蛋白质的裂解精选PPT.ppt
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1、关于蛋白质的裂解第1页,讲稿共47张,创作于星期三 用用用用EdmanEdman降解法测多肽链的氨基酸顺序,一次只能连续降解数十降解法测多肽链的氨基酸顺序,一次只能连续降解数十降解法测多肽链的氨基酸顺序,一次只能连续降解数十降解法测多肽链的氨基酸顺序,一次只能连续降解数十个残基,用手工方法最多测二十多个残基。然而,自然界蛋白质的个残基,用手工方法最多测二十多个残基。然而,自然界蛋白质的个残基,用手工方法最多测二十多个残基。然而,自然界蛋白质的个残基,用手工方法最多测二十多个残基。然而,自然界蛋白质的分子量通常在一万以上,因此在测多肽链顺序时,需将它们先裂解分子量通常在一万以上,因此在测多肽链顺
2、序时,需将它们先裂解分子量通常在一万以上,因此在测多肽链顺序时,需将它们先裂解分子量通常在一万以上,因此在测多肽链顺序时,需将它们先裂解成一系列小肽,分别测出它们的顺序,然后再找出它们的接头位置,成一系列小肽,分别测出它们的顺序,然后再找出它们的接头位置,成一系列小肽,分别测出它们的顺序,然后再找出它们的接头位置,成一系列小肽,分别测出它们的顺序,然后再找出它们的接头位置,才能定出该肽链的顺序。所以如何选择肽链裂解的切点,将对顺序才能定出该肽链的顺序。所以如何选择肽链裂解的切点,将对顺序才能定出该肽链的顺序。所以如何选择肽链裂解的切点,将对顺序才能定出该肽链的顺序。所以如何选择肽链裂解的切点,
3、将对顺序测定起着重要作用测定起着重要作用测定起着重要作用测定起着重要作用裂解条件要求:裂解条件要求:裂解条件要求:裂解条件要求:裂解点少裂解点少裂解点少裂解点少 专一性强专一性强专一性强专一性强 反应产率高反应产率高反应产率高反应产率高 裂解方法:裂解方法:裂解方法:裂解方法:酶法酶法酶法酶法 化学法化学法化学法化学法 酶解和化学裂解是顺序分析中互为补充缺一不可的手段酶解和化学裂解是顺序分析中互为补充缺一不可的手段酶解和化学裂解是顺序分析中互为补充缺一不可的手段酶解和化学裂解是顺序分析中互为补充缺一不可的手段一、一、一、一、引引引引 言言言言早期:早期:部分酸水解法裂解,由于专一性 低,裂解后
4、生成很多小肽,造成 分离纯化困难,工作量也很大。中期中期:生化学家改用蛋白酶酶解,因专 一性强,故被广泛地使用。后来:后来:随着自动顺序仪的广泛使用和对 大肽段的需求,发现某些化学试 剂对蛋白质的裂解有特异的优点。化学法再流行。第2页,讲稿共47张,创作于星期三()简述()简述()简述()简述 用特异性水解酶裂解肽链有许多优点:用特异性水解酶裂解肽链有许多优点:用特异性水解酶裂解肽链有许多优点:用特异性水解酶裂解肽链有许多优点:专一性强专一性强专一性强专一性强,降解后,降解后,降解后,降解后的的的的肽段容易纯化肽段容易纯化肽段容易纯化肽段容易纯化,产率较高产率较高产率较高产率较高,副反应少副反
5、应少副反应少副反应少,在酸水解中容易受破,在酸水解中容易受破,在酸水解中容易受破,在酸水解中容易受破坏的谷氨酰氨、天冬酰氨和色氨酸等在酶解中都不受影响。坏的谷氨酰氨、天冬酰氨和色氨酸等在酶解中都不受影响。坏的谷氨酰氨、天冬酰氨和色氨酸等在酶解中都不受影响。坏的谷氨酰氨、天冬酰氨和色氨酸等在酶解中都不受影响。整个酶解反应中,酶解条件的选择相当重要,需要考整个酶解反应中,酶解条件的选择相当重要,需要考整个酶解反应中,酶解条件的选择相当重要,需要考整个酶解反应中,酶解条件的选择相当重要,需要考虑下列因素:虑下列因素:虑下列因素:虑下列因素:(1 1)合适的合适的合适的合适的pHpH (2 2)适宜的
6、反应温度适宜的反应温度适宜的反应温度适宜的反应温度 (3 3)恰当的酶与底物的比率恰当的酶与底物的比率恰当的酶与底物的比率恰当的酶与底物的比率 (4 4)选择相应的反应时间选择相应的反应时间选择相应的反应时间选择相应的反应时间 二、蛋白质的酶裂解二、蛋白质的酶裂解二、蛋白质的酶裂解二、蛋白质的酶裂解第3页,讲稿共47张,创作于星期三第4页,讲稿共47张,创作于星期三 最常用的水解蛋白酶,专一性强最常用的水解蛋白酶,专一性强最常用的水解蛋白酶,专一性强最常用的水解蛋白酶,专一性强,只断裂赖氨酸和精只断裂赖氨酸和精只断裂赖氨酸和精只断裂赖氨酸和精氨酸的羧基所形成的肽键,用它裂解蛋白质常常可得到氨酸
7、的羧基所形成的肽键,用它裂解蛋白质常常可得到氨酸的羧基所形成的肽键,用它裂解蛋白质常常可得到氨酸的羧基所形成的肽键,用它裂解蛋白质常常可得到合适的肽段合适的肽段合适的肽段合适的肽段 商品胰蛋白酶中,常含有少量胰凝商品胰蛋白酶中,常含有少量胰凝商品胰蛋白酶中,常含有少量胰凝商品胰蛋白酶中,常含有少量胰凝乳蛋白酶,这样,在酶解时会产生不希乳蛋白酶,这样,在酶解时会产生不希乳蛋白酶,这样,在酶解时会产生不希乳蛋白酶,这样,在酶解时会产生不希望有的肽片段。因此,使用前需用望有的肽片段。因此,使用前需用望有的肽片段。因此,使用前需用望有的肽片段。因此,使用前需用L-L-1 1(对对对对-甲苯磺酰)苯丙氨
8、酰氯甲甲苯磺酰)苯丙氨酰氯甲甲苯磺酰)苯丙氨酰氯甲甲苯磺酰)苯丙氨酰氯甲酮(简称酮(简称酮(简称酮(简称TPCKTPCK)处理胰蛋白酶,处理胰蛋白酶,处理胰蛋白酶,处理胰蛋白酶,以抑制胰凝乳蛋白酶的活力。也可以抑制胰凝乳蛋白酶的活力。也可以抑制胰凝乳蛋白酶的活力。也可以抑制胰凝乳蛋白酶的活力。也可直接订购用直接订购用直接订购用直接订购用TPCKTPCK处理过的胰蛋白处理过的胰蛋白处理过的胰蛋白处理过的胰蛋白酶。酶。酶。酶。1 1、胰蛋白酶、胰蛋白酶、胰蛋白酶、胰蛋白酶第5页,讲稿共47张,创作于星期三 讨论:讨论:讨论:讨论:如果蛋白质分子量较大,或遇到碱性蛋白含有较多的赖氨酸和精氨酸如果蛋白
9、质分子量较大,或遇到碱性蛋白含有较多的赖氨酸和精氨酸如果蛋白质分子量较大,或遇到碱性蛋白含有较多的赖氨酸和精氨酸如果蛋白质分子量较大,或遇到碱性蛋白含有较多的赖氨酸和精氨酸残基时,则酶解后的肽段数就会很多,将给顺序测定带来很大麻烦。残基时,则酶解后的肽段数就会很多,将给顺序测定带来很大麻烦。残基时,则酶解后的肽段数就会很多,将给顺序测定带来很大麻烦。残基时,则酶解后的肽段数就会很多,将给顺序测定带来很大麻烦。方法:用柠康酸酐可逆保护赖氨酸的方法:用柠康酸酐可逆保护赖氨酸的方法:用柠康酸酐可逆保护赖氨酸的方法:用柠康酸酐可逆保护赖氨酸的-氨基,使胰蛋白酶酶解氨基,使胰蛋白酶酶解氨基,使胰蛋白酶酶
10、解氨基,使胰蛋白酶酶解时不会在赖氨酸羧端裂解,而只在精氨酸的羧端裂解,以后也很容时不会在赖氨酸羧端裂解,而只在精氨酸的羧端裂解,以后也很容时不会在赖氨酸羧端裂解,而只在精氨酸的羧端裂解,以后也很容时不会在赖氨酸羧端裂解,而只在精氨酸的羧端裂解,以后也很容易去掉保护基团。易去掉保护基团。易去掉保护基团。易去掉保护基团。-氨基保护剂第6页,讲稿共47张,创作于星期三第7页,讲稿共47张,创作于星期三 凝凝乳蛋白酶的前体是胰凝乳蛋白酶原,由凝凝乳蛋白酶的前体是胰凝乳蛋白酶原,由凝凝乳蛋白酶的前体是胰凝乳蛋白酶原,由凝凝乳蛋白酶的前体是胰凝乳蛋白酶原,由245245个氨基个氨基个氨基个氨基酸组成的单链
11、,有酸组成的单链,有酸组成的单链,有酸组成的单链,有5 5个二硫键。酶原本身没有水解活力,靠个二硫键。酶原本身没有水解活力,靠个二硫键。酶原本身没有水解活力,靠个二硫键。酶原本身没有水解活力,靠胰蛋白酶激活,在胰蛋白酶激活,在胰蛋白酶激活,在胰蛋白酶激活,在ArgArg1515-Ile-Ile1616 肽键处水解,形成肽键处水解,形成肽键处水解,形成肽键处水解,形成 -胰凝乳胰凝乳胰凝乳胰凝乳蛋白酶蛋白酶蛋白酶蛋白酶。而而而而-胰凝乳蛋白酶又反过来对本身起作用,酶解掉二个二肽胰凝乳蛋白酶又反过来对本身起作用,酶解掉二个二肽胰凝乳蛋白酶又反过来对本身起作用,酶解掉二个二肽胰凝乳蛋白酶又反过来对本
12、身起作用,酶解掉二个二肽 Ser Ser 1414-Arg-Arg1515 和和和和 ThrThr147147-Asn-Asn148148,生成具完全活力的生成具完全活力的生成具完全活力的生成具完全活力的 a a-胰凝胰凝胰凝胰凝乳蛋白酶乳蛋白酶乳蛋白酶乳蛋白酶。因此因此因此因此a a一胰凝乳蛋白酶由一胰凝乳蛋白酶由一胰凝乳蛋白酶由一胰凝乳蛋白酶由A A、B B、C C三条多肽链组成,三条多肽链组成,三条多肽链组成,三条多肽链组成,它们分别含有它们分别含有它们分别含有它们分别含有1313,130130,9696个氨基酸残基。个氨基酸残基。个氨基酸残基。个氨基酸残基。2 2、胰凝乳蛋白酶、胰凝乳
13、蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、胰凝乳蛋白酶第8页,讲稿共47张,创作于星期三 凝凝乳蛋白酶的专一性不如胰蛋白酶,凝凝乳蛋白酶的专一性不如胰蛋白酶,凝凝乳蛋白酶的专一性不如胰蛋白酶,凝凝乳蛋白酶的专一性不如胰蛋白酶,酶解酶解酶解酶解TyrTyr,PhePhe、TrpTrp、LenLen等疏水氨基酸等疏水氨基酸等疏水氨基酸等疏水氨基酸羧基羧基羧基羧基所形所形所形所形成的肽链,成的肽链,成的肽链,成的肽链,也能在也能在也能在也能在valval、IleIle、SerSer、GlyGly的的的的羧端羧端羧端羧端裂解,但较慢。裂解,但较慢。裂解,但较慢。裂解,但较慢。如果被裂解的邻近基团是碱性的(如如果被裂解的邻
14、近基团是碱性的(如如果被裂解的邻近基团是碱性的(如如果被裂解的邻近基团是碱性的(如LysLys、ArgArg或或或或HisHis),),),),裂裂裂裂解能力将增加。倘若邻近是解能力将增加。倘若邻近是解能力将增加。倘若邻近是解能力将增加。倘若邻近是ProPro或或或或PheProPhePro,则不能酶解。则不能酶解。则不能酶解。则不能酶解。在酶解中,增加酶的比例(对底物)能提高酶在酶解中,增加酶的比例(对底物)能提高酶在酶解中,增加酶的比例(对底物)能提高酶在酶解中,增加酶的比例(对底物)能提高酶解能力,这时,甚至象解能力,这时,甚至象解能力,这时,甚至象解能力,这时,甚至象Ala-valAl
15、a-val键也能酶解。键也能酶解。键也能酶解。键也能酶解。凝凝乳蛋白酶凝凝乳蛋白酶凝凝乳蛋白酶凝凝乳蛋白酶第9页,讲稿共47张,创作于星期三 专一性与胰凝乳蛋白酶类似专一性与胰凝乳蛋白酶类似专一性与胰凝乳蛋白酶类似专一性与胰凝乳蛋白酶类似 适宜酶解适宜酶解适宜酶解适宜酶解pHpH值是值是值是值是2 2 在顺序测定中很有价值,因为在确定二硫键的位置时,在这样在顺序测定中很有价值,因为在确定二硫键的位置时,在这样在顺序测定中很有价值,因为在确定二硫键的位置时,在这样在顺序测定中很有价值,因为在确定二硫键的位置时,在这样的酸性环境下二硫键比较稳定,很少有二硫键的互换反应。反应条的酸性环境下二硫键比较
16、稳定,很少有二硫键的互换反应。反应条的酸性环境下二硫键比较稳定,很少有二硫键的互换反应。反应条的酸性环境下二硫键比较稳定,很少有二硫键的互换反应。反应条件选择恰当,可以变低特异性为高特异性。件选择恰当,可以变低特异性为高特异性。件选择恰当,可以变低特异性为高特异性。件选择恰当,可以变低特异性为高特异性。在在在在pH2.5pH2.5的水溶液中,用胃蛋白酶酶解胰岛素于的水溶液中,用胃蛋白酶酶解胰岛素于的水溶液中,用胃蛋白酶酶解胰岛素于的水溶液中,用胃蛋白酶酶解胰岛素于3 3冰水浴恒温反应冰水浴恒温反应冰水浴恒温反应冰水浴恒温反应1.51.5h h,此后用此后用此后用此后用lN NaOHlN NaO
17、H调调调调pH=9pH=9以终止反应。结果用以终止反应。结果用以终止反应。结果用以终止反应。结果用Scphadex G-50Scphadex G-50柱(柱(柱(柱(3.013.0110cm10cm)分离得到了很纯的去分离得到了很纯的去分离得到了很纯的去分离得到了很纯的去B B链羧端五肽胰岛素,说明胃蛋链羧端五肽胰岛素,说明胃蛋链羧端五肽胰岛素,说明胃蛋链羧端五肽胰岛素,说明胃蛋白酶在酶解中只降解胰岛素白酶在酶解中只降解胰岛素白酶在酶解中只降解胰岛素白酶在酶解中只降解胰岛素B B链中第链中第链中第链中第2525位苯丙氨酸的位苯丙氨酸的位苯丙氨酸的位苯丙氨酸的羧基所形成的肽键(羧基所形成的肽键(
18、羧基所形成的肽键(羧基所形成的肽键(Phc25-THR26-Thr27-Pro28Phc25-THR26-Thr27-Pro28LyS29-aLA30LyS29-aLA30)3 3胃蛋白酶胃蛋白酶胃蛋白酶胃蛋白酶第10页,讲稿共47张,创作于星期三 含金属的酶,锌原子和钙原子,锌是活力所必需的,钙使含金属的酶,锌原子和钙原子,锌是活力所必需的,钙使含金属的酶,锌原子和钙原子,锌是活力所必需的,钙使含金属的酶,锌原子和钙原子,锌是活力所必需的,钙使酶在高温下稳定,该酶易被酶在高温下稳定,该酶易被酶在高温下稳定,该酶易被酶在高温下稳定,该酶易被EDTAEDTA所抑制。所抑制。所抑制。所抑制。专一性
19、比上面三种酶都差,用来直接酶解蛋白质不太专一性比上面三种酶都差,用来直接酶解蛋白质不太专一性比上面三种酶都差,用来直接酶解蛋白质不太专一性比上面三种酶都差,用来直接酶解蛋白质不太合适,因为产生的肽段相对较多,不仅纯化起来麻烦,而合适,因为产生的肽段相对较多,不仅纯化起来麻烦,而合适,因为产生的肽段相对较多,不仅纯化起来麻烦,而合适,因为产生的肽段相对较多,不仅纯化起来麻烦,而且对以后的顺序重排也不利。如用它来裂解次级肽,即先且对以后的顺序重排也不利。如用它来裂解次级肽,即先且对以后的顺序重排也不利。如用它来裂解次级肽,即先且对以后的顺序重排也不利。如用它来裂解次级肽,即先用专一性较强的酶或化学
20、试剂把蛋白质多肽链降解成大肽用专一性较强的酶或化学试剂把蛋白质多肽链降解成大肽用专一性较强的酶或化学试剂把蛋白质多肽链降解成大肽用专一性较强的酶或化学试剂把蛋白质多肽链降解成大肽段,再切成小肽段时,嗜热菌蛋白酶可发挥很好的作用。段,再切成小肽段时,嗜热菌蛋白酶可发挥很好的作用。段,再切成小肽段时,嗜热菌蛋白酶可发挥很好的作用。段,再切成小肽段时,嗜热菌蛋白酶可发挥很好的作用。胰凝乳蛋白酶、胃蛋白酶和嗜热菌蛋白酶有一个共同胰凝乳蛋白酶、胃蛋白酶和嗜热菌蛋白酶有一个共同胰凝乳蛋白酶、胃蛋白酶和嗜热菌蛋白酶有一个共同胰凝乳蛋白酶、胃蛋白酶和嗜热菌蛋白酶有一个共同的特点,即它们的作用范为比较宽,并且主
21、要裂解中性氨的特点,即它们的作用范为比较宽,并且主要裂解中性氨的特点,即它们的作用范为比较宽,并且主要裂解中性氨的特点,即它们的作用范为比较宽,并且主要裂解中性氨基酸残基。基酸残基。基酸残基。基酸残基。4.4.嗜热菌蛋白酶嗜热菌蛋白酶嗜热菌蛋白酶嗜热菌蛋白酶第11页,讲稿共47张,创作于星期三(三)几种高特异性的肽链内切酶(三)几种高特异性的肽链内切酶(三)几种高特异性的肽链内切酶(三)几种高特异性的肽链内切酶 在蛋白质顺序测定中,对较大分子量的蛋白质采用逐级特异在蛋白质顺序测定中,对较大分子量的蛋白质采用逐级特异在蛋白质顺序测定中,对较大分子量的蛋白质采用逐级特异在蛋白质顺序测定中,对较大分
22、子量的蛋白质采用逐级特异性裂解是比较理想的。性裂解是比较理想的。性裂解是比较理想的。性裂解是比较理想的。第12页,讲稿共47张,创作于星期三 Glu蛋白酶蛋白酶 GluGlu蛋白酶亦称金黄色葡萄球菌蛋白酶,是从金黄色蛋白酶亦称金黄色葡萄球菌蛋白酶,是从金黄色蛋白酶亦称金黄色葡萄球菌蛋白酶,是从金黄色蛋白酶亦称金黄色葡萄球菌蛋白酶,是从金黄色葡萄球菌菌株葡萄球菌菌株葡萄球菌菌株葡萄球菌菌株V8V8中分离得到的,是最有效、应用最广泛中分离得到的,是最有效、应用最广泛中分离得到的,是最有效、应用最广泛中分离得到的,是最有效、应用最广泛的一个酶,分子量只有的一个酶,分子量只有的一个酶,分子量只有的一个
23、酶,分子量只有12,00012,000。当酶解在磷酸缓冲液(当酶解在磷酸缓冲液(当酶解在磷酸缓冲液(当酶解在磷酸缓冲液(pH7.8pH7.8)中进行时,它能在中进行时,它能在中进行时,它能在中进行时,它能在谷氨酸谷氨酸谷氨酸谷氨酸和天冬氨酸残基的羧端和天冬氨酸残基的羧端和天冬氨酸残基的羧端和天冬氨酸残基的羧端处裂解肽键。处裂解肽键。处裂解肽键。处裂解肽键。用碳酸氢铵(用碳酸氢铵(用碳酸氢铵(用碳酸氢铵(pH7.8pH7.8)或醋酸胺(或醋酸胺(或醋酸胺(或醋酸胺(pH4.0pH4.0)时,则仅在时,则仅在时,则仅在时,则仅在谷氨酸的羧端谷氨酸的羧端谷氨酸的羧端谷氨酸的羧端处裂解。处裂解。处裂解
24、。处裂解。该酶对下列蛋白质该酶对下列蛋白质该酶对下列蛋白质该酶对下列蛋白质只在谷氨酸的羧端只在谷氨酸的羧端只在谷氨酸的羧端只在谷氨酸的羧端处裂解:核糖处裂解:核糖处裂解:核糖处裂解:核糖体蛋白体蛋白体蛋白体蛋白S7S7,L23L23,EL12EL12,维生素维生素维生素维生素A1A1结合蛋白结合蛋白结合蛋白结合蛋白,钙结合蛋钙结合蛋钙结合蛋钙结合蛋白白白白,a1llla1lll胶原蛋白胶原蛋白胶原蛋白胶原蛋白,22小球蛋白。小球蛋白。小球蛋白。小球蛋白。第13页,讲稿共47张,创作于星期三 Arg Arg 蛋白酶蛋白酶蛋白酶蛋白酶 (1 1)Chostripain Chostripain 酶酶
25、酶酶 专一性裂解精氨酸羧端的蛋白酶专一性裂解精氨酸羧端的蛋白酶专一性裂解精氨酸羧端的蛋白酶专一性裂解精氨酸羧端的蛋白酶。专一性很高;肽链的羧端是精氨酸;该酶在专一性很高;肽链的羧端是精氨酸;该酶在专一性很高;肽链的羧端是精氨酸;该酶在专一性很高;肽链的羧端是精氨酸;该酶在6 6molmol l l尿素尿素尿素尿素2020小时内仍保持活力,这样对不溶性蛋白质小时内仍保持活力,这样对不溶性蛋白质小时内仍保持活力,这样对不溶性蛋白质小时内仍保持活力,这样对不溶性蛋白质 的长时间裂解就很有效。的长时间裂解就很有效。的长时间裂解就很有效。的长时间裂解就很有效。(2 2)凝血酶(凝血酶(凝血酶(凝血酶(t
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