蛋白质合成分离精选PPT.ppt
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1、关于蛋白质合成分离第1页,讲稿共128张,创作于星期三l意义意义l解析蛋白质结构与功能的关系,为应用及人工解析蛋白质结构与功能的关系,为应用及人工合成蛋白质提供全面信息;合成蛋白质提供全面信息;l许多肽具有独特的生物学活性,是目前合成的主许多肽具有独特的生物学活性,是目前合成的主要物质;要物质;第2页,讲稿共128张,创作于星期三第一节第一节 肽合成肽合成合成肽的方法有三类合成肽的方法有三类第一类是由不同氨基酸按照一定顺序的控制合成;第一类是由不同氨基酸按照一定顺序的控制合成;第二类是由氨基酸自由共聚;第二类是由氨基酸自由共聚;第三类由酶催化在非水介质中合成。第三类由酶催化在非水介质中合成。第
2、3页,讲稿共128张,创作于星期三 第一类是目前合成肽的主要方法,该方法在合成前必第一类是目前合成肽的主要方法,该方法在合成前必须先将不参与形成肽键的活泼基团保护起来。例如,须先将不参与形成肽键的活泼基团保护起来。例如,羧基可用活性酯法(酰氯),氨基可以采用碳二亚胺羧基可用活性酯法(酰氯),氨基可以采用碳二亚胺法形成卞氧甲酰胺,合成后再将保护基水解下来。最法形成卞氧甲酰胺,合成后再将保护基水解下来。最后分离产物。后分离产物。第4页,讲稿共128张,创作于星期三第5页,讲稿共128张,创作于星期三第6页,讲稿共128张,创作于星期三第7页,讲稿共128张,创作于星期三l8080年代,开发出固相合
3、成技术。年代,开发出固相合成技术。l合成肽链时,在聚苯乙烯树脂小珠固相上进行。合成肽链时,在聚苯乙烯树脂小珠固相上进行。l待合成的第一个氨基酸的羧基先和氯甲基聚苯乙烯树脂反待合成的第一个氨基酸的羧基先和氯甲基聚苯乙烯树脂反应,共价地挂接在树脂上。应,共价地挂接在树脂上。l除去该氨基酸的除去该氨基酸的N-N-末端保护基末端保护基;第二个氨基酸(氨基第二个氨基酸(氨基被保护)以碳二亚胺为缩合剂,接到第一个氨基酸的氨被保护)以碳二亚胺为缩合剂,接到第一个氨基酸的氨基上;基上;除去除去第二个氨基酸的氨基保护基;第二个氨基酸的氨基保护基;l重复上述步骤,使肽链按控制顺序从重复上述步骤,使肽链按控制顺序从
4、C C端向端向N N端延长。端延长。合成一个十肽,花费合成一个十肽,花费2727小时,产率小时,产率85%85%。第8页,讲稿共128张,创作于星期三l肽链合成到最后一步时,把树脂悬浮在无水三氟肽链合成到最后一步时,把树脂悬浮在无水三氟 乙乙酸中,通入干燥的酸中,通入干燥的HBrHBr,使肽与树脂脱离,同时也切除,使肽与树脂脱离,同时也切除保护基团。保护基团。l现在多肽合成仪上进行,反应杯中的试剂按程序泵入现在多肽合成仪上进行,反应杯中的试剂按程序泵入和除去。和除去。第9页,讲稿共128张,创作于星期三第10页,讲稿共128张,创作于星期三第11页,讲稿共128张,创作于星期三l第二类实际上在
5、讲氨基酸成肽反应时已经讲过,从第二类实际上在讲氨基酸成肽反应时已经讲过,从理论上讲,该反应在工业上可以用来制备聚氨基酸,理论上讲,该反应在工业上可以用来制备聚氨基酸,但是该反应没有选择性。但是该反应没有选择性。l第三类是用酶合成,在水环境下,合成肽需要消耗能第三类是用酶合成,在水环境下,合成肽需要消耗能量(量(ATP);在非水条件下,蛋白酶等水解酶可转变);在非水条件下,蛋白酶等水解酶可转变成合成酶,将氨基酸合成肽。而且不需要消耗成合成酶,将氨基酸合成肽。而且不需要消耗ATP。该法优点是条件温和,步骤少,缺点是氨基酸或肽该法优点是条件温和,步骤少,缺点是氨基酸或肽的溶剂体系选择以及合成物的卸载
6、。的溶剂体系选择以及合成物的卸载。第12页,讲稿共128张,创作于星期三近近2525年来,生物催化剂在非水介质中催化反应以及应用的年来,生物催化剂在非水介质中催化反应以及应用的研究论文呈现爆炸性增长。研究论文呈现爆炸性增长。这里的生物催化剂主要指酶,非水介质包括微水有机溶剂体这里的生物催化剂主要指酶,非水介质包括微水有机溶剂体系;反胶束体系;水系;反胶束体系;水-水不互溶两相体系。水不互溶两相体系。在有机介质中,酶改变反应方向,例如水解酶变成合成酶;在有机介质中,酶改变反应方向,例如水解酶变成合成酶;刚性增加,对底物的专一性大大提高;热稳定性显著提高;刚性增加,对底物的专一性大大提高;热稳定性
7、显著提高;可重复使用;避免微生物污染;可对水敏感的底物进行催化。可重复使用;避免微生物污染;可对水敏感的底物进行催化。非水介质中生物催化简介非水介质中生物催化简介第13页,讲稿共128张,创作于星期三酶催化的反应酶催化的反应氧化还原酶氧化还原酶转移酶转移酶第14页,讲稿共128张,创作于星期三l水解酶水解酶裂合酶裂合酶异构酶异构酶合成酶合成酶第15页,讲稿共128张,创作于星期三酶分子在非水介质中主要以下列形式存在,即:酶分子在非水介质中主要以下列形式存在,即:固态固态-冻干粉或固定化酶或结晶酶;冻干粉或固定化酶或结晶酶;可溶解酶可溶解酶-水溶性大分子修饰酶;非共价修饰的高分子水溶性大分子修饰
8、酶;非共价修饰的高分子-酶复合物、表面活性剂酶复合物、表面活性剂-酶复合物、乳液酶等;酶复合物、乳液酶等;在非水介质中酶能保持整体结构的完整性;在非水介质中酶能保持整体结构的完整性;其活性部位的结构与在水溶液中相同;其活性部位的结构与在水溶液中相同;非水介质中酶的状态非水介质中酶的状态第16页,讲稿共128张,创作于星期三非水介质中的酶学性质非水介质中的酶学性质l非水介质中,酶分子内的氢键起主要作用,导非水介质中,酶分子内的氢键起主要作用,导致其致其刚性增加刚性增加,维持其活性中心的构象与,维持其活性中心的构象与在水介质中的一致。在水介质中的一致。第17页,讲稿共128张,创作于星期三在非水介
9、质中,酶与介质间的疏水相互作用平衡改变,在非水介质中,酶与介质间的疏水相互作用平衡改变,导致酶的专一性、催化性质等受到影响导致酶的专一性、催化性质等受到影响酶的稳定性提高,例如脂肪酶酶的稳定性提高,例如脂肪酶酶的特异性不变,但是对底物的催化效率会发生变化,酶的特异性不变,但是对底物的催化效率会发生变化,即催化效率增加了分配系数项即催化效率增加了分配系数项第18页,讲稿共128张,创作于星期三微量水的影响微量水的影响l是影响非水介质中酶活力及选择性的控制步骤是影响非水介质中酶活力及选择性的控制步骤l水的作用:调控酶构象水的作用:调控酶构象l微量水对酶发挥有效催化是必需的,水分子直接或微量水对酶发
10、挥有效催化是必需的,水分子直接或间接参与酶稳定构象的各种非共价作用,弱化荷电间接参与酶稳定构象的各种非共价作用,弱化荷电基团或极性基团间的相互作用,增加酶柔性及选择基团或极性基团间的相互作用,增加酶柔性及选择性性第19页,讲稿共128张,创作于星期三非水介质中酶结合水的位点及结合量非水介质中酶结合水的位点及结合量l离子化基团水化:与酶分子表面的荷电基团结合;结合量离子化基团水化:与酶分子表面的荷电基团结合;结合量0-0-0.07g/g0.07g/g酶酶l极性水族生长:与酶分子表面极性基团结合;结合量极性水族生长:与酶分子表面极性基团结合;结合量0.07-0.07-0.25g/g0.25g/g酶
11、酶l弱吸附:与酶表面弱极性区域结合;结合量弱吸附:与酶表面弱极性区域结合;结合量0.25-0.38g/g0.25-0.38g/g酶酶l完全水化:酶蛋白表面完全水化;结合量完全水化:酶蛋白表面完全水化;结合量0.38g/g0.38g/g酶酶第20页,讲稿共128张,创作于星期三第21页,讲稿共128张,创作于星期三非水介质中酶催化反应类型及应用非水介质中酶催化反应类型及应用l酶催化反应的类型酶催化反应的类型lC-OC-O键的形成,包括酯合成、环氧化、糖苷合成、加氧氧化键的形成,包括酯合成、环氧化、糖苷合成、加氧氧化lC-NC-N键的反应,包括肽的合成键的反应,包括肽的合成lC-CC-C键的形成,
12、包括羟醛、酮醛和羟醛转移、醛缩合、醛加成等键的形成,包括羟醛、酮醛和羟醛转移、醛缩合、醛加成等l还原反应还原反应l氧化反应,包括氧化反应,包括C-HC-H、C=CC=C氧化,醇氧化,酚氧化,羧酸氧化,氧化,醇氧化,酚氧化,羧酸氧化,C-NC-N氧化,氧化,异构化反应异构化反应l形成形成C-XC-X的反应的反应 (卤化反应)(卤化反应)l包括烯烃、炔烃、芳香族及含有活泼的包括烯烃、炔烃、芳香族及含有活泼的C-HC-H键的化合物的卤化。键的化合物的卤化。第22页,讲稿共128张,创作于星期三酶非水催化反应的应用酶非水催化反应的应用l制备光学活性化合物制备光学活性化合物 l合成旋光性高分子合成旋光性
13、高分子 l糖和类固醇的选择性催化糖和类固醇的选择性催化 l功能性高分子合成功能性高分子合成 l可生物降解高分子的酶促合成可生物降解高分子的酶促合成 第23页,讲稿共128张,创作于星期三合成肌肽及其类似物合成肌肽及其类似物l存在于动物肌肉中的肌肽是由存在于动物肌肉中的肌肽是由-丙氨酸与丙氨酸与L-L-组氨酸组组氨酸组成的二肽,具有抗氧化、清除自由基,成的二肽,具有抗氧化、清除自由基,pHpH缓冲等生理缓冲等生理功能。其最显著的性质是抗氧化,主要表现为捕获活功能。其最显著的性质是抗氧化,主要表现为捕获活性氧和自由基,螯合金属离子,结合脂肪酸氧化产物性氧和自由基,螯合金属离子,结合脂肪酸氧化产物-
14、醛,是迄今发现的最有效天然抗氧化、抗衰老二肽。醛,是迄今发现的最有效天然抗氧化、抗衰老二肽。第24页,讲稿共128张,创作于星期三肌肽及其类似物的结构式肌肽及其类似物的结构式第25页,讲稿共128张,创作于星期三正丁醇中合成肌肽正丁醇中合成肌肽4040、pH6.5pH6.5,转化率,转化率84.26%84.26%第26页,讲稿共128张,创作于星期三四氢呋喃中合成肌肽类似物四氢呋喃中合成肌肽类似物5050、pH8.5pH8.5,转化率,转化率 76.35%76.35%第27页,讲稿共128张,创作于星期三第28页,讲稿共128张,创作于星期三合成硬脂酰三乙醇铵单酯合成硬脂酰三乙醇铵单酯l硬脂酰
15、三乙醇胺盐酸盐是一种季铵化合物,在日化行硬脂酰三乙醇胺盐酸盐是一种季铵化合物,在日化行业主要用于洗发香波中,中和头发蛋白质的负电荷及业主要用于洗发香波中,中和头发蛋白质的负电荷及抗菌。抗菌。l该分子在头发上的附着力强,产生该分子在头发上的附着力强,产生飘逸飘逸效果,但无光效果,但无光亮。亮。l该物质目前采用酸催化剂在该物质目前采用酸催化剂在140140左右脱水合成左右脱水合成第29页,讲稿共128张,创作于星期三用脂肪酶在正己烷中合成,合成温度用脂肪酶在正己烷中合成,合成温度5555,转化率,转化率72.75%72.75%,酶可以反复使用多次。,酶可以反复使用多次。第30页,讲稿共128张,创
16、作于星期三合成羟基脯氨酸双酯l羟基脯氨酸(羟基脯氨酸(L-Hyp L-Hyp),修饰氨基酸,抗自由基、抗衰),修饰氨基酸,抗自由基、抗衰老,日化行业在功能性皮肤化妆品中使用。老,日化行业在功能性皮肤化妆品中使用。l脂脂/水平衡系数低,不能透过皮肤细胞膜。水平衡系数低,不能透过皮肤细胞膜。l目前采用两步法化学合成。单酯合成温度达目前采用两步法化学合成。单酯合成温度达120120,苯系,苯系物为带水剂,双酯的合成方法未见公开报道。由于其吡咯物为带水剂,双酯的合成方法未见公开报道。由于其吡咯环的干扰,预计合成温度将超过环的干扰,预计合成温度将超过160 160,伴随单酯键部,伴随单酯键部分水解。分水
17、解。第31页,讲稿共128张,创作于星期三合成羟基脯氨酸双酯合成羟基脯氨酸双酯无溶剂、脂肪酶、无溶剂、脂肪酶、6060、6-8h6-8h,转化率超过,转化率超过93%93%第32页,讲稿共128张,创作于星期三酯交换合成单酯酯交换合成单酯第33页,讲稿共128张,创作于星期三单酯酯化合成双酯单酯酯化合成双酯第34页,讲稿共128张,创作于星期三第二节第二节 蛋白质分子量测定蛋白质分子量测定最小分子量最小分子量最小分子量最小分子量l如血红蛋白含如血红蛋白含0.335%0.335%铁,其最低分子量铁,其最低分子量=16700=16700l渗透压法渗透压法l=RT=RT(c/M+Kcc/M+Kc2
18、2),l M=RT/lim M=RT/lim(c 0)(c 0)/C/C第35页,讲稿共128张,创作于星期三第36页,讲稿共128张,创作于星期三l凝胶过滤凝胶过滤lV Ve e/V/Vo o=a-blog M=a-blog M l式中,式中,V Ve e为洗脱液体积,为洗脱液体积,V Vo o为外水体积,为外水体积,M M为相对分子质量,为相对分子质量,a a,b b为常数。为常数。l移项得:移项得:log Mlog M=a/b-1/b=a/b-1/b(V Ve e/V/Vo o)l基于蛋白质主要呈球状,假设分子量相同,其分子体积及直径相基于蛋白质主要呈球状,假设分子量相同,其分子体积及直
19、径相同。先测几种标准蛋白质的同。先测几种标准蛋白质的V Ve e,以其相对分子质量的对数(,以其相对分子质量的对数(log Mlog M)对)对V Ve e作图,得一条直线。作图,得一条直线。l再测样品的再测样品的V Ve e,即可从图中查出其相对分子量,即可从图中查出其相对分子量。第37页,讲稿共128张,创作于星期三第38页,讲稿共128张,创作于星期三第39页,讲稿共128张,创作于星期三lSDSSDS聚丙烯酰胺聚丙烯酰胺凝胶电泳凝胶电泳这是以聚丙烯酰胺凝胶作为支持介质的电泳方法。基于被分离物质这是以聚丙烯酰胺凝胶作为支持介质的电泳方法。基于被分离物质的分子大小和电荷。的分子大小和电荷。
20、聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺和聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺和N N,N-N-甲叉双丙烯酰胺聚合而甲叉双丙烯酰胺聚合而成的大分子。成的大分子。第40页,讲稿共128张,创作于星期三聚丙烯酰胺凝胶是人工合成的高聚物,聚合前调节单体浓聚丙烯酰胺凝胶是人工合成的高聚物,聚合前调节单体浓度比,使之既有适宜的空隙度,又有较好的机械性质。度比,使之既有适宜的空隙度,又有较好的机械性质。第41页,讲稿共128张,创作于星期三丙烯酰胺单体和甲叉双丙烯酰胺交联剂在水溶液中通过丙烯酰胺单体和甲叉双丙烯酰胺交联剂在水溶液中通过自由基引发的聚合反应形成凝胶。自由基引发的聚合反应形成凝胶。聚合反应的催化剂包括引发剂和加速剂。
21、引发剂使丙烯酰聚合反应的催化剂包括引发剂和加速剂。引发剂使丙烯酰胺成为自由基,发动聚合反应,加速剂则加快引发剂释放胺成为自由基,发动聚合反应,加速剂则加快引发剂释放自由基的速度。自由基的速度。聚丙烯酰胺热稳定,无色透明,可肉眼观察或用检测仪聚丙烯酰胺热稳定,无色透明,可肉眼观察或用检测仪测定。测定。第42页,讲稿共128张,创作于星期三常用的引发剂和加速剂的配伍如下表:常用的引发剂和加速剂的配伍如下表:引引 发发 剂剂 加加 速速 剂剂(NHNH4 4)2 2S S2 2O O8 8 TEMED TEMED N N,N N,N N,N;N;四甲基乙二胺四甲基乙二胺(NH(NH4 4)2 2S
22、S2 2O O8 8DMAPNDMAPN二甲基胺基丙晴二甲基胺基丙晴核核 黄黄 素素 TEMEDTEMED第43页,讲稿共128张,创作于星期三用过硫酸铵引发的反应为用过硫酸铵引发的反应为化学化学聚合反应;聚合反应;用核黄素引发,需要强光照射反应液,为用核黄素引发,需要强光照射反应液,为光光聚合反应。聚合反应。聚丙烯酰胺聚合反应受下列因素影响:聚丙烯酰胺聚合反应受下列因素影响:1 1、大气中、大气中氧氧能淬灭自由基,使聚合反应终止(空气隔绝)。能淬灭自由基,使聚合反应终止(空气隔绝)。2 2、某些材料如有机玻璃,能抑制聚合反应(选择容器材质)。、某些材料如有机玻璃,能抑制聚合反应(选择容器材质
23、)。3 3、某些试剂可以减慢反应速度,如赤血盐(电位)。、某些试剂可以减慢反应速度,如赤血盐(电位)。4 4、温度高聚合快,温度低聚合慢(控温)。、温度高聚合快,温度低聚合慢(控温)。第44页,讲稿共128张,创作于星期三每每100mL100mL凝胶溶液中含有单体和交联剂的凝胶溶液中含有单体和交联剂的总质量数(总质量数(g g)称凝)称凝胶浓度,常用胶浓度,常用T%T%表达表达;凝胶中交联剂占单体或交联体质量;凝胶中交联剂占单体或交联体质量的百分数称为的百分数称为交联度交联度,常用,常用C%C%表示。表示。此外,聚丙烯酰胺凝胶还有分子筛效应。此外,聚丙烯酰胺凝胶还有分子筛效应。电泳迁移率与肽链
24、分子量的对数有如下关系:电泳迁移率与肽链分子量的对数有如下关系:log M=a-blog M=a-bR R 或或 log M=Klog M=K1 1-K-K2 2R R式中式中R R为为相对迁移率相对迁移率=样品迁移距离样品迁移距离/前沿(染料)迁移距前沿(染料)迁移距离,其余为常数。离,其余为常数。第45页,讲稿共128张,创作于星期三l测定时,以几种标准物蛋白质的测定时,以几种标准物蛋白质的M M的对数值对其的对数值对其R R值值作图,根据待测样品的作图,根据待测样品的R R,从标准曲线上查出它的从标准曲线上查出它的M M。含丙烯酰胺含丙烯酰胺7-7.5%7-7.5%的凝胶,适用于分离的凝
25、胶,适用于分离1 1万至万至100100万物质,万物质,1 1万以下的则采用万以下的则采用15-30%15-30%的凝胶,分子量特别大的采用含的凝胶,分子量特别大的采用含4%4%的凝胶。的凝胶。第46页,讲稿共128张,创作于星期三SDS-SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳十二烷基磺酸钠(十二烷基磺酸钠(SDSSDS)是一种有效的蛋白质变性剂,它能)是一种有效的蛋白质变性剂,它能破坏蛋白质的氢键和疏水作用。破坏蛋白质的氢键和疏水作用。SDSSDS与蛋白质结合使变性蛋白质带负电荷,覆盖于多肽链上,与蛋白质结合使变性蛋白质带负电荷,覆盖于多肽链上,数量远远超过蛋白质所带电荷。数量远远超过
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