真核基因表达调控 精选PPT.ppt
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1、关于真核基因表达调控 第1页,讲稿共110张,创作于星期二真核生物的基因组 真核生物基因表达调控的特点和种类真核生物DNA水平上的基因表达调控 真核生物转录水平上的基因表达调控 真核基因转录后水平上的调控Contents第2页,讲稿共110张,创作于星期二一、真核基因组结构特点真核基因组结构庞大真核基因组结构庞大 3109bp、染色质、核膜、染色质、核膜单顺反子单顺反子基因不连续性基因不连续性 断裂基因(断裂基因(interrupted gene)、内含子)、内含子(intron)、外显子外显子(exon)非编码区较多非编码区较多 多于编码序列多于编码序列(9:1)含有大量重复序列含有大量重复
2、序列第一节 真核生物的基因组第3页,讲稿共110张,创作于星期二 基因组很小,大多只有一条染色体 结构简炼 存在转录单元多顺反子原核生物基因组结构特点 有重叠基因第4页,讲稿共110张,创作于星期二三、基本概念(一)基因家族(gene family)真核生物的基因组中有很多来源相同、结构相似、功能相关的基因,将这些基因称为基因家族。同一家族中的成员有时紧密地排列在一起,成为一个基因簇(gene cluster)。如:编码组蛋白、免疫球蛋白和血红蛋白的基因都属于基因家族第5页,讲稿共110张,创作于星期二1、简单多基因家族简单多基因家族中的基因一般以串联方式前后相连。第6页,讲稿共110张,创作
3、于星期二The eukaryotic ribosomal DNA repeating unit非转录间隔序列外转录间隔序列内转录间隔序列第7页,讲稿共110张,创作于星期二2、复杂多基因家族 复杂多基因家族一般由几个相关基因家族构成,基因家族之间由间隔序列隔开,并作为独立的转录单位。现已发现存在不同形式的复杂多基因家族。第8页,讲稿共110张,创作于星期二Organization of histone genes in the animal genomeRepeating uniteRepeating unite第9页,讲稿共110张,创作于星期二发育调控的复杂多基因家族:血红蛋白基因家族有功
4、能的血红蛋白基因的基本有功能的血红蛋白基因的基本结构:三个外显子被两个内含结构:三个外显子被两个内含子隔开子隔开类类 和类和类 珠蛋白珠蛋白基因家族基因家族人在发育过程中的血人在发育过程中的血红蛋白类型红蛋白类型第10页,讲稿共110张,创作于星期二(二)断裂基因 基因的编码序列在DNA分子上是不连续的,为非编码序列所隔开,其中编码的序列称为外显子,非编码序列称内含子。外显子(Exon):真核细胞基因DNA中的编码序列,这些序列被转录成RNA并进而翻译为蛋白质。内含子(Intron):真核细胞基因DNA中的间插序列,这些序列被转录成RNA,但随即被剪除而不翻译。第11页,讲稿共110张,创作于
5、星期二第12页,讲稿共110张,创作于星期二1、外显子与内含子的连接区 指外显子和内含子的交界或称边界序列,它有两个重要特征:内含子的两端序列之间没有广泛的同源性连接区序列很短,高度保守,是RNA剪接的信号序列 5GTAG 3-GTAG 法则第13页,讲稿共110张,创作于星期二有些DNA序列可编码一条以上的蛋白质相同密码子、不同起始位点产生长度不同的蛋白质不同起始位点、不同读码顺序产生不同蛋白质第14页,讲稿共110张,创作于星期二2、外显子与内含子的可变调控组成型剪接:一个基因的转录产物通过剪接只能产生一种成熟的mRNA。肌红蛋白重链基因41个外显子,但能精确的剪接成一个成熟的mRNA.选
6、择性剪接:同一基因的转录产物由于不同的剪接方式形成不同mRNA。小鼠淀粉酶基因表达的组织特异性变化:唾液腺和肝脏第15页,讲稿共110张,创作于星期二第16页,讲稿共110张,创作于星期二(三)假基因是基因组中因突变而失活的基因,无蛋白质产物。一般是启动子出现问题。第17页,讲稿共110张,创作于星期二第二节 真核生物基因表达调控的特点和种类一、真核生物基因表达调控的特点1、多层次2、个体发育复杂3、活性染色体结构变化:对核酸酶敏感、DNA拓扑结构变化、DNA碱基修饰变化、组蛋白变化 4、正性调节占主导5、转录与翻译间隔进行 6、转录后修饰、加工 第18页,讲稿共110张,创作于星期二根据其性
7、质可分为两大类:一是一是瞬时调控或称为可逆性调控瞬时调控或称为可逆性调控,它相当于原核细胞对环,它相当于原核细胞对环境条件变化所做出的反应。瞬时调控包括某种底物或激素境条件变化所做出的反应。瞬时调控包括某种底物或激素水平升降时,及细胞周期不同阶段中酶活性和浓度的调节。水平升降时,及细胞周期不同阶段中酶活性和浓度的调节。二是二是发育调控或称不可逆调控发育调控或称不可逆调控,是真核基因调控的精髓部,是真核基因调控的精髓部分,它决定了真核细胞生长、分化、发育的全部进程。分,它决定了真核细胞生长、分化、发育的全部进程。根据基因调控在同一事件中发生的先后次序又可分为:DNA水平调控水平调控转录水平调控转
8、录水平调控转录后水平调控转录后水平调控翻翻译水平调控译水平调控蛋白质加工水平的调控蛋白质加工水平的调控二、真核生物基因表达调控的种类:第19页,讲稿共110张,创作于星期二第三节 真核生物DNA水平上的基因表达调控基因丢失基因丢失马蛔虫马蛔虫马蛔虫马蛔虫基因扩增基因扩增rDNArDNA基因重排基因重排DNA甲基化状态与调控甲基化状态与调控染色体结构与调控染色体结构与调控抗体分子的形成抗体分子的形成Ti质粒质粒转座子转座子第20页,讲稿共110张,创作于星期二一、基因丢失:一、基因丢失:在细胞分化过程中,可以通过丢失掉某些基因而去除这些基因在细胞分化过程中,可以通过丢失掉某些基因而去除这些基因的
9、活性。某些原生动物、线虫、昆虫和甲壳类动物在个体发育的活性。某些原生动物、线虫、昆虫和甲壳类动物在个体发育中,许多体细胞常常丢失掉整条或部分的染色体,只有将来分中,许多体细胞常常丢失掉整条或部分的染色体,只有将来分化产生生殖细胞的那些细胞一直保留着整套的染色体。化产生生殖细胞的那些细胞一直保留着整套的染色体。目前,在高等真核生物(包括动物、植物)中尚未发现类似的目前,在高等真核生物(包括动物、植物)中尚未发现类似的基因丢失现象。基因丢失现象。第21页,讲稿共110张,创作于星期二二、基因扩增:二、基因扩增:基因扩增是指某些基因的拷贝数专一性增多的现象,它使得细胞在短期内产生大量的基因产物以满足
10、生长发育的需要,是基因活性调控的一种方式。如非洲爪蟾体细胞中rDNA的基因扩增是因发育需要而出现的基因扩增现象。第22页,讲稿共110张,创作于星期二基因组拷贝数增加,即多倍性,在植物中是非常普遍的现象。基因组拷贝数增加使可供遗传重组的物质增多,这可能构成了加速基因进化、基因组重组和最终物种形成的一种方式。小麦、大豆都是多倍体植物。发育或系统发生中的倍性增加在植物中普遍存在第23页,讲稿共110张,创作于星期二将一个基因从远离启动子的地方移到距它很近的位点从将一个基因从远离启动子的地方移到距它很近的位点从而启动转录,这种方式被称为而启动转录,这种方式被称为基因重排基因重排。通过基因重排调节基因
11、活性的典型例子是通过基因重排调节基因活性的典型例子是免疫球蛋白免疫球蛋白结结构基因的表达。构基因的表达。三、基因重排:三、基因重排:第24页,讲稿共110张,创作于星期二第25页,讲稿共110张,创作于星期二第26页,讲稿共110张,创作于星期二第27页,讲稿共110张,创作于星期二第28页,讲稿共110张,创作于星期二免疫球蛋白由两条重链(可变区V、连接区J、恒定区C)和两条轻链(V、C)组成;免疫球蛋白及其基因重排第29页,讲稿共110张,创作于星期二淋巴细胞 第30页,讲稿共110张,创作于星期二第31页,讲稿共110张,创作于星期二实例二:人类血红蛋白;人类血红蛋白基因基因家族成员的发
12、育阶段特异性表达是通过基因重排的方式决定的,这种变化是不可逆的。第32页,讲稿共110张,创作于星期二四、DNA甲基化与基因活性的调控DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化与表达。其机理是DNA甲基化导致某些区域DNA构象变化,从而影响了蛋白质与DNA的相互作用,抑制了转录因子与启动区DNA 的结合效率。DNA的甲基化能提高甲基化位点的突变频率,因而可作为诱变剂或致癌因子调节基因表达。X染色体上DNA的高度甲基化可引起X染色体的失活。第33页,讲稿共110张,创作于星期二DNADNA的的甲甲基基化化第34页,讲稿共110张,创作于星期二在真核生物中,5-甲基胞嘧啶主要
13、出现在CpG序列、CpXpG、CCA/TGG和GATC中 CpG二核苷酸通常成串出现在DNA上,称为CpG岛 第35页,讲稿共110张,创作于星期二真核生物细胞内存在两种甲基化酶活性:日常型甲基转移酶:在甲基化母链(模板链)指导下使处于半甲基化的DNA双链分子上与甲基胞嘧啶相对应的胞嘧啶甲基化。催化特异性强,保证了DNA复制及细胞分裂后甲基化模式不变。从头合成型甲基转移酶:催化未甲基化的CpG 成为mCpG,不需要母链的指导,但速度很慢。第36页,讲稿共110张,创作于星期二Not recognized by Not recognized by maintenance maintenance
14、methylasemethylaseRecognized by Recognized by maintenance maintenance methylasemethylase第37页,讲稿共110张,创作于星期二2 2、DNADNA甲基化抑制基因转录的机理甲基化抑制基因转录的机理DNA甲基化导致某些区域DNA构象变化,从而影响了蛋白质与DNA的相互作用,抑制了转录因子与启动区DNA的结合效率。甲基化达到一定程度时,DNA构象由B-DNA向Z-DNA过渡,后者结构收缩,螺旋加深,使许多反式作用因子所识别的元件(顺式作用因子)深陷于大沟内,而不利于二者的识别与结合,从而不利于基因的转录起始。第3
15、8页,讲稿共110张,创作于星期二DNA甲基化对基因转录的抑制作用P252第39页,讲稿共110张,创作于星期二第40页,讲稿共110张,创作于星期二DNA的甲基化提高了位点突变频率5-mC脱氨基造成C-T转换:所以CpG二核苷酸序列出现的频率远远低于按核苷酸组成计算出的频率。第41页,讲稿共110张,创作于星期二DNA的甲基化与X染色体失活雌性哺乳动物一条X染色体发育早期失活,可传给子细胞,巴氏小体。X特异性基因Xist(xi-specific transcript,只在失活的X染色体上表达)产物是功能性RNA分子(不含ORF,具有大量的中止密码子,仅定位于核内),可与Xic(X-chrom
16、osome inactivation center)位点结合,造成构象变化,使DNA更易与各种蛋白质结合,最终导致X染色体失活。活化X染色体上的Xist基因总是甲基化的,失活X染色体上的Xist基因总是去甲基化的。第42页,讲稿共110张,创作于星期二XistX染色体其他位点甲基化、不转录活性去甲基化、活性去甲基化、转录失活甲基化、失活Xist基因甲基化与X染色体失活第43页,讲稿共110张,创作于星期二五、染色质结构与基因表达调控:五、染色质结构与基因表达调控:按功能状态的不同可将染色质分为活性染色质常染色质和非活性染色质异染色质,所谓活性染色质是指具有转录活性的染色质;非活性染色质是指没有
17、转录活性的染色质。活性染色质由于核小体构型发生构象的改变,往往具有疏松的染色质结构从而便于转录调控因子与顺式调控元件结合和RNA聚合酶在转录模板上滑动。活性染色质第44页,讲稿共110张,创作于星期二真核细胞中基因转录的模板是染色质而不是裸露的DNA,因此染色质呈疏松或紧密结构,即是否处于活化状态是决定RNA聚合酶能否有效行使转录功能的关键。第45页,讲稿共110张,创作于星期二活性染色质的主要特点在结构上:活性染色质上具有DNase I超敏位点活性染色质上具有基因座控制区活性染色质上具有核基质结合区(MAR序列)第46页,讲稿共110张,创作于星期二活性染色体结构变化1.对核酸酶敏感活化基因
18、常有超敏位点,位于调节蛋白结合位点附近。HMG蛋白与启动子的结合,导致单链区形成,使启动子暴露,产生了DNase超敏感位点。第47页,讲稿共110张,创作于星期二DNase hypersensitive sites第48页,讲稿共110张,创作于星期二HMG 蛋白质是真核细胞核内一组含量丰富的非组蛋白,它们在染色质的结构与功能及基因表达调控过程中均起着重要作用。HMG 蛋白质能与通用转录因子TFIID 和TFIIA 相互作用,增强某些基因的转录.HMG(14/17)是目前已知惟一能特异性地识别围绕在核小体核心颗粒上146 bp DNA 的非组蛋白第49页,讲稿共110张,创作于星期二2.DNA
19、拓扑结构变化天然双链DNA均以负性超螺旋构象存在;基因活化后RNA-pol正超螺旋负超螺旋转录方向3.DNA碱基修饰变化真核DNA约有5%的胞嘧啶被甲基化,甲基化范围与基因表达程度呈反比。第50页,讲稿共110张,创作于星期二4.组蛋白变化 富含Lys组蛋白水平降低 H2A,H2B二聚体不稳定性增加 组蛋白修饰 H3组蛋白巯基暴露第51页,讲稿共110张,创作于星期二活性染色质上具有DNase I超敏感位点。每个活跃表达的基因都有一个或几个超敏感位点,大部分位于基因5端启动子区域。第52页,讲稿共110张,创作于星期二活性染色质上具有核基质结合区(matrix attachment regio
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