛋白质生物学功能分 酶、调节蛋白、转运蛋白、结构蛋白等等酶、调节蛋白、转运蛋白、结构蛋白等等第六页,讲
5、稿共五十八页哦目目 录录二、蛋白质分子的形状和大小1 1、根据蛋白质的形状和溶解度分为:、根据蛋白质的形状和溶解度分为:纤维状纤维状ProPro:分子类似纤维或细棒,线性结构,:分子类似纤维或细棒,线性结构,在生物体内主要起结构作用,在生物体内主要起结构作用,大多不溶于水和稀盐大多不溶于水和稀盐。球状球状ProPro:近球状结构,疏水:近球状结构,疏水aaaa侧链在分子内部侧链在分子内部亲水侧链在外因此溶解性较好,能形成结晶,大多数蛋白亲水侧链在外因此溶解性较好,能形成结晶,大多数蛋白质属于这一类。质属于这一类。膜膜PrPr:与细胞中各种膜系统结合而存在。组成特点是所含:与细胞中各种膜系统结合
6、而存在。组成特点是所含的疏水的疏水aaaa较多,不溶于水但溶于去污剂溶液。较多,不溶于水但溶于去污剂溶液。(p158了解)第七页,讲稿共五十八页哦目目 录录2 2、蛋白质分子的大小蛋白质分子的大小蛋白质分子量的变化范围很大,从大约蛋白质分子量的变化范围很大,从大约60006000到到10000001000000道尔顿道尔顿(DaDa)或更大。)或更大。某些蛋白质是由两个或更多个蛋白质亚基某些蛋白质是由两个或更多个蛋白质亚基(多肽链多肽链)通过非共通过非共价结合而成的,称寡聚蛋白质。有些价结合而成的,称寡聚蛋白质。有些寡聚蛋白质寡聚蛋白质的分子量可的分子量可高达数百万甚至数千万(高达数百万甚至数
7、千万(TMVTMV:4x104x107 7)对于那些不含辅基的简单蛋白质,用对于那些不含辅基的简单蛋白质,用110110除它的分子量可以除它的分子量可以粗粗略的估计其氨基酸残基的数目略的估计其氨基酸残基的数目。蛋白质的。蛋白质的2020种氨基酸的平均分子种氨基酸的平均分子量是量是138138,但在大多数蛋白质中较小的氨基酸占优势,因此平,但在大多数蛋白质中较小的氨基酸占优势,因此平均分子量接近均分子量接近128128。因形成一个肽键脱掉一个水分子,故。因形成一个肽键脱掉一个水分子,故氨基氨基酸残基的平均分子量是酸残基的平均分子量是110110。(P160)(P160)第八页,讲稿共五十八页哦目
8、目 录录三、蛋白质构象和蛋白质结构的组织层次三、蛋白质构象和蛋白质结构的组织层次每种天然蛋白质都有自己特有的空间(三维)结构,每种天然蛋白质都有自己特有的空间(三维)结构,这种结构就是这种结构就是蛋白质的构象蛋白质的构象。构型:是由于化合物分子中某一不对称碳原子上四种不构型:是由于化合物分子中某一不对称碳原子上四种不同的取代基团(或原子)的空间排列所形成的一种光学同的取代基团(或原子)的空间排列所形成的一种光学活性立体结构。一个不对称碳原子只能形成两种不同的活性立体结构。一个不对称碳原子只能形成两种不同的构型,分子从一种构型变成另一种构型,必须发生构型,分子从一种构型变成另一种构型,必须发生共
9、价共价键的断裂键的断裂。构象:构象是分子内所有原子或原子团的空间排布所形构象:构象是分子内所有原子或原子团的空间排布所形成的一种立体结构。天然蛋白质分子都有与其生物活性成的一种立体结构。天然蛋白质分子都有与其生物活性相关的一种或少数几种特定的构象,这种天然构象相当相关的一种或少数几种特定的构象,这种天然构象相当稳定。稳定。一个给定的蛋白质理论上可采取多种构象,但在生理条一个给定的蛋白质理论上可采取多种构象,但在生理条件下一般件下一般只有一种或很少几种只有一种或很少几种。第九页,讲稿共五十八页哦目目 录录 为了表示蛋白质结构的不同组织层次,一般采用这样的专为了表示蛋白质结构的不同组织层次,一般采
10、用这样的专门术语:门术语:蛋白质的蛋白质的4 4级结构级结构(掌握掌握):P160P160一级结构一级结构指多肽链中的氨基酸的组成和排列顺序。指多肽链中的氨基酸的组成和排列顺序。二级结构二级结构是指蛋白质多肽链主链借助氢键排列成自己特有的是指蛋白质多肽链主链借助氢键排列成自己特有的-螺螺旋和旋和-折叠片段。折叠片段。二级结构仅仅是主链构象,不讨论侧链基二级结构仅仅是主链构象,不讨论侧链基团的空间排布团的空间排布。三级结构三级结构指多肽链借助各种非共价键弯曲、折叠成具有特指多肽链借助各种非共价键弯曲、折叠成具有特定走向的紧密球状构象。定走向的紧密球状构象。四级结构四级结构指两条或两条以上具有独立
11、三级结构的多肽链通指两条或两条以上具有独立三级结构的多肽链通过非共价键相互结合而成的蛋白质空间结构过非共价键相互结合而成的蛋白质空间结构-即寡聚蛋白,即寡聚蛋白,其中每条多肽链形成的独立其中每条多肽链形成的独立3 3级结构单元称为亚基。级结构单元称为亚基。一级结构一级结构二级结构二级结构三级结构三级结构四级结构四级结构第十页,讲稿共五十八页哦目目 录录虾红素虾红素为为 研研 究究 方方 便便,分分 四层四层 次次 探探 讨讨第十一页,讲稿共五十八页哦目目 录录四、蛋白质功能的多样性四、蛋白质功能的多样性(了解了解)1.1.蛋白质是生物蛋白质是生物 体重要组成成分体重要组成成分n分布广:分布广:
12、所有器官、组织都含有蛋白质;细所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含有蛋白质。胞的各个部分都含有蛋白质。n含量高:含量高:蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,占人体干重的占人体干重的4545,某些组织含量更高,例,某些组织含量更高,例如脾、肺及横纹肌等高达如脾、肺及横纹肌等高达8080。第十二页,讲稿共五十八页哦目目 录录 蛋白质种类非常多,原因?蛋白质种类非常多,原因?蛋白质的生物学功能有以下几方面:蛋白质的生物学功能有以下几方面:1.1.催化功能催化功能-酶酶2.2.结构功能结构功能-皮毛骨牙细胞骨架皮毛骨牙细胞骨架3.3.载运功能载运功能-膜蛋白膜蛋白
13、4.4.调控功能调控功能-激素激素5.5.运动功能运动功能-鞭毛、肌肉蛋白鞭毛、肌肉蛋白6.6.防御功能防御功能-免疫球蛋白免疫球蛋白7.7.神经传导神经传导 其他蛋白(受体蛋白、毒素蛋白、激素蛋白等)其他蛋白(受体蛋白、毒素蛋白、激素蛋白等)蛋白质分布广泛、功能多样第十三页,讲稿共五十八页哦目目 录录蛋白质的功能与分布单细胞生物胞外酶鞭毛-蛋白质(运动器官)细胞壁-糖、脂、肽细胞膜-载运蛋白、酶蛋白细胞质-酶蛋白(催化物质代谢)细胞核-酶蛋白(催化遗传)第十四页,讲稿共五十八页哦目目 录录多细胞动物多细胞动物个体层次个体层次毛发、皮肤-角蛋白骨骼、牙齿-钙+胶原蛋白第十五页,讲稿共五十八页哦
14、目目 录录食道(口、胃、肠)食道(口、胃、肠)-消化酶消化酶(细胞外)(细胞外)血管中血管中-免疫蛋白免疫蛋白 (Antibody)激素蛋白激素蛋白器官层次器官层次第十六页,讲稿共五十八页哦目目 录录细胞水平细胞水平提问:为什么人体细胞会有不同的形状呢?细胞内有支撑体?w细胞内丝网状骨架蛋白(决定细胞形状及运动);地衣细胞带有绿色荧光的骨架蛋白质食物酵母细胞w细胞粘连物质细胞粘连物质-胶原胶原蛋白蛋白w细胞膜细胞膜载体蛋白载体蛋白w细胞质细胞质(包括细胞器包括细胞器)酶酶(物质代谢)、信号传递(物质代谢)、信号传递w细胞核细胞核酶(遗传)、结构酶(遗传)、结构蛋白(染色体骨架)蛋白(染色体骨架
15、)w结构蛋白结构蛋白,均为均为纤维状纤维状;功能功能 蛋蛋 白白,大多为大多为 球球 状状;第十七页,讲稿共五十八页哦目目 录录其他组成以及结构复杂程度不同其他组成以及结构复杂程度不同 结构决定功能结构决定功能即分子结构的不同决定其具有不同的生物功能即分子结构的不同决定其具有不同的生物功能同样是有同样是有20种种Aa组成,为何这些蛋白质的功能组成,为何这些蛋白质的功能大不相同?大不相同?第十八页,讲稿共五十八页哦目目 录录第二节第二节 肽(肽(peptidepeptide)P162(熟悉)(熟悉)一、肽和肽键的结构一、肽和肽键的结构二、肽的物化性质二、肽的物化性质三、天然存在的活性肽三、天然存
16、在的活性肽第十九页,讲稿共五十八页哦目目 录录一个氨基酸的羧基与另一一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基之间失水个氨基酸的氨基之间失水形成的酰胺键称为肽键,形成的酰胺键称为肽键,所形成的化合物称为肽所形成的化合物称为肽。一、肽与肽键的结构一、肽与肽键的结构由由两两个个氨氨基基酸酸组组成成的的肽肽称称为为二二肽肽,由由多多个个氨氨基基酸酸组组成成的的肽肽则则称称为为多多肽肽。组组成成多多肽肽的的氨氨基基酸酸单单元元称称为为氨氨基酸残基。基酸残基。第二十页,讲稿共五十八页哦目目 录录+-HOH甘氨酰甘氨酸甘氨酰甘氨酸肽键第二十一页,讲稿共五十八页哦目目 录录两分子氨基酸缩合形成两分子氨基酸缩合形成
17、二肽二肽,三分子氨基,三分子氨基酸缩合则形成酸缩合则形成三肽三肽由十个以内氨基酸相连而成的肽称为由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽寡肽(oligopeptide)(oligopeptide),由更多的氨基酸相连形由更多的氨基酸相连形成的肽称成的肽称多肽多肽(polypeptide)(polypeptide)。*肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为团不全,被称为氨基酸残基氨基酸残基(residue)(residue)。肽的命名肽的命名第二十二页,讲稿共五十八页哦目目 录录在多肽链中,氨基酸残基按一定的顺序排列,这在多肽链中,氨基酸残基按一定的顺序排
18、列,这种排列顺序称为种排列顺序称为氨基酸顺序氨基酸顺序氨基酸的顺序是从氨基酸的顺序是从N-N-端的氨基酸残基开始,以端的氨基酸残基开始,以C-C-端端氨基酸残基为终点的排列顺序。如上述五肽可表示氨基酸残基为终点的排列顺序。如上述五肽可表示为:为:Ser-Val-Tyr-Asp-GlnSer-Val-Tyr-Asp-Gln命名为:某氨基酰某氨基酰。某氨基酸命名为:某氨基酰某氨基酰。某氨基酸通通常常在在多多肽肽链链的的一一端端含含有有一一个个游游离离的的-氨氨基基,称称为为氨氨基基端端或或N-N-端端;在在另另一一端端含含有有一一个个游游离离的的-羧羧基基,称为羧基端或称为羧基端或C-C-端。端。
19、肽肽链链中中A AA A的的排排列列顺顺序序和和命命名名第二十三页,讲稿共五十八页哦目目 录录是根据参与其组成的氨基酸残基来确定是根据参与其组成的氨基酸残基来确定的。规定从肽链的的。规定从肽链的NHNH2 2末端氨基酸残基开末端氨基酸残基开始,始,肽链的肽链的NHNH2 2末端一般放左边末端一般放左边,称为某,称为某氨基酰某氨基酰氨基酰某氨基酰某氨基酸。例如,某氨基酸。例如,具有下列化学结构的五肽命名为丝氨酰具有下列化学结构的五肽命名为丝氨酰甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸,简写为甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸,简写为 SerGlySerGlyTyrAlaLeuTyrAlaLeu。第二十四页,讲稿共五十八页
20、哦目目 录录肽链也像氨基酸一样具有极性,通常总是把肽链也像氨基酸一样具有极性,通常总是把NHNH2 2末末端氨基酸残基放在左边,端氨基酸残基放在左边,COOHCOOH末端氨基酸残基放在末端氨基酸残基放在右边。除特别指明者外,上面举例的五肽丝氨酸右边。除特别指明者外,上面举例的五肽丝氨酸残基一侧为残基一侧为NHNH2 2末端,亮氨酸残基一侧为末端,亮氨酸残基一侧为 COOHCOOH末端。末端。注意,反过来书写的注意,反过来书写的 LeuAlaTyrGlySerLeuAlaTyrGlySer是与是与前者不同的另一种五肽。前者不同的另一种五肽。第二十五页,讲稿共五十八页哦目目 录录 肽键肽键(pep
21、tide bondpeptide bond):肽肽键键的的特特点点是氮原子上的孤对电子与羰基具有明显的共轭作用。组成肽键的原子处于同一平面组成肽键的原子处于同一平面。0.125nm0.125nm键长键长=0.133nm=0.133nm 0.145nm0.145nm第二十六页,讲稿共五十八页哦目目 录录肽键肽键肽肽键键中中的的C-NC-N键键具具有有部部分分双双键键性质,不能自由旋转。性质,不能自由旋转。在大多数情况下,以反式结构在大多数情况下,以反式结构存在。存在。第二十七页,讲稿共五十八页哦目目 录录肽键有部分双键性质肽键有部分双键性质肽键由于肽键由于共振共振而具有而具有部分双键部分双键性质
22、,因此,性质,因此,1)肽键比一般肽键比一般C-N键键短短,且不能自由旋转,且不能自由旋转2)肽键原子及相邻的肽键原子及相邻的 碳原子组成碳原子组成肽平面肽平面3)相邻的相邻的 碳原子呈碳原子呈反式反式构型构型第二十八页,讲稿共五十八页哦目目 录录肽键比一般肽键比一般肽键比一般肽键比一般C-N键短键短键短键短肽键为一平面肽键为一平面肽键为一平面肽键为一平面相邻的相邻的相邻的相邻的 碳原子呈反式构型碳原子呈反式构型碳原子呈反式构型碳原子呈反式构型第二十九页,讲稿共五十八页哦目目 录录肽的结构肽的结构第三十页,讲稿共五十八页哦目目 录录N 末端:多肽链中有末端:多肽链中有自由氨基自由氨基的一端的一
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