工业微生物代谢控制育种精.ppt
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1、工业微生物代谢控制育种第1页,本讲稿共63页工业微生物代谢控制育种第2页,本讲稿共63页代谢控制发酵大体过程如下:代谢控制发酵大体过程如下:以生物化学和遗传学为基础,研究代谢产物的生物合成途径和代谢调以生物化学和遗传学为基础,研究代谢产物的生物合成途径和代谢调节的机制节的机制选择巧妙的技术路线,通过遗传育种技术获得解除选择巧妙的技术路线,通过遗传育种技术获得解除或绕过了微生物正常代谢途径的突变株或绕过了微生物正常代谢途径的突变株从而人为地使有用产物从而人为地使有用产物选择性地大量合成和累积选择性地大量合成和累积。代谢控制发酵的关键:代谢控制发酵的关键:取决于微生物代谢调控机制是否能够被取决于微
2、生物代谢调控机制是否能够被解除,能否打破微生物正常的代谢调节,人为地控制微生物的代解除,能否打破微生物正常的代谢调节,人为地控制微生物的代谢。谢。实现代谢控制目标的手段:实现代谢控制目标的手段:代谢控制育种和发酵过程的代谢控制代谢控制育种和发酵过程的代谢控制培养,而代谢控制育种则为主要支柱技术。培养,而代谢控制育种则为主要支柱技术。第3页,本讲稿共63页 微生物菌体微生物菌体积累的发酵产物主要有积累的发酵产物主要有 酶酶 代谢产物代谢产物 (酒精、甘油、乳酸、丙酮、丁醇、酒精、甘油、乳酸、丙酮、丁醇、有机酸、氨基酸、核苷酸、蛋白质、抗生素、维生素、脂肪、多糖等)有机酸、氨基酸、核苷酸、蛋白质、
3、抗生素、维生素、脂肪、多糖等)这些产物中有些是某种微生物在一定的环境条件下生成的,如酒这些产物中有些是某种微生物在一定的环境条件下生成的,如酒精、乳酸等;也有许多产物是生理正常的微生物不能过量积累的,必精、乳酸等;也有许多产物是生理正常的微生物不能过量积累的,必须是具有特异生理特征的微生物才能积累。人为地改变微生物的代谢须是具有特异生理特征的微生物才能积累。人为地改变微生物的代谢调控机制,使有用的中间代谢产物过量积累,这种发酵称为调控机制,使有用的中间代谢产物过量积累,这种发酵称为代谢控制代谢控制发酵。发酵。第4页,本讲稿共63页 考察工业微生物发展史,考察工业微生物发展史,可以看到经典的诱变
4、育种具有一定盲目可以看到经典的诱变育种具有一定盲目性,而代谢控制育种将微生物遗传学的理论与育种实践密切结合,性,而代谢控制育种将微生物遗传学的理论与育种实践密切结合,先研究目的产物的生物合成途径、遗传控制及代谢调节机制,然先研究目的产物的生物合成途径、遗传控制及代谢调节机制,然后进行定向控制育种。后进行定向控制育种。代谢控制发酵的出现与发展,与以下几方面是密不可分的:代谢控制发酵的出现与发展,与以下几方面是密不可分的:生物化学的发展,确立了代谢图谱,同时发现了代谢过程中的各生物化学的发展,确立了代谢图谱,同时发现了代谢过程中的各种调节机制;分子生物学和分子遗传学的发展,可以人为地在种调节机制;
5、分子生物学和分子遗传学的发展,可以人为地在DNA分子水平上改变微生物的代谢,多方面利用微生物的代谢活分子水平上改变微生物的代谢,多方面利用微生物的代谢活性;合理控制环境,采用过程控制方法,对发酵过程进行最优化性;合理控制环境,采用过程控制方法,对发酵过程进行最优化控制,使目的产物大量积累。控制,使目的产物大量积累。第5页,本讲稿共63页第一节 概 论一、初级代谢产物和初级代谢一、初级代谢产物和初级代谢初级代谢产物初级代谢产物微生物产生的对自身生长和繁殖必须的物质微生物产生的对自身生长和繁殖必须的物质初级代谢初级代谢产生这些物质的代谢系称为初级代谢。产生这些物质的代谢系称为初级代谢。初级代谢体系
6、初级代谢体系分解代谢体系:分解代谢体系:包括糖、脂、蛋白质等物质的降包括糖、脂、蛋白质等物质的降解,获取能量解,获取能量素材性生物合成体系:素材性生物合成体系:合成某些小分子材料合成某些小分子材料结构性生物合成体系:结构性生物合成体系:用小分子合成产物装配大用小分子合成产物装配大分子。分子。第6页,本讲稿共63页二、次级代谢产物和次级代谢二、次级代谢产物和次级代谢根据根据Demain的定义:的定义:“次级代谢产物是对产生它们次级代谢产物是对产生它们的生物体本身不需要的一种产物的生物体本身不需要的一种产物”。这些物质有抗生素、生长刺激素、生物碱、色素、这些物质有抗生素、生长刺激素、生物碱、色素、
7、毒素以及甾体等。毒素以及甾体等。通常把以初级代谢产物为前体,合成次生产物的代谢体通常把以初级代谢产物为前体,合成次生产物的代谢体系称为次级代谢。系称为次级代谢。第7页,本讲稿共63页三、初级代谢与次级代谢的关系三、初级代谢与次级代谢的关系1.菌体代谢方面菌体代谢方面 抗生素是微生物的次级代谢产物中的一大类。微生物的初级代谢抗生素是微生物的次级代谢产物中的一大类。微生物的初级代谢与次级代谢既有区别,又有联系。与次级代谢既有区别,又有联系。许多抗生素的基本结构是由少数几种初级代谢产物构许多抗生素的基本结构是由少数几种初级代谢产物构成的,所以次级代谢产物是以初级代谢产物为母体衍生出来成的,所以次级代
8、谢产物是以初级代谢产物为母体衍生出来的,次级代谢途径并不是独立的,而是与初级代谢途径有密的,次级代谢途径并不是独立的,而是与初级代谢途径有密切关系的。切关系的。糖代谢中间体,既可用来合成初级代谢产物,又可用来合成糖代谢中间体,既可用来合成初级代谢产物,又可用来合成次级代谢产物,这种中间体叫做次级代谢产物,这种中间体叫做分支分支(叉叉)中间体中间体。第8页,本讲稿共63页分叉中间体初级代谢产物次级代谢产物-氨基己二糖丙二酰CoA乙酰CoA赖氨酸脂肪酸青霉素、头孢菌素利福霉素族、四环素族大环内酯族、多烯族抗生素、灰黄霉素、橘霉素、环己酰亚胺、棒曲霉素莽草酸对氨基苯丙氨酸苯丙氨酸酪氨酸、对氨基苯甲酸
9、、色氨酸氯霉素绿脓菌素新生霉素第9页,本讲稿共63页 次级代谢产物的合成,至少有一部分取决于与初级代次级代谢产物的合成,至少有一部分取决于与初级代谢产物无关的遗传物质,并和由这类遗传物质形成的酶所谢产物无关的遗传物质,并和由这类遗传物质形成的酶所催化的代谢途径有关,它们多数是特异菌株。从代谢途径催化的代谢途径有关,它们多数是特异菌株。从代谢途径来看,次级代谢产物是以初级代谢产物为前体衍生出来的,来看,次级代谢产物是以初级代谢产物为前体衍生出来的,见下图。见下图。第10页,本讲稿共63页脂肪酸脂肪酸(nC3、nC2)葡萄糖葡萄糖(C6)丙糖丙糖P丙酮酸丙酮酸(C3)(C3)乙酰乙酰CoA(C2)
10、柠檬酸柠檬酸(C6)草酰乙酸草酰乙酸-酮戊二酸酮戊二酸(C5)CO2CO2谷氨酸谷氨酸(C5N)次级代谢产物次级代谢产物戊糖戊糖(C5)氨基糖苷类抗生素氨基糖苷类抗生素糖苷类多糖糖苷类多糖核苷核苷核苷类核苷类抗生素抗生素丝氨酸丝氨酸(C3N)甘氨酸甘氨酸(C2N)半胱氨酸半胱氨酸次级代谢物次级代谢物丁糖丁糖(C4)莽草酸莽草酸(C7)芳香族氨基酸芳香族氨基酸次级代次级代谢产物谢产物芳香族次级芳香族次级代谢产物代谢产物缬氨酸缬氨酸(C5N)生物甲基化生物甲基化次级代谢产物次级代谢产物C1丙氨酸丙氨酸(C3N)甲羟戊酸甲羟戊酸(C3)焦磷酸异戊酯焦磷酸异戊酯(C3)CO2萜萜甾体甾体甾体甾体(6C
11、5)丙二酸丙二酸(C3)CO2CO2CO2聚酮体聚酮体次级代谢产物次级代谢产物天冬氨酸天冬氨酸(C4N)(nC2)葡萄糖分解代谢的主要途径葡萄糖分解代谢的主要途径初级代谢的合成过程初级代谢的合成过程图图从碳代谢流看初级代谢与次级代谢从碳代谢流看初级代谢与次级代谢第11页,本讲稿共63页 由初级代谢产物衍生的次级代谢产物的生物合成途径有由初级代谢产物衍生的次级代谢产物的生物合成途径有七种。在这些次级代谢途径中所涉及的酶有的是初级代谢酶,七种。在这些次级代谢途径中所涉及的酶有的是初级代谢酶,有的是次级代谢所特有的酶。初级代谢与次级代谢都受菌体的有的是次级代谢所特有的酶。初级代谢与次级代谢都受菌体的
12、代谢调节,在调节控制上是相互影响的,当与抗生素合成有关代谢调节,在调节控制上是相互影响的,当与抗生素合成有关的初级代谢途径受到控制时,抗生素的生物合成必然受阻。的初级代谢途径受到控制时,抗生素的生物合成必然受阻。葡萄糖碳架参入途径葡萄糖碳架参入途径 莽草酸途径莽草酸途径 与核苷有关的途径与核苷有关的途径 聚酮糖和聚丙酸途径聚酮糖和聚丙酸途径 由氨基酸衍生的途径由氨基酸衍生的途径 甲羟戊酸途径甲羟戊酸途径 其他复合途径其他复合途径综上所述,在代谢途径、综上所述,在代谢途径、酶系关系以及调控上,次酶系关系以及调控上,次级代谢与初级代谢都有着级代谢与初级代谢都有着密切关系。因此,在研究密切关系。因此
13、,在研究次级代谢时,必须与初级次级代谢时,必须与初级代谢联系起来考虑。代谢联系起来考虑。第12页,本讲稿共63页2.2.遗传代谢方面遗传代谢方面 初级代谢与次级代谢同样都受到核内初级代谢与次级代谢同样都受到核内DNADNA的调节控制的调节控制,而次级而次级代谢产物还受到与初级代谢产物合成无关的遗传物质的控制代谢产物还受到与初级代谢产物合成无关的遗传物质的控制,即即受核内遗传物质受核内遗传物质(染色体遗传物质染色体遗传物质)和核外遗传物质和核外遗传物质(质粒质粒)的控制的控制.有一部分代谢产物的形成,取决于由质粒信息产生的酶所控制的有一部分代谢产物的形成,取决于由质粒信息产生的酶所控制的代谢途径
14、,这类物质称为质粒产物。代谢途径,这类物质称为质粒产物。由于这类物质的形成直接或间接受质粒遗传物质的控制,由于这类物质的形成直接或间接受质粒遗传物质的控制,因而产生了质粒遗传的观点。因而产生了质粒遗传的观点。也有只由染色体也有只由染色体DNADNA控制的抗生素产物。控制的抗生素产物。第13页,本讲稿共63页次级代谢产物(质粒产物)次级代谢产物(质粒产物)初级代谢产物(质粒产物)初级代谢产物(质粒产物)底物(营养物)底物(营养物)中间体(质中间体(质粒产物)粒产物)底物(异常营养物)底物(异常营养物)酶、蛋白质酶、蛋白质酶、蛋白质、次级代谢产物酶、蛋白质、次级代谢产物(质粒产物)(质粒产物)核糖
15、核蛋白体系统核糖核蛋白体系统mRNAmRNA染色体染色体质粒质粒次级代谢产物生物合成与初级代谢产物的关系次级代谢产物生物合成与初级代谢产物的关系第14页,本讲稿共63页第二节第二节 初级代谢的调节控制初级代谢的调节控制一、酶合成的调节一、酶合成的调节通过调节酶合成量进而调节代谢速率,是在基因水平上(原通过调节酶合成量进而调节代谢速率,是在基因水平上(原核生物中转录水平)的代谢调节核生物中转录水平)的代谢调节特点:间接缓慢、节约能量和原料特点:间接缓慢、节约能量和原料酶合成调节酶合成调节诱导酶合成诱导酶合成阻遏酶合成阻遏酶合成 酶合成调节的类型酶合成调节的类型诱导:当环境中存在诱导物(底物及类似
16、物、底物前体)时,诱导:当环境中存在诱导物(底物及类似物、底物前体)时,促进酶合成,诱导方式有同时诱导、顺序诱导促进酶合成,诱导方式有同时诱导、顺序诱导 阻遏:过量代谢产物阻碍代谢途径中包括关键酶在内的一阻遏:过量代谢产物阻碍代谢途径中包括关键酶在内的一系列酶的合成,从而控制代谢,减少末端产物的合成系列酶的合成,从而控制代谢,减少末端产物的合成第15页,本讲稿共63页 酶合成调节的机制酶合成调节的机制乳糖操纵子的调节乳糖操纵子的调节第16页,本讲稿共63页色氨酸操纵子的反馈阻遏色氨酸操纵子的反馈阻遏第17页,本讲稿共63页DNA(促(促 进)进)分解代谢物阻遏的乳糖操纵子模型分解代谢物阻遏的乳
17、糖操纵子模型转乙酰基酶转乙酰基酶调节基因调节基因CAP-cAMPRNApolLacZOLacYLacA阻遏蛋白阻遏蛋白启动基因启动基因操纵基因操纵基因结构基因结构基因RNA聚合酶聚合酶乳糖乳糖阻遏蛋白阻遏蛋白mRNA半乳糖苷酶半乳糖苷酶透过酶透过酶葡萄糖葡萄糖(阻断)(阻断)XATPcAMPCAPAMP葡萄糖分解代谢物葡萄糖分解代谢物X X阻止阻止CAP-cAMP CAP-cAMP 的形成,从而阻止了的形成,从而阻止了RNARNA聚合酶与启动基因上结合位点聚合酶与启动基因上结合位点(RNApol.)(RNApol.)的的结合,即使有诱导物乳糖存在,与乳糖代谢有关的酶仍无法合成结合,即使有诱导物
18、乳糖存在,与乳糖代谢有关的酶仍无法合成第18页,本讲稿共63页二、酶活性的调节二、酶活性的调节通通过过改改变变现现成成的的酶酶分分子子活活性性来来调调节节新新陈陈代代谢谢的的速速率率的的方方式式。是是酶酶分分子子水水平上的调节,属于精细的调节。平上的调节,属于精细的调节。(一)调节方式:(一)调节方式:包括两个方面:包括两个方面:1、酶酶活活性性的的激激活活:在在代代谢谢途途径径中中后后面面的的反反应应可可被被较较前前面面的的反反应应产产物物所所促进的现象;常见于分解代谢途径。促进的现象;常见于分解代谢途径。如:粗糙脉孢霉的异柠檬酸脱氢酶的活性受柠檬酸促进如:粗糙脉孢霉的异柠檬酸脱氢酶的活性受
19、柠檬酸促进2、酶活性的抑制、酶活性的抑制:包括:竞争性抑制和反馈抑制。:包括:竞争性抑制和反馈抑制。概概念念:反反馈馈:指指反反应应链链中中某某些些中中间间代代谢谢产产物物或或终终产产物物对对该该途途径径关关键键酶酶活活性的影响。性的影响。凡使反应速度加快的称凡使反应速度加快的称正反馈正反馈;凡使反应速度减慢的称凡使反应速度减慢的称负反馈(反馈抑制)负反馈(反馈抑制);反反馈馈抑抑制制主主要要表表现现在在某某代代谢谢途途径径的的末末端端产产物物过过量量时时可可反反过过来来直直接接抑抑制该途径中第一个酶的活性。主要表现在氨基酸、核苷酸合成途径中。制该途径中第一个酶的活性。主要表现在氨基酸、核苷酸
20、合成途径中。特点:作用直接、效果快速、末端产物浓度降低时又可解除特点:作用直接、效果快速、末端产物浓度降低时又可解除第19页,本讲稿共63页1.直线式代谢途径中的反馈抑制直线式代谢途径中的反馈抑制:苏氨酸脱氨酶苏氨酸脱氨酶苏氨酸苏氨酸-酮丁酸酮丁酸异亮氨酸异亮氨酸反馈抑制反馈抑制其它实例:谷氨酸棒杆菌的精氨酸合成其它实例:谷氨酸棒杆菌的精氨酸合成2.2.分支代谢途径中的反馈抑制:分支代谢途径中的反馈抑制:在分支代谢途径中,反馈抑制的情况较为复杂,为了避免在一个分在分支代谢途径中,反馈抑制的情况较为复杂,为了避免在一个分支上的产物过多时不致同时影响另一分支上产物的供应,微生物发支上的产物过多时不
21、致同时影响另一分支上产物的供应,微生物发展出多种调节方式。主要有:展出多种调节方式。主要有:同功酶的调节,同功酶的调节,顺序反馈,协同反顺序反馈,协同反馈,积累反馈调节等。馈,积累反馈调节等。(二)反馈抑制的类型(二)反馈抑制的类型第20页,本讲稿共63页(1 1)同功酶调节)同功酶调节isoenzymeisoenzyme定义:催化相同的生化反应,而酶分子结构有差别的定义:催化相同的生化反应,而酶分子结构有差别的一组酶。一组酶。意义:在一个分支代谢途径中,如果在分支点以前的一个较早的意义:在一个分支代谢途径中,如果在分支点以前的一个较早的反应是由几个同功酶催化时,则分支代谢的几个最终产物往往反
22、应是由几个同功酶催化时,则分支代谢的几个最终产物往往分别对这几个同功酶发生抑制作用。分别对这几个同功酶发生抑制作用。某一产物过量仅抑某一产物过量仅抑制相应酶活性,对其他产物没影响。制相应酶活性,对其他产物没影响。举例:大肠杆菌的天冬氨酸族氨基酸合成的调节举例:大肠杆菌的天冬氨酸族氨基酸合成的调节第21页,本讲稿共63页(2 2)协同反馈抑制)协同反馈抑制concerted feedback inhibition定义:分支代谢途径中几个末端产物同时过量时才能抑制共同途径定义:分支代谢途径中几个末端产物同时过量时才能抑制共同途径中的第一个酶的一种反馈调节方式。中的第一个酶的一种反馈调节方式。举例:
23、谷氨酸棒杆菌(举例:谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)多粘芽孢杆菌(多粘芽孢杆菌(Bacillus polymyxa)天冬氨酸族氨基酸合成中天冬氨酸激酶受赖氨酸天冬氨酸族氨基酸合成中天冬氨酸激酶受赖氨酸和苏氨酸的协同反馈抑制和阻遏。和苏氨酸的协同反馈抑制和阻遏。第22页,本讲稿共63页(3 3)合作反馈抑制)合作反馈抑制cooperative feedback inhibitioncooperative feedback inhibition定义:两种末端产物同时存在时,共同的反馈抑制作用大于二者单独定义:两种末端产物同时存在时,共同的反馈抑制作用大于二者单独
24、作用之和。作用之和。举例:在嘌呤核苷酸合成中,磷酸核糖焦磷酸酶受举例:在嘌呤核苷酸合成中,磷酸核糖焦磷酸酶受AMP和和GMP(和(和IMP)的合作反馈抑制,二者共同存在时,可以完全抑制该酶的活性。而)的合作反馈抑制,二者共同存在时,可以完全抑制该酶的活性。而二者单独过量时,分别抑制其活性的二者单独过量时,分别抑制其活性的70%和和10%。第23页,本讲稿共63页(4)积累反馈抑制)积累反馈抑制cumulative feedback inhibition定义:每一分支途径末端产物按一定百分比单独抑制共同途径中前面的定义:每一分支途径末端产物按一定百分比单独抑制共同途径中前面的酶,所以当几种末端产
25、物共同存在时它们的抑制作用是积累的,各末端酶,所以当几种末端产物共同存在时它们的抑制作用是积累的,各末端产物之间既无协同效应,亦无拮抗作用。产物之间既无协同效应,亦无拮抗作用。第24页,本讲稿共63页(5 5)顺序反馈抑制)顺序反馈抑制sequential feedback inhibitionsequential feedback inhibition一一种种终终产产物物的的积积累累,导导致致前前一一中中间间产产物物的的积积累累,通通过过后后者者反反馈馈抑抑制制合成途径关键酶的活性,使合成终止。合成途径关键酶的活性,使合成终止。举例:枯草芽孢杆菌芳香族氨基酸合成的调节举例:枯草芽孢杆菌芳香族
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