第02章酶学基础知识t.ppt
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1、第02章酶学基础知识t现在学习的是第1页,共52页第二章第二章 酶学基础知识酶学基础知识n第一节酶的分类与命名n第二节酶(蛋白类酶)的结构与功能现在学习的是第2页,共52页第一节第一节酶的分类与命名酶的分类与命名n大肠杆菌细胞中,大肠杆菌细胞中,30003000种酶种酶n高等真核生物细胞中,高等真核生物细胞中,50005000种酶种酶n国际酶学委员会已知的酶见表国际酶学委员会已知的酶见表1 1:现在学习的是第3页,共52页表1 已知酶历年增长统计n资料来源与年份已知酶数量资料来源与年份已知酶数量nReport of the Enzyme Commission(1961)712Report of
2、 the Enzyme Commission(1961)712nEnzyme Nomenclature(1964)874Enzyme Nomenclature(1964)874nEnzyme Nomenclature(1972)1770Enzyme Nomenclature(1972)1770nEnzyme Nomenclature(1978)2122Enzyme Nomenclature(1978)2122nSupplements 1-4 2252Supplements 1-4 2252nEnzyme Nomenclature(1984)2477Enzyme Nomenclature(198
3、4)2477nSupplements 1-3(Eur.J.Biochem.)(1990)2966Supplements 1-3(Eur.J.Biochem.)(1990)2966nEnzyme Nomenclature(1992)3169Enzyme Nomenclature(1992)3169nSupplements 1-4(Eur.J.Biochem.)(1997)3702Supplements 1-4(Eur.J.Biochem.)(1997)3702现在学习的是第4页,共52页酶的分类命名原则n分类命名方法:分类命名方法:n对于蛋白类酶现在普遍接受的是对于蛋白类酶现在普遍接受的是国际酶
4、学国际酶学委员会委员会19611961年年制定的酶分类与命名法。制定的酶分类与命名法。n对于核酸类酶由于其研究历史不长,对于对于核酸类酶由于其研究历史不长,对于分类和命名还没有统一的原则和规定。分类和命名还没有统一的原则和规定。现在学习的是第5页,共52页蛋白类酶与核酸类酶n按照分子中起催化作用的按照分子中起催化作用的主要组分主要组分不同,不同,酶可以分为蛋白类酶(酶可以分为蛋白类酶(proteozyme,P酶)酶)和核酸类酶(和核酸类酶(ribozyme,R酶,核酶)两大酶,核酶)两大类。类。n两者的两者的显著区别显著区别之一是蛋白类酶只能催化其之一是蛋白类酶只能催化其他分子进行反应,而核酸
5、类酶却可以催化酶他分子进行反应,而核酸类酶却可以催化酶分子本身也可以催化其他分子进行反应。分子本身也可以催化其他分子进行反应。现在学习的是第6页,共52页一、蛋白类酶(P酶)的分类n(1)氧化还原酶类n(2)转移酶类n(3)水解酶类n(4)裂合酶类n(5)异构酶类n(6)连接或合成酶类1961年国际酶学委员会(Enzyme Committee,EC)根据酶所催化的反应类型和机理,把酶分成6大类:现在学习的是第7页,共52页(1 1)氧化还原酶类氧化还原酶类n催化氧化-还原反应。n供体:受体氧化还原酶n主要包括脱氢酶(dehydrogenase)和还原(氧化)酶(Oxidase)。n例如,乳酸(
6、Lactate)脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。现在学习的是第8页,共52页(2 2)转移酶类转移酶催化转移酶催化基团转移基团转移反应,即将一个底物分反应,即将一个底物分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。供体:受体供体:受体某基团转移酶某基团转移酶例如,例如,谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。现在学习的是第9页,共52页(3 3)水解酶类水解酶类n水解酶催化底物的加水分解反应。n底物名称 反应集团位置 水解酶n主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。n例如,脂肪酶(Lipase)催化的脂的水解反应。现在学习的是第10页,共52页
7、(4 4)裂合酶类裂合酶类n裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或原子形成双键的反应及其逆反应。n底物 裂解基团 裂合酶n主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。n例如,延胡索酸水合酶催化的反应。现在学习的是第11页,共52页(5 5)异构酶类异构酶类n催化各种同分异构体的相互转变。即底物分子内基团或原子的重排过程。n按异构化类型分为6个亚类,异构、消旋、变位、表异构、顺反异构n底物名称 亚类 酶n例如,6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。现在学习的是第12页,共52页(6 6)合成酶类n合成酶,又称为连接酶,能够催化C-C、C-O、C-N 以及C-S 键的形成反应。这类反应必须与ATP分解反应相互偶联。
8、nA+B+ATP=AB+ADP+Pi n底物:底物 连接酶 n例如,谷氨酰胺合成酶催化的反应。L谷氨酸+氨+ATP=L谷氨酰胺+ADP+Pi 现在学习的是第13页,共52页蛋白类酶的系统名蛋白类酶的系统名、惯用名惯用名系统名系统名:包括所有底物的名称和反应类型。乳酸+NAD+丙酮酸+NADH+H+乳酸:乳酸:NAD+氧化还原酶氧化还原酶惯用名惯用名:只取一个较重要的底物名称和反应类型。乳酸:乳酸:NAD+氧化还原酶氧化还原酶乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶对于催化水解反应的酶一般在酶的名称上省去反应类型。现在学习的是第14页,共52页EC.X.X.X.X乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶 EC 1.1.1.27第1大类
9、,氧化还原酶第1亚类,氧化基团CHOH第1亚亚类,H受体为NAD+该酶在亚亚类中的流水编号蛋白酶的系统编号蛋白酶的系统编号现在学习的是第15页,共52页编号系统命名习惯命名催化的反应EC.1.1.1.27乳酸:NAD+氧化还原酶乳酸脱氢酶乳酸+NAD+丙酮酸+NADHEC2.6.1.1L-天冬氨酸:a-酮戊二酸氨基转移酶天冬氨酸氨基转移酶L-天冬氨酸+-酮戊二酸草酰乙酸+L-谷氨酸EC3.1.3.9D-葡萄糖-6-磷酸磷酸水解酶葡萄糖-6-磷酸酶D-葡萄糖-6-磷酸+H2O 葡萄糖+H3PO4EC4.1.2.13D-果糖-1,6-二磷酸:D-甘油醛-3-磷酸裂合酶醛缩酶D-果糖-1,6-二磷酸
10、 磷酸二羟丙酮+D-甘油醛-3-磷酸EC3.1.3.9D-葡萄糖-6-磷酸酮醇异构酶磷酸己糖异构酶D-葡萄糖-6-磷酸 D-果糖-6-磷酸EC6.3.1.2L-谷氨酸:氨连接酶谷氨酰胺合成酶ATP+L-谷氨酸+NH3 L-谷氨酰胺+ADP+H3PO4现在学习的是第16页,共52页三、其他习惯归类命名法n单体酶和寡聚酶单体酶和寡聚酶n单纯酶和结合酶单纯酶和结合酶n恒态酶和调节酶恒态酶和调节酶n胞内酶、胞外酶胞内酶、胞外酶现在学习的是第17页,共52页1.单体酶和寡聚酶单体酶和寡聚酶n根根据据酶酶蛋蛋白白质质组组成成特特点点可可将将已已知知酶酶分分为为单单体体酶酶和寡聚酶。和寡聚酶。n(1)单体酶
11、n单单体体酶酶仅仅由由单单条条肽肽链链组组成成,相相对对分分子子质质量量1300035000,不不能能再再解解离离成成更更小小的的组组成成单单位位。其其中中许许多多是是催催化化水水解解反反应应的的酶酶,一一般般不不需需辅助辅助因子。因子。n在在单单体体酶酶中中有有一一些些是是蛋蛋白白水水解解酶酶,它它们们多多以以无无活活性性的的酶酶原原形形式式合合成成,在在需需要要时时再再水水解解除除去去部部分肽链转变为有活性的酶。分肽链转变为有活性的酶。现在学习的是第18页,共52页(2 2)寡聚酶寡聚酶n已已知知的的酶酶绝绝大大多多数数是是寡寡聚聚酶酶,由由相相同同或或者者不不同同的的亚亚基基组组成成,它
12、它们们包包含含两两条条或或多多条条肽肽链链,相相对对分分子子质质量量通通常常超超过过35000。例例如如,糖糖酵酵解解有有关关的的酶酶都都是是包包含含24个个亚亚基基的的寡寡聚聚酶酶。在在寡寡聚聚酶酶中中有有许许多多是是代代谢谢途途径径中中的的关关键键酶酶,它它们们的的活活性性可可通通过过多多种种方方式式,特特别别是是通通过过别别构机制构机制进行进行调节调节。现在学习的是第19页,共52页2.单纯酶和结合酶单纯酶和结合酶n从从酶酶的的成成分分组组成成上上看看,可可将将酶酶分分为为单单成成分分酶酶和和双双成成分分酶酶两两种种。或或称为称为单纯酶单纯酶和和结合酶结合酶。n单单成成分分酶酶(单单纯纯
13、酶酶)在在催催化化过过程程中中不不需需要要辅辅酶酶,除除了了蛋蛋白白质质外外不不含含其其他他成成分分。如如:水水解解酶酶类类的的胃胃蛋蛋白白酶酶、胰胰蛋蛋白白酶酶、脲脲酶酶、核酸酶等。核酸酶等。n双双成成分分酶酶(结结合合酶酶):又又称称全全酶酶,在在催催化化反反应应中中需需要要有有辅辅助助因因子子,由由蛋蛋白白和和非非蛋蛋白白两两部部分分组组成成。其其中中非非蛋蛋白白部部分分称称为为辅辅助助因因子子,单单纯纯的的辅辅助助因因子子不不呈呈现现酶酶活活力力,只只有有两两者者结结合合在在一一起起形形成成全全酶酶才才显显示活力示活力。如氧化还原酶类、转移酶类中的许多酶。如氧化还原酶类、转移酶类中的许
14、多酶。n 全酶酶蛋白辅助因子全酶酶蛋白辅助因子现在学习的是第20页,共52页3.恒态酶和调节酶恒态酶和调节酶n根根据据酶酶在在代代谢谢中中所所处处的的地地位位、含含量量与与活活性性情情况况,也可以分成恒态酶与调节酶。也可以分成恒态酶与调节酶。n恒恒态态酶酶是是构构成成代代谢谢途途径径和和物物质质转转化化体体系系的的基基本本组组成成成成分分,在在细细胞胞中中恒恒态态酶酶的的含含量量相相对对恒恒定定,其其活活性性仅仅受受反反应应动动力力学学系系统统本本身身的的组组成成因因素素调调节。节。n调调节节酶酶是是指指在在代代谢谢途途径径和和物物质质转转化化体体系系中中起起调调节节作作用用的的关关键键酶酶,
15、它它们们的的含含量量与与活活性性常常因因机机体体的的机机能能状状况况而而不不同同。按按照照其其活活性性调调节节方方式式又又可可分为三种类型分为三种类型:潜态酶,别构酶和多功能酶潜态酶,别构酶和多功能酶。现在学习的是第21页,共52页(1 1)潜态酶潜态酶n潜态酶潜态酶是指那些通常以无活性的酶原状态存是指那些通常以无活性的酶原状态存在,而在机能需要时再转变为活性状态的酶。在,而在机能需要时再转变为活性状态的酶。这种激活调节一般以级联催化方式进行。包这种激活调节一般以级联催化方式进行。包括两种类型:一是括两种类型:一是不可逆的共价调节不可逆的共价调节,即所,即所谓的谓的酶原激活酶原激活。除了前述的
16、消化性蛋白水解。除了前述的消化性蛋白水解酶外,也包括那些具有生理功能的蛋白酶,酶外,也包括那些具有生理功能的蛋白酶,例如例如凝血酶、溶血纤蛋白酶凝血酶、溶血纤蛋白酶等都是通过这种等都是通过这种方式调节的;二是方式调节的;二是可逆共价调节可逆共价调节。现在学习的是第22页,共52页(2 2)别构酶别构酶n别构酶,这些酶别构酶,这些酶在结构上除了具在结构上除了具有能和底物相结有能和底物相结合、并催化底物合、并催化底物进行反应的活性进行反应的活性中心外,还具有中心外,还具有能和效应物相结能和效应物相结合的合的调节中心调节中心。现在学习的是第23页,共52页(3)多功能酶n多多功功能能酶酶指指具具有有
17、一一种种以以上上催催化化活活性性的的酶酶,他他们们有有的的是是由由不不同同亚亚基基组组成成,还还有有一一些些别构酶别构酶也是多功能酶。也是多功能酶。现在学习的是第24页,共52页4.胞内酶、胞外酶胞内酶、胞外酶n生生物物合合成成的的酶酶有有两两种种类类型型:存存在在于于胞胞内内或转位通过细胞质膜到胞外。或转位通过细胞质膜到胞外。现在学习的是第25页,共52页(1 1)胞内酶胞内酶n胞胞内内酶酶是是指指在在合合成成后后仍仍留留在在细细胞胞内内发发挥挥作作用用的的酶。酶。n酶酶在在细细胞胞内内存存在在部部位位是是不不同同的的,有有些些酶酶是是“可可溶溶的的”,并并不不直直接接与与细细胞胞中中任任何
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