蛋白质组成成分和氨基酸精选PPT.ppt
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1、关于蛋白质组成成分和氨基酸第1页,讲稿共125张,创作于星期三第一节第一节 蛋白质通论蛋白质通论蛋白质存在于所有的蛋白质存在于所有的生物细胞中,是构成生物细胞中,是构成生物体最基本的生物体最基本的结构结构物质和功能物质物质和功能物质。蛋白质是生命活动的蛋白质是生命活动的物质基础,它参与了物质基础,它参与了几乎所有的生命活动几乎所有的生命活动过程。过程。第2页,讲稿共125张,创作于星期三一、蛋白质的功能多样性一、蛋白质的功能多样性1.1.催化功能催化功能 2.2.结构功能结构功能 3.3.运输功能运输功能 4.4.贮存功能贮存功能 5.5.运动功能运动功能 6.6.防御功能防御功能 7.7.调
2、节功能调节功能 8.8.信息传递功能信息传递功能 9.9.遗传调控功能遗传调控功能 10.10.其它功能其它功能 蛋白质蛋白质(protein)是由许多氨基酸是由许多氨基酸(aminoacids)通过肽键通过肽键(peptidebond)相连形成的高分子含氮化合物。相连形成的高分子含氮化合物。第3页,讲稿共125张,创作于星期三二、蛋白质的分类二、蛋白质的分类(一)按分子形状分类(一)按分子形状分类 1.1.球状蛋白球状蛋白 球形,多溶于水,球形,多溶于水,多具有活性,长度多具有活性,长度与直径之比一般小与直径之比一般小于于1010。如酶、转运蛋白、如酶、转运蛋白、蛋白激素、抗体等。蛋白激素、
3、抗体等。2.2.纤维状蛋白纤维状蛋白 细长,分子量大,多细长,分子量大,多是结构蛋白。是结构蛋白。如胶原蛋白,弹性蛋如胶原蛋白,弹性蛋白,角蛋白等。白,角蛋白等。第4页,讲稿共125张,创作于星期三二、蛋白质的分类二、蛋白质的分类(二)按分子组成分类(二)按分子组成分类1.1.简单蛋白简单蛋白 由氨基酸组成由氨基酸组成7 7类:类:清蛋白清蛋白球蛋白球蛋白组蛋白组蛋白精蛋白精蛋白谷蛋白谷蛋白醇溶蛋白和硬蛋白。醇溶蛋白和硬蛋白。2.2.结合蛋白结合蛋白 由蛋白质和非蛋白成分组由蛋白质和非蛋白成分组成,后者称为辅基。成,后者称为辅基。7 7类:类:核蛋白核蛋白脂蛋白脂蛋白糖蛋白糖蛋白磷蛋白磷蛋白血
4、红素蛋白血红素蛋白黄素蛋白和金属蛋白。黄素蛋白和金属蛋白。第5页,讲稿共125张,创作于星期三三、蛋白质的元素组成与分子量三、蛋白质的元素组成与分子量元素组成:元素组成:、含量含量 :克克 6.256.25克克 蛋白质蛋白质每克样品中含每克样品中含N N克数克数6.251006.25100 =100 =100克样品中蛋白质的含量(克克样品中蛋白质的含量(克%)第6页,讲稿共125张,创作于星期三第二节第二节 氨基酸氨基酸一、氨基酸的结构与分类一、氨基酸的结构与分类(一)基本氨基酸(一)基本氨基酸 (二)(二)氨基酸的生物学功能氨基酸的生物学功能二、氨基酸的性质二、氨基酸的性质(一)物理性质(一
5、)物理性质 (二)化学性质(二)化学性质 第7页,讲稿共125张,创作于星期三(一)基本氨基酸(一)基本氨基酸1 1、种氨基酸的化学名称及结构通式:、种氨基酸的化学名称及结构通式:一、氨基酸的结构与分类一、氨基酸的结构与分类第8页,讲稿共125张,创作于星期三2 2、构型:、构型:从蛋白质水解得到的从蛋白质水解得到的氨基酸属氨基酸属 L L 氨基酸氨基酸COOHH2NCHR代表氨基酸的侧链(基团)代表氨基酸的侧链(基团)。不同的氨基酸,基团不同不同的氨基酸,基团不同。第9页,讲稿共125张,创作于星期三氨基酸的分类氨基酸的分类根据氨基酸的侧链根据氨基酸的侧链R R基团的化学结构分类:基团的化学
6、结构分类:脂肪族氨基酸:脂肪族氨基酸:甘、丙、缬、亮、异亮、甘、丙、缬、亮、异亮、蛋、半胱、丝、苏、谷、蛋、半胱、丝、苏、谷、谷酰、天、天酰、赖、精谷酰、天、天酰、赖、精芳香族氨基酸:芳香族氨基酸:苯丙、酪、色苯丙、酪、色杂环氨基酸:杂环氨基酸:组、脯组、脯杂环亚氨基酸:杂环亚氨基酸:脯脯第10页,讲稿共125张,创作于星期三第11页,讲稿共125张,创作于星期三第12页,讲稿共125张,创作于星期三第13页,讲稿共125张,创作于星期三第14页,讲稿共125张,创作于星期三第15页,讲稿共125张,创作于星期三氨基酸氨基酸 基团基团 基团上有功能基团基团上有功能基团 丝丝Ser Ser 羟基
7、羟基 半胱半胱Cysh Cysh 巯基巯基 天酰天酰Asn Asn 酰胺基酰胺基谷酰谷酰GlnGln天冬天冬Asp Asp 羧基羧基谷谷GluGlu 赖赖LysLys 2 2氨基氨基 精精Arg Arg 胍基胍基 组组HisHis 咪唑基咪唑基第16页,讲稿共125张,创作于星期三极性氨基酸极性氨基酸:极性不带电荷:甘、丝、苏、天酰、极性不带电荷:甘、丝、苏、天酰、谷酰、谷酰、酪、半胱酪、半胱 极性带负电荷:天、谷极性带负电荷:天、谷极性带正电荷:组、赖、精极性带正电荷:组、赖、精非极性氨基酸非极性氨基酸:丙、缬、亮、异亮、丙、缬、亮、异亮、苯丙、蛋、脯、色苯丙、蛋、脯、色根据氨基酸的侧链根据
8、氨基酸的侧链R R基团的基团的极性极性分类:分类:第17页,讲稿共125张,创作于星期三必需氨基酸必需氨基酸:机机体体维维持持正正常常代代谢谢、生生长长所所必必需需,而而自自身身不不能能合合成成,需需从从外外界界获获取取的的氨氨基基酸酸。如如:PhePhe、TrpTrp、LysLys、MetMet、LeuLeu、I1eI1e、ThrThr、ValVal、HisHis、ArgArg。非必需氨基酸非必需氨基酸:体内能合成的氨基酸。体内能合成的氨基酸。1212种种第18页,讲稿共125张,创作于星期三(二)(二)氨基酸的生物学功能氨基酸的生物学功能1 1、合成蛋白质合成蛋白质,以满足机体生长发,以满
9、足机体生长发育和组织的更新修复等需要。育和组织的更新修复等需要。2 2、转变成具有重要生理功能的含氮转变成具有重要生理功能的含氮化合物化合物(如核苷酸、尼克酰胺、儿茶酚(如核苷酸、尼克酰胺、儿茶酚胺类激素、甲状腺素等)。胺类激素、甲状腺素等)。3 3、转变成、转变成糖类或脂肪糖类或脂肪。4 4、氧化供能氧化供能。第19页,讲稿共125张,创作于星期三二、氨基酸的重要理化性质氨基酸的重要理化性质(一)物理性质(一)物理性质(二)化学性质(二)化学性质第20页,讲稿共125张,创作于星期三紫外吸收紫外吸收参与蛋白质组成的参与蛋白质组成的20种氨基酸种氨基酸中色氨酸中色氨酸(Trp)、酪氨酸、酪氨酸
10、(Tyr)和苯丙和苯丙氨酸氨酸(Phe)的的R基团中含有苯环共轭基团中含有苯环共轭双键系统,在紫外光区显示特征的双键系统,在紫外光区显示特征的吸收谱带,最大光吸收(吸收谱带,最大光吸收(max)分)分别为别为280、275、和和257nm。大大多多数数蛋蛋白白质质含含有有这这两两种种氨氨基基酸酸残残基基,所所以以测测定定蛋蛋白白质质溶溶液液280nm的的光光吸吸收收值值是是分分析析溶溶液液中中蛋蛋白白质质含含量的快速简便的方法。量的快速简便的方法。芳香族氨基酸的紫外吸收芳香族氨基酸的紫外吸收(一)物理性质(一)物理性质第21页,讲稿共125张,创作于星期三 与与苯异硫氰酸酯苯异硫氰酸酯(PIT
11、C)(PITC)的反应的反应 COOH COOH|+H H2 2N-CHN-CH|R R在弱碱中在弱碱中-NH-C-NH-CH-COOH苯氨基硫甲酰氨基酸苯氨基硫甲酰氨基酸(PTC-(PTC-氨基酸氨基酸)S|RH+环化环化-N=C=S苯异硫氰酸酯苯异硫氰酸酯(PITC)(PITC)-NOCCH-RC NHS苯乙内酰硫脲氨基酸苯乙内酰硫脲氨基酸(PTH-(PTH-氨基酸氨基酸)无色无色EdmanEdman反应反应(二)化学性质(二)化学性质第22页,讲稿共125张,创作于星期三 与与2,4-2,4-二硝基氟苯二硝基氟苯反应反应 COOH COOH|+H H2 2N-CHN-CH|R R在弱碱中
12、在弱碱中O2N-|NO2-F2,4-2,4-二硝基氟苯二硝基氟苯(DNFB(DNFB或或FDNB)FDNB)O2N-|NO2-2,4-2,4-二硝基苯二硝基苯-氨基酸氨基酸(DNP-(DNP-氨基酸氨基酸)黄色黄色 COOH COOH|NH-CH NH-CH|R R+HFSanger Sanger 反应反应 第23页,讲稿共125张,创作于星期三SangerSanger 反应反应2.42.4一二硝基氟苯(一二硝基氟苯(DNFBDNFB)DNP-DNP-氨氨基基酸酸,黄黄色色,层层析析法法鉴鉴定定,被被SangerSanger用用来来测测定定多多肽肽的的NHNH2 2末端氨基酸末端氨基酸 第24
13、页,讲稿共125张,创作于星期三 与茚三酮的反应与茚三酮的反应RCHCOOHNH2 氨基酸氨基酸OOOHOH2+沸腾沸腾蓝紫色化合物蓝紫色化合物第25页,讲稿共125张,创作于星期三成肽反应成肽反应 R1 R2 H2NCHCOOH H2NCHCOOH R1 R2 H2NCHCOHN CH COOH肽键肽键二肽二肽-H2O第26页,讲稿共125张,创作于星期三两性解离和等电点两性解离和等电点第27页,讲稿共125张,创作于星期三氨基酸的兼性离子形式氨基酸的兼性离子形式 氨基酸在晶体和水溶液中主要以兼性离子氨基酸在晶体和水溶液中主要以兼性离子形式存在。形式存在。晶体熔点高晶体熔点高离子晶格,不是分
14、子晶格。离子晶格,不是分子晶格。不溶于非极性溶剂不溶于非极性溶剂极性分子极性分子介电常数高介电常数高水溶液中的氨基酸是极性分子。水溶液中的氨基酸是极性分子。第28页,讲稿共125张,创作于星期三第29页,讲稿共125张,创作于星期三氨基酸的氨基酸的等电点等电点 当溶液为某一当溶液为某一pHpH值时,氨基酸分子值时,氨基酸分子中所含的中所含的-NH-NH3 3+和和-COO-COO-数目正好相等,净数目正好相等,净电荷为电荷为0 0。这一。这一pHpH值即为氨基酸的等电点值即为氨基酸的等电点(pIpI)。)。在等电点时,氨基酸既不向正在等电点时,氨基酸既不向正极也不向负极移动,即氨基酸处于两性极
15、也不向负极移动,即氨基酸处于两性离子状态。离子状态。不同的氨基酸,其等电点(不同的氨基酸,其等电点(pIpI)不同。)不同。第30页,讲稿共125张,创作于星期三第31页,讲稿共125张,创作于星期三第32页,讲稿共125张,创作于星期三氨基酸的等电点氨基酸的等电点 侧链不含离解基团的中性氨基酸,其等电点是它的侧链不含离解基团的中性氨基酸,其等电点是它的pKpK1 1和和pKpK2 2的算术平均值:的算术平均值:pI=(pKpI=(pK1 1+pK+pK2 2)/2)/2 对于侧链含有可解离基团的氨基酸,其对于侧链含有可解离基团的氨基酸,其pIpI值也决定于两性离值也决定于两性离子两边的子两边
16、的pKpK值的算术平均值。值的算术平均值。酸性氨基酸:酸性氨基酸:pI=(pKpI=(pK1 1+pK+pK2 2)/2 )/2 碱性氨基酸:碱性氨基酸:pI=(pKpI=(pK2 2+pK+pK3 3)/2)/2 对于丙氨酸等一氨基一羧基的中性型氨基酸来说对于丙氨酸等一氨基一羧基的中性型氨基酸来说,由于羧基电由于羧基电离度略大于氨基电离度离度略大于氨基电离度,所以溶于水时所以溶于水时,其负离子数将多于正离子其负离子数将多于正离子数数,因而在纯水中显微酸性因而在纯水中显微酸性.第33页,讲稿共125张,创作于星期三CH2SCH2SHHCHNH2CHNH2COOHCOOHCH2CH2CHNH2C
17、HNH2COOHCOOHHHS S+CH2CH2S SCHNH2CHNH2COOHCOOHCH2CH2CHNH2CHNH2COOHCOOHS S+-2H-2H+2H+2H形成二硫键形成二硫键形成二硫键形成二硫键第34页,讲稿共125张,创作于星期三第三节第三节 肽肽一、肽键及肽链二、肽的命名及结构三、天然存在的活性寡肽第35页,讲稿共125张,创作于星期三 蛋白质的基本结构单位是氨基酸,由20 种氨基酸组成了各种各样的蛋白质。研究证明,蛋白质是由许多氨基酸按照一定的排列顺序通过肽键连接起来的生物大分子。第36页,讲稿共125张,创作于星期三 R1 R2 H2NCHCOOH H2NCHCOOH
18、R1 R2 H2NCHCOHN CH COOH肽键肽键二肽二肽 -H2O一、肽键及肽链 肽键(肽键(peptide bondpeptide bond)是)是蛋白质分子中氨基酸之间的蛋白质分子中氨基酸之间的主要连接方式,它是由一个氨基酸的主要连接方式,它是由一个氨基酸的-羧基与另一个氨基羧基与另一个氨基酸的酸的-氨基缩合脱水而形成的酰胺键。氨基缩合脱水而形成的酰胺键。第37页,讲稿共125张,创作于星期三 一个氨基酸的-羧基与另一个氨基酸的-氨基之间失去一分子水相互连接而成的化合物称为肽(peptide),由2 个氨基酸缩合形成的肽叫二肽(dipeptide),由3 个氨基酸缩合形成的肽叫三肽(
19、tripeptide),少于10 个氨基酸的肽称为寡肽(oligopeptide),由10个以上氨基酸形成的肽叫多肽(polypeptide)。第38页,讲稿共125张,创作于星期三二、肽的命名及结构 肽链中的氨基酸由于参加肽键的形成已经不是原来完整的分子,因此称为氨基酸残基(amino acidresidues)。肽的命名是从肽链的N-末端开始,按照氨基酸残基的顺序而逐一命名。氨基酸残基用酰来称呼,称为某氨基酰某氨基酰某氨基酸。例如,由丝氨酸、甘氨酸、酪氨酸、丙氨酸和亮氨酸组成的五肽就命名为丝氨酰甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸。第39页,讲稿共125张,创作于星期三 甘丙丝缬亮蛋赖赖精谷 Gly-
20、Ala-Ser-Val-Leu-Met-Lys-Lys-Arg-Glu G-A-S-V-L-M-K-K-R-E 在书写时,含自由氨基的一端总是写在左边,含自由羧基的一端总是写在右边。第40页,讲稿共125张,创作于星期三多肽链多肽链R1R2R3H2NCHCOHNCHCOHNCHCOOH多肽链中单位多肽链中单位氨基酸氨基酸残基;残基;多肽链有两端:多肽链有两端:氨基末端(端)氨基末端(端)羧基末端(端)羧基末端(端)多肽链的主链:多肽链的主链:侧链:各基团侧链:各基团第41页,讲稿共125张,创作于星期三第42页,讲稿共125张,创作于星期三第43页,讲稿共125张,创作于星期三谷胱甘肽的结构谷
21、胱甘肽的结构:SHCH2H2N-CH-CH2-CH2-CO-HN-CH-CO-HN-CH2-COOHCOOH-2H2G-SHG-S-S-G(还原型)(还原型)+2H 2H (氧化型)(氧化型)巯基三、天然存在的活性寡肽第44页,讲稿共125张,创作于星期三谷胱甘肽的功能谷胱甘肽的功能 GSH GSH可与氧化剂如可与氧化剂如H H2 2O O2 2起反应,从而保护起反应,从而保护一些含巯基的蛋白质或酶免遭氧化而丧一些含巯基的蛋白质或酶免遭氧化而丧失正常结构与功能。失正常结构与功能。如红细胞中的如红细胞中的GSHGSH可以保护细胞膜上含巯可以保护细胞膜上含巯基的蛋白质和酶,以维护膜的完整性和基的蛋
22、白质和酶,以维护膜的完整性和酶活性。酶活性。第45页,讲稿共125张,创作于星期三谷胱甘肽的功能谷胱甘肽的功能H2O22H2O2GSHGSSGNADP+NADPH+H+GSH过氧化物酶过氧化物酶GSH还原酶还原酶第46页,讲稿共125张,创作于星期三第四节 蛋白质的分子结构 蛋白质的结构可以分为四个层次来研究,即一级结构、二级结构、三级结构和四级结构。其中一级结构又称蛋白质的化学结构(chemical structure)、共价结构或初级结构。而二级结构、三级结构和四级结构又称为蛋白质的空间结构或三维结构(three dimensional structure)。第47页,讲稿共125张,创作
23、于星期三一、蛋白质的一级结构 所谓蛋白质的一级结构是指蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序以及二硫键的位置。一级结构是蛋白质分子结构的基础,它包含了决定蛋白质分子所有结构层次构象的全部信息。蛋白质一级结构研究的内容包括蛋白质的氨基酸组成、氨基酸排列顺序和二硫键的位置,肽链数目,末端氨基酸的种类等。一级结构是蛋白质的肽键维系的。第48页,讲稿共125张,创作于星期三第49页,讲稿共125张,创作于星期三 T Trypsin rypsin:R R1 1=赖氨酸赖氨酸LysLys和精氨酸和精氨酸ArgArg侧链侧链(专一性较强,水解(专一性较强,水解速度快)。速度快)。肽链水解位点水解位点胰胰蛋蛋白白酶酶
24、第50页,讲稿共125张,创作于星期三肽链水解位点水解位点糜糜蛋蛋白白酶酶 或或胰凝乳蛋白酶胰凝乳蛋白酶(C Chymotrypsinhymotrypsin):):R1=R1=苯丙氨酸苯丙氨酸Phe,Phe,色色氨酸氨酸Trp,Trp,酪氨酸酪氨酸Tyr;Tyr;亮氨酸亮氨酸LeuLeu,蛋氨酸蛋氨酸MetMet和组氨酸和组氨酸HisHis水解稍慢。水解稍慢。第51页,讲稿共125张,创作于星期三肽链水解位点水解位点 胃胃蛋蛋白白酶酶 P Pepsinepsin:R1R1和和R2R2R1=R1=苯丙氨酸苯丙氨酸Phe,Phe,色氨酸色氨酸Trp,Trp,酪氨酸酪氨酸Tyr;Tyr;亮亮氨酸氨酸
25、LeuLeu以及其它疏水以及其它疏水性氨基酸,水解速度性氨基酸,水解速度较快较快。第52页,讲稿共125张,创作于星期三二、蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构(secondary structure)是指蛋白质多肽链本身的折叠和盘绕的方式。研究证明,蛋白质的二级结构主要有-螺旋、-折叠和转角。氢键是稳定二级结构的主要作用力。第53页,讲稿共125张,创作于星期三(一)肽单位的构象 肽单位(peptide group)是多肽链中从一个-碳原子到相邻-碳原子之间的结构。第54页,讲稿共125张,创作于星期三 肽单位的构象具有三个显著的特征:1肽单位是一个刚性的平面结构 肽键中羰基碳原子与氮原子之间所
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