蛋白质的生物合成 (12)讲稿.ppt
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1、关于蛋白质的生物合成(12)第一页,讲稿共一百二十四页哦第一节第一节mRNAmRNA的概念首先是由的概念首先是由F.Jacob和和J.Monod1965年提出来的。年提出来的。mRNA的的半半衰衰期期很很短短,很很不不稳稳定定,一一旦旦完完成成其其使使命命后后很很快快就就被被水水解掉。解掉。第二页,讲稿共一百二十四页哦一、一、原核生物原核生物mRNA的结构的结构15端端SD序列序列在在起起始始密密码码子子AUG上上游游9-13个个核核苷苷酸酸处处,有有一一段段可可与与核核糖糖体体16SrRNA配配对对结结合合的的、富富含含嘌嘌呤呤的的3-9个个核核苷苷酸酸的的共共同同序序列列,一一般般为为AG
2、GA,此序列称,此序列称SD序列。序列。它它与与核核糖糖体体小小亚亚基基内内16SrRNA的的3端端一一段段富富含含嘧嘧啶啶的的序序列列GAUCACCUCCUUA-OH互互补补,使使得得结结合合于于30S亚亚基基上上的的起起始始tRNA能能正正确确地地定定位于位于mRNA的起始密码子的起始密码子AUG。第三页,讲稿共一百二十四页哦第四页,讲稿共一百二十四页哦2.许许多多原原核核生生物物mRNA是是多多顺顺反反子子,也也有有单单顺顺反反子。子。转转译译时时,各各个个基基因因都都有有自自己己的的SD序序列列、起起始始密密码码子子、终终止止密密码码子子,分分别别控控制制其其合合成成的的起起始始与与终
3、终止止,也也就就是是说说,每每个个基基因的翻译都是相对独立的。因的翻译都是相对独立的。如如E.coli,一个,一个7000bp的的mRNA编码编码5种与种与Trp合成有关的酶合成有关的酶第五页,讲稿共一百二十四页哦二、二、真核生物真核生物mRNA的结构的结构1.真真核核mRNA5端端具具有有m7GpppN帽帽子子结结构构,无无SD序列。序列。帽帽子子结结构构具具有有增增强强翻翻译译效效率率的的作作用用。若若起起始始AUG与与帽帽子子结结构构间间的的距距离离太太近近(小小于于12个个核核苷苷酸酸),就就不不能能有有效效利利用用这这个个AUG,会会从从下下游游适适当当的的AUG起起始始翻翻译译。当
4、当距距离离在在17-80个个核核苷酸之间时,翻译效率与距离成正比。苷酸之间时,翻译效率与距离成正比。第六页,讲稿共一百二十四页哦2.真核生物真核生物mRNA通常是单顺反子。通常是单顺反子。真真核核mRNA具具有有“第第一一AUG规规律律”,即即当当5端端具具有有数数个个AUG时时,其其中中只只有有一一个个AUG为为主主要要开开放放阅阅读读框框架架的的翻翻译译起起点点。起起始始AUG具具有有二二个特点:个特点:(1)AUG上游的上游的-3经常是嘌呤,尤其是经常是嘌呤,尤其是A。(2)紧跟)紧跟AUG的的+4常常是常常是G。起起始始AUG邻邻近近序序列列中中,以以ANNAUGGN的的频频率率最最高
5、高。若若-3不不是是A,则则+4必必须须是是G。无无此此规规律律的的AUG,则无起始功能。,则无起始功能。第七页,讲稿共一百二十四页哦第二节第二节遗传密码遗传密码mRNA上上每每3个个连连续续的的碱碱基基或或核核苷苷酸酸编编码码1个个氨氨基酸基酸,称为三联体密码或密码子。称为三联体密码或密码子。第八页,讲稿共一百二十四页哦一、一、遗传密码的破译遗传密码的破译美国科学家美国科学家M.W.Nirenberg等等,1968年获诺贝尔生理医学奖年获诺贝尔生理医学奖.1961年年,M.W.Nirenberg等等人人,大大肠肠杆杆菌菌的的无无细细胞胞体体系系中中外外加加poly(U)模模板板、20种种标标
6、记记的的氨氨基基酸酸,经经保保温温后后得得到到了了多多聚聚phe-phe-phe,于于是是推推测测UUU编编码码phe。利利用用同同样样的的方方法法得得到到CCC编码编码pro,GGG编码编码gly,AAA编码编码lys。如如果果利利用用poly(UC),则则得得到到多多聚聚Ser-Leu-Ser-Leu,推推测测UCU编码编码Ser,CUC编码编码Leu.到到1965年年就就全全部部破破译译了了64组组密密码码子子。遗遗传传密密码码字字典典见见p615表表212,王镜岩,王镜岩p511表表375。第九页,讲稿共一百二十四页哦二、二、遗传密码的特点遗传密码的特点64个个密密码码子子中中有有61
7、个个编编码码氨氨基基酸酸,3个个不不编编码码任任何何氨氨基基酸酸而而起起肽肽链链合合成成的的终终止止作作用用,称称为为终终止止密密码码子子,它它们们是是UAG、UAA、UGA,密密码码子子AUG(编码(编码Met)又称起始密码子。)又称起始密码子。密密码码子子:mRNA上上由由三三个个相相邻邻的的三三个个核核苷苷酸酸或或碱碱基基组组成成一一个个密密码码子子,代代表表肽肽链链合合成成中中的的某某种种氨基酸或合成的起始与终止信号。氨基酸或合成的起始与终止信号。第十页,讲稿共一百二十四页哦1.方向性:从方向性:从mRNA的的5到到32.连读性连读性编编码码一一个个肽肽链链的的所所有有密密码码子子是是
8、一一个个接接着着一一个个地地线线形形排排列列,密密码码子子之之间间既既不不重重叠叠也也不不间间隔隔,从从起起始始密密码码子子到到终终止止密密码码子子(不不包包括括终终止止子子)构构成成一一个个完完整整的的读读码码框框架架,又又称称开开放放阅读框架(阅读框架(ORF)。)。如如果果在在阅阅读读框框中中插插入入或或删删除除一一个个碱碱基基就就会会使使其其后后的的读读码码发发生生移移位性错误(称为移码)。位性错误(称为移码)。两两个个基基因因之之间间或或两两个个ORF之之间间可可能能会会互互相相部部分分重重叠叠(共共用部分序列)。用部分序列)。第十一页,讲稿共一百二十四页哦3.简并性简并性几几种种密
9、密码码子子编编码码一一种种氨氨基基酸酸的的现现象象称称为为密密码码子子的的简简并并性性。如如GGN(GGA、GGU、GGG、GGC)都都编编码码Gly,那那么么这这4种密码子就称为种密码子就称为Gly的简并密码。的简并密码。只有只有Met和和Trp没有简并密码。没有简并密码。一一般般情情况况下下密密码码子子的的简简并并性性只只涉涉及及第第三三位位碱碱基基(具具有有较较小小的的专专一性。一性。第十二页,讲稿共一百二十四页哦简并性的生物学意义?简并性的生物学意义?A、可以降低由于遗传密码突变造成的灾难性后果、可以降低由于遗传密码突变造成的灾难性后果假假如如每每种种氨氨基基酸酸只只有有一一个个密密码
10、码子子,那那么么剩剩下下的的44个个密密码码子子都都成成了了终终止止子子,如如果果一一旦旦哪哪个个氨氨基基酸酸的的密密码码子子发发生生了了单单碱碱基基的的点点突突变变,那那么么极极有有可可能能造造成成肽肽链链合合成成的的过过早早终终止止。如如GUN编编码码Ala,由由于于简简并并性性的的存存在在,不不论论第第三三位位的的U变变成成什什么么,都仍然编码都仍然编码AlaB、可可以以使使DNA上上的的碱碱基基组组成成有有较较大大的的变变化化余余地地,而而仍仍然然保持多肽上氨基酸序列不变(意思基本同上)。保持多肽上氨基酸序列不变(意思基本同上)。第十三页,讲稿共一百二十四页哦4.摇摆性摇摆性密密码码子
11、子中中第第三三位位碱碱基基与与tRNA上上的的反反密密码码子子第第一一位位碱碱基基的的配配对对有有时时不不一一定定完完全全遵遵循循A-U、G-C的的原原则则,Crick把把这这种种情况称为摇摆性,有人也称摆动配对或不稳定配对。情况称为摇摆性,有人也称摆动配对或不稳定配对。密码子的第三位和反密码子的第一位是摇摆位点。密码子的第三位和反密码子的第一位是摇摆位点。反反密密码码子子第第一一位位的的G可可以以与与密密码码子子第第三三位位的的C、U配配对对,U可可以以与与A、G配配对对,I可可以以和和密密码码子子的的U、C、A配配对对,这这使使得得该该类类反反密密码码子子的的阅阅读读能能力力更更强强。见见
12、王王镜镜岩岩表表P513表表377,第十四页,讲稿共一百二十四页哦第十五页,讲稿共一百二十四页哦细胞内有几种细胞内有几种tRNA?当当遗遗传传密密码码破破译译后后,由由于于有有61个个密密码码子子编编码码氨氨基基酸酸,于于是是人人们们预预测测细细胞胞内内有有61种种,但但事事实实上上绝绝大大多多数数细细胞胞内内只只有有50种种左左右右,Crick也也正正是是在在这这种种情情况况下下提提出出了了摇摇摆摆假假说并合理解释了这种情况。说并合理解释了这种情况。根根据据摇摇摆摆性性和和61个个密密码码子子,经经过过仔仔细细计计算算,要要翻翻译译61个个密密码码子至少需要子至少需要31种种tRNA,外加,
13、外加1个起始个起始tRNA,共需,共需32种。种。但但是是,在在叶叶绿绿体体和和线线粒粒体体内内,由由于于基基因因组组很很小小,用用到到的的密密码码子少,因此叶绿体内有子少,因此叶绿体内有30种左右种左右tRNA,线粒体只有,线粒体只有24种。种。第十六页,讲稿共一百二十四页哦5.通通用用性性和和变变异异性性:密密码码子子在在不不同同物物种种间间几几乎是完全通用的。乎是完全通用的。目目前前只只发发现现线线粒粒体体和和叶叶绿绿体体内内有有例例外外情情况况,即即表表明明密密码码子子还还有有变变异异性性。例例如如,人人和和牛牛线线粒粒体体中中的的AUA编编码码Met,而而不不是是Ile,等等等等。但
14、但要要注注意意的的是是不不同同生生物物往往往往偏偏爱爱某某一一种密码子。种密码子。第十七页,讲稿共一百二十四页哦第三节第三节核糖体核糖体又称核蛋白体,它是蛋白质合成的场所。又称核蛋白体,它是蛋白质合成的场所。标标记记各各种种aaaa,注注入入大大鼠鼠体体内内,在在不不同同时时间间取取出出肝肝脏脏,匀匀浆浆,离离心心分分离离各各种种亚亚细细胞胞器器,分分析析放放射射性性蛋蛋白白的的分分布布,证证实实蛋蛋白白质质的的合合成成是在核糖体上进行的。是在核糖体上进行的。游离核糖体:合成细胞质蛋白。游离核糖体:合成细胞质蛋白。内质网核糖体:合成分泌蛋白和细胞器蛋白。内质网核糖体:合成分泌蛋白和细胞器蛋白。
15、不不论论原原核核细细胞胞还还是是真真核核细细胞胞,一一条条mRNA可可以以被被同同时时几几个个核核糖糖体体阅阅读读,把把同同时时结结合合并并翻翻译译同同一一条条mRNA的的多多个个核核糖糖体称为多聚核糖体。体称为多聚核糖体。第十八页,讲稿共一百二十四页哦第十九页,讲稿共一百二十四页哦一、一、核糖体的结构与组成核糖体的结构与组成核核糖糖体体是是由由核核糖糖核核酸酸(rRNA)和和几几十十种种蛋蛋白白质质分分子子(核核糖体蛋白)组成的一个巨大的复合体。糖体蛋白)组成的一个巨大的复合体。不不同同生生物物的的核核糖糖体体中中,尽尽管管其其rRNA和和核核糖糖体体蛋蛋白白的的一一级级结结构构有所不同,但
16、核糖体的结构高度保守有所不同,但核糖体的结构高度保守。每每个个核核糖糖体体是是由由大大小小两两个个亚亚基基组组成成,每每个个亚亚基基都都有有自自己己不不同同的的rRNA和蛋白质分子,王镜岩表和蛋白质分子,王镜岩表P522表表381。核核糖糖体体的的大大亚亚基基上上有有两两个个重重要要的的位位点点:P位位点点是是结结合合肽肽酰酰tRNA的的肽肽酰酰基基的的位位点点,A位位点点是是结结合合氨氨酰酰tRNA的的氨氨酰酰基基的位点。的位点。第二十页,讲稿共一百二十四页哦二、二、rRNA与核糖体蛋白的结构与功能与核糖体蛋白的结构与功能(一一)、rRNA的结构与功能的结构与功能结结构构:有有大大量量的的茎
17、茎环环(发发夹夹)结结构构,形形成成核核糖糖体的刚性骨架。体的刚性骨架。功能:功能:1.蛋白质合成的施工平台(骨架)蛋白质合成的施工平台(骨架)2.催催化化肽肽键键形形成成的的转转移移酶酶活活性性存存在在于于23SrRNA上上(原核),真核是(原核),真核是28SrRNA上。上。有有人人小小心心的的去去掉掉细细菌菌核核糖糖体体的的蛋蛋白白质质组组分分,保保持持rRNA的的相相对对完完整整性性,发发现现蛋蛋白白质质的的合合成成仍仍可进行。可进行。第二十一页,讲稿共一百二十四页哦3.参与参与tRNA与与mRNA的结合的结合可可能能的的情情况况是是:mRNAmRNA先先识识别别16s 16s rRN
18、ArRNA的的特特定定序序列列并并结结合合固固定定下下来来,然然后后tRNAtRNA再再识识别别rRNArRNA的的特特定定部部位位并并固固定定下下来来,最最后后tRNAtRNA的反密码子才能与的反密码子才能与mRNAmRNA密码子配对。密码子配对。4.在大小亚基的聚合中起重要作用在大小亚基的聚合中起重要作用5.在在翻翻译译的的校校正正和和翻翻译译的的调调控控方方面面有有重重要要功功能能(如如可可结结合调控因子)合调控因子)RNA分子似乎是整个核糖体的活跃的活性中心。分子似乎是整个核糖体的活跃的活性中心。第二十二页,讲稿共一百二十四页哦(二二)、核糖体蛋白的结构与功能核糖体蛋白的结构与功能结结
19、构构:大大多多数数核核糖糖体体蛋蛋白白呈呈纤纤维维状状(可可能能起起骨骨架作用),少数呈球状(可能起生物功能)。架作用),少数呈球状(可能起生物功能)。功能:功能:1.维持核糖体的结构维持核糖体的结构2.少数球状蛋白质(可能起生物功能)。少数球状蛋白质(可能起生物功能)。3.新新发发现现:一一些些核核糖糖体体蛋蛋白白具具有有DNA结结合合功功能能(HeilixturnHeilix模模块块);还还有有些些真真核核核核糖体蛋白具有糖体蛋白具有DNA修复功能。修复功能。第二十三页,讲稿共一百二十四页哦【既既然然蛋蛋白白质质是是在在核核糖糖体体中中合合成成的的,那那么么第第一一个个核核糖糖体体中中的的
20、蛋蛋白组分又是怎样合成的?白组分又是怎样合成的?】【第一个核糖体又是怎样出现的?第一个核糖体又是怎样出现的?】【先有先有DNA还是先有蛋白质?还是先有蛋白质?】大多数科学家越来越支持大多数科学家越来越支持RNARNA起源论:起源论:第第一一个个生生活活细细胞胞里里出出现现的的是是RNARNA分分子子,他他同同时时具具有有信信息息储储藏藏和和生生物物演演化化的的双双重重特特性性,既既可可以以在在一一定定程程度度上上复复制制自自己己,又又可可以以催催化化一一些些最最初初的的生生化化反反应应,后后来来,随随着着活活细细胞胞的的进进化,化,DNADNA逐渐出现并成为更为稳定的遗传信息储存分子。逐渐出现
21、并成为更为稳定的遗传信息储存分子。既既然然核核糖糖体体中中既既有有蛋蛋白白质质又又有有RNA,那那么么彻彻底底搞搞清清楚楚核核糖糖体体的结构与功能及其起源也许会弄清生命的起源和演化。的结构与功能及其起源也许会弄清生命的起源和演化。第二十四页,讲稿共一百二十四页哦第四节第四节蛋白质合成的机理蛋白质合成的机理第二十五页,讲稿共一百二十四页哦每每一一种种游游离离氨氨基基酸酸在在掺掺入入肽肽链链以以前前必必须须活活化化并并与与专专一一的的tRNA相相连连(有有人人称称装装载载,LOAD),然然后后由由tRNA负负责责将将它它带带到到核核糖糖体体上上的的特特定定位位点(点(A位点上)并添加到新生肽链的位
22、点上)并添加到新生肽链的C末端。末端。第二十六页,讲稿共一百二十四页哦一、氨基酸的活化和氨酰一、氨基酸的活化和氨酰tRNA的合成的合成氨氨基基酸酸的的活活化化和和氨氨酰酰tRNA的的合合成成是是蛋蛋白白质质生生物物合成的第一步,由氨酰合成的第一步,由氨酰tRNA合成酶催化。合成酶催化。每每一一种种氨氨酰酰tRNA合合成成酶酶既既能能识识别别自自己己的的配配体体氨氨基酸,又能识别对应的基酸,又能识别对应的tRNA。第二十七页,讲稿共一百二十四页哦(一一)、活化活化氨氨酰酰tRNA合合成成酶酶首首先先识识别别并并结结合合专专一一的的配配体体氨氨基基酸酸,然然后后氨氨基基酸酸的的羧羧基基与与细细胞胞
23、环环境境中中的的ATP发发生生反反应应形形成成一一个个酸酸酐酐型型的的高高能复合物(氨酰能复合物(氨酰AMP)。该中间复合物暂时结合在酶上。)。该中间复合物暂时结合在酶上。氨基酸氨基酸+ATP酶酶/Mg2+氨酰氨酰AMP-酶酶+PPI第二十八页,讲稿共一百二十四页哦(二二)、连接连接由由于于氨氨酰酰tRNA合合成成酶酶上上还还存存在在专专一一的的tRNA识识别别位位点点,因因此此特特定定的的游游离离tRNA就就会会识识别别并并结结合合到到氨氨酰酰AMP-酶酶复复合合物物的的活活性性部部位位,此此时时氨氨基基酸酸就就会会被被转转移移到到tRNA的的3端端,其其羧羧基基与与tRNA3端端的的自自由
24、由-OH形形成成氨氨酰酰酯酯键键,从从而而形形成成氨氨酰酰tRNA,这这也也是是一一个个高高能能化化合合物物,其其能能量量足足以以形形成成肽肽键。键。氨酰氨酰AMP-酶酶tRNA氨酰氨酰tRNA+AMP+酶酶由由于于氨氨酰酰tRNA能能量量低低于于氨氨酰酰AMP,所所以以这这一一过过程程是是可可以以自自发的。发的。第二十九页,讲稿共一百二十四页哦第三十页,讲稿共一百二十四页哦氨氨基基酸酸一一旦旦与与tRNA形形成成氨氨酰酰tRNA后后,进进一一步步的的去去向向就就由由tRNA来决定了。来决定了。tRNA凭凭借借自自身身的的反反密密码码子子与与mRNA上上的的密密码码子子相相识识别别,从从而而把
25、把所所携携带带的的氨氨基基酸酸送送到到肽链肽链的一定位置上。的一定位置上。第三十一页,讲稿共一百二十四页哦结论:结论:(1)氨氨基基酸酸的的活活化化和和氨氨酰酰tRNA的的合合成成是是蛋蛋白白质质生生物物合合成成的的第第一一步步,每每一一种种氨氨基基酸酸在在被被掺掺入入肽肽链链之之前前都都首首先先被被活活化化和和连连接接在在专专一一tRNA上上,活活化化和和连连接接都都发发生生在在氨氨基基酸的羧基上。酸的羧基上。(2)载载体体tRNA凭凭借借自自身身的的反反密密码码子子与与mRNA上上的的密密码码子子相识别而把所携带的氨基酸送到肽链的一定位置上相识别而把所携带的氨基酸送到肽链的一定位置上(3)
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