核酸结构和功能分子生物学.ppt
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1、关于核酸的结构与功能分子生物学第一张,PPT共八十页,创作于2022年6月第第3 3章章 核酸的结构与功能核酸的结构与功能 3.13.1 细胞内的遗传物质细胞内的遗传物质 3.23.2 核酸的化学组成与共价结构核酸的化学组成与共价结构 3.33.3 DNA DNA的二级结构(双螺旋模型)的二级结构(双螺旋模型)3.43.4 DNA DNA分子的高级结构分子的高级结构 3.53.5 真核生物的染色体及其组装真核生物的染色体及其组装 3.63.6 RNA RNA的结构与功能的结构与功能 3.73.7 核酸的变性、复性与分子杂交核酸的变性、复性与分子杂交第二张,PPT共八十页,创作于2022年6月3
2、.1 3.1 细胞内的遗传物质细胞内的遗传物质3.1.1 DNA3.1.1 DNA是主要的遗传物质是主要的遗传物质 18691869年,年,瑞士的内科医生瑞士的内科医生Friedrich Friedrich MiescherMiescher从外科医院包扎伤口的绷带上的脓从外科医院包扎伤口的绷带上的脓细胞核中提取到一种富含磷元素的酸性化细胞核中提取到一种富含磷元素的酸性化合物,将其称为核质合物,将其称为核质(nuclein)(nuclein);后来他又从鲭鱼精子中分离出类似的物质,后来他又从鲭鱼精子中分离出类似的物质,并指出它是由一种碱性蛋白质与一种酸性物质并指出它是由一种碱性蛋白质与一种酸性物
3、质组成的,此酸性物质即是现在所知的核酸组成的,此酸性物质即是现在所知的核酸(nucleic acid)。第三张,PPT共八十页,创作于2022年6月n n18851900188519001885190018851900年间,年间,KosselKosselKosselKossel、JohnewJohnew、LeveneLeveneLeveneLevene证实核酸由证实核酸由证实核酸由证实核酸由不同的碱基组成。其最简单不同的碱基组成。其最简单不同的碱基组成。其最简单不同的碱基组成。其最简单的单体结构是碱基的单体结构是碱基的单体结构是碱基的单体结构是碱基-核糖核糖核糖核糖-磷磷酸构成的核苷酸。酸构成
4、的核苷酸。1929192919291929年年又确定了核酸有两种,一又确定了核酸有两种,一种是脱氧核糖核酸种是脱氧核糖核酸(DNA)(DNA)(DNA)(DNA),另一种是核糖核酸另一种是核糖核酸另一种是核糖核酸另一种是核糖核酸(RNA)(RNA)(RNA)(RNA)。第四张,PPT共八十页,创作于2022年6月 1928 1928年年英国科学家英国科学家GriffithGriffith进行了著名的肺炎双球菌进行了著名的肺炎双球菌转化实验。转化实验。但但转化源转化源(transforming principletransforming principle)的化学本质仍)的化学本质仍是一个谜。是
5、一个谜。分离出活的分离出活的S S型细菌型细菌第五张,PPT共八十页,创作于2022年6月 16 16年之后年之后首先用实验证首先用实验证明基因就是明基因就是DNADNA分子的是美国分子的是美国著名的微生物著名的微生物学家学家AveryAvery(19441944)。第六张,PPT共八十页,创作于2022年6月 9 9年之后年之后19521952年年D.HersheryD.Hershery和和M.ChaseM.Chase 再次用再次用T2T2噬噬菌体标记实验证实菌体标记实验证实了了DNADNA是遗传物质的是遗传物质的本质。本质。第七张,PPT共八十页,创作于2022年6月 20 20世纪世纪5
6、050年代年代WatsonWatson和和CrickCrick发现了发现了DNADNA分子的双螺旋结构,最分子的双螺旋结构,最终确立终确立DNADNA是遗传信息的载体。是遗传信息的载体。作为遗传物质的作为遗传物质的DNADNA具有以下具有以下特性特性:储存并表达遗传信息;储存并表达遗传信息;能把遗传信息传递给子代;能把遗传信息传递给子代;物理和化学性质稳定;物理和化学性质稳定;有遗传变异的能力。有遗传变异的能力。第八张,PPT共八十页,创作于2022年6月3.1.2 RNA3.1.2 RNA也是遗传物质也是遗传物质 19561956年美国的两位科学家年美国的两位科学家A.GiererA.Gie
7、rer和和G.SchramanG.Schraman发发现烟草花叶病毒(现烟草花叶病毒(tobacco mosaic virus,TMVtobacco mosaic virus,TMV),其遗),其遗传物质是传物质是RNARNA。19571957年美国的年美国的Heinz Fraenkel-ConratHeinz Fraenkel-Conrat和和B.SingreB.Singre用重建实验证实了这一结论。用重建实验证实了这一结论。第九张,PPT共八十页,创作于2022年6月第十张,PPT共八十页,创作于2022年6月 一些病毒采用一些病毒采用RNARNA作为遗传物质。作为遗传物质。类病毒类病毒只
8、由只由RNARNA组成。类病毒,无壳病毒:一种病组成。类病毒,无壳病毒:一种病毒样感染颗粒,含单链、共价闭环毒样感染颗粒,含单链、共价闭环RNARNA,无蛋白质外,无蛋白质外壳。类病毒结构上与一些内含子近似,可能代表逃逸壳。类病毒结构上与一些内含子近似,可能代表逃逸的内含子。的内含子。第十一张,PPT共八十页,创作于2022年6月3.2 3.2 核酸的化学组成与共价结构核酸的化学组成与共价结构 3.2.1 3.2.1 核酸的化学组成核酸的化学组成 核酸核酸(nucleic acid,多核苷酸)多核苷酸)核苷酸核苷酸(nucleotide,单核苷酸)单核苷酸)磷酸磷酸(phosphate)核苷核
9、苷(nucleoside)戊糖戊糖(amyl sugar )含氮碱基含氮碱基(base)第十二张,PPT共八十页,创作于2022年6月1.1.碱基碱基(base)(base)第十三张,PPT共八十页,创作于2022年6月2.2.核苷(核苷(nucleosidesnucleosides)戊糖与嘧啶或嘌呤碱以糖苷键连接就称为核苷。戊糖与嘧啶或嘌呤碱以糖苷键连接就称为核苷。第十四张,PPT共八十页,创作于2022年6月1122334455(OH)1122334455(OH)嘧啶的嘧啶的1 1位位N N原子、嘌呤的原子、嘌呤的9 9位位N N原子与戊糖原子与戊糖1 1所连所连的羟基形成的羟基形成糖苷键
10、。糖苷键。第十五张,PPT共八十页,创作于2022年6月3.3.核苷酸(核苷酸(nucleotide acidnucleotide acid)脱氧脱氧核糖核糖碱基碱基磷酸磷酸A G C T第十六张,PPT共八十页,创作于2022年6月3.2.2 3.2.2 核酸的共价结构核酸的共价结构1.1.DNADNA的一级结构与功能的一级结构与功能 DNADNA的一级结构是指的一级结构是指DNADNA分子中核苷酸的排列顺序,简称分子中核苷酸的排列顺序,简称为为DNADNA顺序(或序列)。顺序(或序列)。由于核苷酸之间的差异仅仅是碱基的由于核苷酸之间的差异仅仅是碱基的不同,故可称为碱基顺序。不同,故可称为碱
11、基顺序。第十七张,PPT共八十页,创作于2022年6月DNADNA一级结构的表示法一级结构的表示法53结构式结构式53 p p p pOH3ACTG1线条式线条式5ACTGCATAGCTCGA 3字母式字母式第十八张,PPT共八十页,创作于2022年6月2.RNA2.RNA的一级结构与功能的一级结构与功能 RNA分分子子中中核核苷苷酸酸的的排排列列顺顺序序叫做叫做RNA的一级结构。的一级结构。OHOHOH53 RNA与与DNA的差异的差异 DNA RNA糖糖 脱氧核糖脱氧核糖 核糖核糖碱基碱基 AGCT AGCU 不含稀有碱基不含稀有碱基 含稀有碱基含稀有碱基第十九张,PPT共八十页,创作于2
12、022年6月3.3 DNA3.3 DNA的二级结构的二级结构(双螺旋模型双螺旋模型)Watson&CrickWatson&Crick建立双螺旋模型主要是受到建立双螺旋模型主要是受到4 4个方面个方面的影响:的影响:1 1、DNADNA的的X X射线衍射分析结果;射线衍射分析结果;2 2、蛋白质的蛋白质的螺旋模型;螺旋模型;3 3、氢键理论;氢键理论;4 4、19501950英英ChargaffChargaff 规则规则(当量定律)。(当量定律)。第二十张,PPT共八十页,创作于2022年6月3.3.1 3.3.1 双螺旋模型(双螺旋模型(double helix double helix mo
13、delmodel)特征)特征 (1)(1)DNADNA分子由两条反向平行的多分子由两条反向平行的多核苷酸链组成,形成右手双螺旋。核苷酸链组成,形成右手双螺旋。(2)(2)两条链反向平行,两条链反向平行,即两条链的方向相反。即两条链的方向相反。5353磷酸磷酸核糖核糖碱基碱基第二十一张,PPT共八十页,创作于2022年6月 (3)(3)糖一磷酸键是在双螺旋的外侧,糖一磷酸键是在双螺旋的外侧,碱基对与轴线垂直。碱基对与轴线垂直。(4)(4)糖与附着在糖上的碱基近于垂糖与附着在糖上的碱基近于垂直。直。(5)(5)碱基配对时,必须一个是嘌呤,碱基配对时,必须一个是嘌呤,另一个是嘧啶。另一个是嘧啶。(6
14、)(6)DNA DNA双螺旋有大沟(双螺旋有大沟(major or major or wide groovewide groove)和小沟()和小沟(minor or narrow minor or narrow groovegroove)的存在。)的存在。T-A碱基对碱基对C-G碱基对碱基对第二十二张,PPT共八十页,创作于2022年6月(1 1)碱基对之间的氢键)碱基对之间的氢键 (2 2)碱基堆集力碱基堆集力 它包括:它包括:疏水作用疏水作用 范德华力范德华力(3 3)磷酸基的负电荷斥力磷酸基的负电荷斥力3.3.2 3.3.2 维持维持DNADNA双螺旋的作用力双螺旋的作用力第二十三张,
15、PPT共八十页,创作于2022年6月3.3.3 DNA3.3.3 DNA二级结构的其他形式二级结构的其他形式(双螺旋结构的多态性双螺旋结构的多态性)在双螺旋的总体特征之下,能产生各种二级结构的变化,在双螺旋的总体特征之下,能产生各种二级结构的变化,这称为这称为DNADNA二级结构的多样性或多态性二级结构的多样性或多态性(polymorphism)。DNADNA结构产生多态性的原因在于核苷酸链的骨架含许多结构产生多态性的原因在于核苷酸链的骨架含许多可转动的单键,从而使可转动的单键,从而使糖环可采取不同的折叠形糖环可采取不同的折叠形式和苷键采取不同构象。式和苷键采取不同构象。DNADNA的构象现已
16、知有的构象现已知有A A,B B,C C,D D,E E,T T,Z 7Z 7种。种。第二十四张,PPT共八十页,创作于2022年6月(1 1)B-DNAB-DNA的构象的构象 WatsonWatson和和CrickCrick提出的提出的DNADNA双螺旋双螺旋结构模型。结构模型。相对湿度相对湿度92%92%的的DNADNA钠盐。钠盐。是大多数是大多数DNADNA在细胞中的构象。在细胞中的构象。右手双螺旋。右手双螺旋。第二十五张,PPT共八十页,创作于2022年6月(2 2)A-DNAA-DNA的结构的结构 右手螺旋。右手螺旋。相对湿度为相对湿度为75%75%的的DNADNA钠盐。钠盐。螺旋体
17、短粗,大沟变得窄而深,小沟螺旋体短粗,大沟变得窄而深,小沟变得宽而浅。变得宽而浅。结晶的结晶的A A型型-DNA-DNA纤维在吸收了水分后能纤维在吸收了水分后能够变长,并转变为够变长,并转变为B B型型-DNA-DNA。A-DNAA-DNA比较常见在比较常见在RNARNA分子的双股发夹螺分子的双股发夹螺旋区域、旋区域、RNA-DNARNA-DNA杂交双链中。杂交双链中。第二十六张,PPT共八十页,创作于2022年6月(3 3)Z-DNAZ-DNA的结构的结构1972197219721972年年年年 PohlPohl et al et al 发现发现发现发现 poly(dG-dC)poly(dG
18、-dC)poly(dG-dC)poly(dG-dC)在高盐下旋光性在高盐下旋光性在高盐下旋光性在高盐下旋光性发生改变;发生改变;发生改变;发生改变;1979197919791979年年年年 Wang A.H-JWang A.H-JWang A.H-JWang A.H-J(王惠君王惠君王惠君王惠君),),),),A.RichA.Rich对对对对 d(CGCGCG)d(CGCGCG)d(CGCGCG)d(CGCGCG)单晶作单晶作单晶作单晶作X X X X衍射分析提出衍射分析提出衍射分析提出衍射分析提出Z Z Z ZDNADNADNADNA模型。模型。模型。模型。第二十七张,PPT共八十页,创作于
19、2022年6月 嘌呤和嘧啶交替排列,高盐。嘌呤和嘧啶交替排列,高盐。左手螺旋左手螺旋。细长,细长,只有一条窄而深的小沟,大沟消只有一条窄而深的小沟,大沟消失。失。天然天然DNADNA的局部可出现的局部可出现Z-DNAZ-DNA。CpGCpG二核苷酸序列中胞嘧啶的甲基化形成二核苷酸序列中胞嘧啶的甲基化形成5-5-甲基胞嘧啶,可导致甲基胞嘧啶,可导致B-DNAB-DNA向向Z-DNAZ-DNA转化。转化。第二十八张,PPT共八十页,创作于2022年6月 Z-DNAZ-DNA构象有转构象有转录起始的调节活性。录起始的调节活性。Z-DNAZ-DNA构象在转录构象在转录区上游离转录区近区上游离转录区近时
20、,抑制转录;若时,抑制转录;若离转录区远时,可离转录区远时,可以增加转录区的负以增加转录区的负超螺旋程度而促进超螺旋程度而促进转录。转录。第二十九张,PPT共八十页,创作于2022年6月3.4 DNA3.4 DNA分子的高级结构(分子的高级结构(其他其他DNADNA螺旋结构螺旋结构)3.4.1 3.4.1 单链核酸形成的二级结构单链核酸形成的二级结构 单链核酸也可由于部分序列之间的碱基配对而形成单链核酸也可由于部分序列之间的碱基配对而形成分子内或分子间的双螺旋区域。分子内或分子间的双螺旋区域。反向重复序列间间隔反向重复序列间间隔较短或无间隔较短或无间隔反向重复序列反向重复序列间间隔较长间间隔较
21、长第三十张,PPT共八十页,创作于2022年6月3.4.2 3.4.2 短片段的重复序列短片段的重复序列 短片段的重复顺序可分为三种类型:短片段的重复顺序可分为三种类型:(1 1)正向重复)正向重复(direct repeats)(direct repeats)又叫又叫顺向重复顺向重复;(2 2)反向重复)反向重复(inverted repeats)(inverted repeats);(3 3)回文顺序)回文顺序 (Palindromic sequence)(Palindromic sequence)5-GTGAGCTCAC-3 5-GTGAGCTCAC-3 3-CACTCGAGTG-5 3
22、-CACTCGAGTG-5 第三十一张,PPT共八十页,创作于2022年6月上海自来水来自海上上海自来水来自海上农学人才多多才人学农农学人才多多才人学农画上荷花和尚画画上荷花和尚画书临汉字翰林书书临汉字翰林书顺反相同顺反相同第三十二张,PPT共八十页,创作于2022年6月 能在能在DNADNA或或RNARNA中形成发夹结构。中形成发夹结构。通常是作为一种特别信号。通常是作为一种特别信号。如:限制性内切酶的识别位点;如:限制性内切酶的识别位点;一些调控蛋白的识别位点。一些调控蛋白的识别位点。限制性内切酶限制性内切酶 EcoREcoR的识别位点的识别位点第三十三张,PPT共八十页,创作于2022年
23、6月3.4.3 3.4.3 三股螺旋的三股螺旋的DNADNA 19571957年,年,FelsenfeldFelsenfeld等发现一股为嘌呤,另一股为嘧等发现一股为嘌呤,另一股为嘧啶的核苷酸双链能够形成三链。啶的核苷酸双链能够形成三链。如:如:polyA/polyUpolyA/polyU;polydA/polydT polydA/polydT;polyd(AG)/polyd(CT)polyd(AG)/polyd(CT)。19871987年,年,Mirkin.S.MMirkin.S.M证明证明plasmid DNA plasmid DNA 在在 pH=4.3pH=4.3的溶液中的溶液中,有有T
24、.S DNAT.S DNA的存在。的存在。第三十四张,PPT共八十页,创作于2022年6月DNADNA分子内的分子内的三链结构三链结构 多聚嘌呤多聚嘌呤多聚嘧啶多聚嘧啶DNADNADNADNA分子间的分子间的分子间的分子间的三链结构三链结构三链结构三链结构三股螺旋三股螺旋DNADNA的生的生物学意义:物学意义:参与基因表达调参与基因表达调控。控。RNARNA分子参与表分子参与表观遗传调节。观遗传调节。基因治疗或定向基因治疗或定向诱变。诱变。第三十五张,PPT共八十页,创作于2022年6月3.4.4 DNA3.4.4 DNA的四链结构的四链结构 20022002年,一组英国科学家发现染色体端粒年
25、,一组英国科学家发现染色体端粒DNADNA可以形可以形成四链结构,并测定了其晶体结构。成四链结构,并测定了其晶体结构。GGGG53TTTGGGGGGGGGGGGGGGGTTTTTT第三十六张,PPT共八十页,创作于2022年6月功能功能(1)稳定真核生物染色体结构稳定真核生物染色体结构(2)保证保证DNA末端准确复制末端准确复制(3)与与DNA分子的组装有关分子的组装有关(4)与染色体的与染色体的meiosis&mitosis 有关有关 第三十七张,PPT共八十页,创作于2022年6月3.4.5 DNA3.4.5 DNA的结构的动态性与精细结构的结构的动态性与精细结构1.DNA1.DNA结构的
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